1Z6MA

Structure of conserved protein of unknown function from enterococcus faecalis v583
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
SNAMDISVIDATKVNTETGLHIGESNAPVKMIEFINVRCPYCRKWFEESEELLAQSVKSGKVERIIKLFDKEKESLQRGNVMHHYIDYSAPEQALSALHKMFATQDEWGNLTLEEVATYAEKNLGLKEQKDATLVSAVIAEANAAHIQFVPTIIIGEYIFDESVTEEELRGYIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords conserved hypothetical protein
publication title Structure of a conserved hypothetical protein from Enterococcus faecalis V583
rcsb
source organism Enterococcus faecalis
total genus 57
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.1200.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A DsbA-like domain 1z6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6mA01
2ON5A 3FZAA 1O6JA 1ST9A 3F6FA 2JSZA 4TR1A 4L5OA 4LL4B 1U87A 2M80A 4DSSB 3ME8A 2IMEA 1XXUA 5JWQB 2GDRA 2FGXA 22GSA 1KTEA 4PNGA 3BOAA 2FLSA 2VLTA 3HVVA 2KP1A 5D9WA 2HT9A 2QGVA 3S9FA 1OYJA 1F9MA 1TXXA 1X5EA 1G0TA 3HY2A 1R5AA 4OCEA 3VI5A 3CTGA 3N5OA 4Z7XA 1YEPA 2K8VA 2GZYA 5ENUA 3GFKA 4MABA 3FR9A 2PN8A 4EVMA 2PU9C 3EWLA 3TKSA 3I9V2 3EURA 3TRXA 1RQMA 3LYPA 1SU9A 4ECJA 3TJJA 4WKWA 3DD3A 2CX3A 1JFUA 4DSSA 5A4WA 1BEDA 2R5GA 3D4TA 2B1LA 2V6KA 2GSRA 4HQZA 5D93A 1AC1A 4RQXA 5FHIA 2F3MA 3HZ8A 3ZYWA 4EF0A 3A3TA 5ECLB 1J9BA 1FB0A 5ELGA 1Y6EA 5B7CA 4G2EA 2YP6A 4MJAA 4IP1A 5IM9A 3OR5A 3KGKA 4I5QA 1GSFA 2MMNA 1DE2A 1Z3EA 2YWNA 4FO5A 4BVXA 4L0WA 5D9TA 1OC9A 2PMTA 2VCXA 4TVEA 3LJRA 4F9ZA 4TW5A 1UN2A 2EIOA 2GZPA 2KP2A 4O32A 5DALB 2JSYA 2GS3A 1PL2A 2KHPA 1GNWA 1V57A 4IBPA 1ZZYA 5E4WA 3TKRA 3CSJA 4CW9A 2MBSA 3TCOA 6GSXA 4RI7A 4ILFA 2X8HA 2OBKA 4ML6A 5ECMB 1GSYA 5INYA 1F37A 5A4UA 3QAWA 3FZ5A 1Z9HA 5F05A 3D0ZA 2AJQB 5KN1A 2HLSA 4NMUA 4P3YB 2IMKA 3DYRA 3GKXA 4F82A 1GTAA 2WGRA 3QDNA 4IP6A 1EEJA 2EC4A 4TRXA 4JRRA 4L0UA 2PBJA 1IYIA 1FB6A 2YJ7A 3IHQA 4LMWA 5IO2A 3GN3A 5FT3A 20GSA 2LJRA 2LQOA 3DXBA 5DDLA 3C71A 1HNBA 2B3SA 14GSA 1WOUA 2VUPA 4MMMA 4GF0A 1U88A 2CQ9A 2KUCA 3RBTA 4MZBA 5G5FA 1UA5A 4QQ7A 1E2YA 4TR0A 3IE3A 4ZXGA 