1EGOA

Nmr structure of oxidized escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced e. coli glutaredoxin and functionally related proteins
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYCVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN
publication title NMR structure of oxidized Escherichia coli glutaredoxin: comparison with reduced E. coli glutaredoxin and functionally related proteins.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 28
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1egoA00
3TKQA 2VUPA 4Q5FA 4GSNA 1AUCA 3GIXA 1QMVA 2YOIA 3QD9A 1AQXA 5EVOA 4L0UA 1FG4A 4KE3A 4ECBA 2DJ1A 4ZB8A 3EMXA 4XIHA 4ECIA 3TRPA 1WP0A 1XPVA 4MJAA 1M2DA 2FNOA 13GSA 3IAS2 3HA9A 3HJPA 3FEUA 1M2AA 4XCSA 4N11A 1CQGA 2H6ZA 3EU4A 2DMLA 1TKDB 2CZ2A 3ZIVA 2MBTA 3IDVA 4PQ1A 3QAVA 2H6YA 7GSSA 4EC0A 1TOFA 1KEBA 3MAKA 4WETA 5IMZA 4ECJA 1TK8B 1F3AA 4QL7A 1OYJA 4K8MA 3VI5A 5IO0A 5ECMB 3M0FA 5DCGA 1HNCA 3F9UA 6GSVA 3UMAA 4K9ZA 4IGJA 2I3YA 2NVLA 2FHEA 5DQSA 2PERA 3L9VA 1XWCA 3Q74A 1GTIA 2OA7A 4GXZA 4I2UA 1XZOA 1YEXA 4FO5A 1V58A 4IELA 2CV4A 1HYUA 1IYHA 2R6KA 3D22A 4TR3A 3TDGA 1J9BA 2HXKA 2MMOA 5ECSA 6GSUA 4N0ZA 3GKMA 5JWRB 1DE2A 1MD4A 4LMVA 4PURA 2HZEA 3ME7A 3APOA 2YCDA 3FR3A 1A0RP 18GSA 4QL9A 1XW6A 1RW1A 5A5KA 3VLNA 4OD7A 4K7OA 4HOJA 1TRSA 1GNWA 1E6BA 1C72A 4CDOA 2H0HA 3G9BA 4DSRA 5A4VA 4N10A 3BCIA 2KP1A 1TW9A 1XWGA 2XHFA 1XFLA 1TP9A 4ZBDA 5ABRA 3MWHA 4ZBBA 4IN0A 4Q5QA 4KCEA 1EGRA 2R4VA 3GRXA 1DBYA 1SKWB 2XPDA 2B1LA 2GQKA 3DVXA 4MABA 3RDWA 1Z7PA 4NWYA 2MMNA 2V32A 2VL2C 5H5SA 3FY7A 2X8HA 2N5AA 2JZSA 4EKZA 1X9WB 1M2BA 1MDIA 1PSQA 3FZ9A 3FZ5A 2PUKC 5ECIB 2AUVA 4KDXA 4KX4A 2PWJA 4ILFA 5D9XA 4LA1A 1BJXA 1QGVA 2FCHA 2Z9SA 5DVBA 3VURA 3FYGA 4MA9A 1PQNA 3BCKA 3DXBA 1T4YA 2K8VA 2O8VB 1OC9A 3L78A 3M9JA 1LBKA 1X5CA 2M46A 3FR6A 3EINA 4KA0A 1X5EA 1TTZA 2DJ0A 4BPYA 2A2RA 1BAYA 1GUHA 3UARA 3LJRA 1YKCA 5JCGA 2CA8A 2H75A 2GGTA 12GSA 1EOGA 3IE3A 1X0RA 2G0FA 4JR4A 1WWJA 2TRXA 6GSWA 2C0GA 2YV7A 2C1YA 