5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
5JEGB 1CCUA 3KONA 3FFPX 4XE1A 5E5UA 4WUQA 4Q6DA 5E2KA 3M1WA 1CNIA 3DBUA 3M1QA 4QJMA 1CVBA 4QIZA 4WW6A 3IAIA 4Z1EA 3RZ5A 4E5QA 1BN1A 3KKXA 4RIUA 2Q38A 3CAJA 5FNKA 1AZMA 2NN7A 1HCAA 4RUYA 2NNOA 1G0FA 3UYNA 5DSPA 2QOAA 5SZ7A 1I8ZA 1CALA 1FQNA 3MNUA 4RN4A 3M2YA 4JSSA 4HT0A 1BICA 4KP5A 4CACA 1BNNA 2CA2A 3OIKA 3P55A 3S97A 2IT4A 3HKTA 2ZNCA 1KEQA 3P4VA 4KNMA 4BCWA 2WD2A 3DV7A 3M3XA 3TMJA 4YGLA 3DVCA 3P58A 1BNTA 1UGAA 4M2RA 2W2JA 4XIXA 1ZSBA 2O4ZA 4MDGA 5EH8A 1G6VA 1YO0A 4Z1JA 4JSZA 5FLSA 3SAPA 4L5UA 4TWMA 4WUPA 5E5RA 5SZ2A 3V2JA 5EHEA 1CANA 2OSFA 1H9NA 5BNLA 1F2WA 2WEGA 4RIVA 4Y0JA 3SAXA 4R5BA 3BETA 4KUVA 1I9MA 4KUWA 1CNYA 1I91A 2QO8A 5FLOA 5FLRA 1BNVA 2H4NA 4YHAA 1HCBA 3S9TA 2HFWA 1XEVA 4IWZA 4ZAOA 4K13A 1CNBA 5FL6A 2HKKA 1Z93A 1I9NA 4LHIA 2FOVA 4Q8ZA 2X7SA 4KV0A 3T83A 4ITOA 2CBCA 2FOYA 3M67A 3MHCA 4Q06A 1CAZA 3N3JA 3T5UA 3MNAA 3T85A 3T82A 1DMYA 2FOSA 4RH2A 1G1DA 3PYKA 5G01A 2HNCA 1KOQA 4Z1NA 1LGDA 3ZP9A 3HKUA 2GEHA 5CA2A 5G0CA 1THKA 1CINA 3RG4A 3D92A 5DSQA 1G0EA 3HKNA 5EKHA 4Q9YA 1TH9A 5JG3B 3MHMA 3JXHC 1CCSA 4Z1KA 4DZ7A 1A42A 4ZWZA 1Z9YA 4YXUA 5FLTA 3RZ8A 4KUYA 2QP6A 3DVBA 1RZDA 4HF3A 3RZ1B 4JSAA 2FNKA 3P44A 4QY3A 5JEPB 3C7PA 1LZVA 1CNHA 1XQ0A 4N16A 5DSKA 5DSIA 5FNJA 2NNSA 1FSQA 4YGKA 4XZ5A 1UGCA 3P3HA 4KAPA 3HLJA 1I90A 4YXOA 5FNGA 3F7BA 4E3DA 1Z97A 2ABEA 3Q31A 4MDMA 1CCTA 4PYYA 3ML2A 3U45X 1CRAA 3M2XA 3MHLA 1G45A 2FMZA 5DSLA 4JS6A 3DCCA 1CAOA 3KLDB 4QJOA 4QK2A 1J9WA 1ZNCA 3OILA 5EIJA 1YDAA 3ML5A 1OKMA 5E2SA 1UGEA 4K0TA 1V9EA 1CNCA 3FW3A 3MWOA 1I9PA 2NN1A 4PQ7A 4Q08A 1G48A 4YGFA 1CNKA 2NXTA 5AMGA 3UYQA 1HECA 1HVAA 3SBHA 4HU1A 1DMXA 1CA2A 4QEFA 4R59A 2NWOA 1KOPA 4E49A 4K1QA 3SBIA 1RAZA 4HEWA 3L14A 1G4OA 3PO6A 3T84A 1XPZA 4Q99A 4FVOA 4MTYA 4HT2A 3MHIA 3S73B 4KNNA 2NNVA 4WL4A 3DAZA 4CNWA 3F8EA 4CA2A 1G53A 2POWA 4QK1A 5SZ1A 3K7KA 1RZEA 3VBDA 2FMGA 3S77B 4YYTA 2H15A 3CZVA 4HEYA 2NWYA 1DCBA 4ZWIA 