4PQIA

Crystal structure of glutathione transferase lambda3 from populus trichocarpa
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
TASALDKSVPEKLAPPLDATAEQPPLFDGTTKLYTCYTCPFAQRVWITRNFKGLQDEIKLVPLILQNRPAWYPEKVYPPNKVPSLEHNGKITGESLDLIKYLESNFEGPSLLPKDPAKKEFAEELFSYTDKFNGTVYTAFKGDLAKEAGPAFDHLENALHKFDDGPFFLGKEFSLVDIAYIPFVERLNIFLLEVFKYDITAGRQKLAAWIEEVNKIEAYKQTKTDPKELVEFYKKRFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords In2-1 family protein, glutathione transferase lambda3
publication title Structural and enzymatic insights into Lambda glutathione transferases from Populus trichocarpa, monomeric enzymes constituting an early divergent class specific to terrestrial plants.
pubmed doi rcsb
source organism Populus trichocarpa
total genus 86
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4pqiA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4pqiA01
3E9JB 3ME7A 2MMAA 2O7KA 4BVXA 1NW2A 1AQWA 19GSA 14GSA 2FHEA 2F51A 2C1YA 1EEMA 1PL2A 1JZOA 2C0FA 4ZXGA 2VD0A 4YQMA 3TRXA 4PTSA 2PWJA 2OADA 3DEXA 2VAFA 2GS3A 1ZMAA 4RQRA 3CSIA 5ECLB 2DJ0A 5ECNB 3BJ5A 4F2IA 2OBIA 3GKKA 3DYRA 1AQXA 4PUAA 2AAWA 2B6MA 3QAGA 4N0VA 3GL5A 1K0NA 4ZBAA 3O76A 1MTCA 3DXBA 3PR8A 1ST9A 2VCQA 1RQMA 1G7OA 6GSUA 2KHPA 2YWOA 4HUAA 1OYJA 5AISA 2FNOA 2GSTA 1FHEA 2I4AA 4E8EA 2WCIA 4GSSA 2JSZA 3IA1A 5G30A 4POLA 1PKWA 2L6DA 2VCVA 4XRAA 2A2SA 4IW9A 1X5CA 4OCFA 3ISOA 3CBUA 2LS5A 3LJRA 4ML6A 2H30A 2QKEA 2V41A 1U87A 2O8VB 4MF6A 3G7JA 4PNGA 3K8NA 2ES7A 3NOFA 5D9TA 2L59A 2HNLA 4ACSA 2DC5A 4RI7A 2YJ7A 4Q5QA 3IOSA 3UJ1A 2DBCA 2HSHA 2VLVA 1PQNA 3LFLA 1OC9B 4ZL8A 1TOFA 1YQ1A 3W6GA 3WT2A 1BJXA 3Q19A 2C0GA 1SYRA 2R37A 3GMFA 5A4UA 4ML1A 1F9MA 2K8SA 1EGRA 2GQMA 2CZ3A 3TKQA 