5E2MA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme i with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2mA00
3D93A 3RYZA 1THKA 3Q31A 4UOVA 4MDGA 4ZWXA 3S73B 4K0TA 3B4FA 4Z1NA 4FPTA 2Q1QA 4MTYA 1UGDA 1CNJA 5SZ5A 1XQ0A 4RFDA 4RIVA 4WUPA 5DOGA 4N16A 3MNUA 4MO8A 5DOHA 3M40A 1CA2A 4MDMA 4YX4A 3ZNCA 1CAYA 1G6VA 1ZNCA 3DD0A 1Z97A 4YGFA 4Q7SA 2POVA 3MHLA 5FL6A 1A42A 4YYTA 3OY0A 2FOSA 1CNIA 3RYYA 1LZVA 5JEHB 1Z9YA 3SAPA 1G0FA 1HUHA 2NXRA 3HKNA 2HFWA 2CBEA 1CAIA 1OKLA 4M2WA 1TG3A 1KEQA 4BF6A 4ITOA 4JSSA 4YGJA 3D92A 4ETQC 5G03A 1HUGA 2QO8A 1IF8A 3SBHA 5JESB 3P4VA 5E2NA 1RJ5A 12CAA 4C3TA 5JQ0A 1HCAA 1DMXA 3PYKA 4XIWA 3P55A 4E3DA 2ILIA 1CCTA 2HD6A 3DD8A 4WW8A 1CVCA 5FNKA 1OKMA 4QK3A 4XE1A 2CBBA 3S72B 4X5SA 4XIXA 1CILA 5E2SA 5FLRA 4E3GA 1IF7A 1ZSBA 1IF9A 4CNVA 5IPZA 2NN7A 4ITPA 5EKJA 4ZX1A 1ZFKA 1RAZA 3MMFA 1G4JA 5SZ3A 5E2KA 3S74B 2QOAA 1I9LA 3KLDB 2NWYA 4WW6A 1H4NA 3P3JA 4Q7VA 1CVEA 2EU3A 3DCWA 4QY3A 1BNVA 4QK2A 1BNQA 3IBIA 3MNAA 4YXOA 2VVAX 3P5AA 3P58A 1HEBA 4L5VA 3RZ5A 1RZEA 1MOOA 3ML5A 3T85A 1BNTA 5JG5B 4BCWA 1ZE8A 1J9WA 3HKTA 1FQLA 3KOIA 2Q38A 4RUXA 1CNBA 5EIJA 3MHIA 3S97A 4Q07A 1CAOA 1G0EA 3K34A 4R5AA 5BRVA 8CA2A 1RZBA 4JSZA 1DCBA 4K13A 3M3XA 4JS6A 3KWAA 4RUZA 1BZMA 5FLPA 3W6IA 1BNNA 3L14A 1H9QA 2NWZA 3S75B 1G46A 2X7TA 3QYKA 4YGLA 4ILXA 5G0CA 3P44A 4YHAA 1BNUA 4RN4A 4XFWA 3F7BA 3R17B 4L5UA 2CABA 5FL4A 5FLTA 4CNXA 2VVBX 5CLUA 1IF4A 3NI5A 3DV7A 4Q6DA 4RIUA 4CNRA 2WD2A 3S8XA 3F8EA 3DCCA 4FIKA 1UGFA 3U45X 1CNYA 4KP5A 3M5SA 1RZCA 2NNOA 3OYSA 3MZCA 2WEJA 2NMXA 1JD0A 4JSWA 3JXGA 2FOVA 3ZP9A 1IF5A 4Q0LA 4QJPA 5EKMA 3M2YA 1UGAA 4Q9YA 1Z93A 4WUQA 1RZAA 1CAKA 3P3HA 3RZ7A 2FNNA 1LG5A 2NXTA 5EZTX 1OKNA 3S78B 5DVXA 2OSMA 5G01A 3TVNX 5BRWA 5EH8A 3CAJA 3EFTA 3IEOA 5JG3B 4COQA 5SZ2A 4K0SA 4LP6A 4TWMA 1YO2A 1G53A 1T9NA 1BCDA 2AX2A 4BF1A 4CACA 3DA2A 3K2FA 2ABEA 5SZ1A 1HCBA 1LGDA 3N4BA 3HKUA 1I9OA 4FVOA 1CANA 2X7UA 4R59A 3JXFA 4KNJA 4K0ZA 2NN1A 1URTA 1CNHA 5EHWA 4PXXA 3DC9A 