4IQAA

Crystal structure analysis of the e228l mutant of human clic1
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
235
structure length
223
Chain Sequence
PQVELFVKAGSDGAKIGNCPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDELIELAYEQVAKAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
publication title Crystal Structure Analysis of the E228L Mutant of Human CLIC1
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 223
sequence length 235
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4iqaA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4iqaA01
3F6FA 1YJ6A 1SD9A 4J57E 3E0UA 3RPNA 1XZOA 1CQHA 4AGSA 1R5AA 1FB0A 4ZL9A 3UJ1A 3LXZA 5G2ZA 3J7Yb 5JCWA 5J3RA 3TCOA 1BYEA 3ZIVA 3F63A 2OA7A 3KZQA 3DYRA 2P5RA 2V2GA 1Y6EA 4Z7XA 5FWGA 1V2AA 4OFMA 3KTBA 3FEUA 1K3YA 1Q98A 1R4WA 2OACA 4H86A 4GXZA 2GLRA 3TRXA 1YF1A 4WBRD 4K7IA 2FHEA 1VF3A 2ZCTA 3UBLA 3Q18A 5JCGA 4EF0A 5CRDA 4F0CA 4PUAA 1V58A 4TR1A 4ISDA 5ID2B 3R3EA 3DWVA 1PKWA 2C4JA 5JWRB 1QGVA 3EWLA 3C1RA 3TJFA 1XFLA 2M46A 4AJ6A 2FWEA 4Q5FA 2LJAA 4L5LA 4ZB6A 1HNAA 4ULXA 3LYPA 4PQIA 6GSWA 5ABRA 2HRFA 2AYTA 4AF2A 5FHIA 4I5QA 2LNTA 2H19A 2K8SA 3GN3A 3MAKA 1O6JA 3ZRDA 3KD0A 4V2LA 3LWAA 1PRXA 3A2XA 5BMUA 2MMZA 4POMA 5CRGA 3TKSE 3TOUA 2JZRA 2VUPA 3CRUA 4I2TA 2H0IA 3HVVA 4MZCA 3KEBA 3VFIA 4ZL7A 1G6YA 5KN0A 3F4TA 2H8LA 3ME7A 1Z5YE 4YQUA 3KP8A 5JCUA 1ZCPA 3TJGA 2O85A 2NTOA 2HZEB 4WF4A 4ZBDA 3RHCA 3KMOA 2CZ3A 1J9BA 4ACSA 2DMMA 1EWXA 1WWJA 2HSNB 2H0GA 4J56E 4TXVA 3KMNA 2AAWA 2HRKA 2GQKA 4G0IA 3HYPA 1U88A 1EGOA 2GZYA 4HJMA 3G7YA 2OADA 4XS4A 5HFGA 5GSTA 2VL3A 5IM9A 3UBKA 3O76A 3IV4A 1X5DA 5C00A 2HYXA 5C04A 4BVXB 4ZB8A 3HJMA 3ZREA 3NZNA 3L78A 1BX9A 3DKSA 1USBA 1GNEA 4IBPA 1MDKA 3TJBA 12GSA 4QL7A 4MK3A 3CRTA 3DGQA 4YQMA 1GTIA 1S3AA 1X0RA 4XRAA 2YZUA 3IA1A 4BL7B 1EP7A 1QK8A 2Z9SA 4G0LA 4N11A 4XS1A 2H6ZA 2HXKA 5DQSA 1SD8A 3FW2A 2HNLA 2WJUA 1A8YA 1U87A 3LORA 1XCCA 2V6OA 2C3NA 1PKZA 1F37A 1AQVA 4MF7A 3WT1A 4KGIA 3ZFBA 2DBCA 1QFNA 3CMIA 4O32A 1O85A 1JLVA 