4Q87A

Crystal structure of 1-hydroxy-4-(trifluoromethyl)pyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q87A00
2VVBX 1ZNCA 4PYXA 2NXRA 4CQ0A 4QSAA 4FVNA 1ZH9A 1BN4A 3M1JA 3S73B 4M2WA 4Y0JA 5SZ6A 2NXTA 1IF7A 4KP5A 1HUHA 3M98A 2NMXA 4HT2A 1XEVA 2CA2A 4PYYA 3M40A 5DSMA 3RYJB 3K7KA 3M96A 3MHMA 5E2SA 3UYQA 2NWPA 4Q0LA 3V3GB 5DSIA 3DCWA 1RZEA 4M2RA 3UYNA 1RAYA 4LHIA 2HNCA 1HVAA 3IBNA 5AMLA 1BICA 5DSNA 2HOCA 5FLTA 4RN4A 3JXHC 3MYQA 3SAXA 4YXOA 4QIYA 3F7BA 1HEBA 5BRWA 4YGFA 1UGCA 3V3FA 4ZX0A 4E4AA 1Z9YA 2NXSA 4ILXA 4JSWA 5DOGA 1OKLA 4E3GA 1BNVA 1CCTA 2O4ZA 1EOUA 3RLDA 3S8XA 5EKHA 3EFIA 5DSOA 1CAIA 3IGPA 4HU1A 1CNCA 3M3XA 1UGDA 3KLDB 3F7UA 3MNUA 5FNMA 4XZ5A 5SZ4A 3Q31A 3RG3A 4JS6A 2X7TA 4G0CA 4HBAA 1HUGA 3DV7A 1TH9A 5EIJA 1Z93A 4Z1JA 1KWRA 4MDLA 3FW3A 5G03A 3SAPA 1CNBA 3D9ZA 3N2PA 4UOVA 1G1DA 3HKUA 1V9EA 2FOVA 1CA2A 3DC9A 1YDAA 4WW8A 5E5UA 3K2FA 3SBHA 2IT4A 12CAA 3MDZA 1LZVA 2WD2A 3V3JA 1KOQA 1CA3A 3SBIA 1ZGEA 2FOSA 3KIGA 4C3TA 5EH5A 3NJ9A 1UGBA 5JEPB 2AW1A 4HF3A 4Q07A 3BL0A 4TWMA 4PXXA 2VVAX 4X5SA 3NI5A 3T84A 4E5QA 1V9IC 1IF6A 3M5TA 4WUPA 1CVAA 1RZAA 3EFTA 5E28A 5C8IA 1LUGA 2X7SA 5EHVA 1G6VA 5LMDA 4QJMA 4ZAOA 1KEQA 1H4NA 3BL1A 5JG3B 3JXGA 4N16A 1RZCA 4QSIA 3TVNX 2NWZA 6CA2A 1FQRA 5FNIA 1CZMA 1XPZA 1BCDA 2HKKA 5EOIA 5E2RA 3P3HA 1LG5A 3NB5A 4ZX1A 5JG5B 3F4XA 4RFDA 1UGFA 1FSRA 2FNNA 4Q8ZA 5CLUA 1FQMA 1IF4A 3MNJA 2Q1BA 4Q7SA 1CAKA 1RJ5A 4MO8A 1TE3X 4Q78A 5EHEA 1G45A 4QK1A 4HEWA 1CNYA 1G54A 2FOYA 3KWAA 1G52A 1OQ5A 2ABEA 3DBUA 3IBIA 1G3ZA 3M14A 5JQTA 3T85A 4Q7WA 3T5UA 3RZ8A 3D0NA 3M2NA 3RYYA 4LU3A 4FL7A 3RGEA 5SZ1A 4Q8XA 3P3JA 4K0ZA 1CNKA 2NWYA 1UGGA 2X7UA 2EZ7A 3DC3A 3V3HB 5L3OA 3DVBA 1FR7A 4LP6A 4KUYA 1XQ0A 4FU5A 4L5WA 4RUYA 2AX2A 1DCAA 2F14A 1I91A 2FMZA 3KNEA 4K0TA 3OY0A 5FDIA 1ZSBA 4WUQA 4M2UA 4XIWA 4HT0A 4KAPA 3N4BA 3P55A 2QOAA 4QK2A 5DRSA 2CBCA 3RYXB 2NNSA 3V7XA 1MOOA 3FE4A 4K13A 5JESB 1FSNA 1CAOA 1G0EA 4Q87A 4YGKA 3CAJA 3DAZA 1G4JA 4Q49A 3D8WA 4MDGA 1YDDA 5BNLA 