4Q7SA

Crystal structure of 1-hydroxy-4-methylpyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q7sA00
3P5LA 1ZH9A 2HNCA 1TBTX 3MMFA 5SZ3A 4R5BA 2POWA 4L5VA 3T84A 1FQLA 4QSJA 1OKMA 2Q1BA 3V5GA 3MHOA 5FLTA 1BNQA 5DRSA 1XQ0A 3NB5A 4KAPA 2WEHA 3F4XA 5DSLA 1HCAA 1ZGEA 1BN1A 1CAKA 4XIXA 2QO8A 3M1WA 4Q49A 4QK2A 5EKJA 4L5WA 5JGSB 3PJJA 5EHWA 1G1DA 3U7CA 4N16A 5AMLA 1FR7A 4E3DA 3S9TA 4YHAA 4E4AA 4FIKA 1I9MA 4ZX0A 4WL4A 3B1BA 1ZNCA 1TB0X 2HOCA 5J8ZA 1RZAA 3RZ1B 2POUA 2WEOA 1CAJA 1I90A 5E2RA 4JSWA 1AVNA 4Q06A 2WD2A 5EZTX 3HKNA 3L14A 1DCAA 5E2MA 2GEHA 1EOUA 5EH8A 2FOVA 4PXXA 1UGCA 4QSAA 1CIMA 2NN7A 4QK1A 5FLSA 5FNMA 4JSSA 4K0SA 3NI5A 4PQ7A 2NXRA 4YXOA 1BN4A 3RZ7A 5G0BA 4E3FA 3DA2A 3IBLA 4HT2A 4Q81A 1LUGA 3OYSA 3M1KA 2CBAA 1ZSBA 5JEPB 4Q99A 5BRUA 1FSQA 3IGPA 5IPZA 4CNVA 3K2FA 5FLPA 4M2WA 3MNIA 1G53A 3F8EA 4CQ0A 3SBIA 1LG6A 2EZ7A 2NNGA 1CAMA 3HLJA 5BNLA 3TVNX 1YO0A 1LG5A 4QSIA 1CAIA 2QP6A 5DOGA 4KV0A 5E5UA 5SZ0A 3KIGA 4JS6A 3D93A 1UGGA 2H4NA 3OKVA 4Q8YA 3PYKA 1CNWA 5JG3B 3D0NA 3DVBA 3MHLA 1FQRA 1IF5A 2FOYA 3T83A 4LP6A 3KS3A 1YDBA 4Q87A 5CLUA 1CNKA 1Z93A 1G48A 4YGLA 2FOSA 4KNNA 3W6HA 2CBEA 3BL1A 5E28A 3OKUA 1RZBA 4ETQC 4ITPA 4RFCA 3MNHA 5G0CA 4RFDA 1I9LA 3TVOX 3SAXA 1CCSA 5DSJA 1RZCA 5DSIA 5E2SA 1RZEA 4XZ5A 5G01A 4QJWA 1XPZA 5CJFA 5DSKA 1AZMA 1UGBA 3S75B 4Q78A 5EOIA 1HUHA 5LMDA 8CA2A 1RZDA 3T5ZA 1CILA 4Q83A 3IBUA 3CAJA 1YDDA 4FU5A 3UYNA 5BRWA 5SZ1A 4MDGA 3FE4A 1CALA 1CVHA 3CA2A 1CRAA 3KOIA 2FNMA 5EH7A 4MDMA 12CAA 1OQ5A 5G03A 4Q7SA 1F2WA 4HU1A 2FMGA 1BICA 5BRVA 4G7AA 4RIVA 4M2RA 1V9EA 3EFIA 2AX2A 4HF3A 4E9OX 1UGAA 3V3GB 1TTMA 4YXUA 2ZNCA 3DAZA 1H9NA 1BZMA 5FLRA 5EHVA 3M2XA 2OSMA 1BN3A 2GD8A 3MWOA 4UOVA 3SAPA 1CRMA 4E5QA 3F7UA 2NWZA 4QJOA 2NXSA 3N2PA 4XIWA 2QOAA 3RYZA 5JEGB 3MNJA 3S74B 4BF6A 4JSZA 1HVAA 3N4BA 2Q38A 1IF7A 3P5AA 4YX4A 2NN1A 5JEHB 3V3FA 5DOHA 1I91A 1IF9A 5JQTA 3HKQA 4M2VA 4FVNA 5FL6A 2Q1QA 3FFPX 4WR7A 4KUVA 2NNVA 3M5SA 4Z1JA 1CZMA 1FQMA 1HEAA 4QY3A 4ITOA 