3RDWA 3GUSA 5D8IA 2GGTA 2LV3A 4ZB6A 2YV9A 1A8YA 2DLXA 2YOIA 5E4WA 1SJ6A 2I9HA 1GTBA 2EC4A 4G2EA 4N11A 2GLRA 3TJKA 3HCZA 2C3TA 3D4MA 2VCZA 4KDUA 2PPTA 2GSQA 3TOUA 1XVQA 2K18A 3GSSA 2GQKA 1Z7RA 4K8MA 1XFLA 1XBSA 4ZBDA 3EU4A 2DIZA 3IRAA 4K9ZA 3CSHA 2IFQA 2JSYA 1VRSD 4GLTA 2FD3A 1ZYEA 2H0IA 3E0UA 5ECQB 2N5FA 4IBPA 3SBCA 2VL9A 3F6FA 2WB9A 1R5AA 1R4WA 4IELA 1URMA 5H5QA 2XPDA 5IOXA 4MK3A 5H5RA 3AY8A 1ZCPA 5IMVA 1WOUA 1O8XA 3TB2A 4GF0A 4V1Ap 2A4VA 4KH7A 3G7YA 5D73A 5J5NA 4GXZA 4MZCA 5COHA 3ZVJD 2VL2C 2HRKA 1GUMA 4K0GA 4L5LA 5FWGA 4AJ7A 3TKPA 1BAYA 2WGRA 2MBSA 2IJYA 4TKYA 1K3YA 3WGEA 1B8XA 1UC7A 1G6YA 3KD0A 3I6AA 2HSMA 3ZTLA 1FO5A 4QL7A 1JLVA 1AIUA 1X5DA 4YQVA 5AIXA 3FW2A 1KBNA 5HR1A 2AJQB 4KB3A 3APQA 3LG6A 4L5OA 2A2RA 2X8HA 1T4YA 5H5SA 1V98A 1WE0A 2QC7A 2VCTA 2G2QA 2JZTA 1T1VA 2YJHA 1V40A 2HFDA 2V2GA 4MH2A 4Q5FA 2ON5A 4WXTA 4BL7B 1Q4JA 1M9AA 1X0RA 1TJDA 2PUKC 1LJRA 2R5GA 1K0AA 4G19A 1GNEA 1TU7A 5JCUA 1PL1A 1M2AA 4KCEA 1HNAA 3V1WA 4PNFA 3F0IA 3IC8A 4IHUA 1SJZA 5G1KA 2MMZA 1K3OA 1E2YA 5ENUA 1GP1A 4POMA 4HQSA 1QFNA 3PPUA 3TKRA 2MYGA 4GTUA 1LBKA 4MF7A 1Z9HA 3IHQA 4EDYA 3JCML 5D9WA 3F4RA 1PX6A 3FZ9A 5C04A 1QGVA 2F8AA 3LSZA 2GZYA 4PURA 1W4VA 3D21A 4TVEA 4BVYA 4OD7A 5B8AA 3GFKA 2PBJA 3TUEA 3GKNA 1SL0B 1CQGA 3SWLA 3ZIVA 4NXIA 1F3BA 2R4VA 1JLWA 2VL2A 2XHFA 1U6TA 1THXA 2PVQA 1A2LA 5CRHA 2B1KA 4KX4A 1R7HA 3KH7A 1A0RP 1XW9A 2HRAA 5FHIA 4XHMA 1M9BA 2C3QA 1SKSB 3IXRA 3FK8A 4PXOA 4ZIJA 1U3IA 4POKA 1SJIA 5DAKA 2LQOA 1X5EA 2C0EA 3ZFBA 5ELAA 2C3NA 1OKTA 1J0FA 1K3LA 2PU9C 2MMOA 1XIYA 2P31A 1THOA 2CX3A 2ZUPA 5HFIA 3ZYWA 5LNKe 2LRTA 1XWAA 1Z6NA 2J23A 3F3RA 3IPZA 3H79A 5A5KA 1SYXA 2V1MA 5HFKA 3NZNA 4RI6A 1TW9A 1BG5A 2HZEA 4EF0A 3KEBA 2DJJA 4TXOA 1YEXA 2QGVA 