1ILOA

Nmr structure of a thioredoxin, mth895, from the archeon methanobacterium thermoautotrophicum strain delta h.
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
77
structure length
77
Chain Sequence
MMKIQIYGTGCANCQMLEKNAREAVKELGIDAEFEKIKEMDQILEAGLTALPGLAVDGELKIMGRVASKEEIKKILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics
molecule keywords conserved hypothetical protein MtH895
publication title Identification of a novel archaebacterial thioredoxin: determination of function through structure.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 14
structure length 77
sequence length 77
ec nomenclature ec 1.8.4.8: Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin).
pdb deposition date 2001-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1iloA00
3D5JA 2C3TA 2KUCA 1GLQA 2DIZA 2RUEA 1TJDA 4OCFA 4AJ8A 4I2TA 6GSSA 4G2EA 3MDKA 2MMOA 2PVOC 1OKTA 3FRCA 4BWSA 22GSA 3J7Yk 2IMFA 3GTUB 2H73A 3EURA 4ECBA 4EXJA 2GTUA 5J9CA 3H8QA 1OE7A 20GSA 2GT6A 2VO4A 3O76A 1GUHA 1OAZA 1G7EA 2DBCA 1U6TA 5JCUA 2DJJA 1KTEA 3UVHA 3VI5A 4KSOA 3QDNA 2HNLA 3C71A 1A2LA 5CRWA 2YANA 1XW5A 1PL2A 3US3A 3VK9A 4QL7A 3DWVA 5B8BA 2RM5A 2CAIA 2ON5A 4TXOA 3TCOA 2OJLA 2GSSA 2YOIA 5CP1A 5IMDA 4E8EA 2FLSA 1QQ2A 2LRNA 1OKDA 3QAVA 3H4KA 1OC9A 3KIJA 4POKA 3TJJA 4EKZA 3QPMA 1CQGA 1GL8A 4IJ3A 1I5GA 1X5EA 1QMVA 1JZDA 1EP8A 1ACVA 5L71A 1MDKA 5ABRA 4PQIA 5B7CA 3KP8A 3VWWA 3H1NA 4GQFA 1MTCA 4PGTA 4Q5RA 2H0GA 4KGIA 3VFIA 2WJUA 2J9HA 2KHPA 2IN3A 4V2LA 2CX4A 6GSVA 1E2YA 4WBRD 18GSA 5D73A 3ZL5A 2LJRA 1PL1A 3D22A 1WOUA 2E0QA 1AAZA 4OWYA 5G5EA 4JE1A 5KN3A 3GX8A 4K8MA 4O92A 5J9BA 3QCPA 2X99A 4AJ7A 4DSSA 3FR3A 5F0GA 1ST9A 2JZTA 4EVMA 3VWXA 3IE3A 3GSSA 4MA9A 3TKRA 4MZCA 2GVPA 4LL4B 1YZXA 4NV5A 1ZCPA 5KEJA 2H1BA 1MDIA 4GXZA 1AW9A 1TK0B 1G6WA 2R2JA 2F8FA 2QKEA 3TB2A 3F3QA 2FA8A 1WRYA 4E8HA 2DJKA 2YV9A 4X43A 3U5RE 2YWIA 1OE8A 2I81A 1K0AA 3C1RA 2C80A 3LFLA 2YN1A 2EC4A 3CBUA 3ZVJD 1EWXA 1PN9A 4XTSA 2K9FA 1K3LA 1M2DA 3RPNA 1GP1A 1GSQA 1V40A 5DAKB 1XPVA 3IHQA 5AIVA 4IVFA 1GULA 1K0NA 