4JS6A

Crystal structure of inhibitor-free hcaii h94d
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFDFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Metalloprotein-Inhibitor Binding: Human Carbonic Anhydrase II as a Model for Probing Metal-Ligand Interactions in a Metalloprotein Active Site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4js6A00
1CCSA 4L5UA 4FRCA 4Q83A 5A25A 1TG9A 4ZX0A 1FSRA 1CIMA 3D9ZA 5C8IA 4DZ9A 1Z97A 4BF1A 3M40A 1TTMA 4Q07A 3W6IA 3QYKA 4WW6A 3KIGA 1HEDA 4YWPA 3MNAA 3IBUA 4QSJA 3HS4A 4LHIA 3IBIA 4MLTA 4FIKA 3F7UA 1AVNA 2NN1A 3P3JA 4IWZA 3S76A 4Q08A 4JSWA 5JEPB 1CNGA 2NXSA 4TWLA 4Q0LA 3W6HA 3M5TA 1CCTA 5G01A 2NMXA 3M2ZA 5FNLA 5EIJA 3PJJA 1ZE8A 3D0NA 1ZH9A 2CA2A 1DMYA 3DC3A 5E2NA 4YGFA 3DCCA 3T84A 4KV0A 3S74B 4PQ7A 5SZ5A 4JSZA 3B4FA 4HF3A 3U3AX 1TEUX 1HUGA 5FL6A 1OQ5A 2WEGA 3D93A 1T9NA 2CABA 1URTA 4TWMA 3CZVA 2NWZA 1EOUA 5EHEA 1F2WA 3CA2A 5L6KA 3M67A 3BL1A 3CYUA 4MTYA 2NXRA 3KS3A 3FE4A 1TH9A 4HT0A 3PYKA 4KUWA 2NNGA 1G48A 4QJOA 2AW1A 1CVCA 5DRSA 3DA2A 3JXGA 1HCBA 1TE3X 1G46A 1LUGA 3JXHC 5E28A 1CNYA 1FQLA 3V2JA 3MWOA 4QIZA 1CILA 1FLJA 1YDDA 2Q1BA 3M1KA 2EU2A 3MHCA 3P4VA 5SZ1A 4MLXA 4YXIA 5FLTA 3P5AA 1CAOA 1CNHA 4KNNA 4Q9YA 2QOAA 4CACA 7CA2A 5EKMA 4K0TA 1LZVA 1CAZA 1TEQX 1UGDA 3P55A 3P44A 5FLPA 2EU3A 4HEYA 1H4NA 3T5ZA 4YYTA 3P5LA 3RYXB 3RZ0B 1FQMA 1CNKA 4WW8A 3S97A 1MUAA 4YVYA 2X7UA 1CRMA 1THKA 5IPZA 3KONA 3MMFA 1OKNA 3D8WA 1I9LA 1G4OA 3L14A 4KUYA 4QY3A 1CAKA 1CZMA 5BNLA 2EZ7A 4QJPA 1I9NA 2WEJA 4ILXA 5JDVB 3ML5A 4Q78A 2O4ZA 1JD0A 5DSLA 4KNIA 3HFPA 3IBLA 5CLUA 5FLQA 3V7XA 2H15A 5DOGA 1Z93A 3S77B 3V3IB 2FOSA 3EFIA 1KWRA 3MHLA 4Z0QA 3V2MA 1LG6A 4X5SA 1BNWA 3MHIA 1BZMA 5SZ6A 3PO6A 1BNUA 5A6HA 5FNKA 4Q8YA 1I90A 3CAJA 5E2MA 3VBDA 3KOIA 3BL0A 3M04A 1CVAA 3DV7A 5HPJA 3T5UA 1G52A 3M2XA 5E5RA 3T82A 2POUA 1YO0A 4MDGA 1HEBA 1JV0A 2CBAA 2NN7A 3UYNA 4BCWA 1DMXA 3RYYA 1CVDA 3LXEA 3RYZA 3IEOA 4RFCA 4G0CA 4M2VA 3V3FA 4L5WA 4ZAOA 1BNNA 2FMZA 4Q6DA 3B1BA 4Z1NA 4HBAA 1RAYA 1CAIA 5J8ZA 1OKLA 1A42A 2NWPA 3OYQA 1TB0X 3ML2A 3NI5A 4ITPA 