4Q90A

Crystal structure of 4-methylpyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q90A00
1RZBA 3R16A 1CNHA 3F8EA 4KUWA 4ZX0A 2Q1BA 2FW4A 4FU5A 4HU1A 5A25A 4QIYA 5E5UA 1G3ZA 4UOVA 1LZVA 1BNTA 4BCWA 4HEZA 2NWOA 4L5VA 4QJXA 1IF8A 4QSJA 4E3DA 5FL5A 1AVNA 4E3HA 4CNWA 3D9ZA 1ZE8A 3U3AX 5E2MA 4KNJA 1HEDA 4IDRX 3MMFA 1FSRA 3UYNA 4E9OX 1CAKA 1I9MA 3S76A 1UGAA 5JEPB 5SZ3A 3S74B 1CNJA 1IF6A 1JV0A 2NWPA 2HNCA 4PQ7A 3FE4A 3HS4A 1CAMA 2W2JA 3M5TA 3P58A 3K34A 1Z93A 1UGFA 3NI5A 3PJJA 5EH8A 5G0CA 4GL1X 4LHIA 2NNGA 3JXHC 4E5QA 3DC3A 4WL4A 5DSIA 2NXSA 3C7PA 4C3TA 1Y7WA 5HPJA 3F4XA 3IBUA 4KNNA 3M1QA 5BYIA 1HUGA 4ITPA 4Z1EA 4Z1NA 1CVHA 4Q7PA 3RYYA 1FR7A 4KP5A 1BN3A 1THKA 1RAZA 4RUZA 3W6IA 3T5UA 4FL7A 4CACA 3JXFA 1V9IC 4QK2A 4ZX1A 2Q1QA 4K13A 1FQNA 4N0XB 4YWPA 4MO8A 4Q49A 2FNNA 1OQ5A 3NB5A 5EHWA 2POUA 3OIMA 3S73B 2H4NA 3T82A 1OKLA 5L3OA 4JSZA 2CBBA 3EFIA 4IWZA 4ZWYA 1G53A 3CZVA 3KS3A 1UGDA 3D92A 1IF9A 1G4OA 2QP6A 3MNAA 1JCZA 4RFCA 3M67A 4QJOA 3RYZA 3TMJA 1CVEA 2GD8A 3MNJA 4YGNA 2Q38A 5DSPA 3IEOA 4KP8A 3IBLA 1G6VA 1ZSAA 5DOHA 3S72B 1CAOA 5E2SA 3KNEA 3L14A 1J9WA 3N0NA 3P5LA 1KOPA 3D93A 1RZDA 3HKQA 4ILXA 1TE3X 3V3JA 4Z0QA 5EOIA 1CA3A 5FL6A 3S97A 1TG3A 5JQTA 3V2MA 3V5GA 4FVOA 4QK3A 4RN4A 5FNIA 4XIWA 4MLTA 4MTYA 4YYTA 4MDGA 4YGJA 4YGKA 4KUVA 2ZNCA 4Q07A 2OSFA 5AMLA 3RLDA 5EH5A 1CRAA 3S75B 4Z1KA 5DOGA 3T5ZA 3B4FA 4RIUA 4ETQC 3OKUA 3W6HA 4Q7WA 3V3FA 5JDVB 2OSMA 1HCBA 5AMGA 4K0TA 1MOOA 3Q31A 1RAYA 1BV3A 4ZWXA 3DA2A 3M3XA 5FNJA 3ZNCA 1FQLA 4YVYA 3SAXA 4TWMA 3IAIA 2FOUA 1I9QA 4R59A 2ILIA 3RZ1B 1XEGA 3S71B 5FDCA 5E2NA 4CQ0A 5DSQA 3IBNA 1DMXA 1HECA 1BCDA 4QK1A 1CRMA 1XPZA 3SBHA 3OYSA 4JSSA 4Q0LA 5BRVA 4KNMA 4MDLA 3BETA 1G0EA 1BNVA 2GEHA 3MNHA 3GZ0A 4XZ5A 3N2PA 1H9QA 3IBIA 1KWQA 3S78B 1BNQA 5G01A 3DCCA 3HFPA 4N16A 1CCSA 3M40A 2WD3A 3N3JA 4DZ9A 4KV0A 2WEJA 4ITOA 5SZ0A 3LXEA 5SZ6A 3RYVB 3M2XA 1DMYA 3M5EA 4FIKA 4RIVA 3MHOA 1YDAA 4Q90A 4HEYA 4QJ0A 3T83A 1TEUX 3M5SA 5EH7A 4L5UA 1CANA 1CNGA 2NWYA 4PXXA 