4O5Q | Genus

Total Genus 168

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	168
sequence length	521
structure length	521
Chain Sequence	MLDTNMKTQLKAYLEKLTKPVELIATLDDSAKSAEIKELLAEIAELSDKVTFKEDNSLPVRKPSFLITNPGSNQGPRFAGSPLGHEFTSLVLALLWTGGHPSKEAQSLLEQIRHIDGDFEFETYYSLSCHNCPDVVQALNLMSVLNPRIKHTAIDGGTFQNEITDRNVMGVPAVFVNGKEFGQGRMTLTEIVAKIDTGAEKRAAEELNKRDAYDVLIVGSGPAGAAAAIYSARKGIRTGLMGERFGGQILDTVDIENYISVPKTEGQKLAGALKVHVDEYDVDVIDSQSASKLIPAAVEGGLHQIETASGAVLKARSIIVATGAKWRNMNVPGEDQYRTKGVTYCPHCDGPLFKGKRVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVEHVTLLEFAPEMKADQVLQDKLRSLKNVDIILNAQTTEVKGDGSKVVGLEYRDRVSGDIHNIELAGIFVQIGLLPNTNWLEGAVERNRMGEIIIDAKCETNVKGVFAAGDCTTVPYKQIIIATGEGAKASLSAFDYLIRTKTA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit F
publication title	Structure, mechanism and ensemble formation of the alkylhydroperoxide reductase subunits AhpC and AhpF from Escherichia coli pubmed doi rcsb
total genus	168
structure length	521
sequence length	521
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-12-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00070	Pyr_redox	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
A	PF13192	Thioredoxin_3	Thioredoxin domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.80	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4o5qA01
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4o5qA02
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4o5qA03

2A89A 3DJDA 1MXTA 1TRBA 2RGOA 2X8CA 2WQYA 4TM1A 5BULA 3UTFA 2BXSA 4B63A 2Z5XA 3DJGX 3Q9TA 4NEVA 3AECA 4Z26A 4K22A 4AP1A 1LTXR 1ELIA 2EQ7A 2XFNA 1BGJA 2F5ZA 4OPLA 4CCRA 4B65A 3DH9A 2XVFA 1D7LA 1V59A 1TDFA 1D4DA 1K0IA 2UZZA 3AEFA 1PJ6A 5CQFA 2V60A 3CNTA 3DK8A 3EPTA 4OPCA 4XWRA 4YSZA 1ZKQA 2VVLA 