4DXB | Genus

Total Genus 208

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	208
sequence length	637
structure length	637
Chain Sequence	KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHWGSGGGHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGSATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Sugar binding protein, hydrolase
molecule keywords	Maltose-binding periplasmic protein, Beta-lactamase TEM chim
publication title	Structure of an Engineered beta-Lactamase Maltose Binding Protein Fusion Protein: Insights into Heterotropic Allosteric Regulation. pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
total genus	208
structure length	637
sequence length	637
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.5.2.6: Beta-lactamase.
pdb deposition date	2012-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01547	SBP_bac_1	Bacterial extracellular solute-binding protein
A	PF13354	Beta-lactamase2	Beta-lactamase enzyme family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA02
3.40.190.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2	Periplasmic binding protein-like II	4dxbA01
3.40.710.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Beta-lactamase	DD-peptidase/beta-lactamase superfamily	4dxbA03

2Q2AA 2J9PA 4DXBA 4N1HA 3KGCA 3G4PA 3RT8A 3IWIA 1I6AA 1SW4A 1SBPA 3MJNA 1W8QA 2P2AA 4JSDA 4P0IA 5BWJA 4GD8A 3TG9A 3CJMA 2V20A 1B0HA 3PD9A 4ND9A 4JBZA 3S4UA 3ZSFA 1EZOA 1YLWA 3G3FA 5A90A 3BFCA 1IKIA 3O3VA 5K2XA 1B3HA 3VLUA 5JEIA 3ZGAB 3VLVA 1TFDA 5TR7A 3JV9A 2QS2A 2A3UA 1JVXA 1E3UA 3SS5A 2ZM0A 2WKIA 4LATA 4LP2B 5FAPA 4XKRA 1MPBA 4FEBA 2Q9TA 1H8YA 5CXWA 1S7YA 4WZ4A 2XQZA 2OLUA 4Q0CA 5D3OA 5J8XA 5EVLA 3IWQA 4OPRA 2H0YA 2NUVA 4C3QA 3GZGA 1ESUA 1KVMA 5F82A 4PP0A 3ZKKA 5EE8A 3B7DA 3KBRA 1LB8A 3K0VA 1K25A 3LY4A 3NC8A 4X56A 4F94A 1XA7A 4F2OA 4MBPA 5KCJB 2QZ6A 1GV8A 4GL8A 1FQBA 2P0SA 5F1GA 5A5XB 2E0SA 4E3MA 2GHBA 5H8FB 2FFYA 4FATA 5I94A 4NF8A 3FGSA 1IKGA 3PUZE 3VLWA 3MVZA 3EHUA 4OLDA 4YKJA 5F7VA 4FORA 2I4BA 2O84X 2HP9A 1FTOA 3LBSA 3EHSA 1PZOA 1IITA 1ZG4A 3T93B 3HLBA 2Y7WA 1B58A 4HTGA 2DQVA 2XFTA 3CSGA 3MC2A 1MPCA 4E3JA 4PFTA 3VOZA 1SI1A 4QSDA 