5L3OA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with a quinoline oligoamide foldamer
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Self-Assembled Protein-Aromatic Foldamer Complexes with 2:3 and 2:2:1 Stoichiometries.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2016-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5l3oA00
5EKMA 3MHOA 3PJJA 4N0XB 2AX2A 3OYQA 5FNKA 1CRAA 5DSQA 2EU3A 4KAPA 5AMGA 5SZ5A 4Q7SA 4E5QA 3R17B 4YYTA 5DSIA 1G46A 1G54A 2POUA 1CAZA 3MNKA 4Q8XA 4Q7PA 1XPZA 4XFWA 5SZ2A 4QJWA 3V5GA 2X7SA 3KOKA 3M98A 3T5UA 2CBAA 3FW3A 5EZTX 5BNLA 5FLQA 1AM6A 3S73B 1RAZA 1HCBA 5DSPA 1EOUA 4JSWA 1ZGFA 3SBIA 1I9LA 1MOOA 3EFTA 1LGDA 5AMDA 4JS6A 1G48A 3CA2A 4XZ5A 3K7KA 3PO6A 1I9QA 4FPTA 3TMJA 3S72B 1FQLA 2POWA 1KWQA 4L5WA 1CNWA 1CAIA 4M2UA 4WUPA 4YGLA 1CRMA 1HUHA 5DSNA 4FU5A 4QJXA 1CNBA 2NNGA 3FFPX 4CNWA 2VVAX 4RH2A 5E2MA 2H15A 1ZSAA 3HLJA 3W6HA 4FIKA 2HL4A 5G0CA 2WEGA 3V7XA 4K1QA 3MMFA 1Z93A 3KONA 3MHCA 5CA2A 3T84A 4Q7WA 1AZMA 3MYQA 4BF6A 3P3JA 1F2WA 4QIZA 1BN1A 5CLUA 4Z1KA 4QTLA 4FRCA 2FW4A 5FL6A 3U47A 1BNWA 4JSZA 3BL1A 4K0ZA 3UYNA 2CABA 4YGFA 3IBLA 4R59A 3CAJA 3U3AX 5BRWA 1CZMA 3DCSA 4Z1JA 3T82A 5E2RA 2AW1A 4HBAA 3RZ0B 4HT0A 5FLSA 1CAMA 3DD0A 1RZEA 1BN4A 3SBHA 3TVNX 1XEVA 1UGAA 3OY0A 3V3HB 3KKXA 1CAKA 4Q49A 4KUYA 1ZFQA 2FNMA 3V3IB 1ZSCA 5FDCA 1ZFKA 3M1WA 4WR7A 3MNJA 1TH9A 5BRUA 1G53A 2Q1QA 2NN7A 4MTYA 2WEJA 3IAIA 4PYYA 2CBBA 2GD8A 1YDDA 4LU3A 3B1BA 1MUAA 4RIVA 1BV3A 3OIKA 1UGEA 1THKA 3P5AA 2FMGA 3P5LA 1HEDA 1KEQA 5FNLA 1G0FA 1RJ5A 1KWRA 1OQ5A 3S75B 3V2MA 3PYKA 4CNVA 1LG6A 3P58A 3VBDA 1I90A 3M40A 1RZCA 4TWMA 2HOCA 5EH8A 4QY3A 5JESB 3RZ8A 4ZWXA 1LG5A 5SZ0A 5AMLA 3S74B 3ML2A 3P55A 1RAYA 3M5EA 4QJOA 4R5BA 3MNUA 1A42A 1V9EA 4L5UA 4RUZA 3TVOX 2Q38A 1G52A 1FSQA 4YVYA 3UYQA 4QSIA 3U7CA 5CACA 3OKUA 4KP5A 3RYXB 3RYYA 1J9WA 4MDLA 2OSMA 4BCWA 4KNJA 1CCTA 3KLDB 3RZ5A 3IEOA 3W6IA 4RFDA 3V2JA 1BNNA 5G01A 1ZNCA 1YO1A 5DSLA 3RJ7A 3N2PA 3EFIA 1FLJA 1RZBA 3U45X 5EH7A 5JDVB 3K34A 1IF9A 2QOAA 4ITOA 1HEAA 3SAXA 4ZWIA 3M2NA 3M1QA 3NJ9A 4M2VA 4K0TA 3DAZA 