4QSIA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 5-{[(4-tert-buthyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)thio]acetyl}-2-chlorobenzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structure Correlation of Benzenesulfonamides with a Pyrimidine Moiety Binding to Carbonic Anhydrases I, II, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qsiA00
5DVXA 1G52A 3RYXB 1LGDA 1LZVA 1BV3A 1ZGFA 3OKUA 3PYKA 1BN3A 2HOCA 2HL4A 4YGKA 3S8XA 4FVNA 1XEVA 4DZ7A 2FOQA 3KWAA 1I9MA 3SAXA 3ZNCA 4KUVA 4QJMA 1YO0A 4DZ9A 4R59A 4TWLA 5DSRA 3GZ0A 3S72B 1TG9A 2CABA 5E5UA 2HKKA 3M98A 3RLDA 3DV7A 1G48A 2FNKA 5JQTA 5G0CA 1FLJA 1CVFA 4YXIA 3MNJA 4E3GA 4WW8A 3DC9A 2QOAA 4QSBA 4Q07A 3RYZA 5BRVA 3BL1A 4R5AA 1MOOA 2POVA 2POWA 4E3FA 4M2VA 1OQ5A 4K0TA 4YYTA 3RYJB 2CBCA 3S73B 4E5QA 1LG6A 2POUA 5DRSA 3VBDA 4KNNA 6CA2A 2NNGA 4MDGA 2NWZA 5SZ7A 4QJPA 3V2MA 5FNMA 3M5EA 3MYQA 3RZ7A 3P58A 5SZ6A 3P55A 3OIMA 2VVAX 4CNWA 3K2FA 4Q49A 1KOQA 5JG5B 5SZ2A 2CA2A 2NN7A 3KONA 5EH5A 1KWRA 3M96A 1HEAA 4WUPA 1UGGA 3FE4A 1CZMA 4L5WA 4R5BA 4TWMA 4K0ZA 4Z1EA 1RZCA 3KIGA 4CA2A 4XFWA 2NMXA 3MHCA 4E4AA 4GL1X 2NWPA 3B4FA 5E2RA 3K7KA 2FW4A 5JGTB 3DVBA 1ZNCA 5EH8A 1G3ZA 5EHEA 1BNWA 1HEBA 1TTMA 1TH9A 2QP6A 3SBIA 5IPZA 1RZAA 3F7BA 5SZ3A 1YO1A 3UYNA 1IF5A 4K0SA 2GEHA 4WR7A 5FL5A 4QK1A 3S74B 1CAZA 2Q1QA 3M2NA 4PXXA 4RUYA 3RGEA 1CAMA 4Z1KA 4PZHA 3PO6A 4Q08A 4QY3A 3V2JA 1RAYA 4JSSA 3T84A 4QJOA 3M3XA 1BNMA 1CALA 1CVBA 5CA2A 1UGAA 1G53A 4Z1NA 1TB0X 3U7CA 3U3AX 12CAA 3DC3A 3U45X 5AMDA 4ZWZA 1JD0A 5JQ0A 5DSMA 1EOUA 5JEHB 2WEGA 2WEOA 5E2SA 5G03A 4RUZA 5AMGA 4Q9YA 1TBTX 3M5TA 3DCSA 3D8WA 4Q81A 3HLJA 4YWPA 4G0CA 1LG5A 1CAJA 4KV0A 1CVCA 3IBUA 4KP8A 1BNUA 4Q6DA 5EZTX 4FL7A 1I9PA 1G0EA 1H9QA 1YDBA 5DOGA 4CNXA 1CVAA 4MLXA 1I90A 3V3JA 3S76A 3BL0A 2GD8A 1BNNA 5E5RA 5JEPB 1IF8A 3DVCA 1V9EA 4RFDA 2CBDA 4MO8A 4Q99A 4PYXA 2X7SA 3NI5A 4K13A 2HNCA 3KKXA 5LMDA 5CACA 3M1JA 2WEJA 5DSLA 7CA2A 1IF7A 2NNSA 1BNVA 3MNAA 1JV0A 1CAIA 3DD0A 4JSZA 2FNMA 3DVDA 1UGDA 4KNJA 4XE1A 4XIWA 1RAZA 2HFWA 5FL4A 5FDIA 1HECA 3ZP9A 4IWZA 