2PVQA 5H5QA 3GKXA 5E59A 2V6OA 4EE0A 3F4TA 4JE1A 1NW2A 3P2AA 4ZL7A 2DMMA 2YV9A 2OE1A 4WR5A 3F4RA 4Q5NA 1OE7A 2JSYA 3IAM2 5IPHA 4I97A 1TU7A 1A2MA 4MPGA 2IMEA 1JLVA 4FYUA 2C3NA 4V2MA 4IP1A 4ML1A 1S3CA 2VL9A 4WKWA 2H71A 3HCZA 2QKEA 4J57E 1K0MA 3LYKA 4K7NA 4NHZA 4IQAA 1FAAA 4FYBA 4DVCA 2ES7A 2ALBA 4HJMA 1G6YA 3UL3A 3J7Yk 2HSHA 4F82A 1G0TA 2YN1A 5D96A 4BVXA 4NPBA 5GZZB 1RK4A 1SU9A 1PA3A 1U87A 4FH8A 4O5RA 3KCMA 4ML6A 4HZ2A 3ERGA 3HJMA 5ELGA 1SD9A 4KDUA 4YH2A 4F2IA 1AW9A 3VPTA 5G31A 1USBA 1ERWA 2H0IA 2WB9A 2P0GA 3WT1A 1QUWA 1JZDA 3CTGA 2RUEA 3RHCA 1XWAA 1K3LA 6GSSA 5IMVA 4HUAA 4IW9A 4MMMA 3IOSA 4MJBA 4EXJA 2VLVA 5CRWA 3D5JA 2NPBA 2GZZA 2FY6A 2K18A 4LL1B 3GTUA 3GL3A 4MF6A 1HNBA 3PH9A 5A4WA 5LNKe 2FA4A 3M8NA 2GSTA 1ON4A 1ILOA 4ZL8A 2H8LA 4GQCA 2K6VA 1F2EA 4PQIA 4L5LA 3F6DA 4ZB9A 2C4JA 2M72A 2VLTA 4TRXA 2VM2A 1Z5YE 3A2XA 4ECCA 1ABAA 1MD3A 2GZPA 4KGIA 1W4VA 4YQVA 1O8XA 3QCPA 5AN1A 3FZ4A 4MF7A 3ZREA 2V6KA 4POKA 4G2EA 1KBNA 3DD3A 2HNLA 4KNDA 4BVYA 3F8UA 3UEMA 3C1RA 2PBJA 1K3YA 2H1BA 2JU5A 2GT6A 1ZL9A 4POLA 4YQMA 5KN0A 2YZUA 5F06A 1JZRA 4GQFA 1G7OA 4HQZA 2DC5A 2X64A 1W89A 5GSSA 3R2QA 4OCFA 2HLSA 1K0NA 2C8UA 3LG6A 3US3A 1A24A 5G5EA 3WGEA 4K7IA 4IS0A 3ZYWA 2E2GA 4LL4B 4QQ7A 4ZBAA 3C8EA 2LNSA 2WFCA 3RAZA 3TOTA 2H72A 2QC7A 1SK2A 3GUSA 1X5DA 2MBSA 1GSDA 4IHUA 5IMFA 2NBSA 4J2FA 4MZBA 5KN3A 3C73A 1BYEA 1HNAA 10GSA 1JZOA 3EU3A 3H79A 3O3TA 4X1UA 1A8YA 2XBIA 5DAKA 3VPQA 4HEA2 4KCAA 1J08A 1J0FA 4OO4A 1SJZA 4L5OA 2YP6A 4D73A 3KMNA 3Q6OA 2ZCTA 4X0XA 4ZXGA 2VIMA 2BMXA 2ON7A 5CNWA 4KH7A 2XBQA 1KNGA 3OR5A 4HU7A 4KB3A 4DSSB 3I9V2 1T8EB 5CAXA 3IXRA 4O7HA 4K0GA 1TI1A 1VF2A 2GSSA 2YJ7A 4IKHA 3ZIJA 1XXUA 2LUSA 2P5RA 1BG5A 1KTEA 3HVVA 3F6FA 3BD2A 4OFTA 3QR6A 4GF0A 1WIKA 1Q98A 2WZ9A 3RPNA 5DDLA 1RQMA 1GTBA 3K8NA 2QGVA 4AF2A 4XRDA 3GX0A 3P7XA 4V1Ap 4PX1A 1V2AA 2B5XA 1NHYA 3VWWA 3TJBA 2EIRA 5ID2A 4MJEA 2FD3A 2B1KA 1FVJA 3VWVA 1O8WA 2IMKA 2DBCA 4HJ2A 2FLSA 1PX7A 4KDYA 2KUCA 1Y6EA 1A0FA 3TCOA 1H75A 4TXOB 4OFNA 2CVKA 2YWMA 2PN8A 