5E2MA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme i with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2mA00
3RYXB 3F4XA 4CNVA 5SZ3A 4XIXA 1CNYA 1V9EA 4YHAA 4R59A 1FR7A 1CNIA 3N4BA 5FNIA 4YGLA 5A25A 4ITPA 5IPZA 1RJ5A 2X7TA 3VBDA 5FLTA 3ZNCA 1RZDA 5FLOA 1Y7WA 5SZ1A 1DCBA 3OIMA 4LHIA 4L5VA 4QIYA 4Q9YA 1BNWA 1LG6A 3M98A 4RIUA 4KUVA 4MLTA 3KLDB 3NJ9A 1KWQA 1HCAA 1BNQA 2HL4A 3DA2A 4WW8A 2NWPA 2HD6A 2HKKA 1TTMA 1HUGA 3V3GB 1I9NA 3V2MA 1KOQA 5BRUA 7CA2A 5EOIA 1DMYA 3FFPX 4Y0JA 4MDGA 4KP5A 5FNHA 3KWAA 5JQTA 1CINA 2FOSA 1HVAA 2WD2A 3NI5A 4PZHA 1RZCA 1HCBA 3SBIA 4YXIA 4FVNA 4XFWA 3UYNA 1CAYA 5JG5B 3S77B 2FOVA 4ZX0A 4E3GA 1CALA 4G0CA 2WEHA 4L5WA 5J8ZA 3ZP9A 1I9LA 5G03A 3MNAA 1MOOA 4R5AA 4Q09A 3N3JA 3PYKA 5DSKA 4K0ZA 3V3FA 2VVAX 1JCZA 3MHLA 5E2SA 4Q8XA 1G53A 4HBAA 4Q7PA 4Q7WA 4X5SA 3N2PA 4E5QA 3S97A 3P5LA 5SZ2A 3M2NA 3TVNX 1TBTX 3IAIA 5FNMA 5SZ4A 5CJFA 3KIGA 3DVCA 4JSZA 3M1JA 3M2ZA 4QJWA 1YO0A 1JV0A 4FL7A 5JG3B 4FPTA 1CAZA 4FIKA 2EZ7A 3M2YA 3R16A 1G1DA 3HKUA 2OSMA 5E5RA 5FNLA 3S73B 2FNKA 4Q99A 1CCSA 1HECA 1Z93A 3P3JA 4E49A 4FU5A 1CRAA 5DSRA 1ZFQA 5JGTB 5DSIA 3OIKA 3DAZA 5BYIA 1MUAA 2FW4A 3BL1A 3S76A 5CACA 5HPJA 3KS3A 1JD0A 1DCAA 1UGAA 3TMJA 3DD0A 3M1WA 4KUYA 3RLDA 4YGJA 3RYVB 3U3AX 3IBUA 3CAJA 4Q81A 1T9NA 3DC3A 4RUXA 1TB0X 3MWOA 2ILIA 3DVBA 3RJ7A 1FQRA 1ZGFA 3HKTA 5E2NA 5E2MA 1I91A 3OKVA 4QJ0A 1I9PA 2ABEA 5LMDA 5FDIA 1G3ZA 1FR4A 3M14A 1CAHA 3SAXA 1G0EA 4CQ0A 5FNKA 2W2JA 4Z0QA 1ZGEA 3S71B 1CCUA 3DBUA 3RYYA 3OILA 2H4NA 5EH5A 1LUGA 4RUZA 1YDDA 2IT4A 4RFCA 1CVHA 4ZWXA 3RZ1B 4YX4A 3BETA 4KNMA 5JESB 4MDLA 5FDCA 3MZCA 4TWMA 4QY3A 3M40A 4QJOA 1CAJA 4E4AA 4ITOA 1YO2A 4BF1A 5L6KA 4Z1JA 4RN4A 5AMGA 3PJJA 1CNJA 4DZ9A 5FLQA 3T84A 1CVAA 2X7SA 1HUHA 4YXUA 3T83A 5SZ5A 1CVCA 5CLUA 4BF6A 3S74B 4ZX1A 1CVEA 4HT2A 3S75B 3M5TA 5BNLA 1BN3A 4WUQA 2FOQA 1CCTA 3K34A 4Q7VA 4QIZA 4KUWA 1CAOA 4N0XB 1XEVA 3M5SA 3ML5A 1RJ6A 4KV0A 4PQ7A 5DRSA 2CBCA 3ML2A 4YWPA 3F7BA 2HNCA 4PXXA 1CZMA 1CNHA 