3R2QA 5HFGA 2PN8A 5ECMB 3NIVA 1U3IA 5ECSA 1HNAA 4RQRA 2VCWA 2VM1A 1FVKA 3CRTA 5DCHA 2HT9A 2HE3A 1JZRA 4BVXA 2G2QA 4JEDA 2VCXA 1O8XA 1ILOA 4V2NA 4J57E 2CVDA 5IO0A 5G30A 5ID2A 1Z6NA 4HQZA 5IMZA 2PERA 3FZ9A 4GLTA 2YZHA 1M2BA 2CZ2A 3U6VA 1A8YA 2HXKA 4NXIA 5JCWA 5DJMA 2A2RA 1H4OA 5F07A 3HJOA 2B7KA 1YKCA 3GX0A 2VM2A 5B8AA 4JZQA 4TXOB 2LSTA 4PNFA 3UBLA 2L5LA 3EMPA 4NAXA 4KB3A 2I1UA 5IMCA 3RBTA 2GSQA 3IXRA 3VWVA 3F4TA 3GYKA 3F0IA 2YWNA 3TKPA 4JR6A 4WKWA 2CT6A 4RI7A 5JWOB 4ZXGA 2FWFA 3PGTA 4MH2A 2H8LA 4RQXA 2YNXA 1VRSD 1W89A 5DDLA 1JLWA 5KN2A 1GWCA 3G7IA 3QAWA 1YY7A 1T1VA 2B7JA 1LJRA 3Q6OA 3VLNA 3M0FA 2EIQA 5ECNB 1ZYQB 2X8GA 3KCMA 1OC8A 2C1YA 1GSEA 2LRTA 3VI7A 1AIUA 4TKYA 5IMFA 4MP4A 5AGYA 7GSSA 4MF5A 2PWJA 1DE1A 3GHAA 4O5RA 2FWGA 2KP2A 1EGRA 3G7YA 4KNDA 3UJ1A 2DJ1A 4ZB6A 2IJYA 1WIKA 1DUGA 3ZIJA 1X9MB 1NSWA 2H74A 3DMLA 3E0UA 4WR5A 4XCSA 1V9WA 1NW2A 3EE2A 1FW1A 3HDCA 5CRDA 3LQ7A 1GH2A 5HR2A 1FOVA 4CDOA 2JACA 1Y6EA 3WD6A 1F37A 3Q18A 2N5FA 1F2EA 2VL9A 3M8NA 2HSYA 4ZB8A 4KCAA 2VL3A 4HJMA 1BJXA 5HQPA 1Q4JA 4ID0A 3M9JA 4MH3A 4K0NA 3A5WA 1GUKA 3FZ5A 1TP9A 2FY6A 1B48A 1XVWA 2FGXA 5JCGA 2LNTA 4GQCA 3GSTA 5G1KA 4PUAA 4D73A 1XIYA 1FG4A 4FYBA 1GSYA 5A4VA 1YKAA 2XBIA 2PGTA 4DEJA 1PRXA 4YQVA 5LCZA 1PMTA 3LJRA 3KXOA 2NBSA 4TN8A 3ZMKA 2C0FA 3HD5A 4IELA 1GNEA 5H5RA 1K0CA 3ZITA 2I9HA 1RQMA 5ECQB 4NHWA 4ZBBA 5J5NA 5CREA 1DSBA 2E2GA 5ID2B 1YEXA 1TK8B 2G0FA 2OE0A 3EU3A 3ZREA 1Y25A 4N0ZA 1SJZA 1Z5YE 1SL1B 4FYUA 2OBKA 1GRXA 1PD21 3QFBC 1A24A 2JADA 3FKFA 5F05A 3WT1A 3DVWA 3C1SA 2PUKC 3GMFA 2J23A 4TR1B 3RHCA 3IK9A 13GSA 4X1UA 3O3TA 3QD9A 1VF3A 2VD0A 2LNSA 5B6NA 3Q19A 3UAPA 1TI1A 5CO3A 2N5BA 1GSFA 3H93A 2HRFA 2WB9A 5IIZA 5G31A 4I5QA 1HYUA 4JU5A 1TRWA 1ABAA 1W4VA 4F0BA 2DJ3A 2M72A 3MSZA 3GN3A 1WE0A 2OACA 1SL0B 4L8EA 2LRCA 2H72A 3TJKA 2B5EA 1MD4A 4FYCA 4XS6A 5DAKA 4AGSA 2R4VA 4ECCA 2H19A 1RK4A 2IFQB 1DBYA 1B4PA 4HZ2A 2YCDA 1YDKA 1J0FA 1XWCA 2O8VB 1HNCA 5H5QA 3GL5A 4BPYA 2H66A 5ECKB 2K8SA 1WPIA 19GSA 2MZCA 3J7Yb 4WBJA 4YAPA 3TGZA 2GDRA 2YP6A 3W8JA 2WCIA 2A2SA 2D2ZA 5IM9A 