5E2MA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme i with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2mA00
4E4AA 3P5LA 4YXOA 1BNWA 4Q81A 4ETQC 3T83A 1I9LA 3CZVA 5HPJA 3ML2A 2OSMA 1BN4A 3HLJA 1CNHA 1DCAA 2QP6A 2WEJA 5BNLA 1YO0A 3MHCA 4QK3A 3OILA 4R5AA 1XQ0A 3KONA 3RZ0B 1KEQA 5BRVA 6CA2A 1HEAA 4ZWZA 1BNQA 1CA2A 5JEGB 3N0NA 4WW6A 5FNMA 2NN1A 4PQ7A 1BZMA 4K13A 3IEOA 3P55A 3DD0A 3NJ9A 4Z1EA 3GZ0A 4K1QA 3K2FA 4RN4A 3TVNX 5BRWA 1KWRA 1V9IC 1YO1A 4L5UA 1ZSBA 5JEPB 3S76A 1UGBA 4ZAOA 4QIYA 1BNUA 5DOGA 3P44A 2WD2A 4XZ5A 1CALA 3K7KA 3SAXA 3D9ZA 4G7AA 1FQMA 3M5TA 5FLSA 1YDDA 1CRMA 2EZ7A 3FFPX 4KP5A 1G53A 1BV3A 1JD0A 3L14A 4KUVA 2CBBA 2FOQA 3FE4A 4FU5A 3DCWA 1CVEA 3T84A 4Q8XA 4E3FA 5BYIA 3V3IB 3DVDA 3NB5A 4QSIA 2NNOA 3ZP9A 4JSZA 2HD6A 5FL6A 3T82A 1IF4A 4FRCA 2Q38A 5DSRA 3MNAA 2X7TA 1J9WA 2FOVA 4MLTA 1UGCA 1I9PA 3RG3A 5FNJA 1CAMA 4E3HA 1G3ZA 1CAKA 1IF8A 2ZNCA 3M1WA 4YWPA 2WEHA 1G46A 4KP8A 3S78B 5CJFA 3N2PA 5SZ0A 4YGKA 1CNGA 2O4ZA 1LZVA 5G0BA 5SZ7A 3RJ7A 2ABEA 4YX4A 3V3JA 1DMYA 3M96A 4ITPA 5DSNA 4BF1A 1UGGA 1XPZA 4M2UA 4WR7A 4YGFA 3OY0A 5FLTA 2FOSA 2QO8A 3DA2A 3N3JA 3OYSA 1CVDA 5EOIA 3DAZA 4PYXA 4R59A 5JQTA 2FMZA 2NXTA 4HF3A 3UYNA 4JSAA 5E5UA 3DC3A 1FLJA 1G54A 4YGNA 1CCTA 1FSNA 5E2SA 5CA2A 2X7UA 2POVA 5FDCA 1URTA 5FLPA 1KWQA 2EU2A 4FIKA 4Q90A 1V9EA 2NNGA 1FR4A 3RZ7A 2AX2A 3MHOA 4MLXA 4Q7PA 5FNGA 5EIJA 2OSFA 5J8ZA 2NWYA 1IF9A 3P4VA 1CNWA 3HFPA 3M67A 2NNVA 5E2KA 4K0TA 3DCSA 4Q8YA 1CINA 4N16A 3RG4A 3S71B 4KNMA 1G1DA 1ZSCA 3D0NA 4Y0JA 4E49A 4ZWYA 3DC9A 1I9OA 4R5BA 3N4BA 3DVCA 4MTYA 4UOVA 1XEGA 3T5UA 12CAA 4RUXA 4RUZA 3OIMA 1TE3X 4E5QA 3MHLA 1F2WA 5SZ1A 1KOPA 2CA2A 3KWAA 1BNTA 1OKLA 3MNUA 3RGEA 4XE1A 4CA2A 3R17B 2FOUA 3D8WA 2NNSA 3M1KA 5E2RA 4FPTA 2FNKA 5EHEA 3SBHA 4CACA 1RJ5A 4MO8A 1HECA 3V7XA 1HEDA 4K0ZA 5A6HA 3DD8A 1ZGFA 1CVAA 1ZFKA 4IWZA 3IGPA 5JQ0A 4Q9YA 1UGDA 4FVNA 5DSLA 5E5RA 3M5EA 1I8ZA 4PZHA 4XIWA 1MUAA 1XEVA 4L5VA 1Y7WA 1H4NA 4Q78A 1FSQA 4QSBA 1Z93A 3IBLA 