5SZ6 | Genus

Total Genus 76

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	76
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVTFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLLQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDVGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLAECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__974522122755733__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__974522122755733__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/5SZ6/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__974522122755733__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"974522122755733","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/5SZ6/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__974522122755733__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Structure-Activity Relationships of Benzenesulfonamide-Based Inhibitors towards Carbonic Anhydrase Isoform Specificity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	76
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2016-08-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	5sz6A00

4QSIA 4RFCA 2QOAA 4Q8YA 1CVFA 5EHVA 3M2XA 2FOSA 4QJPA 1ZSBA 4Z1JA 4ZWYA 3M1KA 4E9OX 1CVDA 5E28A 5L6KA 1G1DA 1BNNA 3RYVB 4RUYA 3T85A 2HL4A 2H15A 4HT2A 3DD0A 3TVOX 4Q81A 3OYQA 3MDZA 4K0ZA 1CALA 4RUXA 3N4BA 4KUVA 4RIUA 4COQA 5DSJA 2H4NA 8CA2A 4C3TA 1KEQA 5JQTA 3HKQA 1JD0A 4RIVA 1RAZA 5AMGA 1RZAA 1THKA 2NWPA 3HS4A 1LGDA 3OIKA 1YDDA 4YXUA 4Q83A 5E2MA 3DC9A 1IF5A 4QJMA 1G6VA 3CYUA 3SBHA 1CAJA 3KOKA 4HEWA 1UGDA 3DVBA 4PXXA 3KIGA 3PO6A 5FLOA 4Q78A 4ETQC 4K0SA 5EKHA 4CNRA 4M2WA 2WD3A 4WR7A 1CNWA 3M40A 1TG9A 1F2WA 3M5EA 5BRWA 5BYIA 3U7CA 3M04A 4MDLA 1H9QA 2CBEA 4FU5A 3CA2A 3IBNA 4YYTA 5DOGA 5HPJA 5EH5A 3RZ0B 1CVAA 3N2PA 3NB5A 4Y0JA 3V3IB 1FQRA 1BCDA 3IGPA 1CAYA 1YO2A 4Q06A 1RZDA 1UGFA 3F7BA 1CNXA 3M2YA 1UGCA 4Q7PA 4QSBA 3W6HA 4MTYA 5JG3B 1CANA 5JESB 2HD6A 3EFIA 5FLRA 1FR4A 4KNNA 1Y7WA 4HEZA 4JSZA 4RUZA 1I9LA 5A25A 3RYZA 3MMFA 4ZX1A 