4Q5NA 1O6JA 2O89A 2DIYA 2B5YA 2FHEA 4QL9A 3I43A 1EOHA 4NPBA 4OO4A 2DMLA 3IR4A 4ML6A 4ISDA 4EF0A 1X5CA 4ZILA 1XW9A 3APOA 2CV4A 4F82A 4EO3A 5FT3A 4I8BA 1QK8A 4GSNA 3DD3A 2L4QA 2IMEA 1AXDA 14GSA 1B4QA 4GWRA 2YV7A 1PGTA 1Z6MA 2R37A 1BQ7A 2B1LA 3CMIA 2JZRA 1R26A 2MMAA 2P5RA 5DQYA 4HS1A 3PH9A 1B8XA 1MEKA 3HY2A 2M46A 3L78A 3CYNA 3E9JB 3N9JA 5DBQA 2DJ0A 2K6VA 4H86A 3F8UA 4TR4A 3GRXA 3TJFA 2H01A 4D73B 4F9ZA 4HEA2 5GAND 3F9UA 4PURA 1RW1A 1SL2B 3SBCA 1HNBA 2LEGA 3GV1A 5HR3A 2WULA 3BJ5A 3FR9A 2WZ9A 1LBKA 1T4YA 1N8JA 4Q5QA 2H76A 4K2DA 1NHYA 2P31A 3TJBA 5IQYA 4XIHA 6GSXA 3HVXA 4Z7XA 4JR4A 5GSSA 3LXTA 2MBSA 2XPDA 3G9BA 3I6AA 4JBBA 5CRGA 1ERUA 2GLRA 1QGVA 4WF5A 1JZOA 2HZFA 2ES7A 1J08A 1A2MA 16GSA 1KNGA 3L9UA 1NM3A 3D21A 3M1GA 2LV3A 3LWAA 3F6DA 4MJCA 4Q5FA 3CRUA 1B9YC 4K1FA 4MF6A 1ZYEA 2OE3A 2OE1A 2ZUPA 3HHVA 2C0EA 3EYTA 3QOUA 2FWEA 1SD8A 4YAVA 4KA0A 4KDXA 4DSRA 11GSA 3M3MA 1G0TA 5E4WA 3W8SA 3CXGA 1IYHA 2H1AA 2F9SA 3GFKA 1BG5A 3ERGA 2JSZA 5D8IA 3GH6A 3NOFA 1MD3A 2H30A 3H79A 4BA7A 4HI7A 1VF1A 5C00A 4OFMA 4LA1A 4IN0A 4WETA 5ECIB 1JLVA 2WDUA 5G2ZA 3HJMA 4K9ZA 1FB6A 1ON4A 4OO5A 1EP7A 2P5QA 4KH7A 5LNKe 3RDWA 3DKSA 2F3MA 4L0WA 4KUNA 2MMZA 2O87A 3UMAA 4V1Ag 2GGTA 1S3AA 2GS3A 1XWKA 5D96A 3JCML 4EDYA 4LL1B 1F3AA 3BOAA 1EGOA 1ZOFA 2TIRA 2R6KA 3VPTA 1OVNA 3CSJA 3ZZXA 1YF0A 2JL4A 1R4WA 2YPMA 2GZYA 3FHKA 5AISA 2VIMA 3TKSC 2IMIA 1ERWA 2GQKA 1TRSA 2VCTA 5D93A 4TR1A 3GUSA 3BBYA 3MNGA 1BX9A 4MZBA 2VCQA 3KZQA 3AY8A 2VUPA 1MDJA 1KEBA 3KMNA 1FB0A 3VPQA 2X64A 3ED3A 4BVYA 4MJAA 10GSA 4TR0A 9GSSA 3WGDA 1UC7A 4MPFA 2C0GA 2H6YA 2I3YA 2VAFA 1EEJA 4IQAA 1G6YA 3LGCA 2FNOA 2OADA 1O85A 1Z7RA 5G1LA 1O81A 3DVXA 3ZFLA 3CSHA 4ACSA 4PQHA 1OC3A 3W6GA 4EDZA 1LU4A 3A2VA 1J9BA 4YQUA 2IFQA 3F63A 1JHBA 3L4NA 1TK5B 3CTFA 4OFTA 3WGXA 6GSYA 4CW9A 1JZWA 2AB6A 2GZPA 4KDUA 4XRDA 2V2GA 4ULXA 4HJ2A 3SWLA 3HZ8A 4KDYA 1SKRB 2VCZA 3C7MA 4EUYA 4O7HA 5C04A 5ECRB 5ECHB 2HSHA 3GA4A 3KMOA 1JFUA 3ZLPA 4ECIA 1A2JA 1GTUA 1UA5A 4GSTA 5CRHA 4IBPA 4N30A 1I9DA 3ZMLA 3HVSA 1ERVA 4K0GA 1YJ6A 3UEMA 5EPFA 1V2AA 3V1WA 1SK1A 