4QJPA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with inhibitor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qjpA00
1I90A 4KP5A 1FQRA 3RJ7A 4Q07A 4R59A 1BCDA 1CANA 3DBUA 5AMLA 5EKMA 5FLOA 4MLXA 3EFIA 1CNBA 4RN4A 1FLJA 4Q8ZA 1CVHA 2ZNCA 2W2JA 1CNJA 3RZ5A 5JDVB 3MNIA 3V3FA 1RAZA 3OIKA 1LGDA 4PQ7A 4MO8A 3IBIA 3N2PA 1UGGA 5BRUA 2FMZA 5AMDA 3M98A 4QJWA 3P4VA 1BV3A 1HECA 2FOVA 5CJFA 4CNXA 4PYYA 3RG3A 5E5RA 1IF4A 5G0BA 3UYQA 3HKTA 1HEBA 2HKKA 3BETA 3M1WA 1OKNA 4YVYA 1HEDA 2NWPA 3S77B 4M2UA 2HFWA 4WUPA 3P55A 1CCUA 4PZHA 1CINA 1JV0A 3V5GA 4JSSA 3MNUA 1CVEA 1G52A 3DCCA 3DVDA 4ZAOA 2NWYA 1KWQA 3MHOA 3V7XA 4QEFA 1CVCA 3SAPA 5FLSA 1RZBA 3S76A 4QJOA 2WD2A 3PO6A 4FU5A 1DMXA 1I91A 1RZCA 3CAJA 4E49A 5CA2A 3V3IB 7CA2A 1I9LA 3NJ9A 2HL4A 1DCBA 3SBHA 4K13A 3M5SA 1ZFQA 4JSWA 4BCWA 4N16A 4RH2A 1FQNA 2NN1A 4UOVA 1TH9A 4ETQC 2WEGA 3DCSA 3OY0A 12CAA 1CCTA 1CAYA 4ZWYA 3IBNA 4MDMA 2X7UA 5E2MA 5LMDA 1CALA 4PYXA 4QSJA 1CVAA 2Q1BA 1I9NA 1BNQA 5JG3B 4CNVA 3RZ8A 4E9OX 4QSBA 1FSNA 3D0NA 4GL1X 1OKLA 4ITPA 1IF6A 5FNMA 4KUWA 3W6HA 1G0EA 4ZX1A 4ZX0A 4Q9YA 1H9QA 5CLUA 1G48A 3RG4A 3T5ZA 3MZCA 1LG5A 1J9WA 3EFTA 4KP8A 3SBIA 2WEOA 4Q7WA 5JQ0A 1RJ6A 2CBEA 4TWLA 4Q6EA 1KEQA 4X5SA 4MLTA 4M2VA 1YDAA 5DSOA 2X7SA 3F7BA 4YGLA 4YGKA 3V3JA 4MDGA 4WUQA 3CZVA 1H9NA 3U47A 3M96A 4QJMA 2FOQA 5DSPA 3TVOX 1BN3A 1HUGA 1G0FA 2NWOA 1TE3X 5JEPB 1CAOA 3DD0A 1HCBA 3M5EA 2CBCA 4FIKA 4Q81A 1UGBA 3FE4A 3K7KA 5EHWA 5G0CA 3JXHC 2NNOA 4FPTA 3NI5A 2CBDA 4HEZA 4YGJA 3IAIA 3KONA 1CRMA 4QSIA 5FNLA 3F4XA 5A25A 1RAYA 4Q83A 1CCSA 1MUAA 2FNMA 4K0SA 5EH8A 3SAXA 1AZMA 3T85A 4K1QA 2NMXA 3D8WA 4QTLA 3NB5A 1HCAA 5FL5A 1ZFKA 2HD6A 3OKVA 5E2KA 2H15A 1XEGA 2NWZA 5EH5A 1CAJA 2QP6A 4Q0LA 4COQA 1YO2A 2NXRA 3Q31A 3P5LA 3TVNX 5SZ6A 1CNHA 1Y7WA 5FLPA 3RYYA 2NNVA 3M5TA 3V3HB 5HPJA 3N4BA 4QSAA 4YXOA 1CAHA 1KOQA 5SZ5A 2POVA 1HUHA 2ILIA 1ZH9A 3MDZA 1LZVA 5E2RA 1I9OA 3MYQA 2NN7A 1CNIA 2NNSA 3DAZA 1CNGA 4FRCA 5FL4A 1CVBA 1I8ZA 1V9IC 4WW8A 5DSLA 3MNJA 