5DCHA

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa dsba e82i in complex with mips-0000851 (3-[(2-methylbenzyl)sulfanyl]-4h-1,2,4-triazol-4-amine)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
DYTAGKEYVELSSPVPVSQPGKIEVVELFWYGCPHCYAFEPTIVPWSEKLPADVHFVRLPALFGGIWNVHGQMFLTLISMGVEHDVHNAVFEAIHKEHKKLATPEEMADFLAGKGVDKEKFLSTYNSFAIKGQMEKAKKLAMAYQVTGVPTMVVNGKYRFDIGSAGGPEETLKLADYLIEKERAAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Fragment library screening identifies hits that bind to the non-catalytic surface of Pseudomonas aeruginosa DsbA1.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 63
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dchA00
1SK0A 2C80A 3MAKA 4ECIA 1ZMAA 3ZIVA 3EVIA 4E8EA 4KE3A 2CVBA 4TR3A 1SJIA 3LGCA 2GZPA 5C04A 3ZFBA 5ECSA 2L6DA 2H66A 4IJIA 3F3RA 4TR1A 1T1VA 5IQYA 2F3MA 4MH3A 4JR4A 4ACSA 2LNTA 1PKZA 4ML1A 5AGYA 4MPGA 3LXZA 1Z7RA 1IYHA 2H6XA 4IQAA 2V41A 2NBSA 1T7PB 2GTUA 1EGRA 5FT3A 4FYCA 3L4NA 1OAZA 6GSSA 1EV9A 4ULXA 2O8VB 5IIZA 2L6CA 1G6YA 3DVXA 2LQOA 4XS4B 1OKTA 2CX3A 3APQA 3CSJA 3W8SA 1BEDA 3D0ZA 3F6FA 1TRVA 4IW9A 1ON4A 1V98A 1Z6MA 3ISOA 1PGTA 2L59A 1EP8A 3TDGA 1WJKA 2GQLA 3FZAA 4KCEA 2YWNA 3HJOA 3PGTA 4N11A 2LJAA 3APOA 3PINA 4N30A 2HZFA 6GSVA 1ST9A 2B5YA 5D96A 2OJLA 3GN3A 4N10A 3ZVJD 1SD9A 1TW9A 3UBKA 2LUSA 5CRHA 5AISA 3ERFA 2ZUPA 2X8CA 1V2AA 2PMTA 1OKDA 1GNWA 3D5JA 2HYXA 1V57A 1SKWB 4D73B 4BL7A 5H5QA 5ECIB 4J2FA 3Q6OA 2ON5A 1FO5A 1YQ1A 1EEJA 3NZNA 4KDXA 4HOJA 7GSSA 2OKAA 1AQVA 6GSUA 3QAGA 2L57A 3N9JA 5DQYA 1OVNA 4V1Ag 1MDJA 2C0GA 2NDOA 4HUAA 2KP1A 2DJ1A 1HQOA 4PQIA 4OD7A 3HVXA 1K0CA 3M8NA 2N5BA 1F3AA 20GSA 4EXJA 4RI6A 1XXUA 1TRSA 4L5OA 1KEBA 2VM2A 