3GL5A 3HVSA 3D22A 2CVKA 2OA7A 4TR4A 3G7IA 1O81A 3ZL5A 2H0IA 2LRCA 5IMCA 4O92A 2H70A 3WT1A 4HJMA 2H73A 5AIVA 4KB3A 1XVQA 3Q19A 1OC8A 5F06A 4ZB8A 2J9HA 5IOWA 3M1GA 1ERWA 4WF5A 5F8BA 1GUMA 2YWMA 4ZL8A 3KIJA 3DMLA 2XBQA 3GV1A 4ID0A 2VAFA 4KSMA 4KE3A 2MMOA 3HDCA 3RHCA 4V2MA 2WZ9A 3GIXA 2H8LA 3ZLPA 4N11A 2NBSA 4ZL7A 2FA8A 2XPEA 3O76A 3GTUB 1ERVA 5ECHB 3Q6OA 4TN8A 5IPGA 2IIYA 1XWAA 1RW1A 2RLIA 2G2QA 4PNFA 3ISOA 1SK0A 2YANA 3M3MA 4WEYA 2C3NA 3ERFA 3GKKA 4Q5NA 2XBIA 2H6XA 2WB9A 4O7HA 4GCIA 2DIZA 1K0CA 3DIEA 3I6AA 1SL2B 3IOSA 2GT5A 5A4VA 1LJRA 2P5RA 1CQHA 4ACSA 4WR5A 2YJHA 4IN0A 4BVYA 12GSA 2BJXA 3APQA 5G1KA 2RM6A 2QC7A 3LXZA 1QMVA 2DMMA 5JWOB 2VCVA 5HQPA 1A2MA 5DCGA 3CYNA 4I2UA 1EZKA 4HZ2A 4NHWA 5JCWA 1M2AA 2OKAA 2M46A 2I9HA 1EOGA 3VWXA 1W89A 1YKCA 2HSYA 2AYTA 1XZOA 3CTFA 4NPBA 2CV4A 1XWCA 3QD9A 2XPDA 2L5OA 5GSSA 2LV3A 1BYEA 4BL7A 4ZB6A 5EVOA 4HDEA 3V1WA 3IA1A 3HJOA 1SKWB 3MSZA 1OC3A 2HZEA 2GQLA 5GAND 2RIIA 3IRAA 4G9HA 2J23A 1HNAA 3EYTA 4HS1A 2DJ2A 4OO5A 3PH9A 1FW1A 3ZTLA 4WBRD 2DJJA 2JADA 3WYWA 3C8EA 3U6VA 4IJIA 3F4RA 1JZDA 1QGVA 3ERWA 1TK0B 3D5JA 4F0BA 5C04A 2B7JA 2YN1A 3K8NA 3C1SA 5IQYA 3DWVA 4ULXA 5JWRB 3GKMA 1MTCA 1TDIA 1C72A 1OE8A 2H19A 4TOPA 5ECRB 4EKZA 1FG4A 2LUSA 2WS2A 1K0BA 3L9VA 2NTOA 3GURA 5G1LA 4K0NA 4I8BA 4MJBA 4RI6A 4TXOA 2K6VA 4YQMA 4WBJA 1O73A 3APSA 1ZL9A 2I81A 4TKYA 1M9BA 2FD3A 3M0FA 3WT2A 4XS1A 4H86A 3KMNA 4TR1B 3KD0A 3EU4A 3HHVA 1GTUA 2RUEA 1B9XC 2C0EA 3ZMKA 4MA9A 2C3TA 4MLYA 4POLA 2V32A 3KTLA 1VF3A 2VD1A 3O6TA 5CRHA 2L5LA 1OAZA 4OCFA 1A0RP 1SJIA 1J0FA 2VL9A 1GP1A 2O85A 2R2JA 2WJUA 4TXVA 2R3XA 2HE3A 5GSTA 1XWKA 4KCEA 2KLXA 2I4AA 3FHKA 3GSTA 4IS0A 1S3DA 4Q5FA 4KH7A 5IO0A 1THOA 5G5EA 5IMFA 1PN9A 2AUVA 1AQXA 1OVNA 1T4YA 3BBYA 1GLQA 1MDKA 1XVWA 5H5SA 3CRUA 4GSSA 1M7TA 1GL8A 1PSQA 5DJMA 1HD2A 3BJ5A 5J4UA 5J3RA 2L6DA 1V9WA 4JBBA 1Z7PA 2DC5A 4MP4A 4E8EA 3I69A 2LSTA 5CRGA 1WE0A 1J08A 1MD3A 1GLPA 2HRNA 4WXTA 3FKFA 3F63A 4AGSA 6GSWA 3LYKA 4OFMA 6GSTA 3DEXA 2OACA 5J41A 1XW6A 2H6ZA 1M9AA 1OC9B 4LLRA 2PVOC 4I97A 3GRXA 5L71A 3JCML 