4ICYA

Tracing the evolution of angucyclinone monooxygenases: structural determinants for c-12b hydroxylation and substrate inhibition in pgae
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
491
structure length
462
Chain Sequence
SDAAVIVVGAGPAGMMLAGELRLAGVEVVVLERLVERTGESRGLGFTARTMEVFDQRGILPRFGEVETSTQGHFGGLQFDFGVLEGAWQAAKTVPQSVTETHLEQWATGLGADIRRGHEVLSLTDDGAGVTVEVRGPEGKHTLRAAYLVGCDGGRSSVRKAAGFDFPGTAATMEMYLADIKGVEGITRIIVCERGTPPSWHEVADAWKRLTGDDIAHAEPVWVSAFGNATRQVTEYRRGRVILAGDSAHIHLPAGGQGMNTSIQDAVNLGWKLGAVVNGTATEELLDSYHSERHAVGKRLLMNTQAQGLLFLSGPEVQPLRDVLTELIQYGEVARHLAGMVSGLEITYDVGTGSHPLLGKRMPALELTTATRETSSTELLHTARGVLLDLADNPRLRARAAAWSDRVDIVTAVPGEVSATSGLRDTTAVLIRPDGHVAWAAPGSHHDLPMALERWFGAPLTG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Polyketide oxygenase PgaE
publication title Tracing the Evolution of Angucyclinone Monooxygenases: Structural Determinants for C-12b Hydroxylation and Substrate Inhibition in PgaE.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp. pga64
total genus 153
structure length 462
sequence length 491
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4icyA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4icyA01
3AE7A 4C3XA 2VRLA 4AT2A 2HQMA 1PBEA 2WPCA 3CPHG 3S61A 4EQWA 2YLRA 4ZCCA 4EQRA 2YR5A 4ZCDA 3UOXA 1ELIA 2NPXA 3BNUA 4X4JA 1L9DA 1M6IA 4FX9A 4A9WA 2YM1A 2GMJA 3V76A 4U8PA 3GMBA 1L0VA 3C96A 4USRA 3NK2X 2C7GA 4PABA 1YKJA 3AE4A 4NTEA 4OPLA 1GRBA 4AP1A 2H88A 3SQPA 1DOEA 2JB2A 1JNZA 1OJ9A 4RSLA 2CULA 1ZOVA 3FIMB 1NPXA 4CNJA 2JB1A 3II4A 1JRZA 2EQ6A 2WOVA 3C4AA 4B1BA 4BJZA 1S2QA 2JB3A 2WOIA 3H8IA 4ICYA 4USQA 3GSIA 2ZZ0A 4JNQA 4H4SA 4EQSA 2X8HA 3VRDB 4D03A 4EMJA 5L46A 2GMHA 4UP3A 2WP5A 4CBQA 3CNSA 4EMWA 4J31A 4JN9A 1K0JA 3D1CA 3ZYXA 1VDCA 3NK1X 4YSHA 2W0HA 4U8LA 1K0LA 1DNCA 3RNMA 2WETA 1N1PA 1LJ1A 2Y6QA 4HB9A 1D4DA 4GDPA 