5E2S | Genus

Total Genus 77

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__604955085587017__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__604955085587017__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/5E2S/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__604955085587017__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"604955085587017","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/5E2S/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__604955085587017__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	4-Arylbenzenesulfonamides as Human Carbonic Anhydrase Inhibitors (hCAIs): Synthesis by Pd Nanocatalyst-Mediated Suzuki-Miyaura Reaction, Enzyme Inhibition, and X-ray Crystallographic Studies. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	77
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2015-10-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	5e2sA00

5JGTB 2QOAA 2AX2A 1ZSBA 3M2XA 4QJWA 1UGCA 3HKUA 4QTLA 4YHAA 5DSIA 1THKA 1UGGA 4QSIA 4PZHA 2GEHA 4MDLA 4Q8ZA 4Q7PA 4QK1A 4PYXA 1G54A 3ML2A 5LMDA 3MYQA 4E49A 5AMLA 3KLDB 3P58A 4RN4A 3MHOA 5FLOA 3V2JA 1FR7A 1IF6A 5G01A 4XFWA 2EZ7A 2WEGA 3V3GB 1KWQA 5FNGA 5EH7A 3V5GA 4E4AA 3CA2A 1IF7A 4MO8A 4QSAA 5JG3B 3SBHA 4E3GA 1CNCA 3F7UA 4FVOA 2WD3A 3DAZA 3T5ZA 1CAIA 4KUVA 1LG5A 5CJFA 1HCBA 1I9QA 1OKMA 1T9NA 4CNRA 4CA2A 3U7CA 1HEAA 1ZGEA 4Q6EA 4E9OX 2POWA 3N3JA 3DCWA 4FU5A 1ZSCA 4QK3A 1EOUA 1A42A 1CNHA 4Z1JA 1CNBA 1G0FA 3T5UA 4Q8XA 5EIJA 2WEJA 2NMXA 4KUWA 4YVYA 1CVEA 2POVA 3P55A 5SZ6A 5BRUA 4KP8A 4RIVA 5CA2A 3D92A 3L14A 4WL4A 3M3XA 2HKKA 3R17B 1OQ5A 1G4OA 1CNWA 3OYSA 5BNLA 1G3ZA 1YO0A 4ITOA 4KV0A 4Z1KA 4YX4A 4E3DA 4E5QA 1XEVA 2FNMA 3OYQA 1CRAA 1CAMA 3RZ5A 3MZCA 2FOYA 1RZDA 3M96A 5DOGA 4Z1NA 2OSFA 2HOCA 2ILIA 5AMDA 2HNCA 4BF1A 2CBCA 2NNVA 4PXXA 5JQTA 4JSAA 5EH8A 5SZ0A 4JSSA 1Z9YA 4ZWIA 3CYUA 2FNKA 1CCTA 4Z1EA 3T84A 3SAPA 5FL5A 1CNGA 4KNJA 3S97A 5DSMA 3DD0A 3V3JA 3P5LA 4Q7WA 1RZCA 3RYJB 1KOQA 4YGKA 1RAYA 