4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3K7MX 4KX6A 2Z5XA 3P4QA 4EQWA 1F3PA 3C96A 4H4UA 2BK5A 1M64A 3ALMA 2R0CA 3UP5A 5JCNA 2H88A 3F8PA 4HB9A 4U8MA 3RP8A 4H2RA 2IVDA 4JQ9A 3SM8A 2XLTA 2C66A 5GRTA 4B65A 4DSGA 5EBKA 1V59A 3EF6A 2YQUA 1NAAA 3D1CA 4NEVA 4USQA 1KSSA 3P4SA 3SQPA 3AE3A 4EMIA 1E1KA 4C5OA 4K8DA 1IUXA 3UKHA 3NHOX 4ICYA 2BA9A 1YQZA 5J7XA 4K2XA 1DNCA 2BXSA 4A9WA 2VRLA 1YKJA 3AE2A 4Z43A 3CGDA 3NK1X 5CKUA 3CNSA 5J60A 1GTHA 1JU2A 3D8XA 1H7XA 1YY5A 3ZYXA 4H4ZA 1OJ9A 1QLBA 2OLNA 2XFPA 4OPDA 2A8XA 3UP4A 4EQSA 2V6OA 1LJ1A 4H2PA 1ZX9A 1KF6A 3ICTA 2VQ7A 1BGNA 1NHSA 2GR1A 2X8CA 2YVGA 2JBVA 2WP6A 3CNTA 4AOSA 2V61A 3CPHG 1GERA 3UKKA 4Z25A 4U8JA 3FPZA 3BNUA 4WCTA 1H86A 3GWFA 2YVFA 3ADAB 2VVMA 3ITJA 2X8GA 3AE4A 3SFDA 1N4UA 1Y56B 1PBDA 1NHQA 1H84A 1ZMDA 2Q7VA 4C77A 1PBBA 3AB1A 4Y4NA 4CCRA 1COYA 4CRTA 1NHRA 3GYIA 1KSUA 2YLRA 4TM4A 4AT2A 1GRHA 3LZWA 2OAMA 4Z44A 1H7WA 4A65A 4YSXA 4J34A 2BK4A 2IIDA 4Z24A 5HXIA 1VQWA 4K22A 3RP7A 4A99A 2C65A 3LJPA 1CHUA 2YG3A 1MXTA 1NHPA 1O95A 2YR4A 2R4JA 3NN0X 4GF7A 4YWOA 3ALJA 1B37A 1PXAA 3NRNA 2WEUA 1OJAA 3AE8A 2RGHA 3FMWA 1CL0A 4K5RA 1BWCA 1XANA 2YLSA 1F6MA 3BHKA 4JNQA 3V3OA 3IHGA 1HYUA 2BXRA 3KPFA 2C7GA 3AEBA 2QA2A 1BKWA 2YLZA 4NZHA 2B7SA 2GAGB 3KD9A 1LQTA 1UKVG 1FCDA 1ZY8A 4JY2A 1BF3A 1PBEA 3H8LA 5C3JA 4O5UA 4A6NB 5BRTA 2GRTA 3K30A 3QFBA 1EL5A 2A89A 4M52A 3DGHA 3NYCA 1XHCA 2BCPA 2XFNA 2YWLA 3NG7X 4U8OA 2W0HA 2C67A 2BCGG 1REOA 3UKQA 2ARDA 2VVLA 3VRDB 3RHAA 2NVKX 2VZ2A 1L0VA 3GDPA 4B66A 2I0ZA 2C64A 1O5WA 2WU5A 2XLPA 1VDCA 3GD3A 4U8LA 1NENA 3AE5A 4FDCB 3F8RA 5FMHA 4EIQA 3NT6A 4YSZA 1JNRA 3NNEA 4OPGA 2JAEA 5EOWA 1PDHA 4AT0A 2HQMA 1EL8A 3ISHA 5BVAA 2Q0KA 1M6IA 1CC2A 4EQXA 2JB3A 1PJ5A 1PJ6A 2V60A 2TMDA 3AE1A 1X31B 3PO7A 1RP0A 1LPFA 4UDQA 3AE6A 2QCUA 