4Q0LA

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery and characterization of novel selective inhibitors of carbonic anhydrase IX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q0lA00
5E2MA 1ZH9A 5BRUA 1H4NA 1JCZA 4IWZA 4JSAA 1CILA 1TG3A 3DVBA 3D0NA 4XE1A 1CAOA 1HUGA 4Q83A 5JQ0A 3S76A 1T9NA 1AVNA 1BNMA 1FR7A 1BN4A 1A42A 4YVYA 3T5ZA 1UGCA 3BL1A 3SBIA 4YGJA 4YGFA 4FU5A 4WR7A 3DD0A 2NXRA 3FFPX 4M2VA 3N2PA 1HCAA 4YX4A 4E49A 2FOSA 1G52A 1FQNA 1Z93A 4Q90A 3RZ8A 1H9NA 2W2JA 3ML2A 2POVA 3MHCA 3M1QA 2FMZA 4RFDA 3C7PA 4CNVA 2NWPA 1TB0X 1ZSAA 4ZX0A 3U7CA 4QTLA 3RZ0B 3ZNCA 5E5RA 2WD3A 2X7SA 5DVXA 1IF8A 3OYSA 1YDCA 4Q06A 1UGBA 1LG5A 4K0ZA 2NWYA 4COQA 3PO6A 3B1BA 3U45X 4KP5A 1CAKA 3M04A 4DZ7A 1YDBA 2NN7A 5DSLA 3RYXB 3S78B 2NWOA 1CNKA 5EKJA 5JESB 4MDGA 1V9IC 4YWPA 3B4FA 1CAMA 1LUGA 5J8ZA 1FR4A 3CA2A 2CBDA 3N0NA 5DSIA 2EZ7A 1KWQA 5G0BA 5DSMA 3IBIA 4K13A 3M5EA 4PXXA 1HCBA 2NWZA 3UYQA 3MNJA 5EHVA 4Z0QA 3HKTA 3ZP9A 5EHEA 4BF6A 3T5UA 2FOQA 4QJPA 5SZ6A 1I9OA 2GEHA 5JG3B 3FW3A 4G7AA 4QSJA 3JXFA 1RZBA 1UGAA 4ZWXA 5A6HA 5SZ1A 3F8EA 1CZMA 3DCSA 1G46A 3DVCA 3DV7A 9CA2A 2AW1A 5SZ2A 5JEHB 2NXSA 1CVDA 1CAZA 1G4OA 3RJ7A 3DCCA 3HKQA 3S97A 5FNLA 5DSKA 3S77B 5FNHA 4BF1A 5EH5A 4C3TA 3CAJA 1DMXA 3EFTA 4QJWA 3L14A 5CLUA 4Q7VA 4HEYA 4GL1X 1TE3X 4JSWA 5FDIA 12CAA 4QK1A 3ML5A 3OYQA 4KUYA 4Q6EA 1UGDA 5AMDA 1YO2A 5E28A 4QSBA 3JXHC 4HEZA 3HFPA 3M14A 4HT2A 3SAPA 1RZDA 4RH2A 4YXOA 4ITOA 4QJ0A 1XEVA 3DC3A 1OKMA 4ZX1A 2WEJA 1ZSBA 2FOVA 3GZ0A 1HEBA 1RAZA 3OIMA 4Q81A 3S74B 2QP6A 1I90A 4Q09A 2X7UA 4QY3A 2ILIA 4R5AA 3M2XA 1MOOA 4Q6DA 3FE4A 2NN1A 1TEUX 1BICA 3P5AA 3LXEA 1CA2A 3V3JA 5L6KA 1G4JA 1FQRA 2Q1BA 3P4VA 4HF3A 5DOHA 3RG3A 3N3JA 4QIZA 3M5SA 4QIYA 5FNGA 3M40A 3RYVB 3U47A 5FLTA 3NJ9A 2NXTA 4RUYA 1YDDA 3IBUA 5BNLA 3P5LA 2CBBA 1DCBA 3D93A 1Y7WA 1TEQX 3KONA 5SZ3A 1HUHA 1FSQA 2GD8A 5EH8A 3K2FA 2AX2A 3D8WA 4PYYA 3RZ1B 1UGFA 4MTYA 5FL5A 4E3HA 8CA2A 3CYUA 4TWMA 4E9OX 4YXIA 5DSNA 3R16A 5C8IA 2WD2A 4E5QA 5AMLA 3RYYA 3U3AX 1CNYA 4QEFA 1UGEA 3MNHA 3W6IA 1CANA 6CA2A 3MWOA 2FNMA 3HLJA 5E2KA 4FRCA 1EOUA 1HVAA 1ZFQA 1UGGA 5BYIA 1CNCA 4Q7WA 4Q08A 3TMJA 4K1QA 1IF4A 5CA2A 1THKA 2X7TA 4KNMA 5E2SA 1OQ5A 4L5WA 4Q87A 1CNXA 1BN1A 3M3XA 3V7XA 1CRMA 4HU1A 1FSRA 2FNKA 1BZMA 2ZNCA 1G53A 1FQLA 5FLRA 1KWRA 5DSRA 5E2NA 4MO8A 5HPJA 4KP8A 4YGKA 1BNTA 5FL4A 5FLSA 3DBUA 2POUA 5LMDA 3D9ZA 4XIWA 1V9EA 5A25A 5EKHA 4Y0JA 3IGPA 1BNNA 3M1JA 4FIKA 1IF9A 4XIXA 4WW6A 3T84A 1H9QA 1IF6A 3P3JA 4YGNA 4WL4A 3K7KA 