3F4XA 3JXFA 4Y0JA 4CNVA 4FIKA 1CNKA 2EZ7A 3B1BA 3L14A 2IT4A 1CRMA 5A25A 5BYIA 2ABEA 5BNLA 3NB5A 2FOVA 2Q1BA 3RYVB 3M2ZA 3V3IB 2VVBX 1V9IC 4YGLA 3W6IA 4HU1A 3R16A 3IEOA 1CRAA 3TMJA 4L5VA 2QO8A 2FMZA 5L3OA 1CNYA 4BF6A 5SZ4A 1ZFQA 1HCBA 3FFPX 1YO2A 2NN1A 4KUYA 4C3TA 4QJWA 1IF6A 1TEUX 2ZNCA 4HT0A 5FLPA 5JESB 4KP5A 1FQLA 1I91A 2FOUA 3M40A 5EKHA 3P5AA 1CNHA 4YX4A 3D0NA 4YGNA 2W2JA 1MUAA 1I9QA 4QSAA 5G0BA 4XZ5A 3M67A 1URTA 1KOPA 1Z93A 1RZEA 1RZDA 1BZMA 1G1DA 1THKA 3SAPA 3IAIA 4ILXA 4Q90A 3OKVA 3CZVA 4RN4A 1Y7WA 2H4NA 1ZFKA 4Q06A 4Z1JA 5DSKA 1CVHA 3IGPA 4JSAA 1FSRA 4KAPA 4QK3A 3M1WA 1AZMA 2CBEA 3P3JA 1HCAA 5JEGB 3DA2A 3S77B 4QIYA 5FNKA 4Q6EA 3RYYA 5EKMA 4QJ0A 4HEWA 4RIUA 4FPTA 1ZSCA 5E2MA 1CAHA 3LXEA 4HBAA 3HKNA 4CQ0A 1BN1A 3IBIA 1JCZA 4K1QA 1FSQA 3T5UA 4CACA 4Q7SA 3MHIA 1CAKA 3CYUA 3MNUA 5J8ZA 2NWYA 1G45A 3MDZA 3P4VA 1BICA 1CNGA 4LU3A 3CAJA 3DD8A 3KNEA 5FNHA 5DSNA 4FU5A 3RG3A 2F14A 3T82A 3OILA 3V7XA 1AVNA 2NNOA 4L5UA 1RZBA 4FVOA 1FQRA 3IBNA 5EOIA 3ML2A 3HKUA 4E3DA 3V3FA 1TEQX 3MMFA 1ZGEA 4YVYA 3DAZA 3NJ9A 2EU3A 2H15A 3D92A 1BN4A 4YHAA 4Q7WA 4JSWA 2EU2A 4PQ7A 2FNNA 2OSFA 3DCWA 3MHOA 1CVDA 1UGCA 3M1KA 3DBUA 5AMLA 1ZE8A 1KEQA 3MNHA 3MZCA 3M04A 4HEZA 4G7AA 1DCAA 1G4JA 3MHLA 4Q8XA 3R17B 4X5SA 4QEFA 4QK2A 2CBBA 4ETQC 3M2XA 4MDLA 5EHVA 1CNJA 4M2WA 5FLSA 3M14A 3P3HA 3RZ5A 5E2NA 3RZ1B 4MTYA 5C8IA 3S9TA 1ZH9A 3JXHC 4Q7VA 1CCUA 3T83A 1CNIA 2NNVA 3BETA 1UGFA 5SZ1A 1CNWA 3N2PA 4ZX1A 4KNIA 1OKNA 1BCDA 1BNTA 1KWQA 1H9NA 3EFIA 1DMYA 4PYYA 3Q31A 1G46A 3F7UA 3RJ7A 1T9NA 4ITOA 3N3JA 2NXRA 1YDAA 5FL6A 2O4ZA 4YXOA 5DSQA 5FNJA 4Q78A 5DSPA 1CINA 1CAYA 1FSNA 2X7TA 4QSJA 1CILA 4YGJA 3TVOX 4N0XB 1IF4A 3P5LA 1YDDA 3DCCA 3V5GA 1CA2A 1I8ZA 4WUQA 4Z0QA 3C7PA 4M2RA 1UGBA 5FLTA 4JS6A 3OYSA 5A6HA 4CNRA 2WD2A 3SBHA 3EFTA 1YDCA 5HPJA 3QYKA 1FR7A 2AW1A 1AM6A 1UGEA 2OSMA 3PJJA 4ZX0A 2NWOA 5FNGA 1LUGA 1F2WA 2X7UA 5CJFA 1I9OA 1HEDA 5DSIA 4BF1A 1FR4A 5CLUA 4ZAOA 1XQ0A 5DSJA 8CA2A 1DMXA 1HUGA 3ML5A 3M2YA 1DCBA 3MNIA 5DOHA 2Q38A 4HT2A 5SZ5A 1RJ6A 4QTLA 5FDCA 5DSOA 4MLTA 1Z97A 5JGSB 2FOSA 4LP6A 