5JG5B 5G01A 3C7PA 3OYQA 3VBDA 5SZ2A 1FQRA 4ITOA 1TB0X 1CNIA 3PJJA 2HL4A 3OIKA 1CAZA 3PYKA 1ZE8A 1AM6A 4Q09A 1IF6A 3DV7A 1CNCA 1IF7A 3MZCA 2Q1BA 3Q31A 4QEFA 4QSAA 3BL1A 4WUPA 3M2YA 1MOOA 2NWPA 1CILA 5EKJA 1HEBA 3IAIA 1HCAA 3MMFA 3IBNA 3M1JA 1CAOA 3M5SA 4RFDA 3MNJA 1Z97A 1BNNA 1TTMA 4QK2A 3RYJB 3SBIA 4MDMA 1UGEA 5EKMA 4C3TA 5SZ5A 3K34A 1YO2A 4Q49A 3RYXB 1OKNA 3S75B 3KNEA 4RFCA 1AZMA 5A25A 4CNVA 3JXHC 5CLUA 5SZ3A 4BF6A 3MWOA 1UGFA 3F8EA 3S73B 3UYQA 4YXUA 1I90A 5DSPA 5FL4A 3RZ5A 4BCWA 4CQ0A 3P3HA 1RZCA 4Q6DA 5EZTX 3KLDB 1G4JA 1LGDA 1OQ5A 3CA2A 1KOQA 5JDVB 5DSQA 1TG3A 5EHVA 2NWOA 5E2NA 5FNLA 1FSRA 3IBIA 5CACA 1LG5A 4TWLA 1RZEA 5DOHA 5FDIA 3RYYA 4PYYA 2GEHA 3OKUA 1LUGA 3S97A 1HUGA 3W6IA 3M1QA 3D93A 3KKXA 1I9NA 5EKHA 1FQNA 1FQLA 4KUYA 3V5GA 3MDZA 1RZAA 5AMGA 5DSMA 5JESB 4ZWXA 1DMXA 4Q06A 4Z0QA 2F14A 2FOYA 4QJ0A 2WD3A 5EH8A 4YYTA 4ZX1A 3CYUA 4L5WA 4GL1X 1AVNA 4PXXA 1CCUA 4G0CA 4RUYA 1FR7A 4QY3A 1ZH9A 3M2XA 5LMDA 4HU1A 1I9MA 2NWZA 4QJWA 1CZMA 3V3GB 5FLRA 1CVHA 2POUA 1G0FA 3DBUA 3MHIA 4Z1KA 2HNCA 3MHMA 1RAYA 2NXRA 4XFWA 5SZ6A 1Z9YA 3KOKA 1BICA 2AW1A 1CAYA 3S74B 3P5AA 3W6HA 4YXIA 4CNXA 4K0SA 9CA2A 5FLQA 3TVOX 3M98A 4MDLA 4Q6EA 1OKMA 4KNNA 3LXEA 3S9TA 3PO6A 1G0EA 3F7BA 1IF5A 1HUHA 4Q7VA 1DCBA 2IT4A 2FNMA 1EOUA 4Q87A 2EU3A 1TBTX 2HKKA 4JSWA 5E2MA 3HKTA 3V2MA 5DVXA 3FW3A 3SAPA 3HS4A 4KAPA 3B1BA 1CRAA 4CNRA 4LP6A 3RYZA 5DRSA 5G03A 5AMLA 3T85A 1LG6A 4WL4A 2VVBX 1CVCA 3U47A 2POWA 4KNIA 4Z1NA 1BCDA 5G0CA 4WUQA 3KOIA 3OKVA 1G4OA 3NI5A 4Q99A 4RH2A 2CBCA 3MYQA 4ZX0A 5FNIA 1JCZA 1CA3A 3U3AX 5EH5A 4KNJA 4LU3A 1JV0A 1BNMA 1CNXA 4HEZA 4M2VA 4KV0A 3RZ1B 2H4NA 5DSJA 1TH9A 2CBEA 5DSKA 1RZBA 2ILIA 5JG3B 3KS3A 5C8IA 3HKUA 3RZ8A 4Z1JA 1YDAA 3U7CA 1G48A 5BRUA 5JGSB 2VVAX 3M2ZA 4HBAA 3RLDA 3V2JA 4QK1A 2FNNA 7CA2A 4Q7SA 5JGTB 5EHWA 3ML5A 3BETA 3TMJA 1CAJA 1ZGEA 2CBAA 1CNJA 1TEUX 1CCSA 4Q0LA 4COQA 3HKNA 4QJOA 2NN7A 3MNHA 1BNVA 4ZWIA 3JXGA 3V3FA 1HCBA 1CIMA 1ZFQA 1T9NA 4WW8A 1CVFA 1CANA 1ZSAA 1TEQX 2H15A 