4Z1J | Genus

Total Genus 75

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__950736305135075__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__950736305135075__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4Z1J/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__950736305135075__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"950736305135075","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4Z1J/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__950736305135075__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Carbonic anhydrase inhibitors: Design, synthesis and structural characterization of new heteroaryl-N-carbonylbenzenesulfonamides targeting druggable human carbonic anhydrase isoforms. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	75
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2015-03-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4z1jA00

4RUYA 1Z97A 5EZTX 4YX4A 2CABA 1I9QA 4BCWA 3DCWA 2IT4A 1OKMA 4QJMA 1FSNA 1ZNCA 2HKKA 3CZVA 5EHVA 3SAXA 4CNXA 1G46A 5FNGA 3PO6A 1YDBA 4M2RA 5FLOA 1TB0X 4Y0JA 4Z1KA 3N2PA 4PYXA 4QSBA 3FFPX 1BN1A 1YDDA 3M5TA 5FNKA 4Q81A 1CVAA 5DVXA 4GL1X 1Y7WA 5CJFA 4QJXA 5G03A 1TG3A 3D8WA 2POVA 2QOAA 3BETA 3U7CA 4E49A 2NNSA 2POUA 3M96A 4XFWA 4HU1A 1RZBA 5FNMA 4ZAOA 4RUXA 5JDVB 1RJ6A 1TEQX 1TBTX 3ML2A 4KP8A 5FNIA 5JQ0A 5DSNA 5C8IA 2FOYA 2FMZA 4YXOA 3RZ1B 1CAIA 3V7XA 2FOSA 4RH2A 4YHAA 4E5QA 4M2WA 1TH9A 1YO0A 1FQNA 1DMXA 2FW4A 4QEFA 4Q0LA 5AMGA 2X7UA 3U3AX 4BF6A 5DSMA 1BNUA 3R16A 5EHEA 1KOQA 2GEHA 2QP6A 1I90A 2OSMA 3ZNCA 3IAIA 4QJOA 4ITOA 1AM6A 5EIJA 2CA2A 2HNCA 3HKNA 4MO8A 4RN4A 4Q07A 3M5EA 5JGSB 3R17B 1CCTA 3RYVB 1BCDA 3M14A 4FVOA 4Q08A 1CAOA 3T85A 1FSQA 4C3TA 1CANA 5DSJA 1CNIA 2ZNCA 5DSRA 3DCSA 4X5SA 4CA2A 3DVDA 1AVNA 3DVBA 5E2NA 3V3FA 1CVHA 4QJPA 3NI5A 1I9MA 4LP6A 3U47A 1I91A 3BL0A 1UGGA 5SZ7A 5E5RA 5E2RA 4K0SA 4L5UA 3HKUA 3RLDA 3D9ZA 3S8XA 3P4VA 1CNCA 3DA2A 3MNJA 4E4AA 5JG5B 1RZAA 3MNKA 1KOPA 4IDRX 1HCAA 4K0ZA 