5HPJA

Photobacterium profundum alpha-carbonic anhydrase
Total Genus 57

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
EWSYTGEHGTEHWGDSFATCAEGVNQTPIDINQTTQAELAPLHLDYEGQVTELVNNGHTIQANLTGKNTLTVDGKTFELKQFHFHTPSENYLKGKQYPLEAHFVHATDKGELAVVAVMFDFGPRSNNELTTLLASIPSKGQTVELKEALNPADLLPRDREYYRFNGSLTTPPCSEGVRWFVMQEPQTSSKAQTEKLQAVMGNNARPLQPLNARLILE

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV1 (18-21)TI1 (19-22)3H1 (23-28)3H2 (164-167)AH1 (31-35)TIV9 (213-216)TIV3 (36-39)S1 (43-44)TIV4 (69-72)AH3 (203-213)S2 (56-59)S5 (81-85)S3 (62-68)S4 (73-78)S12 (174-179)TVIII1 (110-113)TIV8 (104-107)S7 (104-105)TIV7 (101-104)TIV6 (98-101)S14 (199-201)TIV5 (84-87)S6 (88-98)TVIII3 (169-172)S9 (112-119)TVIa1 (183-186)TI2 (120-123)S11 (154-157)TVIII2 (146-149)S10 (125-134)S13 (190-195)TII1 (151-154)TIV2 (28-31)AH2 (140-146)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Photobacterium profundum ss9
publication title A High-Resolution Crystal Structure of a Psychrohalophilic alpha-Carbonic Anhydrase from Photobacterium profundum Reveals a Unique Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase
total genus 57
structure length 217
sequence length 217
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5hpjA00
4PQ7A 3S72B 1HEBA 4ZWIA 3RZ0B 5BRWA 1I9LA 1UGAA 3V5GA 4CNWA 4Q83A 4JSZA 4RUZA 2W2JA 4QJMA 5DRSA 5JEHB 4K13A 1JV0A 1RAZA 5FDIA 5SZ6A 5EH5A 3V2MA 4CNRA 4E5QA 5SZ0A 2HNCA 1YDAA 1CVAA 5CA2A 1G6VA 1CA2A 3HKNA 3MHIA 1G45A 3FE4A 3HKTA 4CA2A 4R5BA 3FFPX 4Q09A 3JXFA 1I9NA 3M5EA 3BETA 1T9NA 1G48A 4FL7A 4Z0QA 3MYQA 3S97A 2EU2A 3P5LA 5BRUA 2POUA 4QSIA 2CA2A 2FOQA 4YWPA 5SZ2A 1CRAA 2AW1A 5EH8A 4QJWA 3M2YA 1I8ZA 4ZAOA 5E5UA 5JEPB 1BNMA 3OKVA 4QIYA 1G4JA 4QIZA 6CA2A 3MZCA 5JGSB 4WR7A 5FLQA 5EKJA 1TTMA 5G0CA 1Y7WA 5FLTA 4YGFA 1CNJA 5SZ5A 5DSRA 3V3JA 3S9TA 5DVXA 4PYYA 5DSKA 1FQRA 4Q90A 2VVAX 4JS6A 3GZ0A 3F7UA 2ZNCA 1XQ0A 5SZ3A 3T5UA 1CAKA 4XIXA 3CA2A 4MDGA 4FU5A 2FOVA 4YGJA 4Q7SA 3RG4A 3OY0A 3M5TA 3DD8A 4FPTA 5FLPA 2IT4A 1HEDA 1BNNA 2POVA 3U47A 1EOUA 5G01A 3MNIA 3P58A 3DCSA 3D92A 1KOQA 4KNMA 4GL1X 4DZ9A 1G1DA 1BNUA 1HEAA 2NN1A 3DV7A 4CACA 3S76A 1TB0X 3SBHA 4FRCA 3RYXB 3RJ7A 1TG3A 3EFIA 4Z1NA 3S71B 2FOUA 4MO8A 4BCWA 1G0FA 3S77B 4QSBA 4C3TA 4L5VA 2OSFA 5A25A 4YYTA 1RJ6A 1AZMA 3N0NA 4QK1A 1RZBA 2GD8A 3D9ZA 5E2MA 3HKUA 3D93A 1UGFA 4RUYA 3IGPA 