1EGRA

Sequence-specific 1h n.m.r. assignments and determination of the three-dimensional structure of reduced escherichia coli glutaredoxin
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYCVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN
publication title Sequence-specific 1H n.m.r. assignments and determination of the three-dimensional structure of reduced Escherichia coli glutaredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 25
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1egrA00
3H93A 1ILOA 1PL2A 1SKRB 14GSA 2PBJA 3EE2A 1XBSA 4KNDA 4ZL9A 5ECHB 5B8BA 1K0BA 2WRTA 2HE3A 4GSNA 1K0DA 4XRAA 2VLVA 4OFTA 3IR4A 5IMCA 1RQMA 4POBA 4EXJA 2HZEA 2H6ZA 1U87A 2H76A 2LUSA 5IMFA 2B6MA 1WOUA 2LS5A 4ZB8A 1ZYQB 1A23A 2CV4A 3F3RA 4K7NA 4IN0A 5J41A 5AGYA 1LU4A 4MPFA 5EL8A 1AIUA 2PU9C 1GULA 2RUEA 3MSZA 2V1MA 2B7JA 1W89A 1WMJA 4XS6A 3KM6A 1HD2A 1AQVA 1NSWA 3IK7A 3O3TA 5JCUA 2GS3A 3GYKA 4NV2A 5D9VA 3VI5A 1AUCA 2GQLA 4WF5A 4BVXA 1MDKA 3EVIA 5KN0A 2L6DA 2JACA 3GRXA 3SBCA 5F0GA 4JRRA 1TU7A 1A24A 1VF2A 4GSTA 3ISOA 3TOUA 4IHUA 1USBA 2HSHA 2LV3A 4HQZA 2YWMA 3MDKA 3JCML 3I9V2 3VWWA 1XWAA 5J3RA 1V57A 1EOHA 2EIOA 1ON4A 3N9JA 4MH2A 1O73A 2B1KA 1U6TA 2IMKA 2VLUA 3EU3A 1YF1A 4Q5NA 5DBQA 2LRTA 1A2JA 4PXOA 4RI7A 4V2MA 5IOXA 4X1UA 2GZPA 3HZ4A 1WWJA 3DIEA 3LGCA 1TOFA 1O85A 4WEYA 3HJMA 2GZZA 3MWHA 2FLSA 4K7OA 10GSA 1T00A 3LXTA 2VL2C 4ULXA 2YOIA 1UN2A 1ML6A 4EDZA 1MD3A 4MZCA 4IP1A 3G7IA 2YJHA 2H73A 2N5AA 2DLXA 3QAVA 4XS4B 4CHSA 1XWKA 4F0BA 3G9BA 2J9HA 1X9WB 2A2RA 1BQ7A 1SYRA 1XW5A 2H01A 5ELAA 3W6GA 2C3NA 2HLSA 2DIZA 4KCEA 1BG5A 2G2QA 2GDRA 3GX8A 3CTFA 1J0FA 5IMAA 3F8UA 1JZDA 4NPBA 4GCIA 1JLVA 3HHVA 1ZOFA 1JLWA 1K0AA 1X5DA 5IMVA 1PKZA 3SWLA 4MJAA 1VRSD 3KJYA 1FG4A 1GWCA 5HFIA 3LYPA 1XPVA 4JE1A 3HY2A 3KH9A 3ME8A 1JZWA 3FR3A 3DRNA 1K0MA 2VL2A 1XIYA 2CA8A 4DSSB 4HI7A 4IQ1A 2B1LA 1UA5A 5ECMB 4OD7A 3ZIVA 1DBYA 1Z6NA 2KP1A 4MF5A 2VCWA 3QAWA 1Y6EA 3WT1A 2LRCA 2OACA 2I81A 1R4WA 3I6AA 1M2AA 4YQMA 1J08A 