2NWZA 5G01A 1G48A 2X7SA 1FQLA 3F8EA 5BRUA 5JG5B 2IT4A 4X5SA 4MO8A 1FQNA 4YXOA 3MZCA 4ZWXA 3HLJA 2NNSA 1HEDA 3T83A 3RG3A 4ITOA 4R5AA 1TE3X 4R59A 3M2NA 3B4FA 4QY3A 2X7UA 3DCSA 3MNKA 3P4VA 5SZ4A 3P44A 5JGTB 2NNVA 1I91A 4L5VA 2QP6A 5BNLA 1BN1A 2NWOA 1UGAA 1G4JA 4E4AA 4E3FA 1CVHA 4KUWA 1FSRA 5SZ1A 4E3DA 3M96A 4IDRX 4ITPA 1YDBA 3S74B 4KP5A 4E3GA 2EZ7A 3S73B 4HBAA 1ZFKA 3MYQA 4Q49A 1KOPA 2OSMA 4BF1A 2FOYA 3F7UA 3Q31A 1CNYA 5G0BA 4KV0A 1KWQA 1CVBA 5EKMA 4CQ0A 3PJJA 4E3HA 2NXRA 2F14A 3M14A 1OQ5A 4K13A 3OIMA 4UOVA 1ZH9A 3LXEA 1HCBA 4Q0LA 3JXFA 4YGFA 5E5UA 5A6HA 5EHEA 4HU1A 3M3XA 1T9NA 3M98A 4L5UA 1HUGA 5SZ7A 3K2FA 3P3HA 4YX4A 2POVA 3MWOA 4KNMA 4TWMA 5AMLA 5CLUA 3KNEA 4BF6A 4GL1X 1G53A 4HT0A 1CIMA 2HOCA 1CRMA 1Z97A 4FIKA 5FDCA 5FNMA 1CAKA 3FFPX 2CA2A 2NXSA 1CNJA 4QEFA 1URTA 3DD8A 3V2JA 5EH7A 3UYNA 3W6IA 5E2RA 2QO8A 4Z1KA 1UGEA 2FMZA 4MLXA 5CJFA 1KWRA 5LMDA 1LG5A 4FRCA 3HKNA 2CBAA 3RZ5A 1TBTX 1G54A 1BNTA 4CNXA 3C7PA 3V3GB 1RZBA 4N0XB 1XEGA 1XPZA 2NN7A 3D92A 3MNJA 1Z93A 1I9NA 5JDVB 1Z9YA 2HFWA 2WD2A 1BZMA 1HCAA 1A42A 1TG3A 3T82A 4DZ7A 6CA2A 4PQ7A 1BNUA 4YHAA 5SZ0A 3RYJB 4CNVA 1TTMA 1I9MA 3IBIA 1JCZA 2Q38A 2WEGA 4PZHA 2NNOA 4Z0QA 3QYKA 4QK2A 2FNKA 4K0TA 4K1QA 3D0NA 3S75B 5FDIA 1BNQA 4Q8ZA 4Q9YA 1IF8A 3EFTA 5C8IA 1G4OA 3RJ7A 12CAA 2OSFA 2ABEA 3P55A 1CNGA 1AZMA 1TH9A 3OKVA 4JSSA 4Z1EA 1CINA 3P5LA 4WW8A 4Q07A 2X7TA 3MNUA 9CA2A 1YO0A 3IAIA 1XEVA 1OKLA 3RGEA 1CRAA 1I9PA 3S76A 4JSWA 3V3FA 3OYSA 1CNKA 1YO1A 3R17B 1RJ6A 1CAIA 4JSAA 1FR7A 5DSKA 2Q1QA 4WL4A 3IBUA 3IEOA 4KAPA 4RFDA 4WUQA 2O4ZA 5CA2A 3JXGA 4HF3A 3D8WA 2AW1A 1ZFQA 1CA3A 4YGKA 4DZ9A 3HKTA 4G7AA 1IF7A 1BV3A 5EHWA 5FNHA 2W2JA 1G3ZA 5JGSB 2FNNA 3MHLA 5EOIA 5J8ZA 4YGLA 3DAZA 1HVAA 4RH2A 5CACA 1ZSAA 2FOVA 1AM6A 3RYXB 5DSIA 1CILA 4QTLA 2GD8A 4Q7WA 3RZ8A 2NXTA 2WEHA 4KP8A 4QJ0A 1ZNCA 2FW4A 2VVBX 3F4XA 5FLPA 5SZ2A 3DCCA 4L5WA 2HKKA 1DCAA 5E2KA 3KLDB 4QSJA 1G52A 1DMYA 3KONA 1CNBA 1CCTA 1LUGA 4YGJA 1JV0A 5EH8A 3S97A 2POWA 2FOUA 4E5QA 4Q08A 1V9IC 3DVDA 3T84A 3KOIA 5DSQA 4QSAA 3S8XA 3V2MA 3P58A 3JXHC 4WW6A 1G45A 