3RGEA 3SAXA 4Q87A 3CAJA 1RZAA 3HKQA 1OKMA 5E2RA 4CNVA 1HECA 1IF7A 2NWPA 3M1WA 1V9EA 4KP5A 3N4BA 4FVOA 3M3XA 2WEGA 4TWMA 4KP8A 2FNMA 2WEOA 1BCDA 5E2KA 3TMJA 2CBBA 3M40A 4M2UA 2WD3A 5DSMA 1IF5A 1ZE8A 5FNIA 3UYNA 4M2VA 3KKXA 3RYZA 5E2NA 4RN4A 4YGLA 1BNQA 3KOIA 3MHMA 2NNSA 3B4FA 5CLUA 3KLDB 1TE3X 4MLTA 1G4OA 4ITPA 3U45X 1Z93A 3V3FA 1G0EA 1YO0A 5JQTA 3RYVB 3DVCA 1UGEA 4YXOA 1BICA 4K0TA 4RFCA 1ZFQA 1OKNA 3UYQA 3W6IA 1BNWA 2CBDA 2HKKA 5JQ0A 4KNNA 3DVDA 2O4ZA 5DSJA 5EZTX 3RLDA 5L6KA 3M1JA 1I9MA 2WEJA 3T5ZA 4PZHA 4BF6A 3IBIA 3M2NA 4HEWA 1HUHA 3V3GB 3NJ9A 2NXRA 3DCCA 1CANA 1TEUX 3RYJB 1CNCA 1H9QA 2HFWA 3D8WA 3ZP9A 1H4NA 1CNKA 2EU3A 3KOKA 3DAZA 4XFWA 5LMDA 3OILA 4MDMA 3KONA 5JDVB 2WEHA 1ZSAA 2CABA 5SZ4A 4MTYA 5FLSA 1CNWA 1IF9A 1XEVA 4L5UA 3T84A 3HS4A 1DMYA 4HF3A 5FL4A 4RIVA 3KS3A 2AX2A 1CCUA 4MLXA 3M96A 1MOOA 2CBCA 3KNEA 3DA2A 3HFPA 1I9QA 1BN1A 3K34A 3M98A 5EKMA 3JXHC 4YXIA 5JG3B 4WUQA 4KUYA 2H4NA 5DOGA 1CVBA 4IDRX 4BF1A 1RAYA 5EKHA 3M5SA 3P3JA 1IF6A 5DOHA 5AMGA 4QJOA 1YO2A 1OKLA 5JGTB 3RZ7A 3F8EA 1CAOA 3F4XA 3K7KA 1AM6A 3T82A 4ILXA 1ZGFA 3F7BA 5HPJA 3T83A 9CA2A 3MHOA 1LGDA 2NNVA 2NNGA 1ZGEA 3KWAA 3OKUA 1OQ5A 3IEOA 5FLOA 3W6HA 3DCWA 1HCAA 5BNLA 1CNGA 1CVDA 1LUGA 1DCAA 1FQMA 1MUAA 1F2WA 1FSQA 1I9OA 4FVNA 3CYUA 1A42A 2QO8A 2QP6A 2NWYA 4UOVA 4QK2A 1JD0A 2FMGA 1BN3A 4Q99A 4Q7PA 4QTLA 1CINA 4ZX0A 4M2RA 1CNYA 5J8ZA 4QSJA 3SAPA 5A6HA 3ML5A 3K2FA 5SZ1A 4ETQC 1ZH9A 2Q1QA 3RG3A 1FR7A 4KUWA 2ILIA 4RH2A 1CAIA 4ZWYA 4TWLA 3IBUA 4Q6EA 4CQ0A 2OSMA 4K0SA 5IPZA 3Q31A 4ZWXA 3RYYA 4Z1EA 3T85A 4E9OX 5FNGA 3M2ZA 1XPZA 5E5RA 1I90A 4XZ5A 4YHAA 1DMXA 4XE1A 2H15A 1IF8A 1XEGA 4JSWA 2GEHA 3M14A 1BZMA 3MNAA 4YX4A 2NNOA 2CBAA 4RFDA 1FR4A 4Q7WA 4L5WA 3QYKA 4KV0A 1LZVA 4Q0LA 4QJXA 3BL1A 3C7PA 3M04A 2NWOA 3EFTA 4WW8A 4Q8XA 3FW3A 3P4VA 4E4AA 1CNIA 3HLJA 2Q38A 4N0XB 4XIWA 5G0BA 1TH9A 1RJ5A 3N2PA 5EHVA 1RZDA 2VVBX 4Q9YA 1ZNCA 5AMDA 1CIMA 4HT0A 2X7TA 3PJJA 3S73B 1Z97A 1FSNA 1ZSBA 3DD0A 4KNIA 4G0CA 1BV3A 4IWZA 5EIJA 2FW4A 1CVFA 4WL4A 2ABEA 4LU3A 4WUPA 1CAYA 3JXGA 1CAZA 3V3IB 4PYXA 2Q1BA 5FNJA 3RZ1B 1CZMA 3SBIA 1YDCA 5JG5B 3P5AA 4FIKA 1CVEA 4E49A 3U3AX 2HOCA 4E3GA 3MNJA 5DSOA 4Q06A 1V9IC 2QOAA 4K1QA 1UGBA 2NXTA 3ML2A 4M2WA 3TVNX 4Q49A 5DSPA 4YXUA 3VBDA 4Q08A 3MWOA 1CA3A 1JCZA 3ZNCA 2FMZA 4PXXA 3V2JA 4COQA 5CACA 4YVYA 4Z1JA 2POWA 3IAIA 4Q6DA 1BNTA 5FL6A 4ZX1A 3MHLA 1CNBA 