4QK2A

Structural and catalytic effects of proline substitution and surface loop deletion in the extended active site of human carbonic anhydrase ii - e234p
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGPGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and catalytic effects of proline substitution and surface loop deletion in the extended active site of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qk2A00
3K34A 3N0NA 2POUA 1OKMA 4XZ5A 4L5UA 1YDCA 2NNSA 1CRMA 1DMYA 1KWQA 4Q0LA 4MDLA 5E2SA 3C7PA 3KOKA 2VVBX 5JG3B 4DZ7A 4E3GA 2NWYA 3M14A 5JGSB 4QJMA 3HKNA 4Q90A 2HFWA 5E28A 1ZFKA 5DOHA 4TWLA 1UGGA 1CAYA 1UGBA 1IF8A 3PJJA 4K1QA 4XFWA 5EH8A 1IF7A 3M5SA 1CCTA 4L5WA 3ML5A 2NN1A 2H15A 3RYZA 4Y0JA 4Q8XA 4N0XB 1CA2A 4ZWYA 5DVXA 1G1DA 4K0SA 4Q8YA 1CVEA 3P3JA 4Q09A 4RIVA 5JQTA 3DCWA 3P44A 4QSJA 5DSMA 1BNTA 4QTLA 4YWPA 1LUGA 3KOIA 3HS4A 4IDRX 1ZGEA 4Q81A 3SBIA 2EZ7A 4KUVA 4WR7A 3SAXA 1TBTX 4E49A 2HOCA 3FE4A 1FR7A 1ZNCA 5JDVB 1BNVA 1TEUX 2NXRA 2OSFA 4YXUA 3S74B 2EU3A 3T83A 2EU2A 3U3AX 4QJWA 2CBCA 3MHMA 3PO6A 3W6HA 5E5UA 5BRUA 3DD0A 3PYKA 1YO2A 3QYKA 5FLTA 4CNVA 3R17B 1CNHA 1XQ0A 1CVAA 1OKNA 3F8EA 5CA2A 5DSJA 1BN3A 1G53A 3IBIA 4YGLA 1CCUA 1LG6A 5G03A 2FOYA 4WW8A 1JD0A 3M1WA 3T5UA 5E2RA 3V2MA 3OY0A 3KWAA 4Q8ZA 4R59A 1KEQA 1HCAA 1UGFA 5EIJA 1DCBA 5FNGA 2CA2A 3MNUA 3RYJB 1KOPA 2X7SA 3M1KA 5FLRA 1CNKA 1CNCA 2CBAA 4ZWXA 1TE3X 3MHIA 1CAZA 4Q7VA 3HFPA 5DSOA 2AX2A 3ZNCA 4QIZA 3DC9A 1FQNA 3DVCA 1G0EA 3Q31A 1I9QA 2FNNA 1RZCA 3HKUA 1IF9A 4M2RA 4HU1A 5EH7A 3EFTA 3S72B 1UGAA 1Y7WA 5EZTX 3RYXB 3MNKA 3CAJA 2VVAX 5FL6A 3S71B 4CACA 4Z1EA 3MDZA 1CNGA 4LHIA 1YDBA 2CBBA 1BZMA 1AVNA 2QOAA 1XEVA 4Q9YA 1IF5A 3UYNA 1CALA 5IPZA 1Z97A 1I9MA 2WD2A 3HKTA 3V3IB 4YYTA 1XPZA 4Q6EA 4MDGA 3DAZA 4K0ZA 1CVDA 1J9WA 1HUGA 2NMXA 3M1JA 3HLJA 3P58A 4KAPA 5JGTB 3UYQA 4Q7PA 5E5RA 3D0NA 4PQ7A 1RJ5A 5BRVA 4E4AA 1BN4A 1CVHA 1G4OA 1CAOA 3M2NA 5C8IA 2W2JA 4PYYA 1CAMA 1CRAA 5E2NA 1I90A 1CAIA 4ZAOA 5SZ6A 5SZ7A 4G7AA 3P3HA 4X5SA 3RZ1B 5FNLA 2WEJA 4GL1X 4Z1KA 4YGJA 5FL4A 1CANA 3KONA 3F7BA 4QJXA 4Q06A 1ZE8A 4E3HA 4QSIA 4HEYA 