3DCCA 1CVHA 4RUZA 3M2NA 1OKNA 3OIKA 3R16A 3S78B 3RYVB 3FE4A 3IBIA 1TEQX 2NNSA 1IF5A 1FQRA 5E2RA 3MHCA 3KONA 3U47A 2FOSA 4HU1A 4R5AA 1G0EA 1CA2A 1ZNCA 1I9PA 1BNUA 1MUAA 3V7XA 1JV0A 5HPJA 3D93A 2WEOA 3W6IA 1BNTA 1KOPA 2CBBA 4Q90A 2EU3A 3RYYA 3HKQA 4R5BA 4M2WA 4QJ0A 1I9OA 2W2JA 3RLDA 7CA2A 5JQ0A 3MNAA 4MDGA 5DSJA 4MLXA 1XQ0A 1LUGA 3W6HA 3S8XA 3F7BA 1CVCA 5CLUA 1TTMA 1HUHA 5SZ2A 4QSBA 3V2MA 2NWZA 3RG3A 3DD8A 2CABA 3LXEA 3NI5A 3HS4A 3OKVA 1I90A 1AVNA 2OSMA 4ILXA 3RZ8A 3V3HB 5E5RA 3M1JA 5FNJA 3PYKA 1DMYA 4G7AA 4WUPA 4MDMA 4YXUA 1BN4A 1ZSAA 4YGFA 1Z97A 1TBTX 3MHMA 1UGEA 4ZWXA 1FQMA 2QO8A 2X7SA 1HEDA 6CA2A 1J9WA 4KAPA 5JDVB 3MNKA 1BNMA 1V9EA 1CAKA 4Q49A 3S75B 3IAIA 2CBEA 5FNKA 1CVDA 3TMJA 1I9NA 1RJ5A 5L3OA 1BNQA 3IBLA 5FL6A 3MWOA 1G45A 3DC9A 4LHIA 4XIWA 2F14A 4QJXA 3S77B 3IBUA 1BN3A 4PYYA 3P3JA 4XZ5A 3UYNA 1ZFQA 3M14A 4CACA 3DVDA 5FLSA 4COQA 3HFPA 5E2SA 4ITPA 1FR4A 2H15A 1FSNA 1G1DA 2CBDA 5SZ1A 3JXGA 4FVNA 4JSWA 4TWMA 1CIMA 4Q07A 5DVXA 3VBDA 4CQ0A 1RAZA 1ZE8A 1ZGFA 1FSQA 3RYZA 3MNUA 3S9TA 1BNVA 4LP6A 4X5SA 1TE3X 4Q8YA 4N0XB 3M1QA 3RGEA 1HECA 3IGPA 1CVFA 4HF3A 4Q7VA 2HD6A 2WEHA 4Q0LA 3NB5A 2FNNA 4MLTA 1Y7WA 2X7UA 3PO6A 3HKTA 2CBAA 5E28A 1G52A 4Q7SA 3JXHC 4YGLA 3D0NA 4IDRX 1CVBA 1Z93A 1BNWA 1I9LA 4M2RA 3BL0A 1HEBA 3M5SA 4YGJA 3BETA 1RJ6A 5E2NA 5JEGB 5IPZA 1CAZA 5G0CA 2NXRA 4YGNA 1CZMA 1KEQA 4XIXA 1BN1A 3ZNCA 3BL1A 1YDCA 1TG9A 1UGDA 2FW4A 1LG6A 4RUXA 3M1KA 4DZ7A 4Q09A 4ZX1A 4HT2A 1TEUX 5SZ4A 1YDDA 4R59A 2FOVA 2X7TA 4YYTA 5JEHB 1FLJA 3CZVA 3DA2A 5EH5A 1CAHA 1OKLA 3M5EA 3S73B 4RIUA 1FSRA 3HKNA 4E3HA 2QP6A 3KWAA 2HFWA 3K2FA 4E3FA 2NWYA 5BRVA 4HT0A 5FLTA 1CILA 1UGAA 5AMGA 1BV3A 3ZP9A 3T83A 4QIYA 1CNYA 4BCWA 9CA2A 4HEYA 1HUGA 5FLQA 3RYXB 4L5WA 4Q78A 5DSRA 3U45X 4DZ9A 2FOQA 4KP5A 3DVCA 2Q38A 4WR7A 4YWPA 4QEFA 3OY0A 3S76A 4ZWYA 1YO1A 3SBIA 4RH2A 4C3TA 4CNWA 3MNIA 5DOHA 1TB0X 4QY3A 3TVOX 2VVBX 8CA2A 4CNVA 3IBNA 2WD2A 1MOOA 3M1WA 4HBAA 1BNNA 1F2WA 4YXOA 5L6KA 1CVAA 4Q87A 1CCSA 4Z0QA 2NWOA 1LZVA 3N2PA 4QJPA 2NXSA 3T85A 3MMFA 