4L5VA 5AMDA 1CVCA 2FNNA 2WEOA 1IF4A 3EFTA 1MOOA 3HFPA 3MHCA 4QIYA 1CRMA 1I9PA 2WD2A 1UGCA 5FLQA 1HUGA 3S77B 1MUAA 3RYJB 2CBEA 3JXHC 1G54A 3KWAA 3JXGA 4KNMA 1CCUA 4WR7A 1CNJA 3W6HA 1I9OA 1RAZA 2ABEA 5JEPB 3RJ7A 1CRAA 3MHMA 3RGEA 4TWLA 5FDCA 4FU5A 4TWMA 1YO2A 4WW6A 5L3OA 3W6IA 1BNNA 3MMFA 2NNVA 4CNRA 1G45A 2NNGA 4QY3A 5E2MA 4JSSA 3M3XA 2POWA 3KOKA 1H9NA 5L6KA 1RZEA 4K1QA 3MHLA 2FMGA 4HT0A 5FLPA 5DSKA 1LUGA 3MHIA 1TTMA 1CCSA 9CA2A 3RZ8A 3K2FA 1G0EA 1CAKA 1YDCA 4FIKA 4G7AA 4RIVA 3M2YA 4CACA 4ETQC 1JD0A 1LGDA 2NWYA 4Q83A 4ZWXA 3RYZA 4Z0QA 4KNNA 3SBIA 2NWOA 3L14A 3D0NA 12CAA 4JSAA 1ZH9A 2EU3A 4HEWA 5SZ1A 1YDAA 1ZSAA 3M67A 1CAMA 1LZVA 3VBDA 5FL4A 4Q6EA 4G0CA 1CVFA 1CILA 1RAYA 1T9NA 3DC3A 1IF9A 1V9IC 3D93A 4E9OX 3IBNA 5FL6A 4XIWA 5EKJA 1OKLA 2WEJA 4N16A 3C7PA 4RUZA 1FQLA 5E28A 3RZ0B 1A42A 3OYSA 5E2SA 4MLTA 4YGJA 1I8ZA 2CBDA 5SZ5A 1BNWA 1URTA 1HUHA 1BN4A 4Q9YA 3V2JA 1FLJA 3OIKA 1FQMA 3ML5A 1CAHA 2NWZA 4Z1NA 4E3GA 2VVAX 1Z93A 3OILA 1G4OA 3DCCA 4Q06A 3P44A 5LMDA 3V3JA 4HT2A 5EH8A 3N3JA 2NXRA 3IBUA 1IF8A 1CVDA 3MNUA 3T83A 5FNLA 3KKXA 3DAZA 1OKNA 2CBCA 3S78B 4YXUA 3EFIA 1LG6A 2FOQA 4YVYA 3S75B 5EHWA 3F4XA 4Q7VA 4CNWA 3T5ZA 5FDIA 3M2ZA 4Q90A 3BL1A 4QJWA 1UGFA 1UGDA 5CA2A 3RZ7A 1OQ5A 1BNMA 1J9WA 2NWPA 4MDGA 1CAJA 5AMLA 5JEHB 4PQ7A 4KNIA 2ILIA 1F2WA 4QSIA 5JG3B 3OY0A 4COQA 4QK2A 4YYTA 4E3FA 3PJJA 1H9QA 2HL4A 3P5LA 3MWOA 4LHIA 4M2UA 4CNVA 4Z1EA 2EZ7A 2GD8A 4KUWA 2Q1BA 1BNQA 3T5UA 1I9NA 4KAPA 1ZGEA 4HEZA 1HCBA 3P3JA 1G0FA 4WUQA 3RG4A 1AZMA 4MLXA 1G52A 1V9EA 4HEYA 1CVBA 2CBAA 4FVNA 1CAZA 4ZX0A 3MNHA 4Z1JA 3M1WA 2HFWA 8CA2A 5EKHA 4K13A 4KUYA 3TMJA 1I9LA 2W2JA 3HLJA 4QIZA 2AX2A 3N4BA 1THKA 2F14A 3S71B 1JCZA 4RFCA 3MDZA 4JSZA 5FL5A 4KNJA 2FOUA 3NB5A 4HBAA 5DSLA 3RZ5A 5DSQA 5JQTA 1IF7A 4KV0A 3MNIA 3SBHA 5EKMA 1CINA 3ZP9A 1FR4A 4Q7WA 1CAYA 2WD3A 5EH5A 5J8ZA 2QO8A 1UGAA 4Q7PA 4Q7SA 3OYQA 1ZFKA 4DZ9A 4YWPA 5DSIA 5BRUA 3RG3A 3M98A 5CACA 5EH7A 2Q1QA 4E3HA 3IEOA 5EOIA 4MTYA 5BRVA 1CNBA 5BYIA 5CLUA 3QYKA 1XQ0A 3S9TA 1DCBA 