2B5YA 3UMAA 2VL2A 1ZYQB 4ID0A 3QDNA 3UL3A 1GTUA 1K0MA 1O81A 2MMNA 2L6DA 5HR2A 2VCZA 2GTUA 5IMCA 3CYNA 3SBCA 1O7UA 2OKAA 3HY2A 2O7KA 4WEYA 2DLXA 4HI7A 2IIYA 2HT9A 2F8AA 3L4NA 3RDWA 1Z6NA 1TRSA 1H4OA 5F0GA 3V1WA 1VF1A 1JFUA 5IMVA 1FB6A 5KN3A 1XOAA 1SJ6A 3KGKA 2R5GA 5IMDA 4HUAA 2YJ7A 2BMXA 1R5PA 4L5OA 4RQXA 4WKWA 2C0FA 3QD9A 1TRVA 5IO0A 4NMUA 2IWTA 3FZ9A 4BWSA 2C80A 4KUNA 2WCIA 3IHQA 2L57A 3P8WA 1OC3A 1UC7A 1ABAA 3WGDA 4NHWA 1TXXA 4BL7A 4HZ4A 4WF5A 4WR4A 2I81A 2B5EA 1HQOA 16GSA 4KSOA 2X8GA 1A0RP 2L5LA 1O73A 2AV4A 3TKSC 2TRXA 3KCMA 1GSYA 2N5BA 3ZVJD 3ZLPA 4KDXA 4N10A 3VK9A 1T3BA 1X9MB 3ERWA 1U3IA 4OFTA 1V40A 2GZPA 4TXOB 1WIKA 1WRYA 2NBSA 1B9YC 3QMXA 4AJ7A 3GV1A 4IP6A 1RW1A 4MF6A 1EOGA 1GP1A 2L5OA 1SJZA 5AISA 2VL9A 2MYGA 1G7OA 4NWYA 3VI5A 1KTEA 4TR4A 2F8FA 5ECRB 5ECQB 1ZZYA 2KUCA 3OR5A 4BVYA 1A2JA 5J9BA 3IOSA 4OFNA 5IQYA 1VRSD 3O6TA 2DIYA 4KNDA 4EO3A 3H4KA 1TP9A 3IC8A 2DSAA 2I1UA 4D73B 1YEXA 2TIRA 1TDIA 3F3QA 8GSSA 3ZL5A 2VLUA 2IMDA 3EU3A 2H66A 1XVWA 1EZKA 4MJAA 1MDJA 2VCWA 1M2DA 3VWWA 4EDZA 1TRUA 1R26A 2JU5A 3HHVA 2EC4A 4MABA 2K9FA 3F4RA 2E2MA 4X43A 3IAS2 1BEDA 1NHOA 3DVXA 1SK0A 3LXTA 1K0NA 2PGTA 1RK4A 2YWMA 2GSQA 5CNWA 2CVDA 3QPMA 5DAKA 6GSXA 4V1Ap 2FUG2 3MWHA 2LSTA 3M9JA 1PL2A 1WP0A 3VWUA 2L4CA 3PPUA 3VWVA 5ECSA 5LNKe 6GSTA 2L6CA 4MMMA 3F9UA 5DVBA 2K8VA 1U3AA 3W8JA 1ZYEA 3C73A 2YV9A 3D4TA 3TKQA 2VCTA 1PN9A 3AY8A 5B6NA 2LUSA 3G7IA 2C0DA 3UOMA 20GSA 2KP2A 2GVPA 4G9HA 2G0FA 4X1UA 1LJRA 2GS3A 4KCEA 3TGZA 2WB9A 1S3DA 4ZILA 1T00A 3GHAA 1IYIA 5KN2A 1EV9A 2IMIA 4TN8A 3TRQA 5DCGA 1R7HA 1F3BA 1B8XA 2N5FA 4XRDA 2GQMA 4D73A 3CTFA 3WGEA 4PNFA 2CT6A 1A2MA 5IIZA 1AC1A 2GDRA 3GUSA 3QAGA 4BPYA 1HD2A 1BQ7A 2H71A 1WPIA 1HYUA 4KSMA 3HZ8A 4GSSA 4X0XA 5H5QA 2RIIA 1GULA 4XS6A 5IPGA 2ZNMA 2PWJA 3ZMLA 1M7TA 4LL1B 3IAM2 5GAND 1PX7A 4MZBA 5LCZA 4JU5A 1KEBA 2H30A 2DJ2A 2VLTA 3S9FA 1B4PA 1YDKA 3GTUA 3US3A 1TI1A 2A4VA 2CX3A 2H72A 2HSHA 5CRHA 2HSYA 3GNJA 3L9VA 5J4UA 4N0VA 2VLVA 5D9WA 5ECOB 4NV5A 4LMWA 3EYTA 4ZB9A 4HQSA 2YWOA 