3BD2A

Crystal structure of staphylococcus aureus dsba e96q
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
GKPLVVVYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDQNKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Disulfide bond protein A
publication title Staphylococcus aureus DsbA Does Not Have a Destabilizing Disulfide: A NEW PARADIGM FOR BACTERIAL OXIDATIVE FOLDING
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3bd2A00
3CBUA 1MTCA 2VLUA 2C0FA 1A2JA 5CYYA 3VPQA 1VGLA 3LWAA 2DJ1A 2VCXA 2PU9C 2IMDA 2ON5A 1JZOA 1LU4A 3KJYA 4JU5A 2H0IA 3HD5A 3UMAA 5CAXA 3IC4A 4FYCA 1XBSA 2AJQB 2YWNA 2L5LA 1ZL9A 1DE2A 4MZBA 2L59A 2RUEA 3GA4A 1TK0B 1HD2A 1YEXA 1TRWA 1Z9HA 5JWRB 3CSHA 3G7JA 4Q5FA 1YJ6A 4D73B 3HVXA 16GSA 1VF1A 4ECIA 2H66A 1OE8A 5ABRA 5IOXA 2VUPA 3D0ZA 2JZTA 3HZ4A 3M9KA 5IO2A 4TKYA 1ML6A 3EMPA 1LJRA 1THXA 1EV4A 5DALB 3QAVA 2P5RA 5HR1A 1VF4A 2L6CA 1GSUA 3HHVA 4KCAA 2DIZA 5ECOB 3W8JA 4XTSA 3EURA 3G7YA 4L0UA 4F0CA 2V1MA 3GKNA 1M99A 1TDIA 4IQ1A 4GSTA 4TXVA 1E6BA 1B9XC 4WF4A 3L78A 2GQMA 2GVPA 4ECCA 1V98A 3UVHA 2GLRA 2TRXA 2FWEA 5D9XA 3EWLA 4JRRA 3ZFBA 1M2BA 1V2AA 4MH3A 3HA9A 3UAPA 5E59A 1SK0A 2YN1A 4OCFA 2DJ0A 1SENA 3CTFA 1X9MB 2VL2A 4MF7A 5ENUA 1O7UA 1Z5YE 3IHQA 1W89A 5IPHA 4I8BA 1XW6A 5COHA 4KX4A 2M80A 4DSSA 2O7KA 1XVWA 5DCGA 5H5SA 2PMTA 1YKCA 3FW2A 5F06A 2PUKC 4QL7A 1XW5A 3GRXA 4EE0A 1EP8A 2AB6A 2KHPA 4DVCA 1PL1A 4K8MA 2MZCA 4JE1A 1XWGA 5D9TA 1JLWA 5ECHB 3FR9A 3MWHA 3F8UA 2E2GA 2ALBA 3QFBC 5CRDA 6GSWA 2X8HA 1GSFA 3DRNA 1PX6A 4OMVA 3BCIA 3KTLA 3P2AA 4MF5A 1UC7A 2RUFA 4PQ1A 19GSA 1X9SB 4HQZA 4GQFA 3HCZA 3L9VA 4I6XA 3DGQA 4N30A 2WS2A 1Q4JA 4WBRD 2RM5A 2MMZA 3O76A 3HJOA 3O6TA 5B7CA 4BL7A 5JWOB 1G6YA 3CXGA 1BG5A 5C04A 3FR3A 5ECNB 2RIIA 17GSA 1HNCA 3ERFA 1R5AA 2YWIA 4N11A 3ZMKA 3VPTA 2VO4A 5DCHA 4POBA 5HFGA 4KW6A 5D96A 2V6KA 4AF2A 5KN3A 5HFIA 3TCOA 2ES7A 5DBQA 3M8NA 3UIWA 2CX4A 2F9SA 3TRXA 1AAZA 1SD8A 5C00A 1GSQA 1SK1A 1KTEA 3BCKA 2IN3A 3WYWA 3TKSC 1A23A 4OFMA 