2X7TA 5G0CA 5DSOA 4Q6DA 3S97A 1G48A 2OSFA 4RFDA 3HS4A 4YGKA 4PXXA 4CQ0A 2X7SA 3F7BA 3M2XA 4XE1A 1BV3A 5SZ0A 3V3HB 4QJ0A 1CZMA 1EOUA 2FNMA 2NN1A 4LU3A 4QTLA 1CNHA 1CA3A 5SZ6A 1UGEA 5G0BA 3DBUA 4R59A 4MDLA 1CNGA 1CVEA 3DD8A 1CALA 3KOIA 5A6HA 3OIMA 7CA2A 5IPZA 1FQRA 4KUVA 2AW1A 2EU2A 1BZMA 4YXIA 1CA2A 3M1KA 1RZCA 3MHOA 2NXTA 4FL7A 3F8EA 4ZWIA 3IBIA 4Q49A 5G01A 4E3DA 1FSRA 3V3GB 3U45X 4L5WA 1CNKA 2O4ZA 3HKTA 3P55A 3S76A 3T82A 4YGNA 3HKQA 5SZ3A 3N0NA 1TG9A 4PZHA 1CNYA 1HEBA 4QK1A 3D92A 2WEGA 2NMXA 4ILXA 4ZWZA 3MZCA 3V5GA 4MDMA 4YGFA 4YGLA 1FR7A 1LG5A 1XEGA 2FNKA 5DRSA 3B1BA 1HECA 5HPJA 4K0TA 1XPZA 3K7KA 1ZFQA 4FRCA 4WL4A 4Q09A 4Q78A 4QK3A 3GZ0A 1RZDA 1BNTA 3RYYA 1ZSCA 5FLTA 4Q8XA 5DOGA 2HD6A 4Q8YA 4XIXA 1RJ5A 4ZX1A 2WEHA 4JS6A 5FLSA 5JEGB 4UOVA 1KWQA 4Q8ZA 4ITPA 5DOHA 3V2MA 3P5AA 4WW8A 1HEDA 3DV7A 1H4NA 4WUPA 1IF5A 3T84A 3S73B 3FW3A 4DZ7A 1CNWA 1ZSBA 1G3ZA 1G53A 1BN3A 3M1QA 4HF3A 3F7UA 4PYYA 3CYUA 3KLDB 3NJ9A 3TVOX 3OKUA 3SAPA 3CA2A 2FOVA 4RIUA 1UGBA 4N0XB 1ZGFA 5SZ2A 3CAJA 4XZ5A 4FPTA 4QSAA 4R5BA 3DVCA 4ZWYA 3MYQA 2H15A 5JESB 5BRWA 3TVNX 4BF1A 3DC9A 5BNLA 3FE4A 1G6VA 3MNAA 1BNVA 3M40A 3P58A 1ZE8A 1TEUX 1BICA 3IBLA 3M04A 1IF6A 1HEAA 3S74B 3K34A 1CNXA 1TE3X 3V3IB 1G1DA 3S72B 3UYQA 5FNHA 2VVBX 1CIMA 2CBBA 3P3HA 2HOCA 3B4FA 5SZ4A 2H4NA 6CA2A 1KEQA 3IGPA 1DMYA 4Q87A 4Q99A 3DD0A 5JGTB 3OKVA 3KNEA 4JSWA 1DCAA 5A25A 3PYKA 3M1JA 4IWZA 3LXEA 5FLRA 4QSJA 3KS3A 2NN7A 2NNOA 1JV0A 1XEVA 3M2NA 3UYNA 1Z9YA 1G4JA 1YO1A 3KIGA 5FNJA 4M2VA 5DSPA 1KWRA 4R5AA 3JXFA 3Q31A 3M5SA 3RYXB 1HVAA 5E2KA 4KP5A 5E5UA 2NXSA 3KONA 2Q38A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RUY A;  1Z97 A;  5EZT X;  4YX4 A;  2CAB A;  1I9Q A;  4BCW A;  3DCW A;  2IT4 A;  1OKM A;  4QJM A;  1FSN A;  1ZNC A;  2HKK A;  3CZV A;  5EHV A;  3SAX A;  4CNX A;  1G46 A;  5FNG A;  3PO6 A;  1YDB A;  4M2R A;  5FLO A;  1TB0 X;  4Y0J A;  4Z1K A;  3N2P A;  4PYX A;  4QSB A;  3FFP X;  1BN1 A;  1YDD A;  3M5T A;  5FNK A;  4Q81 A;  1CVA A;  5DVX A;  4GL1 X;  1Y7W