2FWFA 4WBJA 5ECMB 1I5GA 5ECOB 3VK9A 2OE0A 2N5AA 1B9XC 2YWNA 5JCGA 2MBTA 3H8QA 1PA3A 3ED3A 4N10A 2RUFA 2DIYA 1YY7A 3ZMLA 12GSA 2WDUA 5D93A 4NAXA 3MAKA 2FUG2 2OKAA 1ZYQB 1XWGA 3GRXA 3EMXA 3TRQA 2XPEA 6GSYA 2R3XA 4KA0A 3EU3A 4MCUA 1TRWA 5F05A 3M9JA 3ZFLA 2RLIA 3VPTA 1NHOA 1PRXA 3US3A 5JWRB 1SK0A 1VF2A 5A4WA 4D73A 1GTUA 2E2GA 2H1GA 4XS4A 2ON7A 3A2WA 1Z3EA 2P5QA 1ON4A 3ZZXA 1FG4A 1K0OA 4OO5A 3TJBA 3S9FA 2YCDA 2DJKA 3ERFA 4K7OA 3L4NA 3VURA 1XXUA 2IMFA 4FIWA 3FRCA 3GH6A 5F0GA 2XBQA 1SL2B 4ULXA 3ERGA 2DJ2A 4FQUA 2R2JA 1WJKA 3H1NA 3N5OA 3D22A 4EE0A 1GNWA 4MABA 4BPYA 5KN3A 2K9FA 5INYA 2PGTA 4DSSA 4MMMA 5DJMA 3G9BA 1LU4A 1GSEA 2FWGA 3ZLPA 2YNXA 4XRDA 4KGIA 3IE3A 1B4QA 4F0CA 1PKZA 1OVNA 4TRXA 1JFUA 4DSQA 4PQHA 3GH9A 3O6TA 2JZSA 3TOTA 2M72A 1ZOFA 4O92A 4H86A 2R6KA 1TRUA 4YAVA 1VGLA 17GSA 1GSUA 3D0ZA 3I43A 3DMLA 4I6XA 3QFAC 1Q98A 3GA4A 1QK8A 2AB6A 4JZQA 5ECKB 4AF2A 4RUVA 5HQPA 3Q74A 1Y6EA 1CQHA 2X64A 4MH3A 3LORA 2H75A 1TK8B 3KMOA 4HI7A 4HU9A 4TXVA 4ZBBA 3HJPA 3M3MA 1NM3A 5IPGA 1XW5A 5F8BA 3DVWA 2X99A 2H1AA 3EURA 1EZKA 2OE1A 5A4VA 4O7HA 2LJKA 2YN1A 1X9WB 1TDIA 5KN2A 2ALBA 2YP6A 2WFCA 3C1SA 3IAS2 5CRGA 3G7IA 2VOCA 4PUFC 5DALB 1AQVA 4V2LA 1PMTA 2PN8A 2HZFA 2L5LA 4IP1A 4MPGA 2BJXA 1K0BA 1YKAA 2IMDA 3WD6A 4I5QA 4HJMA 4WEYA 5JWOB 1TK5B 1TKDB 4ECBA 2G0FA 1BQ7A 1U88A 2X8CA 4G0IA 2LKUA 5J4UA 1OC9A 2VLUA 2HLSA 2NDOA 5L71A 5AIVA 2E7PA 3TJJA 1EP7A 4JU5A 3GKMA 2V6OA 3KGKA 3VLNA 4PQIA 3GX0A 2GVPA 5EL8A 2IN3A 3FZAA 4BWQA 1PGTA 3LXTA 3D4TA 1YDKA 3HVXA 5KEJA 4TR1B 4P3YB 3UVTA 1YF1A 1Z7PA 3VFIA 5C00A 3MDKA 3UVHA 2YANA 2YWIA 3LQ7A 2ZCTA 4TW5A 2IFQB 2B7KA 4KNDA 5AN1A 5IQYA 1WMJA 1A2MA 2MMNA 2EIOA 2VM1A 5DDLA 2H8LA 3HDCA 1AC1A 3L9SA 5JCWA 1J9BA 5J9CA 2I81A 1XVWA 4K7NA 