1K4QA 2GRTA 4H4PA 5EBKA 3UKHA 3L1RA 4H4UA 2V3AA 2YG3A 4U8OA 5BUKA 3AEDA 4TM1A 2I0ZA 3QFAA 1W4XA 5HY5A 2GAGB 1Y56A 3H4KA 2X3NA 2H89A 2NVKX 3ICSA 3BNMA 3E1TA 3OC4A 3GD3A 5LV9A 2V3BA 2X50A 1TYPA 3GYJA 4A6NA 2BXRA 4NTDA 4A79A 1NG4A 1OJCA 3SFDA 1CJ3A 4YXDA 4U8JA 1F8RA 1H83A 5HXIA 2VRMA 3CN8A 3KPFA 4B66A 1NHRA 4U8MA 1COYA 2R46A 4DGKA 1MXTA 4EM4A 4K22A 1TRBA 1F3PA 2EQ8A 2X8GA 1UKVG 3CGBA 3F8PA 4O5QA 3VR8A 4YSYA 3BHKA 2VZ2A 1GRAA 1JU2A 1ZP0A 3CNPA 1E7PA 4DNAA 4YTPA 3H8LA 2WP9A 2OLNA 1X31B 2WDQA 4RG4A 4XWRA 1S3BA 1BGJA 1Q9IA 2XLUA 2AR8A 3DK4A 4XXGA 1PXBA 3PVCA 1F8SA 5BRTA 1ZK7A 2JKCA 2PYXA 3GRSA 4FK1C 4EMIA 3QFBA 2B76A 2YAUA 5KXJA 1NDAA 4Z44A 1VQWA 4AT0A 1E6EA 4DSHA 3ISHA 2C76A 1N4WA 4AOSA 2XLPA 2XVEA 3RP7A 1TDNA 4CY8A 4U8NA 4YT0A 3RP8A 3UTEA 2GQFA 5FMHA 5U63A 4K2XA 2IVEA 1KDGA 3HZLA 4ADWA 3IF9A 5HHFA 4H50A 4C77A 3K7QX 1E1MA 3P9UA 1VRQB 3NRNA 4YKFA 3AEBA 2ZZCA 3K7MX 4OPTA 2OLOA 3I3LA 3NTDA 2QA1A 2V6OA 2RGHA 3BI4A 2BA9A 5C3JA 4H4WA 2WBAA 1BF3A 1FEBA 1GOSA 3UKQA 2YM2A 3NHOX 4H4ZA 1PN0A 1V59A 2GVCA 3QSSA 2QA2A 3NG7X 2YLZA 1KSUA 2EQ9A 1H81A 1PXAA 2J3NA 3AE2A 2AQJA 3K7TA 1Q1RA 5M0ZA 3EF6A 1NHQA 2ACZA 1BKWA 3LJPA 1LPFA 4P9SA 4Z26A 2XLTA 1CJ2A 5U25A 4A99A 2YVJA 4BURA 2APGA 2R4JA 1ZOYA 3P4QA 3QVRA 1XPQA 1PJ6A 3UP4A 4DSGA 1H6VA 2YR6A 1CC2A 2R0CA 1OJAA 2Q0KA 2C65A 2E1MA 3F8DA 4YSZA 1PBCA 4IA5A 4APNA 4C74A 3G5RA 1ZMDA 2WPEA 3T37A 2YLTA 3URHA 1MO9A 3LB8A 3VRBA 2XFOA 2WPFA 4U8KA 3DJDA 1ZY8A 1O5WA 1ZMCA 1B5QA 3ATQA 1DJQA 1JRXA 2BK4A 1JRYA 1FL2A 3FG2P 1LV0A 3G5SA 3AE5A 2YVFA 2JK6A 1E1NA 4JNAA 1JOAA 1CJCA 3DK9A 3KVEA 3ZDNA 1YQZA 3GWFA 3KLJA 4JY3A 4B63A 1N4UA 2WOWA 2GQWA 2WDRA 2XLSA 3ABVA 3AYLA 2OA1A 3AB1A 1JNRA 2DKHA 1KNRA 1TYTA 5FS6A 3KU9A 2BACA 5ER0A 4NZHA 3CNTA 1H86A 4BK1A 2YLSA 5U1OA 4YWOA 1GNDA 2BK3A 3PO7A 1DXLA 1PBBA 3UOZA 4MJWA 1LQUA 2OALA 1NENA 1DJNA 1PDHA 3C4NA 3ATRA 3CPIG 5CQFA 