5A6HA

Synthesis, carbonic anhydrase inhibition and protein x-ray structure of the unusual natural product primary sulfonamide psammaplin c
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An Unusual Natural Product Primary Sulfonamide: Synthesis, Carbonic Anhydrase Inhibition and Protein X-Ray Structures of Psammaplin C.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5a6hA00
3DCWA 1LGDA 1T9NA 1BN3A 4YX4A 4YGKA 5FNLA 4PYYA 2VVBX 4Z1KA 3HKNA 2H15A 3MNUA 3MHMA 4WUQA 1RZBA 4CACA 4Q7WA 5SZ4A 3OKVA 3SAPA 5DSNA 4LP6A 1OKMA 4LHIA 5DSOA 3CYUA 1ZSCA 1KWRA 2ILIA 4Q90A 5J8ZA 3S9TA 3P4VA 3S74B 1G6VA 1RZDA 4MTYA 5A6HA 3M2XA 5AMGA 4GL1X 1IF6A 5G0BA 5DSPA 1MUAA 1CNBA 3MMFA 1CAYA 4QJOA 1YDCA 1IF4A 2NWYA 3Q31A 3M5EA 1ZNCA 1I90A 1XPZA 4MDGA 1RZEA 3DD0A 3K2FA 2X7TA 5E2RA 1CNIA 2ZNCA 4QJXA 3IAIA 4KNNA 4Q83A 4WW6A 8CA2A 1BNQA 3S72B 1V9EA 4G7AA 1CVHA 4M2UA 1H9QA 1UGEA 3M1WA 3F4XA 4BF6A 5BRVA 2FOSA 4YWPA 3KOKA 5DRSA 4YYTA 4CNXA 4YHAA 1YDDA 5DSMA 4ZX0A 4Q9YA 1HEAA 2NNGA 4Q78A 3M1JA 1TH9A 3JXFA 1JV0A 5SZ6A 4RH2A 9CA2A 4WR7A 4RUXA 2HKKA 3P44A 5DSLA 3RGEA 4FVOA 5BRWA 4M2WA 3NI5A 3KS3A 2GD8A 5DOHA 4K1QA 4E3FA 1YO2A 2FNNA 1DMYA 5EIJA 2AX2A 1I91A 1ZFKA 1I9OA 3RG4A 2HFWA 3T84A 1TEUX 1BV3A 4ZAOA 4Z0QA 3BETA 5JGSB 1CA3A 5LMDA 2NWOA 3V7XA 3JXGA 1I9LA 3OYQA 2Q38A 3GZ0A 1Z97A 3S78B 5SZ5A 2NXSA 3MNJA 5E2KA 4HF3A 5SZ1A 2HOCA 3QYKA 1G48A 4Q8XA 4HU1A 4JSSA 3TVOX 1RAYA 3IGPA 3ZP9A 3M5TA 5JEHB 1BNTA 1TG3A 3NB5A 4JS6A 5SZ0A 1BZMA 1CNCA 4YVYA 2QOAA 4KP8A 1TEQX 3IBUA 3P3JA 1BCDA 1BNVA 5EH5A 3N2PA 3N4BA 2EU3A 1KEQA 2AW1A 3M1KA 1HVAA 1CILA 2CBAA 1DCBA 3KONA 5FNHA 12CAA 4QSBA 5FNGA 3B4FA 1CAMA 3MNKA 2X7UA 3M98A 5JESB 2OSFA 4QSIA 1HCAA 2QP6A 3F7UA 3M2NA 5E2NA 2EZ7A 1THKA 4FRCA 1FQLA 3V3IB 2NNSA 1CNGA 5EH8A 4Y0JA 2POVA 1TG9A 5CLUA 3M14A 1CVDA 3RYXB 4FPTA 1ZFQA 4Z1NA 3T82A 4QK1A 3K7KA 4CNVA 5FL4A 2WD3A 5SZ2A 3UYQA 4HBAA 5A25A 1OKLA 3KOIA 4C3TA 3U45X 1CINA 1Y7WA 4FVNA 4QTLA 3V3JA 2HL4A 4Q7PA 3U47A 2WEGA 3PYKA 4Q7SA 1G54A 2CA2A 1G53A 4M2RA 1CNWA 3S97A 1LG6A 3HLJA 4Q09A 1H4NA 2ABEA 4RUYA 5EKJA 