5F06A 3DRNA 2CZ2A 1GL8A 3KM6A 3VWVA 1WPIA 3ZL5A 4HOJA 2O87A 4USSA 3L9VA 4DEJA 3P7XA 2FWHA 1SU9A 4JE1A 4O5RA 1A2JA 1JZWA 4AJ8A 3C8EA 2B1LA 3GURA 4TOPA 3UBKA 4JBBA 4ZB8A 4MJAA 2HRFA 1F2EA 3GTUB 4Q5RA 1FVJA 4DSRA 4WBRD 3RPNA 4K2DA 1ML6A 3IAM2 4QQ7A 16GSA 1K0CA 1XWKA 2KP1A 4V2NA 4GSTA 1GUKA 5AGYA 5ECRB 2B5XA 2OBKA 3D5JA 2MZCA 4IVFA 1TTZA 4GRFA 1YKCA 3UARA 1UN2A 3P2AA 3DWVA 3HHVA 4J57E 2REMA 5G1LA 2GDRA 3HY2A 1O81A 5IOWA 5G2ZA 1G7EA 1SKRB 3UAPA 2FCHA 4WETA 2M46A 1DSBA 4E8HA 2YWMA 5EPFA 1SKWB 3DGQA 5CO3A 2NBSA 2LNSA 1V2AA 2F9SA 2HXKA 4IS0A 4BL7A 1PD21 2CV4A 2GT5A 3QAVA 2CAQA 1Z5YE 1ABAA 2HQTA 1TK0B 5HR0A 3WGDA 4LMWA 1NSWA 5ECSA 1M0UA 1E6BA 2VD1A 1T3BA 4MLYA 4O32A 1O73A 3FYGA 1M2DA 2GZZA 4AGSA 4KDXA 3C7MA 1GUHA 3HYPA 3MNGA 1JZDA 1BYEA 2IMEA 2UZ8A 5EVOA 3FEUA 4AJ6A 2AUVA 3KXOA 5DCGA 4K6XA 2HI7A 4IQAA 3WYWA 2VM2A 3BBYA 1N2AA 2LNTA 5IO0A 2L5OA 1TRSA 2RUEA 2GSRA 5CREA 2H70A 4HQZA 3Q18A 4KF9A 4XTSA 4KUNA 5GAND 4NHZA 4KSOA 13GSA 5ECPB 3I9V2 4WF5A 3KTBA 4IJ3A 5D9XA 2DJ3A 1EOHA 1Y25A 3QFBC 4HJ2A 5IO2A 3QR6A 5CYYA 3RAZA 2RIIA 5CAXA 3EYTA 5B6NA 3KJYA 5IPHA 2FA4A 2FGXA 2V32A 1G0TA 5DJLA 3EVIA 5GZZB 1OKDA 2FLSA 4K7IA 2WJUA 1BEDA 1MEKA 2OJLA 4MJEA 1DE2A 2AHEA 3CMIA 3GKXA 1KNGA 3KTLA 3GX8A 1USBA 3FR9A 4TXOB 4X1UA 3QPMA 2BMXA 5G5EA 2LQQA 2H0HA 1OC8A 3QAWA 3KP8A 2H6XA 3LEFA 2OE3A 4G9HA 2IWTA 1O8WA 3IK7A 1XW6A 4LA1A 6GSTA 5ECIB 1TXXA 4JRRA 3VWUA 3BOAA 1GSQA 3QCPA 5DCHA 5D9VA 2NTOA 5ID2B 6GSSA 1ILOA 3FR6A 3CYNA 4WR5A 3HA9A 3TJGA 2GZPA 3KCMA 4HU7A 4LLRA 4LL1B 4EO3A 4KAEA 3MSZA 4TR0A 1ERWA 3I69A 1ERVA 1YJ6A 1G6WA 2E0QA 2PMTA 4NPBA 2GQLA 5IMAA 3RBTA 4ZB9A 3IC4A 1AXDA 1PN9A 4HS1A 1VF3A 1FB0A 3GYKA 3L9UA 3LGCA 1K0MA 4K1FA 3UMAA 5ABRA 2JU5A 3RPPA 3J7Yb 1EV4A 