2GT5A 2YZHA 1CQGA 4PNGA 4BA7A 1GSDA 1Z9HA 9GSSA 3D4MA 4P3YB 1NW2A 2HSMB 1DE2A 4I8BA 2DMLA 4OCEA 5E59A 3DD3A 3QCPA 2ZUPA 1M2AA 4YAVA 4L0UA 4IELA 4GF0A 4XIHA 3UEMA 4HZ2A 3U5RE 4EDYA 1Z3EA 1DUGA 2PBJA 3D22A 4GCIA 1FVJA 2DC5A 3I9V2 1LU4A 2LKUA 2E0QA 1G7EA 1GLPA 4IW9A 5EY6A 5KEJA 2WZ9A 22GSA 1V98A 2LRNA 4TVEA 1OKTA 5COHA 2F9SA 2LRCA 3GL5A 2X8CA 2PERA 2V1MA 2FNOA 1RQMA 1TW9A 4WXTA 2GSRA 4KDYA 5G30A 3CXGA 4TW5A 5AN1A 5A4WA 2H76A 1XPVA 4IQAA 3FY7A 3VLNA 4OCFA 4JR6A 3GH6A 1UN2A 5J9CA 2VCVA 3FZ5A 1AIUA 1BJXA 3HJOA 2IPAA 1QUWA 2JSZA 4KB3A 2XPDA 5CREA 3FR6A 4IP1A 4LLRA 1Z6MA 3BBYA 5HR3A 2YWIA 4I6XA 4IS0A 1LBKA 4ECJA 2C1YA 2OBIA 2BTOT 2P5QA 1QMVA 1SL2B 3CBUA 4MLYA 2JACA 5EL8A 1DSBA 5B8BA 1K0BA 2LV3A 3U6VA 4NPBA 1GRXA 5EPFA 3P7XA 4GWRA 1JHBA 5ID2A 4O5RA 3TKSA 5IPHA 2B6MA 1E2YA 3LYKA 3LEFA 1F6MC 3NOFA 1T4YA 5A5KA 4YQVA 4IN0A 5ECLB 4NXIA 1SYXA 3ZFLA 3QAWA 1FHEA 5ECIB 5G5FA 2IMFA 4K0NA 3GYKA 3I6AA 2CAIA 4WETA 3PINA 3IXRA 1SYRA 2M72A 5IMFA 5DJMA 4TKYA 4IVFA 3WD6A 1EOHA 1YZXA 4ILFA 4DEJA 2IMEA 5F8BA 2LJKA 1YEPA 3CSJA 4EE0A 1Y25A 4GQFA 4ZL8A 4K2DA 3O3TA 4L0WA 5INYA 1E6BA 2A2SA 1OKDA 1PX6A 2RM5A 5ELGA 2J23A 1MD3A 3CSIA 4MPFA 1A24A 1JZOA 2ON5A 3L9UA 5F07A 5D96A 4ZBAA 2LS5A 2HZEA 3ERFA 3I43A 4K9ZA 4RI6A 5DCHA 3GA4A 4JRRA 1GSUA 1YF0A 3VI7A 4DSSB 1TK0B 4OO5A 1SKSB 1ZOFA 4F82A 2I4AA 3IC4A 2X8HA 3JCML 2WFCA 5HQPA 2OE1A 2H01A 3RPPA 3M0FA 3WT2A 2YCDA 1O8XA 2HRNA 3IK7A 5LD0A 1GSFA 1YQ1A 1A8LA 1XW9A 4XCSA 3HZ4A 2FD3A 1SU9A 4G19A 3FR3A 5HFKA 2CV4A 2VM2A 4BVXA 4J2FA 3ZVJA 1TK8B 2MZCA 1NM3A 1OVNA 1XWCA 3BCIA 3HKRA 2FWFA 1OE8A 4MDCA 1XW6A 3QOUA 1T7PB 3LJRA 4K7OA 3HD5A 3VURA 4L8EA 1SKWB 1C72A 2FA8A 4K8MA 1X5EA 3UVHA 2CVKA 4MH2A 2KOKA 2YANA 1IYHA 2JSYA 3F6DA 4PGTA 3G7JA 3PR8A 4GSNA 4FYUA 1TRWA 1VGLA 2VO4A 1DBYA 19GSA 2H73A 2RM6A 5ECKB 1TK5B 1G0TA 3C71A 2N5AA 1XOBA 3KTLA 5CP1A 3KM6A 1SKRB 2FWGA 4HS1A 3K8NA 1ZGNA 2E7PA 1F2EA 5F05A 3M9KA 4O92A 5ECNB 3GL3A 1TI3A 3W8SA 4N30A 1BG5A 4YAPA 4E8HA 4EXJA 4RQRA 4FH8A 1X9SB 1FOVA 4G10A 1AQWA 1ERVA 