2XX7A 2BJJX 4IB2A 3C36A 2HPBA 1NKXA 1ZKBA 4KZ4A 2HQ0A 2ZQ8A 4XIGQ 2OJTA 1KDSA 2WGIA 5L9OA 2I58A 3WRTA 3OZHA 1I5QA 4GOTA 3HLEA 2PBWA 4DDSA 4H5GA 4F3PA 2XXRA 1ANFA 3MPKA 2Q9MA 3IF6A 2EX6A 4GLIA 5ITOA 4KZ8A 5CBSA 3JYIA 4ZAMA 3IF6C 1AXBA 1PI4A 1PWCA 1SYIA 2OWSA 4JSOA 1XXMA 5EECA 4OETA 4RYEA 4B88A 4MBFA 3BLSA 1BT5A 3NI9A 3N94A 2JCHA 2RC8A 2DCFA 1FQCA 3K4UA 5I59A 3O88A 3VE1B 2PX1A 5CRYA 4TLLB 3MZ9A 2Q89A 2F6PA 3O2AA 2JE5A 2AIXA 4EF1A 1G6AA 4EQIA 2VGKA 3IHBA 5E43A 1YM1A 4LQ2A 4R9GA 2XXPA 5FQKA 4ESWA 3LY3A 3OPRA 1TDLA 2H98A 4RY1A 4JWXA 3ZKLA 1LCFA 1LFGA 4JKTA 2UVHA 1HD8A 4GB7A 4ZJ3A 3G7WA 1IYPA 4JF4A 3CVGA 5JTYB 1IEMA 5AE4A 3FJGA 2DXYA 3CSBA 2DOJA 4NWDA 4U1OA 4E3KA 4OZ9A 1IYSA 2OLVA 2O7IA 3C7UA 1IYOA 5CTNA 4KI0E 4B4XA 2ANJA 1GGGA 3Q7ZA 4NTLA 3V50A 1MY1A 2WKYA 3TZAA 1PBPA 2F97A 1DPPA 2DSFA 4JDFA 2ZM8A 3HLGA 4LCLA 2WUQA 1HSJA 3ZG0A 1BSGA 3USDA 3VP3A 1HZOA 4DCXA 2B3BA 5FI6A 2Y84A 2O6AA 2ZQ9A 4U4SA 2F34A 2ZYKA 1PW8A 2KLFA 3O29A 4S2NC 1QKBA 2F36A 2X26A 2XX9A 4WKMA 1YT4A 3KG2A 4U23A 3E3KA 3TUSA 4G77A 4R74A 1DTZA 3W8KA 3TMGA 1FCMA 4PFWA 2RC7A 2DRWA 4FAJA 2J7VA 1VR5A 5L9MA 2C5WB 4R6HA 3WS5A 3N26A 4ZDMA 1LI9A 3OD7A 4IEDA 4LV3A 1NZUA 1WDNA 3TTLA 5FDHA 5CMKA 5DF8A 3PBNA 1MRPA 4R6YA 1HSEA 5HL1A 5I2KB 4EWFA 4U0XA 1YMXA 1BLHA 4E3NA 1BP5A 5BUUA 2WGWB 2Y55A 2UYEA 3W15C 4FD8A 4NE4A 3TTNA 1QVSA 3FZVA 4P0GA 1YAEA 2GHAA 3EF7A 3PUXE 2XXYA 3SETA 2GRVA 1K6SA 5KZHA 2BLSA 2UXAA 2HZKA 4ZZEA 1EROA 5EOOA 1ONGA 1DTGA 5I2NB 3UNWA 4N9LA 1T0KA 3C5AA 2W7YA 4H8RA 3TPAA 4AB5A 3KN3A 4LUBA 3NY4A 2Y7PA 1NNTA 4JF6A 3MQ9A 4KFQA 5DEXB 4P0MA 4RJZA 4OONA 3Q7VB 1XC1A 5FQ9A 3VDFA 5HBCA 5FI2A 1URSA 1K56A 3V5MA 1GVCA 2I48A 4H1XA 1K38A 2YLNA 4HS7A 2Y7RA 3BRMA 3RXXA 1NNPA 3O66A 2WGVA 4NETA 3O6IA 3W9WA 1RYOA 4U21A 1XGIA 1YCJA 4XKNA 3NIAA 1MPDA 2I4CA 3PV0E 4RVAA 5EHMA 1CI9A 2Y2JA 4Q30B 1GCEA 1II5A 3V3RA 1I2WA 2HDSA 3M6HA 1MQGA 2PU4A 3OSRA 3T96B 1PEBA 1ES4A 5E2HA 3ZVTA 3UPPA 2YJPA 3HUOA 3BFUA 1PBQA 4O7DA 1ALQA 1BLPA 1EU8A 4QSEA 1XKZA 4X1BA 3FXUA 1NYYA 4NWCA 1OLAA 3B6QA 1MXYA 3TQLA 3HPIA 4GFRA 2AL5A 2R9WA 1MQDA 3LSWA 4EUOA 1NJ4A 4R73A 4ONYA 1MWSA 4ZZAA 4KR5A 2QSXA 1PB7A 1ESIA 3HSTA 2V3UA 3TOIA 5I56B 1VM1A 1B5HA 4EBNA 