5FL4A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-naphthalen-1-yl-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2-sulfonamide
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 9
total genus 68
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl4A00
3MHOA 3V3JA 1I91A 1TH9A 1V9EA 3DA2A 3S8XA 4ZWZA 3D8WA 4RUXA 4R5AA 5BNLA 4MTYA 1G3ZA 4YGLA 5SZ5A 1CRAA 4YVYA 3M2ZA 1CVAA 3HKNA 5DRSA 1YDCA 4QSAA 3RYJB 3M1QA 4E3GA 2CBBA 2IT4A 4Q7SA 2FNKA 1UGAA 1FQNA 5JDVB 3U45X 4R59A 4E3FA 9CA2A 3S78B 3S76A 3RLDA 4HEYA 4YX4A 3TVOX 3P5LA 1CA3A 3R17B 5FNKA 4QEFA 4YHAA 4KP5A 1XEGA 3S75B 4QSIA 3KOIA 1G48A 1LG6A 1UGCA 1RJ6A 1G46A 4ILXA 4PQ7A 3RZ1B 3HKQA 3DCWA 5FLRA 2OSFA 1RZBA 2OSMA 3MHIA 4HEWA 5DSQA 4RH2A 3HKTA 1IF9A 2WEGA 4XIWA 2NWOA 2AX2A 2NNSA 5E2RA 3MNIA 3KNEA 5E5RA 5EH5A 1Z93A 3HKUA 2FMZA 2HFWA 3DBUA 4FRCA 4QIZA 4QSJA 4CNWA 3T82A 3MWOA 1G0EA 4YGKA 4HT0A 1FSNA 1FLJA 3D93A 4ZAOA 3IGPA 5DOHA 3D9ZA 2NWYA 3K7KA 1CNIA 3OKUA 3RYZA 3M5EA 1Z97A 4HF3A 1FQMA 3T83A 1MUAA 2H15A 4KUYA 1CNKA 1H4NA 1UGBA 2NXRA 1BN4A 3S73B 3S72B 3V2JA 1TE3X 4XFWA 5LMDA 1HVAA 1HEBA 4Q0LA 1TB0X 3RZ5A 1RAYA 4QJWA 1T9NA 3B1BA 1ZSBA 1HECA 3JXHC 3JXGA 3MZCA 4WUPA 4N0XB 4FU5A 2NNOA 1BNNA 3KIGA 1BNWA 4QJ0A 4QSBA 5EKMA 3SBIA 2NXTA 4JSZA 4L5WA 4WW8A 1TTMA 3DD8A 3M5TA 2O4ZA 3FFPX 5BRVA 1CAKA 4GL1X 3CA2A 4ITPA 4JSSA 1G53A 2NMXA 3P44A 2NXSA 1HEAA 4HU1A 4MLTA 1RZAA 3BL1A 1I9MA 1BNUA 5EH8A 2WEHA 4Z1NA 1DMXA 3F7UA 3V2MA 4QIYA 5FLOA 4HBAA 1ZGFA 1IF7A 3W6HA 1YDAA 3TMJA 4JS6A 1OKNA 2NNGA 2GD8A 4E4AA 1G4OA 4E3HA 4XE1A 3EFTA 3FE4A 3RG4A 1CAHA 5FL6A 1CNGA 4Q7PA 4WR7A 3N2PA 1UGEA 3OYSA 1CVHA 3M40A 5FDCA 3VBDA 3HFPA 2EU3A 1YO1A 3MNAA 3M1WA 4IWZA 3PJJA 2FOUA 1ZFQA 5A25A 1TG3A 1ZGEA 5DSMA 4QJOA 5JEPB 1XPZA 4FVOA 1KEQA 4JSAA 1LZVA 3M5SA 3RJ7A 1FQRA 3DC9A 4YGFA 4CNVA 1BZMA 3M1JA 1YDBA 2CA2A 4L5UA 8CA2A 1IF5A 3OY0A 1RZCA 2POVA 4Q06A 3KS3A 3P3HA 3IBLA 2EU2A 1CILA 1Y7WA 1CRMA 5SZ4A 3NB5A 5JQ0A 2FOSA 4Q6DA 4RFDA 3M1KA 4Q99A 2NWPA 1BNVA 4YXOA 5G03A 4PYXA 1HUHA 4XZ5A 4PZHA 1CNBA 