5G0CA 3SBIA 1RZEA 4XZ5A 5DSLA 2Q1BA 4Q09A 1HEBA 3M67A 4MLTA 4QJWA 3BL1A 1H4NA 5EZTX 3L14A 1G0FA 4QK3A 4LU3A 1FLJA 3B1BA 4Z1NA 5DSPA 4KUYA 4QJOA 1ZE8A 4IWZA 3RLDA 1G46A 3GZ0A 1XQ0A 4R5BA 4XIXA 1AVNA 1TEQX 1J9WA 1RAYA 3RZ7A 3M2ZA 3DVCA 1HECA 2HNCA 3DV7A 5FLQA 2GEHA 5E2NA 1ZGFA 4MDGA 4N16A 5JEHB 1RJ5A 3FW3A 5DSOA 5SZ5A 3IBLA 4JS6A 1BNMA 5SZ3A 1BICA 5JEPB 1BNVA 1FSQA 1YDCA 3ML5A 3KKXA 2CBDA 1ZSCA 1CVEA 4G0CA 4Q99A 5IPZA 1HEAA 2FNMA 3P3JA 4Q90A 3MHOA 1FSNA 1DMXA 4KNJA 3OILA 2POUA 3HKUA 3CAJA 4ZWIA 2AX2A 1CCSA 3DA2A 3S78B 3D9ZA 5DOHA 5DRSA 1FQMA 3T5ZA 5FL6A 1HUHA 4QK1A 3OY0A 3BETA 3SAPA 2NMXA 1IF6A 3U47A 4Q8XA 1I90A 3ML2A 5FNLA 4LP6A 1KOQA 3V3HB 5FNGA 4QIYA 4M2UA 5L3OA 5EKJA 5FLTA 4YWPA 5G03A 2NNGA 4MDMA 4WUPA 3V3JA 5AMDA 2NWYA 3S9TA 2NN1A 3S71B 1CAOA 1H9NA 2ILIA 4M2RA 3M1JA 1I9OA 1BNWA 4LHIA 3MHIA 3KS3A 2FMGA 3OKUA 1CCUA 2VVAX 1IF9A 1BN4A 4M2VA 3ZNCA 3U45X 4CNWA 3FE4A 1YDAA 1CA2A 3N3JA 1I9QA 3S77B 3ZP9A 4TWLA 3U3AX 1CNCA 4Q87A 4XFWA 4RN4A 3RZ1B 3M5SA 5FNIA 4ZAOA 4FVNA 3MHCA 1CAMA 1ZGEA 3DBUA 4HEYA 3NI5A 5E2SA 3DC3A 3UYQA 4FVOA 3S72B 2CBBA 1EOUA 4FL7A 1LG6A 2EU2A 1CAHA 3K7KA 3M1QA 4Q7VA 1I8ZA 2EU3A 5FNJA 5EIJA 3T5UA 4YGNA 4PYYA 1BN3A 1UGGA 1CNIA 1G0EA 2CABA 2ZNCA 3K34A 4XE1A 4PYXA 3TVNX 5DVXA 5DSRA 2CBCA 3D93A 1MUAA 4Q6EA 5E5RA 1LZVA 1CAZA 4ZWZA 3CZVA 3M1WA 3MNHA 2FOQA 3MNIA 3PYKA 4CA2A 3MHMA 4CACA 5FLSA 3N0NA 1CZMA 1OKMA 1CVCA 3RG4A 7CA2A 3SAXA 4YVYA 5DSNA 4Q7SA 3KWAA 5FL4A 3DCWA 3TMJA 2WEJA 4E49A 3R16A 1CNHA 4KNIA 3RYYA 4QJXA 4QIZA 5FL5A 3V5GA 1IF4A 1TEUX 3V7XA 3P5AA 1OKNA 3MNAA 1TB0X 3M5TA 4FPTA 4Q6DA 2WEOA 4YXIA 1RZCA 1DCBA 5BRVA 5JEGB 3HFPA 1UGBA 3BL0A 4ILXA 5JQ0A 4XIWA 5DSMA 3VBDA 5SZ6A 4ZX0A 1MOOA 3NJ9A 4BCWA 1V9EA 5FNKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QSI A;  4RFC A;  2QOA A;  4Q8Y A;  1CVF A;  5EHV A;  3M2X A;  2FOS A;  4QJP A;  1ZSB A;  4Z1J A;  4ZWY A;  3M1K A;  4E9O X;  1CVD A;  5E28 A;  5L6K A;  1G1D A;  1BNN A;  3RYV B;  4RUY A;  3T85 A;  2HL4 A;  2H15 A;  4HT2 A;  3DD0 A;  3TVO X;  4Q81 A;  3OYQ A;  3MDZ A;  