4HEA2

Crystal structure of the entire respiratory complex i from thermus thermophilus
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
178
structure length
178
Chain Sequence
FFDDKQDFLEETFAKYPPEGRRAAIMPLLRRVQQEEGWIRPERIEEIARLVGTTPTEVMGVASFYSYYQFVPTGKYHLQVCATLSCKLAGAEELWDYLTETLGIGPGEVTPDGLFSVQKVECLGSCHTAPVIQVNDEPYVECVTRARLEALLAGLRAGKRLEEIELPGKCGHHVHEVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADH-quinone oxidoreductase subunit 1
publication title Crystal structure of the entire respiratory complex I.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 178
sequence length 178
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.6.5.3: Transferred entry: 7.1.1.2.
pdb deposition date 2012-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
2 PF01257 2Fe-2S_thioredx Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1590 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4hea201
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hea202
4FO5A 1TW9A 2J23A 2L6DA 4X1UA 1I5GA 3WT2A 1FB0A 1PA3A 2FCHA 1TK5B 1K0AA 2PGTA 2GZPA 1XCCA 5H5SA 2H6XA 1ZYQB 2LUSA 4KSMA 2DJJA 4KB3A 3LXZA 3NOFA 2YZHA 3TGZA 16GSA 3CSHA 5JCWA 3TKPA 1E2YA 5CNWA 2P31A 1XWAA 4KCAA 2ZUPA 5ECNB 2B5EA 3QDNA 5B8BA 4TRXA 4POKA 2LV3A 4GWRA 4MK3A 2X8HA 2VOCA 3HVSA 2B1LA 1SENA 2IL3A 4RQRA 2QC7A 10GSA 1GSQA 2VL3A 2H75A 2REMA 3KMNA 3TRXA 13GSA 1PGTA 1EV4A 1UVZA 3TB2A 4JZQA 3ZLPA 1XW6A 3CRUA 3F8UA 3EYTA 1MTCA 4LLRA 2R37A 3PINA 2A2RA 4J57E 3ZVJD 5GSTA 2IMDA 1KBNA 1PMTA 5JCUA 1YKAA 6GSUA 3QFBC 4CW9A 2LRNA 2VIMA 1AC1A 2CV4A 1TRUA 3VWWA 1LBKA 2XPDA 2ES7A 4IP6A 2O87A 1S3DA 3L9SA 2DJKA 3I43A 2GT5A 3FRCA 5IO2A 4N10A 2CAIA 3DXBA 3S9FA 3GNJA 3TRQA 1F3BA 4WETA 2LQOA 4PQHA 3F6DA 2NBSA 