2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
4USQA 2XCGA 1GRGA 4UDQA 1M6IA 1LQTA 3CNSA 3KD9A 3EANA 4TM3A 1IUXA 4B63A 1QJDA 3M12A 2Q0KA 3GMCA 5GRTA 3GDNA 3F8PA 3GYIA 3GSIA 4ADWA 1JEHA 3NYFA 3SQPA 2WDQA 5IQ4A 4ECHA 5TR3A 3GYJA 2CVJA 2WEUA 4OPGA 2I0ZA 3P4QA 1E39A 2WPEA 2X8CA 4FX9A 4J56A 2EQ6A 2GH5A 2UZZA 1H84A 1Q1WA 4H2PA 1TYTA 2JB2A 1L9DA 1RYIA 2YLZA 2IIDA 2IVEA 1S2YA 1YQ4A 3DJDA 2GB0A 1H7WA 1QO8A 4YTPA 4YKGA 4ZN0A 3REDA 3URHA 4EMIA 4J36A 1NEKA 2FBWA 2AR8A 2GMHA 4DSGA 1GT8A 1ZP0A 3CGBA 1P2HA 2E4GA 2QCUA 2C64A 3FIMB 1NPXA 4IVOB 2YLSA 2E1MA 1EBDA 1OJTA 2WDRA 1F8SA 2WHDA 3SGLA 5JCLA 4AP1A 1W4XA 3EF6A 4LIIA 5BRTA 4K5SA 3AXBA 3O0HA 4IA5A 4U8PA 5DBJA 3NT6A 3D1CA 4O5QA 3LADA 1GTHA 3DK9A 2GV8A 1K0JA 5JCNA 2GEWA 3NK1X 3QSSA 2A87A 2R4EA 1BF3A 1DNCA 1GSNA 1XHCA 1K0IA 3QSMA 1PDHA 3CGEA 2XFPA 3KLJA 5HY5A 4EQSA 3F8RA 4J33A 1DOCA 2BS2A 2WOVA 3AECA 1KDGA 3CNPA 3R9UA 4CY8A 1V59A 5HHFA 2ARDA 4EQWA 1GRTA 2FJBA 1NHQA 4U8KA 3ICTA 4RG4A 2CDUA 2GR0A 2YVFA 2YR5A 1K4QA 2Z5YA 1LPFA 3M13A 4H4PA 3SFEA 4YT0A 3D8XA 3QFAA 3BI5A 4X4JA 3DJJA 1BZLA 1LJ1A 4WCTA 1Q1RA 2ZBWA 4H4TA 4Z2RA 2BC1A 4EIQA 3NK2X 2TPRA 4UP3A 1VDCA 1KNRA 1Y56A 1ELIA 3NTDA 1VG9A 3CNDA 2FJEA 3KPFA 4YTNA 1H82A 4RG3A 4XXGA 1B8SA 2X8HA 2YG6A 4J34A 4EM4A 3CPJG 2YLTA 1N4UA 3DGHA 4EMJA 4YXDA 3JSKA 4BURA 4P9SA 3F8DA 3IHGA 4JDRA 1D5TA 4PAAA 4J2WA 1PJ7A 1Y56B 4H2RA 2GR3A 4Z43A 2W0HA 2YG4A 5KXJA 4TM1A 2BXRA 4GDPA 3E1TA 1LVLA 4PABA 4H4RA 2YLWA 2WPFA 3ISHA 3AE5A 2R46A 4RSLA 3AD7B 4C74A 1KF6A 4USRA 1F8WA 4LA1A 3LZXA 2Y6RA 4TM0A 3UCLA 3ITJA 4APNA 3RHAA 3C4AA 4FDCB 2YWLA 3UKHA 1IUTA 2H88A 4OPUA 2YM1A 4H4SA 1OJAA 4IA6A 2XVEA 5KVHA 4U8IA 5M10A 3AE9A 3B6DA 5U25A 3UKAA 1JU2A 2WP6A 4JQ9A 3UKQA 1NG4A 1FECA 2B76A 4U2LA 3UTEA 1GOSA 2GQFA 3UTGA 1BGNA 2GMJA 3DGZA 2C67A 4CCRA 5BUKA 3RP7A 3AWIA 3GD3A 2X50A 1GETA 5CQFA 3UKPA 