3TKS | Genus

Total Genus 63

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	63
sequence length	197
structure length	196
Chain Sequence	HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Peroxiredoxin-4
publication title	Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4 pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	63
structure length	196
sequence length	197
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-08-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tksA00

5C00A 2V6OA 3BOAA 2C8UA 2H0HA 1XOAA 3F8UA 4J56E 3E0UA 3KM6A 4PUAA 1TK0B 2FHEA 4GQFA 3N5OA 4ZXGA 2L5LA 4F0CA 4KDUA 1V9WA 3IA1A 3GKNA 1WIKA 2MBTA 4BPYA 2WZ9A 20GSA 4NHZA 5LD0A 4KNDA 3ME7A 5F06A 4JE1A 1BJXA 4G9HA 2YANA 1VRSD 1OC8A 6GSVA 2LJRA 4TW5A 5IQYA 4JR4A 2GLRA 1U88A 1ZZYA 2RUEA 1FVJA 5IIZA 3MDKA 2HFDA 1SJIA 3A2VA 3CSJA 3TOUA 4MZWA 1YEXA 4GF0A 5ECLB 3US3A 2PN8A 2AHEA 1JZRA 3HYPA 2H6ZA 1QQ2A 1TU8A 4PNFA 3P7XA 4N10A 3HKRA 1S3AA 4POMA 3C1SA 2PVOC 4FO5A 2A2SA 4YQVA 4AJ7A 1GL8A 5EPFA 2ZNMA 3RBTA 3A3TA 2LNTA 3LWAA 2OE0A 2G2QA 3GHAA 2VL2C 2VO4A 4I2UA 1EP7A 1EEJA 2H01A 3TKQA 4FH8A 1NW2A 3GH9A 4IQ1A 3D22A 1KTEA 2LRTA 3KXOA 1K0DA 5G2ZA 1K0BA 4CDOA 2C3TA 2X64A 2O8VB 4V2MA 5IOXA 1UVZA 1Z6NA 2AUVA 4Q5FA 3IAS2 5J9BA 1JHBA 3TB2A 2YV7A 4WKWA 3WD6A 1Y6EA 4MF5A 1OKDA 1SL0B 1TXXA 5D9WA 3F6FA 3GA4A 1O85A 4BVXA 5IMFA 2IMDA 2HZEB 4XTSA 5CNWA 2RIIA 2C0EA 2PERA 1GSUA 1XWGA 3FZ9A 4MLYA 4LA1A 1G7OA 2DLXA 4MDCA 4KSMA 4OMVA 3GKMA 4TXOB 1G6YA 2JU5A 1A24A 12GSA 2EIOA 5A4UA 3H4KA 2CZ2A 3ZFLA 1I5GA 4MCUA 2QGVA 2H19A 5KN0A 3GSSA 1AW9A 5INYA 2CVDA 4K7NA 2LQQA 2YJHA 1URMA 1K0CA 4NPBA 1ERTA 3FR3A 17GSA 1SL1B 3C8EA 1XIYA 2FCHA 2DJJA 2P5QA 3EINA 2WRTA 3TKSE 1M0UA 3D5JA 2VL9A 2OADA 2IMKA 1K3YA 2R37A 2OBIA 4N0ZA 3RHCA 2FGXA 3GFKA 4HDEA 5D96A 3QOUA 3DMLA 5DQYA 4E8HA 1O7UA 3HJMA 4EDYA 1TW9A 2HZFA 5JCWA 4KB3A 3ZLPA 2K8VA 2GVPA 2PVQA 3A5WA 3G9BA 2CX4A 2VLVA 2FWHA 1Z3EA 1LU4A 5HR0A 4DSQA 3ED3A 3DRNA 10GSA 2FY6A 1M9AA 3IAM2 3HA9A 4PQIA 3HZ4A 4PX1A 4RI6A 4PNGA 3FZ4A 