1G7EA

Nmr structure of n-domain of erp29 protein
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
LHTKGALPLDTVTFYKVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKESYPVFYLFRDGDFENPVPYSGAVKVGAIQRWLKGQGVYLGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords ENDOPLASMIC RETICULUM PROTEIN ERP29
publication title Thioredoxin fold as homodimerization module in the putative chaperone ERp29: NMR structures of the domains and experimental model of the 51 kDa dimer.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 38
structure length 122
sequence length 122
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-11-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g7eA00
3GTUB 1GSEA 3CSIA 1S3AA 4ISDA 5IO2A 3RHBA 5DDLA 5CO3A 2PUKC 4OO5A 2PWJA 3CSJA 2WFCA 2HYXA 2F8AA 5EVOA 3EURA 1GTUA 2PVOC 4HZ4A 2FD3A 3GRXA 1G7EA 4P3YB 5KN3A 1OE7A 1FG4A 5CRWA 1YEPA 1J0FA 2GTUA 4WF5A 3ZITA 3TKSE 2YOIA 4NAXA 7GSSA 3LJRA 17GSA 1SENA 2V6OA 2VD1A 3SWLA 4ECCA 4MPGA 4EUYA 1EV4A 2HFDA 4GWRA 1RQMA 3HD5A 2PMTA 2CA8A 4Q5QA 1FB6A 3QCPA 1V2AA 3TKRA 2GQKA 2M46A 2JADA 2OBIA 2PGTA 3NZNA 2O87A 4ECBA 4AJ6A 1GSUA 2DC5A 3HZ8A 3O76A 2K9FA 1MDIA 4RI6A 5J4UA 1ERVA 2C0DA 3GA4A 3TOTA 4Q5RA 1ZL9A 1OKTA 5D93A 3RHCA 4XS1A 5ECIB 1B48A 1U6TA 1QUWA 2IJYA 2WS2A 3KD0A 2VL2A 1E2YA 2GQMA 4EKZA 4EDZA 3TRQA 3GKXA 1KBNA 5E59A 4O92A 14GSA 3APOA 1EWXA 1SKSB 3KJYA 3J7Yk 3KP9A 5G1LA 2HZEB 2H6YA 1WOUA 1W4VA 2B3SA 3GSTA 4WR4A 4I2UA 5F06A 3DGQA 3GNJA 2C3TA 1T7PB 3UVTA 1YEXA 4IP1A 2DJ3A 2VCQA 2F9SA 4KDUA 3ZIJA 2RUFA 3NIVA 3DXBA 3VPQA 1MD4A 3UOMA 2OACA 5IMZA 4BWQA 1EZKA 1GH2A 3W8JA 1TP9A 3GH9A 4KSOA 4F0CA 1QQ2A 1OVNA 1PGTA 4CHSA 3IK9A 2P5RA 2X8CA 4TW5A 2QC7A 4K7OA 4K6XA 1Y25A 4IELA 3TJFA 3TCOA 1UA5A 3IR4A 2L6DA 2IMKA 3LXTA 4K8MA 1YKAA 2IFQA 2YWIA 5G2ZA 5ELGA 1THXA 2VCVA 1SK0A 1MD3A 1F37A 3KIJA 4GF0A 3FR3A 4OFNA 1DE2A 3I9V2 2FUG2 2JSZA 4YQUA 3IE3A 3RAZA 2QSIA 3TGZA 1NSWA 5A4WA 1GWCA 4AJ7A 3DKSA 2YZHA 4O7HA 3UVHA 3QOUA 1X9SB 5D96A 5GAND 1NHOA 1JLVA 2DMMA 2LJKA 1SYRA 2TRCP 