4CNRA 1OQ5A 1H9QA 1KWQA 4XIWA 5EH7A 1CAYA 5DOHA 3M98A 3U7CA 4ETQC 3FE4A 1IF7A 4Q07A 4G0CA 3RYXB 1OKLA 4RFDA 2AX2A 1JV0A 1G46A 5HPJA 4LP6A 1BZMA 3OYSA 4E3FA 3S74B 6CA2A 4Q90A 3MNIA 5CACA 1JCZA 5EKJA 5DSRA 3KWAA 4M2VA 4ZX0A 1BNMA 1MOOA 2F14A 2EU2A 3R17B 3V3FA 2OSMA 4YVYA 2X7UA 3M2NA 1CILA 5EKMA 1BNQA 5EH5A 5SZ0A 3S75B 1UGFA 4QSJA 1UGBA 2GD8A 3RJ7A 4LU3A 4IDRX 4QJXA 4QJPA 1TE3X 3KOIA 5J8ZA 1CVEA 1FSNA 3EFIA 5FNMA 4E3GA 5E2NA 3RZ0B 5FNIA 2CBBA 5DSJA 4QIYA 5FDIA 5JGSB 1YO2A 1RJ6A 1AVNA 3GZ0A 1CNXA 1G52A 4Q78A 2POUA 3HS4A 3JXGA 3HKQA 5E2RA 1ZGFA 1UGDA 4K0SA 4QSIA 4Q83A 3V7XA 5EZTX 1URTA 1ZGEA 5FL5A 5A25A 1IF5A 4RFCA 4WW8A 9CA2A 2NMXA 5SZ3A 1G54A 3MZCA 2WEHA 4ZWYA 4Q09A 2Q1QA 4BF1A 5JEHB 3ZNCA 1ZFQA 3KIGA 1I9OA 4Q7SA 3B4FA 3RG3A 1TG3A 4L5VA 3M5TA 4R5AA 5SZ4A 2CBEA 3TVOX 3F7UA 3DCWA 4YWPA 2VVBX 3PJJA 2WEOA 1CNWA 4JSWA 1G3ZA 1ZH9A 5AMDA 1AM6A 3JXFA 5FL4A 3M14A 4CQ0A 4M2UA 4UOVA 4KNIA 5CLUA 4Q6EA 4FVNA 5DRSA 1CAIA 1CNGA 1CIMA 3NJ9A 5E2MA 3V3GB 1TEUX 1RZAA 1YO1A 3IBUA 1CAJA 2X7TA 3P3JA 5C8IA 3F4XA 1BV3A 2HD6A 3S78B 5A6HA 3CA2A 3W6HA 5DOGA 4ZWXA 1H4NA 3IBNA 1CVAA 4GL1X 3S71B 3EFTA 4MDLA 4PZHA 3BL1A 1IF6A 1IF4A 1CAHA 3RYYA 3V5GA 1CAKA 3RYJB 1KWRA 4YGJA 3RYVB 5SZ5A 3DC9A 3MHOA 3BL0A 4E4AA 12CAA 2VVAX 4PYXA 1LUGA 3N4BA 4E9OX 1CZMA 5JQTA 4Q7WA 3DCSA 4N0XB 3OIMA 3RZ7A 1BCDA 2HOCA 3MDZA 4G7AA 5JQ0A 5L3OA 3KNEA 3MMFA 5BRVA 3NB5A 1BN4A 3S8XA 1V9IC 4FRCA 1CVCA 1RAYA 3M40A 3OYQA 4K0ZA 4TWLA 5DVXA 3S76A 4Z0QA 4COQA 5CJFA 7CA2A 2EU3A 1FR4A 1MUAA 2CBAA 3M2ZA 5JDVB 4WR7A 1FSRA 3K2FA 1YDDA 1TG9A 3IBLA 3RYZA 3HFPA 1RZBA 4QJ0A 1TB0X 3D9ZA 3W6IA 5AMLA 3RGEA 3B1BA 3MNHA 4QSAA 4FU5A 1CVHA 5DSOA 2CABA 4L5WA 3M04A 5JESB 1IF9A 5DSMA 2ILIA 1CVDA 2FOUA 1DCAA 4RUXA 3V2MA 2NXRA 4Q8YA 3D0NA 1JD0A 2NWPA 1FLJA 3TVNX 4YGNA 1HUHA 3T5ZA 5JGTB 4ILXA 1T9NA 5SZ6A 2WD3A 4C3TA 4CNVA 4M2WA 5BRUA 1CRMA 1EOUA 1TBTX 1XEGA 3P5LA 3QYKA 2FW4A 4Q0LA 1FR7A 3RLDA 5G03A 3MNJA 3OY0A 3NI5A 1BNWA 3DVDA 5FLPA 