2R4VA 1V2AA 3KTBA 2GZZA 1DE2A 3EVIA 5C04A 1SK1A 1CQGA 1PKWA 4OFMA 2H6YA 4F9ZA 5IMVA 4XRDA 4F82A 5HFKA 2X99A 3ZFBA 2GSRA 1T7PB 4KAEA 4WR4A 4TR3A 3D6IA 1X9MB 1RQMA 2M72A 3QAGA 3DXBA 2IIYA 2YZHA 1MDIA 3G7JA 4MA9A 2GSQA 2K18A 2X8HA 4GTUA 4BA7A 2F3MA 6GSUA 3APSA 3ZMKA 1EEMA 1ERUA 2GT5A 2BTOT 4KCEA 4IN0A 2JZRA 2XPEA 2F8FA 2HSHA 4IJIA 1UC7A 1IYHA 2VCZA 2B5XA 2NPBA 1SJ6A 4L0UA 1X0RA 2OKAA 3F4RA 3IDVA 5GAPD 2VCWA 3LEFA 4YQUA 3E9JB 1PX7A 1GWCA 4OCFA 2WJUA 4JR6A 2IMEA 1EGOA 1YF0A 2VM2A 5ENUA 1OKTA 3VWVA 3L4NA 1OC9B 3UMAA 1A2JA 2VCVA 4ZL9A 3A2WA 4MABA 1HNCA 2H30A 3F3RA 2P0GA 4G19A 5JWOB 2LV3A 3KMNA 4ID0A 1V40A 2J23A 4DEJA 2VAFA 2IN3A 5FWGA 1IYIA 11GSA 5HR3A 4KH7A 4WETA 2L6CA 3CRUA 4NWYA 3HDCA 3LYPA 5ECKB 2PU9C 8GSSA 5G1KA 4HEA2 1B4QA 1T00A 2H8LA 3WGDA 5E59A 5B8BA 4QL9A 2RUFA 1M2AA 2DMLA 2EC4A 1EOGA 3GL5A 2CVKA 1TK5B 1TOFA 2C80A 3IPZA 5HFIA 4L8EA 2KP2A 3NZNA 5EY6A 5AISA 3VFIA 1F3BA 4IW9A 4DSRA 4DSSA 4TVEA 4NV5A 3I6AA 4X43A 2H72A 5DAKA 3KD0A 3IV4A 1BG5A 3RPNA 4TR1A 3HHVA 3FR9A 3D0ZA 2KUCA 2MBSA 1T4ZA 2IFQA 1N2AA 5GSTA 5CREA 1A0RP 1PSQA 4KUNA 3QR6A 3CBUA 1TRVA 2HE3A 2K8SA 2LUSA 1TI3A 3GV1A 3TKSC 1UN2A 1BEDA 5GZZB 3SBCA 1PL2A 4E8EA 1OYJA 4EO3A 3IE3A 3ERFA 2DBCA 3O6TA 2OE1A 2B1KA 4MPGA 1K0MA 2HLSA 5G5EA 5H5SA 1SKRB 4EC0A 3BCKA 2H1GA 4K7IA 1B8XA 2C0FA 2PBJA 1G0TA 1MDJA 3UIWA 1TRUA 4N30A 1WPIA 1JZWA 3FZAA 3W8JA 1TDIA 2H75A 1PN9A 3MSZA 2H0GA 1AC1A 1MDKA 1GUMA 1WRYA 1GTAA 2X8CA 2IMIA 5AGYA 2BMXA 2H1BA 3DWVA 1GSFA 4GXZA 2I3YA 4OD7A 2DC5A 1GSQA 5A4WA 1GRXA 2DIZA 3BBYA 4POBA 4DVCA 1WOUA 2XC2A 2VL3A 3HXSA 3F9UA 3DVWA 3GN3A 3IBHA 5JCUA 4QL7A 1XWCA 5JWRB 3UAPA 5F8BA 5J3RA 4WF4A 4N11A 1GULA 3KTLA 3LORA 1EWXA 2YWMA 4V1Ag 4AJ6A 4ECJA 3TJBA 4IHUA 2H71A 4FIWA 3ERWA 3U5RE 2IL3A 2GSSA 2Z9SA 5JWQB 5F07A 5AN1A 1GSYA 1AQWA 1U3IA 4LMWA 1YDKA 4IELA 3WT2A 4OO4A 1Q4JA 4EUYA 3EYTA 3UVTA 2L6DA 3KP8A 1GTIA 1FB6A 4D73A 1OE8A 3CMIA 1OC3A 2YWIA 2ZCTA 5LNKe 5G1LA 2MMZA 5CO3A 4HJMA 1FAAA 5EVOA 5A5KA 1XWBA 4XS4A 3M9JA 2K9FA 1SK2A 4ACSA 3PINA 5J5NA 3OR5A 3FZ5A 