2V6OA

Structure of schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase (smtgr)
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Glutathione Reductase and Thioredoxin Reductase at the Crossroad: The Structure of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 180
structure length 586
sequence length 586
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2007-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2v6oA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v6oA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2v6oA03
1K0LA 1X9SB 2QSIA 2I3YA 1VDCA 5CYYA 1XWKA 5LD0A 1FW1A 1JRYA 3EINA 3LFLA 1O8XA 3C71A 3GFKA 3AE4A 1WJKA 3FBSA 1ZL9A 2C3NA 3GKKA 4A6NB 2Z5YA 1IUXA 4MH3A 5EB4A 1FHEA 3RPPA 2WHDA 4LIIA 2EIOA 4ZL8A 1CC4A 4OPUA 1IJHA 2EQ6A 1W89A 4F2IA 4GCMA 1MD4A 2A89A 4U8JA 3GKNA 2PGTA 2H0IA 4RUVA 3EVIA 5E59A 3GL5A 1ST9A 3F9UA 1M9AA 4G9HA 1JOAA 1VGLA 2HE3A 2VCXA 4TM0A 4YQUA 2JAEA 1X5DA 3VRDB 5HXIA 2GR3A 1BKWA 4DGKA 5IMAA 3G9BA 3ED3A 2NDOA 3COXA 1MDIA 2C0EA 2G2QA 3AD8B 2KP2A 2HZEB 4BK2A 5HR2A 4K8DA 1PJ5A 1JZWA 1GL8A 1PKZA 3KMOA 1BGJA 1Q1RA 3NNEA 2B5YA 1PKWA 3NYCA 4ML6A 5DDLA 5J3RA 1K3OA 2REMA 1ZOVA 3W8SA 2C0FA 2GQLA 2K8VA 3C7MA 2YWOA 2ES7A 1D4DA 5JCNA 1X0RA 4TN8A 2BMXA 1PRXA 2E2MA 1SL2B 4RG4A 3GWDA 1FG4A 1OE7A 3UKKA 2Z9SA 5G1LA 2AJQB 2X3NA 2F3MA 20GSA 3NIVA 4F03A 3NK0X 4K22A 1CHUA 1WP0A 3MAKA 4EIQA 1QMVA 5ECKB 4IA5A 1LVLA 2ON7A 1IUUA 3KLJA 4H4ZA 1KNGA 3IV4A 3AECA 2YR6A 3AEAA 2X64A 2B7JA 2HXKA 4M52A 3IC9A 3TKSA 3GX8A 1P2EA 4QL7A 4HB9A 4OPGA 2A8XA 3VWWA 5ID2A 3UP5A 4N10A 1GSFA 1XOBA 2VOUA 3VWVA 3DGQA 3EPTA 1G0TA 4YAPA 5EOWA 1K0CA 2R0CA 3AYIA 1ZY8A 3UBLA 1XHCA 5M10A 3CTFA 3FG2P 5D9TA 3QVPA 4XRAA 2MZCA 2M46A 1KSUA 3C96A 3HVVA 4H4XA 4E8HA 2YWIA 3EMXA 2H66A 3KD0A 2VAFA 1KSSA 3K7MX 