5KN1A

Recombinant bovine skeletal calsequestrin, high-ca2+ form
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
346
structure length
346
Chain Sequence
LDFPEYDGVDRVVNVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMDELILELAAQVLEDKGVGFGMVDSEKDAAVAKKLGLTEEDSVYVFKGDEVIEYDGEFSADTLVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDDNKLIGYFKNKDSEHYKAYEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVSFVEAHKRSTLRKLKPESMYETWEDDLDGIHIVAFAEETDPDGYEFLETLKAVAQDNTDNPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFNIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Calsequestrin
publication title Characterization of Post-Translational Modifications to Calsequestrins of Cardiac and Skeletal Muscle.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 102
structure length 346
sequence length 346
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5kn1A02
2LJRA 4BVYA 4KSMA 3KTLA 4FYBA 3QR6A 4MCUA 2JADA 4P3YB 2GVPA 4K6XA 3IR4A 4OFTA 3E0UA 5H5QA 3UAPA 5JCGA 2VIMA 2ON5A 1YF1A 2VCQA 2V1MA 4WEYA 3EVIA 2HFDA 4GQCA 14GSA 3F3RA 3KMOA 1FB6A 1PGTA 3I6AA 2L6DA 3GH9A 5DAKB 5G1LA 1XWAA 2QKEA 2L59A 1BAYA 3VK9A 3DIEA 4GXZA 5IOWA 2LEGA 2JL4A 1R7HA 1O8XA 3LORA 2KUCA 1TJDA 1VRSD 3ZVJA 2JU5A 3WYWA 3L9SA 4KX4A 2MMAA 3L9VA 4IHUA 2C1YA 3EE2A 1PSQA 2L6CA 4ECJA 1PMTA 3GHAA 4OMVA 5KEJA 4MP4A 2YWNA 2LSTA 4GSTA 4KE3A 5COHA 1SJZA 5AIVA 4Q5RA 5HQPA 1K3OA 3EMPA 4MPFA 4MK3A 2FWFA 3F4SA 4MF7A 4TR3A 1QK8A 3A2XA 4MZWA 3PINA 3VWVA 1GTAA 1SJIA 3HJOA 2MBTA 1ZL9A 3ZRDA 2CA8A 1SK1A 1F3BA 3F8UA 3VWXA 1SKSB 4RI7A 4HQZA 2K18A 4KDXA 3HCZA 4HZ2A 4TXOA 5G31A 2H71A 1G6WA 2C0EA 1MTCA 1XWBA 2AJQB 2YV9A 3QD9A 1FOVA 1NM3A 1KNGA 4KAEA 2PBJA 2YZHA 3TJJA 3GRXA 18GSA 1M99A 1X9MB 1EEJA 2MYGA 2PUKC 5ECRB 1X5DA 3CBUA 3E9JB 2HI7A 5DCHA 1YF0A 4BL7A 3HHVA 2VD1A 4XS6A 3DMLA 3HYPA 5EVOA 5CRDA 4HJMA 1JZOA 2FGXA 2ALBA 2IWTA 5E4WA 1T7PB 2BMXA 3GTUB 1IYIA 4ID0A 2K6VA 4F2IA 4WBJA 2DMLA 2G0FA 4F9ZA 5J4UA 1MEKA 4MF5A 4CW9A 1XW5A 1GSUA 4L8EA 4NHWA 1XWCA 4MDCA 4K7NA 3RHCA 5CYYA 4EKZA 4L5OA 1VGLA 5A4WA 3FW2A 4FIWA 