4JSSA

Human carbonic anhydrase ii h94d bound to a bidentate inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFDFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Metalloprotein-Inhibitor Binding: Human Carbonic Anhydrase II as a Model for Probing Metal-Ligand Interactions in a Metalloprotein Active Site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4jssA00
3OYSA 4CNXA 3D8WA 4QIYA 4KUWA 4IWZA 3JXFA 2OSMA 1Z97A 2ILIA 12CAA 3D93A 1DCBA 1G4OA 3NJ9A 5BRUA 1CVAA 2FNNA 3IAIA 1CNKA 2FNKA 3RZ8A 3MHOA 3MHIA 4Q09A 4MTYA 2H15A 2QO8A 1CZMA 2NN7A 4KP5A 1FSRA 4YGJA 3N0NA 3DAZA 3M5SA 4QJXA 1CCSA 4Q0LA 4ETQC 3T85A 1G0FA 4BCWA 5JDVB 1CNHA 4Q08A 1BN1A 3R17B 2NWPA 2ZNCA 2NWYA 2IT4A 4QK1A 4CNVA 3MNIA 4QIZA 3RYVB 1UGEA 3DD8A 1RZEA 4G0CA 1THKA 1IF7A 3S9TA 1HEAA 2WD2A 4CACA 3V2JA 3MWOA 4RFCA 1FSNA 5EHVA 4JS6A 3MDZA 5EKMA 1AVNA 4HEZA 3D9ZA 5G0CA 4YGKA 1HEDA 5EKHA 3F7BA 3KONA 4K13A 3S78B 4YXOA 3MYQA 1CCUA 2FNMA 3M5TA 3KOKA 1ZSBA 4YGFA 4ZWYA 4Z1KA 1ZH9A 1XPZA 3CAJA 3DV7A 2X7TA 4TWMA 3N4BA 3MHMA 3V3FA 4N0XB 4Q06A 4WW6A 5FNMA 4YX4A 2HOCA 3NB5A 3OIKA 3S73B 2FOUA 3KS3A 5EOIA 4TWLA 4YHAA 4ZWZA 3FFPX 2FOYA 1AZMA 2NXTA 4WR7A 4CNWA 1MUAA 1YO1A 2CBBA 5DSLA 4FVOA 4WUQA 1TE3X 1BV3A 1CNGA 3S77B 1I8ZA 4PXXA 1CILA 1TH9A 2VVBX 3V3GB 5JQTA 3V3IB 1I9QA 4FL7A 3BL0A 2FMZA 1CAHA 5AMDA 4HEYA 4XIXA 1XEVA 1HCAA 5FL5A 2AX2A 4ZX1A 4FRCA 4QSBA 5JEHB 3PO6A 1LG6A 2CBAA 4KUYA 4Q07A 4YYTA 4CQ0A 4Q87A 4L5VA 2NWZA 4HT0A 4Q81A 4LU3A 5DOHA 3MNKA 4KNMA 3RYJB 1TB0X 1BNUA 4QK3A 5FLRA 5DSQA 3CZVA 4RFDA 5EKJA 1RZDA 3P44A 5JGSB 4MLTA 1URTA 5FDIA 3MHLA 1CAZA 3NI5A 4YVYA 4YGLA 4LHIA 1FR7A 1RJ6A 1CNBA 4CNRA 4M2RA 1ZSAA 2HKKA 4MDGA 1H9QA 3B1BA 4Q83A 5J8ZA 1RJ5A 3KLDB 4L5WA 3S74B 1CRAA 4M2WA 5DRSA 5EH8A 2NXRA 2EZ7A 4LP6A 1CA3A 1UGCA 2FMGA 1XQ0A 1CNJA 3MNJA 4DZ9A 3HKTA 1I91A 3OILA 4QK2A 3RG4A 3P5LA 3BETA 1FQRA 5JG3B 2H4NA 1ZFKA 5SZ5A 2X7SA 1HEBA 3C7PA 5EZTX 4K0TA 5E2SA 3KNEA 4KNJA 1G4JA 4RIUA 4R5BA 1HCBA 5EHWA 3M40A 3FE4A 3M1QA 1UGGA 3HS4A 3DVCA 8CA2A 4Q90A 3VBDA 3M2ZA 3SBIA 5BYIA 3S8XA 1Y7WA 1KWRA 3L14A 