5FL6A

Three dimensional structure of human carbonic anhydrase ix in complex with 5-(1-(4-methylphenyl)-1h-1,2,3-triazol-4-yl)thiophene-2- sulfonamide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
Knots found
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
WRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Efficient Expression and Crystallization System of the Cancer Asociated Carbonic Anhydrase Isoform Ix.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE IX
total genus 66
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5fl6A00
5J8ZA 3OILA 1TB0X 3M40A 4G7AA 3T83A 1H4NA 3RYZA 4KAPA 2POUA 4Z0QA 2FNMA 5EHWA 1G6VA 4CACA 4MDMA 5AMGA 4CNVA 3L14A 5E5UA 3JXHC 3UYNA 5FDIA 4FVOA 5EHEA 9CA2A 3LXEA 5CLUA 1HEDA 5CACA 5SZ4A 3D93A 4L5VA 5JGSB 4Q08A 3KKXA 5A6HA 4YGLA 2WEJA 1G4OA 2HKKA 4XE1A 1DMXA 2ILIA 1FLJA 1HEBA 1HEAA 5E2SA 5DSPA 1KEQA 3V2MA 3S78B 1BICA 4Q8YA 1CNXA 4LHIA 1I9NA 2CBDA 4Q7PA 3RZ5A 3EFTA 2FMGA 1OQ5A 3PYKA 5BNLA 2NXTA 1I9QA 1ZFQA 3MZCA 4ZX0A 1RAZA 1CA3A 1FQMA 3DA2A 3RZ7A 1JD0A 4YXOA 5E2RA 4XIWA 4Q8XA 4ZWYA 4Q8ZA 1DCBA 3D92A 1TEQX 1ZSAA 1XEVA 1XPZA 3FFPX 3RYYA 5EH8A 4N16A 4Q7WA 1FQLA 3KWAA 4QK2A 4E9OX 4FL7A 4RFCA 4YGJA 3HLJA 3K7KA 3SBHA 5DSNA 4YGNA 4MDGA 4E3GA 1RZCA 3BETA 3QYKA 5DSIA 5DSOA 3IBIA 4MDLA 2GEHA 4IDRX 4M2UA 4Q83A 3MNKA 1Z97A 5G03A 3SAXA 1Z9YA 1RZDA 4ZAOA 4FU5A 5FNLA 1AM6A 1CNBA 5EZTX 1FSNA 4Q07A 4QSBA 3T84A 1BN1A 1BN3A 2FOYA 3U7CA 4COQA 1CCTA 1IF9A 3IBUA 3B4FA 2POWA 2EZ7A 4XFWA 5FLOA 4HEZA 5SZ2A 4RH2A 4HF3A 4GL1X 4LU3A 3RYJB 3IGPA 1THKA 4K0ZA 2X7SA 3DV7A 4KNJA 3M2NA 2NNVA 2NXRA 3M1WA 4WW6A 5BYIA 4XZ5A 3M3XA 4KUYA 4FIKA 1ZGEA 4LP6A 5CJFA 1CCUA 4HT2A 5LMDA 4R59A 2NWZA 4R5AA 3C7PA 2NN1A 1I9MA 5AMLA 1ZSBA 1RZEA 1HVAA 1KWQA 1FSRA 5EIJA 1V9EA 5E2NA 1LG6A 4Q90A 1YO1A 4Q81A 1CAHA 3HKNA 4QJMA 1CCSA 4R5BA 4CNWA 3IBLA 3U45X 3DD8A 3OIMA 4QJ0A 4JSAA 3TMJA 5JEPB 5BRWA 5IPZA 1G0EA 1BN4A 2FOQA 4Z1JA 3MHCA 4QJXA 1UGFA 4PQ7A 3SAPA 3CZVA 5AMDA 4QJWA 5FLPA 1I90A 3RG3A 3VBDA 5DSJA 1XQ0A 4K0SA 3RJ7A 3S77B 1CNHA 4PZHA 1H9NA 1YDBA 2Q1BA 4QTLA 3DBUA 5FLTA 3DVBA 1CRAA 2WEGA 1AVNA 4Q49A 1ZNCA 1I9LA 