2XFPA 4A6NA 1EL8A 3LZXA 2WEUA 1VQWA 3QSEA 2IIDA 3CPIG 3ICTA 1CJCA 2XLUA 3ITJA 2Q7VA 3CN8A 3M13A 3SFDA 1PJ7A 1GRTA 3NLCA 1Q9IA 3GRSA 5TR3A 2YVJA 3DMEA 4X9MA 1NPXA 2XYOA 2V3BA 1GTHA 4LIIA 1ZDLA 5JCKA 4U8JA 3UOXA 2GMJA 4UP3A 3IC9A 3BI5A 3G5QA 1OJAA 1D5TA 1PS9A 3ALJA 3LXDA 3GMBA 4U2TA 3AEEA 3DA1A 2GMHA 1S3EA 2C75A 3NN0X 2YVFA 4EMJA 4H4ZA 2FJDA 5BUKA 4CBQA 1O95A 3C96A 4J57A 1EL5A 3P1WA 2GH5A 2WBAA 2TMDA 2BK4A 3FBSA 2X99A 2WP5A 2BS3A 3I3LA 4NTDA 1LJ1A 3SQPA 1QO8A 2C67A 3NH3X 4MNNA 1DOEA 4H4YA 2ACZA 1GRGA 3CGBA 1VDCA 3AYIA 3B3RA 4A5LA 4JDRA 2VVLG 4Z44A 3CGCA 1KSSA 2XVIA 3F8PA 4Y4LA 1ZP0A 2YG5A 4OPIA 1AOGA 1GPEA 3ICRA 4NEWA 4RSLA 4BK1A 4GDEA 1BKWA 3CNDA 1IUWA 3UKFA 1L9EA 3E1TA 3UKKA 3V3OA 2JKCA 2EQ6A 3AE3A 5HY5A 1N4WA 1VG0A 3AXBA 3P9UA 2GR3A 2YAUA 2C76A 3LOVA 2B7SA 3ICSA 3LZWA 3NTDA 3AE6A 2GR1A 3KD9A 2B76A 4C3XA 4IV9A 1B37A 1GRFA 4AOSA 3RNMA 1KFYA 1PJ5A 4A99A 3CTYA 4CY6A 2V3AA 2BC0A 2C70A 2R46A 1PHHA 4PAAA 2C73A 1ZX9A 2BS4A 4JN9A 3NK0X 4O5QA 3BHKA 5L46A 2Q6UA 2JB3A 3BHFA 4BJZA 3ALLA 2O9ZA 1S3BA 4Y4MA 1NG3A 1N4UA 2OAMA 4A9WA 1NEKA 3V3NA 1IUUA 5KOWA 1F6MA 3IF9A 1L0VA 1XPQA 1D4CA 2BXRA 4O5UA 1QLBA 2CVJA 5IQ4A 1OJDA 2VZ2A 3UTEA 4ECHA 3ATQA 1OJTA 4IA5A 3SGLA 5JCLA 1LQTA 1B8SA 2Y6RA 3KPFA 2YLSA 1QJDA 4K5SA 4OPUA 1E6EA 4CNKA 4NTEA 5GRTA 3NK1X 3FG2P 1N1PA 1IUSA 1OJCA 2C64A 2VQ7A 3M0OA 4K7ZA 1NHSA 3GWDA 4NZHA 4YSHA 2VOUA 4K8DA 2ZZCA 2R0CA 4C74A 2PYXA 1CC4A 3ZYXA 2FJEA 5BVAA 4JY3A 3FIMB 1CBOA 2C3DA 1D7YA 2X8HA 3GSIA 3KA7A 1F8SA 5J7XA 3SFEA 3NIXA 1NAAA 4A65A 1GRAA 3NYEA 1O94A 2CULA 3NT6A 4GDPA 3AE4A 3GDNA 1FOHA 1N4VA 1ZY8A 1KNRA 3UOZA 4D03A 1W4XA 4Y4NA 1ZOYA 3CPHG 2YG3A 1DOBA 1E1KA 4IVMB 4IA6A 1H84A 2RGHA 4B67A 2JBVA 4K5RA 4WX1A 3QVPA 2YG7A 2YR5A 2CDUA 2OA1A 2WPFA 3CNPA 5EBKA 5KVHA 4YT0A 4OPDA 4OPTA 5M0ZA 1XANA 