5FL6A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-(4-methylphenyl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2- sulfonamide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE IX
total genus 66
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl6A00
1ZSBA 3M2NA 4Q7PA 3HKUA 1OQ5A 4MTYA 4QJ0A 4KNJA 4LP6A 4YGFA 1MUAA 3PYKA 1CA2A 4Q8ZA 3W6HA 4Q7WA 1F2WA 5FNIA 5EH5A 1UGEA 4M2VA 3B1BA 1G45A 4HBAA 2FOUA 3KLDB 4COQA 2EU3A 1G0EA 1RZAA 1UGFA 4RIVA 4L5VA 3IEOA 2FNNA 3CYUA 3FFPX 3M14A 4MDGA 4DZ9A 1KEQA 3F7UA 1BN3A 1IF7A 3P58A 3T5ZA 1CIMA 4IWZA 3VBDA 2ZNCA 4RFCA 1CAKA 3DA2A 3S72B 4QY3A 1CAIA 4RN4A 1ZFQA 1FQMA 1YO2A 4CNVA 2ABEA 3DBUA 2EU2A 3S9TA 3M3XA 2NNSA 4Q90A 1V9IC 1G3ZA 1ZSCA 3BL1A 1TBTX 3DC9A 2NWPA 3N4BA 3MHIA 4E3DA 1ZE8A 1UGBA 2CBBA 4QK1A 3SAPA 1H4NA 3ML2A 1H9QA 3M40A 4XIWA 5EHEA 1CAOA 3S74B 3DD8A 1BNWA 1CILA 3D8WA 1YDAA 4YGNA 4MDLA 1BNMA 1LG5A 4KNIA 4Q6EA 5AMDA 3HFPA 1TEUX 3DD0A 5AMGA 1CCUA 5FL6A 1JV0A 1LUGA 5JGTB 4FVOA 1OKLA 5BRWA 5EHWA 1BCDA 4PZHA 2CA2A 2NN1A 4UOVA 4ETQC 4JSAA 3MNIA 3S71B 4YYTA 5DRSA 3OILA 3P5LA 1CINA 2CBEA 5FDIA 2H15A 4Q7VA 4ZX1A 1FLJA 1TG3A 4Q87A 4Q8XA 5JQ0A 3OKUA 2POWA 2OSFA 5C8IA 1FQLA 3S97A 3EFIA 1ZNCA 3M5TA 3W6IA 1CAYA 2HD6A 3RZ5A 5BRUA 1CNXA 1IF8A 1G0FA 4Q78A 3DCWA 1FSQA 3MHCA 5E2NA 3IAIA 4DZ7A 3RG4A 5JEGB 4KAPA 1UGCA 3MNUA 4FU5A 5DOHA 4Q07A 1I9MA 3MDZA 1ZSAA 5E28A 3C7PA 1DMXA 2CBAA 4MLXA 3SAXA 4BF1A 2FW4A 4YXIA 1CNYA 3OIKA 5A25A 5EOIA 4HF3A 3T5UA 1I8ZA 4Z1KA 4PQ7A 4M2WA 3JXFA 4G7AA 2WEGA 1CANA 1LG6A 4WL4A 1BNVA 3M1QA 3T83A 3M5SA 1H9NA 4K0SA 3OYSA 2FMZA 1RAYA 6CA2A 1BNTA 4PXXA 4M2RA 1TH9A 1AZMA 4MO8A 4WW6A 1CVHA 7CA2A 3MHOA 1LGDA 1CZMA 1RAZA 3RZ8A 1IF4A 1BICA 4MDMA 1T9NA 1THKA 4KUYA 4KUWA 5FLSA 4E3GA 3RJ7A 5SZ0A 3HKTA 3M98A 4FPTA 4LU3A 1BZMA 1HUHA 2OSMA 4JSSA 5HPJA 1LZVA 5A6HA 4JSZA 1OKNA 1CVCA 4QIYA 1I9PA 2HFWA 3DAZA 3KKXA 3S76A 3T84A 5E5RA 4CA2A 4ZX0A 1DMYA 4QJOA 5FLTA 4L5WA 5JG5B 4Q49A 1JD0A 2WEJA 4HEYA 4XZ5A 5FNMA 4ZWYA 2FOSA 3NJ9A 4KNMA 1CNKA 5JGSB 1CRAA 3V2MA 1DCBA 