3IOSA 2EIRA 5HQPA 1R7HA 2CAIA 4IS0A 2O7KA 1A2LA 4J2FA 3L9SA 2O87A 3RDWA 3ME8A 3CXGA 3CTFA 4XS6A 1HQOA 3UARA 3GURA 3EC3A 4F03A 4L5OA 4MF6A 2TRXA 1VF4A 1ERVA 2WDUA 3QD9A 4TOPA 1M7TA 1K3OA 4OFNA 3TGZA 1PMTA 3EU4A 4EDZA 2GSTA 4X1UA 3O76A 3HY2A 1TTZA 3GSTA 3LSZA 3QMXA 4H86A 4GWRA 4ZIJA 2FA4A 1ZGNA 2G0FA 1X9WB 4IP6A 2QKEA 4YH2A 5ID2A 1PRXA 4GLTA 1BAYA 2DSAA 1GH2A 3Q18A 1B4PA 6GSWA 2ZUPA 3VK9A 4G10A 4BWSA 2FA8A 5F05A 2RLIA 4PQ1A 4PUFC 1ON4A 4IQAA 4EE0A 2I81A 3U6VA 4KE3A 1AIUA 2NTOA 4MPFA 1SL2B 1B9YC 4WBRD 2KOKA 1K0NA 4YAPA 1H4OA 1TI1A 4MH3A 1GUKA 1U87A 5G5FA 3QDNA 2B1LA 5ECPB 3GYKA 5ELAA 5F0GA 1AQVA 2IJYA 2CA8A 2X8GA 2F9SA 2LJAA 2J9HA 1ZL9A 1GSSA 2O89A 1T1VA 3EMXA 3TKPA 2NVLA 3ERGA 2QC7A 3DKSA 4EF0A 2GQKA 3KEBA 3GMFA 2AJQB 3ZL5A 1SKWB 1XW9A 3ZIVA 2CV4A 5DCHA 4YAVA 3ZRDA 1MD4A 1FG4A 4MJEA 4BL7A 2LSTA 3HVVA 1GNWA 2FWEA 4TN8A 4TXVA 5HFGA 1BYEA 1YQ1A 2MMAA 3F3QA 4MZBA 3IR4A 1ZCPA 2KHPA 5CRGA 1ILOA 3GTUB 1F9MA 1TJDA 2H1AA 3VPQA 3VWUA 2N5AA 2R2JA 1AAZA 2N5BA 3VURA 1XPVA 3F4SA 4EVMA 1SK0A 4JU5A 4BVYA 2HZEA 2CX3A 4KW6A 5ECHB 2I9HA 3GRXA 1ZYEA 2HNLA 1UA5A 3LG6A 1DE1A 1GSEA 1W4VA 3F6DA 3QFAC 6GSXA 4LL1B 3Q6OA 5IPGA 4TXOA 1A2MA 4JZQA 1I9DA 3BCIA 1MTCA 1THXA 3K8NA 5IPHA 1AXDA 4ML6A 3C1RA 4DSSB 2L4QA 1DSBA 5J4UA 4ZBAA 3KIJA 5J41A 3QFBC 2JADA 5H5RA 5DJLA 3JCML 5CRDA 1B48A 4FYBA 1O8XA 1GUHA 1PD21 4HI7A 1X5CA 3KJYA 4XS1A 1GP1A 4ECBA 2YZUA 4POKA 1T4YA 5ECSA 3FK8A 1KEBA 3FHKA 3EMPA 4X0XA 5J9CA 3W8SA 2JSYA 1XW6A 1G6WA 3UBKA 4MF7A 4ZB6A 2B6MA 1YJ6A 3ZVJA 2H76A 4I8BA 1OAZA 5DALB 4I6XA 3FR6A 1M2BA 1AUCA 4ZBBA 5IMDA 2RM6A 2OA7A 2P5RA 2NBSA 2GQMA 4KSOA 1F6MC 1PX6A 5G31A 2JL4A 2HRNA 4HQSA 2HI7A 3CRTA 3DVXA 4PQHA 1O73A 3ZVJD 4P3YB 2WS2A 1QGVA 4GQCA 2K6VA 1ACVA 1LJRA 4JEDA 4O5RA 3FEUA 3UVHA 1QK8A 4V2LA 1ML6A 1WWJA 2DJKA 1FOVA 4MJBA 3QAWA 2B5EA 3HJOA 1DBYA 1GLQA 4TRXA 1NM3A 2YWOA 2H70A 2AYTA 2D2ZA 1JZDA 1G7EA 4TR4A 3TRPA 4TKYA 4EXJA 3LGCA 4RUVA 2FNOA 2VD0A 4XCSA 5KN1A 3S9FA 2BJXA 1HD2A 1CQHA 1F2EA 5B6NA 4TR0A 3IC4A 5DDLA 1EOHA 3KP9A 1SJZA 2H66A 