4QSBA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 3-{[(4-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)thio]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structure Correlation of Benzenesulfonamides with a Pyrimidine Moiety Binding to Carbonic Anhydrases I, II, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qsbA00
1ZSCA 1ZGFA 1CNGA 4PZHA 4Q0LA 1RAYA 1OKLA 4YGJA 1G53A 1ZFKA 2NXSA 4Q9YA 3M1QA 5SZ3A 1CNJA 3M2NA 4RFCA 1XEVA 3IBNA 1CNIA 1FLJA 3MWOA 3MNIA 3NI5A 4QJMA 2WD2A 3CZVA 5SZ2A 1UGBA 1H4NA 3V2JA 5G0CA 3V5GA 3HS4A 4YVYA 5EKHA 5G0BA 1YO2A 4PQ7A 3S74B 1TH9A 3KNEA 4KNJA 5E2NA 4N16A 5SZ6A 3MNAA 1CNKA 2AW1A 4TWMA 5G01A 5BRVA 1YO1A 1RZAA 1YDBA 1BICA 4ILXA 4Q7VA 3R17B 2NNOA 4QIZA 1FSRA 3K7KA 3MHOA 2FNKA 4R5BA 2HNCA 5JEGB 1Z93A 1HCAA 2FOYA 4LHIA 5FNMA 1IF5A 1JCZA 3P4VA 3S75B 3JXFA 4R5AA 3MNHA 4QJXA 5E2MA 2ZNCA 4Z1JA 1IF9A 3OKUA 2Q1BA 1FR4A 3S71B 2GEHA 3DAZA 5DVXA 3OIKA 5DSRA 3M2ZA 3U47A 3V3HB 3DVDA 5FNGA 3TVNX 5FL5A 3BL0A 4YXIA 3MYQA 3BETA 5DOGA 4WW6A 1I9MA 3FE4A 3HKUA 3S78B 4M2UA 1CNXA 2IT4A 4BF1A 5L6KA 2HFWA 3DV7A 2AX2A 2NWYA 1J9WA 1ZE8A 3DD8A 4JSAA 4MLXA 3V7XA 4Z0QA 2F14A 4RN4A 3K2FA 3JXHC 3V3JA 3F7UA 3KWAA 2X7UA 4ZAOA 2CBEA 5FNIA 4FRCA 4JSSA 5FNHA 1CNHA 3P5LA 4RUYA 1RJ6A 4KNMA 3B4FA 3ML2A 5E2RA 3T82A 4DZ7A 3UYNA 1CNBA 3M5EA 1DMYA 3CA2A 3K34A 4Q8YA 3DA2A 3FW3A 4FL7A 3MDZA 1CAJA 4Q06A 4XIWA 3RZ5A 1IF6A 4E4AA 3V3GB 1OKNA 4MDMA 3T83A 3D0NA 4QK1A 1Z97A 3OYSA 2FOVA 1CNYA 1BN3A 1TG3A 3NJ9A 4XE1A 5AMLA 4MO8A 5FNKA 4E3HA 4XIXA 3D93A 5FDIA 4G0CA 4FVOA 5DSLA 5A25A 3TMJA 2NXRA 1G0FA 3ZP9A 2POUA 5EH5A 1FQLA 3F7BA 2NNVA 4ITOA 3KS3A 3HLJA 4CACA 1FQMA 3GZ0A 4QJOA 3U45X 1LZVA 1CVEA 5DSJA 1F2WA 3IBUA 3MHCA 5EHWA 4L5VA 3RG3A 4Q08A 1G0EA 4QJ0A 4Z1KA 3M40A 3UYQA 4E3FA 4E49A 4LU3A 2HOCA 4KUWA 3CYUA 4YGFA 1CINA 5JGTB 1CNWA 1BZMA 4YYTA 4Q8XA 4PYYA 4ZWXA 1G1DA 3IAIA 4QJWA 1AVNA 1G48A 2CBDA 3MHIA 3MNJA 4MDGA 4WUPA 1ZFQA 1G54A 2HKKA 2W2JA 3LXEA 4KV0A 4HT2A 3M2YA 3D8WA 4R59A 4QIYA 4WR7A 1KOPA 3M67A 4QEFA 5EKMA 3DCCA 3RLDA 5EIJA 1IF8A 3MMFA 1HVAA 3OKVA 4HU1A 