5FLRA 3IEOA 3MWOA 5IPZA 2NWZA 2OSMA 3P3HA 4YGJA 4FIKA 3S71B 4COQA 4Q87A 1F2WA 2HD6A 2NWPA 1G45A 4XFWA 3KIGA 4MO8A 2NN7A 5FLPA 1FSRA 1AM6A 5C8IA 3KNEA 1CAIA 1EOUA 1UGAA 3UYNA 1HECA 3TMJA 4XIWA 1CIMA 3M04A 1I9MA 3M40A 3OY0A 3CZVA 1V9IC 1CVBA 5FL6A 1ZSBA 4KNIA 5SZ7A 5BYIA 4JSWA 5BRUA 3DVCA 3DC9A 3RYYA 4ILXA 5FLOA 3V3FA 3M5SA 1IF7A 5SZ3A 3BL0A 1CANA 5L6KA 4Q06A 3HKUA 2POWA 2W2JA 4QK2A 4RIVA 5E5RA 3DV7A 1FSNA 3ML5A 3RLDA 4RIUA 5G01A 1XQ0A 3V2JA 1FQMA 4KP5A 2QO8A 1JD0A 4Q99A 1CAKA 3FFPX 5BNLA 1CNKA 4QEFA 1HEDA 1HUHA 4Z1EA 1OKNA 4KUVA 2F14A 5CACA 4QSAA 3B1BA 4M2VA 4R5BA 5DSQA 4YXOA 7CA2A 4L5VA 1RZCA 4Q7VA 2NXTA 3ZNCA 3R16A 1G1DA 4JSAA 4R59A 2FNKA 4XIXA 4Z1JA 3S75B 3CA2A 1AVNA 1IF5A 1RZAA 4Q08A 1HEBA 1CCUA 3F7BA 3RYZA 5CA2A 1G4OA 1I9NA 1CAZA 4ITPA 3DCSA 3IBIA 4KAPA 3RZ8A 4CA2A 3HKTA 5G0CA 3D8WA 1J9WA 4ZWIA 1DCAA 4QIZA 1URTA 1FLJA 2Q1BA 4LU3A 4E3HA 3SBHA 1CAOA 3S73B 3D9ZA 4TWLA 3OIMA 5EKHA 1BICA 1HUGA 5FNMA 3M2YA 1CRAA 4Q8YA 4MLXA 4RFDA 4MDMA 3KKXA 1BNMA 1CZMA 4FL7A 4K13A 4X5SA 5JGTB 4HEWA 5FDIA 3M3XA 5JG5B 1Z93A 1BNNA 3PJJA 4MLTA 3RJ7A 5DSJA 4KV0A 3S76A 1FQRA 1CVAA 4QK3A 1ZH9A 1IF8A 3RG3A 3IBLA 1CNXA 1FSQA 4RN4A 5E5UA 3L14A 4XE1A 1UGBA 3KWAA 5E2MA 2CBEA 3OKUA 4IDRX 2FOUA 2CBBA 3MHLA 3RZ5A 1H9NA 1DMXA 3M96A 5FL5A 3DC3A 4UOVA 5JDVB 1JCZA 3P5AA 4G0CA 3EFTA 3MNAA 1UGCA 4PQ7A 1KWQA 4Q81A 5DSIA 4QJPA 3T5UA 1KOPA 4XZ5A 3C7PA 5DSKA 4PZHA 1FQNA 2CBCA 4PYXA 1Z9YA 3KLDB 2O4ZA 5FNKA 2NXRA 4QJ0A 4YXUA 2FNMA 4KUYA 3N3JA 4RFCA 5HPJA 3TVNX 1BN1A 3DBUA 4FU5A 1LUGA 4ZX1A 1TE3X 4YGNA 4QIYA 3RZ0B 4QJWA 5E2SA 5EHEA 4E4AA 3S77B 1RJ5A 4E5QA 1BNUA 2FMZA 5JEPB 4DZ7A 4Q07A 3OILA 5FLQA 4K0SA 4WL4A 4ZWYA 2VVAX 3DAZA 2FMGA 3MHIA 4JSZA 1YDAA 5FLSA 1LZVA 1MOOA 4L5UA 4N0XB 1G52A 5DSRA 1IF9A 1G46A 3V3HB 1I8ZA 1ZGFA 3MHOA 3MNHA 5EHWA 4MDLA 4ZWXA 4BF1A 1UGGA 1CRMA 3U7CA 4DZ9A 3M67A 4TWMA 1CCTA 5JG3B 3PO6A 1OQ5A 3F8EA 3P55A 4YGFA 4ZWZA 5FNJA 1BNWA 1LG5A 4Q8ZA 2FOVA 1CNYA 4HEZA 3BL1A 5CJFA 4YGLA 1G4JA 5L3OA 3K34A 1ZSAA 5DVXA 4Q6EA 5DOGA 3HKQA 5EH7A 1CCSA 3EFIA 4CQ0A 1CVEA 4K0ZA 2Q1QA 3FE4A 4YXIA 