3DK4A 1CC2A 2B5EA 4NWYA 2YLRA 4GXZA 3DA1A 5U63A 2WU2A 2P31A 1GTBA 5JCMA 2V41A 4GQFA 3NGCX 5L46A 4YSHA 2ZCTA 1U87A 3NN6X 1LPFA 4DNAA 2O87A 1ML6A 2RGJA 1PA3A 3DXBA 5ECSA 5LCZA 4AGSA 3UCLA 3UJ1A 3S61A 4PGTA 1GP1A 2QAEA 1PL2A 4H4TA 2VLTA 1F8SA 3CXGA 1NHOA 2LKUA 1OE8A 2KOKA 2WPEA 3J7Yk 1A0FA 2DBCA 1SYRA 3IRAA 1JRXA 1LU4A 4AJ7A 1EWXA 4EQXA 1AC1A 2GF3A 1Z7PA 4OCEA 3AD7B 2B9XA 3LXDA 2N5AA 1PJ6A 4Q5FA 2X8HA 3QOUA 3VI5A 4MK3A 2GSQA 3C1RA 3KVEA 3IAS2 3O6TA 2LTKA 4MDCA 2WU5A 4A7AA 3LORA 2A87A 4D03A 4MJAA 4J34A 2BK5A 3M9KA 1ERUA 3P4QA 4BA7A 1SKRB 2VVLA 1S3BA 4HZ2A 4EO3A 2JBVA 3M13A 1YDKA 4KCEA 3SGLA 2VOCA 1REOA 5G30A 2O9ZA 4Y4MA 1N2AA 4EQRA 4N11A 3NH3X 1TK5B 3D1CA 3II4A 4HEA2 5U25A 3LXZA 3CGBA 3CNTA 3L8KA 5L71A 4J33A 2Z5XA 5IQ1A 5GRTA 2WZ9A 2GVCA 4RG3A 1FB6A 1EEMA 3TKRA 1TI3A 4MZBA 3UOXA 3ZMKA 2VL3A 1GRBA 1NW2A 3DYRA 2VM1A 1THXA 3PINA 5BULA 5IPHA 1QXHA 3GV1A 1YEXA 5KRQA 1GTAA 4AP1A 3P4RA 4MJWA 1H84A 1T00A 3KU9A 1V9WA 3ICSA 2TPRA 2L6DA 2WDQA 2GSTA 4AOXA 3EAOA 4CDOA 4ECHA 4IA6A 2ZZ0A 4PABA 2HZEA 4O32A 1E1MA 1EOHA 3RP7A 2V6KA 1G6WA 1AQVA 2I0ZA 4HI7A 1F3PA 3DVWA 5DALA 4ECIA 1KF6A 3GH9A 1JNRA 4YSZA 4TW5A 1MDKA 1N4UA 4OO4A 2R2JA 2HFDA 3FY7A 1NG3A 4TR3A 3IDVA 1RSGA 4FYBA 4JN9A 1RW1A 4U2SA 4EQSA 3ALJA 4OCGA 2OADA 4K7NA 3CNPA 3EF6A 2YWNA 3UTFA 3TKQA 1XVQA 3L1RA 4EXJA 3MSZA 1X5CA 4KX6A 3F8PA 1OJAA 4C74A 1CBOA 2VRMA 2MMOA 2PVOC 4J31A 5ECHB 1B9XC 4Y4LA 1YKAA 1M6IA 5JCIA 2Y6RA 4KDUA 4EL1A 2HZFA 4H4RA 3O3TA 1HYUA 1QJDA 3GH6A 2JL4A 5HY5A 2HI7A 3AD9B 4B69A 1THOA 1KDGA 2J3NA 2R4VA 1PMTA 4J56E 4JBBA 4CNJA 2H76A 2H01A 3F6DA 4EMIA 2PERA 2TMDA 4FX9A 1OC3A 1O85A 3EU4A 2R45A 1PXAA 3VPTA 2C3DA 2H89A 1R5AA 2B76A 4X9NA 1G7OA 1G6YA 2IWTA 4BPYA 3LZXA 3N5OA 1ERVA 3DJGX 5KWFA 3ALMA 2YVFA 2F8FA 5DQSA 1D7LA 1FL2A 2FUG2 5IOXA 4RSLA 2PUKC 4MPFA 