2H30A 4DSSB 3H93A 3TKSC 1F2EA 4POLA 3UVTA 4GTUA 1BEDA 2PN8A 2VL2C 1BAYA 1GSEA 3APOA 2WRTA 2M72A 5AGYA 2VO4A 3EU3A 2LNTA 4XTSA 1M9AA 5GZZB 1K0MA 3QCPA 1T4YA 1YF0A 2X64A 5KN0A 2KHPA 1R26A 2L4QA 5A4UA 4HS1A 3L4NA 3HDCA 2IFQA 3ZMLA 5D9WA 5CYYA 5DALB 2C0GA 2I3YA 4NHZA 5CRWA 5ABRA 1J08A 1K0NA 4DVCA 3TOTA 4HQSA 2HSHA 2K8SA 1XFLA 1PKWA 2H0GA 4TVEA 3TJBA 5ECPB 4OCFA 4Q5RA 1PKZA 1QUWA 3FR9A 2F8FA 3WGEA 4MPFA 1H4OA 2H72A 2HZEA 1PQNA 1DE2A 1XWKA 4NXIA 2K8VA 4IGJA 1N2AA 2VCWA 3RDWA 3VWVA 1A8YA 3CRTA 4LMVA 3D0ZA 3WYWA 1N8JA 1GULA 3P90A 3HHVA 1YQ1A 3LWAA 5C04A 3BJ5A 1OKDA 4XS1A 1AXDA 5LD0A 2TRXA 4MCUA 2YZUA 3KM6A 4JU5A 4Q5NA 5DDLA 3GV1A 4GSTA 1JZRA 4FYCA 1A2MA 2H70A 1NM3A 3DWVA 4HI7A 1T1VA 3KP9A 2C0DA 4JR4A 1A0RP 4WF4A 3UVHA 4YAPA 1USBA 1EWXA 4HEA2 5HR2A 2BJXA 4XS4A 2AHEA 1GTIA 4HJMA 4TXVA 2CX4A 1A0FA 5KN3A 4JEDA 2OBKA 3ZITA 3DD3A 2DMMA 2VCQA 2FA8A 4HZ2A 3FHKA 3N9JA 3GURA 2AB6A 3OR5A 1ERUA 1UN2A 2FLSA 2MMZA 3VPTA 4GRFA 4QQ7A 4NHWA 2HYXA 3F3QA 4HU9A 4MZCA 4NPBA 5AN1A 3Q19A 1ZYEA 1SD8A 2XPEA 3VK9A 5IMDA 1Y6EA 1AIUA 1XWBA 3LYPA 3L78A 5IMCA 3VFIA 2VLVA 2NDOA 2H1BA 2CA8A 4BVXA 3A5WA 1EOGA 3QAGA 5JWQB 2KUCA 5DCHA 2V41A 2CVDA 3QMXA 1AAZA 3ZVJA 3MWHA 1F3AA 1BJXA 5HR1A 5FT3A 3LG6A 3M3MA 3ZIVA 2GT6A 4AJ8A 1ABAA 4XS6A 3G7IA 4XRAA 1HNCA 1OC8A 3DYRA 2M80A 3P2AA 1VRSD 3ZFBA 4L5LA 2L4CA 4F03A 3LEFA 1GSDA 2C1YA 2IJYA 5D8IA 2CAQA 2E2GA 1AUCA 3O3TA 1A2LA 3CSIA 3JCML 4KAEA 2LRCA 3GTUA 2VL9A 1UC7A 3KIJA 5F06A 3UEMA 1GUMA 4GLTA 1GSSA 2I4AA 4V1Ap 3H8QA 2P0GA 1XOBA 5D9XA 2V32A 1ZMAA 4N0VA 2AAWA 3IHQA 5HR0A 4HZ4A 5G1KA 1WWJA 5ECHB 5G30A 2V6OA 3RAZA 5EL8A 1MD4A 2F3MA 4PNFA 4IKHA 3IPZA 1Z9HA 3GIXA 1M9BA 2XC2A 2JSZA 3FZ4A 4IQAA 2FY6A 3H1NA 4KA0A 3DEXA 2D2ZA 4EDYA 5HFKA 2B7KA 1SKWB 11GSA 