2H1DA 3C1SA 5DJMA 1Q4JA 4HS1A 2PBJA 3M0FA 4YQMA 1O8WA 2N5FA 3VWWA 3D6IA 1JLVA 3G7YA 2H0IA 1OC3A 5CRGA 2LJRA 4HQZA 4MZWA 1B48A 1XW6A 3HJMA 3LYPA 5D9TA 2YCDA 1ZGNA 4JU5A 2O85A 2VCVA 3I69A 1GUHA 5DQSA 1GTBA 4XCSA 1BX9A 3IPZA 2C0FA 4DSSA 5D8IA 2K8SA 3ERWA 3UOMA 2VCQA 3MDKA 4OMVA 1F9MA 1A2MA 3TJJA 1PQNA 1XWAA 3O6TA 5IOWA 4CDOA 4EE0A 2YP6A 1GL8A 1BG5A 3LEFA 3ZLPA 3KGKA 2M72A 2B5XA 4BPYA 4JR6A 3IE3A 2O87A 3HVVA 2XBIA 4FYUA 1O7UA 2MBSA 4AJ8A 3TRQA 3WT2A 2R37A 3H79A 4O5RA 4G10A 3H1NA 4ZBAA 3ZVJA 1X5DA 1FHEA 1AW9A 4XIHA 5ENUA 5GSSA 3TKSE 2MYGA 3C1RA 4PXOA 1ERUA 3CSHA 1EZKA 4HI7A 1ACVA 3E0UA 5B8AA 5ID2B 3DEXA 3P7XA 4DVCA 3E9JB 4PUAA 2HT9A 2KUCA 3E3EA 1GSEA 4RQRA 1ERWA 4ID0A 4GWRA 1Q98A 2L5OA 3TKQA 2FWEA 4GSTA 5ABRA 2R2JA 2DIYA 1AQWA 1LJRA 1WWJA 4ECBA 3MNGA 2NTOA 1G7EA 2CAQA 3QD9A 5JCUA 1F37A 4EDZA 3FKFA 1BAYA 3GH6A 2WCIA 1A8LA 5IMVA 4OFMA 3LFLA 2CV4A 3WGDA 1X9SB 1Z6NA 2AB6A 2VL3A 4Z7XA 1GRXA 3IV4A 2CX4A 2DMMA 3HZ8A 4Q5QA 1PX7A 3F4TA 4KB3A 1M2BA 3EE2A 4MJEA 2NPBA 1A8YA 4G2EA 3TRPA 1K3OA 2WDUA 2LNSA 3ZRDA 2WZ9A 3F9UA 4OWYA 4IP6A 5F07A 3F3QA 1GSFA 1V9WA 1VF2A 1R5AA 3IA1A 1A0FA 2PUKC 2CT6A 1TOFA 3ZFLA 2C0DA 2C4JA 2LTKA 2BMXA 3KP9A 3ZMLA 1G6WA 4YQUA 5DCGA 2VCXA 2HZEA 5IO0A 4TN8A 1HYUA 3TKSC 4F03A 1EWXA 4KSOA 1S3AA 1O8XA 4WBRD 1QQ2A 2HLSA 1QGVA 2LRCA 1GLPA 3O3TA 1AC1A 3GMFA 2JACA 2H1GA 5IPHA 2F51A 3IAM2 5ECNB 1MTCA 1DUGA 3KXOA 2V1MA 4MCUA 1K0AA 4XHMA 1T3BA 3CXGA 3FZ5A 2J23A 3J7Yk 3QAWA 4V2MA 1M7TA 3GX8A 5JWQB 3WT1A 2C0EA 1OC8A 3BOAA 2DJKA 2ALBA 2G2QA 1K0BA 4EKZA 2H71A 1M0UA 1GWCA 1HNBA 2DSAA 3QFBC 2ZNMA 1A2LA 1BQ7A 2NVLA 3GNJA 5A4WA 2N5AA 2ZCTA 1R7HA 5EL8A 5COHA 3TJFA 2V2GA 4I2UA 5IMCA 4K9ZA 1TRUA 3G7JA 3QFAC 