2MMZA 3ZTLA 2K8SA 1G6YA 4MF5A 1MEKA 2GSSA 2LEGA 3I43A 1TRSA 4NPBA 2FWEA 2LJAA 5DBQA 4AJ8A 2H76A 5LNKe 2X99A 3RBTA 4L0UA 2DJKA 1S3DA 1GLPA 2VCWA 1BAYA 2WZ9A 5IMVA 3QPMA 1TRUA 4V2MA 1DE1A 3U6VA 2VLVA 1VF2A 12GSA 4BPYA 3ME8A 1YZXA 1F2EA 1Q4JA 2VIMA 2XC2A 2YP6A 2H72A 3I69A 5C04A 4MF6A 2G2QA 3IA1A 2AV4A 2LS5A 1A23A 3ISOA 5HFKA 5KN2A 4XRDA 5ECQB 4MH2A 1A0RP 4ML1A 1K0NA 3QR6A 5DJLA 5ECNB 2LQQA 3C7MA 2LRCA 3F8UA 3RDWA 2FWFA 3KM6A 4TRXA 3FKFA 3GSSA 1JZDA 3EVIA 4J2FA 1SU9A 3R2QA 4MJEA 4X0XA 4N0ZA 1AQWA 1RW1A 1B4PA 4JRRA 1GL8A 1USBA 2GLRA 2HXKA 3G7YA 1SL1B 4MABA 2CVBA 1EEJA 4AGSA 1M99A 3EU3A 5AIVA 3TJBA 5H5RA 1M2AA 5ELAA 2JU5A 1HYUA 3DVXA 5IO0A 1FOVA 3DEXA 3EU4A 1PKWA 1X9WB 1RK4A 2VAFA 2H1BA 4BVXA 5A4VA 3ZLPA 3Q74A 5ECOB 1PKZA 1SL0B 1EOHA 2KOKA 4O32A 4GCIA 5DJMA 3WD6A 3AY8A 3F9UA 3I6AA 4MCUA 3HHVA 4JR4A 4PUAA 3CRTA 4CW9A 1JLWA 1U3AA 5DCHA 2BMXA 1AQVA 1LBKA 3E9JB 3ZZXA 4CDOA 5J9CA 1GP1A 5JCWA 2OADA 3GN3A 5D9XA 3KMNA 2AYTA 1T3BA 1E6BA 2A4VA 2N5AA 2P31A 5GSSA 2OE1A 4JE1A 1GUMA 4HJMA 2C3QA 2FGXA 4IQAA 2PN8A 4G9HA 2IPAA 2V41A 5KN1A 3LG6A 3VURA 2VL2C 4KAEA 3HA9A 1TI3A 1EOGA 2RUEA 4GSTA 3D6IA 3E0UA 2BJXA 4ZILA 2L5OA 3PGTA 4XHMA 5H5SA 4WR5A 4NXIA 3BBYA 3HZ4A 1OAZA 5DQYA 3IXRA 2ZUPA 4PGTA 2XHFA 1HNBA 3L78A 2VUPA 5J41A 2HE3A 5KN0A 1DUGA 2DJ2A 3DMLA 2B7JA 2V6KA 3GV1A 4WBJA 5D8IA 3APSA 5LD0A 1TJDA 4ILFA 2X8GA 4F2IA 4NHWA 4BVYA 4ZIJA 2M80A 18GSA 2FHEA 3VFIA 4K2DA 4Q5NA 2VO4A 4PNGA 4TXOA 5D9WA 5HR0A 2LUSA 3GX8A 4ZXGA 3Q18A 4V1Ag 1FVKA 1GSFA 2GSRA 5DCGA 1AC1A 1XW6A 3D0ZA 2JL4A 2K8VA 3KZQA 4OCFA 2VCZA 3L0HA 4IW9A 4PNFA 3GL5A 2YJ7A 1SJ6A 4MF7A 5INYA 4FYCA 3ERWA 2L5LA 1TW9A 3KCMA 2FY6A 4TXVA 4GSSA 3BJ5A 2KP1A 5JWRB 3FK8A 1PD21 2CZ2A 1BYEA 2VL9A 3UBLA 1O81A 4KB3A 1F9MA 2VLTA 4TOPA 5CRGA 4IQ1A 1WIKA 2IFQB 2VM2A 3EINA 4X43A 3H1NA 2H66A 4FYUA 6GSWA 1BG5A 4Q5FA 2C0EA 4J57E 3P8WA 2ZNMA 3LSZA 1YF1A 5GSTA 1LJRA 1B9XC 1BX9A 3HJOA 3HVXA 4L5OA 3TB2A 19GSA 3FY7A 3IHQA 2MMOA 2HLSA 3VWWA 1TU7A 3FHKA 1XBSA 2QGVA 2GZZA 2I4AA 3SBCA 1ML6A 4KH7A 1H4OA 2F51A 2DIYA 