3S75B 4FIKA 4G0CA 4HEZA 4K1QA 5FNJA 2HNCA 4Q09A 2NMXA 5JEHB 3KWAA 1TEQX 5E2RA 3V3HB 1CNBA 1G1DA 1ZFKA 3DVCA 4HU1A 4N16A 3RYYA 1I90A 3M5EA 1ZGEA 5L3OA 4Q99A 3N3JA 5G0BA 5LMDA 2FOVA 3M1KA 3OIMA 5CJFA 1KOQA 1XPZA 2QOAA 3NB5A 4TWLA 2VVBX 4QK2A 4ITOA 3KIGA 3MWOA 3K2FA 1G46A 3P3JA 1CCTA 3RZ0B 4YXOA 1AM6A 4CNWA 5DSPA 5EKHA 2NXTA 4BCWA 4WR7A 4E5QA 1JCZA 5G0CA 3U45X 4WW8A 5EHVA 3FE4A 3M1WA 3MNAA 5FLRA 1HECA 4E49A 1I9NA 2VVAX 4XE1A 1G52A 3K7KA 3RYZA 1V9EA 1CVAA 1FQNA 4RUYA 3IGPA 1G6VA 4RH2A 3TVOX 3D93A 3QYKA 3D0NA 1BV3A 5CACA 4YX4A 3EFTA 4RUXA 3RZ1B 1XQ0A 2H4NA 4KP8A 2X7SA 2F14A 4K13A 1CALA 4R5AA 4CNRA 3SBIA 4JS6A 4QSJA 1HEBA 4Q81A 5DSLA 1RZBA 3KONA 5JG3B 4QK3A 4R59A 5SZ5A 3BETA 4YWPA 4E3FA 3OKVA 4YVYA 5SZ3A 1I9QA 2AW1A 3MHMA 3ML5A 4FVNA 4WUQA 4QSIA 4PYYA 3M04A 1Y7WA 4ZWIA 3HLJA 3K34A 3D9ZA 5AMLA 1IF6A 4KNNA 3TMJA 3IBUA 5FL4A 3R16A 1ZGFA 1CVBA 3HKNA 3M67A 3TVNX 3N2PA 5FLPA 1YO0A 2HL4A 3M1JA 3RZ7A 1RZCA 1G53A 3NI5A 3P44A 2Q1QA 3MNHA 2HOCA 4L5UA 5SZ4A 3ZNCA 4XFWA 5DSRA 2Q38A 3S77B 3DV7A 2Q1BA 4WUPA 1EOUA 1KOPA 4ZWXA 4C3TA 1RZDA 5BYIA 4YXUA 1I9LA 4FRCA 4HT0A 3ZP9A 2NWZA 1HUGA 3R17B 4R5BA 1G4OA 5DVXA 4QTLA 1KWQA 2X7UA 4XIXA 4YGJA 3V3JA 4KP5A 3IBIA 3IBNA 2QP6A 5L6KA 5DSIA 2IT4A 3M2XA 4ITPA 4RIUA 3S73B 4HEWA 1URTA 5G03A 3CAJA 5EZTX 3CA2A 5E2KA 2FMGA 3RYJB 2NWYA 5DSQA 1J9WA 4E4AA 1BN1A 3MNJA 1Z9YA 5JEPB 3DCCA 4K0ZA 3L14A 3U3AX 5JQTA 1CVEA 3M2ZA 2CBCA 5BRVA 3PO6A 3DVBA 1Z93A 4QIZA 1CNIA 4KV0A 1FQRA 1RJ6A 5FDCA 3V2JA 3PJJA 1FR7A 4HT2A 3P4VA 5EKMA 5IPZA 1Z97A 1BN4A 1CAMA 4N0XB 2WEHA 4TWMA 4Z0QA 2W2JA 4YGKA 5SZ1A 5JESB 1KWRA 1FSNA 2NNVA 1RZEA 1TTMA 1MOOA 3D92A 3OYQA 4JSWA 5SZ6A 1CAHA 4YHAA 3M2YA 5DSNA 3IBLA 1CNWA 4LHIA 3KOIA 2FOYA 3MMFA 1HCAA 4PYXA 1CVDA 2X7TA 1DCAA 1AVNA 4CNXA 2QO8A 5G01A 1TG9A 4QJMA 1TE3X 5EIJA 3DVDA 4CQ0A 5FL5A 1CA3A 3KNEA 5E5UA 4QJWA 3F7BA 2FNKA 1CNGA 3V5GA 4Q0LA 4M2UA 3RGEA 5CLUA 3RYXB 3S8XA 4Q6DA 3UYQA 5EH8A 3RYVB 1CRMA 1CNCA 4Q83A 5EH7A 4Z1JA 4FL7A 3RG3A 2WD3A 1TB0X 4RFDA 1I91A 3B4FA 2NNGA 3FW3A 4ILXA 4QEFA 