7CA2A

Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAGLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Engineering the hydrophobic pocket of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 7ca2A00
5SZ5A 1CVAA 1XQ0A 1RZDA 7CA2A 3OIKA 4QJPA 5DSJA 1KOPA 5FNJA 3HLJA 3CZVA 4YWPA 4ITOA 4Q87A 2FOSA 3IBLA 1ZSBA 1FSQA 3R17B 3TVNX 3F8EA 3MHOA 1DMXA 4KUWA 4RN4A 4QSIA 4Q0LA 3IGPA 4WUQA 3V3IB 3S77B 2GD8A 1XPZA 1V9IC 4RIVA 3CAJA 1EOUA 4CA2A 1AVNA 4CNXA 4RUZA 4RIUA 4PYXA 5FLRA 1BN3A 1CIMA 3V3HB 3FFPX 3D0NA 1IF9A 1LUGA 5AMDA 4Y0JA 4ZX1A 5DVXA 4ETQC 3S71B 3MMFA 5SZ4A 2EZ7A 1LG5A 2EU3A 2NXRA 4MLTA 4XE1A 5CJFA 3FW3A 3M40A 3MNIA 4QK3A 1CVBA 1I9OA 3M5TA 5FLQA 4Z1EA 3S78B 3DD8A 3PJJA 3V3GB 5FNHA 4YYTA 1RZAA 1ZGEA 4ZWXA 3RYZA 3M2ZA 1RAYA 4MDGA 1CA2A 1ZFKA 5JQ0A 3D92A 2FMGA 3OIMA 4ILXA 3RGEA 4QTLA 4YGLA 4HBAA 3LXEA 1CAOA 4GL1X 3B1BA 1TEUX 1UGAA 5EHEA 2NMXA 3SAXA 2POWA 4QSAA 4QSBA 5FL6A 1KEQA 1G0FA 1XEVA 3P5AA 1Z97A 2HNCA 2NNGA 3D93A 1UGFA 4Q83A 1FR4A 4ZX0A 4E3GA 4G7AA 4JSWA 5E28A 3GZ0A 4HF3A 4Z1NA 3T5UA 5EHVA 3UYNA 3DC9A 3MNHA 2CA2A 5E5RA 4MO8A 1CVHA 3P3JA 4ZAOA 1CVCA 1TG9A 1HUHA 1ZSCA 2OSMA 4YGKA 4DZ9A 3MNJA 5LMDA 4L5WA 4KNMA 4FVOA 1CCSA 1YDDA 4Z0QA 1RJ6A 2F14A 2O4ZA 9CA2A 3IBNA 1ZSAA 1G3ZA 4HU1A 3TMJA 1BZMA 4WUPA 1TEQX 1CZMA 1Z9YA 3V7XA 1TBTX 3OYQA 1CAHA 2FOUA 2NN7A 3F7BA 1KOQA 4HT2A 3MHIA 5EOIA 3S75B 4Q8YA 5FLOA 4CACA 2FOVA 4BF1A 3EFIA 5EH8A 3SBIA 3U47A 5JQTA 1G48A 3N0NA 2NXTA 1CCTA 5SZ2A 3P58A 3MHMA 1A42A 3P44A 1G45A 4E9OX 3KIGA 1TG3A 5DSLA 5FDCA 3KNEA 4Q90A 2NN1A 3DA2A 1V9EA 2Q1QA 4QJXA 1Y7WA 4TWMA 3NI5A 3RYJB 5FDIA 1I9MA 1I90A 3RG4A 1CAYA 4JSSA 4LHIA 3HKTA 4KNNA 4BCWA 1CVEA 3CA2A 3ML2A 4Q99A 1H9NA 3KS3A 5C8IA 5JG5B 4XIXA 5EZTX 5EKHA 1G46A 3KOKA 4PXXA 3S97A 3CYUA 4Q6EA 1CAIA 2NNSA 4HEZA 1I9QA 4DZ7A 4QK1A 3MNKA 4LU3A 3MDZA 3M14A 3KWAA 4YHAA 1FQMA 5JG3B 1KWQA 4K0TA 1HVAA 4YVYA 1TB0X 1HEDA 1BNNA 3N2PA 4HEYA 5BRVA 5L3OA 2X7TA 3U45X 1MOOA 2Q38A 2ILIA 1CNBA 3OILA 3SAPA 4BF6A 4Q7WA 5SZ6A 1FSRA 5JESB 