1GALA 2IVDA 5FS8A 1NG3A 1D7YA 1K0IA 2A89A 2FJBA 3S5WA 1IJHA 3O0HA 1L9CA 1ONFA 1D7LA 3FMWA 2CDUA 2GR3A 3LOVA 3NYFA 1YY5A 2EQ7A 3RHAA 1GRHA 2Z5YA 3VQRA 2XFUA 1RSGA 5GRTA 3UTFA 2QCUA 2B7SA 5EOWA 1CBOA 3NIXA 2XVFA 2RABA 4LU6A 2Q7VA 4KPRA 4UDPA 4J36A 3LZXA 4EQXA 4Z43A 3ALJA 2PHHA 4RG3A 1O95A 4OPIA 4D04A 2R0PA 3UOYA 4Y4LA 4K7ZA 3AEGA 2FBWA 1Z6LA 2YG4A 3BI5A 3DJEA 3QJ4A 2YQUA 3FPZA 4OPGA 2YLWA 3UKLA 4YTNA 1TDFA 4Z24A 4CCQA 1GESA 2ZZBA 4J2WA 4PAAA 3DA1A 4GRTA 1CC6A 2ARDA 5IQ1A 1GTEA 3B6DA 2GB0A 2BXSA 4FK1A 2VOUA 5IQ4A 1DOBA 2C66A 4AP3A 1AOGA 1P2HA 3P4PA 1ZKQA 1GXFA 2CFYA 3AYIA 1S2YA 3RP6A 3DMEA 3COXA 4C3YA 2XVHA 1JEHA 3GD4A 1OJDA 2X8CA 3VRAA 2XYOA 4EIQA 1BZLA 1YQ4A 2BCGG 2WEUA 1IUVA 2RGJA 5EB4A 4K8DA 5JCKA 5CKUA 4GR1A 4CNKA 1RYIA 1PJ5A 1KF6A 5KVHA 1GRTA 3IC9A 1CHUA 3M0OA 4GUVA 2WU5A 4REKA 1B8SA 3NN0X 2R0GA 1DOCA 4U2LA 2C72A 1E39A 1SEZA 3REDA 3CNDA 3ADAB 3AYJA 5GSNA 2RGOA 2VVLG 4H4RA 2FJAA 2WDVA 3IWAA 4Z25A 2XCGA 4K5RA 3DK8A 2XFPA 1Q1WA 3NKSA 1GV4A 4IA6A 4NEWA 1XDIA 1LVLA 3V3NA 4AOXA 1E1LA 1O94A 1PBFA 3AD7B 3BI2A 1PBDA 3AD8B 4H2NA 2A8XA 3GYIA 4BK3A 4E0VA 2WQYA 4FDCB 1CJ4A 2A87A 2C64A 4KX6A 4CY6A 4WCTA 3IHGA 3KA7A 3P4RA 4NTCA 2E5VA 4H2PA 1LQTA 3ICTA 4H7UA 3ALLA 5J7XA 3SFEA 1IUTA 4JDRA 5EB5A 3ALMA 4GCMA 1ZX9A 4H4QA 3M12A 3PS9A 1E1KA 4GF7A 1N4VA 1L9EA 3ITJA 1MOKA 2AAQA 4IV9A 3GDPA 1EL7A 2GF3A 2GR2A 2V60A 5C2TA 4OCGA 1FOHA 2TPRA 3AE8A 3KD9A 3AE3A 3D8XA 4WX1A 3GMCA 4X9NA 4U2SA 3IHMA 2BS3A 2R45A 3KKJA 5BULA 1VG0A 4B64A 2YG6A 4YSXA 1PHHA 4Z2TA 3AEEA 3CIRA 2VQ7A 1GETA 1H7XA 2C67A 2JAEA 1B37A 3EANA 3LADA 1DODA 1GSNA 4M52A 4OPUA 4TLZA 2C3DA 2Y6RA 3Q6JA 4J33A 2ZBWA 4O5UA 4UDRA 1Y0PA 1QJDA 2GAHB 3QSMA 2FJEA 4I59A 5M10A 1D4CA 2BCPA 4TM0A 3DGZA 3UKPA 2XDOA 2B7RA 4IVMB 2OAMA 1VG9A 3LXDA 5IPYA 3EAOA 2QAEA 3AE6A 1IUXA 3LZWA 3BHFA 2YWLA 2XFNA 3L8KA 3WE0A 1IUWA 1EL9A 4H4YA 4BJYA 2VQBA 