1G0FA 3F8EA 1CAJA 4CQ0A 1CVEA 4CNRA 1TE3X 2AX2A 3P58A 4Q6EA 1CNKA 3P5AA 2NXSA 2X7UA 4HT0A 1CNGA 1CNIA 4ILXA 4WUPA 5EKHA 1RAYA 4ETQC 7CA2A 2FOUA 4WR7A 4RUYA 4QK3A 5E28A 1TBTX 1CVDA 3IBNA 1CVHA 3HFPA 3V3GB 1UGGA 2EU3A 2WEOA 5EOIA 1KWRA 1YO2A 1HCAA 1CNWA 1I9OA 5FLSA 1G54A 1CA2A 4MO8A 3DCCA 4Q78A 1CNYA 1EOUA 4QEFA 2NNGA 2Q1QA 4E3HA 1I8ZA 2FNKA 4HEYA 5EH7A 5JGTB 4N0XB 3OYSA 5DSKA 1BNMA 4ZWIA 4UOVA 2CBEA 3R16A 1CANA 3FW3A 2NNOA 1JV0A 4QSIA 3V3IB 4KNMA 5DSRA 3KONA 3F7UA 1F2WA 4RIUA 5BRVA 3ZP9A 4YYTA 4HEWA 1CNJA 4E3FA 1XEGA 3RZ1B 3FE4A 3T5UA 3R17B 5EKMA 4Q6DA 4KUVA 4Q87A 2CA2A 2FNNA 5FL5A 1G52A 4ZX1A 3RG4A 4QJPA 3M5TA 3MWOA 4Z1KA 3MHLA 3UYQA 5SZ1A 3OYQA 1YDAA 2NN7A 1BCDA 1CILA 4RUZA 3W6HA 3DCSA 4BCWA 3RYXB 1RJ6A 12CAA 1ZE8A 4KP8A 1IF7A 2VVBX 4MLXA 5L6KA 3S76A 3V7XA 5G01A 4E49A 2NWYA 1CZMA 3P3HA 5JEGB 3N2PA 1YO0A 4IWZA 3M2YA 4Q0LA 3M1KA 4ZWXA 1J9WA 2CBCA 3V3FA 1BNQA 2X7TA 1Y7WA 2WD3A 1LZVA 3T85A 4Z1EA 4XIXA 3ML2A 4KUWA 4HU1A 5DSLA 4L5UA 1TEUX 2HFWA 3T82A 3P3JA 3MNJA 3S8XA 2FW4A 3T5ZA 1CAOA 4KNNA 4QSAA 4YXIA 4E3DA 2OSMA 4QSJA 4JS6A 2AW1A 4RN4A 1CAIA 3D0NA 2FOSA 5BRUA 3DC9A 2IT4A 3DVCA 5JEHB 5FNMA 3CA2A 3PJJA 4RIVA 5DRSA 4CA2A 5JESB 5FNGA 3KS3A 1IF4A 3KOIA 2VVAX 3TVOX 4YGKA 4K1QA 1TG9A 3DC3A 4M2VA 4FVNA 5E2KA 4Z1NA 2ZNCA 2CBAA 1CINA 3OKVA 5DSQA 3CYUA 1BNVA 3K2FA 3NI5A 1CVFA 1BZMA 1I9PA 3DAZA 3RYVB 4YXUA 1CNCA 3MDZA 2GD8A 2O4ZA 1FSQA 4Y0JA 1TG3A 3M67A 4BF6A 3M2ZA 4JSWA 5SZ5A 1DMYA 2NNSA 5DSMA 1FR7A 4YHAA 3DCWA 2NWPA 4RUXA 5EHVA 1CAZA 3M96A 3CAJA 5FDCA 2FMZA 3PO6A 3OKUA 1BNUA 4QIYA 3N0NA 1UGDA 5FLQA 3RZ0B 1H9QA 4QJOA 5FL4A 1T9NA 3OY0A 1YDCA 1CIMA 5FNKA 5DVXA 1CAMA 3MHMA 2F14A 3S73B 1ZFKA 5SZ0A 2FOVA 2QOAA 1JCZA 3N3JA 3KNEA 5EKJA 3IEOA 3ZNCA 1URTA 1I91A 3P44A 2WEHA 3S75B 4WUQA 2HOCA 1MOOA 4Q99A 1FQRA 1LUGA 1G53A 3DD0A 5A25A 4FPTA 1UGCA 3Q31A 3F7BA 1HUHA 1ZH9A 4DZ7A 5FNIA 4DZ9A 3S71B 5CA2A 3GZ0A 1CALA 3RZ8A 5DOHA 1IF6A 1UGEA 2H4NA 1TTMA 3JXGA 1UGBA 4Q9YA 4YGFA 3P4VA 3P55A 5HPJA 3M5EA 3BL0A 4G0CA 4ITPA 4L5WA 4X5SA 1CAYA 3S9TA 3M04A 4BF1A 2OSFA 3V3HB 4KV0A 4YWPA 3HKTA 4Q09A 3MNAA 3JXFA 1G46A 3M5SA 3OIKA 4PYYA 1DCAA 1CAKA 