4K0Z A;  1CAL A;  4RUX A;  3N4B A;  4KUV A;  4RIU A;  4COQ A;  5DSJ A;  2H4N A;  8CA2 A;  4C3T A;  1KEQ A;  5JQT A;  3HKQ A;  1JD0 A;  4RIV A;  1RAZ A;  5AMG A;  1RZA A;  1THK A;  2NWP A;  3HS4 A;  1LGD A;  3OIK A;  1YDD A;  4YXU A;  4Q83 A;  5E2M A;  3DC9 A;  1IF5 A;  4QJM A;  1G6V A;  3CYU A;  3SBH A;  1CAJ A;  3KOK A;  4HEW A;  1UGD A;  3DVB A;  4PXX A;  3KIG A;  3PO6 A;  5FLO A;  4Q78 A;  4ETQ C;  4K0S A;  5EKH A;  4CNR A;  4M2W A;  2WD3 A;  4WR7 A;  1CNW A;  3M40 A;  1TG9 A;  1F2W A;  3M5E A;  5BRW A;  5BYI A;  3U7C A;  3M04 A;  4MDL A;  1H9Q A;  2CBE A;  4FU5 A;  3CA2 A;  3IBN A;  4YYT A;  5DOG A;  5HPJ A;  5EH5 A;  3RZ0 B;  1CVA A;  3N2P A;  3NB5 A;  4Y0J A;  3V3I B;  1FQR A;  1BCD A;  3IGP A;  1CAY A;  1YO2 A;  4Q06 A;  1RZD A;  1UGF A;  3F7B A;  1CNX A;  3M2Y A;  1UGC A;  4Q7P A;  4QSB A;  3W6H A;  4MTY A;  5JG3 B;  1CAN A;  5JES B;  2HD6 A;  3EFI A;  5FLR A;  1FR4 A;  4KNN A;  1Y7W A;  4HEZ A;  4JSZ A;  4RUZ A;  1I9L A;  5A25 A;  3RYZ A;  3MMF A;  4ZX1 A;  2NWZ A;  5G01 A;  1G48 A;  2X7S A;  1FQL A;  3F8E A;  5BRU A;  5JG5 B;  2IT4 A;  4X5S A;  4MO8 A;  1FQN A;  4YXO A;  3MZC A;  4ZWX A;  3HLJ A;  2NNS A;  1HED A;  3T83 A;  3RG3 A;  4ITO A;  4R5A A;  1TE3 X;  4R59 A;  3M2N A;  3B4F A;  4QY3 A;  2X7U A;  3DCS A;  3MNK A;  3P4V A;  5SZ4 A;  3P44 A;  5JGT B;  2NNV A;  1I91 A;  4L5V A;  2QP6 A;  5BNL A;  1BN1 A;  2NWO A;  1UGA A;  1G4J A;  4E4A A;  4E3F A;  1CVH A;  4KUW A;  1FSR A;  5SZ1 A;  4E3D A;  3M96 A;  4IDR X;  4ITP A;  1YDB A;  3S74 B;  4KP5 A;  4E3G A;  2EZ7 A;  3S73 B;  4HBA A;  1ZFK A;  3MYQ A;  4Q49 A;  1KOP A;  2OSM A;  4BF1 A;  2FOY A;  3F7U A;  3Q31 A;  1CNY A;  5G0B A;  4KV0 A;  1KWQ A;  1CVB A;  5EKM A;  4CQ0 A;  3PJJ A;  4E3H A;  2NXR A;  2F14 A;  3M14 A;  1OQ5 A;  4K13 A;  3OIM A;  4UOV A;  1ZH9 A;  3LXE A;  1HCB A;  4Q0L A;  3JXF A;  4YGF A;  5E5U A;  5A6H A;  5EHE A;  4HU1 A;  3M3X A;  1T9N A;  3M98 A;  4L5U A;  1HUG A;  5SZ7 A;  3K2F A;  3P3H A;  4YX4 A;  2POV A;  3MWO A;  4KNM A;  4TWM A;  5AML A;  5CLU A;  3KNE