4Q06A 3V7XA 4E3HA 2ILIA 5FNHA 1FSRA 3MNKA 5DSKA 1UGAA 1G54A 4CACA 8CA2A 3HS4A 3U7CA 5FLQA 9CA2A 1XEGA 4ZAOA 2NXSA 1HEDA 3DCSA 3SBHA 3Q31A 3P55A 3UYNA 2EZ7A 2CABA 3M96A 5CA2A 1OKMA 1HEAA 4IDRX 3T82A 3GZ0A 4YGLA 4Z1NA 2HKKA 5DSOA 12CAA 4QSAA 4Q8YA 3V3FA 2GD8A 3DC3A 5FNKA 4QJXA 3RLDA 4QSBA 1G4JA 1HVAA 3MHLA 4GL1X 2AX2A 4Z1EA 1A42A 1IF5A 5DSJA 2NWOA 4X5SA 3F8EA 3N0NA 1UGGA 5FLOA 3F4XA 5BNLA 1YDDA 3S78B 1BNUA 3V3IB 5E2SA 1HCBA 3CZVA 1I9OA 5JDVB 1IF9A 4MLTA 1BNQA 1XEVA 3V3GB 4Q7SA 4QJPA 3JXHC 1RJ5A 4KUVA 2NNOA 4K0TA 1YDCA 2FNMA 5SZ7A 5SZ2A 1UGDA 2WD2A 5J8ZA 1CNHA 1CAJA 2NXRA 3HKQA 5E2MA 3MYQA 2FOQA 1FR4A 5FNGA 2NN7A 2CBDA 1CCSA 1CNJA 1YDBA 2O4ZA 4BF6A 2POUA 3JXGA 3KS3A 3P3HA 3OY0A 3U47A 4ZWZA 5EKJA 1BNNA 2GEHA 3BL0A 3T85A 1CVFA 1ZH9A 2WEOA 1CAZA 3KOKA 4RUZA 2POVA 4Y0JA 4Q9YA 5DOGA 4Q08A 1G48A 4E9OX 3LXEA 3P5AA 5DSMA 3MZCA 5FNLA 1YO1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZSB A;  3M2N A;  4Q7P A;  3HKU A;  1OQ5 A;  4MTY A;  4QJ0 A;  4KNJ A;  4LP6 A;  4YGF A;  1MUA A;  3PYK A;  1CA2 A;  4Q8Z A;  3W6H A;  4Q7W A;  1F2W A;  5FNI A;  5EH5 A;  1UGE A;  4M2V A;  3B1B A;  1G45 A;  4HBA A;  2FOU A;  3KLD B;  4COQ A;  2EU3 A;  1G0E A;  1RZA A;  1UGF A;  4RIV A;  4L5V A;  3IEO A;  2FNN A;  3CYU A;  3FFP X;  3M14 A;  4MDG A;  4DZ9 A;  1KEQ A;  3F7U A;  1BN3 A;  1IF7 A;  3P58 A;  3T5Z A;  1CIM A;  4IWZ A;  3VBD A;  2ZNC A;  4RFC A;  1CAK A;  3DA2 A;  3S72 B;  4QY3 A;  1CAI A;  4RN4 A;  1ZFQ A;  1FQM A;  1YO2 A;  4CNV A;  2ABE A;  3DBU A;  2EU2 A;  3S9T A;  3M3X A;  2NNS A;  4Q90 A;  1V9I C;  1G3Z A;  1ZSC A;  3BL1 A;  1TBT X;  3DC9 A;  2NWP A;  3N4B A;  3MHI A;  4E3D A;  1ZE8 A;  1UGB A;  2CBB A;  4QK1 A;  3SAP A;  1H4N A;  3ML2 A;  1H9Q A;  3M40 A;  4XIW A;  5EHE A;  1CAO A;  3S74 B;  3DD8 A;  1BNW A;  1CIL A;  3D8W A;  1YDA A;  4YGN A;  4MDL A;  1BNM A;  1LG5 A;  4KNI A;  4Q6E A;  5AMD A;  3HFP A;  1TEU X;  3DD0 A;  5AMG A;  1CCU A;  5FL6 A;  1JV0 A;  1LUG A;  5JGT B; 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