4CJNA 1QUIA 3BKIB 3IAZA 4GOGA 4BLAA 4JPMA 1UIVA 2REJA 2Y2NA 3C4OA 5AQBA 1Y9UA 4HCWA 1DOTA 1PW1A 1FTJA 4WEPA 5DF9A 3IK6B 2QPNA 1A54A 4OFOA 3U92A 1N0TA 3SOIA 1LBBA 3GBBA 5FTHA 1R9QA 3C35A 2ONRA 2Q8JA 1JVJA 3N8SA 3EPEA 3BYDA 2R6GE 1MXZA 4OP8A 1Y20A 4KZ6A 4QY5A 5CERA 4FCFA 3FZCA 4RNSA 2WZZA 4ZECA 1BUEA 1LBCA 3DP6A 2RCXA 3UA8A 3VVDA 4S2PA 5HX9A 5KDTB 5FASA 1KGEA 1GR2A 3HBRA 3MZ1A 1O7TA 1J1NA 1ES2A 1AL3A 2XF3A 2QRYA 1DMBA 2RCBA 3O87A 4BD1A 3OO6A 3U1OA 3UORA 3BFTA 2XH9A 4EBPA 4EQ7A 3M3KA 3FIRA 4YICA 1MDQA 2HDUA 3FWLA 3FASA 1MY0A 3FD3A 2H4IA 3LEZA 5B7DA 3VOYA 2HDQA 3RY3A 3PUVE 4P6BA 5GLDA 3N7WA 4R9FA 2ZYNA 2IWCA 2Z23A 5M19A 1Y3PA 4QRZA 3UPOA 1BTJA 4FH4A 1LGBC 4KZ5A 2ZD8A 5DTTA 1B51A 1Z7ME 2RKMA 5HAIA 3Q07A 2GH9A 5TP9B 3T66A 4THIA 4OMBA 5TFQA 2H0TA 5ISUA 1QMEA 2ESNA 1PZPA 1JETA 4YU0A 5CGXA 3IH9A 1SW1A 3T9VA 1LAHE 3DM0A 2D5WA 1VSOA 2VD3A 5EVIA 1B1XA 4IBRA 3QSLA 3HLFA 3HL9A 1MY4A 3CFLA 4E0XA 1W8YA 3OO8A 3G2ZA 1K57C 4PM5A 3QXMA 3H6TA 2RF1A 1YLJA 2DS9A 5L9SA 4UAAA 4MNRA 4WMCD 3IQAA 1P1NA 1N9BA 3PUYE 3PD8A 3MZEA 4CPKA 3AGEA 2Z22A 3OXNA 4H8IA 3TKDA 3SEUA 2ZQAA 2NOOA 3RPWA 2VP1A 1CEFA 3PU5A 3U8QA 1O64A 4BDQA 4OESA 1SW5A 4EXKA 1D9YA 4IVIA 4ECFA 3LR1A 1SHVA 1M5BA 3LCEA 4OP5A 3K00A 5A93A 3GV9A 4U0TA 3N8LA 5HAQA 2G29A 2DWHA 4Q8IA 3C31A 5HM4B 4GD5A 2JBFA 4GD6A 4NF6A 2B3FA 1P1WA 3GTCA 4UA8A 1S9TA 3Q81A 5H8NA 3O28A 3SKPA 3I7JA 1FTKA 5EPHA 3OELA 1FQEA 4G68A 4IO2A 1YLYA 3GR2A 4Z7EA 4PETA 2J8YA 3V39A 1JEUA 3HUNA 2XXXA 2XXQA 2AL4A 1ZLQA 3MBZA 4R23A 4BDOA 1CK3A 5J1DA 3AGDA 1SQYA 2ZQDA 3CIJA 5FQJA 4DXCA 2QPQA 3IB1A 2H5SA 2XXVA 1ERMA 5E2FA 1MY3A 4C0RA 4F18A 3TAJA 3TTKA 4P87A 2A5SA 1XOCA 4JXVA 1ZKJA 2DWJA 3O6GA 1P1QA 1MWRA 3IXBA 3C32A 4OOYA 3MZBA 3KFMA 4QFKA 3QK6A 2V25A 1B0LA 1BLFA 1CI8A 3G3GA 4FSFA 4UA6A 4KZAA 3IXDA 1FCOA 2XLNA 4OQIA 1K54A 2UVJA 2Y2QA 3SERA 3RLFE 1K54C 4F22A 1B7HA 1UTHB 1NRFA 3SS3A 4MEZA 2X7PA 4QB8A 5FHOA 4KYSA 3UE3A 3LO7A 4EUZA 1XX2A 3ZCZA 4I1DA 4IY6A 4JB7A 4E6XA 1USYE 4Q5TA 5TGFA 1K55A 3GQZA 1PDAA 1GA9A 4F1UA 3VP0A 2IEEA 4DDYA 1UTBB 4R3BA 1MQHA 4OEUA 3IF6B 2Y59A 2OWTA 1S6RA 5H8QA 3ZVWA 4A5RA 2F6GA 4PM9A 1I6BA 4S2KA 1PB8A 3TTRA 3PPPA 2E1SA 3HVFA 2H25A 5CHJA 2P9VB 1P1OA 3V83A 