3K2FA 3BETA 3M2YA 3PYKA 1BN1A 3U7CA 1FQRA 5EH5A 4K1QA 4PZHA 3B4FA 3V3FA 1YDBA 2WEGA 4FPTA 5E2NA 3V2JA 1OKLA 4HEWA 5JEGB 4YXOA 3P3HA 4IDRX 2FNMA 5DSMA 1URTA 5DSIA 2ABEA 4WW8A 4KUYA 1MUAA 2FW4A 5IPZA 4FL7A 3HFPA 1YDCA 3P5LA 5SZ3A 3N4BA 4E3FA 5FNMA 2WD2A 4Q09A 2NWPA 1CAZA 3QYKA 3DCWA 5FNKA 4KAPA 4XIWA 2IT4A 3MHCA 1T9NA 3IBUA 5AMLA 3DCCA 2FOQA 2H4NA 4COQA 2QP6A 4X5SA 4ITPA 1UGCA 3V5GA 3ZP9A 4XFWA 3DC3A 3P55A 1CNJA 4E49A 3DCSA 1RZEA 3RJ7A 5JGTB 1CNXA 5G0CA 12CAA 3S72B 1CNIA 5DSNA 3IBIA 1THKA 1IF5A 4LP6A 4G0CA 4QIYA 1CNYA 1BN4A 4RFDA 5E2RA 3T83A 3U3AX 3S74B 1KWRA 2Q1BA 2WD3A 1HEBA 3OY0A 3RLDA 4E3DA 5BYIA 3RZ7A 5CLUA 3W6IA 5BRUA 1CRAA 1I9PA 4ZWZA 1HECA 3IAIA 2FOYA 3DVBA 4E5QA 3M1QA 2NWOA 3T5ZA 5E2KA 1LGDA 1OKNA 1ZGFA 4QK2A 4QIZA 1ZE8A 4HT0A 1IF6A 3OKVA 1AZMA 4KUVA 2X7UA 1CNHA 4MDMA 5SZ7A 2NWZA 3OKUA 2GEHA 4ZWIA 4KNIA 1YO0A 1FR7A 5SZ1A 3RG3A 3D9ZA 3ML5A 4FVNA 4E3HA 3N3JA 2VVBX 3K34A 4KP5A 1BNVA 1I8ZA 2NXSA 3NB5A 2AX2A 8CA2A 3M2NA 4E4AA 1CAKA 4KV0A 3M5EA 4N16A 1HCAA 3DD0A 4Q7PA 5FLTA 3HS4A 4Z1JA 5G01A 4FRCA 1FQLA 5FL5A 3NJ9A 1RZCA 1TTMA 4QJ0A 3HKUA 5DSQA 3S9TA 3L14A 3M5SA 4YX4A 4RFCA 3M1JA 3BL1A 3V3JA 1TH9A 1FQNA 5CACA 4Q7VA 4CNVA 4QY3A 3M1KA 1HCBA 1Z93A 1RAZA 4JSZA 5FNGA 3M98A 5FLSA 4CNRA 1LG6A 3FE4A 4CQ0A 1CVFA 5FL4A 4QSJA 1ZFQA 4Q8ZA 3JXHC 3MNUA 5FNLA 3RZ0B 2POVA 3S8XA 3D8WA 3KKXA 3EFTA 3M2XA 4Q07A 4MLXA 3M04A 5G03A 1IF7A 4QJMA 4XZ5A 5EH7A 3RYYA 1JD0A 3R16A 3DVDA 4Q06A 1CAJA 3PO6A 4M2UA 2QOAA 4YXUA 1CANA 2WEOA 4FU5A 1CALA 1UGDA 1CNCA 4Q78A 1RZBA 1JCZA 4KP8A 2FNNA 1IF4A 3S76A 4CNWA 5BNLA 1FSNA 1I9NA 1CNWA 5AMGA 2FMZA 3RZ5A 2HKKA 4PQ7A 4K13A 1G0EA 3KONA 5DRSA 5JDVB 2POUA 5JEHB 2HOCA 1DCBA 4WW6A 3K7KA 2CBEA 2FNKA 3S73B 1G4JA 1G54A 5A6HA 5DSKA 1CRMA 2NNVA 4WL4A 5A25A 4Q81A 2HFWA 4MDLA 4JSAA 1BNTA 2CBBA 4M2RA 1G6VA 3MHLA 2NWYA 1IF8A 4R5BA 5BRWA 3SBHA 4L5VA 1YDAA 5EKMA 3RYVB 1RJ5A 1XEGA 1G52A 5E5UA 4PYYA 3MYQA 5EKJA 4JS6A 1OKMA 1CNGA 4Q9YA 1BNMA 4K0ZA 1J9WA 1UGBA 1DCAA 4UOVA 4RH2A 3HKQA 4Q08A 5L6KA 1I91A 4M2VA 