3ZVJA 2JACA 4LMVA 4WETA 2PVQA 5IMAA 1TI3A 13GSA 4ZBDA 1TK5B 4ULXA 3LEFA 1SD9A 5D8IA 2ZUPA 2LQQA 3KGKA 2PPTA 1PSQA 3ME7A 3ZZXA 2BTOT 5IMVA 5J9CA 8GSSA 4WR4A 5GZZB 2NTOA 4L5LA 1T00A 1EEJA 5A4VA 4JEDA 2H6YA 3H8QA 1K0NA 3WT2A 2I1UA 5IO0A 2JSYA 1NSWA 1F2EA 4IELA 1GNWA 2CAIA 3F6DA 3ZVJD 2VLTA 3C71A 1WJKA 5IMDA 4GCIA 4OFNA 2ON7A 2Z9SA 2OBKA 1HQOA 4XCSA 2H30A 1QMVA 2CAQA 2IFQB 1J08A 3TUEA 1JFUA 4HQSA 1QUWA 4EDZA 4HU9A 5FT3A 4OD7A 2QC7A 2WRTA 1Y25A 4ML1A 4DEJA 3MSZA 1DSBA 3APSA 2RM6A 4POMA 4HZ4A 1OC8A 4TRXA 2GSTA 2HI7A 2G2QA 4KUNA 4E8EA 4XHMA 4AJ7A 3RBTA 2I3YA 3V1WA 5GAPD 1F9MA 3HXSA 3GV1A 4CDOA 1XCCA 1GNEA 2D2ZA 4FH8A 2MBTA 4CW9A 4QQ7A 1ILOA 5B6MA 1AXDA 1EGRA 4IP1A 1VF2A 3EE2A 3NOFA 3QR6A 1ST9A 1T4ZA 1EV9A 2XPDA 1ZCPA 3A5WA 3VWWA 3ED3A 1ZZYA 4GF0A 1AQXA 1JLVA 2H70A 2VCQA 4ZL8A 1NM3A 2GT6A 3ZYWA 1G7OA 4WEYA 4TR1A 3Q19A 2GZZA 4NV5A 4XIHA 1XIYA 4KB3A 4MDCA 2PVOC 1PKZA 4HI7A 3GSSA 1FHEA 4PQHA 1TOFA 1F3BA 2AAWA 1PRXA 2FD3A 2FY6A 5ECKB 5J4UA 5ECMB 2GZPA 5EL8A 4J2FA 1T3BA 4OFTA 3Q6OA 1AQVA 3EVIA 5DVBA 2B7KA 2IL3A 2H6ZA 1R7HA 4MJAA 4MLYA 3WT1A 3GMFA 2L5OA 2H6XA 3KIJA 1O81A 3ZRDA 1J0FA 4XS4A 1PQNA 2R37A 12GSA 1K0MA 2R3XA 4ECJA 5D93A 1SYRA 3Q74A 1ZYEA 6GSXA 18GSA 1SJZA 3H1NA 4I2TA 1ABAA 4RQRA 4KSMA 5ECRB 1K0CA 1LBKA 3UOMA 4JBBA 5INYA 3D5JA 4BPYA 2YV7A 4WR5A 2REMA 3BOAA 2LJAA 3C1SA 1OC9A 4KAEA 4KDXA 3LFLA 1B9YC 2R5GA 1TW9A 4GRFA 5J9BA 2FHEA 3KCMA 3BJ5A 1FO5A 3FHKA 2FUG2 4O7HA 2YWMA 4XRAA 1QK8A 5DAKA 2KLXA 2YZUA 1ZYQB 4EXJA 2GGTA 2TRCP 4ISDA 4ZB6A 1XWCA 2H74A 1EOHA 5AIXA 3WGEA 1Q98A 5ECIB 2VIMA 1FAAA 2H75A 5LCZA 1MEKA 4X43A 2JU5A 4MJEA 2MMAA 4BWQA 4GQCA 5EPFA 2CZ2A 4FYUA 2GZYA 5HR2A 1EGOA 2VD1A 4K7OA 4DSSB 3DWVA 4PXOA 2PN8A 3VLNA 1X5EA 3M9JA 5KN1A 4K7IA 4MP4A 3L9UA 4FIWA 3F3RA 2OKAA 4NMUA 2J9HA 2L4CA 2G0FA 1GH2A 4NPBA 4AJ6A 2HXKA 3Q18A 1GTAA 5IIZA 3MDKA 1IYHA 1M2DA 1WPIA 6GSSA 4LA1A 1Y6EA 3DMLA 1N8JA 1X9WB 3LXTA 5HR3A 2BMXA 3KP9A 5KEJA 2HSHA 2XC2A 1U88A 4PGTA 2IJYA 2C0EA 3RAZA 3LQ7A 1VF3A 