2W2JA 2FOYA 5AMDA 1Z9YA 5EZTX 2CBDA 5DSJA 5L3OA 12CAA 4FU5A 1FQRA 3RLDA 4R5AA 3RZ8A 1H9NA 5EH8A 4MDLA 1BV3A 3TVOX 3KNEA 2FNKA 2NWYA 1ZSAA 1OKMA 4FVNA 3DBUA 2WEOA 5DSIA 5FNMA 1IF9A 3S9TA 5G03A 2HFWA 4KUVA 4QEFA 1YDAA 3DC9A 5CJFA 2OSMA 4E3GA 1FR7A 3TVNX 3K7KA 4JS6A 4UOVA 3IGPA 5G0BA 1ZGEA 4CNXA 2NXTA 1XPZA 4XE1A 4RH2A 3IBNA 5FDIA 4Q7VA 5E2RA 1FR4A 3DCSA 4C3TA 4E49A 3TMJA 4R5BA 3BETA 1YDCA 2H4NA 1RZEA 2ILIA 1G54A 4QJMA 1BN4A 1I9PA 4G7AA 9CA2A 1G3ZA 1CRAA 3DCWA 1CVFA 5DSMA 3RYJB 4YXOA 1UGAA 1UGEA 1IF6A 1ZSBA 5FLOA 2X7SA 5LMDA 4ZWYA 1BNTA 1CVHA 2HD6A 3F4XA 1BNMA 3FFPX 1UGGA 5JG3B 3OY0A 1HVAA 4Z1EA 5SZ3A 2FNMA 3F7BA 4JSSA 1CCUA 1IF4A 5FNIA 4YGLA 3M98A 4ZWIA 1DCAA 3HKNA 4K0ZA 5BRWA 4RFDA 1HCAA 4RUZA 1UGFA 4YGNA 1CVBA 3SBIA 3GZ0A 4QSBA 1CNCA 3HKQA 4KNMA 4Z1JA 1RZDA 1XEGA 4CA2A 2FMGA 5E2KA 5E2SA 1G4JA 1FQNA 1BN1A 5FL5A 3S71B 4RIUA 4FPTA 1G6VA 3U47A 3M3XA 1CNXA 1RJ5A 4N16A 5FNHA 3S73B 4Q7PA 5FDCA 3HLJA 3MHOA 5CACA 4HT2A 4Q99A 4XIXA 2FOVA 4CNRA 2FOQA 5BYIA 5FLRA 1I91A 4QJ0A 1ZFQA 1G45A 4GL1X 4Q7WA 1CAHA 4HEWA 1CAMA 3RZ7A 3M5SA 4MO8A 1UGBA 3S8XA 3MNUA 2IT4A 5FLSA 3DVDA 2X7TA 1I9QA 1LG5A 1KOPA 3OYSA 1HEAA 5FNJA 3M1QA 2Q1QA 3N3JA 1YO2A 1V9EA 3KLDB 4JSAA 5JEGB 1CA3A 2HKKA 4RUXA 4XZ5A 2CBCA 4E5QA 3DD8A 3SAPA 4E3HA 4E4AA 3UYQA 3N0NA 1BNVA 1ZGFA 4MDMA 4K0SA 1CINA 2Q38A 5BRUA 1CNBA 1RZCA 1CVEA 3MHMA 4QJWA 3M1JA 5BRVA 1FSNA 3Q31A 2NNOA 2WD2A 4ZX1A 5JGSB 2NNSA 4Q8XA 4Q87A 5DSRA 4ITOA 5EH7A 5SZ2A 3K2FA 2NNVA 1CAYA 1BNQA 1KOQA 3MDZA 3V3GB 3M5EA 4CNVA 5EHWA 4WR7A 3DVBA 3R17B 4LU3A 4E3FA 1G0EA 1I9OA 1V9IC 5E5UA 4WUPA 2WEHA 4HEZA 4Q06A 3MNIA 1XQ0A 5FL4A 1ZNCA 3SAXA 2CBEA 3KKXA 4L5VA 2GEHA 5DSPA 1Y7WA 4KP8A 3OIMA 5DVXA 5JQ0A 1YO1A 3C7PA 4FL7A 1IF5A 4K1QA 4PYYA 5DOHA 4DZ7A 4CQ0A 3OILA 4RIVA 3ZNCA 5DSKA 1CNWA 1BICA 3DVCA 3RZ1B 3OKUA 3KOKA 5EKJA 3D92A 3K34A 4Q8ZA 4XIWA 1TG3A 1YDBA 5JG5B 2FNNA 4QTLA 1HECA 2HOCA 5EKHA 4YXUA 4Q7SA 4YGJA 4WL4A 5JQTA 2AX2A 4QK3A 1CALA 4PZHA 1RZAA 1ZFKA 1LGDA 4KAPA 2ABEA 3F8EA 1CA2A 3S78B 5G0CA 1IF8A 3M14A 2VVBX 2CBBA 3EFTA 3MNKA 3OKVA 2FOUA 