4BF1A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ii in complex with 5-(1-naphthalen-1-yl-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2-sulfonamide
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title 5-Substituted-(1,2,3-Triazol-4-Yl)Thiophene-2-Sulfonamides Strongly Inhibit Human Carbonic Anhydrases I, II, Ix and Xii: Solution and X-Ray Crystallographic Studies.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4bf1A00
3S9TA 3T5ZA 1I9MA 1FQRA 1FQNA 5FNLA 5DSOA 3FW3A 1OKLA 3P3JA 3SBHA 3F4XA 3RLDA 1HCBA 4MDMA 2H4NA 1HUHA 5FNIA 3S71B 1CINA 3BL1A 1UGEA 3M5EA 3R16A 4WR7A 1BN4A 2H15A 4E3DA 3MHLA 5FDIA 5FLOA 3RYJB 1ZFQA 2ABEA 1I9LA 1RZEA 4MO8A 3S74B 3DVBA 4BF6A 5FNKA 4HEZA 1THKA 3OKUA 4Z1EA 1CALA 5EH7A 3MDZA 2HL4A 4RH2A 4QSJA 3OYSA 1UGBA 5FDCA 5A25A 3DAZA 2FNNA 2NNOA 1V9IC 2OSFA 2X7SA 3N4BA 1G54A 4MLTA 1TEUX 4G7AA 3M04A 4IWZA 3OY0A 4YXOA 8CA2A 1CNXA 4Q7WA 1H4NA 4M2VA 5SZ2A 1IF9A 3CAJA 5L6KA 1UGGA 4CNVA 3KONA 5DSRA 3M2ZA 2NN7A 1BICA 3V2JA 4XFWA 5FL4A 1IF6A 3S8XA 4Q9YA 1A42A 1ZH9A 1RZAA 3RZ1B 3GZ0A 4XIXA 3U47A 5E5RA 3RZ7A 4RIVA 2NWYA 1DCAA 1XQ0A 3KLDB 4E49A 4CA2A 1KWRA 4YXUA 3P4VA 5FLRA 4M2UA 1RAZA 3DD0A 3T84A 3OYQA 4RIUA 3RZ5A 3TMJA 2EU3A 5JDVB 1CVFA 12CAA 1BV3A 4R5AA 4KNJA 4QIZA 5CACA 3K7KA 3N2PA 3EFTA 4GL1X 4CNWA 1CVHA 1OKNA 3KNEA 3D93A 3P5AA 2QOAA 1Y7WA 4M2WA 3S97A 4R59A 5FLQA 1BNUA 3M40A 4YVYA 5L3OA 4L5WA 3V3IB 4RUYA 4QJWA 4ZWZA 1XEGA 1G3ZA 2F14A 1BNTA 3IAIA 4Z1NA 1I9QA 4C3TA 1URTA 5FL6A 5CA2A 1I8ZA 1MUAA 3FE4A 5EZTX 3TVNX 2Q1QA 3BETA 4YYTA 3V3HB 2AW1A 4HT0A 3OILA 1CCSA 2FW4A 1JCZA 4KUVA 3PYKA 3IEOA 4BF1A 5HPJA 3B1BA 2X7TA 5E2RA 4ITOA 1HECA 4Y0JA 3M98A 3HLJA 2HD6A 1BNVA 3ZP9A 4YGNA 3UYQA 4ZWXA 5SZ0A 1TEQX 9CA2A 3MWOA 3T85A 4XE1A 4HBAA 3SAXA 1BNNA 1IF8A 3CZVA 5CLUA 1RZBA 1LUGA 2NWZA 2FMGA 4Q83A 3P55A 1ZGFA 2WEOA 2O4ZA 2FNKA 3MNUA 4FVOA 4N16A 3V2MA 3Q31A 4RFDA 1FQLA 4TWMA 5DVXA 1Z97A 1JV0A 1T9NA 3S76A 1HEAA 3SAPA 3MHOA 2FOUA 3RYYA 4Q8XA 1RZDA 4YHAA 3MYQA 4K1QA 5BRWA 1EOUA 1CAKA 4Q6EA 5EIJA 3M2XA 1BNQA 3DCSA 5JEHB 1CNHA 1G48A 3M2YA 3R17B 4KUWA 4YWPA 