4PYYA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with inhibitor
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery and characterization of novel selective inhibitors of carbonic anhydrase IX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4pyyA00
1JV0A 1IF7A 2FOYA 4HT0A 4L5VA 5EHVA 4E9OX 3SBHA 5JEHB 4QIZA 1EOUA 4MDGA 3UYQA 3OKVA 1RAYA 2X7TA 4CNRA 4YGKA 2CBBA 1CILA 1BCDA 1G3ZA 3IBIA 2NWZA 1CNGA 3MYQA 4MLXA 4Q07A 5FNJA 1ZGFA 3RYZA 1RJ6A 3KOKA 4QIYA 1CALA 4HU1A 5FNHA 4RFCA 2CABA 1CCTA 3D93A 4M2UA 1KWQA 2AX2A 3CA2A 1BNNA 3IGPA 3MHIA 1DCAA 4PZHA 2POUA 3UYNA 3EFIA 3T83A 1CVFA 3D9ZA 4YGLA 2F14A 4YGFA 3U7CA 2AW1A 4E3FA 2FOUA 4L5UA 1UGCA 1CVCA 4TWMA 3M14A 3S8XA 5EOIA 2NXSA 3DCSA 3M5TA 1XQ0A 3SAPA 1OKNA 1CAKA 4WUQA 4Q7WA 3IAIA 2Q1QA 5A25A 3M40A 4WL4A 4QSJA 4RUZA 1I9PA 4ILXA 3PJJA 5L3OA 5DOHA 1CZMA 5CLUA 2EU2A 1XEVA 3S9TA 4JS6A 4FVNA 3DCWA 5JGTB 5E5RA 1CNYA 3OYSA 3DC3A 3RYXB 3JXFA 1ZE8A 2NXTA 3V7XA 4RFDA 4PXXA 3K7KA 5FLTA 3DVCA 1DMXA 4XE1A 5SZ6A 1Z9YA 1G46A 4Q90A 3M2XA 3MWOA 1KOQA 1AZMA 3KNEA 1I91A 3S78B 1JD0A 3IBNA 3DC9A 3MMFA 2FOSA 1KEQA 3DD8A 3MNIA 4R59A 5DRSA 3MHOA 5JG5B 5FL5A 1CNHA 1CNWA 4R5BA 3DA2A 3B1BA 4Q7PA 1HEAA 3N2PA 4RH2A 5DSKA 4KAPA 5SZ1A 5SZ3A 4Q06A 4Q49A 3RGEA 5HPJA 1CAOA 3GZ0A 3OIKA 3F4XA 3SAXA 1UGAA 5IPZA 1TEUX 4GL1X 1DMYA 4MTYA 1CANA 4WR7A 5EKHA 2X7UA 1Z97A 4Q0LA 1TH9A 4ETQC 1ZFQA 3OY0A 4YHAA 4E5QA 5SZ7A 4KUYA 1V9EA 5EH5A 4YXOA 3K2FA 3RYVB 1CVAA 1TTMA 2QOAA 3F7BA 3OIMA 4KNJA 4Q6DA 1CAZA 3IBLA 1HVAA 4QY3A 4XIWA 3RG4A 1FSRA 5DSQA 4YGNA 1G53A 5LMDA 4DZ9A 4E3DA 4Q7VA 1H9QA 1HECA 1MOOA 5E2NA 4K0SA 3V3IB 4G0CA 1IF6A 1G6VA 1TEQX 3CAJA 3MNJA 4Q78A 3W6IA 5EHWA 4FL7A 3PO6A 1RZAA 1UGBA 5G0BA 3NI5A 3ML5A 3RZ1B 1KWRA 1G1DA 4QK2A 3DBUA 3P44A 5DSJA 2W2JA 4FPTA 2CBEA 1HCBA 1OKLA 3F7UA 4YWPA 3M2ZA 3M96A 2NNVA 4E4AA 2NMXA 3K34A 5DSPA 3MNKA 4IWZA 3MDZA 3U47A 2WD3A 4M2RA 1CAJA 1CNXA 1UGEA 5AMLA 2NWYA 4RN4A 3KLDB 5DSIA 1IF8A 3HKTA 2POVA 3C7PA 4FIKA 5BYIA 4BF6A 5EZTX 1YDAA 1RZBA 3JXHC 3QYKA 5EIJA 3FFPX 1YO2A 