3B3RA 2F5ZA 4GF7A 1B5QA 2YR6A 5BULA 1K0LA 2RGHA 3AEAA 5CKUA 5EB5A 1XPQA 4U8MA 2C65A 1E1NA 3G5QA 2WP5A 3PO7A 5M0ZA 2X3NA 4C77A 1JRZA 1NHPA 3CNJA 2AQJA 2R45A 2Q7VA 4YTMA 3AEEA 3HZLA 1MXTA 4A6NA 4GDEA 4U8LA 2YG3A 2JKCA 3QFBA 1KSUA 3IWAA 4AOXA 2B7SA 2WP9A 4B69A 1FCDA 1NG3A 3V76A 1PN0A 3AD9B 1D4DA 4K7ZA 3QSEA 1YY5A 3KVEA 4TLXA 1EL8A 3FG2P 4Z2UA 1JRXA 1P2EA 1ZMDA 2B9YA 1GERA 1ZX9A 4NZHA 2Q0LA 2ACZA 2EQ8A 4OCGA 3IC9A 4MJWA 4H4YA 3ADAB 3BHFA 1DXLA 3AEGA 4XWZA 5FS8A 4BK3A 3LOVA 2R0GA 2XFUA 3DH9A 4A6NB 1XDIA 4OPIA 1D7LA 5EB4A 1PBEA 2X99A 2XLSA 3NLCA 4EQXA 2BS4A 1JOAA 1M64A 3NHOX 4YWOA 2QA2A 3NYCA 4XWRA 1F3PA 3RP6A 3K7TA 1GREA 4JY2A 1E1MA 4C5OA 2R0CA 1DJNA 2CULA 2WS3A 1BGJA 1TRBA 4GRTA 1XANA 1YQZA 3BHKA 3SM8A 4OPLA 3ZYXA 2YLXA 2OA1A 3P4SA 4U2SA 2Y6QA 4GR1A 4KPRA 2XFQA 2BXSA 2B9XA 4ZCDA 3QJ4A 1NDAA 2JB3A 3CPIG 3AB1A 1EL5A 1O5WA 2V3AA 5ER0A 3OC4A 4GCMA 4H7UA 2DKHA 1O94A 3AEBA 3NG7X 3VR8A 2VRLA 4H4WA 5HYMA 4A65A 1H81A 5EBKA 3AE8A 3NN0X 1GRBA 1PXBA 3UOXA 1RSGA 2XYOA 2VRMA 4AT2A 2C76A 3ZDNA 3PS9A 3CTYA 4J57A 3AE7A 2GAGB 4NTEA 1TDEA 4IV9A 3UKKA 1GXFA 2PYXA 3AYLA 2GAHB 3ALLA 4TM4A 1GRAA 3UOVA 2VQ7A 3NTAA 2EQ7A 2OLNA 1ZY8A 1EL7A 3H8LA 1N4WA 3Q6JA 1E7PA 1MO9A 4B64A 2VVLG 5LV9A 1VG0A 4JY3A 4HA6A 4X9NA 1DODA 2JAEA 1OJDA 3ICRA 3K7MX 4DGKA 4CNJA 3UKFA 1ZOYA 1MOKA 3FMWA 3CN8A 5JCIA 3SFDA 1JNZA 2YM2A 2E5VA 4OPDA 1BWCA 3OZ2A 2BYBA 3IHMA 4H2QA 1IUSA 2OALA 3AEFA 1PJ6A 2YQUA 4EQRA 3C96A 1L9EA 1H7XA 4JNAA 3ATQA 3GMBA 1ONFA 3S61A 1GESA 4D04A 2C7GA 3T37A 1H83A 1Q9IA 4B65A 1COYA 2APGA 3EAOA 1PJ5A 3EPTA 2O9ZA 5U1OA 2XVHA 3NH3X 5C3JA 3DJEA 2BA9A 2FJAA 2QAEA 3VQRA 3DK4A 2PHHA 3UP4A 4B68A 1CC2A 2VOUA 1CJCA 2WOWA 1IJHA 2WQYA 2Z5XA 4Z26A 2VVLA 2H89A 1GPEA 4OPCA 4U8JA 4BK1A 4C3XA 1CHUA 2AAQA 2ZZCA 2X8GA 4NEVA 1AOGA 3AE3A 4YSYA 1E1KA 2WU5A 1QLBA 2GR1A 3AYIA 3DJGX 4GUVA 4BV6A 