3ZL5A 3NOFA 4V2NA 4KSMA 1X5EA 4TRXA 3H93A 4BA7A 1TU8A 1XFLA 4PQ1A 4I8BA 3FEUA 3I6AA 3M3MA 3RPPA 2OE1A 4MMMA 5HFKA 1AIUA 1F3BA 1URMA 6GSYA 5FHIA 1YJ6A 1R4WA 1YEXA 5AIVA 2JZRA 1YY7A 1U87A 4LMWA 2C3TA 5G5EA 4ZB6A 1WE0A 4KUNA 4L0UA 1XWGA 3IC4A 5IO2A 2MMOA 2E2MA 2PGTA 4GRFA 4CW9A 2FLSA 1M2DA 2XPDA 4XS6A 3GKMA 3GSTA 3VFIA 4LL4B 2AJQB 3TCOA 3ZMKA 1UC7A 1J9BA 3IR4A 3KEBA 2WJUA 2H1AA 4TXOB 3GTUB 5CREA 2QSIA 3FZ9A 1ML6A 2GZZA 1AAZA 5A4UA 4IBPA 1TJDA 3LG6A 2DJ3A 4ZL8A 1ERVA 1E6BA 5G1KA 3LQ7A 4JBBA 5HR2A 4J57E 3M9KA 2QGVA 1OE7A 4PNGA 1AUCA 2OACA 4MLYA 1JZWA 4KDYA 1O6JA 2HSYA 5D9XA 5G1LA 4IN0A 3D4TA 2M46A 2V6OA 3S9FA 3LORA 3V1WA 1I5GA 5GZZB 4GSNA 2LKUA 1ZCPA 2VLUA 1XW5A 3IXRA 1DBYA 3ED3A 3FHKA 2VAFA 4KX4A 3CSIA 4K0GA 1J08A 3LYKA 2IJYA 3UVTA 2H19A 19GSA 2VCTA 3F4SA 4KNDA 4K6XA 2LQQA 1B9XC 1TKDB 4GTUA 5E4WA 3HD5A 3D22A 3EMPA 2YV9A 2FD3A 1K3YA 2YANA 2H8LA 3VPQA 1SKSB 2X99A 5E59A 1G0TA 2IMEA 4IQ1A 2FWGA 2YPMA 2HFDA 2K8VA 3NIVA 1JLWA 2FA8A 5B6MA 4MF6A 3EC3A 5CNWA 4TR4A 3K8NA 4LLRA 3UAPA 1XW9A 5GAND 3GKNA 3DIEA 3CMIA 3G7IA 3QOUA 5FWGA 2H72A 3KD0A 4TR1B 1ZOFA 4I5QA 5IM9A 4NMUA 2RM6A 2WS2A 1SL1B 1ERTA 5L71A 1FW1A 2KP2A 2R3XA 1JZDA 2FA4A 2VL9A 5ELAA 5ECMB 4MA9A 3TOTA 4EDYA 4MZCA 1W89A 2VIMA 3VK9A 2GT5A 3KTBA 2B5EA 1GH2A 4X0XA 4N0ZA 3QCPA 1K0DA 1FAAA 3Q74A 2WULA 2JU5A 2H73A 4F9ZA 3L78A 3GX0A 12GSA 1A23A 1SK1A 2B7JA 4GSSA 4F0BA 2HSHA 1U3IA 2VCWA 2YJHA 1TK0B 2FUG2 4V1Ap 2RUEA 1T00A 2YWOA 3GFKA 4ILFA 3UIWA 2GT6A 2K9FA 2XPEA 1T4YA 3L0HA 22GSA 4H86A 4PURA 5HFIA 4KCAA 1SKRB 1QMVA 3GURA 2B1KA 4EC0A 1X5CA 1G7OA 4G19A 3HY2A 2KLXA 2OBKA 3A2VA 4IHUA 1S3CA 4EF0A 4QL7A 1W4VA 3KMOA 4FYBA 4MABA 3P2AA 4E8HA 3FYGA 1QFNA 4RI7A 4ZB8A 1Y25A 3A2XA 5IMFA 1E2YA 1SL2B 5EPFA 2IWTA 1PKWA 2YV7A 3D21A 4NHWA 3ZTLA 1XOBA 3ERGA 2R4VA 4LA1A 1O73A 1XPVA 1XVWA 3FR6A 4HQSA 4HJ2A 2VLTA 3IAS2 5INYA 6GSTA 3FY7A 3TUEA 3KCMA 1K3LA 2YJ7A 2L5LA 4PGTA 3QMXA 3ZITA 2TIRA 3F0IA 3TRXA 4O32A 3DGQA 5DAKA 2C3QA 1RQMA 4MP4A 3L9VA 1U88A 2RIIA 2PVQA 3US3A 1HNCA 4RQXA 4MJAA 3GH9A 3H4KA 17GSA 2DJ0A 3DXBA 1FOVA 2IFQA 4K7NA 2DIZA 2C8UA 5IMZA 1FB0A 2HRFA 3M1GA 4HJMA 3TJKA 2EIRA 1GSDA 16GSA 4AJ7A 3CTGA 1XZOA 2H76A 4DSSB 4HDEA 2IN3A 2DBCA 2I4AA 4IP1A 5A5KA 1H4OA 2DLXA 3ME7A 1ABAA 2PERA 2KOKA 2RM5A 1JFUA 3QPMA 1B9YC 2H75A 1M99A 1M2AA 5DCHA 1TTZA 4IVFA 1MDKA 4WETA 6GSWA 2ES7A 3F4RA 4AF2A 4ISDA 2M80A 4J56E 3TGZA 3FK8A 1Z7PA 1XWBA 3CBUA 2JZSA 1JHBA 3M9JA 4ZXGA 1V40A 4POKA 3ME8A 3U5RE 3KMNA 1SJZA 5D93A 3UL3A 3CTFA 3DKSA 2IMIA 1F2EA 1TK5B 2J9HA 2HE3A 2G0FA 5J41A 3IRAA 3DD3A 5DDLA 1Y6EA 4MZBA 3U6VA 2DJ2A 1SK2A 2IMFA 1T8EB 5CRWA 2V32A 5HR0A 4DSQA 4OO4A 4JEDA 2K18A 2VCZA 1FVKA 1T4ZA 3RPNA 1M9BA 3A5WA 1M9AA 4YH2A 3HKRA 5DAKB 2AV4A 4ZL9A 3ZZXA 5EVOA 5DVBA 1I9DA 5CRDA 4JZQA 2IFQB 1YF1A 3SBCA 1S3DA 5JWOB 3F63A 2AUVA 4MF7A 4YAVA 1SU9A 3KH9A 4I6XA 2D2ZA 2FCHA 2HI7A 1GP1A 1OE8A 1TI1A 2DC5A 4F2IA 4ZIJA 2REMA 2X8HA 3Q19A 2YOIA 2FHEA 3TB2A 2AYTA 5HR1A 4GQFA 3RBTA 5EY6A 1PRXA 2I81A 3EYTA 4IJ3A 5D73A 1IYIA 2HRNA 10GSA 1PL2A 1KTEA 4WXTA 2JADA 2XHFA 4PQHA 3CRUA 3FR9A 4MH2A 1FVJA 2QKEA 4ZBDA 1WPIA 5D9VA 2K6VA 2B3SA 2TRCP 2R6KA 3RAZA 3LWAA 1V58A 2P31A 2GSSA 2PVOC 4GF0A 2YWIA 2MMAA 1SYRA 2F8AA 4AGSA 1XCCA 1TRWA 5LNKe 2BTOT 5J3RA 1N2AA 1JZRA 3LSZA 4EO3A 1AQXA 2HZEB 2WGRA 4GQCA 4ZL7A 4XS1A 1NHYA 3VWXA 5AN1A 2B7KA 1A0RP 5IOXA 3KTLA 4OCFA 3Q18A 2L4CA 4WR4A 4GCIA 1GUKA 3EU3A 1ZYEA 1VF4A 2VO4A 4XS4A 3DYRA 