4KUNA 4MZBA 2HXKA 2GSTA 1SYRA 2J9HA 2DBCA 3ME7A 3LGCA 1RK4A 4E8HA 1NHYA 2G2QA 5EY6A 2DIYA 4G2EA 3VURA 3I69A 3HZ4A 4EVMA 5DJMA 2DSAA 3IK7A 1R7HA 2OE1A 6GSXA 4HUAA 1QGVA 1OE7A 4EDZA 2VL2A 4YQUA 1O8XA 4I6XA 2I1UA 1B8XA 1VF2A 3F3RA 2EC4A 4PNGA 4J56E 3WT1A 1E6BA 2WDUA 4KCEA 4K9ZA 1K3YA 1SKRB 2HI7A 3BCKA 3QFAC 2VUPA 3EE2A 1WJKA 1MDIA 1U3AA 2N5AA 4HU7A 1EEMA 1W4VA 3O76A 1EOHA 3EVIA 2YP6A 1B4PA 4CHSA 2N5BA 1O81A 1SD9A 4OWYA 1M7TA 5DQYA 3TJGA 3HY2A 1JZDA 5ECKB 3E0UA 2C3QA 1Z6MA 4MF7A 3VPQA 4JR6A 2P5RA 2V1MA 5JCGA 3EMXA 3LYKA 5G5EA 1V9WA 4GQFA 1SJIA 5DJLA 2FNOA 2PERA 3CTGA 4ID0A 2PBJA 2O7KA 1SL2B 1KTEA 4DSQA 3MDKA 3GKKA 3SWLA 1GSFA 1OE8A 2EIOA 4IQ1A 2WZ9A 1Z3EA 3HKRA 5ELAA 3D22A 2E2MA 3GL3A 3TUEA 2VLUA 5J9BA 2H1GA 5J3RA 3WGDA 1PL2A 2HNLA 3ZRDA 4IHUA 1ACVA 1M0UA 2H76A 4G19A 5A4WA 2OA7A 3GN3A 4TR1B 4MJEA 4PURA 2O85A 4MDCA 3H79A 5G2ZA 5H5QA 4WBJA 5DAKB 3AY8A 1ML6A 4V2MA 2RM6A 1X5CA 4MMMA 1YJ6A 4TW5A 3M9JA 4MJAA 3LFLA 2R6KA 2QGVA 4ECJA 2IMIA 3QOUA 3MAKA 2WULA 4ISDA 1XWGA 1ON4A 2NVLA 2CVBA 1SU9A 4F0BA 1EP8A 1TI1A 3HJOA 2LJKA 5GAND 1XXUA 2AUVA 5D93A 4ULXA 5ECSA 2FHEA 1M2DA 2QKEA 4RI7A 1V98A 2DIZA 4FIWA 2OKAA 1TRVA 2IMEA 1SJZA 2JZRA 4OCEA 4HOJA 4KE3A 2LKUA 3F63A 1DUGA 4FYUA 5G1LA 5IO0A 3HA9A 3KH9A 4ILFA 1LU4A 2L5LA 4DSSA 2TIRA 4DSRA 2DMLA 1T3BA 2IIYA 2Z9SA 4OFMA 1T8EB 2IMFA 6GSYA 2FA4A 5CP1A 5IMFA 3EU4A 1FG4A 2F9SA 1PL1A 2GS3A 3VI5A 1SJ6A 1NHOA 4LL1B 3KXOA 1U3IA 4TN8A 3G9BA 5AIVA 1QQ2A 1TOFA 4IN0A 1B48A 4X43A 4RQXA 3GRXA 3IRAA 2YV7A 5DALA 3I9V2 3ME8A 1X5EA 4TXOA 4EXJA 4I2TA 2OADA 4ML1A 3W8SA 2X99A 3C73A 3KGKA 2H66A 4NV5A 3NZNA 4YQMA 2HRFA 4ZBBA 3Q74A 2B5XA 3A2WA 3PR8A 2YOIA 1IYIA 1GNEA 1IYHA 2L57A 1U88A 2NPBA 4LA1A 1A2JA 2MBTA 4MH2A 4ECBA 3WD6A 4EL1A 1XIYA 4KSOA 