2VVLA 3AD9B 1KNPA 3M13A 3AEFA 1GPEA 2UZZA 2YLXA 3AWIA 1PXCA 3CTYA 3FBSA 4H2QA 1S3EA 4J34A 4Y4NA 3UCLA 4A5LA 2BABA 2C70A 3NNEA 5JCIA 2O9ZA 2YG7A 3OZ2A 2CVJA 1NHPA 1EBDA 2XLRA 3ICRA 2E4GA 3CNJA 3Q9TA 4HA6A 4X9MA 3DJJA 3K30A 4ECHA 1EL5A 4OPCA 5KRQA 4B65A 4LA1A 1NEKA 3AXBA 4Y4MA 1ZDLA 1FECA 4JQ9A 4A7AA 4K5SA 5KWFA 2IIDA 1H82A 4TLXA 4BK2A 4H2RA 4CRTA 3P4SA 2R4EA 1RP0A 2BS4A 1GEUA 3CGDA 4Z2UA 3CPJG 4H4VA 1H7WA 4B68A 1PS9A 2Q0LA 2BK5A 5JCMA 3JSKA 3NGCX 4GDEA 1M64A 2WESA 3QSEA 2Q6UA 4Z2RA 3UTHA 1B4VA 4OPDA 4ZN0A 1EL8A 1BWCA 3G5QA 4CCRA 1QO8A 2GR0A 3DJGX 5HYMA 2GEWA 2XVIA 1XANA 1PJ7A 4EIPA 1FEAA 1TDEA 1HYUA 4IVOB 2WP6A 3SGLA 3UTGA 4H4TA 4U8IA 2WHDA 1P2EA 1CC4A 4J57A 3UP5A 3NYEA 2WU2A 3NN6X 4A65A 3V3OA 2C75A 1F8WA 1REOA 1GT8A 2C73A 2B9XA 1F6MA 2YVGA 5JCLA 1FCDA 3P1WA 3NK0X 4XWZA 1OJTA 4NEVA 1NHSA 3UKFA 2FJDA 2YG5A 4YKGA 3AE1A 3VR9A 5KOXA 2DKIA 3F8RA 4TM4A 2B9WA 1Y56B 1TDKA 1GREA 1GERA 2GH5A 1D4EA 4N9XA 1IUSA 1BGNA 1CF3A 4I58A 4U2TA 3NT6A 3QVPA 4B69A 5BVAA 1GRGA 5KVIA 4A6NB 3GDNA 3AE9A 3I6DA 3R9UA 3EPTA 1CL0A 1D5TA 3AECA 3B3RA 3CGEA 5DBJA 3SM8A 4UDQA 2BYBA 3AEAA 2BS2A 3UKKA 4EM3A 4H4XA 4JY2A 2V61A 3NH3X 4C5OA 2XFQA 2VVMA 2C3CA 5FS7A 5J60A 1GRFA 1KSSA 3CGCA 4BV6A 1XHCA 1IUUA 2TMDA 5JCNA 3NTAA 3GRTA 3DGHA 2F5ZA 2GR1A 3GWDA 2XVJA 2R9ZA 3DH9A 2GV8A 2Z5XA 2WS3A 4J56A 1KFYA 3UOVA 3NLCA 5KOWA 2BC0A 4TM3A 3NYCA 2JBVA 5TR3A 1YQ3A 1QLBA 4B67A 4LIIA 4OVIA 5FS9A 1TDOA 4YTMA 1GTHA 2YR4A 2V5ZA 1H84A 1NAAA 2BC1A 2B9YA 2X99A 1LTXR 3UKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LMWA 5CP1A 4MJEA 4AT2A 3UJ1A 5HR3A 2YLRA 4ZCDA 1O81A 3GKXA 1WJKA 1ELIA 1B4PA 3BNUA 1M6IA 4FX9A 2OE1A 4WKWA 5D93A 4BIKA 4USRA 3NK2X 2C7GA 4PABA 4NTEA 4GTUA 4L0WA 5HR2A 3HJPA 5GAPD 5ECQB 4TXOA 1OJ9A 2X64A 3D21A 3TKSE 4ZIJA 3FIMB 3LG6A 4N30A 4ZXGA 1JRZA 4I2UA 4BJZA 4POBA 4DSRA 4XS4A 2JB3A 1PX7A 2BRAA 1R5PA 