4TWLA 2POWA 2FNKA 4YGLA 1Z97A 4Q81A 4FPTA 4YX4A 4QY3A 1KEQA 5EHEA 1KOQA 4QJPA 3OY0A 3M98A 3PO6A 5AMDA 3P44A 4QSBA 5JGSB 4CNRA 3HKNA 4M2UA 3M04A 5DSMA 5JQ0A 5SZ5A 5SZ2A 4XFWA 5FNLA 1YO1A 1TTMA 3DCSA 3M14A 4ZAOA 1CNBA 4K1QA 4XIXA 3F7UA 1BN4A 3S77B 5FL4A 3RZ8A 2X7SA 1G54A 3OILA 4ZWIA 1YO0A 1BNMA 4JS6A 1I9OA 1I9LA 4L5WA 1V9EA 1CCUA 1YDCA 2NNSA 4QSAA 4HT2A 4Q9YA 4HF3A 4M2RA 4MDMA 2ABEA 1HVAA 4LP6A 1I90A 1FQRA 3HLJA 2CBCA 5IPZA 5E28A 1CZMA 3MHLA 4K0ZA 5EIJA 5E2RA 1TEQX 2X7UA 1I9NA 5FNHA 4Q7VA 1JD0A 3DVDA 3MNUA 3ML2A 1LG6A 3RZ7A 1G1DA 1ZSCA 12CAA 3M96A 4WW6A 1AZMA 5FLPA 5JEGB 4R5BA 1FQMA 3IGPA 3VBDA 2AW1A 5SZ7A 2HKKA 3RGEA 2F14A 3CAJA 2QOAA 4Y0JA 4WUQA 4YGFA 2HFWA 3MNKA 2VVAX 4DZ7A 4Q08A 5FNGA 2HL4A 5JG3B 1I91A 2X7TA 5E2KA 1CAJA 5CA2A 4R5AA 1G4JA 4BF1A 1CALA 5JEHB 3ML5A 1CNIA 2HOCA 2IT4A 1URTA 4CNVA 3V3GB 1HUHA 1CVCA 1IF5A 3KIGA 1G45A 2WD2A 1G48A 6CA2A 4HT0A 3M2YA 2NXTA 5DRSA 4M2VA 1ZSBA 2O4ZA 1UGGA 2WEOA 3T84A 4Q99A 3TVNX 2NN7A 3CYUA 1Z9YA 4YHAA 3U45X 1XQ0A 5FLQA 1RJ5A 4KUYA 2FOYA 4E49A 3MNIA 4G0CA 3V2JA 3M2ZA 3V3IB 1HEBA 3P3HA 1BNWA 4HEWA 3RZ5A 1I9PA 2WEGA 3RJ7A 2VVBX 1IF7A 2HD6A 3P55A 1CNYA 1CAYA 1CINA 5DSKA 3DD8A 1YO2A 9CA2A 1UGCA 2FNMA 3K2FA 1CNXA 1CIMA 1OKNA 4LU3A 1A42A 1RZEA 1FLJA 1CVAA 4YXIA 4Q06A 1ZFKA 1BN1A 1CVDA 1KWRA 3DCWA 1CVBA 3OYQA 3KKXA 4RUYA 4QTLA 1H4NA 1DCAA 3KONA 1G52A 5DSOA 1CNWA 1AM6A 4Z1JA 5CJFA 5FNKA 4XE1A 5JESB 1BNUA 3D0NA 5FDIA 3CA2A 1CCTA 4Q8ZA 4Q6DA 3MDZA 1RJ6A 3ZP9A 5LMDA 1RZCA 4E3GA 3DVCA 1FSQA 4PZHA 5L6KA 5JGTB 3P3JA 1YDDA 2CA2A 3QYKA 1RZAA 3TVOX 1TBTX 3DC9A 5SZ4A 1TB0X 3MYQA 1OKMA 1UGEA 3N4BA 7CA2A 1BICA 3DV7A 4WR7A 3M2NA 4QJWA 1DCBA 3KWAA 5EKJA 3FW3A 1LGDA 2WEHA 3S8XA 4CA2A 1CAHA 4G7AA 3DVBA 3RG4A 5A6HA 5E5RA 1F2WA 2NXRA 5EHVA 4E3FA 3D8WA 1MUAA 4Q09A 3MZCA 3JXGA 1ZGFA 5FNMA 5DSNA 3EFTA 5BRWA 2NNOA 2NMXA 3U47A 3MHIA 3OKVA 1FSNA 4KNIA 4Q78A 3V7XA 4WW8A 3SBIA 5G0BA 1BZMA 5C8IA 1CILA 4CNXA 1G0FA 2CBEA 1BNNA 4HBAA 5CLUA 4RH2A 3KOIA 1CNCA 5FLSA 2FMGA 1LG5A 