2IL3A 5H5SA 3P2AA 2HYXA 2CVKA 2BMXA 3NIVA 1SK2A 3IE3A 4KA0A 1G6WA 1I9DA 2YWIA 4KX4A 2O89A 1Z7RA 3VFIA 1THXA 1PMTA 5G5FA 1R26A 1YF0A 4XRDA 4KGIA 4YAPA 2OE1A 5DALB 3KIJA 3TJBA 1EGRA 3IXRA 18GSA 1A2LA 1H4OA 1FW1A 2YCDA 1BAYA 2HFDA 5D8IA 2FA4A 5IIZA 4K2DA 3TDGA 5F8BA 1M99A 4N10A 4EF0A 1T3BA 4E8EA 4TXOB 4NHWA 2JU5A 5HR2A 2YNXA 3ME7A 5CRWA 2B5XA 1LJRA 1Z7PA 3HYPA 5G1LA 4POMA 3HJOA 1DUGA 3ZZXA 4MLYA 1EEJA 6GSVA 3PH9A 5AN1A 1FHEA 2WFCA 3A5WA 1SU9A 3LG6A 3KXOA 1Z3EA 1WP0A 1O7UA 2ZCTA 3H79A 4GLTA 4RI6A 4HU7A 2YANA 4TR1B 4JZQA 3GL5A 2JZRA 4L5LA 5HFKA 2YZHA 3TJGA 2R2JA 4HJ2A 2IFQA 2P5RA 3EINA 3QAGA 4FO5A 3R2QA 4EO3A 5HR3A 17GSA 4KDYA 3QDNA 8GSSA 2HRNA 4QL9A 4ACSA 5KEJA 4HS1A 2CT6A 2NPBA 4HZ2A 4I6XA 2X8CA 2XPDA 4KSMA 1XWCA 2R3XA 1V2AA 3HD5A 1WJKA 3LQ7A 1AQWA 2C80A 1BEDA 3EC3A 2VL3A 3CRTA 1SL0B 1TW9A 1ZCPA 3RAZA 4XS1A 1BX9A 2OE3A 4HEA2 3D4MA 2VOCA 4X0XA 1OKTA 2MMAA 3CRUA 1GTUA 5F07A 2F3MA 4EC0A 3FY7A 4K0NA 1TI1A 3GH6A 1OC9A 1M0UA 4K9ZA 2DIYA 1GSUA 5A5KA 4QQ7A 1ZL9A 2C8UA 2WS2A 3F9UA 4OWYA 3DVXA 1AW9A 5GSSA 5EVOA 3UIWA 2F8AA 2ON7A 1TK5B 3PINA 3VWUA 4XCSA 2IFQB 4LL1B 1N2AA 2VCZA 2PUKC 5J9BA 2LQQA 2M72A 5GZZB 2MBSA 2AAWA 1X5CA 5J5NA 5C00A 2VAFA 1FB6A 2NTOA 3EURA 4MMMA 2H8LA 1GSYA 12GSA 5LD0A 4PGTA 1HNCA 3W8SA 2H70A 3WT2A 1JZOA 1QK8A 4N11A 3F4TA 2IIYA 4PNFA 1FVJA 2CZ3A 11GSA 2MMOA 1G6YA 3GTUA 1ERTA 4JBBA 5IPHA 1GSSA 1T1VA 4OFMA 4BWQA 2VIMA 1R5AA 1PGTA 1OC8A 3RHCA 4J2FA 5F06A 3D22A 2DC5A 3KCMA 2B5YA 4ECCA 2P5QA 3HKRA 2V2GA 2LSTA 5ID2A 4L5OA 3KZQA 5B6NA 2C0FA 3TKSC 1SKSB 4GQCA 4MF7A 3FZAA 4EKZA 5CO3A 1E6BA 2AYTA 3GFKA 3IC4A 3LFLA 3L9SA 3RPNA 2I4AA 1XOBA 1FAAA 1ST9A 3TB2A 2ES7A 1HYUA 5H5QA 3VURA 2CAIA 1NM3A 2FNOA 4JU5A 3GL3A 4ECJA 2O87A 4I97A 4MK3A 1ZZYA 3ZVJA 1T4YA 2ALBA 3DEXA 5A4WA 5AISA 3KP8A 2XHFA 2IN3A 1VF4A 5A4UA 1ERUA 4NXIA 2LJKA 2P0GA 3D21A 4WR4A 3L4NA 3A2XA 1OE7A 1TK0B 4BL7A 1B4QA 1DSBA 5LCZA 3GURA 4MPGA 1B48A 4V1Ag 1SD8A 3FW2A 2FCHA 4TVEA 4MCUA 3UBLA 2DMLA 2C0DA 1XW9A 2R5GA 3KMNA 4QL7A 2L6CA 1ACVA 