3HXSA

Crystal structure of bacteroides fragilis trxp
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
GTIHLTRAEFLKKIADYENHSKEWKYLGDKPAIVDFYADWCGPCKMVAPILEELSKEYAGKIYIYKVNVDKEPELARDFGIQSIPTIWFVPMKGEPQVNMGALSKEQLKGYIDKVLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Electron transport
molecule keywords Thioredoxin
publication title In vivo oxidative protein folding can be facilitated by oxidation-reduction cycling
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides fragilis
total genus 26
structure length 117
sequence length 117
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hxsA01
5EL8A 3WT1A 3IDVA 1NM3A 4KNDA 4L5OA 2KLXA 5JCUA 3KP8A 5FT3A 5JWOB 5INYA 1YF0A 2P0GA 1G6WA 2GZPA 4PQHA 4PQ1A 1PX7A 3WYWA 4CW9A 1G6YA 1XXUA 2DLXA 1F2EA 4K0NA 20GSA 1SKRB 5F07A 2XBQA 2WULA 3FR3A 2FWHA 1HYUA 1EP7A 3IK9A 3KM6A 3RPNA 5B8AA 5HFIA 3UL3A 1FW1A 1XFLA 1FHEA 1NW2A 1OE8A 4HI7A 2ZNMA 2FY6A 3GSTA 4ID0A 3DYRA 3M9JA 1R5AA 4TVEA 1K0CA 2XBIA 3TRXA 2C0FA 2FNOA 1YY7A 3ZYWA 1GTIA 2EIOA 4GCIA 1EGOA 4ULXA 5ELGA 2B7JA 1JZDA 2KOKA 1RK4A 2K8VA 2LEGA 2FWFA 3O6TA 4AJ7A 5IOWA 3I43A 1OYJA 4EO3A 5HR1A 1DUGA 2GT5A 1O6JA 1JFUA 4Q5RA 1TDIA 5ECNB 4ZBAA 4MF5A 2J9HA 2F51A 4MZCA 3JCML 2MBSA 4MJAA 2LNTA 5IMAA 3A2VA 3MDKA 1GSQA 4POMA 1PKZA 4KCAA 4TR1A 2JADA 2X64A 3MSZA 2JACA 1Z6MA 4ISDA 1AQVA 3VK9A 4DSSA 4E8HA 3QAWA 4MJBA 1O85A 2YV7A 1ZZYA 3BOAA 3KEBA 1UC7A 3TJFA 4JZQA 1YEPA 2E7PA 1V40A 4NV2A 1EP8A 1PD21 2P5RA 2RM6A 3Q74A 4RUVA 3F3QA 2E0QA 2H73A 3TJGA 2B7KA 1QK8A 4ZBDA 2CQ9A 1AAZA 2YWIA 1FB6A 2CVDA 5LCZA 4IP1A 1U3AA 4WR5A 1TRWA 2GTUA 4ZB6A 2DSAA 2DJJA 16GSA 4V1Ap 1A2JA 4EDZA 3QCPA 3CSIA 3H4KA 2R6KA 2WS2A 1OKTA 4KSOA 1MD3A 2AUVA 3VI7A 5AIVA 2PUKC 2E2GA 4J56E 1LBKA 2FWEA 3VLNA 3ZRDA 1M0UA 2V2GA 4KCEA 1O7UA 2H6XA 3EWLA 4NMUA 4OFNA 1VF1A 4K9ZA 2F8FA 1PRXA 3ZVJA 2GSQA 5GAND 3GYKA 4EC0A 3DXBA 5JCWA 1V2AA 2L5OA 3FHKA 3M0FA 1F3AA 3GH6A 3GUSA 4TR1B 4RQXA 5FHIA 3ZL5A 1JZRA 2R4VA 3GH9A 4I6XA 1H75A 2WZ9A 1B48A 4MJEA 1TU8A 1SK0A 2TIRA 3CXGA 