5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
2CBAA 5FL5A 5FDIA 1F2WA 4QSAA 4KNIA 4MDGA 2NXRA 1UGBA 1H9QA 1OKLA 1YO2A 3P44A 3DVCA 1FSQA 2HD6A 5CACA 3OIMA 4KUWA 7CA2A 3M2NA 3ZNCA 2FW4A 4MLXA 3OYQA 3V3IB 5EH5A 4LP6A 5JEPB 3TVNX 2AW1A 5L6KA 3MWOA 3OYSA 2FMGA 3RZ5A 2POVA 1AZMA 2VVAX 4DZ7A 4Q49A 1CAJA 1KWQA 4ZAOA 4ZX0A 4G7AA 3W6IA 3PJJA 5E2SA 4MO8A 1MOOA 2WEJA 1CA2A 2X7UA 4KP5A 3S77B 4L5UA 1YDAA 1LG5A 1BNWA 3K34A 2FMZA 4CNXA 4QJOA 2NWZA 2OSMA 3M5TA 3M04A 4L5VA 4QIYA 3U7CA 3EFTA 2F14A 3DD8A 3HS4A 4X5SA 3F4XA 5SZ3A 1ZSAA 3CYUA 3FW3A 3F7BA 1LGDA 4QSJA 5FNHA 1LUGA 3KS3A 3BL1A 1FR4A 4Q7SA 4KUYA 5SZ7A 1CVFA 1DCBA 1JV0A 4YYTA 4XE1A 2WEGA 4KNMA 5E5UA 1G3ZA 3QYKA 5SZ2A 5AMGA 2CBDA 1UGCA 1CCTA 1YDDA 2NNOA 4HEYA 5FNGA 1G1DA 1IF8A 1HEBA 1CRMA 2QP6A 5L3OA 4QJWA 4WUPA 5E5RA 4E3DA 4HBAA 1CA3A 1KOPA 1ZFKA 4ETQC 1DCAA 3BL0A 1G4JA 3D0NA 4HF3A 4N16A 3S73B 1RZCA 2CA2A 2Q1QA 3IEOA 3M2YA 1RJ5A 4KUVA 2WD3A 1Z97A 3M14A 2FOYA 3DD0A 2ABEA 4YGJA 1G48A 4RFDA 3MZCA 1BNNA 5LMDA 3UYNA 4ZWZA 1XQ0A 4MLTA 1BNMA 4XIWA 1DMYA 5FL4A 4YGKA 3B4FA 1G0FA 1A42A 1CNKA 3V5GA 1CNCA 1CNGA 3P58A 3RYXB 3TVOX 5C8IA 2H4NA 4R5BA 4RUYA 3SAXA 5A25A 1I90A 1CNBA 4QTLA 4CNWA 1IF7A 4FVNA 1OQ5A 5FLQA 1ZGEA 5EZTX 4UOVA 5FLRA 5JGTB 1IF4A 1UGGA 2FOUA 2OSFA 3RYVB 3T84A 3MNIA 3K2FA 1CNYA 5FNJA 4WUQA 1CNJA 1DMXA 4PQ7A 4Q99A 1CAYA 1G54A 3N3JA 3M1WA 3P55A 5G01A 4Q6EA 1JCZA 4TWMA 1I8ZA 3PO6A 1TEUX 5JG3B 1CALA 4Q0LA 1TH9A 1UGFA 3DCWA 3DV7A 1CVDA 3MNJA 1LG6A 3RJ7A 4QJPA 4YVYA 3IBUA 4Q06A 1XEGA 4XIXA 2EU2A 2NNGA 3T5ZA 1CAOA 4E4AA 1ZH9A 3GZ0A 1CANA 3R17B 4K0ZA 4QK3A 2CBEA 3DA2A 1BNQA 1H9NA 1Y7WA 3IBIA 5DSKA 4YX4A 5JEGB 5DOHA 5CJFA 1UGEA 4IWZA 4G0CA 5JESB 4HT0A 2AX2A 2NWYA 4COQA 2FNNA 3V3FA 1UGAA 5G0CA 5FLTA 2NXSA 4ZWXA 2O4ZA 3V2JA 5JEHB 4Q08A 1YO1A 4QJ0A 4HEWA 1BN3A 12CAA 3ML2A 3TMJA 3DC3A 4ZWYA 1BN1A 1TB0X 3P5LA 2VVBX 4FPTA 3RZ8A 1UGDA 4RUZA 5SZ5A 1I9PA 2GD8A 4WL4A 3D9ZA 1KWRA 4WW8A 4JSZA 5DSOA 2NNVA 1CILA 