5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
4LHIA 1FR7A 2POWA 3M2ZA 2NWPA 3P44A 3P4VA 4MLTA 1HCAA 3ML5A 3OIKA 3RYJB 4WUQA 1BICA 5DSPA 3KOIA 4M2WA 1CAHA 3BL1A 3DCCA 1I9MA 5JDVB 3DBUA 4QIZA 1J9WA 3R17B 4Q83A 8CA2A 1KOQA 2X7UA 1LZVA 3JXGA 4FIKA 3V3GB 2Q1BA 3NB5A 4Q06A 3M2NA 4HEZA 3U47A 4Q8XA 1HUGA 5FNLA 1YDAA 3ML2A 3S74B 4YGLA 2CBCA 5IPZA 1ZSBA 3MNAA 5JG3B 2NN1A 3V3HB 1LGDA 4KAPA 1TG9A 2QP6A 5EH7A 5FNKA 1UGEA 4RUXA 1I90A 4Q09A 4JSWA 1LG5A 1CNJA 3M1WA 1CAYA 3P3JA 4QSBA 3TVNX 3V3JA 5JQ0A 4QJXA 2NNSA 2GD8A 2WEHA 5E5UA 4L5UA 4YXUA 5DSQA 4YGNA 3KOKA 3M96A 3JXFA 1G4OA 2QOAA 3DV7A 3BETA 1HUHA 5FNJA 5BRVA 2CBEA 2QO8A 3N0NA 3IBUA 5SZ6A 2ZNCA 1G53A 3MNHA 2NNVA 4HBAA 3VBDA 3S78B 5BNLA 3FE4A 5HPJA 2HKKA 1DCBA 3PYKA 3K34A 4ZAOA 4M2VA 3F4XA 5EH8A 4DZ7A 3RZ5A 4KNMA 4QK3A 5AMGA 1CA3A 3JXHC 4Z1NA 2H4NA 4MLXA 4YGJA 3HKTA 5LMDA 3T83A 4IWZA 2NXRA 3CYUA 1CAZA 4YVYA 3KNEA 1IF9A 5SZ2A 5FDCA 3KIGA 1AZMA 1ZFKA 4HT2A 4WL4A 1CVAA 3F7UA 4FVOA 1BNNA 3DAZA 3V2MA 3GZ0A 1CRAA 1MUAA 1CVBA 5DSLA 4E4AA 4IDRX 5CACA 1G48A 1DMXA 4E3HA 1RJ5A 1CINA 1RZAA 3V7XA 4E3DA 3V5GA 1YDDA 1G0EA 1BZMA 5FL4A 5E2RA 2FMGA 4GL1X 2NWOA 4FPTA 1ZGFA 4Q49A 4Q9YA 3OKVA 1OKLA 3HFPA 2NWYA 5FLRA 5G01A 3MHCA 3OIMA 2FW4A 4ZWYA 2OSMA 2POUA 4PXXA 4G0CA 5DSRA 3V2JA 4Q7SA 1CNGA 3NJ9A 1BV3A 4XZ5A 3B4FA 1CVCA 1G1DA 3M98A 3IGPA 2Q1QA 3DD0A 4MDGA 3S97A 5E5RA 4QJWA 1G46A 3SAXA 3U3AX 1G52A 1IF5A 3W6HA 4JS6A 1CVHA 4QJMA 4RFDA 4HT0A 3Q31A 2H15A 4K0ZA 3LXEA 1OKNA 2FOUA 4HEYA 5L3OA 4QSIA 4BF1A 4RIUA 5E2SA 5J8ZA 3D8WA 1V9EA 5CLUA 1RZDA 1HECA 4KNNA 1CAIA 3DD8A 1FSRA 3SBIA 1CZMA 4QSJA 1I9OA 1CNXA 2WEGA 3IAIA 2FNKA 4JSAA 2NNGA 4M2RA 1G6VA 2IT4A 1HEBA 1RZBA 4ZWIA 4ETQC 4KP5A 3M2YA 2Q38A 3R16A 2HFWA 3M1KA 3T85A 5FNIA 3ZP9A 1BNMA 3P3HA 4QJOA 4KV0A 3RZ1B 3P5LA 1XPZA 3EFIA 1CVDA 3TVOX 1YO2A 4WUPA 1I9LA 3HS4A 1G54A 2OSFA 4KUWA 2EZ7A 3DA2A 1BNWA 4JSSA 4HU1A 3KLDB 5SZ1A 6CA2A 1CNCA 3C7PA 2CABA 5EOIA 3RZ7A 3MDZA 2VVAX 1RZEA 