5FDIA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii with the anticonvulsant sulfamide jnj-26990990 and its s,s-dioxide analog.
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title The anticonvulsant sulfamide JNJ-26990990 and its S,S-dioxide analog strongly inhibit carbonic anhydrases: solution and X-ray crystallographic studies.
pubmed doi rcsb
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fdiA00
5JQ0A 4ETQC 4WW6A 4Z0QA 4MDGA 5AMDA 1LG6A 4FIKA 4KNJA 1TG3A 4KNMA 2Q38A 5G0CA 4DZ9A 2NNVA 3M98A 4FPTA 3S72B 3M67A 7CA2A 3KNEA 3F7BA 5L3OA 3TMJA 2CBCA 5JGTB 1TBTX 9CA2A 2ILIA 4Q06A 2QP6A 4HEWA 1FQLA 1CNIA 4QJOA 5DSRA 2POWA 1HCBA 2HFWA 3QYKA 4CNXA 1I8ZA 2Q1QA 4QJPA 4Q7PA 1ZSBA 4ZWZA 5SZ7A 4LU3A 4Q9YA 2HNCA 4Q6DA 1BNVA 1ZGFA 4Q49A 5G0BA 4Q99A 1G52A 1FSNA 3U7CA 3T85A 5A25A 4QK3A 3DD8A 5JG3B 1OKNA 1ZSCA 3UYQA 3M2YA 1UGGA 5G01A 2FMZA 1CAMA 1IF6A 2FOSA 3JXFA 4K13A 3MNIA 1BCDA 1I9LA 2FW4A 5CACA 3UYNA 2FNMA 4QSAA 1CA2A 4YGFA 5JESB 1TH9A 4MDLA 3NB5A 1RZEA 3V3GB 5FNGA 2X7UA 1CNJA 3RYXB 3V3IB 2OSFA 5BYIA 4CNRA 3B4FA 1J9WA 4HF3A 1BNTA 1FSQA 3D9ZA 4HBAA 4Q07A 1AVNA 1CAHA 1LGDA 5FNKA 4Q78A 3SBHA 4Q8YA 1HUGA 2FOVA 1EOUA 3IBLA 3S8XA 1CVEA 1JV0A 5E5RA 1I9MA 4KUVA 3V3JA 3BETA 3RG3A 3MHLA 4QK2A 5EHWA 2QO8A 1ZE8A 1LUGA 1OQ5A 3V5GA 1G6VA 3OY0A 2GEHA 4L5UA 1CVAA 3TVOX 1LZVA 1RAYA 1KEQA 3P44A 3HKNA 3MNHA 3RG4A 4PYYA 1THKA 1TG9A 1CANA 3K2FA 4RUXA 5JDVB 4JS6A 2EU3A 1CNHA 12CAA 1CCSA 5IPZA 1RZCA 2NXSA 4C3TA 2CBAA 4RIUA 2CBEA 1Z9YA 5FNJA 5CJFA 3M5EA 2HKKA 2HD6A 4FRCA 3NI5A 4TWMA 1IF8A 4WL4A 3KOIA 3V3FA 1G48A 1HCAA 5BRWA 2GD8A 1CAIA 1Z93A 3M04A 3MHOA 4KP5A 5EKJA 1T9NA 3M1QA 4YXOA 3C7PA 1ZH9A 3HKTA 4YHAA 4JSSA 3DC3A 4TWLA 4K0SA 4RH2A 4Z1EA 1CCUA 4PQ7A 2VVBX 3KOKA 1HECA 3DAZA 5SZ6A 1CAJA 3MDZA 3T84A 2NNOA 1XQ0A 1UGCA 2WD2A 1KWRA 1URTA 4QJMA 4QJXA 1I9QA 3U3AX 3HKQA 1I9OA 3SBIA 3DVDA 1BNNA 5FLQA 4QJWA 5EHVA 1TE3X 1YO2A 1BNMA 3MHMA 4QIZA 3BL1A 5SZ2A 2NN7A 3GZ0A 2OSMA 3S78B 3NJ9A 2IT4A 3P5LA 3M2NA 5EH5A 2NXTA 1JD0A 1Y7WA 4Z1KA 5JG5B 1CAOA 2WD3A 1YDCA 3DCWA 4IWZA 3HLJA 3M1JA 1BN1A 