2GEHA 3D92A 1G53A 4L5WA 5DSNA 4Q8XA 1ZSCA 3DC9A 1CVHA 1H4NA 3RYZA 1HUHA 4WW6A 3IGPA 3SAPA 1RAZA 3M2ZA 3P3JA 1TTMA 3N4BA 3OKUA 2NMXA 3UYQA 3MHMA 4C3TA 4QEFA 3R16A 1V9EA 2ILIA 4Q07A 4QJXA 1HEDA 3HKTA 2WD2A 4M2UA 3U45X 1CIMA 3M1KA 5JQ0A 3K7KA 4E3GA 4R59A 4RFCA 1I91A 5E28A 1CZMA 5SZ6A 3ML5A 3V3GB 2Q38A 1I9MA 3V3HB 1ZFQA 3L14A 4Q6DA 4TWLA 4YWPA 5FNMA 4Q83A 3JXFA 2FOVA 5JG5B 1Z93A 1IF9A 4PXXA 1XEVA 1THKA 5DSQA 2FOSA 4E3HA 2W2JA 4KP8A 4ITPA 5AMLA 5EIJA 4K0TA 1MUAA 1CNHA 4FU5A 3CA2A 4WR7A 1FQLA 4JSAA 5AMDA 4Q8YA 3DVDA 1I9LA 4GL1X 5E2MA 4E5QA 4RN4A 4XFWA 4Q9YA 4PYXA 4QIZA 3RLDA 1CVCA 3NB5A 4PZHA 2HKKA 4Q87A 1ZGFA 1YO0A 2POWA 3DAZA 1KOQA 4JSSA 1CNWA 2CBCA 3OY0A 4JSWA 4Z1NA 4MDLA 5SZ0A 5BRUA 4R5AA 4PYYA 3P4VA 5DVXA 2QOAA 3KOIA 3FFPX 4M2WA 3S71B 3OIKA 4CNVA 5BYIA 4K0SA 3KONA 1CNXA 1TG3A 3KKXA 3DCSA 3T83A 1CCSA 3MHOA 5J8ZA 4M2VA 4RIVA 1HCAA 2HOCA 1BNVA 3EFIA 1KEQA 2WEHA 4CACA 2FNMA 3T85A 3KLDB 3PYKA 1CAKA 2ZNCA 3N2PA 4Q7PA 5CA2A 1BCDA 2NWPA 5E2NA 5EKHA 1AM6A 5JGSB 3S9TA 4K13A 3RG3A 4K1QA 4CA2A 1CAZA 3S97A 4JS6A 3M67A 4LHIA 5E2KA 3RZ1B 2X7TA 3MHCA 5DRSA 1FR7A 1BZMA 4CNRA 3HKNA 5G0BA 5FLPA 5JDVB 3ZP9A 1OKNA 4Q81A 2X7SA 3M96A 3FE4A 4FRCA 1HUGA 2QO8A 5EKJA 1G4OA 1CAIA 3LXEA 5FLSA 4QSBA 1G6VA 1FSNA 1ZE8A 2H15A 2IT4A 3KOKA 2Q1BA 3D93A 4YGLA 4KNJA 4Z1JA 2POUA 5FL6A 4YGNA 3M5EA 4ZX1A 3C7PA 5EHVA 1RJ6A 3RG4A 2EZ7A 4Y0JA 9CA2A 3RZ7A 4Q8ZA 1BNTA 4N0XB 4BCWA 5FNLA 1CVAA 4YGFA 1Z9YA 5CLUA 3S72B 1HVAA 1TEQX 1I9QA 5SZ1A 2EU3A 4DZ9A 3DBUA 1G46A 4Q7VA 4HEZA 3MHLA 3M1JA 4MTYA 3S8XA 1BNUA 3MDZA 5EKMA 5E2RA 1LZVA 3HKUA 5DSPA 3CZVA 5SZ4A 1FSRA 3OKVA 2FNKA 2HFWA 4MDMA 2CBBA 5DSRA 5BNLA 1TE3X 4Q90A 6CA2A 4RUXA 3IBNA 3MNAA 4QSIA 4YHAA 3W6HA 3RGEA 5DSMA 4IDRX 3U3AX 1G45A 1IF6A 5DSIA 1BN4A 1ZSBA 5JQTA 3F7UA 1G0EA 4FL7A 5DOGA 3M40A 1CINA 3VBDA 1OKMA 5EHEA 1HCBA 3IAIA 4HT2A 3S75B 1CCUA 3M2XA 1J9WA 3RYYA 1I9OA 4QK1A 4Z1EA 3M3XA 4Z0QA 4HU1A 1CNIA 5FDCA 5FNKA 3SBIA 1AVNA 2NWOA 3S78B 4XZ5A 