3TMJA 3S76A 5G0CA 4ETQC 2QP6A 3V3FA 3ZP9A 3S77B 4K0TA 5EKHA 4ILXA 4BF1A 4QK2A 5FLPA 1URTA 3D9ZA 4HT2A 3RLDA 3CA2A 2FOVA 1CVCA 1RZEA 5DSRA 4JSAA 1H9QA 2HD6A 5EH5A 3TVNX 3KNEA 2CBEA 2ZNCA 3DVDA 4RN4A 5FNMA 1CCSA 3IAIA 1FSRA 2FOQA 2CABA 4MDMA 1F2WA 4Q49A 1EOUA 2OSMA 5BRWA 3OYSA 1A42A 3DV7A 3KLDB 3M98A 4Q99A 3RG4A 2X7TA 5FLSA 3IBLA 3MHOA 1YO0A 3MNIA 4Q07A 3V3HB 4Z1NA 4IWZA 4HBAA 2HNCA 1TG9A 4JSZA 1I9PA 2Q1QA 2WEHA 1ZSCA 2NWZA 4FPTA 4HT0A 3F7UA 4ZWIA 3MNAA 1JCZA 1MOOA 1RAYA 1CVBA 1G6VA 4RUXA 1FQMA 1TG3A 5CACA 5DSLA 4JSWA 1G3ZA 4Z0QA 2NWPA 3M5TA 1RZDA 4PYXA 3W6IA 3S8XA 1DCAA 4KUYA 3DC3A 4R5BA 8CA2A 2WEOA 5JESB 1AM6A 3OILA 3P55A 4Q6DA 1TB0X 2H4NA 3JXFA 5FLQA 5FNHA 4Q87A 1RAZA 3FW3A 1CIMA 3JXGA 4QJPA 5EHWA 4YGNA 2FNKA 1BICA 5EKMA 4DZ9A 2NXTA 1HEAA 2GEHA 4QJOA 4Q83A 3BETA 5DSKA 3RZ5A 4UOVA 2HL4A 3RYYA 4KUWA 3MHCA 3DVBA 3MMFA 5BNLA 2NNOA 4HEZA 1CVFA 7CA2A 3S73B 1ZSAA 3OKVA 4Z1JA 2FW4A 3M96A 1G46A 3L14A 4KNJA 4RUYA 1TH9A 3SAPA 4KP8A 4Q78A 3IEOA 1BCDA 1TEQX 2FMGA 4QEFA 4CNWA 3V2JA 4BF6A 1G4JA 4FVNA 1KWRA 4R5AA 5AMDA 2FMZA 3V7XA 3D92A 4PXXA 3LXEA 1KOQA 3VBDA 5AMGA 3M40A 1BNQA 2IT4A 4QK1A 4RFDA 3TVOX 4QY3A 3OIKA 4FVOA 1IF6A 3MZCA 3CYUA 4KNIA 3M04A 5DOGA 1LZVA 5DRSA 3U47A 4KV0A 1FSQA 3M2YA 4HEWA 4XE1A 2NWOA 3P4VA 1CINA 2NNGA 3B4FA 4E3FA 3B1BA 3BL1A 3S78B 3GZ0A 3BL0A 5SZ0A 5BYIA 4LU3A 1H9NA 4ZWZA 4MTYA 4YXIA 4E9OX 1CA3A 3DCSA 1G45A 3KS3A 3T5ZA 4FU5A 5JG5B 1BNMA 4KNNA 3MWOA 9CA2A 4Q7WA 2ILIA 1OKLA 5CLUA 3V3JA 4CNXA 5SZ3A 4JS6A 5DSPA 1LGDA 1HUHA 3MYQA 1BV3A 3IBUA 1HECA 1ZSBA 2F14A 3S9TA 3KIGA 1H4NA 1Z9YA 5FLOA 1HEDA 1HVAA 4Q7SA 1RZBA 1FSNA 1V9IC 1BNWA 2POWA 3MNHA 4XIWA 3HKQA 4QIYA 3K2FA 3OYQA 5LMDA 4M2VA 1TTMA 4MLTA 1YDDA 4RH2A 3U45X 1CAHA 1G48A 5FNIA 3DD8A 4ITPA 4ZX1A 1CNIA 4WL4A 3RZ7A 1UGDA 5EOIA 1XEGA 3M5EA 4FRCA 1CNBA 3S75B 3OIMA 2CBDA 3SBHA 4QJ0A 3OKUA 1CNXA 1HCBA 3KKXA 5A6HA 5CJFA 5HPJA 1V9EA 1ZGFA 1I8ZA 3N2PA 1UGEA 1BN1A 2ABEA 3MNJA 4WUPA 4E5QA 3P5AA 3ML2A 4WW6A 1I9OA 5AMLA 5SZ1A 1G52A 5A25A 4E3DA 4XIXA 3CZVA 5G0BA 5EHVA 1CILA 5L3OA 3S97A 2GD8A 5DSQA 3FFPX 4QSAA 3JXHC 4YX4A 4N16A 3M2XA 3T84A 