2EU2A 5DSRA 5FDIA 4KP5A 3V2JA 2WEJA 5EHEA 1CINA 3MZCA 3KONA 2NWOA 2F14A 3QYKA 3S78B 4CNWA 3M2YA 4E3GA 3SBHA 1DMYA 1T9NA 1CA2A 3OY0A 3EFTA 4ZAOA 3CZVA 1TEUX 1TG3A 3ML2A 3D9ZA 4E49A 1CNYA 3MNAA 4IWZA 1I9NA 3T85A 3Q31A 1YDAA 2NNOA 4LU3A 3HKTA 4WW6A 3RZ0B 4Q8ZA 1I8ZA 4QK3A 1G52A 4MTYA 1DMXA 4YVYA 2X7UA 1LZVA 5C8IA 3RYVB 1THKA 3DV7A 3JXHC 1OKLA 1A42A 2FOUA 3MHIA 2AW1A 4KP8A 3T82A 3OILA 5AMDA 1YO2A 5SZ2A 5FNLA 4RUZA 1G0FA 1HCBA 4M2UA 4QIZA 4R59A 4FVOA 2NWPA 4HEWA 1XEGA 4BF1A 3M04A 5SZ4A 3M5TA 3MHCA 3M3XA 5SZ6A 5DSQA 4HBAA 5E2NA 4RH2A 3M67A 2OSFA 3KKXA 3DVDA 3RG3A 1BNUA 4MLXA 3U47A 3MYQA 3RGEA 4K0ZA 4XFWA 2IT4A 1FSRA 4Q6EA 4Q9YA 3ZNCA 2POVA 4Q08A 1YO1A 2FOQA 3D92A 4RUYA 1URTA 3K7KA 4TWMA 4HEZA 1KEQA 2WEGA 1CAZA 3B4FA 3HS4A 4Q7WA 1BCDA 3W6IA 2EU3A 5A6HA 1JD0A 1TEQX 3RYJB 1KOPA 4KUWA 1CCTA 1MUAA 4ZWXA 4WUQA 4PZHA 6CA2A 1RJ6A 3P44A 4FPTA 4ZWZA 1TH9A 5DSPA 4Y0JA 3M2NA 4ZX1A 3DCWA 3M14A 5FNJA 4G0CA 1CAOA 1BNVA 3S8XA 1G6VA 4YGKA 1CNGA 4R5AA 1CNHA 2WD3A 5FDCA 2NMXA 1HUGA 3BL0A 3KWAA 4YYTA 3V3HB 1CANA 3V3IB 1CNIA 1CVEA 1IF4A 3IAIA 1HECA 3C7PA 3KLDB 4Q6DA 5CACA 3RZ8A 5A25A 3UYQA 4DZ9A 1JCZA 1ZE8A 5FLOA 2CABA 2VVAX 4JSAA 4ILXA 7CA2A 4XE1A 3IBNA 2FNNA 4QTLA 4RUXA 4Q07A 2CBCA 1J9WA 3P3JA 5EH5A 3OIMA 5SZ7A 3MDZA 3OYQA 4KNMA 4KNJA 4COQA 2HFWA 5FNIA 3GZ0A 1OKNA 3R17B 4MLTA 4K0TA 5L6KA 5AMGA 3M1JA 1LGDA 1G54A 1UGEA 4Z1NA 3HKUA 2FMZA 3N0NA 3M1QA 2W2JA 1KWQA 4CNRA 4PYXA 4QSBA 4Q7VA 1DCBA 3M5EA 4CACA 1G46A 4L5UA 5JESB 4YXIA 5FNKA 4QJMA 3P4VA 4K1QA 3V3JA 3S71B 4YGJA 1TE3X 1CA3A 3D8WA 1HEDA 1G0EA 4LHIA 3N3JA 5CA2A 2NNSA 5JQ0A 5E2KA 5SZ5A 1UGDA 4KNIA 3P3HA 5DSMA 2CBDA 1ZFQA 3DVCA 3DC9A 4TWLA 4CA2A 5E5RA 3JXFA 4QJXA 1Z9YA 1BNTA 1KWRA 4Q0LA 3P58A 1UGFA 3V2MA 1TG9A 4QEFA 1CNBA 3IEOA 1H9QA 4CNXA 3FW3A 3RLDA 4QJPA 2CBBA 1BNMA 2NXTA 1RJ5A 1IF8A 2O4ZA 4WUPA 4YWPA 4IDRX 1ZGFA 1G4JA 1AM6A 3BETA 5FL5A 1FLJA 5EKMA 4K13A 5FNHA 4FRCA 1CVAA 1MOOA 2X7SA 1ZSAA 2ABEA 3F7BA 9CA2A 4N0XB 1IF6A 3JXGA 4QJ0A 1RAYA 