5E2NA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 3-(cyclooctylamino)-2,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)sulfonyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5e2nA00
1CAOA 4ZWIA 3RZ8A 1CAIA 4QIZA 1CNWA 4JSZA 6CA2A 1CRMA 1RAYA 1CNHA 5A6HA 1CALA 1HECA 5L6KA 1G52A 4KAPA 3TMJA 4E49A 4DZ7A 3CAJA 2NXSA 4Q6EA 1UGGA 4QSJA 1JCZA 1ZSAA 2EZ7A 4QIYA 3TVNX 5FLRA 3UYNA 4MDGA 5CA2A 4MLTA 1G0FA 4KP8A 5SZ1A 5EKJA 3HS4A 1XQ0A 3RLDA 5C8IA 2X7UA 4MO8A 5FNHA 1HUHA 1ZSBA 1G4JA 2HFWA 4COQA 3P58A 1CANA 3BL1A 4ZWYA 1HEBA 3IBUA 1CCUA 3JXFA 1V9EA 5EKMA 5DVXA 3RYVB 1LG6A 4Q81A 3DVCA 3B1BA 4MLXA 5DSPA 3RZ5A 3V3IB 3D0NA 3EFIA 1I9NA 1CAYA 1RZDA 2ILIA 3CZVA 4KNMA 3ML2A 3IBLA 3V2JA 4N0XB 4E3GA 3OIKA 2QO8A 1ZE8A 4G7AA 2Q38A 4K0TA 2NXTA 1IF4A 3DC9A 4M2WA 3P4VA 3V7XA 3PYKA 5CLUA 2CBDA 3KLDB 4RUXA 4RUZA 4Z1EA 1YDCA 3D9ZA 5JEHB 1CVBA 3N2PA 5E5RA 1YO1A 1BNNA 2OSMA 2ABEA 4QJXA 5DSQA 3MHLA 3NI5A 5CACA 3VBDA 4Q07A 3IGPA 3T85A 2FNKA 4YHAA 1FQMA 4YXIA 4R59A 3SAXA 3DD0A 2FNNA 5E5UA 5BRVA 2FMGA 3JXGA 3OYQA 1XEGA 3M5TA 4K0ZA 3ML5A 3F8EA 5EZTX 2NNSA 5DSKA 1EOUA 3MMFA 3M14A 1F2WA 4Q6DA 3T84A 2FOUA 4TWMA 4R5BA 3S72B 3KNEA 4Q7PA 4QSIA 2HD6A 2NNGA 3M04A 3K7KA 2CBAA 2GEHA 3SAPA 4YGLA 8CA2A 4K1QA 5JG5B 1KWQA 5G0BA 1CVFA 4YX4A 4L5WA 4LU3A 3M5SA 5FLSA 3ZNCA 1DCAA 1FSQA 4KUYA 1HCBA 3RZ7A 4CNRA 1CVDA 3KOIA 4CNWA 3KOKA 4ITOA 4BCWA 1HCAA 3OYSA 4Q99A 1CVAA 1A42A 3MNHA 1TTMA 5FLTA 2X7TA 3CYUA 5EH7A 3IEOA 2NNOA 4Q8ZA 5BRWA 5FNLA 5JGSB 3Q31A 3FW3A 3N4BA 1BNMA 4YVYA 5EKHA 4KUVA 3L14A 3V3FA 1YO0A 3BETA 5JESB 1CNIA 1G54A 3EFTA 1UGAA 2HL4A 2WEJA 5EH8A 2ZNCA 1FSRA 4E5QA 4LHIA 1FR4A 3S74B 3RYYA 5IPZA 3S73B 3HKQA 3RYZA 2POVA 5E2MA 4ZX0A 4PYYA 4KNJA 4LP6A 4RUYA 2POWA 3F4XA 4N16A 1RJ5A 2VVAX 1RAZA 4Q9YA 4QY3A 9CA2A 3KIGA 4XIWA 4PZHA 4HU1A 1I9LA 4MDMA 5FLPA 3T5UA 3KWAA 3MHMA 3S97A 2FOYA 1BNUA 1KEQA 1YDBA 3DA2A 5BNLA 1MOOA 3F7BA 2NWYA 1XPZA 5EHVA 2CBCA 1BNTA 3HLJA 4E9OX 5EIJA 1FSNA 1UGCA 1FQLA 4Q83A 4QJMA 5DSRA 1ZSCA 3KKXA 5JGTB 