6CA2A 5LMDA 4WR7A 1HEDA 4IWZA 3N0NA 4TWLA 1JV0A 3BETA 4QJ0A 1V9EA 3DC3A 2GD8A 1UGBA 1YDDA 4HT0A 4Q87A 2HNCA 2EZ7A 5EH7A 1FSRA 1FSNA 3IBUA 4LU3A 3OKUA 4YWPA 4Z1EA 4FVNA 3S9TA 1UGGA 3BL0A 4Q83A 1CNGA 4Q8ZA 2IT4A 3NJ9A 1ZH9A 3D9ZA 3M1WA 4QSAA 5DSOA 3RG3A 3B1BA 1TTMA 3MDZA 4QSIA 4CNWA 4HT2A 5DSLA 1YO1A 3U3AX 4GL1X 4YVYA 3CA2A 1G3ZA 3M96A 3VBDA 4Z0QA 3T5ZA 1F2WA 1I90A 2GEHA 1CAMA 5C8IA 1UGEA 1YDBA 2FNKA 4R5BA 1AZMA 4G0CA 5J8ZA 1CVAA 5FNGA 1XPZA 3IAIA 5E5UA 5JGTB 3K7KA 2NNSA 3V3IB 1CVBA 3F7UA 4HEWA 2OSFA 3CYUA 4XZ5A 3KS3A 1RAYA 4HU1A 5E2RA 3R16A 4HEZA 2FOUA 1LG6A 4RFCA 3TMJA 1ZGFA 1TB0X 4Z1KA 3MHOA 4RUYA 3OIKA 4YGNA 3JXHC 4N0XB 5JDVB 4E5QA 2POWA 1CNKA 3DVCA 3V7XA 1G48A 4PZHA 5DSJA 3FFPX 4QJXA 1HECA 2FMZA 3M2ZA 5FNIA 4CA2A 3LXEA 5FDCA 4PYXA 3SBIA 2POUA 5AMDA 4Q81A 5DSKA 1YDCA 1Y7WA 2HOCA 1I9QA 3M04A 3PJJA 4PYYA 3RZ0B 3T83A 1DCAA 4KP8A 4M2RA 3OKVA 4G7AA 3T82A 4KNIA 2H4NA 1XEVA 2FOQA 1G1DA 1FSQA 4Q06A 1TH9A 1CALA 1CRMA 1DMYA 1JCZA 2H15A 3KNEA 3N3JA 5FNLA 3SAXA 2CBDA 1HVAA 3FE4A 2NXSA 3M98A 5SZ4A 1CINA 2FNMA 2NWPA 3V2MA 3KOKA 3N2PA 1KWRA 1G54A 5FL5A 1V9IC 4Q90A 3KIGA 4KAPA 1H9NA 1CA3A 3OILA 5SZ6A 2AW1A 1G52A 5FNJA 3RJ7A 2WEOA 7CA2A 3UYQA 1CVFA 3M1QA 4YGKA 2FW4A 5CA2A 3ML2A 3IBNA 1YO0A 4FU5A 5DSMA 4MLXA 3DBUA 4KUVA 5JQTA 3MWOA 3GZ0A 3S77B 1I91A 5A6HA 5SZ7A 1BNMA 1CNXA 2HL4A 5SZ0A 1FR4A 3MNKA 3V3JA 3M14A 4RH2A 4QIYA 4ZWZA 1KOPA 1G45A 2ZNCA 4Q7PA 4Y0JA 5E28A 3HLJA 3M67A 5FLQA 3T5UA 3HFPA 3D8WA 1FLJA 1HEAA 3C7PA 4ZAOA 4Q08A 4QIZA 3S76A 5BNLA 1CAJA 5JEGB 1IF6A 3BL1A 2O4ZA 3OYQA 1BNWA 4QEFA 3V3FA 1CNWA 4Q09A 1G4OA 4FL7A 4Q8YA 1BV3A 1OQ5A 5AMGA 4CQ0A 5DSIA 1AVNA 4Q78A 3S71B 5BYIA 1CAZA 5A25A 5L6KA 3P5LA 2EU2A 3MHCA 1I8ZA 3W6HA 1CRAA 5DSQA 2WD3A 3DVDA 3RYJB 1CIMA 4LHIA 5CJFA 3RZ8A 3M2NA 5FLOA 1CVDA 3MYQA 2CBAA 3M5EA 3OIMA 5BRUA 3MHMA 1CAHA 3TVOX 3RZ1B 1RZDA 1FQRA 3M2XA 5DSNA 4YXUA 1AM6A 4E4AA 5EHVA 3V5GA 2NNVA 3HKQA 4K1QA 5JGSB 5FLSA 1LUGA 4PQ7A 4Q49A 4QK1A 3U47A 3IGPA 4KUWA 2FMGA 3T84A 