1N8JA 5DQYA 1RW1A 2V6KA 4MF5A 3UIWA 2H71A 1FVKA 3IBHA 3J7Yk 3FZ5A 1YEPA 3QMXA 3A5WA 3PINA 4PQ1A 1BX9A 2DSAA 2KUCA 9GSSA 2H72A 3ME8A 4FO5A 4QL9A 1GSDA 4POBA 1DE1A 2P0GA 1PX7A 2NPBA 2VLTA 2PERA 4BVXB 1FAAA 1R5PA 3OR5A 4MZBA 3KMNA 2CVKA 2PVOC 2AV4A 1KTEA 2C4JA 3CXGA 1C72A 1MD4A 1XCCA 1WP0A 1GLQA 3GV1A 4EL1A 2LEGA 2HSNB 3HKRA 1O6JA 5B6MA 2IMIA 2BTOT 3QOUA 3KZQA 4ECIA 1SD9A 1GSSA 3DD3A 1EWXA 4Z7XA 4L8EA 4GSNA 1IYHA 3VWWA 1AAZA 4ZL9A 4EVMA 2TIRA 4MZWA 4Q5NA 1ERUA 1KEBA 3Q6OA 5F07A 3M0FA 1QUWA 2GT6A 1RK4A 4ZL7A 1HD2A 2VO4A 2GSSA 2VL3A 1DBYA 5J9BA 2WS2A 5HR3A 2RM6A 2HSYA 2H1BA 4NV5A 5DQSA 4IN0A 1MDIA 2P5RA 2FY6A 2HT9A 1H4OA 5IMCA 3F9UA 3PH9A 3EC3A 2IPAA 5DVBA 4OWYA 2DMLA 4K0NA 3P8WA 2OACA 3H93A 3ZIJA 2GTUA 4X0XA 3VWXA 3RHCA 4YAPA 1WWJA 4EKZA 3KH9A 5EY6A 1SENA 2K8VA 4KCAA 2VUPA 5CRDA 5DALA 4JR6A 1M7TA 5LCZA 3GSTA 3IK9A 1MD3A 5IIZA 1R26A 2O89A 3VI5A 1XPVA 3W8SA 2H66A 2WULA 1OAZA 1O85A 2CAIA 5CP1A 2OA7A 2CA8A 1YF0A 3ZRDA 3DKSA 4YH2A 3KIJA 4YQUA 2KLXA 3F8UA 5BMUA 3F4SA 2O85A 2H1DA 2H19A 2L4QA 2EIRA 6GSVA 1XOBA 1ACVA 1EGOA 3APSA 4XIHA 2ZNMA 3VI7A 2D2ZA 4IP6A 1T8EB 1GH2A 4X43A 2N5BA 1GSFA 1QMVA 1Z6MA 4KSMA 1SD8A 4TR1A 4HZ2A 2QSIA 10GSA 3R2QA 3ZVJA 4WKWA 3E3EA 1GTIA 2B5YA 3FR3A 4OO4A 8GSSA 2KP2A 2CVDA 4FYCA 4WR4A 1V58A 1FB6A 4LMVA 2C0DA 2L6CA 3DVXA 3ZITA 2H01A 3O3TA 1F37A 4N0ZA 4XS6A 20GSA 2LRNA 5FT3A 1DUGA 4IJIA 1OE7A 1XWBA 2HRKB 5IMZA 2H6ZA 3BD2A 1ERTA 2LUSA 5KN0A 2I1UA 4MJCA 3GNJA 5DBQA 1J08A 1WRYA 2TRCP 4HDEA 4CDOA 1M99A 1VF4A 3UBLA 5D96A 2YV7A 4GQFA 1T7PB 3VPQA 2HSMB 3TKSE 4PGTA 4CW9A 1NHYA 3C1RA 2AYTA 5G31A 1GWCA 4I2TA 1EEJA 2C80A 3GTUA 2FA8A 1V57A 5GSSA 3HXSA 3M1GA 4IGJA 3RHBA 4L0WA 2XC2A 3A3TA 1GTAA 1B48A 4OFTA 5G5FA 2LSTA 1GSYA 1S3CA 