1F6MA 2YG7A 2B7RA 3GWDA 3CPHG 1ZDLA 1DOBA 1GV4A 2CFYA 3UOZA 1D4EA 1PXAA 4YSXA 1GRHA 4ICYA 1GEUA 2WBAA 3DMEA 4ZCCA 2JBVA 2BK3A 5JCKA 4H50A 4A7AA 1KNPA 2WU2A 2C72A 1ZMCA 3G5RA 1S2QA 3LB8A 2EQ9A 2XVJA 2BK5A 4X9MA 5FMHA 5JCMA 1GRFA 4YSZA 4U8NA 3ALMA 4Z24A 1H6VA 5C2TA 5KRQA 4Z25A 4CRTA 3VRDB 1OJCA 1F8RA 1NHRA 2BABA 2JK6A 3ABVA 1BKWA 4BK2A 4B1BA 1O95A 5KOWA 2BCGG 2WESA 3VRBA 4CCQA 3ICSA 3P4PA 2GF3A 1CC4A 1B4VA 2NPXA 4H4VA 4CBQA 1H86A 1JRYA 3IF9A 3ALJA 2DKIA 4EM3A 4U8OA 4LU6A 5BVAA 3CGDA 4H4QA 5GSNA 1CJ4A 3I6DA 4KX6A 1Z6LA 3VRAA 3K30A 2XLRA 1PS9A 3II4A 3RP8A 1FOHA 1UKVG 4TLZA 2V61A 1TDNA 1YKJA 3P9UA 4N9XA 3KU9A 1FEAA 1TDFA 4IVMB 2RABA 1GNDA 1KSSA 2RGJA 5KVIA 2R9ZA 2YG5A 3GD4A 1EL9A 1FL2A 2XDOA 3GWFA 1NAAA 2YR4A 4DNAA 1S3BA 2WOIA 2XLTA 2RGOA 1JNRA 2B9WA 2XVFA 5HXIA 2WETA 4EMWA 4K5RA 3CNTA 1NHSA 4WX1A 2OAMA 3K7QX 2BS3A 2YVGA 5EOWA 2YLRA 3FBSA 4Y4NA 3DK8A 1L9CA 4BJZA 1DJQA 3NIXA 4K8DA 5KWFA 2BK4A 1HYUA 3ATRA 5FS7A 2NVKX 1N4VA 4FK1A 4B67A 1DOEA 4AT0A 1B37A 1RP0A 2Q6UA 3H4KA 3NGCX 2XLPA 2JB1A 1D4CA 4M52A 1CBOA 4NTCA 1N1PA 3GDPA 2C3DA 2C75A 3RNMA 2ZZBA 4Z2TA 4FK1C 4I58A 2C3CA 1ZKQA 2XFNA 2BACA 3Q9TA 5L46A 4OVIA 2C70A 5J60A 2WPCA 1PBCA 4Z44A 2VVMA 3UTHA 3M0OA 1PXCA 1L0VA 4JNQA 4A99A 3VR9A 2C66A 3KA7A 5IQ1A 4YSHA 4BJYA 1YQ3A 2V3BA 3KKJA 1E1LA 1TDKA 2C73A 4AOSA 1IUWA 2GR2A 2ZZ0A 2A89A 2FJDA 2WDVA 1OJ9A 2BCPA 4J31A 3GRTA 4B66A 2GVCA 1PBDA 3BI4A 3FPZA 3NKSA 3P1WA 2R0PA 1LTXR 4C3YA 3LJPA 2TMDA 3NK0X 2XFOA 2XVIA 4HB9A 4A9WA 3S5WA 3NRNA 1PBFA 1NENA 4NEWA 4Y4MA 3AE1A 1CF3A 4H4UA 1TYPA 3L1RA 1LQUA 2XLUA 3AD8B 3COXA 5FS9A 3UOYA 4O5UA 1CJ3A 2V60A 4H4ZA 3UKLA 1GALA 4UDPA 1LV0A 4K22A 3NN6X 1Y0PA 2IVDA 2BC0A 3AE6A 4JN9A 1CC6A 3BI2A 5IPYA 4D03A 3QVPA 1REOA 1E6EA 1PBBA 3CGCA 1D7YA 2V6OA 1PHHA 4DSHA 2VZ2A 2A8XA 3WE0A 4U2TA 1IUUA 3I3LA 4YKFA 1FEBA 3BNMA 3V3OA 4EIPA 1IUVA 