4LLRA 3HDCA 4JEDA 2LRNA 3P7XA 2LTKA 4L0WA 1M9AA 1FVJA 4OCFA 3UBKA 1YEXA 3BCKA 2IMIA 1PX6A 1Z5YE 2B3SA 4RI7A 3W6GA 1ML6A 1ZYEA 1V98A 5IMVA 4IHUA 4DVCA 4OFMA 3TJKA 2IMFA 4HS1A 3LJRA 4MPFA 1GSSA 3IPZA 2FGXA 4I5QA 4TR3A 2FCHA 2YZUA 4IELA 2VCXA 3L9SA 3GKXA 2R5GA 2I3YA 3TCOA 1HNCA 2V6KA 2C3NA 1VF4A 1JLVA 3ZVJD 2JZSA 2H66A 1J9BA 3IBHA 2P5QA 2HRNA 5G31A 3D22A 5A5KA 2LQQA 2K8SA 3HCZA 4IKHA 1G0TA 3NIVA 4KE3A 4MH3A 1PN9A 5CAXA 1Z7RA 3ERFA 1K3LA 3H79A 2D2ZA 2AHEA 3M1GA 1ZOFA 4V2MA 2B6MA 3LEFA 4XS1A 3F8UA 2OE0A 4YQMA 1B4QA 1XOBA 2ZUPA 4GF0A 4JR6A 2F3MA 1MEKA 2CVKA 5COHA 3TKSC 4FYCA 5LD0A 1ERTA 1WMJA 4ECBA 4EUYA 3KGKA 1FOVA 1XWBA 3TKQA 1TXXA 3ISOA 1SL0B 2PVQA 2O8VB 1A8LA 5ID2A 2CZ2A 4IJIA 3FR9A 3FR6A 5DAKA 3KXOA 3G7YA 1SK1A 3D0ZA 1XVQA 2HNLA 4BWSA 1XZOA 3K8NA 1K0AA 3HZ4A 5JWQB 1E2YA 5DJMA 1O8XA 4MJCA 3EMXA 3KH7A 2HYXA 2BTOT 1SL1B 4BPYA 4MDCA 4RQRA 5D9TA 3LQ7A 1NHYA 4G10A 1BEDA 3P8WA 4MABA 4O5RA 1SD9A 3FZ4A 4X1UA 3IR4A 2H19A 4OFTA 2A2RA 4EVMA 2I4AA 2CA8A 1WJKA 5G1KA 1TKDB 3QMXA 2NPBA 2HFDA 1S3CA 4D73A 4KDUA 2FHEA 2V32A 3APQA 2H1AA 5F06A 1WIKA 4N10A 3GN3A 2HZFA 1K0MA 4IBPA 4K1FA 2PN8A 4HUAA 2AAWA 1TI1A 3TRQA 3KTLA 3PINA 1JHBA 3WGEA 3J7Yk 5G2ZA 1HNBA 1FVKA 4BWQA 1GULA 1UN2A 4YH2A 1OC9A 3CSJA 3KMOA 4MMMA 1GUHA 4GTUA 2QKEA 4I2TA 5KN3A 3D21A 5ID2B 3MNGA 1QFNA 1A0RP 5DAKB 4KDXA 4PNFA 3UJ1A 2G0FA 3VURA 4HJ2A 1GLPA 2K18A 5ECQB 4JE1A 3IXRA 3EYTA 2YJHA 4ECJA 2VL9A 2H0IA 1XVWA 1GTUA 1AUCA 4V2NA 5ECOB 2WGRA 2B1LA 2OE1A 3GX0A 1R4WA 5J3RA 3TOTA 1GSUA 1KBNA 4WXTA 4ZB9A 3WD6A 1AC1A 4CHSA 1T3BA 4GSTA 5HR3A 5E59A 1MDJA 2HZEA 3TOUA 1TI3A 2B5YA 4D73B 5CO3A 3UIWA 3TKSE 4YQVA 1USBA 3A2WA 3TDGA 2K6VA 1I5GA 5IM9A 2CV4A 2I9HA 5C00A 3TUEA 2GLRA 4JU5A 4X0XA 3KJYA 3VPQA 1BYEA 9GSSA 2AV4A 1X5EA 4XRDA 6GSXA 1T1VA 1DE1A 3GKMA 2KP2A 2F9SA 3FZAA 2HI7A 1R7HA 3A3TA 3MAKA 1PMTA 4NHZA 1X0RA 4L0UA 5D9XA 2NDOA 3I9V2 1TRVA 3ZIJA 5D9WA 4WEYA 4IJ3A 1PL2A 3E3EA 5H5SA 2OE3A 4Z7XA 1A2MA 1B8XA 4HU9A 2LJRA 4KGIA 1X5DA 2L6CA 3VI5A 2GSTA 1ERWA 5IQYA 2HZEB 3Q19A 