5HR0A 2C8UA 2E0QA 2ZNMA 1MDKA 1X5CA 4RQXA 4BA7A 5G5FA 1R26A 4QL9A 2TIRA 1GSYA 4OCEA 2A4VA 2XBIA 3GNJA 2OACA 4HS1A 5HQPA 2K8SA 2H1BA 1U3AA 2VOCA 3L9SA 4IVFA 2K8VA 3SWLA 4K0GA 1THOA 3UEMA 4RUVA 1RQMA 1WRYA 3F4SA 3ERWA 1GL8A 3ERGA 2WFCA 5IMFA 3KH7A 3TJJA 1QGVA 4KDUA 2FCHA 5D73A 3E3EA 5CRWA 4KH7A 2BJXA 6GSYA 3GL5A 4EKZA 2LS5A 3QOUA 1GTIA 4ZIJA 3A2WA 3ISOA 1M2AA 2LRNA 2M72A 3LORA 3VWXA 2VD0A 4ZBAA 1FB0A 4WXTA 3GSTA 2EC4A 2XHFA 4GLTA 4MF6A 2WB9A 3PR8A 1R5PA 3QD9A 4KCEA 2LUSA 2YPMA 3KD0A 4ZILA 1FW1A 3HVVA 4V2LA 1BX9A 2JZRA 4IHUA 2YZHA 4PNGA 1OKDA 4IJ3A 1S3AA 4N0ZA 3D4TA 5A4WA 1QFNA 4BVXA 1Z6MA 2C3NA 2L57A 3BD2A 3PH9A 3UJ1A 3IRAA 2F3MA 2VCTA 10GSA 9GSSA 1FOVA 5EY6A 3HZ8A 3GX0A 2FGXA 3IBHA 3F63A 3UARA 2OJLA 2LRCA 4K9ZA 3D6IA 4YH2A 3HY2A 5IQYA 2HFDA 2VM2A 3E9JB 2DJ3A 3GIXA 4HZ2A 2B7JA 3TRQA 4WBJA 3PGTA 2FA4A 4V2NA 3E0UA 3APOA 1G7EA 3J7Yk 1PX7A 20GSA 2DLXA 1ZGNA 2VM1A 2GTUA 3QPMA 1Z7RA 3ZL5A 3A2VA 1TK8B 1AIUA 1URMA 3R2QA 4IS0A 2H1AA 4TOPA 4KA0A 3GYKA 4I97A 4TR1B 3KMOA 1EWXA 2HYXA 1B8XA 2WGRA 3N5OA 5H5RA 3CRTA 3H93A 4NAXA 1F6MC 1XWBA 2EIRA 2C0DA 2WJUA 3GKMA 2C3TA 4EC0A 1XWKA 4KE3A 3IV4A 4PUFC 1SL0B 2O89A 1TU7A 4N0VA 2F8AA 3LGCA 1A2MA 3L0HA 5G30A 3L4NA 2LNSA 4IQAA 1CQGA 3GTUA 2HT9A 2K18A 2LTKA 3IXRA 2OA7A 4P3YB 4XS4B 4YAPA 5LD0A 2LKUA 3TJGA 4K0NA 2C80A 4POKA 2JADA 4PURA 3DXBA 1GUHA 2H72A 3UVTA 1SL2B 4TR4A 2CA8A 2AUVA 2DJKA 4ZBBA 2H1GA 2R2JA 1A8YA 1EZKA 3WD6A 1I9DA 5E4WA 1K0DA 1OC9B 3M0FA 1GUMA 5B6NA 1M0UA 2IMEA 2FLSA 2PERA 3S9FA 1A8LA 2LSTA 5B8BA 3GFKA 1MDJA 2E7PA 2CT6A 2PWJA 3US3A 1S3DA 4G2EA 3F0IA 1XVQA 5D9WA 1QQ2A 4IP6A 1V9WA 1KBNA 1QXHA 2HRFA 5G1LA 2HNLA 4EUYA 5DAKB 4POLA 4LL4B 3MNGA 5CO3A 4DSQA 3RDWA 5CREA 1TRVA 1Z3EA 1V57A 3IOSA 4I5QA 4NV2A 3CYNA 1SK2A 2YNXA 4KNDA 2MYGA 1T8EB 5ELAA 5F8BA 3I43A 3SBCA 3F4RA 4MCUA 3W6GA 3DD3A 1YY7A 4ECBA 2CZ3A 4Q5NA 5A5KA 2GSRA 5D9VA 1ACVA 3F6FA 3LJRA 4NHWA 5L71A 1NW2A 3D21A 1OC3A 2LRTA 3IDVA 4MA9A 4GWRA 2P31A 5EVOA 3RHCA 5ECLB 4EVMA 2P0GA 1Z7PA 3HVSA 