4WKWA 4G9HA 4LMWA 3G7YA 3P7XA 3UL3A 4LL4B 2NTOA 4CDOA 3D5JA 4EKZA 3FR6A 2A4VA 4KW6A 5COHA 1Y25A 1YZXA 2FD3A 4XHMA 4DEJA 1BYEA 14GSA 3L9VA 1EGOA 4GSSA 4K7NA 1QMVA 3C7MA 1O6JA 3KEBA 5AIXA 4V2LA 1JFUA 3G7JA 4L0WA 1XPVA 2YWMA 1ERWA 1Q4JA 5HR3A 1HQOA 5INYA 2QSIA 1SL0B 2WCIA 2LEGA 1EV9A 1H75A 3CYNA 3ZIJA 2DLXA 1JHBA 3LQ7A 2H71A 1OC9B 3C71A 1GNWA 2C3TA 3F6FA 3UAPA 2GZYA 1JZWA 1PX6A 3FZ5A 1TRWA 4GQCA 3VI7A 3FZAA 2PVOC 3R2QA 2JZSA 2CT6A 1V40A 3CBUA 2CQ9A 1B4QA 4ZL9A 1WP0A 5A5KA 3HJPA 2GQLA 2JZTA 2V6KA 3FKFA 3VLNA 4O7HA 2JL4A 3GYKA 1QFNA 3TKSE 1Z5YE 2I81A 4TR0A 1X9SB 2E0QA 2GLRA 3ISOA 1K0OA 4N0ZA 2M46A 4NAXA 3FZ9A 1JZOA 3M0FA 2JACA 5CAXA 3KD0A 3D21A 2R5GA 4ECIA 3QD9A 2RIIA 4PGTA 1TP9A 2KP1A 2GSSA 2XBQA 1TI3A 4JBBA 3U5RE 1THOA 4XIHA 3TJJA 4K1FA 1MDKA 3C8EA 2N5FA 5DVBA 5ELGA 4YH2A 2K18A 1TU7A 2CZ2A 4J2FA 4ZB6A 2HSYA 1TXXA 2YWOA 3IR4A 4JRRA 2A2SA 1WMJA 5F07A 2AJQB 2FWGA 3LXTA 2H8LA 2JSYA 3D6IA 3DIEA 5IOWA 1K3OA 1VGLA 2VD1A 1TU8A 2WS2A 3FW2A 3FY7A 3W8JA 4AJ6A 2YNXA 4HQZA 1ERVA 3U6VA 1OVNA 3F4TA 4EE0A 1MDJA 1TKDB 3FEUA 2H6ZA 4G10A 3HJMA 4WXTA 2JADA 3ZMKA 3QAWA 1GSYA 5DCGA 2YWIA 1V58A 1TRSA 1R5PA 3UBKA 4PUAA 1WIKA 4F2IA 1K0BA 3RHBA 4ACSA 3UARA 1X9WB 4F0CA 4ZBAA 22GSA 2O89A 4O5RA 2OBIA 1EZKA 1PD21 3QR6A 4D73B 1ILOA 2VM2A 5CRHA 2FWFA 3TKRA 1WRYA 4ZBDA 1Z7PA 1F9MA 3N5OA 3KH7A 1XVQA 2PU9C 3US3A 4Z7XA 1HNBA 5J5NA 5F8BA 5IOXA 2YCDA 2VCVA 6GSTA 1G0TA 4L0UA 5CRDA 5EVOA 2GZZA 2XBIA 5IIZA 1FB6A 2HRNA 1PRXA 2CX3A 2GGTA 4QL9A 5HQPA 3J7Yk 4ZIJA 4MF6A 2WFCA 3M9KA 4EUYA 2H73A 1YF1A 3ZREA 2AYTA 2ALBA 3D4MA 3IK9A 5JWOB 3IC4A 1WOUA 3F9UA 1PSQA 4PXOA 1U6TA 2L5OA 1TK0B 1M99A 2FGXA 4PQ1A 1GTUA 1XW9A 4TR4A 3RHCA 3P8WA 3FR3A 3L0HA 3Q6OA 2WGRA 1ZZYA 4KH7A 2HT9A 4OMVA 5DBQA 2HLSA 2OACA 