2L6DA 1M99A 2NTOA 1ZYQB 1C72A 4MA9A 1HNAA 2L5LA 5GAPD 1DE2A 2HLSA 1THOA 1QGVA 2IFQA 1GL8A 19GSA 2LV3A 1ZGNA 5DJLA 4FYUA 1AIUA 3UEMA 4WETA 3HA9A 2R37A 2V6OA 1Z7PA 2ALBA 4F0CA 2C0DA 2H74A 2QGVA 3UARA 2ON7A 3IHQA 3APOA 4WKWA 3FEUA 4LA1A 2F8AA 1K3OA 3IOSA 3F0IA 4MZWA 3EVIA 4XS4A 1X9MB 5ENUA 2V1MA 3EC3A 2LSTA 3GHAA 2OADA 2YV9A 4OCEA 2DJKA 2ES7A 5J9BA 4POLA 2PVOC 3CTGA 2YNXA 3BCIA 1TOFA 2RM5A 1O8WA 3F6FA 1F6MC 2RIIA 4HQSA 4AF2A 4GQFA 4EE0A 4KSMA 2VL2C 2TRCP 5CREA 4KDYA 1VF2A 5B6MA 1VRSD 3RHBA 4JBBA 1T00A 2DC5A 5ECKB 3CRUA 2RUFA 1ZCPA 1TW9A 2PBJA 3QDNA 1OC3A 3H1NA 5F0GA 3ZLPA 1HQOA 3FW2A 2VLTA 3TKRA 3U5RE 3M9KA 6GSSA 3AY8A 6GSYA 4WBRD 1Y6EA 1YZXA 5KN1A 4IS0A 2H71A 10GSA 1OC8A 2YOIA 3VFIA 1OAZA 2IFQB 4ZL9A 5D96A 2VCVA 2GZYA 4ZIJA 2H6YA 3L0HA 1T8EB 5F05A 3HD5A 2MMNA 1YF1A 3LORA 1PKWA 2GQKA 1GSDA 4N11A 1ST9A 4PGTA 3C7MA 4ML6A 1O81A 4L5LA 2DMLA 3QPMA 3G9BA 4J57E 4G9HA 4O7HA 2VM1A 4PX1A 2REMA 4K7NA 2B5XA 1MTCA 2H1GA 1BX9A 1FB0A 3FY7A 2WB9A 3ZTLA 3UOMA 3PGTA 3TKPA 1X9WB 4EXJA 4P3YB 2DBCA 4DSSB 3QOUA 4XS6A 2M80A 3DGQA 3HHVA 1ABAA 4IQAA 3OR5A 2L59A 4OWYA 3E9JB 5KEJA 3CRTA 4ZILA 1SU9A 1GH2A 5IPGA 3VWWA 3EMPA 3I6AA 4ECIA 2A4VA 2J23A 4OO5A 3IV4A 2DJ3A 4CDOA 2FA8A 2AJQB 1T4ZA 1X9SB 3NOFA 3UMAA 2BJXA 4MP4A 3UBLA 3KD0A 4TXOA 4KH7A 3L4NA 1DBYA 4KA0A 3HJPA 5H5QA 2YN1A 2HSHA 4WBJA 3A2XA 1EZKA 3F3RA 1UVZA 1S3AA 3LSZA 2NBSA 1HD2A 1XPVA 3DRNA 2H8LA 1M7TA 3UVHA 1QMVA 4PXOA 3C1SA 3GTUA 4GQCA 2QSIA 2JSYA 1SJZA 1A24A 2LS5A 1WRYA 1ZL9A 5IPHA 4POBA 3HKRA 2YWNA 4F82A 4EKZA 1B9YC 1W4VA 2RUEA 2C4JA 1FO5A 4I2UA 4PUFC 2WRTA 4IQ1A 3GX8A 4NXIA 4XIHA 4BVYA 5CP1A 3FZ9A 2GGTA 4ZBBA 2C80A 4YQUA 2YZHA 2FA4A 4IP6A 4F9ZA 1WPIA 5IMDA 1DSBA 2VLVA 3HVSA 3ME7A 2YJ7A 2IMDA 2X8GA 1XCCA 4HQZA 3NZNA 4HZ2A 2M72A 1VGLA 1M9BA 2EIQA 3TRPA 3A5WA 1PSQA 4LL1B 4MF7A 4G19A 4GLTA 4ACSA 1QXHA 2DIYA 2H76A 2DJ0A 2H0GA 5ECMB 1GUKA 3DVWA 3EU4A 2XPEA 3WT2A 1SKSB 2VUPA 3CMIA 3GTUB 5HR2A 1XIYA 1WE0A 4NWYA 3ZMKA 1K3YA 3GMFA 4DSRA 2PU9C 1G7EA 4QL7A 1M2DA 6GSVA 3WGXA 5B8BA 2IL3A 