4KNMA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanyl]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
LSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4knmA00
2QO8A 4HEWA 2Q1BA 3HFPA 4HU1A 2NNSA 3MMFA 3OIMA 3DCCA 1IF9A 4IWZA 4JSSA 2NXSA 5SZ2A 3QYKA 4QSAA 4QJMA 4Q8XA 5FNLA 4CQ0A 1CVAA 5C8IA 1TTMA 4UOVA 1BN1A 3TVNX 4YGLA 4YYTA 2NNVA 4QSIA 4LP6A 4YVYA 4KNIA 5DSMA 3M1JA 1AM6A 3M1KA 4K0SA 5DOGA 4Q78A 4WUPA 5EHEA 4MLTA 1TBTX 3FFPX 5DSJA 3M98A 1RZAA 2W2JA 1Z93A 4MDMA 1HECA 2FNNA 1T9NA 5EIJA 5FNMA 4Q8ZA 4YXUA 3P3JA 5FNGA 3T83A 4IDRX 2FMGA 3UYNA 4L5VA 3B1BA 4G7AA 1BCDA 4JS6A 3RZ8A 4QK2A 4QIZA 2HKKA 4QTLA 3M67A 4DZ9A 5E2NA 4MLXA 5JGSB 4Q6DA 3FE4A 5SZ0A 2FOVA 4Z1KA 5BRUA 3M2ZA 5E2KA 1ZSBA 1YO1A 1YDDA 5G03A 3DCWA 1FSRA 1FLJA 4E3FA 4BF6A 3V3FA 3KIGA 1CVEA 2CBBA 4MDGA 4Z1JA 1G54A 5EH8A 2CBEA 3W6IA 2WEHA 4ILXA 5EOIA 1CNCA 1I9NA 2NXTA 1BNTA 5G01A 3D9ZA 1CA3A 1XEVA 1CNYA 3L14A 1RJ5A 3M04A 3M1WA 4E9OX 6CA2A 1IF7A 1CVFA 4FU5A 1OKLA 3IEOA 5E5UA 4Z1EA 4G0CA 5HPJA 1CNHA 5E5RA 4CACA 3M5TA 3EFIA 4E4AA 5BNLA 4KNJA 2CA2A 1G1DA 3DCSA 1MUAA 4R59A 3DD8A 3CA2A 3V2JA 3KOIA 3KKXA 1IF6A 4L5UA 2CBCA 4M2WA 1CAIA 4K13A 5DSIA 5CLUA 1ZSAA 5J8ZA 2O4ZA 2NNOA 5DOHA 1FQRA 1CAKA 5EKJA 1CRAA 1TG9A 2FOSA 3NJ9A 7CA2A 4HT0A 2CBAA 5FNIA 3RYJB 1XEGA 1ZNCA 3S97A 4CNWA 4GL1X 3MWOA 2X7SA 4QIYA 3ZP9A 3M5SA 1BV3A 5DVXA 5FLRA 2IT4A 5FL5A 1OQ5A 4ITOA 1FR7A 3MNKA 5FDIA 3B4FA 1BN4A 1LUGA 4RUXA 5FL6A 3S72B 2FNKA 5BRWA 3TMJA 3V3HB 1RAYA 5E2SA 1RZDA 5EH5A 1BNVA 4Q83A 5DSNA 4Q7WA 4E5QA 1CNGA 2HL4A 3EFTA 1FSNA 2H15A 4HEZA 4Q0LA 3RJ7A 3SAPA 3RYXB 3DAZA 2FW4A 2NN7A 2NXRA 1IF5A 3HLJA 2NWYA 5DRSA 1CCTA 3M2XA 1BNNA 4RFCA 1CAOA 3MYQA 4Q7PA 4YHAA 3OILA 4ZX1A 3DBUA 3U3AX 3HKTA 4Q8YA 4TWLA 1DMXA 1HEDA 2EU3A 3KS3A 3OKUA 5SZ1A 1HEAA 1I8ZA 4WW8A 1G46A 3ZNCA 1HCBA 3T5UA 4KUYA 3P55A 4YGKA 4YXOA 2VVBX 4QK3A 2WEGA 3S74B 4KNNA 3RZ1B 3MHOA 1CAHA 1G45A 2OSMA 1I9LA 1HUGA 5EKHA 4WL4A 2HOCA 4QJ0A 1JCZA 2QP6A 1JD0A 4YGNA 1UGBA 4RIUA 1HEBA 1LG5A 