8CA2A 3MHLA 3DV7A 4KUVA 4ZWIA 3IGPA 3B1BA 4CNWA 5SZ2A 4ZWZA 4E3HA 5C8IA 2QOAA 1CAZA 3DC9A 2CA2A 3D92A 3ML2A 4XFWA 4YXUA 5BRWA 1ZE8A 3FFPX 5L3OA 4CNRA 9CA2A 3MHIA 4RUYA 4BF6A 1FSQA 4Q7PA 5G03A 1CNKA 2H4NA 5L6KA 3RGEA 2FMGA 3UYNA 4Z1EA 2CBAA 4Q8XA 5FLQA 4QIZA 3HKUA 1FQMA 1CAKA 3M2XA 1G4JA 3DD8A 1IF9A 3MNAA 3V2MA 3K34A 3OILA 4JSZA 1CVFA 4FVNA 3MNHA 4HBAA 1ZSCA 4JS6A 2OSFA 5FNIA 3S74B 3M1QA 1UGCA 3ZNCA 1CRAA 3N0NA 3HKNA 3C7PA 4HF3A 5SZ7A 5FNHA 5DSQA 1V9EA 1YDCA 3M2NA 3M67A 5FNJA 1CAMA 5BYIA 4Q87A 4QJ0A 1Z93A 2FNNA 3S73B 4ITOA 4DZ9A 5IPZA 3F7UA 4QJPA 5EZTX 1FQLA 3KOIA 1BNTA 1ZGFA 5EOIA 3P5AA 5E2SA 1I9MA 5JQTA 3M3XA 1ZNCA 3DC3A 2HNCA 4L5VA 5DSJA 5FNGA 3D93A 5J8ZA 1RJ5A 4YXIA 2POWA 2Q38A 3QYKA 5FDCA 5SZ4A 5A6HA 2EZ7A 1IF5A 1XEVA 4QJXA 1OQ5A 3RYJB 1DMYA 3DVCA 3HKQA 4HEYA 5JG5B 1URTA 1AM6A 5FNKA 3K2FA 4K0TA 3KLDB 1TB0X 3M1JA 4CACA 5E28A 1G54A 3MWOA 4Q78A 3KOKA 3MNKA 2OSMA 3MHCA 4QY3A 5EIJA 3M40A 4ILXA 3V2JA 1G4OA 2F14A 3DA2A 4TWMA 3PYKA 1YDDA 3OYSA 5EHEA 4WL4A 5E5UA 1TG9A 1A42A 1XQ0A 1ZSBA 1RZEA 1CZMA 2EU3A 5JEGB 4Q08A 3R17B 1CNXA 3T82A 2WD3A 3P58A 3KWAA 1AVNA 4KNJA 4RUXA 4JSAA 5DOHA 1TEUX 3P44A 4MTYA 5DOGA 3OIMA 1FR4A 4FL7A 1CNYA 1CAIA 1IF7A 1BNUA 3PJJA 3D9ZA 3ZP9A 4C3TA 1YO1A 4QIYA 4RFCA 2EU2A 4KAPA 1EOUA 2NNGA 1YDBA 2QO8A 4IDRX 1G46A 2X7TA 4QK3A 5DVXA 2O4ZA 4YYTA 3U45X 5FLTA 4Q7SA 4XE1A 2IT4A 1UGEA 2ABEA 4KNNA 2FW4A 4Z1JA 3IEOA 5EH7A 1BN4A 3DVBA 3U3AX 1CILA 4Q6DA 4E4AA 4M2WA 5G01A 4BF1A 1Z97A 4MDLA 2VVBX 1UGFA 4L5UA 3RZ1B 4R5BA 1CVDA 4PXXA 1JD0A 4YX4A 4M2RA 2VVAX 3HS4A 3RZ7A 4Q7VA 3RLDA 3RYVB 3V3GB 1KOPA 5EKJA 3JXGA 1FR7A 5JGSB 1THKA 3OYQA 1XPZA 1OKMA 5E2NA 1JCZA 1RZAA 4WR7A 3BL1A 3LXEA 1BNVA 3CYUA 2NXSA 3KKXA 3M04A 2Q1QA 3S72B 2GEHA 4HT0A 3VBDA 3JXFA 5BRVA 2CBBA 2AX2A 3M2ZA 3CA2A 1HVAA 4HU1A 2FNKA 4ZWXA 3RYXB 4KNMA 2CABA 1UGAA 4YHAA 4Z0QA 4Q49A 4HT2A 3KS3A 5EKHA 3T84A 6CA2A 4R5AA 4LP6A 4Q8YA 4QK2A 4HEWA 3S78B 4Z1NA 4RIUA 4RIVA 1BN1A 5SZ1A 1BNNA 4K0ZA 4Y0JA 4Z1KA 5BNLA 