1HEBA 4JSSA 4RUZA 3T85A 1DMXA 3DBUA 5FDIA 1FR4A 3NJ9A 4Q08A 3M67A 1FLJA 1UGCA 5JQ0A 4K13A 3RZ8A 3EFIA 5SZ2A 2NN7A 4PZHA 1IF4A 4QK3A 5E2KA 3M1QA 3V5GA 5JEHB 1T9NA 1I9NA 2QO8A 1MUAA 3M3XA 3F4XA 3NI5A 3IBNA 2NXSA 5E2MA 5G01A 1THKA 4YXOA 4KP5A 1Z93A 2Q1BA 1ZH9A 4C3TA 5EKJA 5L6KA 4M2WA 1CAKA 3D93A 2FOSA 5FL5A 1CAJA 6CA2A 3RGEA 1FQRA 1ZFQA 4YHAA 1RZAA 1YO1A 3RG3A 1OQ5A 5DSNA 3RZ0B 1CNWA 3M2ZA 4G0CA 5J8ZA 4FL7A 2HKKA 2X7UA 1BNUA 2Q38A 4CNRA 2NNVA 3DA2A 2AW1A 1CNJA 1YDAA 3DCCA 3K7KA 2FNMA 1CNYA 1I91A 5EHEA 1JV0A 4ITOA 4FIKA 4YGFA 1G0FA 3NB5A 2WD3A 1BNNA 4TWMA 5DSIA 4CA2A 4WUQA 3T82A 4COQA 4CQ0A 12CAA 3U7CA 1G54A 3D8WA 4YVYA 3MHLA 5FNJA 5FNKA 5SZ5A 4HF3A 3N3JA 5JEPB 3IGPA 3RJ7A 4M2UA 1AZMA 4BCWA 4QSBA 4YGKA 5FDCA 1I9LA 2FOUA 2O4ZA 3P5LA 4ZX0A 5SZ4A 4RFCA 4L5VA 4MLXA 3R16A 1FQLA 1RJ6A 4MO8A 1CZMA 4KNMA 4LP6A 4RIUA 3RYVB 1LG5A 2POVA 3V3GB 2WEGA 5JEGB 3N4BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K34 A;  3N0N A;  2POU A;  1OKM A;  4XZ5 A;  4L5U A;  1YDC A;  2NNS A;  1CRM A;  1DMY A;  1KWQ A;  4Q0L A;  4MDL A;  5E2S A;  3C7P A;  3KOK A;  2VVB X;  5JG3 B;  4DZ7 A;  4E3G A;  2NWY A;  3M14 A;  5JGS B;  4QJM A;  3HKN A;  4Q90 A;  2HFW A;  5E28 A;  1ZFK A;  5DOH A;  4TWL A;  1UGG A;  1CAY A;  1UGB A;  1IF8 A;  3PJJ A;  4K1Q A;  4XFW A;  5EH8 A;  1IF7 A;  3M5S A;  1CCT A;  4L5W A;  3ML5 A;  2NN1 A;  2H15 A;  3RYZ A;  4Y0J A;  4Q8X A;  4N0X B;  1CA2 A;  4ZWY A;  5DVX A;  1G1D A;  4K0S A;  4Q8Y A;  1CVE A;  3P3J A;  4Q09 A;  4RIV A;  5JQT A;  3DCW A;  3P44 A;  4QSJ A;  5DSM A;  1BNT A;  4QTL A;  4YWP A;  1LUG A;  3KOI A;  3HS4 A;  4IDR X;  1ZGE A;  4Q81 A;  3SBI A;  2EZ7 A;  4KUV A;  4WR7 A;  3SAX A;  1TBT X;  4E49 A;  2HOC A;  3FE4 A;  1FR7 A;  1ZNC A;  5JDV B;  1BNV A;  1TEU X;  2NXR A;  2OSF A;  4YXU A;  3S74 B;  2EU3 A;  3T83 A;  2EU2 A;  3U3A X;  4QJW A;  2CBC A;  3MHM A;  3PO6 A;  3W6H A;  5E5U A;  5BRU A;  3DD0 A;  3PYK A;  1YO2 A;  3QYK A;  5FLT A;  4CNV A;  3R17 B;  1CNH A;  1XQ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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