2NWOA 4DZ9A 5EOIA 3OILA 5IPZA 5DSRA 2QO8A 1BCDA 8CA2A 5DSOA 4CNXA 2NWZA 4TWLA 3V3FA 4MDMA 3IBIA 1CAOA 4Q99A 2HD6A 1TG9A 2X7TA 4PYXA 4YGJA 5DOHA 2Q1BA 3ZP9A 1XQ0A 1CANA 4Q9YA 5FL4A 3DVBA 1IF4A 3GZ0A 3DVDA 4G7AA 5JGSB 4KP8A 5FLTA 5DOGA 4YGNA 3DV7A 2WEOA 4KUVA 1UGFA 1HVAA 1AVNA 1YDAA 1JCZA 1CNYA 1Z97A 1G45A 4E4AA 2OSFA 3V3GB 4E9OX 5A25A 1CILA 2H4NA 3C7PA 5FLPA 5DRSA 5FNGA 5G0BA 5EHWA 2HNCA 1CCUA 4ZX0A 3P44A 2QP6A 5SZ1A 3N4BA 3OIMA 3RG3A 4QSAA 4KNIA 3F7UA 1DCAA 1G4JA 3S77B 2NWPA 4YHAA 1YDBA 4Q0LA 3BL0A 4HEYA 4Q83A 4PXXA 5SZ6A 4Q08A 2FNNA 2EZ7A 3RG4A 3MNAA 3RGEA 2W2JA 4Z0QA 1CNIA 1CNXA 1FR4A 4MDGA 1TEUX 3HKNA 1BNVA 1CVAA 4K0SA 4RFCA 2FOYA 3F4XA 4L5VA 1KOPA 3P4VA 1G4OA 2HFWA 3FE4A 3MWOA 3HKUA 2FOSA 3RYVB 1BNTA 1IF8A 3HFPA 4Y0JA 4CNRA 1H9NA 1CNJA 3MNIA 5JEPB 4LP6A 1CVBA 4ILXA 3RLDA 4Q81A 1TE3X 3ZNCA 1LUGA 4YXIA 1KOQA 1YO2A 2WEHA 4IDRX 1H9QA 4GL1X 1CA3A 5E5RA 4FL7A 2VVBX 4E3HA 4KV0A 1YDCA 4MO8A 1TBTX 1DCBA 4YX4A 3S78B 2CA2A 2IT4A 2NN1A 1OKMA 3OKVA 4QK1A 5JEHB 4LHIA 1CNGA 3RYZA 2ZNCA 3S9TA 3JXHC 2GEHA 1HCAA 3S71B 1TB0X 1BN3A 1UGGA 1CNHA 1ZSBA 5JGTB 3M2YA 4Q90A 4WW6A 1JD0A 3D92A 2NXRA 4HEZA 1G0EA 2FOQA 4RUYA 3S97A 4CACA 4ZWZA 4Q7VA 4HU1A 5SZ7A 4N16A 5SZ3A 1FR7A 5BRVA 3MHLA 1DMYA 1ZH9A 4Q07A 1CVCA 1UGCA 4BF1A 1BICA 4HF3A 4E3GA 2CBDA 4ZAOA 5E2NA 2FOUA 3T83A 2EU2A 5FNJA 3M5TA 3CYUA 1BNMA 2NNVA 4Q78A 4QJPA 1IF5A 3KOIA 3M14A 3OYSA 4QJ0A 1CIMA 2NXTA 4PQ7A 1I9MA 3QYKA 3RYJB 3M96A 4ZX1A 5CJFA 3HS4A 3KWAA 3ML5A 5G03A 3M1KA 1LZVA 3IBUA 1H4NA 4QIYA 1I9OA 3MHIA 2ILIA 3HKTA 3MDZA 4YXUA 2POVA 2X7UA 4MLTA 4QEFA 1I9NA 4YXOA 3M3XA 5JQTA 3M67A 3IGPA 1FQRA 3LXEA 3HKQA 4M2WA 5EH5A 4R5AA 1CVDA 3D9ZA 4CQ0A 1G6VA 3N3JA 1G3ZA 1RZDA 1TEQX 4DZ7A 4Q6EA 3T5ZA 3IBNA 3KS3A 3M1JA 4KNMA 3T85A 3JXFA 1HECA 4QJMA 4HEWA 3KNEA 2ABEA 3DA2A 3Q31A 4Q09A 1FQMA 3MNHA 4E3FA 5EHEA 2HKKA 3D93A 4MLXA 4E3DA 3F8EA 4K13A 1BNUA 5FNIA 3M2XA 7CA2A 1CAYA 1OKLA 5J8ZA 1CVEA 5EIJA 1T9NA 4X5SA 2NNOA 5DSMA 1G1DA 1XEGA 2F14A 5A6HA 1CAJA 4RUXA 5JG3B 3L14A 3R16A 1ZE8A 1IF7A 3MZCA 4QSBA 2WD2A 4ITPA 2CBCA 5SZ4A 3SAPA 3BETA 