2GD8A 3DCWA 5FLRA 4XZ5A 4DZ7A 5JEHB 3RZ0B 4G7AA 3TMJA 1LUGA 1UGDA 4LU3A 5FDIA 5FL6A 3S97A 3BL0A 4Q99A 2FOUA 3T83A 3P3JA 4KUYA 4RUZA 1I9PA 1TG3A 4IWZA 4XIXA 4CQ0A 4Q06A 3U7CA 3B4FA 1TBTX 4QK1A 1TEQX 4LHIA 1CA2A 1G3ZA 1RZDA 1T9NA 3W6IA 3M2YA 1G45A 1HEAA 5DSRA 3KIGA 3F8EA 3N3JA 3R16A 4RFDA 3ML5A 3MHMA 3S75B 4YGNA 3M1KA 1MOOA 3T5UA 3KNEA 3OKUA 4E3FA 3GZ0A 4FVOA 4YWPA 5DSNA 3S71B 1G53A 1CIMA 1BNMA 1Z9YA 1DCAA 1I9QA 1ZSAA 5EHVA 5JESB 3L14A 5DSKA 3HLJA 4WW6A 5DRSA 3M14A 1ZGEA 3IBLA 4KV0A 5JGTB 5DSMA 1KWRA 4Q90A 2POUA 4Q09A 4N0XB 1CNCA 3HFPA 1LG6A 5AMGA 3P3HA 1H4NA 1G6VA 3S9TA 1CNWA 3IBUA 3S8XA 4YGFA 1IF8A 1BICA 2NXTA 2FOSA 5DSIA 4E3DA 4L5WA 1FSRA 4G0CA 1BNWA 2AW1A 4E5QA 2FOYA 5SZ3A 4CA2A 4KNIA 1CA3A 2WEJA 1BZMA 2WEHA 1G1DA 3RYZA 4XIWA 3MMFA 4E3GA 1YO0A 5CACA 3FW3A 1TTMA 2HOCA 5SZ0A 1F2WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1I90 A;  4KP5 A;  1FQR A;  3RJ7 A;  4Q07 A;  4R59 A;  1BCD A;  1CAN A;  3DBU A;  5AML A;  5EKM A;  5FLO A;  4MLX A;  3EFI A;  1CNB A;  4RN4 A;  1FLJ A;  4Q8Z A;  1CVH A;  2ZNC A;  2W2J A;  1CNJ A;  3RZ5 A;  5JDV B;  3MNI A;  3V3F A;  1RAZ A;  3OIK A;  1LGD A;  4PQ7 A;  4MO8 A;  3IBI A;  3N2P A;  1UGG A;  5BRU A;  2FMZ A;  5AMD A;  3M98 A;  4QJW A;  3P4V A;  1BV3 A;  1HEC A;  2FOV A;  5CJF A;  4CNX A;  4PYY A;  3RG3 A;  5E5R A;  1IF4 A;  5G0B A;  3UYQ A;  3HKT A;  1HEB A;  2HKK A;  3BET A;  3M1W A;  1OKN A;  4YVY A;  1HED A;  2NWP A;  3S77 B;  4M2U A;  2HFW A;  4WUP A;  3P55 A;  1CCU A;  4PZH A;  1CIN A;  1JV0 A;  3V5G A;  4JSS A;  3MNU A;  1CVE A;  1G52 A;  3DCC A;  3DVD A;  4ZAO A;  2NWY A;  1KWQ A;  3MHO A;  3V7X A;  4QEF A;  1CVC A;  3SAP A;  5FLS A;  1RZB A;  3S76 A;  4QJO A;  2WD2 A;  3PO6 A;  4FU5 A;  1DMX A;  1I91 A;  1RZC A;  3CAJ A;  4E49 A;  5CA2 A;  3V3I B;  7CA2 A;  1I9L A;  3NJ9 A;  2HL4 A;  1DCB A;  3SBH A;  4K13 A;  3M5S A;  1ZFQ A;  4JSW A;  4BCW A;  4N16 A;  4RH2 A;  1FQN A; 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