4ZIJA 4AJ8A 3GFKA 3GKMA 2H1GA 1T4ZA 4Q5RA 4ZXGA 1ERTA 3C8EA 5L71A 3WGXA 3LGCA 2DJ3A 2C0EA 2K6VA 1I9DA 2A2RA 4V2MA 2AUVA 5A4UA 1ZMAA 2YNXA 5G1LA 1YY7A 2XPEA 2YN1A 1OYJA 2MMAA 5DBQA 2CZ2A 3GURA 5FT3A 3ZIJA 2E2GA 1ACVA 2V32A 4TOPA 2CX4A 3HVSA 2IMKA 4MZWA 3MDKA 2VD1A 2GT6A 3PH9A 2JZTA 1OC8A 2NPBA 3ED3A 1UA5A 4NV2A 1GL8A 2LTKA 3TKRA 5IOWA 4MP4A 3NIVA 2EIQA 2V41A 2LJRA 1K0AA 2L4QA 1T8EB 4POBA 1PQNA 4EL1A 5IO2A 1GTAA 3IPZA 6GSUA 3ZITA 2PMTA 1WMJA 1X9WB 1YKAA 4KH7A 4E8EA 4TRXA 1K0OA 4TXOA 3M3MA 2DIZA 1KNGA 2PVQA 4ML6A 3P90A 2MBSA 1PSQA 3BOAA 4LMVA 6GSSA 4F03A 1I5GA 4OWYA 4F0BA 1PL1A 3KXOA 1SK2A 3ZTLA 1W89A 2BJXA 3HCZA 4CW9A 3QFAC 2RLIA 5EVOA 1A23A 3TJKA 1NHYA 2XBIA 3N5OA 1A2LA 3ME8A 1V57A 4EUYA 4Q5NA 4I97A 4OD7A 1VF4A 3D0ZA 5GSSA 2H6YA 5DQYA 3R2QA 3GKNA 3MNGA 2OBKA 1PMTA 1EEJA 2VOCA 2QGVA 3G9BA 1Q4JA 1FAAA 1V9WA 3DRNA 4IJIA 2G2QA 3KJYA 1N8JA 3GIXA 5DALB 5F06A 2VAFA 1M0UA 2HZFA 2H1DA 3UVTA 2GSTA 11GSA 4NAXA 2R3XA 2P31A 4PURA 4MA9A 4K0GA 1ST9A 3F0IA 1K0CA 4NHZA 4RI7A 1F9MA 3GSSA 5D9TA 3LG6A 2PUKC 2C3QA 4OMVA 1VF2A 2WS2A 4O7HA 5D73A 3LSZA 1MDIA 3IK9A 4I2UA 5J5NA 3KH9A 6GSYA 3J7Yk 3VPTA 3FHKA 3C1SA 1AQXA 4ZBBA 4USSA 5B7CA 2PU9C 1O8WA 2TRCP 2C8UA 2QC7A 4G2EA 4ECIA 5HFIA 4RUVA 1GSSA 10GSA 3M8NA 2JL4A 4LA1A 3FR9A 2KP1A 4KX4A 2FLSA 4CDOA 2IL3A 2AHEA 1ZL9A 2GSSA 2NVLA 1AXDA 2YJHA 2WDUA 2XC2A 1GSQA 1XWAA 1SL1B 2YWNA 3L0HA 5ENUA 1FW1A 5CO3A 5JWOB 5G31A 2H6XA 3A5WA 1TOFA 4DVCA 2ES7A 3APQA 3RBTA 5AIVA 2H75A 1GLQA 3EE2A 2HRKB 4KE3A 2DJ1A 3MSZA 4BWQA 4V2NA 5DALA 4XS4B 1M9BA 5GAPD 5IOXA 4GTUA 3HJPA 2MBTA 1ERUA 4IGJA 1WOUA 4MJEA 4ECBA 4FIWA 2D2ZA 3IBHA 1PD21 4EC0A 3BCKA 1N2AA 1QXHA 5ECHB 3ZYWA 1XIYA 4PUFC 1FO5A 3E3EA 17GSA 3SWLA 1THXA 2HI7A 1PA3A 4MF5A 5ECPB 3DMLA 3GRXA 4KAEA 3TOTA 2GGTA 2EIRA 1UVZA 1BAYA 3FKFA 1AUCA 3CTGA 2J9HA 3D21A 4XHMA 4EKZA 4HOJA 2LQQA 2LRTA 5DDLA 5D8IA 4MJBA 3TUEA 2EIOA 2B5XA 2FY6A 1MTCA 4QQ7A 2H74A 2HSMA 4F2IA 3HXSA 2R6KA 1TJDA 1THOA 1GNWA 1Z7RA 3GKKA 4HQZA 3EINA 2IFQB 2CA8A 4HU9A 4KF9A 2AJQB 3DEXA 