4G7AA

The crystal structure of an alpha carbonic anhydrase from the extremophilic bacterium sulfurihydrogenibium yellowstonense yo3aop1
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
Knots found
sequence length
224
structure length
224
Chain Sequence
EWSYEGEKGPEHWAQLKPEFFWCKLKNQSPINIDKKYKVKANLPKLNLYYKTAKESEVVNNGHTIQINIKEDNTLNYLGEKYQLKQFHFHTPSEHTIEKKSYPLEIHFVHKTEDGKILVVGVMAKLGKTNKELDKILNVAPAEEGEKILDKNLNLNNLIPKDKRYMTYSGSLTTPPCTEGVRWIVLKKPISISKQQLEKLKSVMVNPNNRPVQEINSRWIIEGF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonate dehydratase
publication title X-ray structure of the first `extremo-{alpha}-carbonic anhydrase', a dimeric enzyme from the thermophilic bacterium Sulfurihydrogenibium yellowstonense YO3AOP1.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfurihydrogenibium sp. yo3aop1
total genus 61
structure length 224
sequence length 224
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4g7aA00
4QK1A 1YO1A 5A6HA 3K2FA 3P44A 3T5UA 4RIUA 1UGGA 5FNIA 3MYQA 3D92A 1TEQX 1OKNA 1TTMA 4WW6A 1RZAA 1ZSBA 1BN4A 1AZMA 2WEOA 3MNKA 4YGJA 2CABA 5FNMA 5CJFA 3KKXA 3OKUA 5E2KA 3D0NA 3F7BA 3CYUA 4Q8ZA 3RYJB 3DCSA 4M2RA 4M2UA 2CBDA 4KNIA 3ML5A 1OQ5A 3JXHC 3IBUA 2AX2A 5JG5B 1CNJA 2CA2A 5E5UA 4Q87A 4ZWXA 2FOQA 3MHCA 5SZ4A 2WEJA 2QO8A 5FLSA 3BETA 3RZ7A 4HBAA 4RFDA 2NN1A 3RG4A 4BF1A 3RYXB 3IBIA 3MDZA 4Z1NA 4MLTA 4KNJA 1ZNCA 5DSIA 3RYZA 4UOVA 4MLXA 3DCCA 4QJOA 4QJWA 2WD2A 3RZ5A 3RZ8A 4C3TA 1HEBA 5SZ1A 3V5GA 5JG3B 1Z97A 4CNWA 2NWYA 5G03A 4Y0JA 4PQ7A 5DOHA 5DSQA 4Q8YA 3MHLA 3OYQA 1FQMA 1KWRA 4RH2A 3U7CA 1CIMA 4K13A 4QJMA 3S97A 1CRAA 4Q78A 3OKVA 1H9QA 1HCAA 2CBAA 4N16A 5G01A 1CNYA 3RYVB 5EHEA 5DVXA 4Z1KA 2FNMA 5EKMA 4Q7WA 3SAXA 4CACA 1JCZA 3ML2A 4ZAOA 5JGSB 3M2YA 4QK3A 4KP8A 4QIZA 4WL4A 3KS3A 4KV0A 1YDAA 3MMFA 1I90A 1FLJA 1TEUX 5EOIA 1G46A 4X5SA 5SZ7A 1CVFA 5FLPA 4Z0QA 4KNMA 1I9LA 3S78B 3SAPA 4QSJA 2GD8A 2IT4A 3U3AX 5FLTA 1HUHA 3OYSA 1CVAA 5JGTB 5L3OA 4XIWA 3NJ9A 3HS4A 1G3ZA 3B4FA 1IF9A 2EZ7A 2HD6A 4RIVA 1BZMA 5FL4A 4HEWA 3M1QA 3CAJA 4E49A 3EFIA 3HKTA 3IBNA 4KUVA 5JEPB 1RZEA 3S74B 3T83A 3R16A 4FRCA 3RYYA 4CA2A 1ZSAA 3BL0A 1T9NA 2VVBX 4JSAA 5DSLA 3KLDB 4E3DA 4Q09A 3M96A 2HL4A 1G48A 1YDBA 3EFTA 4YHAA 4HT2A 3RZ0B 4MDMA 3IBLA 4XZ5A 1UGBA 