A;  4BF6 A;  4GL1 X;  1G53 A;  4HT0 A;  1CIM A;  2HOC A;  1CRM A;  1Z97 A;  4FIK A;  5FDC A;  5FNM A;  1CAK A;  3FFP X;  2CA2 A;  2NXS A;  1CNJ A;  4QEF A;  1URT A;  3DD8 A;  3V2J A;  5EH7 A;  3UYN A;  3W6I A;  5E2R A;  2QO8 A;  4Z1K A;  1UGE A;  2FMZ A;  4MLX A;  5CJF A;  1KWR A;  5LMD A;  1LG5 A;  4FRC A;  3HKN A;  2CBA A;  3RZ5 A;  1TBT X;  1G54 A;  1BNT A;  4CNX A;  3C7P A;  3V3G B;  1RZB A;  4N0X B;  1XEG A;  1XPZ A;  2NN7 A;  3D92 A;  3MNJ A;  1Z93 A;  1I9N A;  5JDV B;  1Z9Y A;  2HFW A;  2WD2 A;  1BZM A;  1HCA A;  1A42 A;  1TG3 A;  3T82 A;  4DZ7 A;  6CA2 A;  4PQ7 A;  1BNU A;  4YHA A;  5SZ0 A;  3RYJ B;  4CNV A;  1TTM A;  1I9M A;  3IBI A;  1JCZ A;  2Q38 A;  2WEG A;  4PZH A;  2NNO A;  4Z0Q A;  3QYK A;  4QK2 A;  2FNK A;  4K0T A;  4K1Q A;  3D0N A;  3S75 B;  5FDI A;  1BNQ A;  4Q8Z A;  4Q9Y A;  1IF8 A;  3EFT A;  5C8I A;  1G4O A;  3RJ7 A;  12CA A;  2OSF A;  2ABE A;  3P55 A;  1CNG A;  1AZM A;  1TH9 A;  3OKV A;  4JSS A;  4Z1E A;  1CIN A;  3P5L A;  4WW8 A;  4Q07 A;  2X7T A;  3MNU A;  9CA2 A;  1YO0 A;  3IAI A;  1XEV A;  1OKL A;  3RGE A;  1CRA A;  1I9P A;  3S76 A;  4JSW A;  3V3F A;  3OYS A;  1CNK A;  1YO1 A;  3R17 B;  1RJ6 A;  1CAI A;  4JSA A;  1FR7 A;  5DSK A;  2Q1Q A;  4WL4 A;  3IBU A;  3IEO A;  4KAP A;  4RFD A;  4WUQ A;  2O4Z A;  5CA2 A;  3JXG A;  4HF3 A;  3D8W A;  2AW1 A;  1ZFQ A;  1CA3 A;  4YGK A;  4DZ9 A;  3HKT A;  4G7A A;  1IF7 A;  1BV3 A;  5EHW A;  5FNH A;  2W2J A;  1G3Z A;  5JGS B;  2FNN A;  3MHL A;  5EOI A;  5J8Z A;  4YGL A;  3DAZ A;  1HVA A;  4RH2 A;  5CAC A;  1ZSA A;  2FOV A;  1AM6 A;  3RYX B;  5DSI A;  1CIL A;  4QTL A;  2GD8 A;  4Q7W A;  3RZ8 A;  2NXT A;  2WEH A;  4KP8 A;  4QJ0 A;  1ZNC A;  2FW4 A;  2VVB X;  3F4X A;  5FLP A;  5SZ2 A;  3DCC A;  4L5W A;  2HKK A;  1DCA A;  5E2K A;  3KLD B;  4QSJ A;  1G52 A;  1DMY A;  3KON A;  1CNB A;  1CCT A;  1LUG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5SZ6A

Total Genus

Knots found

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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