3S78B 4COQA 1YO0A 3DVDA 3K2FA 1CAJA 1FQMA 1FSNA 2NNGA 3P44A 4Q78A 4TWLA 3U7CA 4G0CA 1HCAA 3OIMA 4PXXA 4QK1A 4XZ5A 1TG3A 5EHVA 3EFIA 1TH9A 3IBLA 3RZ0B 3W6IA 4JSAA 4CNXA 4E3HA 4ITPA 1F2WA 3C7PA 3MZCA 5EH5A 3T5UA 4XIWA 4ZX1A 5DOGA 4FVNA 4KUYA 4QY3A 2CBDA 2WD3A 1CAMA 4L5VA 5JEGB 3DV7A 1CAHA 1BNWA 5DRSA 1YO1A 5SZ4A 4R5BA 1LG6A 1RAYA 3D0NA 4DZ9A 4E3GA 4JSSA 2AX2A 2NXTA 5G01A 1AZMA 3DC3A 4QK2A 2Q1BA 1YDAA 3NJ9A 4ZX0A 1G52A 1RZCA 2HOCA 3MHCA 4X5SA 5BYIA 1AM6A 3IGPA 5JEPB 3W6HA 2WEGA 1MOOA 4QTLA 4CNRA 3KOIA 4Q06A 1RJ6A 5JGSB 1CVAA 5LMDA 3B4FA 4QJPA 2ZNCA 5IPZA 1FR7A 3U3AX 1CA3A 1LZVA 4QIYA 2IT4A 4QJXA 1H9QA 4Q6DA 3MHMA 1JD0A 1CAZA 3NB5A 2CABA 4CQ0A 2FMZA 3KKXA 4KAPA 5E2NA 3DBUA 5EOIA 5FNHA 5SZ7A 3M5SA 4MDLA 4HEYA 4YGJA 5DOHA 5J8ZA 1YO2A 3DC9A 4CACA 4YXIA 4WL4A 4FIKA 3M1QA 1G53A 1OQ5A 2FOVA 1CNCA 4HT2A 4LP6A 4PQ7A 4Q08A 4PZHA 5E5UA 4MDGA 3SBIA 5DSJA 1CNBA 3UYNA 1UGFA 4ZWYA 1CCTA 3DVCA 4Q0LA 1TG9A 2FOYA 3V5GA 4K0ZA 3KOKA 3RZ8A 3V3JA 5SZ5A 1CRAA 1G4OA 4JS6A 1FSQA 2CBAA 5SZ3A 4ILXA 3V3FA 3TVOX 2VVAX 1CVCA 1BNMA 1KOPA 3K34A 1IF4A 1ZSBA 5DSKA 2POVA 1I90A 4L5UA 2GD8A 1KWQA 5JG5B 5FNMA 2HNCA 5EKJA 4KNIA 5JGTB 4M2RA 1CA2A 5SZ1A 4HF3A 5JG3B 1I9OA 3HKNA 1ZGEA 3L14A 3DD8A 4WW8A 1BZMA 4E4AA 3DCWA 1CNGA 3HS4A 5E2KA 4KNNA 1FSRA 4JSWA 4WW6A 3M5TA 3M1JA 1G4JA 4IDRX 1V9EA 1LGDA 3IBNA 3OKVA 3M67A 4MTYA 5FLTA 3MNJA 3V7XA 1BN1A 3M1WA 4YGKA 3FFPX 1CNKA 1CILA 1Z93A 1ZFKA 1CNJA 4RN4A 1I9PA 1YDCA 3JXHC 1ZSAA 1TB0X 5DSPA 4Q09A 3N3JA 3V3GB 4Q7VA 1CAOA 4KV0A 5AMDA 4PYXA 3IBUA 3DCCA 1CAIA 1CANA 4FU5A 5EH8A 1H9NA 3PJJA 1CNIA 5EHEA 1CVDA 5BNLA 5SZ6A 1I91A 4QJOA 1Z9YA 3F8EA 4WUPA 5DSMA 4LHIA 3F7BA 4QSBA 1IF5A 4JSZA 2FOQA 3M2NA 4QJMA 2WEJA 1IF7A 1LG5A 1CZMA 3ML2A 2OSMA 3QYKA 2Q38A 3HKQA 3RYZA 3MMFA 4YX4A 1DMXA 3F7UA 2QO8A 4KP5A 5FLPA 5DSNA 4Z1JA 3M96A 4N0XB 2POWA 3D8WA 3KIGA 4QSIA 4YGLA 3MNKA 4RUXA 3S73B 1XPZA 4Q07A 5EKMA 1G0EA 4QSAA 3KWAA 2EU2A 4PYYA 4Z1KA 2CA2A 1J9WA 4E3FA 2NWOA 2FOSA 4RFCA 3HKUA 4KP8A 3S77B 3M1KA 5JQTA 1TBTX 1DCBA 1G6VA 1G45A 2CBEA 2FNMA 3N0NA 3S75B 3RGEA 5DSIA 7CA2A 1CCUA 4QK3A 1ZSCA 2NXSA 2X7UA 