4KNNA 9CA2A 1CALA 3M3XA 3IEOA 4QSIA 1I8ZA 1Z9YA 3IAIA 5LMDA 1FQNA 3S72B 1HCBA 1I9MA 1F2WA 3V3FA 4Q08A 5EIJA 1CNIA 5E5RA 2CBEA 1UGCA 1YDDA 4JSWA 3M1JA 3V3GB 5JEGB 1CAOA 3HLJA 3D8WA 2EU2A 3V2MA 4RUZA 3V3JA 3U45X 4RUYA 2X7SA 4Q7VA 3RLDA 2NNOA 4Q83A 4FL7A 3DBUA 3LXEA 4M2VA 3S75B 3KWAA 1I9NA 2FMGA 1IF4A 3SBHA 3M04A 1RZDA 4YXUA 4DZ9A 1JD0A 1HECA 3M14A 4G7AA 1BNNA 1CNCA 4PXXA 1BNQA 1RAZA 2AW1A 3PYKA 1H4NA 2NXSA 3DV7A 3KIGA 3M1WA 4HEYA 1TBTX 1YO0A 2WEHA 5FL5A 3S9TA 4YYTA 4TWLA 5EZTX 5E2RA 1I9QA 2POWA 2ABEA 2H4NA 5JEHB 1BCDA 1CVHA 3QYKA 1AM6A 5BRVA 1TH9A 2NXRA 4Q07A 4YXIA 1DCBA 1THKA 3CZVA 4KUYA 4L5VA 3V3IB 3W6HA 5FLOA 5J8ZA 1IF6A 5FDIA 2CBCA 4ZWIA 3N0NA 1RZCA 4ITPA 3MHMA 3CA2A 1CNGA 1DCAA 1RZBA 1RAYA 3N2PA 1IF5A 5DSRA 3MNAA 3DVCA 4Q49A 4YGLA 1LG6A 2FNNA 1G4JA 4QY3A 4CNRA 3DA2A 3UYQA 4E4AA 2FW4A 5AMDA 3BL1A 3B1BA 3KNEA 5FLQA 3Q31A 3ZNCA 4QK2A 1HVAA 1CAKA 3MWOA 4E3HA 3VBDA 5FNKA 5JQTA 3P5LA 3M98A 1J9WA 1BNTA 3DAZA 2QOAA 1CAMA 1XPZA 3RGEA 4E3GA 4QJPA 1KOPA 4MO8A 1ZFKA 4YGNA 4WUPA 5JESB 1BNVA 1HEAA 5CLUA 4JS6A 3T84A 4PZHA 3DCWA 5DSJA 4ETQC 4YWPA 3FW3A 4QJXA 1YDCA 3DD0A 4K0ZA 1DMYA 1FSQA 1KWQA 2OSFA 4FIKA 4PYXA 3KONA 3T85A 1CA3A 3N4BA 2FOSA 1FR7A 3M40A 2POUA 2X7UA 2FOYA 3TMJA 4ITOA 1RJ6A 4R5BA 5E2MA 4ZWYA 4KP5A 4Q0LA 1BV3A 4LU3A 5AMGA 4WUQA 1BICA 4XIXA 1DMXA 4K1QA 1Y7WA 5DSOA 3P5AA 3P55A 1G45A 1LGDA 4HT0A 1G6VA 5JDVB 2HFWA 4FPTA 1G54A 4CNVA 1CAZA 2HNCA 4Q06A 4Q81A 4QEFA 12CAA 4LHIA 1FR4A 3DD8A 5A25A 4N0XB 5BRUA 4HU1A 3M5SA 3D93A 5JQ0A 5DRSA 1CAJA 1ZGEA 1CNKA 3S76A 3S73B 2GEHA 4YX4A 5FLRA 1CVCA 1TB0X 1G53A 5DOGA 5EHVA 4L5UA 4ZWZA 5BRWA 4Z1EA 5FNJA 1RJ5A 3JXFA 3M5TA 4JSSA 3F8EA 1CAHA 5EH8A 1I91A 5DSMA 4G0CA 1HUGA 4YVYA 1UGFA 1CCUA 4Q7SA 3S71B 4E3FA 1CAIA 2NWZA 4WR7A 4JSZA 4TWMA 3MZCA 1BN3A 3RJ7A 3TVNX 3MHOA 3OIKA 1BN1A 2WEGA 3N3JA 4Q8XA 1IF8A 4IWZA 4HF3A 1ZGFA 1CNHA 5DSPA 5FL6A 5HPJA 3FE4A 3OY0A 1G4OA 3W6IA 3RG3A 3P4VA 3PJJA 4E9OX 5E28A 4CQ0A 3M5EA 1A42A 1G52A 1CNWA 1CVBA 3K34A 3P58A 2HKKA 4WW8A 4FVNA 4FVOA 4LP6A 4FU5A 3UYNA 3RZ1B 1TG3A 4RFCA 3V3HB 2F14A 2Q38A 3M2XA 1CRMA 3HKQA 3MNUA 4QSAA 1CCSA 3D9ZA 4Q99A 4QSBA 5G0CA 1MOOA 2OSMA 5E2NA 3DVBA 2CBBA 3S8XA 1MUAA 2NN7A 3T82A 4DZ7A 1LUGA 1TE3X 2VVAX 5SZ2A 1ZSCA 1IF7A 3OILA 1URTA 2FNKA 4R5AA 1UGDA 