1HEAA 4RIUA 4FIKA 3MMFA 1G52A 3M1QA 4YXIA 3KNEA 1IF5A 3DCCA 3MNHA 2NNSA 3P3HA 1YDCA 8CA2A 4LU3A 3T82A 3V2MA 1FQNA 3MHIA 1FQRA 4KNNA 3V7XA 1TG9A 4BF1A 3KIGA 4Z1KA 1ZNCA 5IPZA 5DSLA 5HPJA 4E3FA 5BRVA 2NN1A 5EH7A 3SBHA 5BRWA 2NN7A 3M98A 4ILXA 3D8WA 1CVBA 1CRAA 3U47A 5EOIA 5FNIA 1XPZA 4E9OX 3IBLA 1HECA 5DSJA 5EHWA 2NXTA 4KAPA 3JXHC 3RZ0B 3BETA 1BICA 3CAJA 1RZAA 3KWAA 4QY3A 1CVEA 1FLJA 1JD0A 4RH2A 1RZBA 1FQMA 3JXGA 4YXOA 1YDBA 1BV3A 1TBTX 4CQ0A 1V9IC 5EH8A 3NI5A 3MNUA 3P5AA 1CAMA 4BF6A 1EOUA 2FOQA 3DVBA 3NJ9A 2HL4A 4QJMA 1RZDA 3T5UA 5FLOA 3MNKA 4KV0A 5G03A 1T9NA 3HLJA 3Q31A 1RAYA 4ITOA 4Q09A 4FVOA 2CABA 3M5SA 4QK2A 5A6HA 3HKQA 3RYJB 3MYQA 3S74B 4E49A 3S76A 4Q7WA 4M2RA 4ZWIA 3F8EA 3N0NA 3V3JA 2WEOA 1RZEA 4Q78A 3B1BA 4YXUA 1URTA 3HFPA 2HNCA 1I9NA 3OILA 1CAHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CBA A;  5FL5 A;  5FDI A;  1F2W A;  4QSA A;  4KNI A;  4MDG A;  2NXR A;  1UGB A;  1H9Q A;  1OKL A;  1YO2 A;  3P44 A;  3DVC A;  1FSQ A;  2HD6 A;  5CAC A;  3OIM A;  4KUW A;  7CA2 A;  3M2N A;  3ZNC A;  2FW4 A;  4MLX A;  3OYQ A;  3V3I B;  5EH5 A;  4LP6 A;  5JEP B;  3TVN X;  2AW1 A;  5L6K A;  3MWO A;  3OYS A;  2FMG A;  3RZ5 A;  2POV A;  1AZM A;  2VVA X;  4DZ7 A;  4Q49 A;  1CAJ A;  1KWQ A;  4ZAO A;  4ZX0 A;  4G7A A;  3W6I A;  3PJJ A;  5E2S A;  4MO8 A;  1MOO A;  2WEJ A;  1CA2 A;  2X7U A;  4KP5 A;  3S77 B;  4L5U A;  1YDA A;  1LG5 A;  1BNW A;  3K34 A;  2FMZ A;  4CNX A;  4QJO A;  2NWZ A;  2OSM A;  3M5T A;  3M04 A;  4L5V A;  4QIY A;  3U7C A;  3EFT A;  2F14 A;  3DD8 A;  3HS4 A;  4X5S A;  3F4X A;  5SZ3 A;  1ZSA A;  3CYU A;  3FW3 A;  3F7B A;  1LGD A;  4QSJ A;  5FNH A;  1LUG A;  3KS3 A;  3BL1 A;  1FR4 A;  4Q7S A;  4KUY A;  5SZ7 A;  1CVF A;  1DCB A;  1JV0 A;  4YYT A;  4XE1 A;  2WEG A;  4KNM A;  5E5U A;  1G3Z A;  3QYK A;  5SZ2 A;  5AMG A;  2CBD A;  1UGC A;  1CCT A;  1YDD A;  2NNO A;  4HEY A;  5FNG A;  1G1D A; 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