3EC3A 5LD0A 3D0ZA 3E3EA 2XHFA 3ZFBA 2NDOA 3UL3A 4IKHA 2IMDA 4ZBAA 3WYWA 3KGKA 3GIXA 1SK0A 1K3YA 4OD7A 3GH9A 3ERWA 4HDEA 2B6MA 4TVEA 2DJ2A 1QFNA 4BWQA 1M2AA 4HZ4A 4N11A 3QFAC 4IS0A 2RIIA 3Q74A 5HFKA 1YQ1A 3UARA 3GNJA 2NVLA 1K0BA 3KJYA 1M9BA 3ZRDA 1SD9A 5A4WA 4HU9A 5IPGA 4I97A 5HFIA 2RUFA 1WJKA 1N2AA 1SU9A 1BEDA 2TRXA 4PQ1A 1GNWA 4IQ1A 5F06A 5IMVA 1AUCA 2L6CA 3L9SA 4CHSA 1CQHA 4TOPA 5KN1A 2NPBA 2OBIA 4L5OA 2IWTA 4JRRA 3DGQA 2H71A 2EIOA 2H75A 2FCHA 3TRXA 5CAXA 4YH2A 1XW6A 2ALBA 2XBQA 5DJLA 1PA3A 1G7OA 4J2FA 4TRXA 4OMVA 3HXSA 3VURA 1OYJA 4X0XA 2I4AA 2LKUA 4N0VA 2JSYA 1USBA 1TXXA 2R5GA 4IP1A 3KH9A 4P3YB 3IPZA 4BL7A 2WRTA 4NMUA 2L4CA 2GQMA 4NV2A 3HZ4A 2PBJA 2KOKA 1A0FA 1AQXA 4MF7A 1TW9A 2VLUA 4K7NA 3HJPA 4F03A 1ML6A 4ECJA 1FAAA 1K3OA 2PMTA 2C3NA 1SJIA 1O8WA 3LSZA 3CSIA 2K8VA 3TKSA 2AAWA 2LTKA 1TU7A 2H1GA 4MZWA 4NWYA 4GTUA 1X0RA 4HOJA 2FA4A 3TRPA 2QC7A 3IOSA 1PX6A 5KN0A 3TKQA 3DRNA 1PKWA 2IPAA 3ME7A 2CVBA 4KX4A 1X9WB 5ELAA 3IDVA 2L59A 3FYGA 2LJAA 3FK8A 3ZTLA 2YJHA 1ZGNA 1A0RP 1TRUA 3IRAA 1K0DA 4MCUA 1T7PB 1XVQA 4I6XA 3IV4A 1WMJA 3APQA 2HZEA 4IW9A 3ZYWA 2XPEA 5ELGA 3HCZA 2KLXA 3D6IA 2H6ZA 2OKAA 4MPGA 2AHEA 4POMA 2MBTA 4V2MA 3GKMA 1FHEA 4LMWA 4K7IA 2L6DA 1XOAA 4GCIA 4YQMA 3FZAA 4IGJA 4MK3A 1M7TA 2HFDA 1C72A 1SYRA 1THXA 3TKSE 2X8CA 5FWGA 3IK7A 4XS4B 4L0UA 2DLXA 5IOXA 5EY6A 1VF4A 5ECLB 1HD2A 5DVBA 2RLIA 4LLRA 5G5FA 4ZL9A 1XWBA 1AQVA 5D9WA 1XCCA 3IAM2 2CAQA 1H75A 3IA1A 3QMXA 3IAS2 2HYXA 3GKNA 3RPPA 2YWMA 3KD0A 3EU4A 2JZSA 3TDGA 3N5OA 5ECOB 4I2UA 2H0HA 3A2WA 1E6BA 4F2IA 1WP0A 5D9VA 2AYTA 2P0GA 3ZIVA 3G7JA 1TRVA 5AIXA 2LJKA 4NHZA 2AUVA 1XWAA 2V41A 1XZOA 5IOWA 5JWRB 2KP1A 3P7XA 3KTBA 2IIYA 1V57A 1YEPA 5CNWA 2O85A 2V6KA 4MJEA 4G10A 2DC5A 3FR6A 4PUFC 2CZ3A 1SKWB 3CTGA 5DALA 1TKDB 2REMA 1PQNA 2FWHA 3UBKA 4MJBA 4HUAA 5ECPB 4PNGA 4O32A 6GSWA 1DE2A 5FHIA 1UVZA 2C4JA 5J4UA 2B5XA 4WEYA 2OA7A 4ML1A 1GTIA 5GZZB 1QUWA 4XRAA 3DIEA 1O73A 2LS5A 3TRQA 2VOCA 3KTLA 2GZZA 1AC1A 1UN2A 3LYPA 4PXOA 2CX3A 1FVJA 1T00A 2VL2C 1EEMA 2DMMA 2B3SA 3RAZA 1F6MC 1AQWA 3D4TA 1IYIA 