2KHPA 2GLRA 3L0HA 3NIVA 1FHEA 4RQRA 2PWJA 1WE0A 5D9TA 1FVKA 1WPIA 3RAZA 3TJFA 1S3CA 5FHIA 5ELGA 3DRNA 1BYEA 1YDKA 3IBHA 2HNLA 3D4TA 4I6XA 2NBSA 3WT1A 3EURA 4RQXA 5AGYA 3VWWA 2E2GA 2WGRA 1HD2A 1H4OA 3G7YA 2VL2A 3IRAA 4KSOA 3CSJA 4ZL7A 1A23A 4MA9A 4ZIJA 4LL1B 1YEPA 1GSYA 3D4MA 4GCIA 4WETA 2BTOT 3ZREA 4NHZA 1EEMA 2MBSA 4MJEA 4X43A 2HYXA 2B3SA 1AXDA 3DVXA 2EIQA 5H5SA 2CZ2A 3C8EA 1K0BA 2C3TA 1OE8A 3W8SA 3TKSA 4ZBDA 4MLYA 2ZUPA 3DXBA 1T1VA 2M46A 5D9XA 2DJJA 3QFBC 2L4QA 3GKKA 2OBIA 1FW1A 3PGTA 2HT9A 1T00A 1S3DA 2L5OA 2TRXA 4TRXA 2H66A 3DYRA 1JZDA 2YOIA 1PL2A 3CSIA 3HJPA 3TKSE 2YV7A 2VCTA 5CREA 1WOUA 2CAQA 2FWGA 1JZWA 2Z9SA 4PX1A 5KN0A 4EUYA 4PUAA 4PUFC 3ZIVA 1QUWA 1Z7PA 4NAXA 3QFAC 4JR4A 1A2MA 2C3QA 3W6GA 3Q18A 4F0CA 1UA5A 5EPFA 1MD3A 4LA1A 4XTSA 3LGCA 3H93A 5IIZA 1DE1A 3MDKA 4K0GA 3IK9A 4BWSA 2LNTA 1VF4A 2O7KA 1FAAA 2CAIA 1AAZA 1E6BA 4NMUA 3RPPA 1QXHA 5D8IA 1ERWA 1A8YA 2CX4A 1GSQA 5DQSA 3RDWA 4AJ7A 3P90A 2WZ9A 3CMIA 3KEBA 5G5FA 5DAKA 2R4VA 3KJYA 3H79A 3KXOA 3WGDA 1GLQA 1Y25A 3ED3A 3F6FA 5DALB 4EE0A 2RM5A 11GSA 1QQ2A 3LWAA 1ST9A 2VL2C 1PQNA 3UARA 3GKMA 4KH7A 4DSSB 1UC7A 2RM6A 3ZL5A 4PQ1A 4WBRD 1AUCA 4V2LA 3H4KA 2R2JA 4YQMA 8GSSA 2YWIA 1B9XC 2B6MA 3FR6A 2VCWA 2FNOA 1GSEA 1TTZA 5F8BA 2H0IA 1U3IA 2YPMA 1V9WA 2WDUA 1NSWA 2TIRA 4BPYA 3F4TA 4DEJA 4D73B 4POBA 4EF0A 2KP2A 2V6KA 4HEA2 5JCWA 3FHKA 4NWYA 4N10A 4N11A 6GSXA 1ZYQB 3D21A 1S3AA 1OE7A 3DVWA 2VO4A 4XS4B 2CQ9A 1IYHA 2P0GA 1CQHA 4FO5A 5G2ZA 3HZ4A 3G7IA 1A0RP 5L71A 2OKAA 4H86A 2YJ7A 4XS1A 2CV4A 2VL9A 2LV3A 1ZMAA 4KDUA 4QL7A 2XC2A 1XW6A 4K8MA 2LQQA 1GTIA 2VCVA 4E8HA 2L4CA 1OKTA 1V57A 5DBQA 2VOCA 5LCZA 1USBA 3APQA 4FYCA 4ZB8A 1GULA 5ELAA 1EV4A 1SD9A 4O7HA 2RUFA 3IA1A 4Q5FA 4J57E 4GSNA 3GTUA 5IPHA 1Y6EA 3IAS2 1CQGA 2R37A 2C0FA 1DE2A 2IPAA 2H6YA 13GSA 2C80A 3IPZA 5DDLA 4F0BA 3ME7A 5J41A 3LEFA 5F06A 1GRXA 1XWKA 2NTOA 1WRYA 2GZPA 2H1DA 4BWQA 1XFLA 3CRUA 3BOAA 3HVVA 3TRXA 2GDRA 5ECOB 2O87A 2OE3A 4IGJA 2R3XA 4J56E 1ZYEA 3APOA 2IN3A 3KTBA 2LKUA 2GSQA 2NVLA 3TRPA 1TU7A 1URMA 1O6JA 1KBNA 2X8GA 1F9MA 1GH2A 2O89A 4X1UA 1FB0A 