3DVBA 4M2RA 3DCCA 4DZ9A 3JXFA 1BN1A 3HKQA 1G6VA 2NMXA 2WEGA 1CNBA 4X5SA 3V3HB 3T5ZA 2X7SA 3M04A 3MNIA 2CABA 4JSSA 3RYVB 3M2NA 1A42A 2Q1QA 1I91A 3S72B 4HT2A 2QOAA 4JS6A 4Q83A 2GD8A 1RZDA 4XIXA 2FMGA 5DSIA 3D92A 3M3XA 1G52A 4QTLA 1RAZA 4IDRX 1CAIA 1BN3A 4FVOA 4QIZA 5L3OA 4Q7WA 4QJXA 5L6KA 1CVBA 4YHAA 5FL5A 3KIGA 4E3DA 4CNWA 3M40A 4RIVA 2HOCA 3B4FA 3IBUA 3M14A 5EH7A 4KUWA 2CBDA 1THKA 1CNYA 4HEWA 3EFIA 4YVYA 4QSJA 1H9QA 3U45X 2HFWA 4Q07A 4Q08A 1G45A 2W2JA 5DSOA 3S77B 3ZNCA 3QYKA 5SZ4A 1H9NA 4LHIA 1YDBA 3S8XA 4YGJA 3MNKA 1UGAA 3F7UA 1I9QA 3EFTA 1RJ6A 1CNKA 5FNKA 3CAJA 4DZ7A 4E9OX 5FLOA 1HVAA 8CA2A 5FNHA 4ILXA 3F4XA 1TG9A 4QJMA 4QJPA 4RIUA 4YGLA 4HEYA 4TWMA 5AMDA 2WEOA 4Q8ZA 4M2WA 1CAHA 3P58A 5JEHB 2FW4A 4E3GA 5IPZA 1ZNCA 3R16A 1YDCA 3P3JA 4FL7A 4HT0A 3BL0A 5E28A 4MDGA 4N0XB 2NXSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E4A A;  3P5L A;  4YXO A;  1BNW A;  4Q81 A;  4ETQ C;  3T83 A;  1I9L A;  3CZV A;  5HPJ A;  3ML2 A;  2OSM A;  1BN4 A;  3HLJ A;  1CNH A;  1DCA A;  2QP6 A;  2WEJ A;  5BNL A;  1YO0 A;  3MHC A;  4QK3 A;  3OIL A;  4R5A A;  1XQ0 A;  3KON A;  3RZ0 B;  1KEQ A;  5BRV A;  6CA2 A;  1HEA A;  4ZWZ A;  1BNQ A;  1CA2 A;  5JEG B;  3N0N A;  4WW6 A;  5FNM A;  2NN1 A;  4PQ7 A;  1BZM A;  4K13 A;  3IEO A;  3P55 A;  3DD0 A;  3NJ9 A;  4Z1E A;  3GZ0 A;  4K1Q A;  3K2F A;  4RN4 A;  3TVN X;  5BRW A;  1KWR A;  1V9I C;  1YO1 A;  4L5U A;  1ZSB A;  5JEP B;  3S76 A;  1UGB A;  4ZAO A;  4QIY A;  1BNU A;  5DOG A;  3P44 A;  2WD2 A;  4XZ5 A;  1CAL A;  3K7K A;  3SAX A;  3D9Z A;  4G7A A;  1FQM A;  3M5T A;  5FLS A;  1YDD A;  1CRM A;  2EZ7 A;  3FFP X;  4KP5 A;  1G53 A;  1BV3 A;  1JD0 A;  3L14 A;  4KUV A;  2CBB A;  2FOQ A;  3FE4 A;  4FU5 A;  3DCW A;  1CVE A;  3T84 A;  4Q8X A;  4E3F A;  5BYI A;  3V3I B;  3DVD A;  3NB5 A;  4QSI A;  2NNO A;  3ZP9 A;  4JSZ A;  2HD6 A;  5FL6 A;  3T82 A;  1IF4 A;  4FRC A;  2Q38 A;  5DSR A;  3MNA A;  2X7T A; 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