2EQ6A 1CBOA 1K0LA 1L9CA 2YG7A 2C73A 2TPRA 3BI4A 3VQRA 5KWFA 4RSLA 4H4YA 4IVMB 3NIXA 3FBSA 3CNJA 5FS6A 5KVIA 4H4PA 2B76A 1ZP0A 3M12A 1N1PA 4EM3A 4OPTA 4H4TA 1JNZA 1GV4A 3UCLA 2FJBA 2X99A 4EIPA 1OJCA 5IQ4A 3NH3X 1D4CA 3DJEA 4EM4A 4Z26A 1BZLA 3EANA 3SFEA 2PYXA 2E1MA 1GPEA 2GEWA 3BI2A 2BS4A 2EQ8A 3URHA 5JCIA 2IVEA 5LV9A 4EMJA 2WDRA 3QSEA 1PN0A 1K4QA 3OZ2A 4K7ZA 4XWRA 4TLZA 1CC4A 2UZZA 5KRQA 2V3AA 3RP6A 3KA7A 4J33A 2WQYA 1IUSA 4H2QA 4U8KA 1ZDLA 1IUUA 1PXCA 3CIRA 2BACA 3UTFA 4TM1A 4OPLA 1P2EA 4BV6A 3UKAA 4GDEA 3CTYA 2B7RA 3II4A 2CDUA 1VG9A 3CPIG 3DH9A 3NK0X 4H4RA 4I58A 5ER0A 4YSYA 3ZDNA 4YTNA 4ECHA 2RABA 2Z5YA 1FL2A 2XYOA 3UOXA 2WOWA 4CNKA 1DOEA 1YQ3A 3M0OA 5KVHA 4CY8A 1Q9IA 4LU6A 2H89A 1IUTA 2J3NA 4BK3A 1EL9A 3AYIA 5CQFA 1GREA 2C3DA 3F8DA 3DK8A 3FIMB 3V3NA 4HA6A 4ADWA 1IUWA 3S61A 4YSHA 1ZK7A 4TLXA 3VR8A 3G5RA 3H4KA 1VRQB 1Y0PA 3AEDA 4IV9A 3AEGA 5FS8A 1DJQA 3DJJA 1L9EA 3EPTA 1KNRA 4Y4MA 1TDKA 2Y6QA 2QAEA 3ATRA 4EMWA 3WE0A 2WPCA 4GRTA 3S5WA 1VG0A 4BJYA 1JOAA 1GESA 2BS3A 2FJAA 5BULA 3GYJA 4P9SA 2GAHB 3L8KA 1S2YA 4A79A 4D04A 4Z2UA 1FECA 4O5QA 3AEEA 1DOBA 2XFOA 2F5ZA 2JK6A 4TM0A 4AP1A 5KOXA 4GUVA 4XWZA 2XFQA 2APGA 3CNPA 4USRA 1SEZA 3DMEA 1F8SA 1GOSA 3C4NA 1IJHA 3IC9A 1K0JA 1IUVA 5U25A 1CJ2A 2Y6RA 4REKA 4RG3A 4E0VA 1GTEA 4NTDA 3VRBA 2O9ZA 3KKJA 1LQUA 3BHFA 4U8IA 5U1OA 1Q1WA 4FX9A 2WESA 2CVJA 1CJ4A 3CGBA 4YT0A 1TYPA 3AYJA 1NG4A 1N4VA 1JEHA 4Z2RA 3AE7A 1FEBA 3G5SA 4X9MA 1GETA 2JB2A 2R9ZA 4GCMA 1H81A 1P2HA 3REDA 2FJEA 3P1WA 1CC6A 2FBWA 2WP5A 3O0HA 3SGLA 3UOYA 2XCGA 1H83A 1CJ3A 2XLSA 5L46A 4C3XA 3DK9A 2XLUA 4C3YA 1Y56A 2BYBA 2ZZBA 4LIIA 1K0IA 3G5QA 3P9UA 3UTHA 3QSMA 3K7QX 4A5LA 2BC0A 4MJWA 2OA1A 3QJ4A 4OPCA 3P4PA 4ZCDA 2YG5A 2DKHA 4YKFA 2R46A 2YLXA 3UTGA 1DXLA 1S3EA 3UKLA 2ACZA 1TDEA 5KOWA 1TYTA 