3M1KA 5DSLA 5FDCA 1THKA 2FOSA 5FNMA 1ZSCA 2NN7A 2WD2A 4E3HA 3MHCA 5FLRA 1BN4A 4ZWZA 5EOIA 3PYKA 5BYIA 1UGGA 3S74B 4K0ZA 3LXEA 4HEZA 1CILA 2FNNA 3V3HB 1YDBA 1CAHA 4R59A 3CZVA 1KEQA 3TVOX 1KWQA 1CAMA 2FNKA 3DC3A 3DVBA 1HUGA 3DC9A 1RZCA 1BNVA 5FNLA 1G52A 4Z1KA 7CA2A 1HCBA 2EZ7A 3NB5A 3OIKA 2HL4A 3IBNA 3MNKA 4YGNA 5JESB 1AVNA 4HEYA 5E28A 1I9PA 1YDDA 3MMFA 4QK3A 5E2SA 5G03A 3V7XA 1TBTX 2X7UA 1G46A 1G3ZA 3M1QA 5AMLA 3OYSA 3P3HA 3MNHA 3MNUA 1CALA 2HD6A 3L14A 2NWZA 4KUVA 4CNXA 3BL0A 4MDLA 5EH7A 4QEFA 4Q07A 8CA2A 5C8IA 4X5SA 1CNXA 4N16A 5L3OA 1DCBA 3U7CA 3P44A 3OIMA 3S78B 2F14A 4RIUA 5FNHA 5SZ7A 3S75B 5DSIA 1FQLA 4YGKA 4HU1A 4ITOA 4QJ0A 1URTA 3N3JA 4RUXA 4E3DA 5DSNA 1LG5A 3IBLA 1TEQX 1KWRA 1IF4A 2FOYA 5DSQA 3M2XA 1CCSA 1YO1A 3MDZA 1UGCA 4Y0JA 3RZ5A 1CRMA 4E3FA 12CAA 1CNHA 4KNJA 3D0NA 4WW6A 1H9NA 5EHWA 5FL5A 5CJFA 1CVCA 2X7SA 4HT2A 4QY3A 1J9WA 4Q81A 1I91A 3DBUA 3KIGA 4R5AA 1RZEA 3P55A 1TG9A 1Z9YA 4QJPA 1HVAA 4LP6A 3R16A 4KAPA 1UGDA 1FQNA 1FSRA 3S8XA 4Q8ZA 1CVHA 4LHIA 2NMXA 1FLJA 4HBAA 3RZ8A 1G54A 4Q78A 1ZFKA 1CCTA 1KOPA 3PO6A 3R17B 5EHEA 5FNKA 4Q7VA 3M67A 5BRVA 4QSAA 2NXSA 3NI5A 1LG6A 4G7AA 3OYQA 1CAJA 2CBEA 5JEGB 4JSSA 1G53A 4Q8YA 4JSAA 4DZ7A 3B1BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PQ7 A;  3S72 B;  1HEB A;  4ZWI A;  3RZ0 B;  5BRW A;  1I9L A;  1UGA A;  3V5G A;  4CNW A;  4Q83 A;  4JSZ A;  4RUZ A;  2W2J A;  4QJM A;  5DRS A;  5JEH B;  4K13 A;  1JV0 A;  1RAZ A;  5FDI A;  5SZ6 A;  5EH5 A;  3V2M A;  4CNR A;  4E5Q A;  5SZ0 A;  2HNC A;  1YDA A;  1CVA A;  5CA2 A;  1G6V A;  1CA2 A;  3HKN A;  3MHI A;  1G45 A;  3FE4 A;  3HKT A;  4CA2 A;  4R5B A;  3FFP X;  4Q09 A;  3JXF A;  1I9N A;  3M5E A;  3BET A;  1T9N A;  1G48 A;  4FL7 A;  4Z0Q A;  3MYQ A;  3S97 A;  2EU2 A;  3P5L A;  5BRU A;  2POU A;  4QSI A;  2CA2 A;  2FOQ A;  4YWP A;  5SZ2 A;  1CRA A;  2AW1 A;  5EH8 A;  4QJW A;  3M2Y A;  1I8Z A;  4ZAO A;  5E5U A;  5JEP B;  1BNM A;  3OKV A;  4QIY A;  1G4J A;  4QIZ A;  6CA2 A;  3MZC A;  5JGS B;  4WR7 A;  5FLQ A;  5EKJ A;  1TTM A;  5G0C A;  1Y7W A;  5FLT A;  4YGF A;  1CNJ A;  5SZ5 A;  5DSR A;  3V3J A;  3S9T A;  5DVX A;  4PYY A;  5DSK A;  1FQR A;  4Q90 A;  2VVA X;  4JS6 A;  3GZ0 A;  3F7U A;  2ZNC A;  1XQ0 A;  5SZ3 A;  3T5U A;  1CAK A;  4XIX A;  3CA2 A;  4MDG A;  4FU5 A;  2FOV A;  4YGJ A;  4Q7S A; 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