3V5GA 2X7UA 4N16A 2WD3A 4YWPA 5FL4A 5SZ2A 2ZNCA 3F8EA 3RYVB 1TG9A 5DSLA 3QYKA 3N0NA 4K0TA 5FNJA 4E5QA 2AW1A 5SZ7A 4M2RA 4BCWA 4TWMA 5L3OA 5JQTA 4CACA 5DSPA 1FSQA 5DVXA 1CVCA 3IBUA 3DD0A 4CA2A 1CAIA 1CAJA 2POWA 1BV3A 4FPTA 4IDRX 5E2SA 4Q6EA 5FLQA 5EHVA 3FW3A 1CVDA 4KNJA 5JG5B 4Q08A 1I9OA 1TEUX 1URTA 1Z9YA 1BNMA 3M67A 4QK2A 4ZX0A 2POUA 2FNNA 3DCCA 3CYUA 3P58A 3D0NA 5JGTB 1AM6A 3D92A 3ML5A 3UYQA 1ZNCA 1CVFA 5SZ0A 2F14A 1MOOA 5E2MA 1CNXA 2VVBX 4Q87A 2VVAX 1HCAA 1UGGA 1TEQX 3CAJA 4Q90A 5FNHA 1DCBA 4QY3A 4ZWIA 4E49A 5BYIA 3KOKA 1ZFKA 5SZ3A 4ETQC 3KWAA 4MDMA 1J9WA 5E28A 1CCTA 1ZSCA 4ZWYA 1FR7A 1CNWA 2H4NA 3EFIA 4CQ0A 5FNMA 1G1DA 1A42A 1JCZA 4C3TA 1BICA 5DSIA 1RJ5A 1H9QA 4Q8YA 4RUYA 4K13A 1CAMA 4MDGA 4X5SA 1CCUA 4Q49A 1AVNA 5FLSA 4YXIA 3M04A 1KOQA 3OILA 1CINA 1CVEA 1CAYA 3IBIA 3U3AX 3MHMA 4XIXA 2WD2A 4CNRA 5G0BA 2ILIA 3UYNA 5E2KA 3DC3A 4LU3A 1H9NA 1BNTA 4KNNA 4Q81A 2HOCA 4RIUA 1XEVA 1I90A 2QO8A 4FVNA 4Z0QA 1G54A 4M2WA 4RFCA 3RZ0B 1LGDA 4MLXA 1UGFA 3M96A 5L6KA 4HT2A 4LHIA 4CNXA 5DSJA 3S74B 1CNHA 3K34A 5E5UA 4MO8A 2FOQA 4Q09A 4Q9YA 4KNIA 3T85A 4ZX1A 1HEDA 2NN1A 2NN7A 5EHEA 4Q78A 1JV0A 3IEOA 2QOAA 3RGEA 3OIKA 4QJXA 1I9QA 3RZ7A 5BRWA 3U7CA 2HD6A 3M2YA 3ML2A 4M2VA 1IF8A 4Q83A 5G0CA 1OKLA 3V3IB 1F2WA 1THKA 3MDZA 5DSNA 1LUGA 4HEZA 2NWZA 1CNCA 5AMLA 5BRUA 4ITOA 4WUQA 1CNYA 3B4FA 1KWQA 2Q1BA 1CZMA 1ZSAA 4K0SA 4KP8A 4Z1KA 2WEJA 1IF4A 4G7AA 1BNQA 3P3JA 4K0ZA 4L5VA 4Q7VA 4Q7WA 5JESB 3RYYA 4YGNA 1CNJA 4Y0JA 3DVCA 1CALA 2HNCA 3V7XA 3V3GB 5FNLA 5DSKA 3M3XA 5EZTX 1DMYA 5J8ZA 3M2NA 5DSRA 4YXUA 2CBAA 3HLJA 3HS4A 4LP6A 5A6HA 1FSRA 3GZ0A 2CBEA 1ZE8A 3DAZA 1CAZA 3C7PA 1BN3A 3BL0A 3V3HB 4YGJA 4BF1A 3DV7A 3CZVA 1BN1A 4FL7A 1FQLA 1HUGA 3NJ9A 3OYQA 3MMFA 5EOIA 4Z1JA 1FR4A 4QTLA 5AMDA 5G01A 3SBHA 5JGSB 3DCSA 5C8IA 4QJPA 3JXFA 4TWLA 3MNHA 1RAZA 4BF6A 2CBCA 3TVNX 4QK3A 4PYYA 1ZH9A 3PYKA 3RG3A 4M2UA 5HPJA 4RUZA 5IPZA 1RZDA 7CA2A 3KONA 3KKXA 5JEGB 3MNUA 1HCBA 3N3JA 4K1QA 3S97A 3OIMA 1CIMA 4QK1A 4DZ9A 2GEHA 4RIVA 1YO2A 2QP6A 3DVBA 3F4XA 3ZP9A 1G52A 4KV0A 