2VD0A 1GTAA 4EL1A 5CAXA 3IBHA 4IELA 1C72A 4KW6A 2C3NA 2B1LA 1EOHA 4HU7A 3SWLA 5F06A 3RHCA 3ZIJA 5DJLA 3QAVA 5J5NA 2FNOA 2Z9SA 2A2RA 4QQ7A 1J0FA 2GS3A 4MK3A 4WF5A 5DALA 1YEPA 1TK8B 2CAIA 3BCKA 4KA0A 1MD3A 2AAWA 5J9BA 1EOGA 4DSRA 5H5SA 1ZL9A 4MPFA 5H5RA 3GKKA 2RUFA 2GSRA 1TP9A 4D73A 2LV3A 1K0MA 5B7CA 2PN8A 1GSYA 3WGXA 3FZ4A 3EMXA 3VI5A 4ZBBA 1XBSA 2H01A 3DWVA 1OC9A 4OCEA 5B8BA 1O81A 3OR5A 2OA7A 4NWYA 4XRDA 4KGIA 3CRTA 2LJKA 3O76A 5IMAA 4X1UA 4WBJA 3KM6A 1U3AA 1SENA 1PD21 5JCGA 3RHBA 2CVDA 4NV2A 3C71A 1NW2A 4K1FA 3HA9A 1TU7A 2GZYA 3FW2A 3IOSA 4BVXA 1A2JA 1K0OA 3KJYA 5ECHB 3QDNA 5B6NA 3L9UA 2GGTA 2R5GA 4TOPA 3R2QA 1DE1A 1RW1A 3C8EA 1USBA 4Q5RA 2H74A 4KH7A 3J7Yb 2F8FA 5KN2A 2GVPA 4RUVA 5KN3A 1H75A 1Z3EA 2I1UA 3HDCA 2P5QA 4POBA 4Q5NA 1TXXA 3BCIA 2MBTA 4MF5A 4TR0A 3VI7A 5DALB 2VD1A 3GL3A 2GQMA 2OE3A 3HZ4A 1WMJA 1VRSD 11GSA 2FY6A 1PMTA 1DE2A 1EV4A 2H30A 3C73A 4NAXA 4ML6A 2H0HA 2O7KA 1FB6A 1BYEA 4ECJA 2EIQA 1X0RA 4XRAA 1WOUA 3CYNA 3GL5A 1VGLA 2EC4A 3W6GA 3ZREA 1TDIA 1OC9B 3P8WA 4EUYA 3F6DA 3HYPA 1N8JA 3IDVA 1YZXA 2HXKA 6GSXA 3VWVA 4WEYA 8GSSA 1FG4A 2IL3A 4O92A 4OO5A 3LXTA 5G30A 3UEMA 3IK7A 2GQKA 4K7OA 4L8EA 4POLA 3MWHA 1QXHA 2BJXA 2LRTA 3BJ5A 3A2WA 3I9V2 1WIKA 3TJGA 5GSTA 1SYXA 5ID2A 2E2GA 5IPGA 5ELGA 2FWHA 2O89A 4HU9A 2IPAA 3KH7A 1XWCA 2IMKA 4FIWA 1A24A 2WRTA 5ECRB 1MD4A 3PR8A 4ZILA 2FWFA 1YKCA 3HHVA 1GLQA 5JCWA 3AY8A 2JSZA 3KIJA 4O7HA 1B4PA 4P3YB 2CZ3A 3KZQA 3GKXA 4K0NA 3GV1A 4POMA 1LU4A 3TOUA 3TKRA 2I9HA 2DJJA 3KP8A 5HR3A 1O85A 3FRCA 5KEJA 4MJCA 5KN1A 5F0GA 1VF3A 4N0VA 2GLRA 2QC7A 5HQPA 4DEJA 3I43A 1R5PA 3C7MA 5CO3A 2VUPA 1YKAA 4WF4A 3APSA 3TKPA 3GA4A 1VF1A 1PN9A 1WP0A 2JSYA 1EP7A 4BWSA 4PX1A 5IMDA 2FGXA 