2VCZA 5IOXA 5G1LA 2ZCTA 1THXA 1CQGA 3TB2A 3KZQA 2WCIA 4G2EA 3KP9A 3D5JA 4J2FA 4Q5QA 1N8JA 3TGZA 3KIJA 1A0FA 1OVNA 2JU5A 2R3XA 2E2MA 2JZTA 3LYKA 2IPAA 4MCUA 1SENA 2C0EA 5KN2A 1IYIA 2AYTA 5D93A 2DJ2A 3HJOA 1WWJA 2VAFA 4FO5A 2L4QA 3D4MA 4Q5FA 1SJIA 4YAPA 4POKA 1A23A 1WP0A 1SYXA 1GP1A 2LRCA 2VCTA 1QUWA 3HZ8A 1LU4A 4TN8A 3KTBA 5DBQA 5AN1A 3LG6A 2H6ZA 1H4OA 1V58A 3CTFA 5G30A 2H72A 2H1BA 3EU3A 3ZIVA 3I69A 1B9XC 4HEA2 1BAYA 1GNWA 4NPBA 3L9UA 1E6BA 2N5BA 2VCWA 2YCDA 3ZREA 5HFGA 2GQLA 5H5RA 2VL3A 3E0UA 4MK3A 3PR8A 3ZFBA 2HSYA 3GV1A 5ABRA 1SD8A 1SKWB 5A4UA 3GFKA 2HE3A 1EWXA 4PQIA 4AJ6A 4PNGA 3GKKA 2DJ1A 1OKDA 4NAXA 2ON5A 7GSSA 5G5EA 4E8EA 3RAZA 5D73A 4WF5A 2LUSA 3DD3A 4K7IA 2A2SA 3W8SA 5ELAA 1ILOA 2TRXA 2YP6A 3LGCA 2FD3A 4HU7A 3DEXA 3J7Yb 3IC4A 3DMLA 4JRRA 1XWKA 1V9WA 3ERWA 3D4TA 1SL2B 4FYBA 1A2LA 1BG5A 1OC9B 3UAPA 1XW5A 22GSA 3GL3A 2MZCA 3SBCA 2WFCA 2CX3A 2YANA 1YQ1A 4HOJA 3U6VA 8GSSA 2O85A 5CRWA 4FH8A 3KCMA 3GRXA 1XWGA 5J4UA 1MDKA 12GSA 3F6DA 2B5EA 3D6IA 3ZITA 2WDUA 1TK0B 1U87A 2WJUA 3M3MA 4V2LA 5DQSA 3HXSA 4X43A 3VWUA 4OD7A 3H8QA 3F4SA 1ON4A 1GLQA 2H0HA 2HXKA 2MYGA 4JR4A 1EGRA 1GSFA 2VCQA 2MMOA 3QAGA 1XW6A 5AIXA 1SK2A 1TK5B 1AW9A 4DSQA 3C1RA 4HJMA 1B4PA 17GSA 3RHCA 4WR4A 1IYHA 3RDWA 1SYRA 1KEBA 4KUNA 2LKUA 2MMAA 3O76A 5JCGA 1GTBA 1UA5A 2DIZA 2MMZA 2H30A 1KTEA 3DWVA 2HT9A 1XWAA 1MDIA 2LNSA 2XPDA 3L9VA 4GWRA 3SWLA 4PURA 4KAEA 3IA1A 3GNJA 2OA7A 4TRXA 3QR6A 1GNEA 4MF6A 3CSHA 4MH2A 3VWXA 1U6TA 2LJAA 3QD9A 1CQHA 1Q4JA 2CX4A 3BD2A 3M8NA 3GA4A 4N0ZA 1SJ6A 1NHOA 4EF0A 1YKAA 2KUCA 4I97A 4H86A 1JZOA 1Y25A 5B7CA 2C0GA 1GWCA 4MZBA 1A8YA 5IMFA 3F4TA 5ECSA 3KMNA 3LWAA 4F2IA 2IMEA 4F0BA 1PGTA 4IGJA 4TXVA 2IWTA 4BVXA 1XW9A 5GSSA 2I1UA 3FYGA 5ECRB 2B1KA 4PUAA 4XTSA 2OBKA 2VD1A 1EV4A 2FUG2 2XC2A 3DIEA 3TKSA 4GRFA 5CRGA 3BBYA 4MPGA 1JZWA 3Q18A 4NHWA 3FZ5A 5IO0A 2OBIA 3HVXA 5IIZA 5D9VA 1JLWA 2EIRA 14GSA 1K0DA 3US3A 1GSEA 2X99A 3V1WA 1M2AA 4NV5A 5IMCA 3IAM2 5B6NA 1GSYA 4ECCA 2N5FA 3IK7A 5J41A 4TOPA 3WGDA 2CAIA 18GSA 4TR4A 2C3QA 5DVBA 