1CILA 2NWOA 4ZX1A 1H9NA 1XEGA 2ILIA 1AVNA 1G1DA 3MNJA 5BNLA 3FFPX 3ZP9A 4CNXA 1BNWA 4XE1A 3KOKA 4XFWA 4IDRX 1CAYA 5G0BA 2EU3A 4BCWA 3C7PA 1FQRA 1OKMA 4R59A 2QP6A 4COQA 5EH7A 1CNBA 3V2JA 3MNHA 3R17B 3F7UA 4MDGA 2NWPA 5AMLA 5EKHA 5SZ0A 3K7KA 1V9EA 1I9OA 2FOUA 1BNMA 8CA2A 5SZ6A 3L14A 4E5QA 1CVDA 3P3HA 1HEDA 2ZNCA 5CA2A 3JXGA 1ZE8A 2O4ZA 3F4XA 2Q1QA 5FNGA 3V7XA 5FNHA 5DSNA 5SZ5A 3M67A 4QIYA 4BF6A 3T5ZA 4QJ0A 3P3JA 1FSNA 3HFPA 2NNSA 3DVDA 1KOQA 4Q6EA 2H15A 1CVEA 1FQLA 4Q7PA 1KEQA 5FNLA 1BNUA 2NMXA 2NXTA 1CCTA 4RN4A 4KAPA 1V9IC 6CA2A 4ZX0A 4M2WA 4RUXA 4K0SA 2FMZA 4QTLA 1Z93A 4MDLA 1LZVA 4MTYA 5SZ3A 1UGEA 1ZFQA 3IGPA 1CINA 3MHIA 3HKUA 4L5WA 7CA2A 3NI5A 5CACA 2NNVA 4K0TA 1YO2A 5FDCA 1XEVA 2NNGA 2WD3A 3U47A 4ILXA 4YGFA 4Z1JA 1G0EA 3M2ZA 2HOCA 3GZ0A 4GL1X 3OIMA 1CA2A 3DC9A 3NB5A 2POVA 3S77B 1OKLA 4HEZA 4Q9YA 2FOVA 2Q1BA 3HKNA 4Q6DA 4Q90A 1TG9A 3TVOX 4KUWA 2W2JA 1FSRA 3MNIA 5EH5A 3M2NA 1ZH9A 1CANA 1UGAA 3KOIA 5DSKA 5C8IA 4PYYA 1I9PA 3DC3A 5BYIA 3SBIA 3PO6A 1JV0A 5E2SA 1CNXA 1LG5A 5IPZA 4YXOA 1XQ0A 3M1KA 1CZMA 5EHWA 5EKJA 4YGKA 1G0FA 1EOUA 5L6KA 2X7TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QK1 A;  1YO1 A;  5A6H A;  3K2F A;  3P44 A;  3T5U A;  4RIU A;  1UGG A;  5FNI A;  3MYQ A;  3D92 A;  1TEQ X;  1OKN A;  1TTM A;  4WW6 A;  1RZA A;  1ZSB A;  1BN4 A;  1AZM A;  2WEO A;  3MNK A;  4YGJ A;  2CAB A;  5FNM A;  5CJF A;  3KKX A;  3OKU A;  5E2K A;  3D0N A;  3F7B A;  3CYU A;  4Q8Z A;  3RYJ B;  3DCS A;  4M2R A;  4M2U A;  2CBD A;  4KNI A;  3ML5 A;  1OQ5 A;  3JXH C;  3IBU A;  2AX2 A;  5JG5 B;  1CNJ A;  2CA2 A;  5E5U A;  4Q87 A;  4ZWX A;  2FOQ A;  3MHC A;  5SZ4 A;  2WEJ A;  2QO8 A;  5FLS A;  3BET A;  3RZ7 A;  4HBA A;  4RFD A;  2NN1 A;  3RG4 A;  4BF1 A;  3RYX B;  3IBI A;  3MDZ A;  4Z1N A;  4MLT A;  4KNJ A;  1ZNC A;  5DSI A;  3RYZ A;  4UOV A;  4MLX A;  3DCC A;  4QJO A;  4QJW A;  2WD2 A;  3RZ5 A;  3RZ8 A;  4C3T A;  1HEB A;  5SZ1 A;  3V5G A;  5JG3 B;  1Z97 A;  4CNW A;  2NWY A;  5G03 A;  4Y0J A;  4PQ7 A;  5DOH A;  5DSQ A;  4Q8Y A;  3MHL A;  3OYQ A;  1FQM A;  1KWR A;  4RH2 A;  3U7C A;  1CIM A;  4K13 A;  4QJM A;  3S97 A;  1CRA A;  4Q78 A;  3OKV A;  1H9Q A;  1HCA A;  2CBA A;  4N16 A;  5G01 A;  1CNY A; 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