1TG3A 1ZGEA 3SBHA 5FLTA 4XE1A 4KNMA 3K7KA 1CNJA 3M40A 8CA2A 4KV0A 3S77B 4E3GA 1V9IC 3MHLA 5EKMA 3KNEA 4HF3A 4ITPA 3T5ZA 4CNRA 1H4NA 1CCSA 3MNHA 1CAYA 1RJ6A 3BETA 3DVBA 2ILIA 4HEYA 3W6HA 1G6VA 5DSRA 1CAMA 3SBIA 1BZMA 1I9QA 1DMYA 3U47A 3N3JA 4QK1A 3MHMA 1Z9YA 3V3IB 3P3HA 1BICA 4HT2A 5DSLA 5IPZA 1I90A 3V7XA 3U45X 4JSWA 3BL1A 4YGJA 4QJOA 5JEPB 1H9QA 4CNVA 1XQ0A 1YDAA 4JSAA 1YO2A 3M2NA 3T84A 3MNAA 2FOUA 5JEHB 4ZWYA 4RIVA 3OYSA 4CNXA 5G0CA 3K34A 5LMDA 3N4BA 4KUWA 3P4VA 1ZGFA 1UGDA 1V9EA 3IBIA 4Q6EA 3IBNA 2AW1A 4Q99A 4YX4A 1ZH9A 1BN3A 5SZ4A 4RUYA 1I91A 3MHIA 5JDVB 4Q09A 5JGTB 4Q49A 1G4JA 1YO0A 3RLDA 1CALA 4LU3A 3M2YA 3RZ7A 2X7TA 2ZNCA 5JG3B 4YWPA 3LXEA 5FNHA 5SZ3A 3DVDA 5L3OA 5FLOA 1UGEA 1URTA 2ABEA 1CAZA 3V2MA 4M2UA 3S8XA 3M14A 5JESB 3M96A 4FL7A 4Q87A 3RGEA 2WEOA 5G0BA 3F8EA 3CYUA 4N16A 1FQMA 4R5AA 4PQ7A 2AX2A 4RUZA 3TVOX 4E3HA 3IGPA 1Y7WA 3PJJA 3M3XA 5DSQA 1FQLA 5AMLA 3PO6A 1ZSCA 3JXHC 3SAXA 4MTYA 4Q7VA 4ZAOA 5JG5B 3C7PA 1CILA 1RAZA 3VBDA 1G52A 1HUHA 1CANA 3RYYA 3M5EA 5EH7A 1KOQA 4ZWZA 3P44A 4FPTA 2QOAA 5SZ7A 3GZ0A 4BCWA 1BNQA 4Y0JA 1G53A 4CA2A 5FDCA 5FNJA 3N0NA 3D8WA 1OKNA 4PZHA 1UGFA 3RZ0B 3D92A 4HBAA 2Q1QA 1EOUA 5AMGA 1CIMA 4Z0QA 1CNIA 2CBDA 3KLDB 3UYQA 3DD0A 4M2RA 4Q90A 1G3ZA 1DCAA 3OYQA 4YGFA 4QSJA 1I9OA 4DZ7A 4Z1NA 2HFWA 3DV7A 5E28A 3RYZA 3KWAA 4FVOA 3U7CA 1UGCA 4PYYA 4N0XB 1BNWA 3S71B 2FMZA 3F7BA 1TH9A 4XZ5A 3RG3A 2Q38A 3JXGA 1XPZA 4FRCA 5FLQA 2NWZA 3MNJA 1RZCA 2POWA 5JQ0A 3P5AA 3CZVA 1TEUX 3HKNA 3BL0A 1IF4A 4JSZA 5FLPA 1ZFKA 4PXXA 4Q08A 1JV0A 1CAJA 3HKQA 1CVCA 3HS4A 3NB5A 4Q81A 3V3JA 4YXIA 3KOKA 4K0TA 3IBLA 4XIWA 5SZ5A 3F4XA 4ETQC 3R17B 1I9PA 1TE3X 5SZ6A 1ZE8A 2EZ7A 2FOYA 4QY3A 1HVAA 2FOQA 4K0ZA 4WR7A 3S75B 1Z97A 3DC3A 3MNUA 1LZVA 3V5GA 1FSQA 3MZCA 3M1QA 1CNBA 1CVDA 3MDZA 3T85A 1LG6A 1G0EA 3P5LA 5E2RA 1UGAA 2GEHA 1A42A 4K1QA 4L5WA 4LHIA 3KONA 1CNXA 1KWQA 4X5SA 1IF8A 1YDBA 2F14A 1KOPA 5FLSA 1CCUA 1FR4A 5CACA 5AMDA 4KP8A 5EHVA 4WW6A 2GD8A 1CVBA 4WUQA 3S78B 1BNUA 2NMXA 2NWPA 4C3TA 5DSPA 