2CQ9A 1B48A 2H19A 2QSIA 1VGLA 1SK0A 3M3MA 4JRRA 3UBKA 2H0GA 3N5OA 2YNXA 2NTOA 5B8AA 1PKWA 1A8LA 1PGTA 5IMAA 5GSTA 3HDCA 3KM6A 3U6VA 2WDUA 3IPZA 3RHBA 2MYGA 2IFQB 3L0HA 3EMPA 4P3YB 2H1AA 4TN8A 2YANA 5ECOB 1K0DA 2IL3A 1FHEA 4MZCA 2KLXA 5DQYA 2H01A 2KHPA 4MLYA 4FYCA 1OKDA 5JCWA 4E8HA 4KSMA 1A23A 3E9JB 4TR0A 5IO2A 1V57A 3APQA 1T3BA 3MSZA 5D73A 2EC4A 2R2JA 4XS6A 3QFBC 3I69A 2B6MA 5E4WA 5DJMA 2LSTA 3APSA 2X99A 4JBBA 1B9XC 2A2SA 4MF5A 5KN1A 4V2LA 4CW9A 1QFNA 2PU9C 1TJDA 5G30A 4G9HA 1MDKA 3GKNA 4MCUA 3UVTA 4XHMA 2HT9A 2WCIA 2PPTA 2C3QA 2LJRA 3VI7A 5DALB 3TRXA 4ID0A 2OADA 3BJ5A 1XVQA 4L0WA 4WR4A 4EL1A 2H76A 3UAPA 1DE1A 3ED3A 3LXTA 1AQVA 3QPMA 5LD0A 2CVBA 4OMVA 4BA7A 3GSSA 4WBJA 1GP1A 1F6MC 2ZUPA 5H5RA 1XOBA 2K9FA 4IBPA 3J7Yb 5HR2A 4PUAA 4XS4B 1AXDA 3QAGA 1XWBA 1LJRA 3H93A 2N5BA 4DSQA 2RIIA 3UOMA 2CZ3A 4AGSA 3Q18A 1FVKA 1EV9A 2I9HA 3F4SA 1U6TA 1F37A 2FA8A 3EC3A 3WGXA 1S3AA 2WULA 2AAWA 3N9JA 5G2ZA 1EEJA 5INYA 2DJJA 2PGTA 1THXA 4XS1A 5HR3A 5HFGA 2OBIA 2GDRA 1K3OA 1WMJA 3A2WA 4NV5A 3DIEA 3GN3A 2VCTA 1G7EA 4MK3A 4NMUA 3VFIA 3CRTA 2CX4A 4DEJA 3QMXA 5D8IA 3IHQA 1XW9A 3VWXA 4TVEA 3C7MA 1K0CA 4JZQA 4J56E 3TKPA 3GX8A 2DSAA 1GH2A 2E7PA 3IBHA 1ACVA 2HZEB 5ECLB 1Z6NA 2J23A 2JSZA 2LRTA 5HR0A 2FWGA 4I5QA 1A2JA 4MH3A 1F9MA 3BOAA 1GWCA 1GRXA 3QFAC 1G6WA 4I6XA 4F0BA 3ZITA 1AIUA 3KGKA 2F8AA 3H4KA 3GURA 4RQXA 1T00A 1EP7A 1O73A 4PGTA 4HDEA 1UN2A 5HFIA 4GCIA 2LNTA 4WEYA 1FB6A 2CT6A 3WYWA 1OC8A 4HU9A 5G1KA 2OBKA 4EF0A 1M9AA 1GNEA 1XW5A 3ZLPA 1N8JA 1YQ1A 3O76A 5ECHB 1SKSB 4GSSA 2YWNA 2AYTA 2EIOA 4EO3A 3SBCA 1SENA 4K0NA 1GUMA 2D2ZA 5COHA 3DYRA 1GSUA 5G1LA 4ULXA 2HFDA 5J3RA 2OE3A 3EVIA 1TDIA 5FHIA 1NSWA 3H8QA 3FW2A 3ZVJD 4TR1B 1R26A 3BBYA 1OC9B 1M0UA 1V40A 1DSBA 5IOXA 1U3AA 4LMWA 2P5QA 2C0DA 2DJKA 2H30A 3GNJA 5B8BA 2G2QA 2GSRA 2VCWA 4AJ8A 2B3SA 2AJQB 3HYPA 2WGRA 5KEJA 1THOA 4H86A 2RM6A 1ZGNA 3KEBA 4WF4A 5CREA 1XWKA 3TJKA 1O81A 2R37A 3V1WA 4NXIA 5IIZA 2PVOC 2AB6A 1PN9A 2XC2A 3LSZA 3DEXA 2DJ3A 5HQPA 3IK9A 3KP8A 1PX6A 1O6JA 