4M2RA 4KUVA 1G52A 1I9PA 1LG6A 5DRSA 5E5UA 5DSMA 4IWZA 1CILA 1CCTA 4RIUA 1TG9A 3DVCA 1BNUA 5JDVB 3OILA 1TB0X 1ZSBA 4YXUA 1JD0A 1CVHA 2CBCA 3U7CA 5JEHB 3RYZA 2FNMA 3RZ7A 1RZDA 3KKXA 4KP5A 3Q31A 3P3HA 2CA2A 5FNJA 4COQA 4QSJA 1BV3A 4Q49A 4KUYA 1RZCA 5BRWA 4KP8A 2POWA 3FFPX 1BNNA 3C7PA 4FVNA 3OY0A 5EHVA 3S77B 1CRMA 3T5UA 3M2XA 5IPZA 4KNNA 4K0ZA 5G03A 1CALA 3D92A 1I9LA 3U3AX 1BNMA 4Q7SA 1IF7A 1I91A 4RUXA 5JQ0A 2HL4A 2NMXA 3M04A 3RYYA 2EZ7A 4YGLA 5EZTX 1UGAA 3KONA 1I8ZA 3MZCA 3P3JA 4BCWA 2ABEA 2NN1A 1HUHA 1G4OA 2WEGA 1TEUX 5DSOA 3M1KA 3DCSA 5JEPB 2CABA 4WL4A 3SBHA 1CNCA 1BNWA 1BNVA 2HD6A 3S8XA 1RAZA 3V3IB 3RGEA 2FOQA 1IF4A 3F8EA 1KWQA 5E2SA 1CVBA 2EU3A 4ETQC 3T84A 4CA2A 5L3OA 4BF6A 5BNLA 1OKMA 3P55A 1UGEA 3HKTA 1T9NA 4YGNA 1I9QA 3N0NA 3IBLA 1ZGEA 3RYJB 2OSMA 4Y0JA 2NXTA 1LUGA 1G3ZA 4RH2A 5FNLA 2FOUA 1XEGA 5CACA 1ZNCA 4L5WA 4MLTA 5EKJA 4Q81A 4LP6A 7CA2A 2NNGA 1UGFA 3PJJA 5JGSB 4ZWIA 1BNQA 4XZ5A 4YHAA 9CA2A 1CZMA 5DSQA 4IDRX 4JSWA 4HT0A 4Q99A 4Q78A 1CA3A 1CRAA 3IGPA 3M1WA 4Q83A 5FL4A 4HEWA 4WW8A 12CAA 1FQRA 5FLOA 4CNVA 4PXXA 2VVAX 1FR7A 4Q8ZA 2OSFA 4X5SA 5E5RA 2WEJA 1G45A 2QOAA 4YWPA 1DMXA 4KAPA 2CBBA 2QP6A 3NB5A 3ZNCA 4ITPA 3RZ0B 3SAPA 1Y7WA 1HCBA 1KWRA 2GD8A 2VVBX 3RYXB 1CAOA 2X7SA 4ZX0A 4Q07A 5E28A 1G6VA 3DCWA 1RJ5A 4RUZA 1BCDA 1OQ5A 4FU5A 4HBAA 4Q87A 4K1QA 4TWLA 1DCAA 1G4JA 1TE3X 3MNKA 4C3TA 1TTMA 3QYKA 3P58A 1HEDA 4RIVA 1KEQA 3M3XA 1I90A 3HFPA 4N0XB 3S76A 2FW4A 1I9OA 3N2PA 3D9ZA 1TBTX 3M98A 5SZ5A 3EFIA 1CCUA 3T85A 5DSNA 5E2KA 1HECA 4Q90A 3V3FA 4L5UA 4GL1X 4YGKA 1MUAA 1FSQA 4HEZA 5SZ4A 3W6IA 4MTYA 3HKNA 3N4BA 3SAXA 4Q6EA 1YO0A 1ZSAA 3W6HA 2WEOA 2H15A 2NWPA 1XPZA 3PO6A 3M1JA 3V2MA 3KOKA 1CAYA 1CVDA 4E5QA 5SZ7A 8CA2A 4QK2A 1BNTA 1BN4A 4HEYA 4MDLA 5CLUA 5JG3B 4DZ9A 4QSIA 5EH7A 1XQ0A 5CJFA 3S72B 3DD0A 1CAZA 5JQTA 3BL1A 5HPJA 5J8ZA 2H4NA 2FNNA 3DVBA 4CQ0A 1EOUA 5A6HA 4Z1EA 2NWOA 3P44A 4YX4A 5BYIA 1UGCA 3DBUA 3L14A 1G46A 1RZBA 1YDAA 1CAHA 4FPTA 4K13A 4Q6DA 4QSAA 4RFDA 3DC3A 3OYQA 4M2WA 4PYXA 4YXOA 3JXGA 1URTA 1V9EA 3KOIA 3TVOX 1H9NA 1CANA 4CNXA 4CNRA 5DSIA 4WUQA 