4E3FA 3CZVA 4ZWXA 3D93A 5FLRA 1CRAA 2QP6A 3OIMA 5L6KA 5SZ3A 3K34A 3N3JA 1TG9A 4JSSA 4KNNA 3MZCA 3ZP9A 4R5BA 2EU2A 4ZWYA 4Q6EA 1CNHA 5DSLA 1DMXA 4Q7VA 3W6HA 4WW6A 1CVBA 1CNGA 1BNQA 4YHAA 1J9WA 3IEOA 3M1QA 5DSJA 3MHCA 4FVOA 5HPJA 5SZ2A 8CA2A 5FNJA 4YGJA 3N0NA 4QJ0A 1CVFA 3MHLA 4COQA 3OKVA 4Q8YA 5E2KA 1LG6A 1XEGA 1BNTA 2FOQA 3M5EA 4Z1NA 2HD6A 4HEYA 1BZMA 2ILIA 4E49A 1G48A 3MNHA 3IAIA 1MUAA 3DD0A 2ZNCA 3RZ7A 3MNKA 3BETA 5SZ0A 1DMYA 2NNGA 3P4VA 1T9NA 4QJWA 1JD0A 3DD8A 4QJOA 5DOHA 1OKNA 4XE1A 2CBDA 2NN7A 3P44A 1ZFKA 4TWLA 4Q08A 4JSAA 3OYQA 3VBDA 3TMJA 3KOIA 3GZ0A 4RUZA 4DZ9A 1RJ6A 3MNAA 3M2ZA 1YO2A 1I90A 3U47A 2WEJA 3R17B 5FNLA 1FSQA 1YO0A 2HL4A 4FPTA 3RYVB 3S9TA 3RZ5A 4QJXA 4ETQC 1CAZA 1BNMA 3M5SA 4L5VA 1TEUX 4MLTA 3MHIA 2Q1QA 1AM6A 1TB0X 3KS3A 2QO8A 4Q09A 3M67A 5DSKA 3CA2A 7CA2A 4MDMA 1ZE8A 1BN3A 1CCUA 4ITPA 1LGDA 4XIXA 3MNIA 2NNOA 4RUXA 5FLPA 3T82A 2GEHA 3RYZA 1I9QA 1TTMA 5FDCA 3P5LA 1CVEA 2CBEA 1G53A 1IF9A 2GD8A 3T83A 4CACA 5BRVA 1I9LA 4N0XB 1TBTX 5DSQA 1CNJA 1HEAA 3CYUA 5DVXA 3M2YA 5FLSA 4Z1EA 5E5RA 4WR7A 4RIVA 1FQNA 1CVHA 1URTA 3PJJA 5EHWA 5FLQA 4MLXA 3HLJA 4RFCA 1CVDA 3HFPA 3KOKA 1FQLA 4RH2A 3IBLA 4YXUA 4YGLA 1THKA 5A25A 1CNIA 3QYKA 4IDRX 3P58A 5BRUA 2WEGA 1UGEA 3V2JA 1CNWA 4K1QA 4QSBA 5G0BA 4GL1X 4YVYA 3T5ZA 3IBUA 5J8ZA 4QSJA 5EKMA 2W2JA 3B1BA 1IF5A 2FNMA 3DVDA 3OKUA 3D92A 4Q83A 4CA2A 2POVA 3U7CA 3U3AX 4G7AA 1ZFQA 4E3DA 4YGNA 5JEGB 5FL6A 4PZHA 5JDVB 1CAYA 1ZSCA 4Q99A 4QK3A 3OIKA 1TG3A 1ZSAA 3RZ0B 5AMDA 2FOUA 3L14A 5BYIA 2HFWA 4ITOA 2FNKA 3U45X 3F8EA 1I9PA 4Z0QA 1I9OA 4Q6DA 5CACA 1CRMA 1YDCA 5DSRA 5SZ7A 4BF1A 4QIZA 1I9MA 1BN1A 5SZ5A 1AVNA 1UGAA 1CINA 2NWOA 3MWOA 3S77B 1CIMA 4FRCA 3MMFA 1A42A 1CILA 1OKMA 4KP8A 4ZWIA 5EZTX 5AMGA 4BF6A 1BNWA 2OSMA 4XFWA 1G0FA 3HKTA 1G4OA 3M04A 5E2NA 1CAHA 1Y7WA 3DCSA 1CAMA 1FLJA 1CVCA 1BNUA 3PO6A 1YO1A 3RJ7A 4R59A 1I9NA 3S76A 4RIUA 4KUWA 4KNIA 1I8ZA 2EU3A 4Q90A 5JQ0A 3R16A 4QY3A 3HKNA 1CANA 2WD3A 5FL5A 4YYTA 4FIKA 3OILA 3RG4A 4MTYA 