1SKRB 1NHOA 2H6XA 2NPBA 3NZNA 3TJGA 1TW9A 3U5RE 2QSIA 4MF6A 2RLIA 3L4NA 3K8NA 5ABRA 4ULXA 3EINA 3KH9A 1JHBA 3F9UA 1TOFA 1ABAA 3QCPA 4XIHA 4JR6A 4KNDA 1Z9HA 1PKWA 1ZOFA 2P31A 2VD0A 2P5QA 1TRWA 3O6TA 3CXGA 2DJ1A 1U88A 2N5AA 5FT3A 1GNWA 4AGSA 1SL1B 6GSSA 2D2ZA 1B4QA 2MZCA 2QC7A 4YH2A 3UEMA 5IMFA 2M80A 2JSYA 3A2VA 4K1FA 4LLRA 2I3YA 4PXOA 2GQLA 3FR3A 1MDJA 1OYJA 2RUEA 22GSA 4CDOA 4GTUA 1Z6NA 4TR1B 3FK8A 4MZBA 1GTUA 4V2NA 4ZXGA 2I1UA 3HKRA 4Q5QA 1XCCA 4GRFA 4WF5A 2K8SA 2CT6A 1HQOA 3KH7A 2WFCA 5IMZA 1X9WB 5GSTA 3CYNA 2CVKA 3I43A 4IN0A 2F51A 3Q74A 4XRDA 3VFIA 3TDGA 5HR3A 4HDEA 4ACSA 2E0QA 3M8NA 1A0FA 2EIOA 4L0WA 4KW6A 5ECQB 4G10A 3M9JA 5DVBA 4G19A 1HNBA 4EL1A 1EWXA 2FY6A 2X99A 1YZXA 1XVWA 6GSWA 2GQMA 5ECIB 1U3AA 2GSSA 4MPGA 3KD0A 1EV9A 3GX8A 2HLSA 3O3TA 4POKA 3ZLPA 1UVZA 2X64A 5D93A 1GSDA 3VI7A 1LU4A 2XBIA 1FVJA 3ZZXA 4V1Ap 1QMVA 1T8EB 4GLTA 1G0TA 1OVNA 5DALA 4RI6A 5IOXA 4TR4A 2AB6A 4IP1A 3MSZA 1ON4A 5B6NA 4TKYA 3HVSA 4DSSA 4IBPA 5D9VA 2F8AA 3FZ5A 2ES7A 4NV2A 3BJ5A 3J7Yk 5F0GA 4XCSA 3P7XA 2GTUA 2LUSA 2AYTA 1WIKA 3GNJA 3L78A 3UOMA 3GSTA 4ECIA 5CNWA 4ECBA 2VM2A 5CRGA 3FKFA 3F63A 3LQ7A 1G7EA 1PKZA 1W4VA 3UL3A 4D73A 4V2MA 4KDYA 3GSSA 2C4JA 2JZSA 1K0AA 1YEXA 2H73A 1ML6A 3HXSA 2EIRA 4K0NA 5CRHA 3TKQA 1Z6MA 1GUKA 2H76A 4N0ZA 1K0OA 4ILFA 4XS4A 3U6VA 3TJBA 3HY2A 1GP1A 4WXTA 1BEDA 3D0ZA 2H01A 3GN3A 1GUHA 5HFIA 5DQYA 2AV4A 3ZMLA 2LS5A 2O8VB 2A2RA 1J0FA 4EDZA 3N9JA 2JZTA 4IS0A 3GYKA 2V6OA 2XHFA 3FR9A 1SYRA 4ZB6A 9GSSA 3PR8A 1QGVA 4IKHA 3ISOA 4JEDA 4ZILA 2HZFA 3E3EA 4TOPA 3LG6A 1XOAA 5CP1A 5C00A 1GNEA 4YAPA 2WB9A 3UIWA 3CTGA 2MMNA 1B9YC 4QQ7A 4HOJA 5ECHB 5GAND 4K7OA 1KTEA 2RIIA 2ZNMA 1DUGA 1BQ7A 2DLXA 2DSAA 2FWHA 4HZ4A 2AUVA 3GFKA 3KMNA 3BBYA 4GF0A 3CTFA 3KP8A 5KN3A 2HE3A 5F07A 1YJ6A 1M9AA 2CVDA 5LNKe 4O32A 2F3MA 3WGXA 3TUEA 2H1BA 4IP6A 1THOA 3FEUA 2MMOA 2HRNA 1SK0A 4IQAA 1O7UA 4POMA 2KLXA 5AN1A 1H75A 4KA0A 4N30A 2ON7A 1Z5YE 5AIXA 2YJHA 2OBKA 2B5XA 2VCXA 3UBLA 3S9FA 5F05A 1LJRA 2DJKA 4HS1A 3IDVA 2HZEB 2C3NA 5B8BA 2VAFA 4LMVA 5FWGA 4K2DA 5J9CA 5JCUA 2NDOA 1SL0B 2LTKA 4POLA 1SK2A 