4IHUA 4JZQA 3E9JB 2FA4A 4IQ1A 4GLTA 1Z7PA 3UIWA 1K3LA 4K7NA 14GSA 5D9XA 4V1Ag 2B7KA 5AIXA 4K1FA 2IN3A 4G0KA 1M99A 3TRPA 2LQOA 3GSTA 2YV7A 1TKDB 4YH2A 1GH2A 4JR4A 1K3OA 3F4SA 5IMZA 1XWKA 3N9JA 3F3RA 2K18A 3IDVA 2H1BA 1DE1A 3EMPA 5A4VA 3D6IA 2O8VB 4HDEA 3GX8A 2DJKA 4CHSA 3A2WA 4MH3A 3UAPA 1XWGA 4KDUA 5KN1A 4JBBA 4XTSA 2VCXA 4DSQA 1PGTA 1MD4A 3Q6OA 4ML1A 2OE3A 3TDGA 2PVOC 1JZRA 1A0FA 1SJIA 3VWXA 5GZZB 2F3MA 1ERWA 1JLWA 3ISOA 2OE0A 3GX0A 4POKA 1GSEA 1X5CA 3QAVA 2GQLA 4MCUA 2IFQA 3FK8A 2XBQA 3KIJA 3DIEA 1JZWA 3FYGA 1FG4A 4FYCA 3DVWA 3EC3A 1ON4A 2O87A 2I9HA 4OO4A 4QL9A 2VIMA 1TTZA 3F8UA 2L59A 3DXBA 2CAQA 2HRAA 2DJ0A 3HA9A 5ECMB 3ERGA 4JEDA 2P0GA 2LEGA 4BVYB 13GSA 2H0HA 2WULA 3RHBA 1B48A 1H75A 2RUFA 2JZSA 2NDOA 3RAZA 3TJJA 2QKEA 3FZAA 2M80A 3TKPA 4MJCA 4Q5QA 2UZ8A 1SK1A 2V6KA 2MMOA 3LQ7A 2PPTA 3Q74A 1WJKA 3A2VA 1K0DA 2KLXA 3HVXA 7GSSA 3APOA 4PQ1A 5J41A 3H8QA 2KHPA 2FWHA 1EP8A 2VD0A 4KW6A 6GSVA 4N0ZA 4TR3A 3KP9A 2WGRA 1GUHA 2YPMA 3FRCA 2HE3A 5CAXA 2B7JA 3QFBC 4PTSA 5DAKB 5ELAA 1XVQA 3WYWA 3EMXA 1GUKA 4TR0A 2F51A 3GKXA 3PGTA 2ON7A 4DSSA 2H70A 4HEA2 5HR1A 2R4VA 1F3AA 5CRWA 5AGYA 4POLA 1SL0B 3A3TA 2RUEA 3VPQA 1AAZA 1GUMA 2HQTA 4MPGA 1YKCA 3EU4A 1G6WA 2HLSA 1ML6A 3LFLA 4GRFA 2LNSA 4JE1A 1T1VA 5IMAA 1AW9A 1M2BA 3TB2A 1TU7A 1XW5A 3H1NA 1B4QA 2PN8A 3EURA 4DSRA 3APSA 2FGXA 1EEMA 1OC9B 3H93A 2O89A 3C7MA 2HFDA 4FYBA 2R2JA 1OE7A 1KBNA 2FCHA 2QSIA 2H1AA 1M9AA 4WR5A 1J08A 1ILOA 1XWBA 1HNBA 2R37A 4PXOA 2CQ9A 2XHFA 1U6TA 3QR6A 2VM1A 5HR0A 3IR4A 3W6GA 2REMA 3HDCA 3H79A 4FQUA 3EVIA 3D5JA 1XBSA 4HU7A 2VL2C 2YP6A 3BD2A 1NSWA 4PX1A 1MEKA 3P2AA 2I3YA 3GTUB 1W4VA 5JWQB 1HNCA 2GZZA 4GQCA 4PQHA 4LL4B 2OJLA 4K6XA 1OAZA 2IJYA 1B9XC 4IKHA 3KH7A 3GMFA 4KCAA 1XXUA 3Q19A 1QQ2A 2DJJA 3L9SA 2JADA 2VCQA 1TU8A 2X99A 3IRAA 1WE0A 4HJ2A 2ALBA 5G5EA 2WRTA 5G1KA 5H5RA 5B8AA 1EGRA 1GWCA 5H5SA 5DJLA 2B1KA 3ZZXA 3GH9A 2X64A 3FZ4A 4GSTA 5D9VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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