A;  5CJF A;  4QJX A;  5G03 A;  1TG3 A;  3D8W A;  2POV A;  2QOA A;  3BET A;  3U7C A;  4E49 A;  2NNS A;  2POU A;  3M96 A;  4XFW A;  4HU1 A;  1RZB A;  5FNM A;  4ZAO A;  4RUX A;  5JDV B;  1RJ6 A;  1TEQ X;  1TBT X;  3ML2 A;  4KP8 A;  5FNI A;  5JQ0 A;  5DSN A;  5C8I A;  2FOY A;  2FMZ A;  4YXO A;  3RZ1 B;  1CAI A;  3V7X A;  2FOS A;  4RH2 A;  4YHA A;  4E5Q A;  4M2W A;  1TH9 A;  1YO0 A;  1FQN A;  1DMX A;  2FW4 A;  4QEF A;  4Q0L A;  5AMG A;  2X7U A;  3U3A X;  4BF6 A;  5DSM A;  1BNU A;  3R16 A;  5EHE A;  1KOQ A;  2GEH A;  2QP6 A;  1I90 A;  2OSM A;  3ZNC A;  3IAI A;  4QJO A;  4ITO A;  1AM6 A;  5EIJ A;  2CA2 A;  2HNC A;  3HKN A;  4MO8 A;  4RN4 A;  4Q07 A;  3M5E A;  5JGS B;  3R17 B;  1CCT A;  3RYV B;  1BCD A;  3M14 A;  4FVO A;  4Q08 A;  1CAO A;  3T85 A;  1FSQ A;  4C3T A;  1CAN A;  5DSJ A;  1CNI A;  2ZNC A;  5DSR A;  3DCS A;  4X5S A;  4CA2 A;  3DVD A;  1AVN A;  3DVB A;  5E2N A;  3V3F A;  1CVH A;  4QJP A;  3NI5 A;  1I9M A;  4LP6 A;  3U47 A;  1I91 A;  3BL0 A;  1UGG A;  5SZ7 A;  5E5R A;  5E2R A;  4K0S A;  4L5U A;  3HKU A;  3RLD A;  3D9Z A;  3S8X A;  3P4V A;  1CNC A;  3DA2 A;  3MNJ A;  4E4A A;  5JG5 B;  1RZA A;  3MNK A;  1KOP A;  4IDR X;  1HCA A;  4K0Z A;  4L5V A;  5AMD A;  1CVC A;  2FNN A;  2WEO A;  1IF4 A;  3EFT A;  1MOO A;  3HFP A;  3MHC A;  4QIY A;  1CRM A;  1I9P A;  2WD2 A;  1UGC A;  5FLQ A;  1HUG A;  3S77 B;  1MUA A;  3RYJ B;  2CBE A;  3JXH C;  1G54 A;  3KWA A;  3JXG A;  4KNM A;  1CCU A;  4WR7 A;  1CNJ A;  3W6H A;  1I9O A;  1RAZ A;  2ABE A;  5JEP B;  3RJ7 A;  1CRA A;  3MHM A;  3RGE A;  4TWL A;  5FDC A;  4FU5 A;  4TWM A;  1YO2 A;  4WW6 A;  5L3O A;  3W6I A;  1BNN A;  3MMF A;  2NNV A;  4CNR A;  1G45 A;  2NNG A;  4QY3 A;  5E2M A;  4JSS A;  3M3X A;  2POW A;  3KOK A;  1H9N A;  5L6K A;  1RZE A;  4K1Q A;  3MHL A;  2FMG A;  4HT0 A;  5FLP A;  5DSK A;  1LUG A;  3MHI A;  1TTM A;  1CCS A;  9CA2 A;  3RZ8 A;  3K2F A;  1G0E A;  1CAK A;  1YDC A;  4FIK A;  4G7A A;  4RIV A;  3M2Y A;  4CAC A;  4ETQ C;  1JD0 A;  1LGD A;  2NWY A;  