1EBDA 1CC2A 3BNUA 4C5OA 1B4VA 2ZZ0A 3AD8B 3K7QX 4A7AA 2GQWA 3REDA 1GALA 2PHHA 5HXIA 2XVHA 4TLZA 1GRHA 2QA2A 1VRQB 4EM4A 1B5QA 1PXCA 2XDOA 2BA9A 1TYPA 1Z6LA 2H88A 5JCIA 4Z2UA 4CRTA 3AYJA 3GYJA 3S61A 2GEWA 2R4EA 3CNJA 2YLRA 1JEHA 1IUXA 3PVCA 4USRA 2ZZBA 4FX9A 3AB1A 3II4A 4J31A 4YTPA 3QJ4A 4EMWA 3OZ2A 1RYIA 4B68A 3QSMA 4C77A 4H4XA 1LVLA 2NVKX 3ABVA 4J56A 1FEAA 2BK5A 4CCQA 4H2QA 1IUVA 4P9SA 1ZYPA 3P4RA 2JB1A 3KVEA 1H81A 1XHCA 3KKJA 4FDCB 2B9XA 2EQ9A 3NTAA 5KWFA 4BJYA 3UTGA 2BABA 3CIRA 3G5RA 1GESA 2WOIA 5C2TA 4YKGA 4YSXA 1Q1WA 2GAGB 2AAQA 2XFQA 5FS7A 1CF3A 3M12A 4I59A 2BCGG 1F8RA 3AE2A 2GRTA 4J2WA 2JB2A 3PS9A 2WPEA 4I58A 3CPJG 1GTEA 5IQ1A 1H6VA 2ZBWA 3I6DA 3QSSA 4DSHA 1P2EA 2BCPA 2I0ZA 2WESA 2WU2A 2IVDA 2E5VA 5JCNA 4H4PA 4H4WA 5LV9A 4Z43A 2GB0A 2WHDA 4TM4A 5EB5A 3VQRA 2QAEA 1EL7A 4U2SA 4U8NA 3AD9B 2DKHA 2NPXA 4AT0A 3COXA 2JK6A 1GREA 1PBFA 1CL0A 5J60A 3AYLA 2GR0A 1JRYA 5EOWA 3FMWA 4APNA 2BS2A 4Z2RA 1PXBA 1KF6A 3GD3A 2YR4A 3RP6A 1KSUA 1PBBA 3BI4A 3UCLA 1K0JA 1CJ4A 1JOAA 2H89A 2WDQA 3AE1A 3FPZA 3IHGA 4GUVA 1IUTA 4WCTA 3CGDA 3RP8A 1Y0PA 3NHOX 3D1CA 4GCMA 3VR9A 2XVEA 3GRTA 1COYA 1RP0A 2VRLA 3JSKA 1KNPA 5KOXA 4K2XA 1E39A 1H82A 1L9CA 4AP3A 1YKJA 2XLTA 1FECA 4JNAA 2RABA 2XCGA 3DJEA 3AE5A 2W0HA 2V61A 3NRNA 2E1MA 1BF3A 2EQ8A 3WE0A 1BZLA 1FL2A 5C3JA 2YLWA 1PXAA 1CJ3A 1M6IA 1MOKA 1TDNA 2AQJA 3ALMA 3L1RA 4BK2A 3V76A 3UKQA 3NNEA 1YY5A 3QFBA 3RHAA 1ZYNA 2A8XA 1FCDA 2GAHB 2WDRA 1LPFA 4H4SA 4OCGA 2GV8A 3NKSA 2XLRA 3UKAA 5FS9A 2AR8A 2IVEA 3T37A 2A87A 2XLSA 4ZCCA 3DK4A 3O0HA 1FEBA 3PO7A 1PBEA 3VRBA 3C4NA 2WP6A 2ARDA 1JNZA 4EQRA 4REKA 4GRTA 3LJPA 2YM2A 2YWLA 4Z24A 1O5WA 3SM8A 3L8KA 5BRTA 2YG6A 4JNQA 2YG4A 2WS3A 2V6OA 3NYFA 4GF7A 4IVOB 1H7WA 4BV6A 5KVIA 2V5ZA 2YQUA 4EQXA 4YXDA 4YWOA 1NHRA 1RSGA 1ZMCA 1JRZA 3KLJA 4UDPA 1GNDA 