1DBYA 4RI6A 4H86A 1QK8A 4EC0A 2GVPA 3O6TA 3GKNA 3PH9A 3UJ1A 2R4VA 4Q5QA 5IPGA 2LTKA 2E7PA 2F8AA 2OE0A 5CRGA 5D73A 5J41A 2VCZA 2HFDA 4HJ2A 1VF4A 3K8NA 2B3SA 4XCSA 1MD3A 4N11A 3ERWA 2C3NA 4L8EA 1GTAA 2YJ7A 1FO5A 1O73A 1R4WA 2H19A 1S3CA 3ZFLA 3Q18A 2IN3A 3M8NA 4OO4A 4IW9A 2KP2A 2X8CA 2FWEA 2VM1A 7GSSA 4BPYA 1YY7A 3BD2A 4K0NA 4MP4A 4MABA 2PMTA 2TRCP 4N30A 4TR1A 3VWUA 1G6WA 4IELA 1B9XC 1U87A 4OFNA 4PUFC 5ID2B 4NV2A 4V1Ag 5DAKA 2PUKC 1T4ZA 5B7CA 2GTUA 2H1AA 2YJHA 5B6MA 4GF0A 3A3TA 2H74A 3FK8A 1GRXA 3GH9A 1NSWA 2PVQA 4BWSA 4MLYA 2LJAA 3ZZXA 1GL8A 1S3AA 4ECCA 1KEBA 3CXGA 1F6MC 1G7EA 1DE1A 3KJYA 4MH3A 2R3XA 3D4TA 1J0FA 3A2VA 3I6AA 4BVYA 4MJBA 3HD5A 1FVJA 4I5QA 4POMA 1CQGA 4ZXGA 5ENUA 1NW2A 5B6NA 5E59A 5D9VA 2VLTA 2FWHA 4I8BA 5E4WA 3F4RA 2C0FA 2KLXA 1XBSA 4WR4A 4MJCA 1ST9A 2B7JA 4EO3A 1J9BA 2ON5A 2ON7A 1UA5A 2B6MA 1XW5A 2L59A 4KDXA 4IJ3A 1GTBA 1SK2A 19GSA 2MMAA 5ECQB 2LJRA 3UMAA 1SKSB 2GDRA 1XVWA 4ZB8A 2XHFA 2VCTA 4V2NA 3GX8A 2LSTA 4ZL7A 5G5FA 2H01A 2X8GA 5JWRB 1ZOFA 1ZGNA 3C1SA 2GQMA 3FYGA 2YN1A 3GL5A 4PX1A 4F82A 2P5QA 2PPTA 1ERTA 3HZ8A 4KNDA 3IDVA 3QPMA 3A2XA 1C72A 4ML6A 2C4JA 5FWGA 2I9HA 1OKTA 3BOAA 4K7IA 1O7UA 2MZCA 1XOAA 4PQIA 3LSZA 4XRDA 8GSSA 1K0CA 2RUFA 5LNKe 1FAAA 2YV9A 1TTZA 2WJUA 4KDUA 4AGSA 4Q5FA 1GLPA 3UIWA 3ERGA 2DJ0A 1X5DA 2GQKA 1AQVA 3HVVA 1B9YC 1BX9A 1MEKA 4HDEA 4O92A 4KX4A 4AF2A 3DGQA 4ZB9A 2GSRA 3APQA 5C00A 3EWLA 5IM9A 2YWNA 1GUKA 4TKYA 3GH6A 1HNAA 4X0XA 3ZL5A 2VCXA 4KDYA 3ZYWA 2DJ3A 4MZWA 1SK0A 3KTLA 3GFKA 1SK1A 2IPAA 4YQVA 6GSSA 1K3LA 1OYJA 4TXOB 4WEYA 3HYPA 3KZQA 1TDIA 3GHAA 5IMAA 1URMA 2OJLA 2IFQB 4I2UA 2C8UA 4OO5A 2MYGA 4WR5A 1A23A 1GUHA 3KP8A 5LCZA 1OC3A 1V2AA 2R2JA 4FYBA 5KEJA 4OD7A 1GSUA 1OC9A 3CTFA 1K0DA 2B5YA 1SYXA 4NWYA 2MBSA 