4HF3A 4JSZA 3F8EA 3MHCA 3T84A 4Z1JA 4HEZA 4BF1A 3R16A 3KKXA 2OSMA 1YDBA 1G48A 4HEWA 3RJ7A 1CNKA 1I90A 4QSAA 3DVDA 4HBAA 4KUVA 3DCCA 1BNMA 4TWLA 1URTA 4QJXA 1FR7A 1I9OA 2FOQA 2NWOA 1YO1A 1FQNA 1ZSBA 3NJ9A 4RIUA 4HT2A 4K0TA 1G0FA 1BZMA 1YDCA 5G03A 5CACA 2VVAX 4Y0JA 3P58A 3U3AX 1ZFKA 4YVYA 5JG3B 4LU3A 3TMJA 4E3GA 4PYYA 3IBUA 1F2WA 4PQ7A 5G01A 4RIVA 4PYXA 4ZX0A 1CIMA 4E3HA 3N0NA 1RJ5A 4FVOA 5L6KA 4KV0A 4DZ7A 5JESB 4E49A 1CINA 4C3TA 4ITPA 3S74B 1H9NA 4R5AA 3V3FA 3S75B 4WUPA 2Q1BA 3HLJA 3BL1A 3M2YA 5FL4A 3CYUA 4KP8A 4Q6EA 4ZWYA 1CAYA 1TE3X 4XZ5A 1UGFA 2FNKA 2FOVA 3DD0A 2QP6A 2NNSA 1CRAA 4CA2A 2NXRA 4QJWA 3FW3A 2EU3A 3KWAA 1RZCA 4COQA 4K13A 5EKMA 4ZWZA 3MHMA 3LXEA 3ZP9A 1THKA 5FLQA 7CA2A 1XPZA 4LHIA 1H4NA 2NN7A 5CJFA 3M04A 5JGSB 4QTLA 5SZ2A 4KNNA 2WEGA 4YXIA 1G0EA 1LG5A 1BN4A 1BNTA 5AMGA 1I9NA 4QJPA 3HS4A 1CNIA 1HEBA 1BN3A 2GD8A 5EKJA 3KOIA 5C8IA 3D0NA 3M1KA 3D92A 1J9WA 2CBCA 4Q87A 1BNWA 4MLTA 2HD6A 3MNHA 3OKUA 4IDRX 5SZ4A 4ITOA 1I9QA 3RZ8A 1RAZA 1G45A 1CAMA 1TG3A 2HFWA 1ZSAA 4MDLA 5DSMA 5J8ZA 9CA2A 5DSOA 3S72B 2POWA 2GEHA 1CNJA 3MZCA 5FLSA 2CBAA 3V5GA 3M5SA 3T85A 1UGGA 4CNWA 2Q38A 5FDCA 4CNXA 3R17B 5BNLA 5EHEA 12CAA 4Q8YA 1CVDA 4YYTA 1A42A 4JSSA 3S73B 1DCBA 1FLJA 1Y7WA 5DSRA 4BCWA 4YGJA 5A6HA 1CVBA 1LZVA 1CRMA 1CVHA 4CQ0A 4N16A 3RYJB 4Q9YA 5FL6A 3RG3A 8CA2A 1LUGA 3ZNCA 3W6HA 5BRUA 3RLDA 2HNCA 2FW4A 2FNNA 1OQ5A 1ZH9A 4Q8XA 1ZNCA 3P4VA 3N4BA 2ZNCA 2FNMA 3T5UA 4M2VA 1FR4A 2H15A 3Q31A 3VBDA 4YX4A 1UGDA 5FNKA 3DAZA 5FNLA 4RUXA 1IF9A 5E5UA 2ILIA 5FNGA 3V3JA 4KP5A 2CBDA 5EH8A 1KOPA 3HFPA 1G4OA 1HUGA 1TG9A 3OILA 2CA2A 3N3JA 1LGDA 2EZ7A 1JCZA 1HUHA 1CCUA 1I8ZA 4Z1KA 3JXGA 1OKMA 4N0XB 2WEJA 5JEPB 3OYQA 1BNUA 4QEFA 4QJOA 3M1WA 4Q99A 4UOVA 1FQMA 4YXUA 4WW6A 2NWPA 3IEOA 5E2RA 3U45X 2NNOA 2HOCA 4Q08A 3TVOX 1LG6A 5JEGB 1CA2A 1BNVA 3B4FA 4QSBA 5AMDA 5DSLA 3M98A 4XFWA 4MO8A 4CACA 5JQTA 5CA2A 3S97A 4QSIA 1MUAA 3V3GB 3HKQA 5E2MA 4ZX1A 2X7SA 4QK3A 3RZ7A 2NNGA 1HEDA 5FDIA 1XEGA 1IF4A 1HCAA 3P5LA 4K1QA 5FLPA 5BRVA 1Z93A 3D8WA 3M67A 5SZ0A 