4WW8A 3T83A 5FLTA 1CA2A 3DD8A 1TTMA 2FOQA 2NMXA 3DVBA 4R5AA 5AMLA 3FW3A 5EOIA 5EZTX 3W6HA 1CAHA 4QY3A 1CVCA 2WEHA 1CAJA 4PXXA 3RZ7A 2IT4A 4L5WA 3HFPA 3RYVB 5G03A 3DVDA 5FDCA 4HT2A 1I9PA 1YO1A 4KUWA 3R17B 4Q0LA 5AMDA 4E49A 1ZGEA 1A42A 3MHCA 3M2ZA 3RYJB 1YDBA 5JQTA 5FNIA 2NNVA 4QSJA 6CA2A 1UGDA 1FR7A 1CNJA 5JQ0A 1CVFA 3SAXA 4QJMA 4ITOA 5EKMA 4K0TA 3V3GB 1CNHA 3MYQA 4WUPA 1ZE8A 4RUZA 3OYSA 3W6IA 2NNOA 1YO0A 3DA2A 4CNWA 2HNCA 2FW4A 3V2MA 2NN1A 1FR4A 4E3GA 2GEHA 1XEGA 3V5GA 1RJ6A 3T5ZA 3D0NA 2WD2A 4N16A 3JXHC 1HCBA 2FOYA 4CNRA 1XEVA 3DCCA 1CALA 4BCWA 4KNMA 3VBDA 1AZMA 4HT0A 4ETQC 3M1QA 2CBDA 3LXEA 2X7SA 1TBTX 3IBNA 3MZCA 1G0FA 4Q6DA 4Q49A 3T85A 4E9OX 4IWZA 1I9QA 1G0EA 1TB0X 4HEYA 1KOQA 2EU2A 3S8XA 3HS4A 1G3ZA 2CABA 5EHVA 3RZ1B 2H4NA 3N0NA 2WEJA 3MNIA 3ML2A 5E28A 4KNJA 3D92A 2WEOA 3D93A 1RAZA 3SBIA 3U3AX 4E3DA 5JEGB 2POUA 1UGFA 3P5LA 3NJ9A 3CAJA 3P58A 3MDZA 1BN4A 3OIKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DCW A;  1LGD A;  1T9N A;  1BN3 A;  4YX4 A;  4YGK A;  5FNL A;  4PYY A;  2VVB X;  4Z1K A;  3HKN A;  2H15 A;  3MNU A;  3MHM A;  4WUQ A;  1RZB A;  4CAC A;  4Q7W A;  5SZ4 A;  3OKV A;  3SAP A;  5DSN A;  4LP6 A;  1OKM A;  4LHI A;  5DSO A;  3CYU A;  1ZSC A;  1KWR A;  2ILI A;  4Q90 A;  5J8Z A;  3S9T A;  3P4V A;  3S74 B;  1G6V A;  1RZD A;  4MTY A;  5A6H A;  3M2X A;  5AMG A;  4GL1 X;  1IF6 A;  5G0B A;  5DSP A;  1MUA A;  1CNB A;  3MMF A;  1CAY A;  4QJO A;  1YDC A;  1IF4 A;  2NWY A;  3Q31 A;  3M5E A;  1ZNC A;  1I90 A;  1XPZ A;  4MDG A;  1RZE A;  3DD0 A;  3K2F A;  2X7T A;  5E2R A;  1CNI A;  2ZNC A;  4QJX A;  3IAI A;  4KNN A;  4Q83 A;  4WW6 A;  8CA2 A;  1BNQ A;  3S72 B;  1V9E A;  4G7A A;  1CVH A;  4M2U A;  1H9Q A;  1UGE A;  3M1W A;  3F4X A;  4BF6 A;  5BRV A;  2FOS A;  4YWP A;  3KOK A;  5DRS A;  4YYT A;  4CNX A;  4YHA A;  1YDD A;  5DSM A;  4ZX0 A;  4Q9Y A;  1HEA A;  2NNG A;  4Q78 A;  3M1J A;  1TH9 A;  3JXF A;  1JV0 A;  5SZ6 A;  4RH2 A;  9CA2 A;  4WR7 A;  4RUX A;  2HKK A;  3P44 A;  5DSL A;  3RGE A;  4FVO A; 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