4ZWYA 4Q8XA 3MNIA 3HS4A 2NWOA 1RJ6A 5DSPA 1YDAA 4HEYA 1I9NA 1KOQA 2HKKA 4Z1JA 5L3OA 4E3HA 4ZX0A 1FQMA 1FR7A 4M2VA 2X7SA 1CCSA 4HF3A 5E2MA 3RLDA 5E5RA 4E49A 3V2JA 3KKXA 1FQNA 5FDIA 1ZGEA 2F14A 2WEHA 3IBLA 3NB5A 4QSJA 4KUYA 5EH5A 3M5TA 1ZSAA 3MNJA 4DZ7A 4KV0A 3F4XA 1I9PA 2W2JA 1CVHA 4QJMA 4Q7WA 4MLTA 4QSBA 5HPJA 4FRCA 1XEGA 1UGCA 4E3FA 3D0NA 5EHEA 3DVBA 1BN1A 5FNMA 4MDLA 4KNMA 4M2UA 4DZ9A 3CZVA 3PO6A 3RG4A 3V3GB 4ZWIA 3DCSA 5AMLA 1MUAA 3RYXB 4KNNA 1BN4A 3KONA 4Q99A 1TEUX 1CZMA 5EKHA 3DAZA 1KWQA 1TEQX 2Q1BA 3M1KA 9CA2A 1TE3X 3U7CA 5CACA 4WL4A 2WEGA 3EFIA 1EOUA 3V3HB 4YXIA 3FW3A 1ZFQA 3M1JA 1BN3A 1BICA 3UYNA 5JEPB 1CCUA 4Q6EA 4JSAA 5DRSA 4QTLA 5G0BA 3RYVB 4IDRX 5FNHA 4QJWA 1TBTX 1CNCA 2FOYA 3MNHA 4E9OX 2CBCA 2CA2A 4L5WA 4QJOA 2NNGA 3RGEA 1I9MA 5DSRA 5EOIA 4HBAA 1ZSCA 1TG9A 2QP6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D93 A;  3RYZ A;  1THK A;  3Q31 A;  4UOV A;  4MDG A;  4ZWX A;  3S73 B;  4K0T A;  3B4F A;  4Z1N A;  4FPT A;  2Q1Q A;  4MTY A;  1UGD A;  1CNJ A;  5SZ5 A;  1XQ0 A;  4RFD A;  4RIV A;  4WUP A;  5DOG A;  4N16 A;  3MNU A;  4MO8 A;  5DOH A;  3M40 A;  1CA2 A;  4MDM A;  4YX4 A;  3ZNC A;  1CAY A;  1G6V A;  1ZNC A;  3DD0 A;  1Z97 A;  4YGF A;  4Q7S A;  2POV A;  3MHL A;  5FL6 A;  1A42 A;  4YYT A;  3OY0 A;  2FOS A;  1CNI A;  3RYY A;  1LZV A;  5JEH B;  1Z9Y A;  3SAP A;  1G0F A;  1HUH A;  2NXR A;  3HKN A;  2HFW A;  2CBE A;  1CAI A;  1OKL A;  4M2W A;  1TG3 A;  1KEQ A;  4BF6 A;  4ITO A;  4JSS A;  4YGJ A;  3D92 A;  4ETQ C;  5G03 A;  1HUG A;  2QO8 A;  1IF8 A;  3SBH A;  5JES B;  3P4V A;  5E2N A;  1RJ5 A;  12CA A;  4C3T A;  5JQ0 A;  1HCA A;  1DMX A;  3PYK A;  4XIW A;  3P55 A;  4E3D A;  2ILI A;  1CCT A;  2HD6 A;  3DD8 A;  4WW8 A;  1CVC A;  5FNK A;  1OKM A;  4QK3 A;  4XE1 A;  2CBB A;  3S72 B;  4X5S A;  4XIX A;  1CIL A;  5E2S A;  5FLR A;  4E3G A;  1IF7 A;  1ZSB A;  1IF9 A;  4CNV A;  5IPZ A;  2NN7 A;  4ITP A;  5EKJ A; 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