3HYPA 4FIWA 4XS4B 5JWRB 2CT6A 2OKAA 5C04A 3L78A 3QFBC 2XHFA 5A4VA 3C8EA 3GKNA 2M46A 1K0BA 3FKFA 5F8BA 3RBTA 5HR0A 1XBSA 4TR0A 2H01A 1AXDA 1YKCA 1R5PA 1J0FA 2IMKA 3N9JA 5L71A 4Q5NA 3LFLA 2GQMA 4YAVA 3BJ5A 2RLIA 1TU7A 4BA7A 5CRHA 4KX4A 2O89A 4DEJA 2IN3A 4TW5A 1T7PB 2L57A 5HFKA 3ERGA 4GSNA 2NVLA 4ZB8A 1PL1A 4N0VA 3FK8A 3O3TA 1TRUA 4AGSA 3F63A 3GL5A 1YDKA 2X8CA 4GSSA 1I9DA 4K0GA 1F3BA 1FG4A 2C1YA 2FWGA 1Z6NA 3R2QA 3TJJA 3PH9A 2N5AA 3CBUA 2CAQA 2C8UA 2KHPA 4V1Ag 3S9FA 1OE7A 3MWHA 3QAVA 2MBTA 5IO2A 2H75A 1U3IA 5G5FA 1K0NA 3CYNA 2DMMA 1R26A 3LYPA 4O92A 4XCSA 4GXZA 2H1DA 4LL4B 5DCGA 2PMTA 3GURA 2JL4A 3G7JA 5EPFA 3KH9A 6GSTA 1TTZA 1AQWA 4IN0A 3LXZA 2LJKA 2AB6A 3TJBA 1PQNA 1TJDA 3N5OA 5KN0A 2PWJA 1KNGA 2O7KA 5DQYA 1Q98A 1U88A 5ECLB 2GZZA 2IJYA 3G7IA 5J5NA 4IW9A 1ERUA 2L4CA 5E4WA 4ZL7A 3QFAC 3ZMLA 4RI6A 3HY2A 3EINA 1FAAA 4LMVA 4XRAA 4WF4A 5D8IA 5ECHB 1V57A 1WOUA 2GVPA 3UVTA 3W8JA 1GUMA 3IRAA 2GS3A 2VO4A 2KP1A 4TXOB 4QL9A 4O32A 1Z3EA 2FLSA 4MLYA 2LQOA 1M2BA 5DALA 1W89A 5CNWA 2JSZA 1RQMA 4EDYA 4HZ4A 4F03A 3VPTA 4K8MA 5CYYA 4K6XA 3C73A 2I81A 2GT6A 2VM2A 1NSWA 1T4YA 1GRXA 2VLUA 3VWVA 5CRDA 2R2JA 5A4WA 3DVXA 1Z9HA 2H70A 1BQ7A 1K0OA 2OACA 1ERVA 2YWMA 3HJMA 2BMXA 4AJ8A 4KB3A 3Q6OA 3FRCA 5AGYA 1YJ6A 2X8HA 2EC4A 1LJRA 4ILFA 2GSRA 1TK8B 1G7OA 2PPTA 1MD4A 1EEMA 2JZRA 3C71A 1URMA 2GSSA 1QQ2A 2YWOA 3F9UA 5LNKe 1XWCA 4XHMA 4LMWA 5GZZB 2HRFA 1XOAA 3P90A 3ZZXA 5EVOA 6GSUA 2LRTA 3IAS2 1EEJA 1X5CA 4I8BA 13GSA 4KW6A 3RPPA 4TKYA 2YPMA 2P31A 2O87A 5ECIB 5IMZA 2Z9SA 1VF3A 3GSSA 1TRSA 1J08A 2OJLA 3DKSA 4K2DA 3ME8A 3H93A 4L8EA 5DALB 1ZMAA 1F9MA 1S3DA 2K9FA 2CZ3A 1EOHA 2CVBA 5HQPA 4IVFA 1AQXA 2PGTA 2VD0A 2G2QA 1F37A 1RW1A 3IE3A 1PA3A 5EY6A 2PERA 1EV9A 1BJXA 3GIXA 2VL2A 3LXTA 4ZXGA 3EE2A 3ED3A 2IIYA 3F4RA 5DCHA 4BL7A 4N30A 2VIMA 5J9CA 4HDEA 1O73A 2GDRA 5FWGA 3HVVA 3EURA 3P2AA 11GSA 2VOCA 3APSA 5DDLA 5ECPB 4ML1A 1N2AA 4OMVA 4ZL8A 1EOGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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