3M1QA 1CAIA 1G54A 4M2WA 4RUYA 1RZEA 4Q7SA 4Q81A 4ZWIA 1CAHA 6CA2A 4Q83A 3BL0A 5E2KA 5DSNA 1CNCA 3V3HB 4JSWA 1CNBA 2WEOA 1BN1A 3KS3A 3V2JA 1FSQA 5FNIA 4QJ0A 4ZWXA 3DVBA 3M3XA 5BRWA 4Q09A 2ABEA 1T9NA 1YDDA 3T82A 3P3JA 4K0ZA 4Q8ZA 4KUWA 2OSFA 3V2MA 3ML2A 1FQRA 5EH7A 3FE4A 2QO8A 2HKKA 3MNUA 1TB0X 5JDVB 1AVNA 1FSNA 4X5SA 1YO0A 4FRCA 4G7AA 5E28A 4JSAA 1FQLA 4FU5A 5E2SA 2WD2A 4CNVA 4ZAOA 3PYKA 3HKNA 3P3HA 3S77B 5FLRA 3RYYA 1BV3A 2FMZA 1I9MA 1G52A 2HL4A 2O4ZA 3EFTA 1AM6A 3NB5A 2FMGA 3M2NA 4Z0QA 4Z1NA 3KIGA 5G0CA 1G4JA 3CZVA 1ZSCA 1CCSA 5JQ0A 4KNMA 3RZ5A 1I9LA 3T5ZA 1BICA 3M1JA 5DVXA 4LP6A 1CA3A 3M5EA 3S76A 4XIXA 3L14A 2IT4A 5FNMA 3RZ0B 1ZGEA 2NN1A 2H4NA 4MDMA 3P55A 1TBTX 1IF5A 4Z1EA 1BNQA 2WEHA 3MHLA 4QK1A 4KNIA 1V9IC 5SZ5A 3MNAA 3P5AA 3KONA 1CVEA 4HEYA 3BETA 4L5WA 5DOGA 1RZDA 3HKUA 4QJMA 5FLOA 3S71B 3DV7A 3TVNX 2VVBX 4WW8A 3SBIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JV0 A;  1IF7 A;  2FOY A;  4HT0 A;  4L5V A;  5EHV A;  4E9O X;  3SBH A;  5JEH B;  4QIZ A;  1EOU A;  4MDG A;  3UYQ A;  3OKV A;  1RAY A;  2X7T A;  4CNR A;  4YGK A;  2CBB A;  1CIL A;  1BCD A;  1G3Z A;  3IBI A;  2NWZ A;  1CNG A;  3MYQ A;  4MLX A;  4Q07 A;  5FNJ A;  1ZGF A;  3RYZ A;  1RJ6 A;  3KOK A;  4QIY A;  1CAL A;  4HU1 A;  5FNH A;  4RFC A;  2CAB A;  1CCT A;  3D93 A;  4M2U A;  1KWQ A;  2AX2 A;  3CA2 A;  1BNN A;  3IGP A;  3MHI A;  1DCA A;  4PZH A;  2POU A;  3UYN A;  3EFI A;  3T83 A;  1CVF A;  3D9Z A;  4YGL A;  2F14 A;  4YGF A;  3U7C A;  2AW1 A;  4E3F A;  2FOU A;  4L5U A;  1UGC A;  1CVC A;  4TWM A;  3M14 A;  3S8X A;  5EOI A;  2NXS A;  3DCS A;  3M5T A;  1XQ0 A;  3SAP A;  1OKN A;  1CAK A;  4WUQ A;  4Q7W A;  3IAI A;  2Q1Q A;  5A25 A;  3M40 A;  4WL4 A;  4QSJ A;  4RUZ A;  1I9P A;  4ILX A;  3PJJ A;  5L3O A;  5DOH A;  1CZM A;  5CLU A;  2EU2 A;  1XEV A;  3S9T A;  4JS6 A;  4FVN A;  3DCW A;  5JGT B;  5E5R A;  1CNY A;  3OYS A;  3DC3 A;  3RYX B;  3JXF A;  1ZE8 A;  2NXT A;  3V7X A;  4RFD A;  4PXX A;  3K7K A; 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