3DA1A 3L8KA 4CY6A 4I59A 1VRQB 2R4JA 3V3NA 5U63A 3NYEA 2GRTA 4A79A 5FS6A 4Y4LA 4OPTA 2J3NA 4K2XA 1KFYA 1S3EA 1TDOA 3C4NA 3LXDA 3UP5A 2OLOA 1ZK7A 2YVJA 1CJ2A 4NTDA 3PVCA 3CIRA 2HQMA 2YAUA 3BNUA 1ZOVA 3H8IA 3QVRA 4UDRA 1X31B 4H2NA 4E0VA 3AEDA 4CNKA 4AP3A 1CL0A 3AYJA 3NNEA 4REKA 1VQWA 4A5LA 5J7XA 2V5ZA 5KOXA 3AE2A 3P4RA 3G5SA 2QA1A 3AE4A 3LZWA 1SEZA 1GTEA 2VQBA 4H4XA 3UTFA 3GRSA 2GQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FIWA 1URMA 1LQTA 3CNSA 4TM3A 4KSMA 3H1NA 3GDNA 2PWJA 3LYPA 1ZYPA 2LNTA 6GSYA 3L9VA 2YZUA 1T4YA 4KAEA 1JLWA 2WDQA 1E2YA 4IJ3A 3UBKA 9GSSA 1E39A 2WPEA 2IMEA 2JB2A 1XXUA 1LJRA 1K0AA 2IIDA 2XC2A 1G6YA 1JZRA 1QO8A 2DJ1A 2FBWA 2GMHA 3D21A 3APSA 3CGBA 2NPBA 4ID0A 3FIMB 1NPXA 4IVOB 4TW5A 2E1MA 2AJQB 2WDRA 3SGLA 3I69A 2IMKA 3GL5A 1W4XA 1XWCA 4N0ZA 5D93A 2GZPA 1MD4A 1O8WA 3CMMA 2GZYA 3PR8A 3D1CA 1X9MB 2A4HA 2V1MA 2A87A 2R4EA 4G10A 1XHCA 1NHOA 4V2NA 3IAS2 3QSMA 4X43A 3KM6A 2VD1A 3QR6A 1Z9HA 4J2FA 2BS2A 4EQWA 5BMUA 1NHQA 2HZEA 3FKFA 4OMVA 4YT0A 4K7IA 3F6DA 4EE0A 3BI5A 1Q1RA 5ECSA 2ZBWA 1MEKA 1F3BA 1ABAA 4MCUA 3QFAC 2TPRA 4UP3A 1ELIA 1M9AA 4G9HA 3FYGA 3NTDA 2RIIA 1MDIA 3KPFA 1WRYA 1SU9A 4XXGA 4V1Ap 1B8SA 2LRTA 3ZLPA 4EM4A 3DIEA 4ZB9A 3JSKA 2ALBA 2DJKA 1K0OA 2C3TA 4TKYA 1PJ7A 2IFQA 4PQ1A 3PINA 4H2RA 2H0GA 2H1BA 2VLTA 3LORA 2W0HA 4Z43A 2YG4A 2AV4A 4TM1A 2BXRA 2LTKA 1LVLA 4H4RA 2YLWA 1DUGA 1FHEA 2C8UA 2DJJA 2H01A 2OJLA 1WMJA 4JEDA 5B8BA 1TXXA 1F8WA 2E4AA 4TM0A 3I6AA 1GH2A 4D73B 1F2EA 1OVNA 2F8FA 4FDCB 3K8NA 4G2EA 4HJ2A 2AYTA 4KDXA 3A2VA 4GWRA 3DVWA 4U8IA 4HU9A 5IPHA 1DDOA 1NG4A 3CRUA 3UTEA 4POMA 1GOSA 3LW9A 3VLNA 4CCRA 2HI7A 3RP7A 3UKPA 4GF7A 4G19A 5AGYA 5ECIB 2GT6A 3AEAA 1C0IA 1XPQA 2C65A 1E1NA 3G5QA 5M0ZA 4C77A 3LFLA 1F37A 3HZLA 4IP6A 3IE3A 2JKCA 2X49A 2E7PA 1K0DA 3VPTA 1KSUA 3FZ4A 5J4UA 4HS1A 3A5WA 3MIXA 2B7SA 1FCDA 1OE8A 