1M0UA 2H8LA 3SBCA 5IPGA 3F0IA 1FG4A 2YWOA 1A24A 2FA8A 3GMFA 3MNGA 1Z7RA 4ML6A 1E2YA 3GUSA 3IE3A 2FA4A 3UJ1A 3ZYWA 2IFQB 1EP8A 3DKSA 4YAVA 4TR1A 6GSYA 2FD3A 1VF1A 4MJAA 4OD7A 4WKWA 3ZMKA 4PURA 3V1WA 3ZIJA 2H75A 2CZ3A 3VURA 1FO5A 3FRCA 1NHYA 3IAM2 4DSQA 1TK5B 2GSRA 2WCIA 4HU7A 2H0GA 2GS3A 5EY6A 10GSA 1TXXA 1YQ1A 2DBCA 2R5GA 3ZFLA 4AJ6A 5IMDA 4I2UA 3DGQA 4HQSA 3TKSC 2PGTA 2JACA 2OACA 3ME8A 2G2QA 2WRTA 4EDYA 2C8UA 4AF2A 2A2SA 2IIYA 3WT2A 4PNFA 2H1AA 12GSA 5AISA 1RK4A 1GSSA 3P8WA 4ZL9A 1XBSA 1EOGA 1ERTA 2H74A 6GSTA 3TRQA 3VPQA 1JFUA 2PERA 2X8CA 4WR5A 1TRUA 5ECNB 5J5NA 1HNCA 3GA4A 5IO0A 3IOSA 3F3QA 1LBKA 4L5LA 2FCHA 4G2EA 1T4ZA 19GSA 4DSRA 4YQUA 2LRCA 5D73A 1ERUA 1OKDA 3QAVA 1SD8A 2FLSA 3EC3A 1AC1A 2XPEA 2DJ0A 5ID2B 3JCML 1WP0A 3OR5A 4CHSA 2B1LA 1F37A 4IJIA 1C72A 3TOTA 3LXTA 5DJLA 1YKAA 3M0FA 4TR0A 5EL8A 2FUG2 1N2AA 1X0RA 1TKDB 1SU9A 4PQHA 2FWEA 3IV4A 3GV1A 4ZL8A 3FZ9A 3IHQA 2B5YA 1J9BA 2FHEA 5ECKB 3EYTA 3KM6A 2DJ3A 1SYXA 2N5FA 5DCGA 5A4UA 2YWMA 3TKPA 5CO3A 4MJCA 3QOUA 2WS2A 1V2AA 2YCDA 1TRSA 20GSA 2OE1A 5ECSA 4X0XA 5INYA 1V40A 1XOBA 3Q6OA 1DSBA 2IMIA 1GTBA 1N8JA 3LSZA 4GQFA 3C1RA 5IMVA 3GH6A 2GT5A 2BJXA 1OC9B 4JU5A 3M1GA 2DIYA 1K0DA 1M2AA 2LQOA 4PNGA 3GKXA 1TI3A 3QPMA 5CRWA 4F03A 1WWJA 5IMCA 3AY8A 4HUAA 5A5KA 1T4YA 3EMXA 2QGVA 3LFLA 4LL4B 3D6IA 3GURA 2E2MA 3EWLA 5B6MA 4V1Ag 2DC5A 4DVCA 4MH2A 4EC0A 1BX9A 3ERFA 3D5JA 2VLTA 3G7JA 1U6TA 2HSYA 2XPDA 2A4VA 3EU4A 4GWRA 4EXJA 3GL3A 3FZAA 2HZEA 4K9ZA 3M3MA 2P5RA 3I69A 4WF4A 3IK7A 1JLWA 5GAPD 4KUNA 5IM9A 5HR0A 1QFNA 2H1GA 3MAKA 5A4VA 1EP7A 1XIYA 2V32A 5CAXA 1M7TA 1ZCPA 2GZYA 1ZGNA 1F6MC 1X5EA 2HSHA 1AQWA 3RHBA 3VPTA 4MJBA 2IFQA 4TXVA 2EC4A 3HD5A 4KCAA 3ZVJD 1TP9A 3ZFBA 2E7PA 2H6ZA 3QAWA 2DJ2A 1A2LA 5J9BA 3GIXA 4WR4A 3PH9A 3Q19A 3CSHA 2LJKA 1TK0B 1EZKA 3BD2A 1GUMA 4OCFA 3R2QA 2OADA 5IQYA 4ECCA 3ERGA 2X8HA 4TN8A 1F3AA 5IO2A 3WD6A 4YQVA 1BJXA 5D96A 2K8VA 1O8WA 3L9UA 5JWQB 1PD21 3HDCA 3G9BA 2O85A 1Q4JA 2AAWA 2CX3A 5IMAA 3VWUA 1JZRA 3D22A 5ECPB 1PRXA 2PPTA 2VL3A 5B8AA 1K3LA 2H0HA 2GT6A 1YKCA 3W8JA 4OFMA 5E59A 2REMA 2AHEA 3J7Yb 