4Q83 A;  4ZWX A;  3RYZ A;  4Z0Q A;  4KNN A;  3SBI A;  2NWO A;  3L14 A;  3D0N A;  12CA A;  4JSA A;  1ZH9 A;  2EU3 A;  4HEW A;  5SZ1 A;  1YDA A;  1ZSA A;  3M67 A;  1CAM A;  1LZV A;  3VBD A;  5FL4 A;  4Q6E A;  4G0C A;  1CVF A;  1CIL A;  1RAY A;  1T9N A;  3DC3 A;  1IF9 A;  1V9I C;  3D93 A;  4E9O X;  3IBN A;  5FL6 A;  4XIW A;  5EKJ A;  1OKL A;  2WEJ A;  4N16 A;  3C7P A;  4RUZ A;  1FQL A;  5E28 A;  3RZ0 B;  1A42 A;  3OYS A;  5E2S A;  4MLT A;  4YGJ A;  1I8Z A;  2CBD A;  5SZ5 A;  1BNW A;  1URT A;  1HUH A;  1BN4 A;  4Q9Y A;  3V2J A;  1FLJ A;  3OIK A;  1FQM A;  3ML5 A;  1CAH A;  2NWZ A;  4Z1N A;  4E3G A;  2VVA X;  1Z93 A;  3OIL A;  1G4O A;  3DCC A;  4Q06 A;  3P44 A;  5LMD A;  3V3J A;  4HT2 A;  5EH8 A;  3N3J A;  2NXR A;  3IBU A;  1IF8 A;  1CVD A;  3MNU A;  3T83 A;  5FNL A;  3KKX A;  3DAZ A;  1OKN A;  2CBC A;  3S78 B;  4YXU A;  3EFI A;  1LG6 A;  2FOQ A;  4YVY A;  3S75 B;  5EHW A;  3F4X A;  4Q7V A;  4CNW A;  3T5Z A;  5FDI A;  3M2Z A;  4Q90 A;  3BL1 A;  4QJW A;  1UGF A;  1UGD A;  5CA2 A;  3RZ7 A;  1OQ5 A;  1BNM A;  1J9W A;  2NWP A;  4MDG A;  1CAJ A;  5AML A;  5JEH B;  4PQ7 A;  4KNI A;  2ILI A;  1F2W A;  4QSI A;  5JG3 B;  3OY0 A;  4COQ A;  4QK2 A;  4YYT A;  4E3F A;  3PJJ A;  1H9Q A;  2HL4 A;  3P5L A;  3MWO A;  4LHI A;  4M2U A;  4CNV A;  4Z1E A;  2EZ7 A;  2GD8 A;  4KUW A;  2Q1B A;  1BNQ A;  3T5U A;  1I9N A;  4KAP A;  1ZGE A;  4HEZ A;  1HCB A;  3P3J A;  1G0F A;  4WUQ A;  3RG4 A;  1AZM A;  4MLX A;  1G52 A;  1V9E A;  4HEY A;  1CVB A;  2CBA A;  4FVN A;  1CAZ A;  4ZX0 A;  3MNH A;  4Z1J A;  3M1W A;  2HFW A;  8CA2 A;  5EKH A;  4K13 A;  4KUY A;  3TMJ A;  1I9L A;  2W2J A;  3HLJ A;  4QIZ A;  2AX2 A;  3N4B A;  1THK A;  2F14 A;  3S71 B;  1JCZ A;  4RFC A;  3MDZ A;  4JSZ A;  5FL5 A;  4KNJ A;  2FOU A;  3NB5 A;  4HBA A;  5DSL A;  3RZ5 A;  5DSQ A; 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4Z1JA

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Chain Sequence

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