1YDBA 4QTLA 3N0NA 4MLTA 5FDCA 4PXXA 3M96A 1ZE8A 3V3HB 5DSNA 1LG6A 4MLXA 2HL4A 4FL7A 1UGGA 3D8WA 3M1JA 4Q8XA 3M5SA 2FNNA 4QK3A 1HEBA 1I9QA 1RJ5A 2AW1A 3DD8A 1HUGA 3DD0A 2FOQA 3IBIA 1ZSCA 4Q81A 1FQLA 8CA2A 5L6KA 3OKUA 3MYQA 1I9LA 4Q49A 4Q7PA 4Q7VA 1BN3A 4X5SA 3D93A 4ZX1A 2NXSA 3CYUA 4FPTA 5FNLA 3U3AX 5JG5B 5FLQA 3LXEA 4KNJA 3MNKA 4ITPA 4YX4A 3IGPA 4DZ9A 1HEAA 1CVFA 2NNGA 3M1KA 5G0BA 5LMDA 3DC3A 3P5AA 1Y7WA 1TTMA 4KP8A 1TEQX 3M5EA 3U47A 4QJWA 4CNXA 3IEOA 1BNUA 2Q1BA 5EHVA 3V3JA 2EZ7A 1FQRA 3S72B 1FQMA 2CBDA 1LG5A 1YDCA 3N2PA 5FNHA 3V3IB 5BRWA 2POVA 4BF6A 1CA3A 3KS3A 3DA2A 5EHWA 4HBAA 3K34A 4RUZA 2NWZA 4XFWA 1IF8A 3OKVA 5EOIA 5IPZA 4YXIA 2WEJA 1ZFKA 1CNJA 5BYIA 1ZSAA 2FNMA 4MO8A 1RZCA 4HEZA 4E3HA 1OKNA 5E28A 4QSBA 4FIKA 4Q87A 3KOKA 1HEDA 1CAMA 3R16A 1G4JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JEG B;  1CCU A;  3KON A;  3FFP X;  4XE1 A;  5E5U A;  4WUQ A;  4Q6D A;  5E2K A;  3M1W A;  1CNI A;  3DBU A;  3M1Q A;  4QJM A;  1CVB A;  4QIZ A;  4WW6 A;  3IAI A;  4Z1E A;  3RZ5 A;  4E5Q A;  1BN1 A;  3KKX A;  4RIU A;  2Q38 A;  3CAJ A;  5FNK A;  1AZM A;  2NN7 A;  1HCA A;  4RUY A;  2NNO A;  1G0F A;  3UYN A;  5DSP A;  2QOA A;  5SZ7 A;  1I8Z A;  1CAL A;  1FQN A;  3MNU A;  4RN4 A;  3M2Y A;  4JSS A;  4HT0 A;  1BIC A;  4KP5 A;  4CAC A;  1BNN A;  2CA2 A;  3OIK A;  3P55 A;  3S97 A;  2IT4 A;  3HKT A;  2ZNC A;  1KEQ A;  3P4V A;  4KNM A;  4BCW A;  2WD2 A;  3DV7 A;  3M3X A;  3TMJ A;  4YGL A;  3DVC A;  3P58 A;  1BNT A;  1UGA A;  4M2R A;  2W2J A;  4XIX A;  1ZSB A;  2O4Z A;  4MDG A;  5EH8 A;  1G6V A;  1YO0 A;  4Z1J A;  4JSZ A;  5FLS A;  3SAP A;  4L5U A;  4TWM A;  4WUP A;  5E5R A;  5SZ2 A;  3V2J A;  5EHE A;  1CAN A;  2OSF A;  1H9N A;  5BNL A;  1F2W A;  2WEG A;  4RIV A;  4Y0J A;  3SAX A;  4R5B A;  3BET A;  4KUV A;  1I9M A;  4KUW A;  1CNY A;  1I91 A;  2QO8 A;  5FLO A;  5FLR A;  1BNV A;  2H4N A;  4YHA A;  1HCB A; 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