1G0FA 3M1QA 4Q83A 5BRUA 1CA3A 3KS3A 4E49A 3S78B 4ITPA 3MHMA 1H4NA 1I9NA 3M5SA 4QSIA 2AX2A 3S75B 1CIMA 1CNXA 1I9LA 3V3GB 4Q87A 3KLDB 4KNMA 4MDMA 4Q8YA 3HS4A 5FNIA 4E3HA 4QJXA 1XEGA 3N4BA 3W6HA 4ZWYA 3V3HB 2WD3A 4KUWA 1HVAA 4Q0LA 1XPZA 1OKLA 3U47A 5E28A 5FLQA 1Z9YA 4BCWA 1TG3A 5SZ0A 1A42A 1CNCA 1OKMA 9CA2A 4IDRX 1G4OA 1FQMA 5BRWA 4HF3A 1G54A 3TVNX 4ZWIA 5JDVB 3HKQA 5L6KA 3D93A 4FRCA 4N16A 3K34A 2NXTA 1TE3X 5EIJA 1FQNA 5FLOA 2HD6A 4RIVA 4YGFA 4M2UA 1G6VA 4WL4A 5FLRA 5FNLA 3RZ8A 3T85A 4Q09A 4UOVA 3OY0A 5E2KA 5EHWA 4LHIA 1IF9A 1ZSBA 2ILIA 3JXGA 3MWOA 1HUHA 4YXUA 4Q8ZA 1CCTA 3D9ZA 3CA2A 3OIKA 3KOIA 3OYQA 2NXSA 3HFPA 3HKTA 1RJ5A 3N0NA 2CBAA 4RFCA 4E9OX 3P44A 1CANA 3UYQA 4QIZA 2WEHA 4WW6A 1BNQA 5JG3B 1CNBA 3IBLA 4Q7PA 3KOKA 1CCSA 1CAOA 3FW3A 4RH2A 1ZSAA 2FOYA 4HEYA 3RZ0B 3F8EA 4ZWXA 3S71B 5G01A 5EH7A 4RUXA 3MNKA 5EKJA 3T5ZA 4XIXA 1J9WA 3RG4A 4COQA 2FMGA 3S97A 1CVEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DVX A;  1G52 A;  3RYX B;  1LGD A;  1LZV A;  1BV3 A;  1ZGF A;  3OKU A;  3PYK A;  1BN3 A;  2HOC A;  2HL4 A;  4YGK A;  3S8X A;  4FVN A;  1XEV A;  4DZ7 A;  2FOQ A;  3KWA A;  1I9M A;  3SAX A;  3ZNC A;  4KUV A;  4QJM A;  1YO0 A;  4DZ9 A;  4R59 A;  4TWL A;  5DSR A;  3GZ0 A;  3S72 B;  1TG9 A;  2CAB A;  5E5U A;  2HKK A;  3M98 A;  3RLD A;  3DV7 A;  1G48 A;  2FNK A;  5JQT A;  5G0C A;  1FLJ A;  1CVF A;  4YXI A;  3MNJ A;  4E3G A;  4WW8 A;  3DC9 A;  2QOA A;  4QSB A;  4Q07 A;  3RYZ A;  5BRV A;  3BL1 A;  4R5A A;  1MOO A;  2POV A;  2POW A;  4E3F A;  4M2V A;  1OQ5 A;  4K0T A;  4YYT A;  3RYJ B;  2CBC A;  3S73 B;  4E5Q A;  1LG6 A;  2POU A;  5DRS A;  3VBD A;  4KNN A;  6CA2 A;  2NNG A;  4MDG A;  2NWZ A;  5SZ7 A;  4QJP A;  3V2M A;  5FNM A;  3M5E A;  3MYQ A;  3RZ7 A;  3P58 A;  5SZ6 A;  3P55 A;  3OIM A;  2VVA X;  4CNW A;  3K2F A;  4Q49 A;  1KOQ A;  5JG5 B;  5SZ2 A;  2CA2 A;  2NN7 A;  3KON A;  5EH5 A;  1KWR A;  3M96 A;  1HEA A;  4WUP A;  1UGG A;  3FE4 A;  1CZM A;  4L5W A;  4R5B A;  4TWM A;  4K0Z A;  4Z1E A;  1RZC A; 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