4Q7PA 4ZAOA 4JSWA 1IF6A 1TBTX 4RH2A 4X5SA 3M96A 3ZP9A 2NNSA 4KUVA 1DMXA 4E9OX 1I9MA 4E5QA 3K34A 1CAOA 5E5UA 2NNGA 3T84A 3V2MA 3M2NA 4L5UA 5FLOA 5FL6A 1I9PA 1EOUA 2CBEA 3M98A 4RUZA 4KNNA 3UYNA 4GL1X 1IF5A 3KIGA 1RAYA 1JD0A 3MNHA 5DSMA 3T5ZA 5DSRA 4HT2A 4FVNA 4Q99A 4ITOA 1I9OA 3V7XA 3RZ7A 2WEOA 4COQA 4Q7VA 4E3DA 3D0NA 5SZ7A 4ZWXA 2Q38A 1DCAA 1ZGEA 4WUPA 5A25A 5SZ6A 5SZ4A 3EFIA 1Z9YA 7CA2A 1CCTA 1BN4A 3SAXA 4E3HA 5DSJA 3JXHC 4E49A 2FW4A 4QJ0A 1KOQA 1IF9A 4Q8ZA 1YO2A 1FSQA 3M67A 5FLTA 3RGEA 3CA2A 4ITPA 1TEQX 1I9LA 1LUGA 1Z93A 4KV0A 1G48A 1H4NA 1CNWA 5JEPB 5E2MA 1FQNA 2EU2A 3K2FA 3M2XA 1CNXA 3S72B 1CNIA 5E5RA 3RYXB 3SAPA 4QTLA 2HD6A 4Z1JA 4MDLA 4G7AA 2Q1QA 3F4XA 3BL1A 4R5AA 4E3FA 1BNVA 1UGBA 2X7UA 4PYYA 3MMFA 4FPTA 4KAPA 3QYKA 3DD0A 5JQ0A 5JEGB 5SZ2A 3T82A 1CAYA 2FOSA 5BRVA 2POWA 1CAJA 5FLPA 1OKMA 5FNGA 4PZHA 3T5UA 4WL4A 1CVHA 3DVDA 3U47A 1UGFA 2ABEA 1RZBA 3UYQA 1G54A 1YDCA 1TG9A 4FU5A 3IBNA 5FNJA 1OKLA 3DC3A 4QSIA 5SZ1A 4MDMA 1BNQA 3DBUA 4ZX0A 4ILXA 1YDAA 2GEHA 1JV0A 3M1KA 1BNNA 4N16A 4YWPA 4DZ7A 6CA2A 3TVOX 4Q7WA 2POVA 5FNKA 2CBDA 1CIMA 3MNUA 1I9NA 1J9WA 4K0SA 4RUXA 5FL4A 5JGTB 2NN1A 4HU1A 1UGAA 3OY0A 3RZ0B 3N3JA 4Q7SA 3MNAA 3DCCA 1I90A 3U3AX 3GZ0A 1ZE8A 3F8EA 1OKNA 3N2PA 3RG3A 3M14A 1FQLA 1RZAA 1T9NA 1FQMA 2CABA 4QSAA 4XIWA 1TEUX 1CALA 4Z1EA 5DOGA 5E2KA 3PYKA 1BNWA 3TMJA 3HKQA 1F2WA 5DSIA 3IEOA 1CVFA 4QJMA 3PJJA 2W2JA 2CA2A 4RN4A 5FNLA 5G0BA 3ZNCA 1G6VA 3IBUA 4QSJA 2WEHA 4Q6DA 3T83A 1CAIA 1YDBA 5DVXA 1G53A 1ZFQA 5SZ0A 2AW1A 1XEGA 4M2UA 3RYYA 5L6KA 5FLQA 3K7KA 1ZNCA 1ZGFA 3HKUA 5EHEA 3OKUA 4BF1A 4K0ZA 3V5GA 3DVBA 1CRMA 3W6IA 4BF6A 4C3TA 3RYZA 2HNCA 3DCSA 5IPZA 3U7CA 4PQ7A 1HVAA 1YO0A 4JSZA 3V3JA 5EIJA 1BCDA 3FW3A 3KWAA 5AMGA 5CLUA 4QY3A 2HFWA 1JCZA 5BNLA 3KOIA 4UOVA 3HLJA 5DSPA 3IGPA 4YXIA 2FOVA 5L3OA 1V9IC 3P3JA 5DSOA 3R16A 5EH5A 1CAKA 4RUYA 1KWQA 5G03A 2GD8A 3P4VA 1G0EA 1CVCA 3MZCA 4HF3A 3P58A 2VVAX 1G45A 3Q31A 3TVNX 1CNYA 4QJWA 1V9EA 2POUA 1G3ZA 3JXGA 3M5EA 2Q1BA 4FIKA 1LG5A 3ML2A 1BZMA 5JESB 3U45X 3DC9A 3M04A 4K1QA 4WW8A 1H9NA 1CINA 1BNTA 1YDDA 