1LZVA 5E5UA 5JEGB 1URTA 3D0NA 3U7CA 1TEUX 4QTLA 2H15A 2X7UA 3DCWA 2NN7A 5SZ6A 3B1BA 3S9TA 6CA2A 4Q0LA 4JSWA 3RYZA 5EKJA 1TEQX 1RAZA 2GEHA 2WEJA 3DC9A 3N0NA 1BNNA 4IDRX 1IF6A 4RIVA 4RH2A 3RG3A 1KWRA 5DSJA 3LXEA 3TVOX 5AMDA 4ZWYA 3MNUA 1BNVA 1BNTA 1CNXA 3MNIA 1TH9A 2GD8A 3OYSA 4CNWA 3IGPA 3Q31A 4UOVA 3M2XA 4GL1X 1KOPA 3RZ5A 2VVBX 1BZMA 1CILA 2WD3A 4YVYA 1THKA 2FNNA 1KEQA 2QOAA 1IF9A 1G54A 1YO1A 4K1QA 3CZVA 4E3FA 3L14A 4YYTA 1FSQA 3P44A 1V9IC 5EHWA 5DSMA 3P55A 1ZE8A 3RG4A 1CVFA 4WL4A 1HEBA 1ZSAA 1UGDA 4KP8A 4N16A 1CIMA 4CACA 1RAYA 4KNIA 1J9WA 3D8WA 12CAA 1Z9YA 1BICA 4QJPA 4E3DA 4ETQC 1OKLA 5FL5A 1DMXA 1CNCA 1FQNA 1TG3A 4LP6A 3DVDA 3OYQA 3MNHA 5EIJA 5EKHA 4ZWIA 1G4JA 1AM6A 1XPZA 1OKNA 3EFTA 3DD8A 5EH7A 3MYQA 2POWA 4Q06A 4L5UA 1A42A 3U45X 3FW3A 3S78B 5G01A 2NXSA 3P4VA 4M2VA 3T5ZA 1BNMA 1CANA 3HLJA 5BRVA 5AMLA 2CA2A 1ZNCA 1CAKA 3IBLA 4YGKA 1XEGA 3MNJA 3GZ0A 1OKMA 4Q6DA 1BV3A 4ZAOA 1TG9A 1G46A 3R17B 5FL4A 1H9NA 5BRWA 4LU3A 2Q1QA 5G0BA 1UGGA 4QK1A 3RYJB 4FRCA 4JSSA 2FMGA 4K0SA 4MDMA 3JXGA 8CA2A 4QSIA 3MHCA 5JQ0A 1UGEA 4M2RA 3IEOA 1I90A 3B4FA 2QP6A 2OSFA 3V3IB 4Q6EA 5A6HA 2FOUA 4PYXA 3KONA 2F14A 3D93A 3M1QA 2CBDA 1HEDA 1UGFA 3EFIA 3KNEA 3M67A 3W6IA 1FSRA 1G4OA 4E3HA 4XE1A 4HEZA 4K0TA 1BN4A 3P5AA 1I9QA 5FLPA 3V2JA 1CVBA 5DSQA 3HKNA 2NWZA 2FOYA 4Q08A 1ZSBA 5DSPA 5E28A 3C7PA 3M5EA 3KOIA 1I8ZA 2NXTA 2CBEA 3K2FA 4M2UA 4Z1NA 5EHVA 1CA2A 3IBIA 1F2WA 4CA2A 4YGFA 3DCCA 3CA2A 2HFWA 1G45A 1BNUA 2FNMA 4Q49A 4WR7A 4COQA 4E9OX 5FLRA 2NNSA 2EU3A 3IBNA 3RZ7A 1I9MA 3U47A 5E2RA 1AVNA 3M1KA 4CNXA 3MHMA 5FLSA 3V5GA 1H4NA 3S8XA 3KKXA 4QJMA 1AZMA 3V3HB 4QSAA 2WEGA 1FSNA 4WW6A 1Z97A 5FNJA 1G6VA 1LGDA 4QEFA 4HEYA 3M3XA 2FMZA 3T85A 1CNKA 3JXFA 3D92A 3RZ0B 1YDCA 3K7KA 2NWYA 5EKMA 3BL0A 4HEWA 1LG5A 4MLXA 1IF8A 1YDBA 1G52A 4K13A 3RZ8A 3SAPA 4YGNA 4M2WA 3RGEA 4WUPA 4Q8ZA 9CA2A 4QK3A 5DOHA 1FQLA 2Q1BA 1RZBA 4XZ5A 3UYQA 1CAIA 2POUA 2HOCA 3JXHC 4KNJA 1ZFKA 2QO8A 2AW1A 3M04A 4FVOA 1CA3A 3MHIA 3MMFA 4Q83A 4QSJA 