1URMA 5J9BA 4XRDA 4OFTA 4DSQA 2H0GA 4ECIA 3CXGA 2V6OA 4NHZA 2LEGA 1JZOA 1PD21 3UVTA 1GSUA 2LNSA 2HXKA 1Q98A 3LG6A 1X5CA 3QFBC 1GULA 2LNTA 2H66A 1DUGA 3DKSA 1Z6NA 1ABAA 3WGXA 3KMOA 1T7PB 3APOA 1T4ZA 5KN3A 1G7EA 1A0FA 3KJYA 2YNXA 4F0CA 2IWTA 3LORA 1TI3A 1KNGA 2P0GA 2VCWA 4KAEA 6GSUA 3RAZA 3M9KA 2CZ3A 3QAVA 2H75A 1TKDB 3UAPA 2YPMA 3ZMLA 3L78A 2NPBA 3MNGA 3GYKA 2DSAA 6GSSA 4ZBBA 4IQAA 2OJLA 2N5BA 5IPHA 1VRSD 3O3TA 3QCPA 2H1DA 4OMVA 2LTKA 4K9ZA 3WGEA 3ZREA 3VPQA 2CVBA 2Z9SA 5IMAA 1BQ7A 4PXOA 1O7UA 4BWQA 1K0NA 2IMFA 3CMIA 3A2VA 4GSTA 1QK8A 4ECCA 3L0HA 2TIRA 2EIQA 1SD8A 1Z5YE 2IMIA 1CQGA 2XHFA 3H4KA 4MH2A 5ECKB 4AJ8A 2C8UA 4GQFA 2DIYA 1BJXA 3VI7A 3P2AA 4WF4A 1AAZA 1UC7A 4MF7A 1TTZA 3US3A 3LWAA 3KH7A 4FH8A 2MBTA 2YWIA 1VGLA 1ZYQB 5F0GA 1ILOA 4L5LA 1K3OA 4N0VA 5ECPB 3GH9A 1JLVA 4X43A 4F2IA 1AW9A 3C73A 2WRTA 1ML6A 1R7HA 3LGCA 5H5QA 1FOVA 1PKWA 2FCHA 1SD9A 3RPPA 4YAPA 3G9BA 2AHEA 5B8AA 1A24A 1XBSA 3L9SA 5B6MA 2R4VA 1EOHA 3UARA 4FIWA 1B48A 3RPNA 2DBCA 2C4JA 1RK4A 1YEXA 3MDKA 4YAVA 3D6IA 4PQHA 2AAWA 1XW9A 4KDYA 3FR6A 2O87A 5GZZB 4V1Ap 3IDVA 3QOUA 2B5EA 1X0RA 2CAIA 1ERUA 1EV4A 4MZCA 1FHEA 2X99A 2TRCP 2H72A 3FEUA 3LFLA 4PX1A 1JLWA 4RQRA 5G2ZA 5DAKA 5COHA 1VF2A 4ZB9A 4GQCA 3PR8A 3DGQA 2MYGA 3C1RA 5HFGA 2JZRA 2A2SA 3A2WA 3GNJA 1SK1A 5E59A 2NDOA 1QUWA 5EL8A 3E9JB 3FW2A 4O5RA 1DE1A 1K0DA 4V2LA 3IXRA 1Q4JA 2BMXA 5HR2A 4LL1B 5KN2A 1PRXA 2O7KA 3DVWA 3TJFA 5J5NA 1TP9A 3F4TA 1ON4A 2REMA 2IJYA 1QXHA 1EWXA 3NIVA 2GGTA 5GAPD 2H1BA 3LQ7A 1WRYA 1TI1A 2OBIA 3F3RA 1YKAA 1TW9A 3M9JA 1YJ6A 3VPTA 2IL3A 4WETA 3ED3A 1R5PA 4MPGA 2C3QA 2H0HA 3EMPA 1XFLA 2VM2A 5B8BA 2LS5A 2HZEB 1NM3A 4OWYA 2MMZA 3U5RE 1IYHA 2X8GA 5CO3A 3VWWA 2FWHA 1N2AA 4JU5A 4POKA 2VCTA 1TRSA 1V98A 1PMTA 3IC4A 3CSHA 3F8UA 18GSA 3KEBA 2IPAA 4EL1A 3GHAA 5AGYA 5AN1A 3IAM2 1ZCPA 1AXDA 5AISA 4GSNA 3F9UA 1HNCA 4K2DA 1PQNA 1A23A 4ZILA 5LNKe 1U6TA 4YQUA 1OE7A 4IQ1A 5G30A 5DJLA 4KDXA 4J57E 3Q18A 3FZ4A 1HQOA 2GTUA 4MDCA 4MJCA 1GTIA 4TXOB 1N8JA 1A8YA 5ABRA 2AV4A 3H79A 4NWYA 1A8LA 2PVQA 1LU4A 5HFIA 2D2ZA 3HYPA 4FYBA 