2DC5A 3CMIA 3KTBA 5J9CA 2VAFA 3UOMA 5ECOB 2YPMA 2HZEB 5F0GA 1VF3A 2AV4A 4IJIA 2RM5A 1ZL9A 3KMOA 3TDGA 4MPGA 4E8EA 3ZTLA 4WF5A 3NIVA 1AW9A 3UBLA 1AQXA 1AQWA 3W6GA 1JLWA 3ERFA 5EPFA 4ZILA 4IVFA 3KCMA 4OFTA 2K6VA 5D96A 1DSBA 3LORA 5AISA 3DVXA 2IWTA 4GXZA 5FHIA 2EIRA 1HD2A 4F9ZA 4TOPA 5B8AA 3VWXA 3TCOA 3EINA 5HFGA 9GSSA 2RLIA 2VD0A 2C0EA 20GSA 3C1RA 1CQHA 1O85A 2CZ3A 4POBA 2KOKA 5A4VA 4IP1A 1EGRA 2K9FA 2G0FA 3ED3A 3M1GA 1GLQA 4KGIA 5CO3A 1X0RA 2L6CA 4FH8A 5CREA 2OE3A 4XS4B 3SBCA 3MSZA 4RUVA 4K6XA 3GMFA 5ECLB 3RBTA 2PWJA 1M2AA 5H5RA 1WE0A 3IBHA 1THXA 4NMUA 3DRNA 1FHEA 1G7OA 2LNSA 5L71A 1YDKA 2ZNMA 1I9DA 2LRTA 4AJ7A 2C80A 3F0IA 1TJDA 3GSTA 3IAM2 1FW1A 2BMXA 3IXRA 1OAZA 4IS0A 3IE3A 2FUG2 3CSJA 1V57A 3HCZA 4QL7A 5KN2A 5DQSA 2DJ1A 1TK8B 2H0HA 5D9TA 17GSA 3E3EA 4D73A 4BA7A 3RPNA 3BCIA 1FOVA 5IQYA 1XWCA 4JE1A 5ECMB 1KNGA 1WPIA 1T7PB 5ECRB 1FVKA 3EC3A 1RQMA 2H6YA 2MMNA 1A24A 1RW1A 4K7OA 1LJRA 3HXSA 4K8MA 1JLVA 1M2BA 2DJ2A 3HVXA 3DVWA 1R5AA 1VF1A 5F05A 3F4SA 2O8VB 1YEPA 3TJFA 1PX7A 2F51A 3BBYA 4TR3A 2YANA 1EP7A 3GTUB 3DKSA 1O8WA 5IMZA 3J7Yb 3APSA 1GH2A 4K2DA 1PN9A 1SL1B 3LJRA 2IMKA 3IOSA 2B1KA 1XZOA 4WBRD 2JU5A 3QAVA 3TOUA 2LQQA 3GA4A 1BQ7A 5GAPD 1Z6NA 3IAS2 3GKXA 2EIQA 1X9MB 1T00A 3DMLA 4BL7A 3TJKA 4IBPA 2MMOA 1BG5A 3MNGA 2BTOT 1EEJA 1Q98A 2H1DA 3V1WA 5IMVA 2HZFA 3PGTA 1ZCPA 4L5OA 3TKSA 1HYUA 5ECIB 5GSSA 3IA1A 3EMPA 4MF5A 1YKCA 2GSQA 2CVKA 3RPPA 1YEXA 4ZL8A 4GCIA 4MA9A 4BWQA 5IPHA 2HE3A 4P3YB 5KN1A 3TKQA 1GWCA 4GSNA 3TRPA 2ZCTA 4YAVA 3E9JB 1G6YA 18GSA 3GKMA 2H0IA 12GSA 5G31A 1GP1A 4K0GA 3L9UA 4I97A 2RUEA 5HFIA 1QXHA 3EURA 3WGXA 6GSWA 4EF0A 2V2GA 3H4KA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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