4Q09A 2O4ZA 2EU2A 3SBIA 3EFTA 4K0TA 4G7AA 1HUGA 3M5SA 1LG5A 1YDDA 4E9OX 1CVAA 1FQNA 4QY3A 4FIKA 2WEHA 4QK3A 5FLQA 3PYKA 2CBAA 3IBIA 3IEOA 1CVFA 1HEBA 3KLDB 4M2VA 1I9NA 3F4XA 4JS6A 4JSZA 4E3DA 3B1BA 1KOQA 1Z9YA 3OIMA 3S97A 2FMGA 5LMDA 2WD3A 1UGDA 3P5AA 3KIGA 1H9QA 3ML5A 4UOVA 5EHEA 1HEAA 4Q7WA 4ZWZA 1LGDA 1BN1A 3MHMA 3CAJA 2X7TA 1CVCA 2Q38A 4CNWA 4QTLA 5EH8A 2FOSA 1CAKA 5JG5B 1AZMA 1A42A 1CAIA 1CCSA 1RZEA 1UGGA 4ZWYA 1CA2A 1FSNA 5FLSA 1CAMA 5DSKA 4Q7PA 5DOHA 1AM6A 5FLPA 1YDCA 3N3JA 5EOIA 2ILIA 5JESB 2NNSA 3MHLA 5FLTA 2Q1QA 2QO8A 1TEQX 4HF3A 3T5ZA 3RYVB 4KNIA 5FL6A 1V9IC 3VBDA 5SZ0A 5AMDA 3RJ7A 3M14A 4ZX1A 5C8IA 3RZ1B 3R16A 2NWZA 4E3GA 2POVA 1DCBA 1THKA 5AMGA 5FLRA 5CA2A 2NN7A 3HKQA 4K0SA 5SZ1A 4QSBA 3M96A 5BRUA 3DC9A 1CIMA 1JV0A 5DSPA 3RZ8A 6CA2A 1MOOA 4XFWA 3S73B 4QJPA 2FMZA 3MNUA 3RG4A 3M5TA 5FDCA 3S9TA 1ZH9A 4Z1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZSC A;  1ZGF A;  1CNG A;  4PZH A;  4Q0L A;  1RAY A;  1OKL A;  4YGJ A;  1G53 A;  1ZFK A;  2NXS A;  4Q9Y A;  3M1Q A;  5SZ3 A;  1CNJ A;  3M2N A;  4RFC A;  1XEV A;  3IBN A;  1CNI A;  1FLJ A;  3MWO A;  3MNI A;  3NI5 A;  4QJM A;  2WD2 A;  3CZV A;  5SZ2 A;  1UGB A;  1H4N A;  3V2J A;  5G0C A;  3V5G A;  3HS4 A;  4YVY A;  5EKH A;  5G0B A;  1YO2 A;  4PQ7 A;  3S74 B;  1TH9 A;  3KNE A;  4KNJ A;  5E2N A;  4N16 A;  5SZ6 A;  3MNA A;  1CNK A;  2AW1 A;  4TWM A;  5G01 A;  5BRV A;  1YO1 A;  1RZA A;  1YDB A;  1BIC A;  4ILX A;  4Q7V A;  3R17 B;  2NNO A;  4QIZ A;  1FSR A;  3K7K A;  3MHO A;  2FNK A;  4R5B A;  2HNC A;  5JEG B;  1Z93 A;  1HCA A;  2FOY A;  4LHI A;  5FNM A;  1IF5 A;  1JCZ A;  3P4V A;  3S75 B;  3JXF A;  4R5A A;  3MNH A;  4QJX A;  5E2M A;  2ZNC A;  4Z1J A;  1IF9 A;  3OKU A;  2Q1B A;  1FR4 A;  3S71 B;  2GEH A;  3DAZ A;  5DVX A;  3OIK A;  5DSR A;  3M2Z A;  3U47 A;  3V3H B;  3DVD A;  5FNG A;  3TVN X;  5FL5 A;  3BL0 A;  4YXI A;  3MYQ A;  3BET A;  5DOG A;  4WW6 A;  1I9M A;  3FE4 A;  3HKU A;  3S78 B;  4M2U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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