5JCUA 1S3AA 2JL4A 1R26A 2EIRA 4ECBA 5DVBA 1SKSB 4XS6A 10GSA 3EC3A 5HFKA 3ZIJA 1WMJA 3AY8A 2LRTA 4RUVA 3PINA 2X64A 4QL7A 2P31A 1SKRB 5DQSA 1T3BA 2YZUA 4WR4A 2R6KA 3ZIVA 3HXSA 5HR1A 2PUKC 4GWRA 4ZBAA 3FK8A 5A5KA 1PX7A 4I2TA 1V40A 2B5XA 3H93A 2F8FA 3P7XA 2WCIA 3BD2A 1EP7A 1YF1A 5HR0A 5CRDA 1TJDA 4X1UA 3E3EA 1B8XA 4PUFC 1GNEA 3M8NA 1O8WA 3F4SA 1O8XA 4LA1A 4V2NA 2CVDA 3MAKA 1EP8A 1X5DA 3LSZA 1X9MB 2FWEA 2PWJA 2I3YA 3TOTA 3QMXA 1U3IA 4D73B 4MH3A 1DSBA 3ZFLA 4ML1A 2L59A 2K8SA 17GSA 4PUAA 3HKRA 5ECOB 4IKHA 2F9SA 3IK9A 4AJ7A 1HYUA 4QL9A 2IN3A 2PGTA 4OO4A 1MDJA 6GSYA 3ERGA 1I9DA 3EE2A 1VF1A 1X9SB 1GUHA 3TJBA 4IJ3A 5LCZA 5CNWA 2VLUA 3IV4A 1Z7RA 1PA3A 3BCKA 1K3LA 4HU7A 1TOFA 5HR3A 1SJZA 2CAQA 2ZNMA 4ZBDA 3ZVJA 2OE0A 2VIMA 1SK2A 4PGTA 3FY7A 1A2JA 1H75A 4XS4A 3TKPA 1K0MA 2H01A 1GRXA 7GSSA 2FUG2 2ZCTA 2VM1A 3IAS2 1R4WA 1EV9A 3VURA 2H1GA 2WFCA 3EU3A 4EO3A 4IHUA 3TOUA 1JHBA 3I43A 2ZUPA 3DRNA 3J7Yk 3GKNA 4D73A 1UVZA 2L57A 3VWUA 4XCSA 2YWOA 1SYRA 3RDWA 3KZQA 2QKEA 4G19A 1FO5A 2YCDA 1NHYA 2TRXA 4NXIA 1XCCA 1PKZA 1AIUA 1YQ1A 4N30A 2GVPA 4HQSA 1TU8A 3SBCA 3TJKA 4YH2A 4PQIA 2VOCA 1M2DA 4EDYA 3KP8A 1TK5B 1EGOA 2XC2A 5CAXA 1PX6A 2ALBA 4K0GA 1EGRA 3QFAC 3DVXA 2C0DA 2HZFA 4GXZA 2HSHA 4N0ZA 1K3YA 1S3CA 5IMDA 2HFDA 1WJKA 2E2MA 3E0UA 3A2XA 2GT6A 1E6BA 4V1Ag 1SJ6A 3N9JA 1KBNA 1F6MC 2B5YA 2WDUA 3MWHA 4IW9A 5DCHA 2KOKA 4K8MA 4ZL9A 3HZ4A 3VK9A 5DBQA 2LQQA 4G10A 2JU5A 3WGDA 2A4VA 5C00A 1H4OA 3UVHA 3ZRDA 8GSSA 2VO4A 3KCMA 1AUCA 1FVJA 4DEJA 2FA4A 2C80A 5ECIB 2VCQA 2VL2C 3PGTA 1OKTA 1B4QA 2F8AA 4NAXA 1K0OA 2VCZA 4MPFA 2M72A 2YOIA 4KA0A 3W8SA 4KSOA 3G7YA 2QSIA 1GH2A 2BTOT 3L9UA 4POMA 4MF5A 2L4QA 4KUNA 4MK3A 2G0FA 1YDKA 1FVKA 2ON7A 1THXA 3D4MA 4Q5QA 3HD5A 5DQYA 2HYXA 2E2GA 1A2LA 1WP0A 4OD7A 2F51A 3P90A 5IMZA 2N5FA 5DAKB 3EMXA 1G6WA 5AIXA 3TKSE 3Q74A 4NV5A 5B6NA 5ECQB 2FWGA 3UBLA 1BX9A 1PL1A 1GSQA 1F2EA 2O8VB 5CREA 3VLNA 1T1VA 4BWSA 2FY6A 1NSWA 4IGJA 4KW6A 3FYGA 3TKSC 2B6MA 3D21A 1AQVA 5DALA 2HRFA 3GMFA 3UEMA 3SWLA 2VLVA 4PURA 3HJMA 1G6YA 2N5AA 4AF2A 2DJKA 3TKQA 11GSA 