2GSSA 2MMNA 4D73A 4LL4B 1U3IA 1QMVA 2K8SA 4TKYA 5CAXA 5B6MA 4PUFC 1SENA 4ID0A 4MH3A 1YY7A 1SD9A 4ZL7A 2A2SA 3TGZA 2H1GA 4F9ZA 3TKSA 4RQRA 1RK4A 1KBNA 2CVDA 2GQKA 4KDXA 1PL1A 1AC1A 2B3SA 2HZEB 2CAQA 2P31A 1AAZA 1S3CA 1GNWA 2C1YA 2WB9A 2H66A 1PD21 4BVYA 4X43A 1A0RP 5LNKe 5D96A 4OCEA 3FK8A 2AUVA 2YWNA 5AIVA 6GSWA 3TCOA 2GSQA 3QOUA 2CZ2A 4KE3A 2LKUA 3O6TA 3VI7A 4POKA 3Q18A 1XVQA 3EU4A 1F37A 3KEBA 3ZYWA 2XPEA 2WJUA 5DAKA 4Q5FA 2VCQA 4IJIA 1TRUA 4O5RA 1GLQA 2E0QA 1EWXA 1GTAA 3TKQA 4MDCA 5D73A 3IAM2 2ZNMA 1X9SB 2X8GA 1XWBA 3QPMA 6GSUA 3GKNA 3A3TA 2VCXA 3I43A 16GSA 2R4VA 3GA4A 6GSXA 1Z5YE 4ZL8A 1IYIA 5JWQB 2WULA 3ZVJD 4WETA 5FT3A 5EPFA 3GH9A 4LLRA 3HCZA 3TUEA 1TK8B 4ILFA 3D6IA 2C0EA 4K0GA 5L71A 3DYRA 2GT6A 2MMZA 1TRSA 1T4ZA 2TRXA 3HDCA 1KNGA 4I5QA 2FWFA 5IMDA 1GRXA 2TIRA 1I5GA 3FR9A 2XBQA 3M3MA 3WYWA 2AB6A 1OE8A 3CMIA 4HDEA 3QFBC 4MP4A 1MTCA 3L78A 5E4WA 4MJEA 5HQPA 3C1RA 3IHQA 1UC7A 3G7JA 2CQ9A 3GV1A 2A4VA 2H0IA 1NHOA 5G1KA 3F3QA 1M7TA 2H30A 1SK0A 3UOMA 3TJFA 3D5JA 3QMXA 4KDUA 4J56E 5ABRA 2CVBA 2WCIA 4F82A 4MA9A 1UVZA 4Z7XA 4KH7A 4G10A 1GP1A 3QR6A 4IKHA 3P90A 1F9MA 19GSA 1SJZA 3C71A 2MYGA 2PPTA 4HJMA 3UVTA 3QFAC 3E9JB 2GLRA 5IMZA 1K3YA 4OFNA 5D9XA 4AJ8A 1EP7A 2VD1A 3GNJA 3UVHA 3C73A 1V40A 1TRVA 1XVWA 1EV9A 2H0HA 3DKSA 3TKSE 2IMFA 5ECQB 1FB0A 3WGDA 4K1FA 2LTKA 5DVBA 5DQSA 2RIIA 4ZBDA 3UJ1A 2BJXA 5ECOB 2K6VA 4IVFA 3ZFBA 2N5FA 4IW9A 2WZ9A 3OR5A 4ECIA 4CW9A 5J4UA 1M9AA 4JR4A 3LWAA 2FD3A 3I69A 5H5RA 5INYA 1PSQA 2YV7A 3BCKA 5HFGA 4LMWA 2EC4A 3O76A 2LJAA 3CSHA 3WGXA 3J7Yk 3Q6OA 4O32A 5JWOB 2FUG2 2ON5A 4ZB6A 4L8EA 3TRXA 1MD4A 4DEJA 1A8YA 1SL1B 4ML1A 3VPTA 2DJKA 1GH2A 4ZB9A 2DBCA 1FVKA 1Q98A 1O8WA 3ZREA 3DMLA 5ECKB 4ML6A 3RHBA 3FRCA 2GZYA 2OE0A 1QQ2A 2VL9A 4EL1A 2EIQA 2M80A 1FO5A 2DJ1A 3GIXA 4EVMA 4BPYA 2VM1A 1GLPA 3HVXA 1DE2A 4O92A 1GSQA 4KW6A 3F6DA 1N8JA 13GSA 1K0NA 5DJMA 1DE1A 2DJ0A 1PX6A 2C0GA 4K7IA 2LQOA 4JEDA 1PQNA 4L0WA 5DCHA 2TRCP 3KTBA 1V9WA 3M1GA 1QXHA 2Z9SA 3TKRA 4POLA 3LXZA 4FIWA 2LEGA 