4QK1A 3UYQA 4JSSA 1HEDA 1FQRA 3MNIA 1IF9A 4Z1KA 3M67A 1G6VA 5DSLA 1TE3X 1CCSA 3M40A 4CA2A 5SZ5A 5DSJA 2AX2A 3RJ7A 4XIXA 4HT2A 1CVEA 1G3ZA 3S75B 1JD0A 4YXUA 2Q1QA 4YYTA 4HBAA 1YDDA 1THKA 1IF5A 5BRUA 3M98A 1CNBA 3MNJA 3DBUA 4Z0QA 3HKTA 1CAZA 1CAHA 4QJOA 4RFDA 1I9QA 5SZ2A 3RYJB 3MHCA 1TEUX 1AVNA 3M2XA 3DAZA 3LXEA 4Q7VA 4BF6A 2GD8A 1CCTA 5DRSA 4YGJA 1CNJA 3HKUA 1TH9A 1G46A 5JEPB 3MNUA 3U47A 5DSOA 3U45X 1DMXA 1LZVA 2CABA 5SZ6A 1CA3A 3OILA 4UOVA 3T83A 1TB0X 1JV0A 4Q90A 4CQ0A 3M2NA 3M3XA 4Q7SA 2H4NA 3IBIA 4Q87A 4WR7A 5FNGA 3DCCA 1UGEA 4HEWA 1OKMA 4E4AA 1LUGA 1RZAA 5JDVB 3B4FA 1YDAA 1ZFKA 1AM6A 3M1KA 4Y0JA 3F7UA 2POUA 4KNNA 2FOVA 1AZMA 3MHIA 5E2NA 4QSBA 1CAMA 1RZBA 3DV7A 4QJPA 5AMLA 1IF7A 3U7CA 2X7SA 1Z9YA 3TVOX 3PJJA 5G0CA 4M2VA 4BF1A 3M2ZA 4E3FA 2VVBX 3BL0A 5DSMA 1XEVA 2WD3A 2NMXA 5FL4A 2F14A 5DOGA 3S8XA 1TG3A 3DVBA 3NB5A 1CINA 2Q1BA 4JS6A 1OKLA 1G0EA 5E28A 4Q8YA 1H9QA 5FNKA 4ETQC 5A25A 4FIKA 3D92A 3U3AX 3V3GB 2HKKA 3OKUA 5E2SA 5FDCA 1LGDA 2H15A 3DCSA 1BICA 1BN4A 4MTYA 1DCBA 2IT4A 3IBNA 2HOCA 4QJ0A 3P3HA 2WEOA 4K13A 2WEGA 3MZCA 3M1JA 1I8ZA 5E2RA 5FL5A 3OIMA 4QK2A 1T9NA 5AMGA 3V2MA 1BN1A 4FPTA 5SZ0A 4RN4A 3MWOA 3DVDA 4FU5A 2NNVA 2WEHA 3MYQA 4FVOA 7CA2A 3C7PA 4XZ5A 3DC3A 1CNKA 3K34A 1Z97A 1TBTX 4DZ9A 1DMYA 1G4OA 5J8ZA 3N0NA 12CAA 4PQ7A 1CNCA 4WUPA 4HF3A 3QYKA 3M2YA 4PYXA 4X5SA 4YGKA 1G1DA 4Q0LA 3OY0A 5EH5A 2FOQA 4M2RA 4L5UA 3V5GA 4WW6A 3SBHA 1ZH9A 1CNXA 4QTLA 4Z1JA 4IWZA 5FNMA 5DSIA 3HFPA 2NN7A 1BNQA 1CA2A 1Y7WA 1UGFA 1CVHA 4CNVA 4JSWA 1BCDA 1BZMA 1CAKA 4Q78A 1FQNA 4KV0A 1BNWA 1KWRA 3T5ZA 4QJWA 2WD2A 3S76A 4Q8XA 5EOIA 2FOSA 4Q06A 1RZCA 1CZMA 2CA2A 4C3TA 1BN3A 5JQ0A 4R5AA 1OQ5A 1KOPA 2FMZA 3DD8A 4HT0A 3OKVA 5JQTA 4M2UA 4KP5A 3M96A 4ZWXA 4YXOA 3DCWA 1V9IC 2CBBA 3T82A 3M5EA 1TG9A 3HKNA 3ZP9A 5AMDA 1J9WA 1CVCA 4QK3A 4XFWA 2EU2A 4YGFA 1ZNCA 5E2KA 4HEYA 4WL4A 1I9OA 3SBIA 2AW1A 4Z1NA 4ILXA 5G01A 3NJ9A 2EU3A 3RZ0B 4RFCA 5L3OA 3FFPX 4RIVA 5FNJA 3P55A 3RYXB 4E3HA 1RJ6A 3S78B 1ZGFA 4XE1A 5SZ3A 3M1QA 5CJFA 