2GS3A 2JADA 2K8SA 5JCUA 3VWUA 3KH9A 5AIXA 1GSEA 2WJUA 2H1DA 1XBSA 5D9VA 1XCCA 2IPAA 4K6XA 3DVWA 2H1GA 4JEDA 4TOPA 2CAQA 1Q4JA 2JZRA 1XOAA 3TRQA 1SD8A 2HRNA 3EWLA 3KH7A 4N30A 4Z7XA 3ME8A 4XTSA 5JWOB 4Q5RA 1YF1A 1GLQA 4RQRA 1K0AA 5CRGA 3CBUA 1OE8A 1YF0A 3O6TA 2OACA 4I2TA 1N2AA 3ZFBA 2L5LA 2GZYA 4ZILA 5IMDA 4KAEA 4BL7A 5ECPB 4PXOA 1ZMAA 1SL2B 4K1FA 2CAIA 3TKSE 3ZL5A 3HZ4A 3WD6A 1ZOFA 4TKYA 1Z7RA 2NDOA 4JU5A 1MTCA 2VL3A 3GFKA 2O89A 2BJXA 3LWAA 4PNGA 5ELAA 1TXXA 4PUFC 3H1NA 3DKSA 2JZTA 5EY6A 3CYNA 1BX9A 3I6AA 2YWOA 2IMIA 1URMA 2IFQA 3P8WA 4OFMA 1XIYA 3LORA 2L6DA 2E0QA 3KJYA 3FKFA 2VCQA 2WS2A 3PINA 2L6CA 5C00A 3GMFA 4HQSA 2LTKA 2C0EA 5IOWA 1PL1A 3HXSA 4ZB6A 1BQ7A 1FB0A 4WXTA 3JCML 1TRVA 1SL0B 4ACSA 4GSTA 3ZMKA 3G7YA 1GSQA 1MDJA 4IJIA 5C04A 1Z3EA 1GSFA 2B5EA 2HSYA 1AQWA 1T4ZA 3HVXA 4LLRA 3DRNA 4KSOA 2OKAA 1Z6MA 5GAPD 2IN3A 1UA5A 1M7TA 3W8JA 5IM9A 5J5NA 5FT3A 1PRXA 5DALA 3CRUA 2VLUA 3LQ7A 3UVHA 3L4NA 1ERTA 4IVFA 3TOUA 4GRFA 3C71A 3ZFLA 1PKZA 5AISA 1TRUA 3G7JA 3L9SA 1EWXA 5CRDA 3A5WA 3LGCA 1VF4A 3LYPA 3WT2A 2C3TA 3LFLA 16GSA 4V1Ag 3GL5A 2VO4A 1QK8A 2LQQA 2YJHA 4XS4A 3NZNA 2EIQA 2HZFA 1SJIA 5AIVA 5G5FA 1OC3A 2TRCP 5J9BA 1SK1A 3F63A 2JACA 1B4PA 3D21A 3HZ8A 1JZWA 3FK8A 2VM1A 2HYXA 4HZ4A 5CRHA 1PD21 1EEMA 1UC7A 2WRTA 1F3BA 3IK7A 5DJLA 3UBLA 4AJ7A 3EURA 1B4QA 1Z9HA 4ZL9A 5DAKB 1GLPA 3FZAA 1QXHA 2GLRA 4BWQA 2IWTA 1ERVA 5KN2A 2MZCA 1FOVA 3QAWA 3MDKA 4D73B 2GVPA 1EOHA 3G7IA 3GHAA 4V2NA 4BWSA 22GSA 4IP6A 1OVNA 6GSTA 1SJ6A 5B6MA 2L59A 4F9ZA 5J4UA 2E2MA 2V41A 2H73A 1YZXA 4O32A 3CTFA 4GLTA 1WE0A 1GSSA 1PL2A 2B7JA 3KD0A 2O7KA 1GULA 3D6IA 1JLWA 3GYKA 3SWLA 2RUFA 2YZHA 4YAVA 3UIWA 2GQLA 2H74A 1U88A 3U5RE 3HKRA 19GSA 3IR4A 3PR8A 2IJYA 2O87A 1GTAA 1YDKA 1NHOA 3QDNA 3I43A 4POBA 6GSYA 5ID2B 5ECKB 4MDCA 2IMFA 1B8XA 5ECRB 2VD0A 1PMTA 1I5GA 1EGOA 4YQUA 3TKSA 3IRAA 3C1SA 5AGYA 2GSQA 1R4WA 3A3TA 1O85A 5F05A 3KTLA 2KOKA 4KW6A 3FR9A 1X9SB 1E2YA 1H4OA 3RBTA 1JHBA 1YJ6A 3P90A 4MJCA 2TIRA 2IMDA 1DUGA 4X43A 2C0FA 1MEKA 4FIWA 