2H74A 1XBSA 2V41A 3IXRA 2CZ3A 2MYGA 5HR1A 2FWGA 2VOCA 2IPAA 2R3XA 4RQXA 5ECMB 5KN3A 2DJ2A 1SYXA 1PQNA 3APOA 1PA3A 1S3CA 2GS3A 1GTUA 2E0QA 3TJFA 3ZYWA 5IMAA 2MMNA 14GSA 2WULA 2E2MA 4MK3A 4PURA 1FB0A 1KBNA 4O7HA 5D9VA 4KCAA 1XVQA 3FY7A 4WBJA 2A4VA 3GX0A 3M1GA 2GT6A 3GH6A 5DBQA 5IOWA 4LL4B 2GDRA 4F0BA 1TKDB 1XOBA 2FD3A 2YOIA 2ES7A 1ZMAA 2LEGA 3P8WA 1VF3A 1N8JA 3W6GA 5KEJA 1YZXA 1TP9A 4RQRA 4K8MA 4IKHA 1OC9A 3PR8A 1GNEA 2REMA 4XS4B 3ZTLA 2DJ0A 5GSSA 2L59A 1VGLA 2V32A 3O3TA 2VIMA 2CQ9A 3VPTA 2F51A 3KMOA 2OACA 2FLSA 2AAWA 3GX8A 3MNGA 3AY8A 5L71A 3VWXA 3IK7A 1LBKA 1T8EB 1E6BA 5D93A 5E4WA 1GTBA 3VI5A 3EURA 5COHA 4LLRA 3ZMLA 4LMVA 2C3QA 1J08A 3CSIA 3NIVA 3TRQA 1NHYA 1X5EA 2AB6A 1ERWA 2M46A 3WYWA 1DUGA 2PWJA 2VL2A 2VLUA 5ID2B 3DD3A 3WT1A 4POLA 2ALBA 4HZ2A 5ABRA 1FHEA 3F0IA 4I97A 4NXIA 1TU7A 4KDYA 5D9XA 4AJ8A 1GLPA 1SD9A 4OFTA 1EP8A 5CP1A 5D9TA 3LXZA 3RAZA 1Z9HA 4FYCA 5D8IA 3HVXA 3UL3A 4L5LA 2FWFA 3GL3A 4KX4A 2TRCP 2B7JA 1RW1A 4XRAA 2VCQA 4NHWA 5B7CA 5H5QA 2DMMA 1BX9A 3BD2A 1XZOA 4KA0A 1VF2A 2YCDA 3IRAA 4G2EA 2E7PA 3MAKA 3DGQA 5FT3A 4KGIA 1K3LA 1YF1A 1V98A 4ILFA 2VCTA 2GZPA 4K0GA 1YKCA 5HR2A 3RPPA 1ZYQB 1T3BA 1U3AA 2WB9A 3A2XA 3VLNA 4FYUA 1M9BA 2LS5A 3VI7A 1QUWA 3M8NA 1O6JA 4Q5NA 5G30A 2E2GA 2C1YA 2F8AA 1KNGA 3ZREA 2DIYA 3DIEA 1S3DA 3HCZA 1NHOA 3KH7A 3LYKA 1X5DA 4PXOA 5IMCA 2WGRA 4ZL8A 3LQ7A 2YP6A 1V57A 2R6KA 3TCOA 4NAXA 2YNXA 3E3EA 2YJ7A 5DJMA 2RM5A 4EKZA 3GNJA 2PMTA 2L5OA 3KGKA 3H93A 3HJPA 1USBA 3EE2A 4MZCA 1THOA 2H0IA 3QPMA 1OVNA 2YN1A 5ELGA 2PGTA 2O85A 1MEKA 2V2GA 3WGXA 3Q74A 2R5GA 4HU7A 3IHQA 5ECIB 1HNBA 3LXTA 2EIQA 2GZYA 2GTUA 4ECIA 3CTGA 2JZTA 3HD5A 4ULXA 1R5PA 1A8LA 2PPTA 1JZOA 5LCZA 2H1DA 1VF1A 4V1Ap 1J0FA 3TKRA 4NV2A 3D4TA 3HZ8A 3PGTA 1W89A 3C7MA 1EV4A 1XFLA 4ZB9A 3I43A 2VLTA 2GGTA 2HSYA 5D73A 1XCCA 5CRHA 3NOFA 3IK9A 3GUSA 3CSHA 3TJJA 1ST9A 3Q19A 2VUPA 2CT6A 3H79A 1F37A 4IVFA 4ZB8A 5FHIA 1FO5A 4K2DA 6GSTA 5IM9A 3H8QA 4K7OA 4JRRA 3EU3A 2DJ3A 1FVKA 4KDXA 3ZIJA 2NDOA 4IGJA 1Z6MA 2C0DA 2WFCA 3L0HA 3SWLA 2MZCA 2JZSA 4GRFA 