2CABA 5EH7A 9CA2A 5JGSB 2FMGA 1H9NA 1HECA 4M2VA 5FLOA 3S97A 4Q7PA 3DVCA 4L5UA 3M1KA 3KONA 3LXEA 1YDBA 2POWA 3S75B 3JXFA 2POUA 3S71B 5EH8A 3V5GA 1KWQA 2WEOA 4ZWZA 5FNGA 1BV3A 3MHOA 1CAJA 5EKJA 1G46A 3W6IA 2FW4A 1ZGFA 2CBBA 5G01A 4WL4A 1TEQX 3B4FA 3DA2A 1CALA 5E2MA 1F2WA 1JV0A 1HCBA 4PQ7A 2CBAA 4YXIA 1HEDA 1CCSA 1Z97A 4YWPA 3ZNCA 3S78B 1IF8A 2H15A 5DSPA 3S74B 4Q9YA 3V2MA 4CNXA 2H4NA 4YX4A 5FL4A 5CA2A 4CNRA 4BCWA 4QTLA 4K0SA 3RZ1B 4E9OX 3V3IB 3PYKA 1FR4A 4Q06A 3M2XA 4R5AA 1RAZA 4HEZA 3C7PA 3S72B 4IWZA 3M1WA 4KV0A 1H9QA 1KOPA 3OYSA 1RZBA 4DZ7A 2WEHA 3KKXA 3FFPX 4JSZA 5FNHA 2Q38A 5IPZA 4KUVA 3ML2A 3P5AA 4KNMA 3ML5A 4KNJA 1JCZA 2OSFA 4Z1KA 5JEHB 4CNWA 5FNKA 4CNVA 1DCBA 2NN1A 5CJFA 5A6HA 1RZDA 5G0CA 5JGTB 1AZMA 3HS4A 4QEFA 4Q81A 3HKQA 4QJPA 1BNNA 3DCCA 4E3HA 1CNXA 1HCAA 3TVOX 2NNVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVB X;  1ZNC A;  4PYX A;  2NXR A;  4CQ0 A;  4QSA A;  4FVN A;  1ZH9 A;  1BN4 A;  3M1J A;  3S73 B;  4M2W A;  4Y0J A;  5SZ6 A;  2NXT A;  1IF7 A;  4KP5 A;  1HUH A;  3M98 A;  2NMX A;  4HT2 A;  1XEV A;  2CA2 A;  4PYY A;  3M40 A;  5DSM A;  3RYJ B;  3K7K A;  3M96 A;  3MHM A;  5E2S A;  3UYQ A;  2NWP A;  4Q0L A;  3V3G B;  5DSI A;  3DCW A;  1RZE A;  4M2R A;  3UYN A;  1RAY A;  4LHI A;  2HNC A;  1HVA A;  3IBN A;  5AML A;  1BIC A;  5DSN A;  2HOC A;  5FLT A;  4RN4 A;  3JXH C;  3MYQ A;  3SAX A;  4YXO A;  4QIY A;  3F7B A;  1HEB A;  5BRW A;  4YGF A;  1UGC A;  3V3F A;  4ZX0 A;  4E4A A;  1Z9Y A;  2NXS A;  4ILX A;  4JSW A;  5DOG A;  1OKL A;  4E3G A;  1BNV A;  1CCT A;  2O4Z A;  1EOU A;  3RLD A;  3S8X A;  5EKH A;  3EFI A;  5DSO A;  1CAI A;  3IGP A;  4HU1 A;  1CNC A;  3M3X A;  1UGD A;  3KLD B;  3F7U A;  3MNU A;  5FNM A;  4XZ5 A;  5SZ4 A;  3Q31 A;  3RG3 A;  4JS6 A;  2X7T A;  4G0C A;  4HBA A;  1HUG A;  3DV7 A;  1TH9 A;  5EIJ A;  1Z93 A;  4Z1J A;  1KWR A;  4MDL A;  3FW3 A;  5G03 A;  3SAP A;  1CNB A;  3D9Z A;  3N2P A; 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