3ZMLA 2ZCTA 3HXSA 4H86A 1ZGNA 1GSDA 4HDEA 3H4KA 5IIZA 2WJUA 4F03A 1W89A 2HSYA 4BA7A 3FEUA 1V57A 3QMXA 2MYGA 1X5CA 2YPMA 2DMLA 5DVBA 1XOAA 3IAS2 1FAAA 1K0MA 2F8FA 2WRTA 3E3EA 2GSTA 2F3MA 2N5BA 3ZYWA 4JBBA 2H8LA 2DJ1A 4EL1A 3LGCA 4OCEA 4XCSA 3KEBA 2GS3A 1PSQA 3HJPA 1V58A 2C4JA 4ZL7A 5AN1A 2PERA 1EGOA 4OFMA 3HKRA 1T4YA 1V9WA 4ZBDA 3NOFA 4G2EA 3G7IA 4TVEA 1YQ1A 3C8EA 4TKYA 4HEA2 1Z7PA 3GFKA 5DAKA 3ERFA 3EC3A 2KLXA 3ZREA 3A3TA 3GUSA 3TJGA 2O8VB 4L0WA 3W6GA 1TRWA 1XW9A 4HUAA 4MZBA 3WT1A 1AXDA 2L4CA 4IN0A 2B1LA 2XBQA 5HFIA 4YQMA 1BEDA 3D5JA 2AAWA 2CVKA 2J23A 5LCZA 1SD8A 4IVFA 1YF0A 2NTOA 4HJ2A 4K0GA 1MDKA 1C72A 1WJKA 3MDKA 3BCIA 2H1AA 4GLTA 4OD7A 1ERTA 1OE8A 3KMOA 4RQXA 4PURA 1IYHA 4TR0A 1XWCA 3GHAA 3KTLA 2IIYA 2OA7A 2DIZA 2YWMA 3IAM2 3GKMA 5CAXA 2NVLA 4NV5A 5COHA 2K6VA 2QKEA 4G19A 16GSA 5ECSA 3QD9A 2DSAA 2E2GA 1TKDB 2H74A 5IOXA 3US3A 4YQVA 2JZRA 1XVWA 4IS0A 1XWKA 4MA9A 5CP1A 2R37A 3ZMKA 3CSHA 1K3YA 1AIUA 5A5KA 3F4RA 5JCUA 4TR4A 5GZZB 4MH3A 3TKQA 4WF4A 5HQPA 1OKDA 2YWOA 1GULA 2MMAA 1K0DA 3FZ4A 4XRAA 4KUNA 3HDCA 2YV7A 1YKCA 3GIXA 1TI1A 3P90A 1WMJA 2H6XA 1EV9A 4DSSA 2H0HA 1EP8A 4WKWA 1R5AA 2H6ZA 1QK8A 5ID2A 3LQ7A 1FW1A 4PUFC 1HD2A 4RI7A 1O73A 1ZOFA 1TK5B 3VWUA 1HQOA 1EEMA 5F05A 4ZB8A 2MBTA 3F0IA 2L57A 4I6XA 2DBCA 4I2TA 4LL4B 3D4TA 4K0NA 1CQHA 3Q6OA 3EMPA 1A2JA 1VRSD 5ECPB 3MNGA 2B5EA 5ECHB 2YV9A 3Q19A 5G5EA 2H01A 1QXHA 5ECMB 2OE3A 2ES7A 4KW6A 3KGKA 3GKKA 4HI7A 5IMDA 22GSA 2IMDA 3L9VA 1ZZYA 4KA0A 3C1RA 1PX7A 1CQGA 2IL3A 1IYIA 4TR3A 4TXOB 2GSQA 4GTUA 2D2ZA 6GSYA 1V98A 1PQNA 2H71A 3CYNA 3GH6A 2X8HA 3PINA 5B6NA 1M9AA 3DYRA 1JHBA 2GT5A 2TIRA 2O7KA 2MBSA 4IP6A 4MDCA 3MWHA 1ERUA 2I9HA 4OO4A 2FNOA 4LL1B 3VI5A 3ZRDA 4RQRA 2IMIA 1PN9A 5IOWA 5ECLB 2N5FA 1XOBA 3WYWA 4RUVA 5HR3A 3L4NA 5B8BA 5CREA 3RPNA 5IMAA 1U87A 2EIOA 5D9VA 1PX6A 1VF4A 3WGEA 1BJXA 2JZSA 3F4TA 3TKSA 1WE0A 3UEMA 2VOCA 6GSXA 3IOSA 2H1GA 1GUKA 4ZL8A 3FYGA 1ON4A 5ENUA 4F0BA 4IKHA 5D73A 4EVMA 3UARA 4JU5A 5JWOB 5E4WA 3GYKA 2C0GA 3WGXA 5FWGA 2H19A 4EO3A 2IN3A 1N8JA 2ON7A 2IWTA 4YH2A 