3FE4A 5EZTX 5SZ7A 4JS6A 4HT0A 4BCWA 1RZAA 5E2KA 4ILXA 4CNRA 4YXOA 3P58A 3HFPA 5JDVB 2NN1A 5JGSB 3W6HA 3V3JA 1TE3X 4Q07A 1OQ5A 5L3OA 1IF4A 2NNOA 4MO8A 1I9OA 1ZH9A 4DZ7A 5DSNA 1UGBA 3T5UA 5SZ0A 1CNBA 4Q7SA 1BN1A 1CVDA 3MNKA 1UGCA 4XIWA 1H9QA 3HKQA 2CBBA 2AX2A 5FNGA 2POVA 1FLJA 2EU2A 1CRMA 1IF7A 3PO6A 1YDAA 4JSAA 5EH8A 1FQMA 5EHEA 1G48A 1CNGA 2NXRA 5DVXA 5DSLA 5CA2A 3KOKA 3SBHA 5C8IA 2NNGA 5G0CA 1HEAA 5JEPB 2O4ZA 2CABA 3D9ZA 4Q87A 5JEHB 2WEOA 4QSBA 3V7XA 3T82A 4RFDA 3CYUA 1EOUA 1XQ0A 4G7AA 4Z1KA 1BCDA 4RUYA 4R5BA 3QYKA 1G0FA 2ZNCA 4KNNA 4Q78A 5DOGA 4Z1EA 5FL6A 1RZEA 3DCSA 3MDZA 4C3TA 1IF5A 4IWZA 4MTYA 1CNWA 2NNVA 1CAMA 4HF3A 4KAPA 4PYYA 3OY0A 2NMXA 3NB5A 3P3HA 3OKUA 1ZSCA 2Q38A 3M96A 4QJXA 3S72B 4Q8YA 4HU1A 3MHOA 4TWLA 5DSOA 4QK2A 2NWOA 3HS4A 3F7UA 4ZWZA 4Q90A 2CBAA 3DV7A 3F8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RYX B;  3F4X A;  4CNV A;  5SZ3 A;  4XIX A;  1CNY A;  1V9E A;  4YHA A;  4R59 A;  1FR7 A;  1CNI A;  3N4B A;  5FNI A;  4YGL A;  5A25 A;  4ITP A;  5IPZ A;  1RJ5 A;  2X7T A;  3VBD A;  5FLT A;  3ZNC A;  1RZD A;  5FLO A;  1Y7W A;  5SZ1 A;  1DCB A;  3OIM A;  4LHI A;  4L5V A;  4QIY A;  4Q9Y A;  1BNW A;  1LG6 A;  3M98 A;  4RIU A;  4KUV A;  4MLT A;  3KLD B;  3NJ9 A;  1KWQ A;  1HCA A;  1BNQ A;  2HL4 A;  3DA2 A;  4WW8 A;  2NWP A;  2HD6 A;  2HKK A;  1TTM A;  1HUG A;  3V3G B;  1I9N A;  3V2M A;  1KOQ A;  5BRU A;  7CA2 A;  5EOI A;  1DMY A;  3FFP X;  4Y0J A;  4MDG A;  4KP5 A;  5FNH A;  3KWA A;  5JQT A;  1CIN A;  2FOS A;  1HVA A;  2WD2 A;  3NI5 A;  4PZH A;  1RZC A;  1HCB A;  3SBI A;  4YXI A;  4FVN A;  4XFW A;  3UYN A;  1CAY A;  5JG5 B;  3S77 B;  2FOV A;  4ZX0 A;  4E3G A;  1CAL A;  4G0C A;  2WEH A;  4L5W A;  5J8Z A;  3ZP9 A;  1I9L A;  5G03 A;  3MNA A;  1MOO A;  4R5A A;  4Q09 A;  3N3J A;  3PYK A;  5DSK A;  4K0Z A;  3V3F A;  2VVA X;  1JCZ A;  3MHL A;  5E2S A;  4Q8X A;  1G53 A;  4HBA A;  4Q7P A;  4Q7W A;  4X5S A; 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