4HEZA 1DCAA 1JD0A 3MHLA 3DV7A 5EHEA 2IT4A 3Q31A 3N0NA 1XPZA 1CCUA 2Q1BA 5A6HA 4WW8A 4FL7A 1JCZA 12CAA 4KNMA 5FLRA 3M40A 4LU3A 4K1QA 5DSPA 3DC3A 1FQLA 2Q1QA 3P5AA 5EOIA 2NNGA 1AM6A 2POUA 3MNHA 3C7PA 5EHVA 3TVNX 5G0BA 1H4NA 1G48A 1YO2A 5FL4A 5FNLA 4QJMA 5EKMA 3V3FA 2NWPA 3GZ0A 4GL1X 5DRSA 4XE1A 5DSQA 4TWLA 4N16A 4Q06A 4ZX0A 4FPTA 4PQ7A 5EZTX 3KIGA 1YDBA 5E2KA 1CALA 4L5VA 3PJJA 1I9MA 1IF9A 1KWRA 2VVAX 5FNIA 5G03A 3UYQA 4KUYA 3N4BA 3MDZA 4K0SA 3V3IB 3RZ7A 1ZH9A 2NN7A 1TG3A 1CA3A 1HVAA 3K34A 4M2VA 4Q81A 5DSOA 1G53A 1IF4A 3RJ7A 5JG5B 4M2UA 1IF8A 1DMXA 4G0CA 5DSLA 2AW1A 1BZMA 5EKJA 3M04A 3F8EA 3U3AX 1HCAA 4QJOA 5JGSB 4FRCA 1G4JA 3OILA 1CNXA 2GD8A 2NN1A 3S72B 2ABEA 3FFPX 1H9NA 3P44A 4JSZA 4KNNA 3M2ZA 4KNIA 1G46A 3S71B 2H4NA 5FDIA 1CAJA 3M98A 3CAJA 3HLJA 4FIKA 1G6VA 1LGDA 2FMGA 3QYKA 4YXIA 4RFCA 1CAYA 1YDAA 2HL4A 3KOIA 4K13A 3M67A 4UOVA 4WUQA 1UGBA 3DCSA 1UGFA 4QIZA 5EKHA 5FNMA 3RZ0B 4WW6A 3FW3A 4Q9YA 1XEGA 5E5UA 5DSKA 4L5UA 2NXTA 1I91A 3OKUA 4K0TA 1V9IC 5BRWA 1RZBA 5BYIA 3JXFA 5FNHA 2O4ZA 1BCDA 1CNKA 1AZMA 1CNJA 1BICA 5SZ3A 2FMZA 2FOUA 1RZEA 3MNJA 3EFIA 3D9ZA 1ZFKA 3OIMA 5CACA 4Q6DA 3K7KA 4RFDA 3KS3A 3KNEA 1CINA 1CRMA 4K0ZA 3NJ9A 3S74B 3EFTA 2NNOA 5EHWA 4ETQC 5A25A 5JESB 3IEOA 3P4VA 4RUYA 3P3HA 3F4XA 1H9QA 3KOKA 1TH9A 3KKXA 3ML5A 4QK2A 1DCBA 5SZ5A 5FLPA 1RZAA 3D8WA 4ZWZA 4IWZA 4Q99A 5DSNA 5J8ZA 4HEWA 5FDCA 4QSJA 5C8IA 3RZ1B 4MTYA 4Q08A 2ZNCA 3T82A 5E2MA 3DVBA 4Q83A 1CANA 3DBUA 2EU2A 4CNXA 4ZAOA 1I8ZA 3MHIA 5SZ7A 5JEPB 3RG4A 1FQNA 1CAOA 3M5TA 3B1BA 3B4FA 3SAXA 1URTA 2CA2A 4Y0JA 1CNIA 4JS6A 4BF6A 3M2YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5JGT B;  2QOA A;  2AX2 A;  1ZSB A;  3M2X A;  4QJW A;  1UGC A;  3HKU A;  4QTL A;  4YHA A;  5DSI A;  1THK A;  1UGG A;  4QSI A;  4PZH A;  2GEH A;  4MDL A;  4Q8Z A;  4Q7P A;  4QK1 A;  4PYX A;  1G54 A;  3ML2 A;  5LMD A;  3MYQ A;  4E49 A;  5AML A;  3KLD B;  3P58 A;  4RN4 A;  3MHO A;  5FLO A;  3V2J A;  1FR7 A;  1IF6 A;  5G01 A;  4XFW A;  2EZ7 A;  2WEG A;  3V3G B;  1KWQ A;  5FNG A;  5EH7 A;  3V5G A;  4E4A A;  3CA2 A;  1IF7 A;  4MO8 A;  4QSA A;  5JG3 B;  3SBH A;  4E3G A;  1CNC A;  3F7U A;  4FVO A;  2WD3 A;  3DAZ A;  3T5Z A;  1CAI A;  4KUV A;  1LG5 A;  5CJF A;  1HCB A;  1I9Q A;  1OKM A;  1T9N A;  4CNR A;  4CA2 A;  3U7C A;  1HEA A;  1ZGE A;  4Q6E A;  4E9O X;  2POW A;  3N3J A;  3DCW A;  4FU5 A;  1ZSC A;  4QK3 A;  1EOU A;  1A42 A;  1CNH A;  4Z1J A;  1CNB A;  1G0F A;  3T5U A;  4Q8X A;  5EIJ A;  2WEJ A;  2NMX A;  4KUW A;  4YVY A;  1CVE A;  2POV A;  3P55 A;  5SZ6 A;  5BRU A;  4KP8 A;  4RIV A;  5CA2 A;  3D92 A;  3L14 A;  4WL4 A;  3M3X A;  2HKK A;  3R17 B;  1OQ5 A;  1G4O A;  1CNW A;  3OYS A;  5BNL A;  1G3Z A;  1YO0 A;  4ITO A;  4KV0 A;  4Z1K A;  4YX4 A;  4E3D A;  4E5Q A;  1XEV A;  2FNM A;  3OYQ A;  1CRA A;  1CAM A;  3RZ5 A;  3MZC A;  2FOY A;  1RZD A;  3M96 A;  5DOG A;  4Z1N A;  2OSF A;  2HOC A;  2ILI A;  5AMD A;  2HNC A;  4BF1 A;  2CBC A;  2NNV A;  4PXX A;  5JQT A;  4JSA A;  5EH8 A;  5SZ0 A;  4JSS A;  1Z9Y A;  4ZWI A;  3CYU A;  2FNK A;  1CCT A;  4Z1E A;  3T84 A;  3SAP A;  5FL5 A;  1CNG A;  4KNJ A;  3S97 A;  5DSM A;  3DD0 A;  3V3J A;  3P5L A;  4Q7W A;  1RZC A;  3RYJ B;  1KOQ A;  4YGK A;  1RAY A;  3DCC A;  1CVH A;  4RUZ A;  3M2N A;  1OKN A;  3OIK A;  3R16 A;  3S78 B;  3RYV B;  3FE4 A;  3IBI A;  1TEQ X;  2NNS A;  1IF5 A;  1FQR A;  5E2R A;  3MHC A;  3KON A;  3U47 A;  2FOS A;  4HU1 A;  4R5A A;  1G0E A;  1CA2 A;  1ZNC A;  1I9P A;  1BNU A;  1MUA A;  3V7X A;  1JV0 A;  5HPJ A;  3D93 A;  2WEO A;  3W6I A;  1BNT A;  1KOP A;  2CBB A;  4Q90 A;  2EU3 A;  3RYY A;  3HKQ A;  4R5B A;  4M2W A;  4QJ0 A;  1I9O A;  2W2J A;  3RLD A;  7CA2 A;  5JQ0 A;  3MNA A;  4MDG A;  5DSJ A;  4MLX A;  1XQ0 A;  1LUG A;  3W6H A;  3S8X A;  3F7B A;  1CVC A;  5CLU A;  1TTM A;  1HUH A;  5SZ2 A;  4QSB A;  3V2M A;  2NWZ A;  3RG3 A;  3DD8 A;  2CAB A;  3LXE A;  3NI5 A;  3HS4 A;  3OKV A;  1I90 A;  1AVN A;  2OSM A;  4ILX A;  3RZ8 A;  3V3H B;  5E5R A;  3M1J A;  5FNJ A;  3PYK A;  1DMY A;  4G7A A;  4WUP A;  4MDM A;  4YXU A;  1BN4 