3VLNA 3L0HA 4ECBA 3UKHA 1LBKA 2FCHA 5A4UA 5ABRA 2QGVA 1O95A 1NHSA 4HQZA 4MABA 4DSSA 1FEBA 1YJ6A 1XW6A 3RAZA 1UVZA 4Q5RA 4MA9A 2MBSA 1VG9A 2EQ7A 3ME8A 1YKCA 2JK6A 2L4QA 1M7TA 4GDEA 3LSZA 3KCMA 2WQYA 1T1VA 2VCWA 4RQRA 1X31B 3G7YA 3Q18A 1O6JA 5B8AA 4KNDA 3TDGA 1Z5YE 4AJ8A 3NK1X 2YLTA 2AB6A 2CA8A 1M2AA 5B7CA 3KTBA 3DKSA 4AF2A 3DJEA 2V5ZA 3AE8A 5IMCA 3FIMB 2OBIA 4B1BA 1BZLA 1JHBA 2H88A 4BK3A 2GLRA 1ZCPA 1TW9A 3ZITA 4ZB9A 2H30A 4I97A 1X9MB 1QFNA 2WJUA 2QA1A 4ICYA 1SKSB 5JCWA 1GNEA 3BOAA 4NEVA 5A5KA 3FZ9A 2WPFA 4APNA 1K0DA 1GSSA 4U8IA 2R0GA 2XDOA 4DEJA 1DE1A 1TDFA 3NK2X 3RNMA 1XWCA 3NIXA 2C75A 1ERWA 1ZMAA 1V2AA 2I4AA 1FVJA 4CW9A 4MZWA 1USBA 2DIYA 4XHMA 4USQA 3CPJG 3CPHG 1KEBA 3KJYA 2Q0KA 3QMXA 3O76A 3F8DA 1A23A 1F37A 4NHWA 3PO7A 3IAM2 2AAQA 1NPXA 1E6BA 4BJZA 1YKJA 3TJFA 4JZQA 1GLQA 3RPNA 3QFAC 4WCTA 2YAUA 4HZ4A 1PX7A 4BJYA 3NTAA 3CTYA 4RI6A 2BXRA 3CSIA 3IHMA 4OO5A 2N5FA 4QQ7A 3GSTA 3GWFA 3DMLA 1BAYA 1F3AA 2VLVA 1NHYA 1A2LA 3HZ4A 2ALBA 5DCGA 3JSKA 3CIRA 5C3JA 1FB0A 3CN8A 1QGVA 5IO2A 4PURA 3PVCA 4IN0A 1Q9IA 5IMVA 4HS1A 1XW5A 3KM6A 1LV0A 4FYUA 3GNJA 3CGDA 2BS4A 3AE5A 1L9DA 3F4SA 4LL1B 4YQMA 2J23A 2XLSA 5HR0A 4B65A 4EKZA 3NRNA 11GSA 2XLUA 5KN0A 1Q4JA 4XCSA 2PMTA 4CCQA 3TRPA 1NHQA 3CSHA 5CAXA 6GSWA 4NZHA 4CRTA 3VWXA 4U8OA 3U6VA 1LJRA 2CX4A 2LEGA 2IVEA 1E1KA 4A65A 1PGTA 3QAWA 1ZK7A 2RLIA 3RHBA 2FBWA 2AR8A 1V57A 3FR6A 1O81A 1PBCA 1NG4A 4K2DA 4U2LA 4NMUA 2YM2A 17GSA 3GRTA 2Q6UA 4LMVA 2DIZA 2V3AA 3QJ4A 5JCUA 3G7JA 4IVOB 4WF5A 4X0XA 1L9CA 5GSSA 3KA7A 4Z43A 4MF6A 4A5LA 2L5OA 3CNDA 2O89A 1LQUA 1GV4A 2XFOA 4C3XA 2P5RA 5BUKA 1YEPA 1HNBA 1D5TA 3REDA 3AE9A 3FR9A 4KX4A 2DMLA 3GHAA 3QDNA 4KAEA 4D73A 3BBYA 3AE1A 3AEDA 3M1GA 2XVIA 2YANA 4MCUA 3S9FA 1GXFA 4OPCA 3W6GA 1PD21 5JCGA 1WPIA 2C0DA 2WRTA 4JRRA 3FR3A 4DSRA 4K2XA 2XFUA 