3QFAC 1XPVA 3VURA 1H4OA 3FR6A 2FA8A 3ZTLA 2F51A 2WULA 4F82A 5AGYA 2V41A 1FVKA 3I6AA 4E8HA 4ACSA 3KMNA 11GSA 2NVLA 4WF5A 2E2MA 3D22A 3HJMA 2DJ2A 3OR5A 4HDEA 4RI7A 3FEUA 4AGSA 4EF0A 1F37A 3IK9A 4FO5A 3GKKA 3GX8A 1BEDA 1JZDA 2XPEA 2B1LA 4BWSA 1OKTA 2IIYA 3AY8A 1ZOFA 4MMMA 1WIKA 2HSYA 4IN0A 5B8AA 4GTUA 4V1Ap 1YF0A 4H86A 1X0RA 4KGIA 2KUCA 2X8CA 1GWCA 2K9FA 4EO3A 3LG6A 2EIQA 1XXUA 3FK8A 3KP8A 3FZ4A 3TGZA 2O8VB 3ME8A 4YAVA 2I81A 1U6TA 3TJBA 1PGTA 1EEMA 1PD21 3F4TA 1XWAA 2OADA 1RW1A 3CTGA 3C73A 2HLSA 3FRCA 2YP6A 2QKEA 1HNBA 3QMXA 3DVXA 3FKFA 2YCDA 4TW5A 4IBPA 4DSRA 2I9HA 3N9JA 5A4UA 2PBJA 4XS6A 4YQUA 5IOWA 3GURA 1SJIA 4O92A 1R4WA 1HNAA 1ERVA 3KH9A 3VFIA 1WWJA 4FYBA 4NXIA 1MD4A 1GULA 3GKXA 1NHYA 1H75A 3HDCA 3QAWA 1T4YA 4V2MA 1S3CA 2X64A 3ZMLA 2QSIA 2J23A 1GLPA 1XZOA 2YV9A 4PUAA 1AUCA 2VCWA 4K6XA 2AHEA 5J5NA 1PA3A 3M3MA 5DQSA 3UBKA 4OO4A 5CNWA 14GSA 4XRDA 2HZEA 3U6VA 3D4MA 2VLVA 6GSUA 5JCGA 2MMNA 3DKSA 5JCUA 1AC1A 3ZIVA 2YOIA 1PKWA 5ECSA 2H0HA 3DYRA 1GTBA 2P5QA 3IAM2 1TKDB 2PGTA 3CMIA 4BVYA 3EINA 1K0AA 1GLQA 3G9BA 3FZ5A 4HJMA 4F9ZA 1U87A 1B4QA 5GAND 6GSVA 1DUGA 1JZRA 1T7PB 3RHBA 2QGVA 4OO5A 2L6DA 4TXOA 4ML6A 1GP1A 3RPPA 1BAYA 2FWHA 1PN9A 2FWFA 1WMJA 3I9V2 3EYTA 3FY7A 5J41A 2N5BA 4ZXGA 3IK7A 2DSAA 3ZLPA 3WGDA 3HKRA 5JWQB 1B4PA 3TKRA 5FHIA 1BQ7A 2N5AA 1X5DA 1UVZA 4IKHA 3TOTA 1K0OA 1M9AA 1FB6A 2H19A 5LNKe 2L4QA 3C7MA 4TN8A 3VWUA 1DE1A 2VCVA 3TB2A 3DEXA 4MZWA 3KEBA 5ID2A 3IAS2 2R4VA 3NIVA 2VAFA 5IM9A 2IMIA 3IR4A 3LSZA 1GSSA 3GUSA 2JL4A 2V32A 3CSIA 2X8GA 5KN0A 1OYJA 3GTUB 3DIEA 1PL2A 1ERUA 2AV4A 1JZWA 4K7NA 1K3OA 2A2SA 2VL2C 3P90A 2FNOA 2LNTA 2YJ7A 1O8WA 4PX1A 4G9HA 3P7XA 2B6MA 3TDGA 5AIVA 3NZNA 3ZFLA 3ZIJA 4MH2A 5JCWA 5G1KA 5H5QA 2WCIA 1XFLA 2OE3A 2JSZA 2CX3A 2NDOA 4HJ2A 1YDKA 1XW9A 4CHSA 3VI7A 5KN2A 4EL1A 1GTUA 2NPBA 3C8EA 2LJRA 3WGXA 2K6VA 2H0GA 5G5EA 4JZQA 4Q5QA 1EP7A 1A0FA 4TVEA 4K1FA 1A2LA 3M1GA 3GL3A 4ZL7A 2C4JA 1T1VA 1GRXA 4MPFA 3TOUA 3C1RA 1AQWA 5G31A 3JCML 2M46A 3TJKA 5DJLA 