4QK1A 4YGJA 4Q09A 3M5SA 4ZWXA 3MNKA 4KP8A 1IF9A 2CABA 3ZNCA 1YO0A 3Q31A 5BNLA 2H15A 5JQTA 4M2WA 4Q8ZA 3B1BA 3MNJA 3JXHC 4XE1A 5AMLA 3RYVB 4BF6A 2H4NA 1CAYA 2CBBA 2WEJA 3EFTA 4XFWA 3TVNX 3P58A 3RGEA 3MNAA 1AM6A 1CNGA 3KONA 4WUQA 1V9IC 4E3DA 1ZGEA 1CNXA 1ZFQA 4FU5A 5SZ4A 3RLDA 3PO6A 3K34A 1BICA 3S74B 4JSZA 1FR4A 3HFPA 5G03A 5DSQA 4E9OX 3OILA 4UOVA 3ML2A 4WW8A 3IGPA 4MLTA 4MTYA 1UGBA 3S75B 5FNMA 5FLPA 4COQA 1FQRA 2HOCA 1G46A 4BCWA 1G4OA 1CVDA 1KWQA 3BL0A 1G3ZA 5FLTA 5E2KA 5JEPB 4ILXA 1CZMA 1UGEA 4FVNA 1CALA 2POVA 4QSBA 1MOOA 1H9NA 3P3JA 1CNYA 5EH7A 3S9TA 4ITOA 1JCZA 3D93A 3M96A 4PXXA 5DVXA 5JGSB 3R17B 4XZ5A 5E2NA 2CBDA 3P3HA 1XEVA 5SZ0A 3S71B 5FDIA 1AZMA 2POUA 4KAPA 1YO1A 1XEGA 3D0NA 1DCBA 3K7KA 3EFIA 2NMXA 1I90A 4DZ7A 1CAKA 1CILA 4M2RA 5E28A 3RZ8A 4MLXA 4IDRX 1XPZA 5L6KA 1TEQX 4FL7A 1CINA 5FNIA 5E2MA 4HU1A 3RYZA 3M14A 1BN3A 3ML5A 3MNUA 5SZ3A 3FW3A 1UGAA 4YGKA 1I9NA 3N4BA 1CRMA 2HL4A 1CNWA 4K0TA 4CQ0A 5HPJA 1UGDA 5EH8A 4M2UA 5FNLA 1HEAA 1G53A 1YDBA 6CA2A 3IBNA 4ZWYA 2EU2A 4XIXA 1FSRA 3OYQA 3S76A 3S73B 5SZ5A 2VVAX 2AX2A 3KIGA 4FVOA 4YX4A 5EHEA 1CNCA 1H4NA 3W6HA 3JXGA 1I9PA 3FFPX 4K1QA 1F2WA 3V3HB 3M5TA 2WEHA 3DV7A 3MMFA 4G0CA 3MZCA 4KNNA 3RZ0B 3MYQA 3F4XA 1CVBA 3OIKA 5EKMA 1OKMA 4JSAA 2O4ZA 3SAPA 3OKUA 3F7UA 1CAZA 4QTLA 5EIJA 5DSMA 4CNWA 2QOAA 3KKXA 5BRVA 3RYYA 1ZFKA 3IBIA 3P4VA 4Q83A 4KUWA 1CA3A 2NWOA 3IBUA 5FNHA 4YGLA 3DBUA 1OKLA 5DSLA 4RFCA 3ZP9A 4L5VA 4QEFA 4HT2A 1FQNA 3S77B 3KS3A 4N16A 2NWYA 4Q7VA 8CA2A 1RZDA 4JSWA 4YXUA 2W2JA 1IF4A 5DOGA 4E3HA 3D8WA 5FDCA 3LXEA 1HEDA 4Q81A 3CZVA 1HUHA 4Q0LA 5C8IA 4Z1JA 4QSIA 5J8ZA 2ABEA 4HT0A 4KUYA 5FLSA 3MHCA 5FLOA 1RJ5A 3PYKA 1CNKA 3M1WA 1BN4A 4PZHA 5CLUA 4E3GA 5SZ1A 5A6HA 3SAXA 3RZ1B 2ZNCA 4ITPA 3DCSA 3M3XA 4BF1A 4Q7WA 1G0FA 1LG5A 1FR7A 4CNVA 3PJJA 4YXIA 4N0XB 3RJ7A 4YWPA 1KOPA 1MUAA 4RN4A 2FNKA 3OKVA 1IF5A 5E2SA 4MDMA 3IEOA 1CIMA 1TTMA 3HKUA 3N3JA 5LMDA 3CAJA 1CVCA 4CACA 3M2ZA 3DVBA 5FL6A 4Y0JA 1ZSAA 4LHIA 4Q6EA 1G45A 3VBDA 5EKHA 1FLJA 1UGFA 1CVFA 4QJ0A 4G7AA 4E49A 4ZAOA 1DMYA 2CA2A 1BNQA 2Q1BA 5FL4A 1G1DA 4RIVA 2WEGA 4WUPA 