2IMFA 5A4UA 1A2LA 3K8NA 1UN2A 1F6MC 4EXJA 3A2XA 5D9TA 1M9BA 3PH9A 4ML6A 3HYPA 1GSSA 3IDVA 1OC9A 4ULXA 4PQ1A 1QMVA 2H0IA 2HI7A 3LXZA 6GSVA 2LKUA 2HNLA 5F07A 20GSA 2TRXA 4N11A 3GKNA 3UAPA 1YDKA 1NHYA 3VWXA 1R26A 2MMNA 5IPHA 3IRAA 2H0GA 3TUEA 2BTOT 1X5EA 2CX4A 3DRNA 3TJJA 3F6DA 1PL2A 3G7JA 4XS4A 4OWYA 5IMFA 1WP0A 4POKA 5HR2A 4MP4A 4QL9A 1A24A 2V2GA 2B1KA 3H79A 4LMVA 2KP2A 4PQHA 4PXOA 8GSSA 3ED3A 3DWVA 4ACSA 2C1YA 3LEFA 4MK3A 2LJRA 2NDOA 1A8YA 2GT6A 1K0OA 2O89A 1Z6NA 2DLXA 4TR1A 4XS6A 1GRXA 3M9JA 5B6MA 5JWQB 5H5QA 2XBIA 5CYYA 3UBKA 4NMUA 4GRFA 5CRHA 3C71A 1B9YC 4K1FA 4YAPA 1OYJA 2X64A 1QGVA 1Z7RA 2R2JA 4I5QA 1YY7A 3TDGA 4QL7A 3OR5A 3QAVA 5GAPD 5ABRA 6GSTA 4K9ZA 3CBUA 1KTEA 4QQ7A 5HFGA 2CZ3A 2GDRA 4E8HA 1XVQA 1JZRA 3VI7A 1HNCA 2VL3A 5G30A 3APQA 3F3RA 5ECKB 4MJBA 2RIIA 4KCEA 1XWBA 1ABAA 4EDYA 2K18A 2E2MA 3ZVJD 2ALBA 3HVSA 4F9ZA 1I9DA 3DIEA 4BWSA 4ECIA 2VCXA 3G9BA 1EGRA 2B5XA 3LYKA 2I81A 3LYPA 2OJLA 1FVJA 1U88A 1DSBA 5DALA 4HQZA 2FA4A 4JR6A 4GSNA 2B7KA 3M3MA 2C8UA 3RPPA 2PVQA 1A8LA 1GLQA 1XCCA 5AGYA 3FZ9A 2Z9SA 1SJIA 1TTZA 2H30A 4JZQA 1ST9A 4MJCA 2AUVA 2CV4A 1NW2A 2JSYA 3M0FA 4F82A 1LU4A 2L4QA 5G31A 2KUCA 4POLA 4WEYA 2L59A 4MZWA 2R4VA 1O85A 1K3OA 5B7CA 4G10A 3FW2A 4ZBAA 5AISA 1ACVA 1MTCA 2WCIA 3EWLA 2WULA 3U5RE 1TRVA 1XW5A 1K3LA 1SJZA 4DSQA 2H1DA 1BQ7A 2CVDA 3QFBC 3KH9A 4IJIA 5J3RA 2JACA 3KH7A 2MZCA 1PMTA 1PA3A 2CAIA 2LSTA 3HJMA 5IMCA 1VF1A 1ERWA 3P2AA 4E8EA 4ZBBA 2LV3A 1B4QA 4DSSB 1SK1A 5EY6A 5ID2B 1X5DA 1F3AA 2HRFA 5F8BA 1GTIA 3M9KA 3O6TA 4IBPA 2AHEA 2OKAA 2NPBA 3ZFLA 2FWGA 2C80A 3FZ5A 1XIYA 2DJJA 3CRUA 3GMFA 4FYBA 4BL7A 1SKWB 4KNDA 2EIQA 2EIRA 1TK0B 1I5GA 1ZYEA 4IJ3A 2FLSA 4IGJA 1F3BA 3CTFA 1G0TA 2XPDA 2VCTA 1R5PA 2LRNA 2NBSA 3V1WA 3GURA 4FO5A 2YWNA 2YCDA 4WBRD 2GGTA 2CX3A 4POBA 4GXZA 2KHPA 2GQLA 5FHIA 3L9SA 1O6JA 3BCKA 3QAWA 3LWAA 1A0FA 1VGLA 1THOA 3C1SA 2HT9A 3VK9A 3TRXA 4MMMA 4ZB9A 3IV4A 1SD9A 2PU9C 3M1GA 3W8SA 1TU8A 4ECJA 9GSSA 1M2DA 3N9JA 4NHZA 3TKSC 1G7OA 2I1UA 1TOFA 2JZTA 2B5YA 2EC4A 1S3CA 4X1UA 4D73A 4HZ2A 5EL8A 