4E8HA 4I6XA 2MZCA 1F3BA 1MDIA 3CRTA 2JACA 3GL3A 2VL3A 4EC0A 4HUAA 1YF0A 5IOXA 1TK8B 5D96A 1W4VA 4FYUA 4JZQA 3W8JA 4GTUA 4KCAA 1GTBA 1SYXA 3G7JA 1ZOFA 2CZ2A 3ZFBA 2B7KA 4BPYA 4EXJA 1WPIA 4HJ2A 2LJAA 4DVCA 1Y25A 4EUYA 4JR6A 1XOAA 4HU9A 2GLRA 4KGIA 2E7PA 3FR3A 2DJ3A 3R2QA 1GWCA 1GSDA 3FRCA 2LJKA 1G7OA 1Z6MA 1TRUA 1XPVA 3HCZA 4POBA 5D9VA 1SL0B 2YZHA 2FHEA 4MJEA 2DLXA 4XHMA 5LD0A 2DJ0A 1QFNA 2C0FA 2GSTA 4TR3A 1USBA 1GSEA 1F3AA 3KTBA 4MF6A 4JE1A 2IFQB 2H74A 2V41A 5KEJA 2E0QA 1SL1B 3EINA 2R37A 2FWFA 3ME7A 2H1AA 2DJ1A 1BG5A 1O85A 1YY7A 4XIHA 2H6YA 4K7NA 3KP9A 3UMAA 2GQKA 3F3QA 3TGZA 3CSIA 3QPMA 2AB6A 3F0IA 3H8QA 5D8IA 1WWJA 4HEA2 3C7MA 4MZWA 2H76A 5H5RA 3IK7A 2HI7A 3TJGA 2ES7A 2HNLA 3GSSA 5F07A 3ZVJD 2P5QA 2K9FA 4HZ4A 4ISDA 1AQWA 1V2AA 4YQVA 2DMLA 1GUKA 2H71A 3J7Yb 3GX0A 3VWVA 2V1MA 2A2RA 3L4NA 3BCIA 4L8EA 1VF4A 1TRWA 3FZ9A 1ERTA 2B1KA 3F6DA 3RHBA 4J56E 3CBUA 2CT6A 2NVLA 1XIYA 3TB2A 4Q5RA 1BAYA 2IFQA 3GH6A 2I1UA 4GLTA 3W6GA 2MMAA 1B4PA 3LEFA 3UIWA 3ZITA 4CDOA 2JZTA 3GTUA 2L6CA 3ZZXA 6GSVA 4JR4A 1B9YC 4CHSA 3UBKA 2OADA 1I5GA 5ELAA 3UL3A 1X9WB 1SENA 2GSQA 1K0AA 3TRQA 5J9CA 2VD0A 3P8WA 3HA9A 1M0UA 5D73A 2H30A 4N10A 4OFNA 1JZRA 1TU7A 1XOBA 4KDUA 4LMVA 4JEDA 4K6XA 3HJPA 4AJ6A 4BA7A 3NOFA 2OE1A 1YZXA 2GQMA 2CA8A 4J2FA 3IBHA 4XTSA 1NW2A 1WIKA 3QAGA 1T00A 1U3AA 1V58A 3QR6A 5ECSA 5CRWA 3KM6A 1ZGNA 2JZSA 3IR4A 2C0GA 5G31A 2O89A 1MEKA 5ID2B 1EEMA 4KX4A 1ZYEA 3LXTA 1NHOA 4XS4B 1DBYA 4HOJA 2YV7A 2GZZA 3UOMA 1JZWA 1PGTA 2CX4A 5EPFA 19GSA 1LBKA 5JCGA 5EY6A 2RUFA 1XWBA 1XW5A 1TRVA 4DSRA 3TUEA 4GRFA 5CP1A 4HI7A 4ZIJA 5ECNB 4KNDA 2WULA 1QQ2A 4XRAA 3GUSA 4EDZA 4IELA 4EE0A 2V2GA 2GSSA 4FYCA 2PPTA 2LRNA 3IPZA 5IIZA 3A5WA 1FAAA 3EVIA 2K18A 5D9XA 1KEBA 1ACVA 9GSSA 4PQ1A 2LKUA 3KH9A 4NV2A 4IVFA 5ID2A 3GA4A 1T8EB 1M2BA 2C1YA 1ZMAA 1GSSA 3GX8A 4K7IA 3H1NA 3WD6A 4X0XA 1MD4A 1XWGA 3TRPA 3NZNA 5CYYA 2L4CA 1M99A 2VL2A 3UJ1A 2YV9A 1OKDA 5FWGA 3KXOA 5IMVA 13GSA 3TDGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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