4Q8ZA 4LU3A 4Q78A 1ZH9A 2FOSA 2WD3A 5SZ4A 2FOVA 1YO1A 3MHOA 1IF4A 4QK2A 3K2FA 5E2KA 4CNVA 5JG5B 2ILIA 3T5UA 3MHMA 1FSQA 4K1QA 4M2UA 5DSMA 4COQA 3P58A 1ZGEA 4LP6A 5DSJA 3SBHA 5AMDA 4QEFA 3D93A 1Z97A 2WEOA 4K13A 4QJ0A 2VVBX 4ZX1A 3BL0A 3IEOA 4E49A 5BYIA 2HL4A 3IBLA 1A42A 3T5ZA 2W2JA 1CCSA 1TE3X 3HLJA 3KONA 1XQ0A 4RH2A 1LG6A 3OYQA 4Q0LA 3MNKA 4TWMA 3RYYA 3RZ8A 1FQNA 3N3JA 1UGGA 4QSAA 3DC9A 4RUYA 1BNQA 1RAZA 3F7BA 3RYXB 3K7KA 5FLQA 4Z1EA 3RG3A 5E2NA 1CNKA 3M40A 4ITOA 4PZHA 4Q81A 1TTMA 2F14A 1XEGA 2POVA 1CCTA 3DVDA 4PYXA 1HEAA 1T9NA 5EHVA 1FSNA 4Q7WA 3HKUA 3KKXA 4L5VA 4K0TA 4RUZA 5CJFA 3RYVB 3M04A 1I9QA 5JQTA 2X7TA 1KOPA 3OKUA 3S9TA 3RGEA 1H9QA 5SZ3A 1BNVA 3N2PA 4CACA 9CA2A 1I8ZA 4MDMA 1BN4A 1TBTX 3D9ZA 5FLSA 4RIVA 4R5BA 5FLPA 1V9IC 4FU5A 3UYQA 4RFCA 4FRCA 5G03A 1ZE8A 1CAKA 4WW8A 4MTYA 4ZX0A 1RJ6A 5FNMA 4E5QA 2CBDA 1YDCA 3DVBA 4Q6EA 5FL6A 3RYZA 5L6KA 4YXIA 7CA2A 4L5WA 5EH5A 1BN3A 2NN7A 4Z1KA 4XFWA 3KS3A 1BNTA 5DSNA 4XE1A 1AM6A 5EKJA 5A25A 1I9PA 1KWRA 3ZNCA 2CBAA 3F8EA 3U7CA 4Q87A 2GEHA 2HD6A 5EKHA 4YWPA 4E3GA 3MWOA 3TMJA 1TH9A 3S73B 5G0CA 1CVEA 1CAJA 3L14A 5JEPB 4YGKA 5JGSB 3OYSA 4KUVA 3RZ0B 1JV0A 2EU2A 3DVCA 2CBBA 3M2XA 4N16A 2AW1A 3CA2A 5DSIA 3D0NA 4FVNA 1OKMA 1Z9YA 5FDIA 3OY0A 4CA2A 1UGAA 5SZ0A 3S72B 5JEHB 4R59A 4YX4A 3S71B 4PQ7A 4XIWA 1TB0X 1Y7WA 1FQRA 2NXTA 1H9NA 1XEVA 5DSKA 1EOUA 3DC3A 5DVXA 5C8IA 4X5SA 2WD2A 1BCDA 3HKQA 3FFPX 1UGBA 4QIYA 2NXSA 1TEUX 3W6IA 4E3FA 1CRMA 4QY3A 1HVAA 1CNIA 3CZVA 3M1JA 4Q7PA 1IF7A 4E9OX 5E28A 3UYNA 2AX2A 4HF3A 4RN4A 4QTLA 4YGFA 3MNIA 3MNUA 2O4ZA 3P55A 1FQLA 2FOQA 4ITPA 3FW3A 5JGTB 5BRUA 1H4NA 3S8XA 5FLTA 1CNYA 1LUGA 4N0XB 3V3IB 1JCZA 1IF8A 2HOCA 4BF6A 1URTA 4Q7VA 3SAPA 1JD0A 1MOOA 4KNIA 3S77B 4Q90A 4UOVA 2NMXA 5DOHA 2FNNA 1ZSAA 3M1QA 4Q07A 5EZTX 3MNJA 3KWAA 1DCAA 1G45A 1UGDA 1YO0A 3HKNA 4YHAA 4QJPA 3PO6A 4KUYA 3M5SA 1FR4A 1RZCA 4ILXA 3S76A 5EKMA 3MZCA 2NNOA 5G0BA 1G4JA 3QYKA 3M67A 5JEGB 4MDLA 4PYYA 3U45X 4XIXA 5FLOA 