A;  1ZSA A;  4YGF A;  1Z97 A;  1TBT X;  3MHM A;  1UGE A;  4ZWX A;  1FQM A;  2QO8 A;  2X7S A;  1HED A;  6CA2 A;  1J9W A;  4KAP A;  5JDV B;  3MNK A;  1BNM A;  1V9E A;  1CAK A;  4Q49 A;  3S75 B;  3IAI A;  2CBE A;  5FNK A;  1CVD A;  3TMJ A;  1I9N A;  1RJ5 A;  5L3O A;  1BNQ A;  3IBL A;  5FL6 A;  3MWO A;  1G45 A;  3DC9 A;  4LHI A;  4XIW A;  2F14 A;  4QJX A;  3S77 B;  3IBU A;  1BN3 A;  4PYY A;  3P3J A;  4XZ5 A;  3UYN A;  1ZFQ A;  3M14 A;  4CAC A;  3DVD A;  5FLS A;  4COQ A;  3HFP A;  5E2S A;  4ITP A;  1FR4 A;  2H15 A;  1FSN A;  1G1D A;  2CBD A;  5SZ1 A;  3JXG A;  4FVN A;  4JSW A;  4TWM A;  1CIM A;  4Q07 A;  5DVX A;  3VBD A;  4CQ0 A;  1RAZ A;  1ZE8 A;  1ZGF A;  1FSQ A;  3RYZ A;  3MNU A;  3S9T A;  1BNV A;  4LP6 A;  4X5S A;  1TE3 X;  4Q8Y A;  4N0X B;  3M1Q A;  3RGE A;  1HEC A;  3IGP A;  1CVF A;  4HF3 A;  4Q7V A;  2HD6 A;  2WEH A;  4Q0L A;  3NB5 A;  2FNN A;  4MLT A;  1Y7W A;  2X7U A;  3PO6 A;  3HKT A;  2CBA A;  5E28 A;  1G52 A;  4Q7S A;  3JXH C;  4YGL A;  3D0N A;  4IDR X;  1CVB A;  1Z93 A;  1BNW A;  1I9L A;  4M2R A;  3BL0 A;  1HEB A;  3M5S A;  4YGJ A;  3BET A;  1RJ6 A;  5E2N A;  5JEG B;  5IPZ A;  1CAZ A;  5G0C A;  2NXR A;  4YGN A;  1CZM A;  1KEQ A;  4XIX A;  1BN1 A;  3ZNC A;  3BL1 A;  1YDC A;  1TG9 A;  1UGD A;  2FW4 A;  1LG6 A;  4RUX A;  3M1K A;  4DZ7 A;  4Q09 A;  4ZX1 A;  4HT2 A;  1TEU X;  5SZ4 A;  1YDD A;  4R59 A;  2FOV A;  2X7T A;  4YYT A;  5JEH B;  1FLJ A;  3CZV A;  3DA2 A;  5EH5 A;  1CAH A;  1OKL A;  3M5E A;  3S73 B;  4RIU A;  1FSR A;  3HKN A;  4E3H A;  2QP6 A;  3KWA A;  2HFW A;  3K2F A;  4E3F A;  2NWY A;  5BRV A;  4HT0 A;  5FLT A;  1CIL A;  1UGA A;  5AMG A;  1BV3 A;  3ZP9 A;  3T83 A;  4QIY A;  1CNY A;  4BCW A;  9CA2 A;  4HEY A;  1HUG A;  5FLQ A;  3RYX B;  4L5W A;  4Q78 A;  5DSR A;  3U45 X;  4DZ9 A;  2FOQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5E2SA

Total Genus

Knots found

sequence length

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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