4PNFA 1SYXA 1VF1A 1JFUA 2BTOT 5DCHA 5EPFA 4TR1A 1QQ2A 3F3RA 2AHEA 5CP1A 4MPFA 1K0BA 2LJAA 3E0UA 2VOCA 4IQ1A 3TJGA 2H6XA 3CSIA 2JL4A 5IMCA 1VRSD 2DLXA 2GTUA 2MMAA 1GTUA 1V98A 5F0GA 4K2DA 2L4CA 11GSA 2X8CA 3TB2A 1NM3A 3KZQA 3M9KA 4HS1A 3HHVA 2O85A 2FGXA 3L9UA 1R7HA 4NHWA 1T7PB 5F07A 3TJFA 1K0OA 5JWQB 6GSXA 1VF3A 1V9WA 5CYYA 17GSA 2LRNA 4MZWA 4E8EA 3GH9A 2R3XA 4RI7A 5D93A 3W8SA 8GSSA 3EE2A 2VCXA 3IA1A 1S3DA 1WRYA 4WF5A 3FHKA 1TRWA 1R5PA 1B9YC 3E3EA 2H66A 1TK0B 2X8GA 1ML6A 1AC1A 2REMA 2DJ2A 1WOUA 3FRCA 4CHSA 4WBRD 1X9MB 1HD2A 3F3QA 3M1GA 3ZMLA 1ZZYA 3ERWA 1ERUA 2VCZA 2HRFA 3DWVA 3NOFA 2L5OA 2YPMA 1YY7A 2R5GA 4I8BA 1SKRB 2F8FA 2F51A 4YAPA 2P31A 2LRCA 3HD5A 1WJKA 4ISDA 3ZRDA 1EP8A 5ECQB 4NAXA 5L71A 4RI6A 3RPPA 3S9FA 3GSTA 2B7KA 1HQOA 3UJ1A 2I81A 2LS5A 1A2LA 5B6NA 4MP4A 3D4MA 1UVZA 1GL8A 3EYTA 3HJOA 4G19A 3ISOA 4AJ6A 2J9HA 1EV4A 2VCVA 1FW1A 5D9TA 3TJJA 5F8BA 3ZVJA 1WPIA 2LKUA 1TI3A 3LXZA 5FWGA 3KTBA 3IC4A 2XPEA 4IJ3A 5IQYA 2MMZA 1FO5A 2FUG2 4G10A 2L4QA 20GSA 3WGDA 4NV2A 2V1MA 3CSHA 1AAZA 1M99A 4RUVA 3HY2A 2GT5A 2GQMA 5D9WA 4DSSA 2OJLA 3VK9A 3MNGA 3AY8A 5IPGA 4N0VA 3GH6A 1U3IA 9GSSA 1Y25A 4OWYA 2DIZA 1GUKA 2VAFA 1ZYEA 2OE0A 5ENUA 2IIYA 3CMIA 2CVDA 5CO3A 1TK5B 3PGTA 2FWEA 2LJKA 2LV3A 4ZIJA 2A4VA 2RM5A 4TW5A 2I1UA 4KUNA 1ST9A 3GKKA 3A2VA 3LEFA 4HI7A 1BEDA 2AV4A 1ZCPA 4GTUA 5B7CA 2F3MA 2VL2A 2M80A 2CX3A 3W6GA 1LU4A 5EL8A 3TKSC 4PQHA 5J41A 4MH2A 4TR4A 1I9DA 4OCEA 3TUEA 2N5FA 3DMLA 5HFKA 2ZNMA 2C80A 4F0CA 3F0IA 4TXOA 5LCZA 1R5AA 4XRAA 1TU8A 3KMOA 4L8EA 2V2GA 2LQOA 4F03A 3Q19A 2VD1A 3IV4A 5J9CA 4EUYA 1ZYQB 2LEGA 2KP2A 3KIJA 3TGZA 3D4TA 2YWIA 1XVWA 4O92A 4JR6A 1YKAA 1YEPA 3GTUB 1SL1B 2RLIA 3D0ZA 1CQHA 2FWFA 3CXGA 3QOUA 1GSYA 4GWRA 4EVMA 1SYRA 1OKTA 2L57A 3GA4A 3ZTLA 2B5YA 2ON5A 4EDZA 1O7UA 3KXOA 5GAND 2HI7A 3DGQA 4EDYA 14GSA 4TXVA 5A4UA 1T1VA 2FWHA 3HVSA 1M9BA 3ZZXA 2HE3A 2H70A 2F9SA 2PMTA 3TKRA 3GV1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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