3P5AA 3SAPA 2POVA 2CBDA 1YDBA 3OIKA 1HCAA 1IF4A 2FOSA 2H15A 1ZH9A 4QJMA 4FVNA 1TH9A 1TG9A 4KAPA 1FR4A 4FRCA 3S9TA 1ZGEA 3DAZA 3RYXB 4PYYA 3K7KA 1CAIA 4QSIA 5EKHA 5EZTX 4COQA 2EZ7A 2CBAA 3DD0A 4QIZA 5DVXA 4PYXA 2EU3A 4X5SA 4Q7SA 5BRUA 4MLXA 2NNVA 3NJ9A 3M1KA 5FLRA 3DBUA 1CA2A 1LUGA 3MHCA 5DSJA 3R17B 2FOQA 4Q8YA 1UGBA 3RYJB 1HEAA 3B1BA 3M1WA 3BL0A 4K0SA 2QO8A 2AX2A 1CAZA 4ZWZA 2FMZA 4RUXA 1CVFA 1G46A 4JSAA 5G03A 2NWZA 2EU2A 5BNLA 1H9NA 3PYKA 3M1JA 4Q87A 3MWOA 3V3HB 4JSWA 4QEFA 4RFDA 5SZ1A 4Q8XA 5J8ZA 5CACA 5EKMA 2CABA 1ZFQA 3F7BA 4Q6EA 4WUPA 3FFPX 5DSLA 3KOKA 1T9NA 3MHMA 5FLTA 5FLOA 3HKUA 3U7CA 4Q83A 4BF6A 1CNKA 3P4VA 4M2WA 4YXUA 3RG3A 4E4AA 3HKTA 2NN1A 3KLDB 3T85A 4YXOA 3RZ0B 1EOUA 5DSRA 3UYQA 1I8ZA 2FOVA 3BL1A 5JG5B 1ZNCA 8CA2A 1XEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RZB A;  3R16 A;  1CNH A;  3F8E A;  4KUW A;  4ZX0 A;  2Q1B A;  2FW4 A;  4FU5 A;  4HU1 A;  5A25 A;  4QIY A;  5E5U A;  1G3Z A;  4UOV A;  1LZV A;  1BNT A;  4BCW A;  4HEZ A;  2NWO A;  4L5V A;  4QJX A;  1IF8 A;  4QSJ A;  4E3D A;  5FL5 A;  1AVN A;  4E3H A;  4CNW A;  3D9Z A;  1ZE8 A;  3U3A X;  5E2M A;  4KNJ A;  1HED A;  4IDR X;  3MMF A;  1FSR A;  3UYN A;  4E9O X;  1CAK A;  1I9M A;  3S76 A;  1UGA A;  5JEP B;  5SZ3 A;  3S74 B;  1CNJ A;  1IF6 A;  1JV0 A;  2NWP A;  2HNC A;  4PQ7 A;  3FE4 A;  3HS4 A;  1CAM A;  2W2J A;  3M5T A;  3P58 A;  3K34 A;  1Z93 A;  1UGF A;  3NI5 A;  3PJJ A;  5EH8 A;  5G0C A;  4GL1 X;  4LHI A;  2NNG A;  3JXH C;  4E5Q A;  3DC3 A;  4WL4 A;  5DSI A;  2NXS A;  3C7P A;  4C3T A;  1Y7W A;  5HPJ A;  3F4X A;  3IBU A;  4KNN A;  3M1Q A;  5BYI A;  1HUG A;  4ITP A;  4Z1E A;  4Z1N A;  1CVH A;  4Q7P A;  3RYY A;  1FR7 A;  4KP5 A;  1BN3 A;  1THK A;  1RAZ A;  4RUZ A;  3W6I A;  3T5U A;  4FL7 A;  4CAC A;  3JXF A;  1V9I C;  4QK2 A;  4ZX1 A;  2Q1Q A;  4K13 A;  1FQN A;  4N0X B;  4YWP A;  4MO8 A;  4Q49 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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