3GKNA 1HYUA 1XW9A 6GSVA 2HXKA 4XRAA 4OO5A 4ZBAA 2PMTA 5KN2A 1WMJA 1SL2B 5JWRB 4G9HA 3EU3A 3FY7A 1SKWB 2CVBA 2I81A 7GSSA 1O81A 2DIZA 5J3RA 4IELA 1F2EA 2IMDA 1VF3A 5ID2A 1K0CA 1THXA 1OC3A 4JZQA 3A2WA 3TKRA 4KGIA 4AJ8A 3SWLA 2KP1A 4ML1A 1G6YA 1I9DA 3ERWA 3LXZA 5ECMB 5G30A 5GSSA 2VLVA 2V41A 2YP6A 2ZCTA 3TCOA 4QL9A 1OC8A 2GSTA 1XXUA 4GSSA 1ERVA 2HRFA 2J23A 3HVXA 1O73A 3UMAA 2N5BA 2LNSA 2LRNA 2VUPA 3HA9A 3APSA 1K3YA 2VLUA 4OCEA 2V2GA 4HU9A 2PN8A 2C0DA 1B4PA 1AQVA 3C73A 1ZZYA 1XWGA 3US3A 1MDIA 1RW1A 1UN2A 6GSUA 4JRRA 2TRCP 2KOKA 4HI7A 2H30A 3NOFA 1OC9A 4HJ2A 4FYUA 1AIUA 4KB3A 2M72A 2F8FA 3GX0A 3HJMA 2YNXA 3VLNA 4EVMA 3I9V2 1MD4A 2IMKA 2IL3A 1WJKA 3DWVA 4O92A 1PA3A 1A8LA 2I9HA 1U87A 3M9KA 1V58A 4I8BA 4IJ3A 4PQIA 1PX7A 3C71A 1VF2A 2JZRA 4PGTA 4FH8A 4Z7XA 3VI5A 1GSFA 4NXIA 5B7CA 2H70A 1M9BA 2YN1A 4XHMA 3F4RA 4IQ1A 1Q98A 4KCEA 4IVFA 4NPBA 1R5AA 1RQMA 4TXOB 2WULA 3FYGA 4JE1A 2YZUA 1EGOA 2WJUA 4Q5NA 4L0UA 3A5WA 3HZ8A 2MMZA 1K0NA 1W89A 2C0GA 4IW9A 1HNAA 3DD3A 2L5LA 1EOHA 3GL5A 1AQXA 4O5RA 3TOUA 3BCKA 2IJYA 3C1SA 3O76A 3TB2A 2XBQA 1ILOA 2F9SA 3KGKA 1SJ6A 1B8XA 4NV5A 1PN9A 4ZB9A 2GZZA 4RUVA 2GQKA 1EGRA 4E8EA 1DBYA 2PU9C 1G7OA 2K9FA 2YANA 1V98A 5HFKA 5D9WA 3QDNA 1PL1A 4MABA 1MDKA 3LYKA 4OWYA 4K7IA 3LJRA 3CRTA 2L57A 4OFNA 4BVXA 5JWOB 1JLVA 1K0MA 1GLPA 5HR2A 1XPVA 1TRVA 3IC4A 1TK8B 2PVQA 3A3TA 2VM1A 3QMXA 4TVEA 4BA7A 4I5QA 4MH3A 1TI1A 2OJLA 3WGEA 1XZOA 1R26A 2I4AA 2DMMA 3UVHA 1AW9A 3BCIA 3UVTA 2R6KA 5C04A 1TDIA 5HFGA 2LRTA 4MMMA 4EO3A 3QAGA 5G5EA 2B7JA 5ENUA 3N5OA 3KZQA 3ZTLA 2B5EA 3RBTA 1A2JA 3LYPA 1NW2A 2IMEA 5ECLB 17GSA 4LMWA 2PVOC 3MWHA 2VCZA 1I5GA 2IMFA 1KEBA 4MZCA 1SENA 1BG5A 1X9SB 2H19A 4TW5A 2H72A 1T3BA 4I2TA 2JSZA 3KP9A 5DJMA 5KN1A 3RPNA 1PX6A 3ZITA 4ISDA 3C7MA 4I97A 5LD0A 1TU8A 1O85A 3F6DA 1OAZA 2J9HA 1R5PA 3IXRA 4ZBBA 1GL8A 3UBKA 3DEXA 2B7KA 1X5CA 1YY7A 1J08A 4J2FA 2LJAA 1XVQA 2GGTA 3TJKA 4N0VA 3P2AA 3H8QA 3TGZA 3KIJA 4JBBA 1M2DA 1ACVA 5GZZB 2B1KA 5G1KA 1Z3EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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