1NG3A 3CXGA 4RQXA 4K7ZA 3SBCA 3QSEA 3KVEA 3GH9A 1P2EA 2WS2A 1ZMDA 4NZHA 3QFBC 2Q0LA 3IK9A 4BK3A 4P3YB 5KN1A 1TK8B 5FHIA 1TRUA 4PXOA 1D7LA 1PBEA 2X99A 3NLCA 3UOMA 1K3LA 4FYUA 1ZOFA 1M99A 1T1VA 1JOAA 1M64A 3NHOX 2GS3A 3TDGA 5ECHB 2VCZA 5B7CA 3L0HA 3RP6A 3W4KA 4PURA 2FWHA 1E1MA 2R0CA 3EC3A 1DJNA 4GRTA 1XANA 5KMQA 2YLXA 3ME7A 1A2LA 1QGVA 3QAWA 2XFQA 2BXSA 2B9XA 3ZVJD 1SJIA 2WDUA 1EL5A 1WPIA 3P7XA 3QAVA 1Z3EA 5HFIA 5HYMA 1O94A 1H81A 5EBKA 2PVOC 3NN0X 1PXBA 2N5FA 3UOXA 2VRMA 4AT2A 3PS9A 1GSDA 3CSHA 3KCMA 3KTBA 4Z7XA 1YKCA 3HVSA 2GGTA 4IJIA 1GTAA 4TM4A 1GRAA 2GSSA 2HXKA 2I4AA 3NTAA 2EQ7A 1FG4A 1YY7A 2F9SA 1ZY8A 3VWUA 2MMZA 5AISA 1MO9A 2VVLG 4MA9A 3ERFA 3F63A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FIW A;  1URM A;  1LQT A;  3CNS A;  4TM3 A;  4KSM A;  3H1N A;  3GDN A;  2PWJ A;  3LYP A;  1ZYP A;  2LNT A;  6GSY A;  3L9V A;  2YZU A;  1T4Y A;  4KAE A;  1JLW A;  2WDQ A;  1E2Y A;  4IJ3 A;  3UBK A;  9GSS A;  1E39 A;  2WPE A;  2IME A;  2JB2 A;  1XXU A;  1LJR A;  1K0A A;  2IID A;  2XC2 A;  1G6Y A;  1JZR A;  1QO8 A;  2DJ1 A;  2FBW A;  2GMH A;  3D21 A;  3APS A;  3CGB A;  2NPB A;  4ID0 A;  3FIM B;  1NPX A;  4IVO B;  4TW5 A;  2E1M A;  2AJQ B;  2WDR A;  3SGL A;  3I69 A;  2IMK A;  3GL5 A;  1W4X A;  1XWC A;  4N0Z A;  5D93 A;  2GZP A;  1MD4 A;  1O8W A;  3CMM A;  2GZY A;  3PR8 A;  3D1C A;  1X9M B;  2A4H A;  2V1M A;  2A87 A;  2R4E A;  4G10 A;  1XHC A;  1NHO A;  4V2N A;  3IAS 2;  3QSM A;  4X43 A;  3KM6 A;  2VD1 A;  3QR6 A;  1Z9H A;  4J2F A;  2BS2 A;  4EQW A;  5BMU A;  1NHQ A;  2HZE A;  3FKF A;  4OMV A;  4YT0 A;  4K7I A;  3F6D A;  4EE0 A;  3BI5 A;  1Q1R A;  5ECS A;  2ZBW A;  1MEK A;  1F3B A;  1ABA A;  4MCU A;  3QFA C;  2TPR A;  4UP3 A;  1ELI A;  1M9A A;  4G9H A;  3FYG A;  3NTD A;  2RII A;  1MDI A;  3KPF A; 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