3MNAA 3RZ1B 2W2JA 1UGDA 4KUWA 3V3JA 5EHEA 4K0SA 3K2FA 1FLJA 1BV3A 1G53A 4YWPA 4GL1X 4ITPA 3CA2A 2NWOA 1RZEA 3D8WA 4PXXA 2QP6A 3M1WA 3PO6A 1Z93A 3S77B 1ZFQA 3MHOA 4RH2A 1I90A 5SZ4A 1LG5A 1TEQX 4L5VA 4CNXA 4MDLA 5FL6A 5FNIA 4Q08A 1KOQA 1IF6A 4HEZA 4ZWZA 2HNCA 4TWLA 1ZGEA 2FW4A 3P3JA 5EHWA 3MDZA 3RG4A 4E3DA 3KONA 2CBEA 4FL7A 2NWPA 1G48A 4FVNA 1CNYA 4YGNA 5HPJA 1URTA 3MNKA 4IDRX 3IAIA 1MUAA 4QEFA 2NWZA 3N3JA 4Q49A 3FE4A 4Q09A 1CNGA 1CILA 4G0CA 5JEGB 1HEAA 2FNMA 1UGBA 3P44A 3R16A 3JXHC 4Q7WA 4FRCA 1YO2A 1H4NA 5JG3B 2QOAA 1FR7A 3RG3A 5G03A 1I91A 1CAJA 1G45A 1H9NA 4WUQA 1IF8A 2OSFA 3P5AA 3V3HB 3W6IA 1I9MA 4JSAA 3RGEA 1HVAA 5DOHA 3KS3A 4QSAA 2NN1A 5SZ7A 3S71B 5DSNA 3P5LA 3D93A 1OKNA 5BYIA 4WW8A 4KNIA 4CACA 3S9TA 4RIUA 5FDIA 5FLQA 1CRAA 2NXRA 5LMDA 2O4ZA 1I9PA 1BNVA 1HUGA 5FLOA 3GZ0A 3R17B 4ZAOA 4ZX1A 3W6HA 1CIMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CAO A;  4ZWI A;  3RZ8 A;  1CAI A;  4QIZ A;  1CNW A;  4JSZ A;  6CA2 A;  1CRM A;  1RAY A;  1CNH A;  5A6H A;  1CAL A;  1HEC A;  5L6K A;  1G52 A;  4KAP A;  3TMJ A;  4E49 A;  4DZ7 A;  3CAJ A;  2NXS A;  4Q6E A;  1UGG A;  4QSJ A;  1JCZ A;  1ZSA A;  2EZ7 A;  4QIY A;  3TVN X;  5FLR A;  3UYN A;  4MDG A;  5CA2 A;  4MLT A;  1G0F A;  4KP8 A;  5SZ1 A;  5EKJ A;  3HS4 A;  1XQ0 A;  3RLD A;  5C8I A;  2X7U A;  4MO8 A;  5FNH A;  1HUH A;  1ZSB A;  1G4J A;  2HFW A;  4COQ A;  3P58 A;  1CAN A;  3BL1 A;  4ZWY A;  1HEB A;  3IBU A;  1CCU A;  3JXF A;  1V9E A;  5EKM A;  5DVX A;  3RYV B;  1LG6 A;  4Q81 A;  3DVC A;  3B1B A;  4MLX A;  5DSP A;  3RZ5 A;  3V3I B;  3D0N A;  3EFI A;  1I9N A;  1CAY A;  1RZD A;  2ILI A;  3CZV A;  4KNM A;  3ML2 A;  3IBL A;  3V2J A;  4N0X B;  4E3G A;  3OIK A;  2QO8 A;  1ZE8 A;  4G7A A;  2Q38 A;  4K0T A;  2NXT A;  1IF4 A;  3DC9 A;  4M2W A;  3P4V A;  3V7X A;  3PYK A;  5CLU A;  2CBD A;  3KLD B;  4RUX A;  4RUZ A;  4Z1E A;  1YDC A;  3D9Z A;  5JEH B;  1CVB A;  3N2P A;  5E5R A;  1YO1 A;  1BNN A;  2OSM A; 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