4NWYA 3U6VA 4F9ZA 1TU8A 4I97A 1B4PA 1K0DA 1UA5A 2E2MA 4EUYA 3A2XA 1X9MB 11GSA 4LL4B 3FHKA 3GHAA 1F3AA 1QXHA 5CRWA 2X8GA 6GSXA 1TP9A 2IMKA 5J3RA 3F3QA 3TJFA 5B8BA 2YZUA 2L4CA 5B7CA 4IKHA 3IDVA 1S3DA 1HYUA 1HNCA 4FYUA 3HJMA 4JEDA 7GSSA 4MA9A 3FZ4A 4KW6A 3H4KA 2TRXA 4G0LA 3CSJA 4KE3A 1ZL9A 1PSQA 1F6MC 3EMPA 3PGTA 2B3SA 2FWEA 3TKSC 4MJBA 1A23A 2XBIA 1SL1B 1IYIA 1XZOA 3ZMKA 2L57A 3ERWA 4BA7A 1X9SB 1AW9A 3W8JA 4MDCA 5JWQB 4MPFA 4V1Ag 4OFNA 2H74A 4J2FA 3CTGA 3HD5A 4F82A 3HVSA 1GLPA 3P90A 3HZ8A 4XCSA 3WT1A 3R3EA 3CRTA 4BVYB 1TI3A 2I3YA 4G10A 1JZRA 3EINA 4N30A 1SK1A 3C71A 3IR4A 1WIKA 5HFGA 4NHWA 4ILFA 1S3AA 1ZZYA 1GRXA 2LRCA 3LWAA 3LYKA 2F3MA 3KP9A 2Z9SA 4I8BA 3FY7A 5IM9A 4OMVA 2EIQA 1W89A 3F6DA 1V9WA 1ZGNA 4XS1A 5DAKB 4F03A 2HYXA 5GAPD 1A0FA 2H6YA 4J56E 2DJ1A 3DIEA 2DMMA 4DVCA 1MDJA 1YZXA 5IMFA 3N9JA 4ECCA 2LJAA 4I2UA 4CHSA 3APOA 4FH8A 22GSA 1M2BA 4JR4A 4TR3A 4ECJA 18GSA 1JHBA 3HJOA 1UVZA 4RQXA 4EDZA 3MWHA 2IL3A 2B5EA 2HZEB 4L0UA 4BWSA 4ID0A 2H73A 2WRTA 4GWRA 5ELGA 3GN3A 3UEMA 4HEA2 3GIXA 2YPMA 3HVVA 4PX1A 4EXJA 2K6VA 4NMUA 3U5RE 2KOKA 4WF4A 3FKFA 4KDYA 3A2VA 2H76A 4HZ4A 4G0KA 2WZ9A 3HZ4A 4NV2A 4GCIA 3LXZA 2VIMA 4TN8A 4F0BA 3F63A 5ECHB 5GSTA 2H0GA 4V2MA 3TKSA 5CNWA 2F8FA 2JADA 2IIYA 2LTKA 2C8UA 3EE2A 1EV9A 3NIVA 4MP4A 5KN1A 1HNBA 3C73A 2J9HA 4IQ1A 5IMDA 2JACA 3CTFA 3M9KA 3F4TA 4D73B 1EOGA 4FYBA 5ID2A 3TGZA 1H75A 3LYPA 3TRPA 4XS4B 2NVLA 3D6IA 1OC3A 3UOMA 2JZRA 1SK2A 2VCXA 3UL3A 2VCWA 2M80A 3EWLA 3QD9A 5HR2A 5LD0A 3M8NA 2CVBA 2RM5A 1O7UA 1A8LA 2CQ9A 3QDNA 3L0HA 4TR4A 1TI1A 1FW1A 1GULA 4GQCA 4OCEA 3TCOA 1TRVA 4EC0A 1XWCA 2B7JA 3IV4A 2JL4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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