3OKVA 4RN4A 5EHWA 1V9IC 4E3DA 2FOYA 3LXEA 4R5BA 1I9PA 3P55A 3L14A 5CACA 4YYTA 3N4BA 5FDIA 5JG3B 1BCDA 4KUWA 5E2NA 3NI5A 2CABA 3T5ZA 2EZ7A 1CAOA 1I9NA 1JD0A 1CCSA 1LG5A 1OKMA 3M2XA 5EKJA 4QJMA 1RZEA 1KWRA 1G0FA 2W2JA 5AMGA 5DOGA 3MHLA 3V3FA 3R16A 3SAPA 5EH7A 3U47A 6CA2A 3MYQA 5CJFA 2X7TA 3DVDA 3F7BA 3IAIA 5JEHB 4PXXA 1G6VA 1G45A 2FMGA 3M14A 3M98A 4KAPA 4ZWXA 2NNVA 4COQA 1XQ0A 3S77B 3PO6A 4WL4A 2CBDA 5DSOA 1CVBA 4WW6A 3S9TA 3P4VA 12CAA 4JSWA 4Z1EA 4KUVA 3SAXA 5FLPA 3KLDB 3RYXB 1EOUA 5EKHA 4FIKA 4MDLA 3T84A 5FL5A 1AZMA 2X7SA 5SZ6A 3Q31A 4Q8ZA 3IBNA 1YO0A 4Q07A 1YDDA 3MNKA 2Q1QA 2FW4A 2HL4A 4Q8XA 5FNIA 2FOVA 5FLTA 1OQ5A 4DZ7A 1I9LA 2HKKA 5CLUA 3ZNCA 3RZ8A 1KOPA 3MHCA 1CANA 3K2FA 2FNMA 2Q38A 5EIJA 2ABEA 1DCAA 4G0CA 4UOVA 3P5AA 1I8ZA 3W6IA 5FNGA 5CA2A 1UGDA 3BETA 3S71B 4KNMA 3T5UA 2WEOA 1CA2A 1IF6A 4E9OX 5SZ1A 1TBTX 3MNJA 1G4JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MHO A;  3V3J A;  1I91 A;  1TH9 A;  1V9E A;  3DA2 A;  3S8X A;  4ZWZ A;  3D8W A;  4RUX A;  4R5A A;  5BNL A;  4MTY A;  1G3Z A;  4YGL A;  5SZ5 A;  1CRA A;  4YVY A;  3M2Z A;  1CVA A;  3HKN A;  5DRS A;  1YDC A;  4QSA A;  3RYJ B;  3M1Q A;  4E3G A;  2CBB A;  2IT4 A;  4Q7S A;  2FNK A;  1UGA A;  1FQN A;  5JDV B;  3U45 X;  4R59 A;  4E3F A;  9CA2 A;  3S78 B;  3S76 A;  3RLD A;  4HEY A;  4YX4 A;  3TVO X;  3P5L A;  1CA3 A;  3R17 B;  5FNK A;  4QEF A;  4YHA A;  4KP5 A;  1XEG A;  3S75 B;  4QSI A;  3KOI A;  1G48 A;  1LG6 A;  1UGC A;  1RJ6 A;  1G46 A;  4ILX A;  4PQ7 A;  3RZ1 B;  3HKQ A;  3DCW A;  5FLR A;  2OSF A;  1RZB A;  2OSM A;  3MHI A;  4HEW A;  5DSQ A;  4RH2 A;  3HKT A;  1IF9 A;  2WEG A;  4XIW A;  2NWO A;  2AX2 A;  2NNS A;  5E2R A;  3MNI A;  3KNE A;  5E5R A;  5EH5 A;  1Z93 A;  3HKU A;  2FMZ A;  2HFW A;  3DBU A;  4FRC A;  4QIZ A;  4QSJ A;  4CNW A;  3T82 A;  3MWO A;  1G0E A;  4YGK A;  4HT0 A;  1FSN A;  1FLJ A;  3D93 A;  4ZAO A;  3IGP A;  5DOH A;  3D9Z A;  2NWY A;  3K7K A;  1CNI A;  3OKU A;  3RYZ A;  3M5E A; 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