1CNKA 5A25A 3OIKA 1CZMA 3IBUA 4Q7SA 4ZX0A 3OKVA 2WD3A 4TWMA 1KEQA 4COQA 1G48A 3Q31A 1LGDA 5A6HA 2H4NA 1OKMA 2NWOA 3K2FA 4Q07A 3RG4A 4RFDA 1TB0X 2WEJA 3DA2A 4KUVA 3NI5A 3ML5A 4QJWA 3S9TA 4QJPA 3CAJA 2CABA 3JXFA 12CAA 3R16A 1CINA 1RZEA 4RH2A 3RYVB 2NNGA 5JQTA 1ZFQA 1RZBA 4M2VA 4QSBA 3S76A 3IAIA 4XFWA 4E49A 2FNMA 3MNIA 5CA2A 3N2PA 1G4OA 4Q9YA 3V3GB 5FNKA 3FW3A 1HCAA 1DCBA 1CNWA 5BRVA 3RZ5A 5EHWA 3DVCA 5JEGB 1F2WA 3HKUA 3ML2A 3OY0A 4E3DA 4Q06A 4XIXA 5CJFA 3F7UA 1FQNA 5L6KA 5DSOA 3D0NA 2HNCA 2VVAX 4QJXA 2X7UA 1YDCA 9CA2A 1CA2A 1TEQX 5EZTX 3S73B 4FIKA 3T82A 5DSKA 1UGGA 5FL4A 3DC9A 4FVNA 4KAPA 4PYXA 3D93A 1CVHA 1AZMA 2EU2A 1CRMA 2HD6A 1BNMA 2NN1A 5BYIA 1J9WA 1AVNA 3P58A 4BF1A 4RN4A 2POUA 4MO8A 1KWRA 4R5BA 3MHCA 4MDLA 1G0FA 2POVA 1I9MA 3PYKA 4QEFA 1THKA 2WD2A 4ZWIA 5E2MA 1MOOA 4ZWXA 1H9NA 2OSFA 4KP5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QO8 A;  4HEW A;  2Q1B A;  3HFP A;  4HU1 A;  2NNS A;  3MMF A;  3OIM A;  3DCC A;  1IF9 A;  4IWZ A;  4JSS A;  2NXS A;  5SZ2 A;  3QYK A;  4QSA A;  4QJM A;  4Q8X A;  5FNL A;  4CQ0 A;  1CVA A;  5C8I A;  1TTM A;  4UOV A;  1BN1 A;  3TVN X;  4YGL A;  4YYT A;  2NNV A;  4QSI A;  4LP6 A;  4YVY A;  4KNI A;  5DSM A;  3M1J A;  1AM6 A;  3M1K A;  4K0S A;  5DOG A;  4Q78 A;  4WUP A;  5EHE A;  4MLT A;  1TBT X;  3FFP X;  5DSJ A;  3M98 A;  1RZA A;  2W2J A;  1Z93 A;  4MDM A;  1HEC A;  2FNN A;  1T9N A;  5EIJ A;  5FNM A;  4Q8Z A;  4YXU A;  3P3J A;  5FNG A;  3T83 A;  4IDR X;  2FMG A;  3UYN A;  4L5V A;  3B1B A;  4G7A A;  1BCD A;  4JS6 A;  3RZ8 A;  4QK2 A;  4QIZ A;  2HKK A;  4QTL A;  3M67 A;  4DZ9 A;  5E2N A;  4MLX A;  5JGS B;  4Q6D A;  3FE4 A;  5SZ0 A;  2FOV A;  4Z1K A;  5BRU A;  3M2Z A;  5E2K A;  1ZSB A;  1YO1 A;  1YDD A;  5G03 A;  3DCW A;  1FSR A;  1FLJ A;  4E3F A;  4BF6 A;  3V3F A;  3KIG A;  1CVE A;  2CBB A;  4MDG A;  4Z1J A;  1G54 A;  5EH8 A;  2CBE A;  3W6I A;  2WEH A;  4ILX A;  5EOI A;  1CNC A;  1I9N A;  2NXT A; 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