3EU3A 1VG0A 1ZP0A 3UKAA 4FK1A 1ZOFA 5DQYA 1B4VA 3I6AA 1PX6A 3UAPA 3CMIA 4IJ3A 4PNGA 3ITJA 4GDPA 4UDPA 2NPXA 3DVXA 4EDZA 3KTLA 5JCLA 2VUPA 2VQ7A 3CSJA 1R5PA 1K3YA 1BYEA 1F8WA 2OE3A 3I3LA 4EQWA 2DSAA 2GR1A 4F9ZA 1AAZA 1ZZYA 1N4WA 1GT8A 3K30A 2LV3A 2R46A 2MMNA 3A2WA 2C8UA 4ADWA 2LNTA 2JZTA 4WX1A 5KXJA 2CVDA 1NHRA 5D9VA 1NAAA 1E39A 4PUAA 3H93A 4V2NA 2DJKA 3EANA 1J9BA 2C4JA 4POMA 4IJIA 4AT0A 2XLRA 1OKDA 2CT6A 2C72A 2GEWA 4H4QA 2XVEA 3GRSA 2EC4A 3NOFA 4CY6A 4B64A 1NDAA 4TR1A 1TRBA 5IOWA 2H73A 1TDOA 4Z24A 5IPYA 4KSMA 1VF4A 2VLUA 4CHSA 5LNKe 3AYJA 2YOIA 1GRFA 3F3RA 3WGXA 1TRSA 1X5EA 5FWGA 4K0NA 1YZXA 2BABA 3IHGA 1FOVA 3P8WA 2E0QA 1S3CA 1JRZA 2F51A 2KUCA 5J9CA 4XWRA 2X50A 3VQRA 1SENA 2FWEA 3AB1A 4KA0A 3HD5A 5ELGA 3CNSA 1O8WA 5FS8A 1T3BA 1SYXA 1MO9A 2QKEA 2AAWA 4POLA 4GCIA 4XS1A 2IIYA 1L0VA 4YAVA 3UTEA 3W8JA 2XVJA 4EM4A 2LS5A 3FRCA 2DJ3A 1VRQB 4FH8A 2GRTA 1UKVG 3I43A 2HSHA 5HYMA 4XS4B 5EL8A 3P4SA 5HFGA 3L4NA 1SJIA 4TM3A 2ZNMA 4V2LA 2NPBA 3EWLA 3OC4A 3HA9A 4OPLA 2O7KA 4V1Ag 3Q9TA 5CNWA 3VURA 3ME7A 1EGRA 5LV9A 1N4VA 2PPTA 1GPEA 1V58A 4UP3A 2P5QA 2YQUA 2ZUPA 5TR3A 4H4YA 4ID0A 4I8BA 2I1UA 2JZSA 4PXOA 4J2FA 2VCQA 2WFCA 3KGKA 6GSTA 6GSXA 4KH7A 3LYPA 4ZXGA 1E6EA 3FK8A 2PHHA 3V1WA 2C7GA 4O92A 5HFKA 3MDKA 1EP7A 4PX1A 2L4CA 1EOGA 1YY7A 3GUSA 1JNZA 3GMCA 4NEWA 1RQMA 2GMJA 3ICRA 1H4OA 5DAKB 1F9MA 3BNMA 3TJKA 3H8IA 1NEKA 2JU5A 4Y4NA 5BRTA 1BG5A 1V98A 3GSSA 5C00A 5IMFA 2XPEA 1BX9A 2VL2A 2FJDA 2MYGA 2M80A 3FZ4A 3NYEA 1JLVA 1NM3A 3RDWA 2GQWA 5D9XA 3FYGA 2XBIA 1AOGA 2W0HA 5ECPB 4POBA 4JEDA 2ZZCA 1C72A 3A2XA 3M3MA 2NBSA 2RM5A 1XBSA 2LJRA 4PQIA 1GERA 18GSA 1ZYQB 3UTGA 3HZLA 1EV9A 4K5RA 2JACA 3VR9A 5FMHA 5GAND 1F8RA 2V32A 3B6DA 2RGHA 4EVMA 4KUNA 1OC9A 4GF0A 4F0BA 5FT3A 4MZCA 1GRXA 1L9EA 1CJ3A 2JSZA 3NG7X 4X4JA 1TP9A 1GNWA 2JB1A 