4AJ6A 3FZ4A 2H71A 4PX1A 3GHAA 1GUMA 5JCGA 4LA1A 3ZFLA 3M9KA 3ZMLA 4F2IA 4KUNA 1G7EA 4KB3A 5F05A 4WXTA 3LJRA 7GSSA 3ZL5A 3UARA 1VF1A 4YQUA 1KTEA 3GUSA 5E59A 4ZBBA 1XWGA 2N5BA 1RW1A 2IJYA 1ZGNA 1TRWA 3HA9A 3BBYA 3F4RA 4FH8A 1SJ6A 2IPAA 1B4PA 3GKMA 3C1SA 4P3YB 3GN3A 3IK9A 1YQ1A 4TR0A 1HQOA 2L4QA 1S3DA 2OADA 4N0VA 2FWEA 2L59A 3TOTA 2VUPA 3VWXA 2I1UA 2HZFA 2E2GA 2GSRA 2GSTA 1Z9HA 5ECIB 1B9YC 2L57A 1B8XA 2ZUPA 3TRQA 3HVVA 3Q19A 2H1BA 3LYKA 5GAND 2OBIA 1GSEA 1YEXA 6GSTA 3E3EA 2PVOC 1M2BA 3F0IA 3GKXA 5JWRB 4L0UA 2H19A 2HSYA 1QUWA 5A4VA 3CYNA 2V32A 1OC9B 4OCFA 3UAPA 4TN8A 2PERA 1VGLA 2QSIA 1GTIA 1H75A 4K8MA 4WF4A 2C3QA 4FYCA 5DQYA 2GT5A 3CSIA 3IBHA 5COHA 4PNGA 2VD0A 5CRDA 2DJJA 3ERFA 4PURA 4RUVA 2C4JA 5IO0A 3H4KA 1TTZA 5DCGA 3FEUA 5C04A 4N30A 4TW5A 4I2UA 3DVWA 2V41A 4HUAA 1XFLA 5IO2A 2L5LA 2V6KA 4TOPA 3A2VA 2E2MA 2MBTA 4EUYA 4Q5RA 1ABAA 2VO4A 3S9FA 3M0FA 2XC2A 4IELA 4XHMA 3U6VA 2EIRA 3DWVA 1YKAA 3HJPA 5ECNB 3GTUB 1XW6A 2BTOT 3L9UA 2X99A 22GSA 3G7YA 2NVLA 5EY6A 4V2LA 1B9XC 1EZKA 4O7HA 3IV4A 5IQYA 4ZBAA 2K8VA 1F6MC 4K6XA 4BWSA 1OAZA 2AJQB 3WGEA 4ECBA 2HRFA 4IQAA 4GSSA 4WR5A 4XTSA 2AHEA 2IMIA 2MZCA 5ID2B 3ERWA 4WKWA 3CXGA 1QGVA 3UL3A 3KP9A 3H1NA 3V1WA 5CREA 2RLIA 1V98A 2F8FA 2YZUA 5D9TA 3L9VA 2OKAA 5AIXA 2DJ2A 2LNTA 2H6YA 4CDOA 4E8HA 4TR4A 1K0OA 4XIHA 2VCTA 3ZLPA 2HT9A 4FYBA 1X9MB 3ZMKA 3VK9A 1GSDA 2JZSA 2KP2A 1EEMA 2DJ3A 3ZITA 1SYXA 4I2TA 2NDOA 4ISDA 3US3A 3WD6A 2XBIA 1Z6MA 1TP9A 5ECSA 2K18A 2WGRA 1BJXA 3ZIJA 1X5EA 4KCAA 5IPGA 2JSZA 3DD3A 5KN1A 1GTBA 5JCWA 4IJ3A 2KUCA 2FHEA 2VM2A 3U5RE 3K8NA 1ZYEA 5ELGA 3A2WA 4NMUA 3VPQA 2H72A 3FHKA 3W8JA 4XS4A 2RM6A 1GUHA 1A0FA 1XXUA 1K3LA 1THOA 1OC3A 3IOSA 1SKWB 3NOFA 4GWRA 3D4TA 1YJ6A 1A8LA 4D73B 2H0GA 2RUFA 1YZXA 4V1Ap 5CP1A 2L4CA 2DSAA 5DJLA 1V58A 3NZNA 1R5PA 2X64A 2V6OA 3HVSA 4PQ1A 4HU9A 3GX0A 1EP8A 1JZRA 2NBSA 3F6FA 2PGTA 2E7PA 2QKEA 1TI3A 1PKWA 3Q74A 5ECPB 4G9HA 2KOKA 2REMA 1XZOA 4PQHA 3APQA 3LEFA 1U88A 4MJBA 4F03A 2QGVA 5B8AA 1PN9A 2F9SA 5CRHA 1HNBA 4MJCA 