3BETA 3MNKA 4Q9YA 2FMGA 3T85A 3V3GB 4E3DA 3HKNA 1RAYA 4Z1JA 3MHIA 4RIVA 5SZ5A 4CNRA 4HT0A 5DSQA 4FL7A 5E2RA 4ETQC 2HD6A 5BRWA 1CCSA 3MMFA 1RJ5A 5G01A 1HEDA 2VVAX 3M96A 4CNXA 1CAHA 4KNNA 5FDCA 1XEGA 3KIGA 4DZ9A 1G0FA 3V3FA 1I9NA 4L5UA 4QSIA 3KNEA 1ZE8A 1LZVA 2OSFA 4PZHA 3KS3A 1BCDA 3P3HA 4QJXA 2QOAA 5SZ7A 2CBEA 3DC9A 5FLPA 1G45A 2FW4A 2NNSA 1FQMA 4QJMA 2CA2A 2WEOA 1AZMA 1YO0A 3UYNA 3MYQA 3HKUA 5SZ4A 3M2YA 3OKVA 1DMYA 1DCAA 3MHMA 2NNOA 3QYKA 5FL6A 4Z1KA 5IPZA 4X5SA 1CNIA 3MNIA 3OY0A 5FNIA 3TVNX 2Q1QA 1Z97A 3R17B 2HL4A 5CJFA 1BNUA 1TH9A 4TWLA 4KV0A 2Q38A 4Q8ZA 1CCUA 4K0SA 5DOGA 1XPZA 1AM6A 1YDAA 3V2JA 1TBTX 2QO8A 4E3FA 4Q8XA 3DD8A 5G03A 3KLDB 3RLDA 4RUZA 4UOVA 3D92A 3F7UA 4KNJA 3IBNA 4Q99A 1CALA 1G6VA 3S9TA 3W6HA 5EIJA 3M2NA 4LHIA 1TTMA 4IDRX 3RYJB 4Q8YA 5DSJA 5JG5B 3IAIA 2H15A 1CAIA 3P55A 4RUXA 3M2ZA 4Z1EA 1CIMA 3M67A 5AMGA 3KOKA 1FSNA 3DVDA 3MNUA 3S72B 2WEGA 4KUVA 3OIKA 3P44A 1URTA 3OILA 4QSAA 4YHAA 1CNWA 5EOIA 3V3IB 5EKMA 3IBLA 5FNMA 1F2WA 1ZFKA 4WW8A 5JDVB 1LG6A 2ABEA 2O4ZA 3T83A 4WUQA 4E4AA 3KWAA 1I9MA 4FVNA 4MLTA 2F14A 5JGTB 7CA2A 5SZ0A 4E3GA 4MDLA 2NNVA 4Q7SA 4L5VA 4YGLA 3CZVA 1CAYA 4Z1NA 5JQTA 1G3ZA 3V3HB 3PYKA 4HEWA 3M1KA 1RZCA 2EU3A 4JS6A 4ITPA 4LP6A 4HBAA 1BNWA 5FLOA 3SAXA 4N0XB 1HEAA 1FLJA 4JSZA 1RZAA 4K0TA 3S73B 1BN3A 5EH7A 1I8ZA 1CNHA 1TG9A 3DAZA 4YYTA 3JXGA 1ZGFA 4Q78A 1KOPA 4ZAOA 4ZWZA 1CCTA 3S8XA 3V5GA 1BNVA 4Q49A 4CNWA 1BV3A 1CVCA 4JSSA 1CVFA 1G1DA 3M98A 4PQ7A 4WUPA 3Q31A 5BRVA 3NI5A 3NB5A 1YO1A 1IF7A 1I9PA 4KAPA 1CVHA 1CVEA 3P58A 4QK2A 1G48A 4PYXA 3KOIA 2FNNA 2FOYA 1BNQA 4CA2A 5G0CA 3OKUA 4M2WA 3RG4A 4ZWIA 5E5UA 1I91A 3MHOA 3RZ7A 1CNBA 4CACA 4CQ0A 2VVBX 2WEHA 3EFIA 1CA3A 3M1WA 2HOCA 4M2RA 3TVOX 2FOUA 4RFCA 1CNJA 3V2MA 1Z9YA 3S71B 1ZGEA 1CNGA 1G54A 5DSOA 4G0CA 3BL0A 1ZNCA 4Q0LA 3DCWA 1I9QA 4XZ5A 1LGDA 2CABA 3IEOA 1IF5A 5FNJA 1OKNA 3MZCA 1KEQA 1RJ6A 2OSMA 4FVOA 1J9WA 4MLXA 5DRSA 3RYZA 1ZSCA 3HS4A 4QK3A 3MHLA 1JV0A 3N4BA 2NNGA 4XFWA 5JEPB 5EHWA 4R59A 1G0EA 1I9LA 4MDMA 4Q7PA 2HKKA 4ILXA 1JD0A 3RGEA 2HFWA 1CRAA 5FNKA 4KNIA 1CAJA 1CVAA 2EU2A 3S75B 1OKLA 4RIUA 4R5BA 1RZEA 2POWA 5FLQA 4QJOA 5L3OA 3T82A 3KKXA 5JGSB 3PJJA 3MNAA 3DA2A 3VBDA 2H4NA 4RN4A 3K34A 2HNCA 1KOQA 4BCWA 1MUAA 5JEGB 1XQ0A 3RZ5A 1HECA 4LU3A 4FPTA 4KUWA 4Q07A 5EZTX 3SBHA 1CINA 4M2UA 2CBCA 1CVBA 3F7BA 4ZWYA 4N16A 2IT4A 3M5TA 3F4XA 5CACA 2NMXA 4YXUA 3MDZA 5DSPA 2CBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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