2QCUA 3HZLA 4YTNA 1F3PA 5U25A 1NDAA 3H8LA 2Z5YA 2BYBA 3CNSA 4H2NA 2FBWA 4U8MA 3G5SA 5KRQA 4YKFA 3CGEA 5JCMA 2C3CA 1F8WA 3VRAA 3AE7A 1VG9A 3GMCA 3NN6X 4H2RA 1UKVG 1IJHA 1LQUA 1SEZA 3QVRA 4E0VA 1K0LA 4JQ9A 3UKHA 2R45A 3EAOA 1X31B 1ZMDA 4H4UA 4J36A 1H7XA 4H7UA 5IPYA 2WPCA 3C4AA 1CHUA 2GR2A 1DODA 4TLXA 4B1BA 3H8IA 3NG7X 1E7PA 1K4QA 3AWIA 3UOYA 1DNCA 3GYIA 2YLZA 4B66A 2WDVA 4EQSA 4H4QA 4FK1A 4J34A 3BNMA 1YQ4A 4EQWA 1DJNA 2QA1A 3VRDB 4B64A 1XDIA 4U8LA 4USQA 3DGZA 2X50A 3LB8A 3UKPA 2GQFA 4C3YA 3AE9A 3BI2A 2WP9A 1YQ3A 3QFAA 4A79A 5KXJA 4JY2A 3UP5A 4DGKA 2XFUA 1EL9A 3AEGA 5HHFA 1S2YA 5HYMA 4H4RA 3GD4A 4H50A 3UP4A 4ZN0A 3UOVA 2E4GA 1GSNA 3P4QA 2YM1A 4CY8A 3K7TA 4X4JA 3UKLA 5CKUA 1GERA 4RG4A 5FS6A 2B9YA 5U1OA 2R4JA 2OLNA 2VVMA 3NGCX 1E1NA 1GV4A 4DNAA 4H2PA 3DGHA 4TM0A 2JAEA 3UTHA 1NHQA 1Q1RA 2C72A 2FJAA 1TYTA 2BK3A 2Y6QA 2HQMA 2YVGA 3P4PA 4GR1A 5GSNA 2GVCA 2C66A 4U8OA 2OLOA 4U8IA 1CJ2A 2YLTA 3NYCA 4M52A 4ICYA 2RGJA 4XWZA 1L9DA 1CC6A 2B9WA 3EF6A 2WU5A 4Z2TA 1JU2A 1HYUA 1NENA 3AD7B 3S5WA 4OPGA 1DOCA 4YSYA 4FK1C 3H4KA 4OVIA 3AEAA 3DK9A 2DKIA 2CFYA 3R9UA 2VRMA 1S2QA 4NTCA 4XXGA 3GWFA 2WETA 2C65A 4B69A 2VQBA 1TDOA 2FJBA 2R9ZA 1Y56B 3B6DA 5FS8A 4ZCDA 3D8XA 4BK3A 3IWAA 5U63A 1E1MA 4YTMA 3K30A 4EM3A 1JRXA 1PN0A 4AOXA 1M64A 4HB9A 2XVJA 3IHMA 4UDQA 1P2HA 1GETA 1REOA 1NHPA 4D04A 1MO9A 4RG3A 4KX6A 2TPRA 1GRBA 1DJQA 4MJWA 4EIPA 4KPRA 1LV0A 4EMIA 3F8RA 2R0GA 4ADWA 3ADAB 2BC1A 1BGNA 3EANA 1H83A 1ZK7A 3ATRA 3LADA 1ONFA 2YLXA 3AEDA 4BURA 3Q6JA 4Z25A 4N9XA 2WOWA 3OC4A 1GEUA 3RP7A 3AEBA 3ZDNA 3F8DA 1H86A 3KU9A 1GXFA 2Q0KA 1KDGA 1TDEA 3K7MX 4U2LA 1Y56A 2X3NA 5EB4A 2YR6A 5DBJA 5ER0A 2J3NA 2WOVA 4TM3A 4X9NA 4U8KA 3NK2X 3ISHA 1JNRA 5M10A 1E1LA 1OJ9A 2Q0LA 2R0PA 3VR8A 2XFOA 2XLPA 4UDRA 3GDPA 1PBDA 1NG4A 2APGA 4H4VA 1D4EA 4EIQA 1PDHA 