3M1QA 1LG5A 3MNUA 3MMFA 2H15A 3KLDB 4PXXA 3RLDA 5FLRA 3S97A 4ZWZA 5FNJA 4E4AA 2ABEA 4CNXA 3M2XA 4JSZA 3MHOA 2QP6A 4RFDA 4YX4A 1HUGA 1G4JA 1LGDA 4MTYA 5FL6A 4M2WA 3SBIA 3M98A 2WD2A 3D8WA 3MHIA 1UGAA 1V9IC 1HECA 3DVDA 2CABA 2Q38A 3KIGA 1FQNA 5E2MA 1OKLA 5SZ6A 5JQ0A 1ZSCA 5JG5B 1CVCA 1A42A 4MLTA 3HS4A 4M2RA 8CA2A 1BNTA 1IF8A 5JDVB 1G3ZA 1ZGFA 1G48A 4HBAA 4ITOA 2EU2A 4KP5A 4K13A 1KOQA 3D9ZA 1Z93A 3P5LA 4Q7SA 2CBBA 4KNIA 5G0BA 4Q06A 3W6IA 5C8IA 3B1BA 1MUAA 3M1JA 5FNHA 3U47A 4E5QA 4WW8A 5L3OA 1G45A 4YVYA 4TWMA 3K34A 1G1DA 5SZ3A 3V3JA 3F4XA 3ML5A 5G0CA 1CVAA 1OKMA 1HCBA 3MNIA 4QK1A 1RZBA 3S74B 5E5RA 1TH9A 1CVBA 1IF5A 1FR4A 3KOKA 5SZ7A 3NB5A 1YDDA 2HD6A 3M14A 4FRCA 3U3AX 1CRMA 2NWOA 4QY3A 4TWLA 3RGEA 1OKNA 3IAIA 3EFIA 1AZMA 4WL4A 3HKUA 3NJ9A 3S72B 4K0TA 1KOPA 3MNHA 4JSSA 4QIZA 2NMXA 5DOGA 2HNCA 1RJ5A 4Q7VA 1BNNA 4C3TA 1BNWA 3HKQA 6CA2A 5JQTA 3V2JA 2QO8A 1RZAA 3BL1A 2W2JA 2POVA 3N4BA 3TVNX 5JG3B 2HL4A 1BV3A 5EH5A 3MYQA 4PYXA 3V5GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J8Z A;  3OIL A;  1TB0 X;  3M40 A;  4G7A A;  3T83 A;  1H4N A;  3RYZ A;  4KAP A;  2POU A;  4Z0Q A;  2FNM A;  5EHW A;  1G6V A;  4CAC A;  4MDM A;  5AMG A;  4CNV A;  3L14 A;  5E5U A;  3JXH C;  3UYN A;  5FDI A;  4FVO A;  5EHE A;  9CA2 A;  3LXE A;  5CLU A;  1HED A;  5CAC A;  5SZ4 A;  3D93 A;  4L5V A;  5JGS B;  4Q08 A;  3KKX A;  5A6H A;  4YGL A;  2WEJ A;  1G4O A;  2HKK A;  4XE1 A;  1DMX A;  2ILI A;  1FLJ A;  1HEB A;  1HEA A;  5E2S A;  5DSP A;  1KEQ A;  3V2M A;  3S78 B;  1BIC A;  4Q8Y A;  1CNX A;  4LHI A;  1I9N A;  2CBD A;  4Q7P A;  3RZ5 A;  3EFT A;  2FMG A;  1OQ5 A;  3PYK A;  5BNL A;  2NXT A;  1I9Q A;  1ZFQ A;  3MZC A;  4ZX0 A;  1RAZ A;  1CA3 A;  1FQM A;  3DA2 A;  3RZ7 A;  1JD0 A;  4YXO A;  5E2R A;  4XIW A;  4Q8X A;  4ZWY A;  4Q8Z A;  1DCB A;  3D92 A;  1TEQ X;  1ZSA A;  1XEV A;  1XPZ A;  3FFP X;  3RYY A;  5EH8 A;  4N16 A;  4Q7W A;  1FQL A;  3KWA A;  4QK2 A;  4E9O X;  4FL7 A;  4RFC A;  4YGJ A;  3HLJ A;  3K7K A;  3SBH A;  5DSN A;  4YGN A;  4MDG A;  4E3G A;  1RZC A;  3BET A;  3QYK A;  5DSI A;  5DSO A; 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