4PYXA 1ZSCA 4YX4A 1DCBA 4COQA 3M2NA 4LP6A 4Q6EA 5AMGA 4WUQA 1BN3A 6CA2A 2HL4A 2WD3A 2GD8A 4Z1KA 3T85A 4BF6A 3P58A 4M2WA 4E3DA 3ZP9A 1XEVA 4YGKA 5EOIA 5SZ0A 3HKUA 3N2PA 1J9WA 5FNGA 3HKTA 1IF7A 1AM6A 1TBTX 3MZCA 4Q90A 4KP5A 3V3JA 1RAZA 1KEQA 3NJ9A 3R16A 5EH5A 5SZ4A 3KWAA 1RZBA 5DSOA 3MYQA 1G1DA 3U7CA 4M2RA 4R59A 5JGTB 3M1WA 3OIKA 4PXXA 4N0XB 1KWQA 3M96A 3SBHA 5SZ7A 1I8ZA 3M2YA 4ZWXA 2OSFA 3NB5A 8CA2A 5EHVA 2VVAX 3V3HB 2POVA 3DAZA 4QSIA 5JESB 4QIYA 3IAIA 4YHAA 4KNJA 1HUHA 3JXFA 1G0FA 4ETQC 1RJ6A 1MOOA 2FW4A 3RGEA 2F14A 3MNHA 4E9OX 3MNJA 4Y0JA 3T83A 3V5GA 2ZNCA 1I9MA 1CANA 1AZMA 4CNWA 3RG4A 1H9QA 5AMLA 4RN4A 2NWOA 3RJ7A 3FW3A 1BCDA 4RUYA 1UGCA 3RZ5A 2HNCA 3S75B 5DSQA 1G53A 1CNJA 3P3HA 4QSAA 2POWA 3S72B 4QK1A 4QK2A 4FVOA 3DD0A 4XFWA 2QP6A 4M2UA 4HU1A 4Q81A 4Q09A 4QJXA 4IDRX 1JCZA 1CNIA 4K13A 2QO8A 5JEHB 1FSQA 3N4BA 4Q49A 5CA2A 4ZWZA 3U45X 3RYVB 1CAJA 3RG3A 5DSNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CCS A;  4L5U A;  4FRC A;  4Q83 A;  5A25 A;  1TG9 A;  4ZX0 A;  1FSR A;  1CIM A;  3D9Z A;  5C8I A;  4DZ9 A;  1Z97 A;  4BF1 A;  3M40 A;  1TTM A;  4Q07 A;  3W6I A;  3QYK A;  4WW6 A;  3KIG A;  1HED A;  4YWP A;  3MNA A;  3IBU A;  4QSJ A;  3HS4 A;  4LHI A;  3IBI A;  4MLT A;  4FIK A;  3F7U A;  1AVN A;  2NN1 A;  3P3J A;  4IWZ A;  3S76 A;  4Q08 A;  4JSW A;  5JEP B;  1CNG A;  2NXS A;  4TWL A;  4Q0L A;  3W6H A;  3M5T A;  1CCT A;  5G01 A;  2NMX A;  3M2Z A;  5FNL A;  5EIJ A;  3PJJ A;  1ZE8 A;  3D0N A;  1ZH9 A;  2CA2 A;  1DMY A;  3DC3 A;  5E2N A;  4YGF A;  3DCC A;  3T84 A;  4KV0 A;  3S74 B;  4PQ7 A;  5SZ5 A;  4JSZ A;  3B4F A;  4HF3 A;  3U3A X;  1TEU X;  1HUG A;  5FL6 A;  1OQ5 A;  2WEG A;  3D93 A;  1T9N A;  2CAB A;  1URT A;  4TWM A;  3CZV A;  2NWZ A;  1EOU A;  5EHE A;  1F2W A;  3CA2 A;  5L6K A;  3M67 A;  3BL1 A;  3CYU A;  4MTY A;  2NXR A;  3KS3 A;  3FE4 A;  1TH9 A;  4HT0 A;  3PYK A;  4KUW A;  2NNG A;  1G48 A;  4QJO A;  2AW1 A;  1CVC A;  5DRS A;  3DA2 A;  3JXG A;  1HCB A;  1TE3 X;  1G46 A;  1LUG A;  3JXH C; 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