2BACA 4H4TA 4DSGA 1GT8A 2C7GA 1PBCA 2X8GA 4LU6A 1BWCA 1DXLA 1TDKA 1ZOVA 2B7RA 4U8PA 5FMHA 4A6NB 4CNJA 3P4SA 4J33A 4LA1A 4AT2A 4HA6A 3URHA 2OALA 1YQZA 2GF3A 3DJJA 3AE8A 1GOSA 4PABA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1WE0A 1BQ7A 2RGOA 4TM1A 2IFQB 3HZ4A 3QAGA 3HJOA 3DJGX 3CMIA 3SZWA 2HSMA 2AUVA 5ECPB 2QC7A 4K22A 1YDKA 4MF7A 1NW2A 2DJKA 3DH9A 4WF5A 1TOFA 1PJ6A 5ELAA 5LNKe 3QPMA 2BMXA 3EPTA 2YZUA 4YSZA 2FUG2 3KH7A 2H70A 4OWYA 2XFPA 4A6NA 1DUGA 1PSQA 1AQWA 3ICTA 3M3MA 3M13A 3CN8A 2WB9A 3NLCA 2MBTA 1M0UA 2IFQA 3GURA 1ZDLA 2AYTA 3LWAA 5E4WA 5DQYA 2FWFA 1ZYQB 4N30A 1D5TA 3LXDA 4LL4B 4TR0A 3AEEA 4KAEA 2CVDA 2O87A 2GMHA 1S3EA 2YVFA 2GQLA 3QDNA 3IAM2 4ZB9A 1EL5A 2HRFA 5HFKA 3P1WA 2X99A 4ID0A 1O85A 3SQPA 2NBSA 1GH2A 4H4YA 2L5OA 2IMDA 4IELA 5IMCA 2ACZA 5J4UA 1VDCA 1SK2A 1XW6A 4GRFA 3FR6A 3HXSA 3AYIA 2PVOC 3SBCA 1U6TA 4Z44A 4XS4B 3CGCA 3F8PA 1BKWA 6GSVA 5KMQA 1FW1A 4AGSA 4MZWA 3TRXA 4I6XA 1XXUA 1ST9A 2JKCA 5HY5A 3AXBA 2GR3A 2REMA 3LZWA 4HSCX 2GGTA 3CTFA 3HY2A 1K0MA 3PINA 2B76A 4C3XA 1Q4JA 4IV9A 3RNMA 1KFYA 1PJ5A 5CRHA 2C70A 4IQAA 5A4WA 1ZX9A 3Q74A 1NHOA 1ACVA 4O5QA 4I5QA 5JCUA 4XS4A 1DE2A 1N4UA 4XHMA 3D6IA 4EXJA 1D4CA 1MDKA 4O32A 4NWZA 2VLVA 3UTEA 3UJ1A 3ATQA 5F8BA 4YH2A 2NDOA 3CXGA 5JCLA 1LQTA 1V2AA 2C0GA 1B8SA 1QJDA 5ECKB 5J9BA 4NTEA 1BX9A 1N1PA 2MZCA 2N5FA 2C64A 3FY7A 3CSJA 2VQ7A 4K7ZA 4OCEA 2VOUA 3C73A 2ZZCA 2R0CA 3FZAA 1CC4A 2PERA 1OE8A 5BVAA 3FIMB 5D9XA 1CBOA 2C3DA 3KA7A 4KCAA 4MZBA 5J9CA 2K18A 1NAAA 1TI1A 2H73A 2L4QA 1GRAA 2DSAA 3NYEA 1USBA 4HJ2A 4ZBBA 6GSXA 3NT6A 1RW1A 1ZY8A 1KNRA 3TKQA 1ZOYA 3A5IA 1DOBA 4IA6A 4O92A 4B67A 3DKSA 2OA1A 4HU9A 4OPDA 3LXZA 3QAWA 1CC2A 3GKKA 4C5OA 1B4VA 2CV4A 4EUYA 3NIVA 5JCWA 1GALA 4I2TA 2KOKA 2QA2A 1PXCA 2XDOA 4YAVA 3MDKA 3AYJA 3UBKA 1C72A 3BJ5A 3CNJA 3CYNA 