2Q6UA 2YG4A 4C74A 2R0GA 1ZOVA 3GDNA 3GRTA 4UDPA 4GDPA 3AE9A 4CY6A 3BI5A 5U63A 1GT8A 2JKCA 3I6DA 1LV0A 1PJ7A 1PXBA 3GMCA 4U8PA 3GSIA 4I59A 1H82A 2GH5A 4JY3A 1S2QA 1YQ4A 3DGZA 4UDRA 4A6NA 2R0PA 2GB0A 3GD4A 1E7PA 3VR9A 2XVHA 2C70A 3CN8A 2GV8A 1ZOYA 3QSSA 1KNPA 1GRAA 2XFUA 3B6DA 4FK1C 2AR8A 5EB5A 4H4WA 4TM3A 4X4JA 3Q9TA 3KU9A 4OPIA 4U2LA 4BK2A 2ZBWA 2YM2A 1ZKQA 3Q6JA 4BURA 4CBQA 3IHMA 4B69A 2QA1A 2YAUA 4AP3A 2VQBA 1DOCA 2AQJA 2YLTA 1GSNA 4GR1A 4ZN0A 3ALLA 4AOXA 2YG6A 3OC4A 4N9XA 3EAOA 4RG4A 1XPQA 3C4AA 3CGCA 1D4EA 4FK1A 2BK3A 3JSKA 5JCKA 1EBDA 4Y4LA 2BC1A 1PBCA 2RGOA 3NK2X 4OPUA 1S3BA 5JCLA 2GVCA 2YLWA 1QJDA 1E1LA 3QFAA 1F8WA 5M0ZA 1B8SA 1GRBA 2V5ZA 4DNAA 1TRBA 1GEUA 3AECA 1B5QA 1LTXR 4NTCA 2GR0A 1E39A 2CULA 5GSNA 4B63A 2B9YA 2YM1A 4H4XA 3T37A 2WOVA 3UOZA 3DJDA 3KLJA 4JN9A 2OALA 4BJZA 2VRMA 4CCQA 4ZCCA 5IPYA 4BK1A 1JRXA 1CF3A 3IWAA 1DJNA 1DODA 2OLOA 3CPJG 1JRZA 1GALA 2ZZCA 5HY5A 2GQWA 2X8HA 1PHHA 4EQRA 4K5SA 2R4EA 2WDVA 4LA1A 4J2WA 4H4QA 3AD7B 1CJCA 3BNMA 3VRAA 3PVCA 1N4WA 2YR5A 3E1TA 4B68A 1GNDA 3UKPA 4YXDA 2GF3A 3CNDA 3NN6X 4YKGA 4OVIA 2ZZ0A 2R45A 1LVLA 2YR6A 2FJDA 1KDGA 4APNA 5JCMA 3NTDA 1MOKA 1EL7A 1Z6LA 3L1RA 3AXBA 3R9UA 2C75A 3CGEA 4XXGA 3UTEA 4WX1A 1GXFA 1BGJA 1H6VA 3FG2P 1RSGA 5BUKA 1W4XA 3DA1A 3PS9A 5HHFA 2Q0LA 4H2NA 4H50A 3QVPA 4H7UA 2GMHA 2VVLG 4NTEA 2V3BA 2B9WA 2GR3A 4Z2TA 2WHDA 5KXJA 3QVRA 4B1BA 1D7YA 4B64A 3DJGX 2DKIA 3COXA 1D7LA 1MO9A 4PABA 1NEKA 4J57A 3ICSA 2WBAA 3M13A 1TDFA 1TDNA 4IVOB 3UOVA 4YTMA 1B4VA 1D5TA 3AEFA 2WETA 4J31A 2CFYA 1GRGA 1O94A 4OCGA 2B9XA 2AAQA 5TR3A 2NPXA 3ICRA 2WPFA 1NG3A 3LADA 1E1MA 3GMBA 3NLCA 3NKSA 2PHHA 3NTAA 4J56A 5C2TA 4UP3A 3GWDA 2WOIA 3GRSA 3LOVA 4H4VA 4PAAA 4A7AA 1D4DA 3NYEA 2WDQA 2WP9A 3AYLA 3H8IA 2BS2A 2X50A 2XDOA 3NGCX 4DSHA 1F8RA 2X3NA 