3HKNA 4KP8A 4Q8YA 3RJ7A 3V3HB 9CA2A 5A6HA 1CNCA 1DMYA 1CANA 5DSKA 3RZ5A 4ZWIA 1BICA 3DA2A 1UGDA 5HPJA 5FLSA 3D92A 4JSAA 1G46A 1CAMA 4KNIA 3DCWA 4Z1NA 2NNVA 1FLJA 1LGDA 2F14A 5SZ3A 5JG5B 3RZ1B 3P5AA 1HUGA 4Q8XA 2O4ZA 4XE1A 3KKXA 1HECA 4YXUA 3LXEA 1G1DA 4XFWA 3OIMA 2NXSA 2NNOA 3OYQA 4Q49A 4M2VA 4MO8A 3S71B 4CA2A 5C8IA 1BN3A 3RLDA 3CYUA 5DSNA 1G52A 1CVEA 4PYXA 5E2NA 1CA2A 4IDRX 3S75B 2WEJA 3M2YA 1KOPA 4YGNA 3S76A 2NWOA 2EU3A 5LMDA 1TTMA 5AMLA 1KEQA 2WEGA 1BNMA 1IF4A 2NMXA 4Z0QA 4XZ5A 3W6HA 3P55A 4JSSA 1RAZA 1ZSCA 3F7UA 3M1JA 3ML5A 3IBLA 5CJFA 3HFPA 4MLXA 4Q78A 1TG3A 4HEWA 5E28A 2FOQA 4Q9YA 5BRWA 4QJPA 5CA2A 2HL4A 4Q6EA 4E3GA 5FNHA 4R59A 5EH7A 3OKVA 1RZCA 1IF8A 2CBCA 4HBAA 1CVBA 5FDCA 2WD3A 3IBIA 1OQ5A 3EFTA 5E2RA 1FR4A 5G01A 3MHCA 2QP6A 3M3XA 3P3HA 4QJOA 1LZVA 3M1WA 4QEFA 4RIVA 5CACA 1HUHA 4E4AA 1A42A 2OSFA 2QOAA 4Y0JA 5FNIA 3S97A 3B4FA 1CVDA 3SBHA 1MOOA 1AM6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OYS A;  4CNX A;  3D8W A;  4QIY A;  4KUW A;  4IWZ A;  3JXF A;  2OSM A;  1Z97 A;  2ILI A;  12CA A;  3D93 A;  1DCB A;  1G4O A;  3NJ9 A;  5BRU A;  1CVA A;  2FNN A;  3IAI A;  1CNK A;  2FNK A;  3RZ8 A;  3MHO A;  3MHI A;  4Q09 A;  4MTY A;  2H15 A;  2QO8 A;  1CZM A;  2NN7 A;  4KP5 A;  1FSR A;  4YGJ A;  3N0N A;  3DAZ A;  3M5S A;  4QJX A;  1CCS A;  4Q0L A;  4ETQ C;  3T85 A;  1G0F A;  4BCW A;  5JDV B;  1CNH A;  4Q08 A;  1BN1 A;  3R17 B;  2NWP A;  2ZNC A;  2NWY A;  2IT4 A;  4QK1 A;  4CNV A;  3MNI A;  4QIZ A;  3RYV B;  1UGE A;  3DD8 A;  1RZE A;  4G0C A;  1THK A;  1IF7 A;  3S9T A;  1HEA A;  2WD2 A;  4CAC A;  3V2J A;  3MWO A;  4RFC A;  1FSN A;  5EHV A;  4JS6 A;  3MDZ A;  5EKM A;  1AVN A;  4HEZ A;  3D9Z A;  5G0C A;  4YGK A;  1HED A;  5EKH A;  3F7B A;  3KON A;  4K13 A;  3S78 B;  4YXO A;  3MYQ A;  1CCU A;  2FNM A;  3M5T A;  3KOK A;  1ZSB A;  4YGF A;  4ZWY A;  4Z1K A;  1ZH9 A;  1XPZ A;  3CAJ A;  3DV7 A;  2X7T A;  4TWM A;  3N4B A;  3MHM A;  3V3F A;  4N0X B;  4Q06 A;  4WW6 A;  5FNM A;  4YX4 A;  2HOC A;  3NB5 A; 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