1BZMA 1G4JA 3DD0A 2FOQA 3DA2A 4Q08A 1HEBA 4GL1X 1YDDA 4ZWIA 3M1KA 3CA2A 2NN1A 4YYTA 1CCTA 3M40A 3N0NA 3V2JA 4E4AA 1RAZA 1Z97A 3D92A 1DCAA 2FMGA 5E5UA 3U45X 5DSNA 5E2RA 5BRUA 1RZAA 3RYJB 3RZ7A 4L5WA 4QY3A 3M2XA 5DOHA 4E3FA 3V2MA 3OIMA 3L14A 1BNWA 3RZ5A 1CVHA 4Q87A 2FOYA 3MHIA 4Z1NA 1V9EA 3KLDB 3HS4A 3T82A 4RUZA 1A42A 3S97A 1RJ6A 5FLRA 4ZX1A 3DC9A 4PYXA 3R16A 3FE4A 1DMXA 4RFDA 5CA2A 2AW1A 2NWPA 4LP6A 4R5BA 4Q8XA 1CNBA 3T83A 3CYUA 3P55A 4K0ZA 2NXRA 3V7XA 1RZBA 1FQMA 3W6IA 1ZNCA 3IAIA 4QIYA 1TB0X 1BNUA 4RUYA 1BV3A 1TEUX 4ZX0A 4YGNA 1H9QA 3OYSA 4QSJA 3F8EA 3N2PA 3P5AA 4Q7SA 5DSIA 3U47A 2FOUA 2EZ7A 4HEZA 1G0EA 1IF7A 2NNSA 4M2VA 4Q90A 4E5QA 3T5UA 5DSOA 3KWAA 4KNIA 4R5AA 4XIWA 2NNGA 3MWOA 5DRSA 1YDAA 4CA2A 1KOQA 5EOIA 1CRAA 3DCCA 1G54A 5DSKA 1I91A 4HEYA 4R59A 5JEGB 2FNNA 2X7SA 3T5ZA 2WEOA 5DSJA 5JEHB 4YVYA 5FL5A 5DSPA 4WR7A 5EZTX 2NWZA 4X5SA 2X7TA 2F14A 1HVAA 5AMGA 3DVCA 4KV0A 4MO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5JQ0 A;  4ETQ C;  4WW6 A;  4Z0Q A;  4MDG A;  5AMD A;  1LG6 A;  4FIK A;  4KNJ A;  1TG3 A;  4KNM A;  2Q38 A;  5G0C A;  4DZ9 A;  2NNV A;  3M98 A;  4FPT A;  3S72 B;  3M67 A;  7CA2 A;  3KNE A;  3F7B A;  5L3O A;  3TMJ A;  2CBC A;  5JGT B;  1TBT X;  9CA2 A;  2ILI A;  4Q06 A;  2QP6 A;  4HEW A;  1FQL A;  1CNI A;  4QJO A;  5DSR A;  2POW A;  1HCB A;  2HFW A;  3QYK A;  4CNX A;  1I8Z A;  2Q1Q A;  4QJP A;  4Q7P A;  1ZSB A;  4ZWZ A;  5SZ7 A;  4LU3 A;  4Q9Y A;  2HNC A;  4Q6D A;  1BNV A;  1ZGF A;  4Q49 A;  5G0B A;  4Q99 A;  1G52 A;  1FSN A;  3U7C A;  3T85 A;  5A25 A;  4QK3 A;  3DD8 A;  5JG3 B;  1OKN A;  1ZSC A;  3UYQ A;  3M2Y A;  1UGG A;  5G01 A;  2FMZ A;  1CAM A;  1IF6 A;  2FOS A;  3JXF A;  4K13 A;  3MNI A;  1BCD A;  1I9L A;  2FW4 A;  5CAC A;  3UYN A;  2FNM A;  4QSA A;  1CA2 A;  4YGF A;  5JES B;  1TH9 A;  4MDL A;  3NB5 A;  1RZE A;  3V3G B;  5FNG A;  2X7U A;  1CNJ A;  3RYX B;  3V3I B;  2OSF A;  5BYI A;  4CNR A;  3B4F A;  1J9W A;  4HF3 A;  1BNT A;  1FSQ A;  3D9Z A;  4HBA A;  4Q07 A;  1AVN A;  1CAH A;  1LGD A; 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