1Q98A 3P90A 2XPDA 4ZILA 3FKFA 1HYUA 1K0AA 1QMVA 2WCIA 1BQ7A 4HJ2A 1NSWA 2LQOA 4L0WA 2OE3A 1X9SB 9GSSA 4K6XA 3UJ1A 4CHSA 1GSDA 1WJKA 5A4VA 5IO0A 1PKZA 2V1MA 2B7KA 4HS1A 2XBIA 1PL1A 2LNSA 1V58A 3ZZXA 3KH9A 1XWAA 2KP1A 4XIHA 4O32A 4OWYA 4WR5A 2VD1A 1SKSB 4ECCA 4NMUA 2LTKA 3GKKA 5DQSA 2LKUA 2YPMA 1QXHA 2ON5A 1SU9A 1E2YA 1M2DA 5DAKB 1M99A 2I4AA 2PUKC 2IWTA 2HT9A 1QFNA 4TR1B 1ABAA 4I2TA 2HYXA 1OE7A 3TJKA 4O92A 1WP0A 22GSA 1EZKA 2IFQB 1XWKA 3KZQA 4HU9A 3TRXA 4ZBDA 5CAXA 13GSA 4WEYA 3TJGA 3EWLA 4JBBA 5DVBA 3DYRA 3G7IA 3MWHA 4Q5QA 3L9UA 1O81A 2C0GA 1XXUA 3GKXA 18GSA 3J7Yb 3UEMA 4IJ3A 3QCPA 1H75A 3LFLA 2H73A 3L78A 1YY7A 3LJRA 1YKAA 3PH9A 1Z7PA 1Y25A 1TRSA 2ON7A 1Z7RA 3C73A 2XHFA 3N9JA 7GSSA 4HZ4A 2GQLA 4BWQA 5GAND 1A23A 2CVBA 3GIXA 2AV4A 4MJCA 4ISDA 5CRWA 4EL1A 4YQMA 3F4TA 1JLVA 3GTUA 1EGRA 4HOJA 1A8YA 4MMMA 3RHBA 6GSSA 2C3NA 1ZOFA 2JACA 3FW2A 5KN2A 4GCIA 4I5QA 1WE0A 3TKSA 3M9KA 2B3SA 4ML1A 3TDGA 2H6XA 3L9VA 3UOMA 1RK4A 4OCEA 1K0OA 2LJKA 4WXTA 2P31A 2L4CA 2TIRA 5DCGA 4IBPA 3H1NA 4MP4A 1F3AA 2XBQA 1FW1A 4N0VA 2N5FA 2LRNA 4K9ZA 4Q5RA 2OJLA 4F2IA 5AIXA 5ECNB 3M3MA 3I9V2 3P2AA 3R2QA 4WF5A 5IMZA 2C4JA 4XHMA 1R5AA 1C72A 2CAQA 4CW9A 1JFUA 3UBLA 1HNAA 4HQZA 2V6KA 3KCMA 3VWWA 1SENA 4IP1A 1MD3A 2MMOA 1A0FA 2L57A 3APQA 5ECQB 5ECRB 1YEPA 4K1FA 1U6TA 3TUEA 5JCGA 2YWNA 3C71A 4RI7A 1WMJA 1B9XC 4J57E 5EL8A 3WGEA 16GSA 5ECOB 3ISOA 1JLWA 1TK8B 3FYGA 4D73B 19GSA 3M0FA 2VCXA 2I1UA 2HXKA 4ZL7A 3D21A 3I69A 2YV9A 3F63A 4MJAA 5DALA 1XW5A 1XVWA 4PGTA 4GSNA 3HVSA 4GSSA 2QSIA 5AIVA 1SD8A 3QAVA 3FRCA 3DEXA 2DJ1A 1Z5YE 5IO2A 1TRWA 2VM1A 1SYRA 1PGTA 3D4MA 5B8AA 2JSZA 4OO5A 4MH2A 3ZITA 5B6MA 2LRCA 4HUAA 1EV9A 4AF2A 4GSTA 3G7YA 6GSYA 2KLXA 4V2NA 4K0NA 1AQXA 2B5YA 1R4WA 2FUG2 1R26A 4Z7XA 1J9BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3TKSA

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structure length

Chain Sequence

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Chord Diagram

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