4WKWA 7GSSA 6GSTA 4MJCA 3GH9A 2VL9A 2H73A 2CQ9A 4J56E 4G19A 4Z7XA 5AN1A 4ZL9A 5F07A 1XOBA 1C72A 1G0TA 5G2ZA 1RK4A 4D73A 3TKQA 4O5RA 3ZITA 4GSSA 1V40A 3KXOA 2GT5A 4ZB8A 1TXXA 1Z6NA 22GSA 2OBIA 2GQLA 3VWVA 3PINA 1IYIA 5DALA 3LXZA 4HOJA 1FG4A 4V1Ag 1U3IA 4L0WA 1BJXA 1A0RP 4F0BA 4TR0A 1VRSD 3P8WA 3EU4A 1O6JA 4IW9A 1N2AA 3H79A 4L8EA 3TKSA 1OVNA 1O8XA 4PQIA 2B5XA 1DBYA 1KNGA 1HYUA 3FZAA 1GSEA 2NBSA 3CRUA 3W8SA 2WZ9A 5J3RA 4HU7A 1SL1B 1USBA 3U5RE 2EIOA 1TI1A 3FZ9A 1BYEA 2DBCA 1YEPA 2DMLA 1M9BA 2DIYA 5DJMA 2C3QA 2GSQA 3BBYA 1E2YA 1W4VA 2LEGA 1MD3A 1PMTA 1MDIA 2H8LA 4MZCA 2V6OA 3KM6A 4MABA 1OAZA 3UL3A 2GDRA 2GQKA 2IPAA 2I4AA 2F8FA 4LL1B 4PNFA 4X1UA 1YKAA 5CP1A 1FVJA 2V2GA 2IMFA 1TRUA 2KP1A 4TR3A 5FWGA 2H71A 2YWOA 1CQHA 3TJFA 4I2UA 3FYGA 1K3LA 5GSTA 1B48A 5CRHA 1SJ6A 4AJ8A 2CVBA 2CVKA 1TJDA 1WE0A 5IMZA 2H01A 2B1KA 3TRPA 2X99A 3QDNA 2H76A 1UA5A 1YQ1A 3LYKA 1A24A 1YZXA 4MJBA 1GSDA 2GSSA 4KSOA 1V58A 2N5FA 4MK3A 2A2RA 2HE3A 1O85A 4N10A 1M7TA 3EU3A 2OE1A 2DC5A 2B5YA 3HJPA 2CVDA 2ZCTA 4XS1A 5CRGA 2MBSA 3VK9A 2B3SA 2HZFA 4O32A 3A2XA 5ECQB 3TKPA 3O3TA 1G6WA 2HZEB 3CSJA 3GH6A 4F03A 5HFKA 2FWGA 4Q5RA 1F3AA 2C1YA 2IMKA 5IMCA 1TU8A 2R6KA 2KP2A 1ZMAA 2O85A 4NWYA 1AW9A 4IJIA 3DVWA 1OE7A 3I69A 4GXZA 2KOKA 3UBLA 1SKWB 5DDLA 1JHBA 2RLIA 1KEBA 4LLRA 2C0GA 3IPZA 4HUAA 4ILFA 2AYTA 4YQVA 4TXOB 3H4KA 3EMXA 1K3YA 2OE0A 2YJHA 4LMWA 1NHOA 4JR4A 3QCPA 1YF1A 1ON4A 2DMMA 4L5OA 2O87A 1SYXA 3ZREA 1XOAA 2H1DA 3EC3A 2GS3A 5AISA 3K8NA 4GSNA 4KDYA 1GUKA 3APQA 3GHAA 4G10A 4RI6A 1WP0A 2IFQA 2XBQA 2MMOA 4JR6A 1K0BA 1EOGA 2YANA 2DJJA 4J57E 4MPGA 2VCZA 5IPGA 2LV3A 3QAGA 1ERWA 5ID2B 4F2IA 3KZQA 1I5GA 1SKRB 1J9BA 4ID0A 5DQYA 3RPNA 3TKSE 3LYPA 4HEA2 3F3QA 5F05A 3KTBA 4K2DA 3F9UA 2VL3A 4X0XA 3VI5A 2JZSA 2IWTA 1SU9A 1TTZA 1TP9A 3GN3A 1O73A 3A3TA 3G7IA 2CV4A 5ECPB 4OWYA 1SKSB 2HRNA 4ZB9A 3IA1A 3IE3A 1ERTA 2LQOA 1TRSA 2B5EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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