3I3LA 5FS7A 5FS9A 1Q1RA 1E6EA 1AOGA 5EB4A 3HZLA 2XVIA 2YVJA 4X9NA 4H4SA 2GMJA 4JNAA 3AWIA 3LXDA 2XLRA 1QO8A 5HYMA 1GRFA 1RYIA 4U8NA 1FEAA 2EQ9A 2GQFA 3P4RA 1ONFA 1OJTA 1OJDA 1PBFA 3NYFA 4U2TA 1E1NA 3KVEA 5DBJA 1PS9A 4JDRA 3LZXA 2XVEA 3AD8B 1TDOA 2VOUA 2RGJA 2WS3A 1L9DA 2C76A 2E4GA 3AEAA 2E5VA 2A87A 2GR2A 4U2SA 1GRTA 2C72A 2C3CA 4NEWA 4KPRA 2XVJA 3K7TA 2XVFA 4YTPA 1FOHA 3LB8A 4IA6A 3V76A 1JRYA 4DGKA 4B67A 5IQ1A 2EQ7A 1KFYA 2BABA 1XDIA 3IF9A 1NPXA 3ABVA 2WU2A 3DK4A 4IA5A 1ELIA 2JB1A 4D03A 3UKFA 5M10A 4J36A 1ZMCA 3B3RA 3RNMA 2WPEA 4CNJA 1NDAA 3ATQA 3AD9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K7MX 3UBKA 4KX6A 5IMCA 3P4QA 2BK5A 3QCPA 4PTSA 3CRUA 1SD9A 4V2MA 4XS1A 4HB9A 4U8MA 3IDVA 2L4CA 5ECKB 2XLTA 4B65A 3SQPA 3AE3A 3DD3A 1AIUA 2DIZA 1WP0A 4WF4A 4K8DA 1SL1B 1N2AA 4POKA 1YQZA 4V1Ag 2VCXA 5J7XA 4BVXA 4A9WA 1BEDA 1KBNA 1YY7A 3NK1X 3KP8A 4EC0A 5D96A 1WWJA 2AHEA 3KMOA 3L4NA 2OLNA 1PA3A 2A8XA 1MD3A 3UP4A 1Z6NA 4H2PA 3WGDA 3ICTA 2VQ7A 2X8CA 1EGOA 3CNTA 4AOSA 3IV4A 3UKKA 4Z25A 3FEUA 1MDKA 3HZ4A 4G0IA 2EIRA 4MLYA 3UARA 2VVMA 5ECNB 1EOGA 3EU4A 14GSA 3AE4A 1H84A 1ZMDA 2Q7VA 5J3RA 1U87A 1KEBA 4Y4NA 4TM4A 4AT2A 3F3RA 5CREA 2OAMA 2G2QA 1GLPA 4J34A 1TKDB 2HFDA 2BK4A 1VQWA 4K22A 2OE3A 4TXOA 3T14A 2C65A 3T2ZA 3LJPA 2YG3A 1NHPA 2BRYA 3NRNA 1OJAA 3AE8A 2YLSA 2QA2A 3GKKA 1UKVG 1FCDA 1ZY8A 1PBEA 2E2GA 2JZTA 4A6NB 5BRTA 1MDIA 1SU9A 3FR9A 6GSYA 5J41A 2BCPA 4U8OA 3NG7X 2TRCP 3TJGA 2VVLA 4MJAA 3EINA 3H1NA 2VZ2A 4G6GA 2I0ZA 4ZB6A 2WU5A 3NT6A 2OKAA 1TJDA 2JAEA 1AUCA 3ISHA 1QUWA 1SJIA 1CQHA 2BJXA 2JB3A 2TMDA 2C3TA 1X31B 1LPFA 3GSSA 2EQ6A 1NW2A 3CSHA 2C80A 4KNDA 3SXIA 1O6JA 3DKSA 4JBBA 5DQYA 5J9CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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