6GSUA 3K7TA 2E7PA 1M64A 2TIRA 1SD9A 5IMDA 3BI4A 1PBEA 1VF2A 5CP1A 3UKPA 4KCAA 4E0VA 1XW9A 3TKSC 3L9SA 4MJBA 1ABAA 3HDCA 3G5RA 1XWBA 5FHIA 4A79A 3GTUB 2IL3A 4H4VA 5KVIA 1UA5A 3C8EA 3D5JA 2FHEA 3E3EA 1O73A 4A6NA 4UDQA 5C04A 5BVAA 2R4JA 4ZB6A 1EEJA 3EE2A 4WXTA 5F0GA 1XANA 1CQGA 2E1MA 3Q6JA 4ZILA 4K8MA 1S3AA 4XWZA 2GH5A 4YSYA 4L8EA 1WWJA 2IMDA 5H5RA 1SK0A 4TXOB 2JB2A 3WT2A 2PU9C 2IN3A 2QCUA 19GSA 1HD2A 3EMPA 3GYIA 2WP5A 3IOSA 4J57E 1CQHA 3KZQA 5G2ZA 2EIRA 1BQ7A 2JZRA 2GQFA 1IYHA 2PN8A 2VL2C 1IUVA 4MMMA 2CULA 3OZ2A 4GTUA 3LOVA 1UC7A 2GV8A 4ZCDA 2GQKA 9GSSA 2BTOT 4RQXA 2BK4A 4P3YB 1Y6EA 1KFYA 2DJ1A 5GZZB 2WDVA 2BC1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1K0L A;  1X9S B;  2QSI A;  2I3Y A;  1VDC A;  5CYY A;  1XWK A;  5LD0 A;  1FW1 A;  1JRY A;  3EIN A;  3LFL A;  4G0L A;  1O8X A;  3C71 A;  3GFK A;  3AE4 A;  1WJK A;  3FBS A;  1ZL9 A;  2C3N A;  3GKK A;  4A6N B;  2Z5Y A;  1IUX A;  4MH3 A;  5EB4 A;  1FHE A;  3RPP A;  2WHD A;  4LII A;  2EIO A;  4ZL8 A;  1CC4 A;  4OPU A;  1IJH A;  2EQ6 A;  1W89 A;  4F2I A;  4GCM A;  1MD4 A;  2A89 A;  4U8J A;  3GKN A;  2PGT A;  2H0I A;  4RUV A;  3EVI A;  5E59 A;  3GL5 A;  3A5I A;  1ST9 A;  3F9U A;  1M9A A;  4G9H A;  1JOA A;  1VGL A;  2HE3 A;  2VCX A;  4TM0 A;  4YQU A;  2JAE A;  1X5D A;  3VRD B;  5HXI A;  2GR3 A;  1BKW A;  4DGK A;  5IMA A;  3G9B A;  3ED3 A;  2NDO A;  3COX A;  1MDI A;  2C0E A;  2G2Q A;  3AD8 B;  2KP2 A;  2HZE B;  4BK2 A;  5HR2 A;  4K8D A;  1PJ5 A;  1JZW A;  1GL8 A;  1PKZ A;  3KMO A;  1BGJ A;  1Q1R A;  3NNE A;  2B5Y A;  1PKW A;  3NYC A;  4ML6 A;  5DDL A;  5J3R A;  1K3O A;  2REM A;  1ZOV A;  3W8S A;  2C0F A;  2GQL A;  2K8V A;  3C7M A;  2YWO A;  2ES7 A;  1D4D A;  5JCN A;  1X0R A;  4TN8 A;  2BMX A;  1PRX A; 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