3QR6A 2RLIA 4JRRA 5G2ZA 4TVEA 1U6TA 4FO5A 2OBIA 1QUWA 1GTIA 4KAEA 1YF0A 4BWQA 1K0NA 1THOA 5GAPD 3WGEA 5DBQA 2X64A 1GUMA 3EWLA 3DRNA 4I2TA 4OFNA 2H6YA 5CYYA 3FR3A 1JZOA 3P90A 2VLVA 2MZCA 4XTSA 5CP1A 4WR5A 4ZB9A 2CQ9A 1PA3A 4FH8A 1TI3A 3TJBA 2IIYA 14GSA 4L5LA 4PNFA 3D4MA 2GDRA 1PL1A 5LD0A 2JL4A 3GUSA 1R26A 2TRXA 2LRNA 2H0GA 1GSSA 2MMZA 1NSWA 1MEKA 4HZ2A 4F82A 1SJ6A 1GSUA 5ECPB 4IKHA 4EVMA 1HD2A 2VOCA 4K8MA 4LL1B 3EINA 2ON7A 4KDUA 3IHQA 3WD6A 1RK4A 1OYJA 4OFTA 2H6ZA 1NHOA 4JE1A 3GSSA 2MMNA 1ILOA 3EURA 1GULA 1PX6A 1KBNA 2H1BA 2YZUA 2A4VA 2E0QA 1X9MB 2CZ2A 1GNEA 4NHZA 2YZHA 4NPBA 2KHPA 3VLNA 2P5RA 5F8BA 5ECQB 2CA8A 1Z9HA 4BVYA 3W8JA 5ECLB 4IS0A 2L4QA 2YN1A 2WFCA 2H70A 4GLTA 5LCZA 3DMLA 2YWMA 3JCML 4YAPA 2LEGA 5J4UA 3HVSA 2YNXA 1UVZA 4PUFC 3VWUA 1XVQA 2OADA 3RDWA 3GIXA 3VPTA 2WB9A 4YQVA 4NXIA 4K2DA 2CVKA 2EIOA 2AHEA 4HEA2 5AIXA 1GSQA 4G9HA 4HZ4A 5HFGA 5J9CA 3N5OA 4GXZA 4I97A 3GYKA 3BD2A 1EEMA 3UMAA 3F8UA 3HCZA 4TXOA 4F0CA 3A3TA 3GTUA 1AXDA 4CHSA 5D9WA 5ECKB 2PU9C 3TKSA 5KN0A 4V2LA 3ZYWA 3LJRA 13GSA 4MDCA 4WKWA 2GSTA 2XBQA 5C00A 2IMDA 1KNGA 2X8GA 5A4VA 4TXVA 4K7IA 3VURA 1BJXA 5G5FA 3HXSA 3UVHA 2LSTA 4MJBA 3GRXA 5F05A 1UA5A 2XC2A 3EU4A 4NV5A 1Z5YE 2C1YA 1XIYA 5G31A 3PH9A 2PPTA 4IGJA 2GSQA 1XOAA 1F6MC 2P0GA 4TKYA 3MSZA 18GSA 2I3YA 1WRYA 3DVWA 1GTUA 4LMVA 3GHAA 9GSSA 1PSQA 1NM3A 4X43A 3IK9A 2VL2C 1SL0B 1HNAA 2B6MA 2VM1A 2F9SA 4L0WA 1B4QA 2PWJA 1QK8A 3UBLA 1ZZYA 2JZTA 3H8QA 4Q5FA 4TW5A 2LS5A 1EGOA 4AJ6A 2E7PA 2DMLA 1ZYQB 1MDIA 3L9SA 3BBYA 1LBKA 5JWRB 1UN2A 1CQHA 1XWKA 1B8XA 3UJ1A 2HNLA 1DSBA 1THXA 1X9WB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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