3F7UA 5CA2A 3T82A 3Q31A 2HL4A 1G1DA 3KLDB 3VBDA 1G53A 3OYSA 4K0SA 4Q6DA 3W6HA 3RZ8A 3P4VA 4L5UA 3DBUA 3JXGA 3MWOA 2AW1A 4YXIA 4TWLA 3DV7A 1CNKA 4Z1KA 3UYQA 6CA2A 1LZVA 5FLPA 1HUGA 2HD6A 5J8ZA 5FNIA 4C3TA 1H9QA 1CILA 1UGGA 1H4NA 1BNQA 1BICA 1F2WA 1FLJA 2CBAA 3C7PA 3KOIA 5EHWA 2CBDA 3T85A 3DAZA 1BNUA 4IWZA 5DSRA 2OSFA 2W2JA 5DSPA 4RUXA 4WR7A 4MTYA 2EU2A 5DSOA 2CBCA 3DVCA 5HPJA 3MNAA 4FIKA 4YGJA 5DOGA 5E2MA 1AM6A 1CCUA 2X7SA 2WEHA 4KNJA 2H15A 2VVAX 1YO1A 3M67A 1CINA 2CABA 3HKNA 3IEOA 1ZH9A 3M1WA 5EIJA 1I9LA 4QEFA 3F4XA 5SZ0A 1CVDA 1YO2A 4Q49A 1JV0A 1CA3A 5G0BA 3M96A 3M3XA 1G4OA 2ZNCA 1BCDA 3BL0A 1UGEA 4QJOA 3T84A 2NNOA 4R59A 5JEPB 4Q7SA 3V2MA 3TVOX 1HEAA 1BNWA 4Q8XA 5E2SA 1TE3X 4R5AA 2QO8A 1OQ5A 1DMYA 3MZCA 1BV3A 4ZWYA 4YGFA 3RZ1B 4YGNA 4N0XB 2WEJA 4RUYA 1CAMA 4M2WA 3JXFA 5JGSB 5DOHA 1ZNCA 3RYXB 4QJWA 3ZNCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5SZ5 A;  1CVA A;  1XQ0 A;  1RZD A;  7CA2 A;  3OIK A;  4QJP A;  5DSJ A;  1KOP A;  5FNJ A;  3HLJ A;  3CZV A;  4YWP A;  4ITO A;  4Q87 A;  2FOS A;  3IBL A;  1ZSB A;  1FSQ A;  3R17 B;  3TVN X;  3F8E A;  3MHO A;  1DMX A;  4KUW A;  4RN4 A;  4QSI A;  4Q0L A;  3IGP A;  4WUQ A;  3V3I B;  3S77 B;  2GD8 A;  1XPZ A;  1V9I C;  4RIV A;  3CAJ A;  1EOU A;  4CA2 A;  1AVN A;  4CNX A;  4RUZ A;  4RIU A;  4PYX A;  5FLR A;  1BN3 A;  1CIM A;  3V3H B;  3FFP X;  3D0N A;  1IF9 A;  1LUG A;  5AMD A;  4Y0J A;  4ZX1 A;  5DVX A;  4ETQ C;  3S71 B;  3MMF A;  5SZ4 A;  2EZ7 A;  1LG5 A;  2EU3 A;  2NXR A;  4MLT A;  4XE1 A;  5CJF A;  3FW3 A;  3M40 A;  3MNI A;  4QK3 A;  1CVB A;  1I9O A;  3M5T A;  5FLQ A;  4Z1E A;  3S78 B;  3DD8 A;  3PJJ A;  3V3G B;  5FNH A;  4YYT A;  1RZA A;  1ZGE A;  4ZWX A;  3RYZ A;  3M2Z A;  1RAY A;  4MDG A;  1CA2 A;  1ZFK A;  5JQ0 A;  3D92 A;  2FMG A;  3OIM A;  4ILX A;  3RGE A;  4QTL A;  4YGL A;  4HBA A;  3LXE A;  1CAO A;  4GL1 X;  3B1B A;  1TEU X;  1UGA A;  5EHE A;  2NMX A;  3SAX A;  2POW A;  4QSA A;  4QSB A; 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