1DMYA 6CA2A 1FLJA 3MHIA 3MNHA 4Q8YA 3MNAA 4YGFA 1RJ5A 3D9ZA 5DSQA 1OKMA 3RYXB 1AVNA 5EHWA 1UGAA 3T82A 3MNIA 4UOVA 3DA2A 5JQ0A 3RJ7A 1CIMA 5DSLA 1XEVA 1G46A 5C8IA 1HEDA 4KNMA 5AMGA 1YDDA 2POUA 2NXRA 1CRMA 2W2JA 3BL0A 1CVBA 4FPTA 5FNJA 5E2SA 2VVBX 4Q7PA 3CA2A 3OIKA 1YDBA 2HFWA 4Z0QA 4QEFA 5G0BA 2WEHA 2EZ7A 5BRUA 3U45X 3PO6A 3CYUA 1UGCA 1I9NA 3P5LA 1G0FA 4ZAOA 1FR4A 5E28A 4MLXA 1ZE8A 1TE3X 2GEHA 4FRCA 1BCDA 5G03A 2NN1A 4K0SA 3KS3A 3HKTA 5A6HA 3RYVB 4Q49A 5FL5A 3S72B 4ETQC 3P3HA 1BN3A 1KOQA 5FLSA 4BCWA 2ILIA 2CBBA 2NNSA 3M3XA 2QP6A 3ML5A 1KEQA 4ZWIA 1HEBA 2NMXA 3RG3A 5FNGA 4WUQA 1CVEA 4DZ7A 4Q87A 1UGDA 4LU3A 5CJFA 1ZNCA 2NNVA 2WD2A 4K13A 3RG4A 3JXFA 5JESB 1HVAA 4Q7SA 5BRVA 4HEWA 2NWPA 1CNYA 3D92A 2HKKA 1HUGA 5G0CA 5E2MA 1TTMA 4K0TA 4HU1A 4RUZA 4Q8ZA 4FL7A 3NI5A 3ZNCA 4Q81A 4QJ0A 3P58A 4Q90A 4Q99A 5AMLA 4E5QA 1CNWA 3HFPA 1G1DA 3IBIA 4E9OX 5EKHA 2CBCA 3T83A 1CAYA 3VBDA 3JXGA 3LXEA 3M14A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S9T A;  3T5Z A;  1I9M A;  1FQR A;  1FQN A;  5FNL A;  5DSO A;  3FW3 A;  1OKL A;  3P3J A;  3SBH A;  3F4X A;  3RLD A;  1HCB A;  4MDM A;  2H4N A;  1HUH A;  5FNI A;  3S71 B;  1CIN A;  3BL1 A;  1UGE A;  3M5E A;  3R16 A;  4WR7 A;  1BN4 A;  2H15 A;  4E3D A;  3MHL A;  5FDI A;  5FLO A;  3RYJ B;  1ZFQ A;  2ABE A;  1I9L A;  1RZE A;  4MO8 A;  3S74 B;  3DVB A;  4BF6 A;  5FNK A;  4HEZ A;  1THK A;  3OKU A;  4Z1E A;  1CAL A;  5EH7 A;  3MDZ A;  2HL4 A;  4RH2 A;  4QSJ A;  3OYS A;  1UGB A;  5FDC A;  5A25 A;  3DAZ A;  2FNN A;  2NNO A;  1V9I C;  2OSF A;  2X7S A;  3N4B A;  1G54 A;  4MLT A;  1TEU X;  4G7A A;  3M04 A;  4IWZ A;  3OY0 A;  4YXO A;  8CA2 A;  1CNX A;  4Q7W A;  1H4N A;  4M2V A;  5SZ2 A;  1IF9 A;  3CAJ A;  5L6K A;  1UGG A;  4CNV A;  3KON A;  5DSR A;  3M2Z A;  2NN7 A;  1BIC A;  3V2J A;  4XFW A;  5FL4 A;  1IF6 A;  3S8X A;  4Q9Y A;  1A42 A;  1ZH9 A;  1RZA A;  3RZ1 B;  3GZ0 A;  4XIX A;  3U47 A;  5E5R A;  3RZ7 A;  4RIV A;  2NWY A;  1DCA A;  1XQ0 A;  3KLD B;  4E49 A;  4CA2 A;  1KWR A;  4YXU A;  3P4V A;  5FLR A; 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