1TDIA 2QSIA 1VF2A 2PPTA 2PU9C 4GSSA 4KCEA 4KSMA 2NTOA 6GSUA 1R5AA 3GKKA 2LQQA 5J41A 2EIRA 2C8UA 3TOUA 5IO2A 1PX7A 3K8NA 3QR6A 1PSQA 4QQ7A 2YZUA 4WF4A 4G9HA 4WR4A 4IP6A 5H5SA 1XOBA 3BD2A 2C0DA 2ZCTA 5D9XA 3EMXA 3APSA 3KH7A 5HR0A 5DQSA 4TW5A 1GUMA 3FZ4A 2HZEB 2ZNMA 2L57A 3EWLA 1U3AA 1K0MA 6GSTA 2O7KA 1TU8A 1SKSB 1S3CA 12GSA 1R5PA 3A3TA 1R7HA 1BYEA 3UOMA 4FO5A 1XWGA 5IPHA 3KP9A 1ERTA 3HVVA 2WGRA 2XC2A 2WS2A 3ERFA 3F6FA 1XXUA 2BTOT 3LYKA 4HU7A 1ZL9A 1EZKA 5ENUA 1TI3A 5D9TA 3P90A 1M9AA 4FIWA 1M0UA 4POLA 5F8BA 2VLVA 2F51A 3HKRA 1XFLA 3D4MA 2HI7A 1SENA 1OC9B 2YWOA 4XS1A 1HQOA 2V6OA 3M9KA 4EE0A 4DVCA 1Q98A 1U88A 5GSTA 5GAPD 3LXZA 3FY7A 4V1Ap 1SJ6A 4MLYA 3UIWA 2JU5A 4LMVA 5A5KA 1F3BA 2CVKA 1FO5A 2E2MA 3I9V2 5EL8A 4AJ6A 2TRCP 1SYXA 2F8AA 1S3DA 1QXHA 1K0OA 2HRNA 5IMAA 3S9FA 2B1KA 1NHOA 1SK2A 4HQSA 4N10A 2VCVA 4ZBDA 2ON7A 1O7UA 3TJGA 1KBNA 3PR8A 5INYA 1WWJA 2IMKA 3NZNA 4K7OA 4MABA 4ZB9A 1X5DA 2CA8A 2Z9SA 3GTUA 5COHA 2AJQB 5DALB 1GTAA 1V58A 2QGVA 3IC4A 2WFCA 4KE3A 3L9VA 4DSSB 3KM6A 3BCIA 3RHBA 4FH8A 2RM6A 3P8WA 1T4ZA 5JWQB 1X9SB 4IHUA 2M80A 3FW2A 5HR1A 4GRFA 5CYYA 3F4RA 4KAEA 2X8HA 2E7PA 3A2XA 2VLTA 3ME8A 2FD3A 3DXBA 3WT2A 2GQLA 2BJXA 1T3BA 4EC0A 4KW6A 4DSQA 1TOFA 3EVIA 1Z9HA 3P2AA 3HA9A 4RI6A 3LEFA 4EL1A 1GTBA 3BCKA 5DCGA 2R3XA 1V98A 4XS4A 4MDCA 4OFNA 1THOA 2HLSA 4L5LA 3WGEA 2DSAA 4K6XA 1EV9A 1YF1A 2GSTA 2GSRA 2VD1A 1GSDA 2GT5A 3IBHA 1URMA 1U87A 3PINA 4IJIA 2MYGA 2H1DA 2H70A 4ZIJA 1ZZYA 3L0HA 2IL3A 2H0IA 1BAYA 3C8EA 3HYPA 2CQ9A 1TTZA 3ZVJA 4PX1A 1GLPA 8GSSA 1A8LA 5A4UA 1PKZA 3F3RA 5EVOA 2MMNA 1Z7PA 4J56E 2V1MA 2H6XA 3UVTA 2N5AA 2VL2A 3TUEA 1M99A 3OR5A 3I69A 2A4VA 5J3RA 3GKXA 3F4SA 4ZL7A 4TR3A 1EV4A 3O6TA 4MMMA 2V32A 2FUG2 3C73A 3ISOA 4TXVA 4F0CA 3LG6A 2LUSA 1T8EB 2YJ7A 3EINA 2K18A 2C3QA 4XHMA 5B6MA 1VGLA 3LORA 1Z3EA 3VWUA 1ZMAA 4POBA 1EOGA 4GF0A 4WXTA 4ILFA 2BMXA 1GSSA 5AN1A 3TOTA 2AV4A 1XBSA 1A23A 3MWHA 4ZL8A 3FEUA 2LQOA 4AF2A 3DYRA 1B9XC 2L5OA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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