4F9ZA 2JADA 4IS0A 4USQA 3GSIA 1SL0B 2X8HA 2G2QA 2PU9C 2GMHA 2WP5A 4CBQA 3CNSA 3HCZA 1PL2A 1TW9A 4N10A 3VWVA 1K0MA 3R3EA 4I5QA 4HU7A 4OMVA 1VDCA 2W0HA 1K0LA 1S3RA 2GSRA 4MPFA 5IMCA 1LJ1A 1N1PA 2K8SA 4GDPA 4H4PA 5HR1A 2V3AA 5BUKA 4NPBA 1GTIA 4TM1A 1X0RA 2GAGB 1Y56A 3H4KA 2HFDA 4YH2A 1QXHA 1GNEA 2F9SA 3ICSA 3OC4A 2CQ9A 2BXRA 1U88A 1NG4A 4YXDA 1CJ3A 2MMNA 1H83A 5AIXA 1XWAA 1F9MA 3KEBA 4PQIA 2I1UA 4U8MA 5JWOB 5KN3A 1COYA 2AHEA 2R46A 8GSSA 1TRBA 2EQ8A 3UOMA 1UKVG 4YSYA 2KUCA 1YKAA 2GTUA 1JU2A 3CNPA 4DNAA 4YTPA 1PKWA 3FR9A 5ECIB 1X31B 4RG4A 2DMMA 3AY8A 2XLUA 1BGJA 1F8SA 3WGEA 4XS1A 5BRTA 1ZK7A 4FK1C 2LJRA 5CRGA 4Z44A 5DCGA 4XHMA 2C76A 1N4WA 5F07A 1TDNA 3SZ0A 5ELAA 3RP8A 2VL3A 4HJ2A 5FMHA 5U63A 4H50A 2H0HA 3D4MA 3NRNA 3AEBA 2CX3A 2QKEA 3SZWA 2OLOA 1HNBA 4WR5A 4Q5QA 2RGHA 4WETA 1ERUA 2C8UA 1K0CA 5DBQA 3FZ9A 1FEBA 3F3RA 1RK4A 4V1Ap 3UKQA 5ECMB 2XHFA 1V59A 3GHAA 2QA2A 1A2LA 1KSUA 2EQ9A 4IJIA 2DIZA 5F8BA 4K9ZA 4QQ7A 2AQJA 2J3NA 2HI7A 3K7TA 1VF3A 1ERVA 3LJPA 1JZDA 4Z26A 2XLTA 3IXRA 2H1GA 4ZBBA 3KD0A 3ZRDA 2R4JA 1H6VA 1SK1A 4D73A 4PX1A 2ES7A 4APNA 3HXSA 4C74A 4XRAA 1M2DA 5HFIA 5F06A 3P8WA 2XFOA 1A8YA 2ZNMA 4EVMA 3IPZA 1TP9A 3GYXA 2L57A 3ZL5A 2DJ2A 4L8EA 1CJCA 3HVSA 3GWFA 3KLJA 2K9FA 2HRKA 1N4UA 3A5WA 3EURA 2WDRA 2WOWA 3ABVA 3EC3A 2ALBA 2OA1A 3AB1A 1TRVA 1KNRA 1TYTA 1W4VA 1PMTA 2CA8A 3WYWA 3GX8A 4GQCA 2H0IA 4BK1A 5H5QA 1DXLA 1X9MB 1ERWA 1LQUA 3IK9A 4MJAA 1DJNA 1PDHA 3C4NA 2CVBA 3CPIG 2IVDA 1B9XC 2FJBA 1T4ZA 3KP9A 3O0HA 1PKZA 3ZVJA 2V2GA 3FMWA 2CDUA 3I69A 4AGSA 1SKSB 3NYFA 1YQ1A 1GRHA 3VQRA 2XFUA 2QCUA 2H73A 1SD8A 22GSA 1SL1B 1CBOA 3NIXA 5IMZA 1XW6A 2VM1A 2XVFA 4LMVA 3ZYWA 3IA1A 5LNKe 4KPRA 4J36A 3ALJA 2HRFA 3GMFA 5ABRA 2L4QA 4OFMA 5ECNB 3UOYA 3UAPA 3BI5A 2LTKA 2HE3A 3FPZA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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