4N0VA 4IHUA 4KE3A 2HRNA 3TJKA 1ZMAA 2VD0A 1AAZA 4GQCA 1SYXA 5L71A 3HVVA 1X9MB 5IQYA 4HQSA 1FB0A 1PRXA 2YJHA 1Y6EA 6GSUA 1AUCA 4KDXA 1T4ZA 3GTUA 4OMVA 10GSA 2RLIA 1GNEA 1A2MA 1JFUA 1DBYA 3WGDA 4MJAA 1AW9A 3CMIA 4XTSA 4V2NA 1U3IA 2C0FA 1TDIA 1GNWA 3CXGA 2A2SA 3MAKA 4YAVA 3TOUA 2IMEA 2FWHA 5CNWA 4DVCA 1J08A 2VM1A 3F3QA 1Z3EA 4NWYA 4TN8A 3ZIVA 1MDJA 4JEDA 4FIWA 1Z5YE 3A2WA 1JZOA 4LLRA 4MPFA 2E7PA 4WETA 3BOAA 3A2VA 3H8QA 2YZUA 1OC9B 5AIXA 1WRYA 3ERGA 5J9BA 1ZCPA 2A2RA 5JCGA 1ILOA 2P0GA 5HR1A 2YN1A 2L6CA 4XS4B 2CAQA 3ZVJA 3F63A 1R4WA 1UVZA 1XZOA 5FT3A 1PL1A 4N30A 1QFNA 1GSYA 2OBKA 1K0CA 3D21A 2LQOA 4PQIA 3LFLA 2WB9A 2HZEA 5B8AA 2FA8A 3P7XA 4TR1B 1EP7A 2ON5A 1XXUA 4EF0A 3ME7A 4J56E 3D22A 5KEJA 3TKPA 5IM9A 4FH8A 3C73A 11GSA 3VPTA 3QFAC 2FCHA 4EE0A 3IK7A 3A5WA 3J7Yb 4L5LA 3BD2A 4HS1A 2R5GA 1SL2B 3PR8A 1TXXA 2P5QA 4I8BA 2RM5A 1GUHA 1T00A 1TK8B 1OC3A 3UL3A 3UMAA 2I3YA 4V2LA 3FR6A 1J9BA 3VWVA 1Z9HA 4KDYA 2O85A 1OC8A 4XIHA 1XWGA 3FR9A 4HU7A 3DVWA 2LNSA 1KEBA 1XFLA 4LA1A 2AJQB 3F4SA 2CQ9A 4HU9A 3QAGA 2HSHA 1V40A 2OE0A 3KTBA 4DEJA 1G6WA 2GVPA 3D4MA 4ZL9A 2XPEA 3KP8A 5DALB 4L8EA 5ECRB 3ZFBA 3IBHA 1XPVA 3MSZA 3LORA 2R6KA 5G5FA 3VLNA 3QDNA 2YNXA 1Q98A 1NM3A 2LRTA 4KSMA 1GTAA 2DJ0A 1X0RA 1WWJA 1JZWA 1YJ6A 1K0AA 1N2AA 3UIWA 1UC7A 1GSQA 3FZAA 3GL3A 1O8WA 2PBJA 4I97A 3H93A 1HNAA 1KNGA 1SKRB 2V32A 1XWAA 4MLYA 3TRPA 2VLUA 2HZFA 1M7TA 2LNTA 4AF2A 2CT6A 2AB6A 3ZL5A 4N10A 2H70A 3DD3A 1H75A 3FRCA 1URMA 2WDUA 5CRDA 1WPIA 4POMA 4O5RA 2J9HA 2GZPA 4KCAA 5J5NA 1K0BA 3HCZA 6GSSA 1ZYQB 4Z7XA 3IC4A 4K7IA 3EMXA 2H75A 2R3XA 4ID0A 3JCML 2RM6A 2GZYA 5G1KA 2REMA 4V1Ap 2M72A 5F0GA 4OFTA 13GSA 2C3NA 5DAKB 2LTKA 1M2BA 2YANA 3GX0A 3IPZA 3S9FA 3O3TA 1O7UA 4GQFA 4HOJA 3EYTA 4EC0A 3CTGA 3EE2A 4KGIA 4WXTA 1SK2A 3M8NA 3N5OA 1FHEA 5DQSA 1AQXA 1R7HA 2PPTA 5IPGA 1Z6MA 2G0FA 2V1MA 4LMWA 1FO5A 1VF3A 2WGRA 3KXOA 1T1VA 5EPFA 4ZB6A 2H73A 2E0QA 4D73B 4K7NA 4PX1A 4NV2A 3HY2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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