5EIJA 1CAYA 5EKHA 5DSNA 5BYIA 4Q7PA 4ZWYA 1G45A 4Z1EA 3P55A 4KUYA 1ZSCA 3S76A 3DCCA 1HEBA 1FQNA 3CYUA 1G4OA 3DD8A 5DVXA 5FLQA 3RYXB 1JV0A 4YGNA 4WW8A 5L3OA 4Z0QA 4GL1X 3KOKA 2HL4A 3RZ5A 4PYYA 3ZP9A 4HEYA 3VBDA 3S72B 4C3TA 3TMJA 4DZ7A 3KNEA 3M40A 3M96A 4YGFA 1CVFA 2FNKA 5FNGA 4Q8XA 5JGTB 3MNKA 3PO6A 3RJ7A 3R16A 4QIYA 3HFPA 4HT0A 4RN4A 2HKKA 1CCUA 1CNCA 1BNNA 3DC3A 4RIUA 1CAHA 1CVCA 4Q90A 5FL4A 2NWYA 4BCWA 1H4NA 1Y7WA 4FL7A 3DBUA 1RAZA 3RG4A 3T5UA 1KOQA 3M98A 3RYYA 5DSOA 1YDCA 2H15A 1I9PA 3V7XA 2ILIA 2CA2A 1CVBA 3S73B 3DD0A 1CNXA 3ML5A 4MDLA 3DCSA 3U3AX 3IBIA 3S97A 4Z1KA 3M2ZA 5JG5B 3LXEA 1BNWA 4ZWIA 3MNUA 3OIKA 1CNJA 1BV3A 1CVDA 1V9IC 3U45X 1XEVA 4X5SA 3MHMA 1ZFKA 1I9QA 2VVBX 2FW4A 1FR4A 5JDVB 4MO8A 5HPJA 1G3ZA 2HD6A 1Z97A 1I9OA 1FSNA 3NJ9A 4E3HA 3K34A 3S77B 2X7TA 4Q09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P5L A;  1ZH9 A;  2HNC A;  1TBT X;  3MMF A;  5SZ3 A;  4R5B A;  2POW A;  4L5V A;  3T84 A;  1FQL A;  4QSJ A;  1OKM A;  2Q1B A;  3V5G A;  3MHO A;  5FLT A;  1BNQ A;  5DRS A;  1XQ0 A;  3NB5 A;  4KAP A;  2WEH A;  3F4X A;  5DSL A;  1HCA A;  1ZGE A;  1BN1 A;  1CAK A;  4XIX A;  2QO8 A;  3M1W A;  4Q49 A;  4QK2 A;  5EKJ A;  4L5W A;  5JGS B;  3PJJ A;  5EHW A;  1G1D A;  3U7C A;  4N16 A;  5AML A;  1FR7 A;  4E3D A;  3S9T A;  4YHA A;  4E4A A;  4FIK A;  1I9M A;  4ZX0 A;  4WL4 A;  3B1B A;  1ZNC A;  1TB0 X;  2HOC A;  5J8Z A;  1RZA A;  3RZ1 B;  2POU A;  2WEO A;  1CAJ A;  1I90 A;  5E2R A;  4JSW A;  1AVN A;  4Q06 A;  2WD2 A;  5EZT X;  3HKN A;  3L14 A;  1DCA A;  5E2M A;  2GEH A;  1EOU A;  5EH8 A;  2FOV A;  4PXX A;  1UGC A;  4QSA A;  1CIM A;  2NN7 A;  4QK1 A;  5FLS A;  5FNM A;  4JSS A;  4K0S A;  3NI5 A;  4PQ7 A;  2NXR A;  4YXO A;  1BN4 A;  3RZ7 A;  5G0B A;  4E3F A;  3DA2 A;  3IBL A;  4HT2 A;  4Q81 A;  1LUG A;  3OYS A;  3M1K A;  2CBA A;  1ZSB A;  5JEP B;  4Q99 A;  5BRU A;  1FSQ A;  3IGP A;  5IPZ A;  4CNV A;  3K2F A; 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