1CA2A 1UGCA 1ZNCA 3D92A 3PJJA 1YDBA 3M5TA 4QK1A 1FLJA 5JESB 3RLDA 2FOYA 3P5AA 1BN1A 4JSZA 4WW6A 1CIMA 5BRWA 1TG3A 1KEQA 3M14A 5FNGA 3RG4A 2X7SA 1CVFA 1CAOA 4KNJA 3T84A 1CAMA 5EHWA 1CNHA 4Q08A 5FNHA 1I91A 4Q6DA 4CQ0A 3DCWA 2FMZA 4K0SA 1KWQA 1HCBA 4HEWA 5SZ7A 1CANA 4ZWXA 1G3ZA 5SZ5A 3B1BA 1THKA 4WR7A 1I9NA 3EFTA 2CA2A 1CILA 5A6HA 3M5EA 4FL7A 4DZ9A 1Z93A 3M3XA 4Z1JA 1CNWA 1ZSCA 1UGFA 2NWZA 5DRSA 5EHEA 4CNXA 12CAA 5EIJA 1FQMA 3MMFA 3OILA 5DSOA 1AVNA 4Z0QA 4TWLA 5CA2A 1IF6A 5DOGA 5FL5A 4Q99A 4YXOA 4Y0JA 3T82A 3MHIA 1DMYA 1TEQX 1RAYA 2EU3A 4MO8A 5E2MA 3CAJA 4CNWA 4BCWA 4ZWZA 3V3FA 3N4BA 1F2WA 2HNCA 4YYTA 1CALA 3NI5A 1CCUA 3MYQA 1ZFQA 1CNBA 4C3TA 3DCSA 4R5AA 3IBNA 1HEDA 1G0FA 4Q8YA 3MHLA 2WEJA 4G7AA 5AMLA 4CNRA 4KP8A 2FNMA 1BNUA 1OQ5A 3RJ7A 3S75B 3IBIA 2ABEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LHI A;  1FR7 A;  2POW A;  3M2Z A;  2NWP A;  3P44 A;  3P4V A;  4MLT A;  1HCA A;  3ML5 A;  3OIK A;  3RYJ B;  4WUQ A;  1BIC A;  5DSP A;  3KOI A;  4M2W A;  1CAH A;  3BL1 A;  3DCC A;  1I9M A;  5JDV B;  3DBU A;  4QIZ A;  1J9W A;  3R17 B;  4Q83 A;  8CA2 A;  1KOQ A;  2X7U A;  1LZV A;  3JXG A;  4FIK A;  3V3G B;  2Q1B A;  3NB5 A;  4Q06 A;  3M2N A;  4HEZ A;  3U47 A;  4Q8X A;  1HUG A;  5FNL A;  1YDA A;  3ML2 A;  3S74 B;  4YGL A;  2CBC A;  5IPZ A;  1ZSB A;  3MNA A;  5JG3 B;  2NN1 A;  3V3H B;  1LGD A;  4KAP A;  1TG9 A;  2QP6 A;  5EH7 A;  5FNK A;  1UGE A;  4RUX A;  1I90 A;  4Q09 A;  4JSW A;  1LG5 A;  1CNJ A;  3M1W A;  1CAY A;  3P3J A;  4QSB A;  3TVN X;  3V3J A;  5JQ0 A;  4QJX A;  2NNS A;  2GD8 A;  2WEH A;  5E5U A;  4L5U A;  4YXU A;  5DSQ A;  4YGN A;  3KOK A;  3M96 A;  3JXF A;  1G4O A;  2QOA A;  3DV7 A;  3BET A;  1HUH A;  5FNJ A;  5BRV A;  2CBE A;  2QO8 A;  3N0N A;  3IBU A;  5SZ6 A;  2ZNC A;  1G53 A;  3MNH A;  2NNV A;  4HBA A;  3VBD A;  3S78 B;  5BNL A;  3FE4 A;  5HPJ A;  2HKK A;  1DCB A;  3PYK A;  3K34 A; 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