4KUNA 2ES7A 1ML6A 4USRA 3I9V2 3AB1A 3SZ0A 5ABRA 3ABVA 3PH9A 3L9SA 4CCQA 1BEDA 2PPTA 1ZYPA 1XIYA 2JB1A 1XHCA 2B9XA 5F05A 2F8AA 2OA7A 5C2TA 2O8VB 4YSXA 4IQ1A 1ZL9A 2XFQA 3SXIA 3SZCA 3PS9A 4I58A 3CPJG 3QSSA 4DSHA 2I0ZA 4J56E 2E5VA 4H4WA 2B1LA 2WHDA 5EB5A 2GT6A 1OC8A 4AT0A 3ERWA 5J60A 3L78A 1JRYA 3ZMKA 4APNA 5KN3A 2BS2A 3MAKA 1KSUA 3FPZA 1OVNA 3ZVJA 1SK0A 3CGDA 1WRYA 3N5OA 4RI7A 5AN1A 2HYXA 3GRTA 2VRLA 5KOXA 4I2UA 2LJKA 1H82A 2YNXA 4XIHA 4JNAA 2WGRA 4GTUA 2VCQA 3KTBA 3NRNA 3C71A 2EQ8A 1BZLA 1FL2A 4DEJA 4ZILA 1IYIA 1T3BA 5GAND 4FYBA 1M6IA 1SKWB 3NNEA 1YY5A 3QFBA 5DQSA 2A8XA 4H4SA 3HYVA 3VPQA 4F03A 1JZRA 4H86A 3T2YA 12GSA 2A87A 1BAYA 4N10A 1G0TA 2YWMA 3KP8A 3DK4A 1FEBA 2NVLA 1EP7A 1PBEA 5EY6A 1YZXA 2WP6A 3C1RA 1JNZA 4EQRA 4MF5A 3GUSA 3GL3A 1B4PA 1M9AA 3M9JA 2YG6A 2YG4A 2WS3A 2G2QA 2VIMA 3NYFA 1QGVA 2X4AA 4GF7A 4YXDA 2M80A 5KVIA 4RQXA 3IHQA 4EQXA 1Z7RA 4YWOA 4NNJA 2FHEA 5HR3A 5CO3A 3RHBA 4E8EA 2BYBA 5KRQA 1GRXA 3TRPA 6GSSA 5KN2A 3VRAA 2L4CA 4YQMA 1IJHA 5CRGA 5COHA 4MA9A 4KF9A 1HNBA 1K0LA 4NMUA 3UVHA 3CMMA 1ZMDA 4ECJA 1SKRB 1O8WA 2WPCA 4ML6A 3C4AA 4B1BA 3QFBC 1QFNA 1GUKA 3I6AA 4WKWA 1WOUA 1E7PA 1K4QA 3UOYA 3DD3A 2YPMA 1NM3A 4H4QA 2GZYA 17GSA 1AAZA 2YV7A 3ZMLA 4BWSA 2HT9A 4J34A 2MBSA 2VOCA 1Y25A 3BNMA 4EQWA 4IHUA 5ENUA 3KM6A 3TCOA 2X50A 3LB8A 3UOMA 3AE9A 3BI2A 4F0CA 2WP9A 2CX3A 4A79A 6GSTA 2L57A 2JZTA 5AGYA 2XFUA 4H4RA 4Q5FA 5EPFA 4TN8A 1GSSA 2HXKA 2VAFA 5G2ZA 3K7TA 4ZB8A 1GERA 3KEBA 2ZNMA 2R4JA 1QMVA 5G1KA 2VVMA 1E1NA 5INYA 4FYUA 1NHQA 2FJAA 1YEXA 4GR1A 3P4PA 2JL4A 2KHPA 3D4TA 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chains in the Genus database with same CATH topology

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4O5QA

Total Genus

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