2FNKA 4WL4A 1V9IC 2NWYA 2NNSA 2FMZA 3M2ZA 4UOVA 2CBEA 4C3TA 9CA2A 4QK2A 4IWZA 1URTA 5BYIA 1HUGA 1I8ZA 5L6KA 1I9PA 1CINA 4QSJA 4WW8A 5DSJA 1IF6A 4XIXA 12CAA 3MHMA 4Q87A 5DSKA 4E49A 1FSNA 3F7BA 3JXGA 4G0CA 4CA2A 5EHVA 3N0NA 3M5SA 4WUQA 3V3JA 1FQNA 4RIUA 1UGDA 5FDIA 1HEBA 5FL5A 1CNKA 1CNCA 4YGKA 3RZ1B 4RN4A 4JSSA 3DC9A 3S76A 1CCSA 1I91A 5E2KA 3DCCA 4KNNA 5L3OA 1RJ6A 1OKNA 5HPJA 4PZHA 4QK3A 5JG5B 5FLRA 5E28A 4HT2A 1CVFA 2FOVA 1DMXA 3B4FA 3D8WA 5FNHA 1TG3A 4Z1EA 4COQA 1TTMA 1ZGEA 2NMXA 3KIGA 5E2SA 3M04A 4JSAA 4M2RA 4Q06A 1BZMA 3NI5A 1CA2A 3NB5A 4XE1A 5DVXA 5JEGB 4Q8YA 4ZWYA 5C8IA 3DVCA 2O4ZA 2WD3A 4FVNA 3K2FA 5LMDA 1FSRA 1RZAA 4Q8ZA 3S8XA 3DD8A 1CVHA 1YO0A 3CZVA 1CALA 5FLOA 4ETQC 3D0NA 3RZ7A 3P3HA 4YWPA 1CAHA 4XIWA 1Y7WA 2NXSA 4Q6DA 5EKJA 1BNQA 4KUWA 3DBUA 4FVOA 5E5UA 3DCWA 6CA2A 1JV0A 5FNMA 5EKHA 5JQ0A 1Z9YA 3DC3A 1UGBA 4Z1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EKM A;  3MHO A;  3PJJ A;  4N0X B;  2AX2 A;  3OYQ A;  5FNK A;  1CRA A;  5DSQ A;  2EU3 A;  4KAP A;  5AMG A;  5SZ5 A;  4Q7S A;  4E5Q A;  3R17 B;  4YYT A;  5DSI A;  1G46 A;  1G54 A;  2POU A;  1CAZ A;  3MNK A;  4Q8X A;  4Q7P A;  1XPZ A;  4XFW A;  5SZ2 A;  4QJW A;  3V5G A;  2X7S A;  3KOK A;  3M98 A;  3T5U A;  2CBA A;  3FW3 A;  5EZT X;  5BNL A;  5FLQ A;  1AM6 A;  3S73 B;  1RAZ A;  1HCB A;  5DSP A;  1EOU A;  4JSW A;  1ZGF A;  3SBI A;  1I9L A;  1MOO A;  3EFT A;  1LGD A;  5AMD A;  4JS6 A;  1G48 A;  3CA2 A;  4XZ5 A;  3K7K A;  3PO6 A;  1I9Q A;  4FPT A;  3TMJ A;  3S72 B;  1FQL A;  2POW A;  1KWQ A;  4L5W A;  1CNW A;  1CAI A;  4M2U A;  4WUP A;  4YGL A;  1CRM A;  1HUH A;  5DSN A;  4FU5 A;  4QJX A;  1CNB A;  2NNG A;  3FFP X;  4CNW A;  2VVA X;  4RH2 A;  5E2M A;  2H15 A;  1ZSA A;  3HLJ A;  3W6H A;  4FIK A;  2HL4 A;  5G0C A;  2WEG A;  3V7X A;  4K1Q A;  3MMF A;  1Z93 A;  3KON A;  3MHC A;  5CA2 A;  3T84 A;  4Q7W A;  1AZM A;  3MYQ A;  4BF6 A;  3P3J A;  1F2W A;  4QIZ A;  1BN1 A;  5CLU A;  4Z1K A;  4QTL A;  4FRC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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