2O69A 3QIMA 2I3VA 4YB7A 5I59B 3MAMA 3SESA 1E25A 3V3SA 5K2YA 2Z8EA 3BFFA 4R75A 5GLCA 3KN7A 1MH4A 3HUMA 5CEBA 4ZEKA 3W4PA 3N8RA 5AA4A 1Z6FA 2Y7IA 1FCNA 4UACA 4JXIA 4KQRA 3ILTB 1PI5A 1MQIA 3PMXA 1KE0A 1SKFA 1P1UA 4E6WA 3UGWA 5CHUA 4ZJ1A 1LI0A 2PMSA 2ZYOA 3IF5A 3IOTA 5DVJA 2ZLYA 4S2MA 1R9LA 2XXTA 2O7UA 2CC1A 1B4ZA 4PMAA 1NY0A 4O3CA 3MP6A 4X9TA 4I62A 2Z8FA 1DJCA 2F7BA 4MF3A 2Y2IA 5FATA 5KCJA 3UDIA 1IQ7A 1C3BA 5FQQA 4MFIA 3G3KA 3BFEA 2I72A 1W79A 3MXRA 5A5XA 4WEDA 3Q27A 4DCYA 3TDJA 4KQQA 4WXJA 4S2JA 2ONKE 2Q2CA 4C6YA 4PM6A 4N9KA 3A09A 4NMYA 2QMIA 3W9VA 4RK2A 4IBXA 1KE3A 4Y0TA 3CG1A 3CR9A 4R2BA 5JK4A 3E2LA 3O86A 4KZ9A 4BQMA 1B4HA 2NXOA 4F29A 2HEUA 1RGYA 3EHTA 3UDFA 1XVXA 5DVAA 3Q28A 4Y0UA 3PMWA 1LL5A 2Y4AA 2FYIA 3N6TA 4HEFA 4GVOA 1MH3A 2I0CA 1M5CA 4Y0OA 4OEVA 4ZTKA 4M3KA 3ITBA 3KSJA 1JWPA 4LV0A 2IWBA 5H8SA 3M3LA 2OCUA 1WYBA 1B3GA 2ZC6B 4RX3A 5L8DA 1KE4A 1XT8A 1LHYA 4EQ9A 3KSXA 2OLBA 1QMFA 1HTZA 4G4PA 4F3SA 3DTMA 1IIWA 1EWZA 1SD3A 1XGJA 3DWZA 2PYYA 3RN8A 2IWDA 1SCWA 3S9LC 5AA3A 3QAXA 4KCDA 1RGZA 4PE5B 3FATA 4BD0A 1D9VA 1NYMA 3U72A 2HCAA 1LAXA 4RK9A 2XX8A 5H8HA 1K56D 4KENB 3TTMA 2PVUA 4E3IA 1YLZA 2ZJ9A 3VV5A 4E0WA 3C4MA 3MWBA 5FSRA 4QD4A 1S0WA 5CI5A 4GL0A 4NF5A 4WZ5A 3O97A 1IXGA 1DJBA 1USYH 1L0DA 1AOVA 4TQUQ 4XXUA 1W5DA 4WZ5C 5ICTA 1CB6A 3T9HB 3HLDA 1CEGA 4OH0A 3PUWE 4R0QA 3G30A 3KJTA 3BECA 1Q2QA 3TCHA 1OQGA 5LOMA 3SH8A 1LL9A 2M8CA 2EX2A 3QHYA 4X69A 1B05A 2ZC3B 1IZ1A 1Z7NE 1URDA 4JXWA 4XXRA 2ZC4B 5EOEA 4UHUA 3T22A 5BOHA 4F31B 5CECA 1MWTA 1MM7A 4C1TA 2QMXA 2QS3A 3PMVA 3S4XA 1ERQA 4HBUA 4GKUA 2XD2A 1OMPA 4MLLA 3WS4A 3FKWA 2UYFA 4R3JA 1M6KA 1YTVA 1FOFA 1B1HA 1WE4A 3T9UA 3WWXA 2V3TA 1LLSA 3UPNA 4U3TA 5FHNA 3UE0A 4AB6A 5M1AA 1J9MA 1MXUA 2Y2MA 4JWOA 2YPNA 3I3VA 1DSNA 4RPOA 5I2KA 3FV2A 2A5TA 1NNKA 1N4OA 1ELJA 2ZMAA 1URGA 5FAOA 3FUZA 2XD3A 3H6VA 4EV4A 3RQTA 1XP4A 2ZNUA 1B40A 4XTCQ 3FXQA 4NF4A 4H65A 4X68A 1TDGA 2Y2PA 4S2IA 1VE4A 2HZLA 3R7XA 2QS1A 5KZTA 1BLCA 4ZDXA 2VGJA 4WEKA 1IXIA 5I2NA 5L2FA 2E8IA 3THIA 1M5DA 5CGSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4DXBA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

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