1FOVA 2YV9A 4PUAA 2I3YA 4GF0A 2LRNA 4ZIJA 3F4SA 2O8VB 3F63A 1T8EB 1KEBA 3H8QA 4DSSA 3BD2A 3GMFA 2IWTA 3BOAA 3CTGA 1OYJA 2PVQA 4JR6A 5DAKB 1Y25A 4YH2A 1CQHA 4EE0A 1TKDB 1G7OA 2YJ7A 5HR0A 1ERVA 5GAPD 5IOWA 1WIKA 2HI7A 3IA1A 3TJKA 3FZ9A 2YP6A 2H1AA 5CRGA 5G2ZA 2DMMA 5ECRB 3GKKA 3AY8A 4NV5A 1EGOA 2GTUA 2YN1A 1NW2A 4HQSA 5DALA 3EMXA 2FWHA 2JADA 4IBPA 1TU8A 1XCCA 2YPMA 2RM5A 1M2DA 3M8NA 2K9FA 4WBJA 3KD0A 2PWJA 5B7CA 1MDIA 1OVNA 4RQXA 1BYEA 1Q4JA 1XOAA 3FYGA 4TXOA 4MZBA 5G31A 4YQVA 4G19A 2X8HA 1EV4A 2FA8A 4J57E 2KHPA 3E0UA 3IPZA 5FHIA 2PN8A 4GQFA 4GTUA 2LNSA 2GVPA 1WPIA 4FYUA 4MABA 2IMDA 3KTLA 3UBKA 3VLNA 1CQGA 1LBKA 3HXSA 3LORA 5ECLB 3LSZA 4TR1A 1C72A 3UMAA 1O81A 4TRXA 5FWGA 3ZTLA 3ERGA 2VCVA 2O85A 4OMVA 6GSYA 1W4VA 5IM9A 1PRXA 1SK1A 4V2NA 1TJDA 1G0TA 1MDJA 2OBKA 3C8EA 1HNAA 5DDLA 3M9JA 4AGSA 4KAEA 3KGKA 2JSYA 4DSQA 2C3TA 3MAKA 3UEMA 1TDIA 20GSA 2H75A 2H6XA 3FZ5A 3PGTA 4EDYA 4AJ7A 4BA7A 2OA7A 1M9BA 3IAS2 1GSFA 1JFUA 3EMPA 4NWYA 3DXBA 3GSSA 3MNGA 3QCPA 3IRAA 1S3AA 1SJIA 1O8XA 3EYTA 5CNWA 5CYYA 4IGJA 4I8BA 4N0ZA 5GSTA 4G2EA 1GUKA 2J23A 1PX7A 1JHBA 4IS0A 3RPPA 3FR6A 1R7HA 3N5OA 1WE0A 2FY6A 1F2EA 3D0ZA 1URMA 2OJLA 3P8WA 1SL2B 4WBRD 1YKCA 3RBTA 2WDUA 3IDVA 4OO5A 2H74A 1QFNA 3CSJA 4GXZA 3J7Yb 3RDWA 2R6KA 5KN2A 1IYHA 1WRYA 1VF3A 1YDKA 3FKFA 4MZWA 2HXKA 2D2ZA 1TXXA 1NHYA 4Q5QA 2GQMA 1U3AA 1X0RA 1PA3A 4F0CA 4TR3A 4AF2A 2IMEA 4LMVA 2CX4A 5ENUA 1AQXA 9GSSA 2JL4A 2PMTA 2I9HA 3APOA 2L5OA 4H86A 1E2YA 3TRPA 2YWOA 3DGQA 2AV4A 4IP6A 3EWLA 3GSTA 1K3OA 3BJ5A 1T7PB 4KSOA 3C7MA 4PQIA 3CBUA 4NAXA 4GRFA 3ED3A 2KLXA 3P7XA 4MF6A 5G30A 1GNEA 5HR1A 2B5EA 2H1DA 2QC7A 1A2MA 4HZ4A 2CX3A 2M46A 3QD9A 4DVCA 3APSA 3VWVA 2HNLA 5G5EA 6GSSA 1ERWA 1O6JA 2F51A 1J9BA 1F3AA 3TKPA 3KH7A 5KN3A 3KMOA 3PR8A 4NHZA 1K0CA 4ZILA 3ZRDA 3BCIA 2O7KA 5D93A 4OO4A 1OKDA 2JZTA 4HOJA 1GL8A 2VLTA 2GGTA 3HZ8A 3L0HA 1F3BA 5D9WA 2B7KA 2FGXA 1YEPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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