1JHBA

Human glutaredoxin in fully reduced form, nmr, 20 structures
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
AQEFVNCKIQPGKVVVFIKPTCPYCRRAQEILSQLPIKQGLLEFVDITATNHTNEIQDYLQQLTGARTVPRVFIGKDCIGGCSDLVSLQQSGELLTRLKQIGALQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords GLUTAREDOXIN
publication title The NMR solution structure of human glutaredoxin in the fully reduced form.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 29
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1jhbA00
1ERVA 4HZ2A 3LFLA 2CX4A 1PSQA 2L59A 4IQAA 2C4JA 4I8BA 2GZPA 2AUVA 4N10A 3GKKA 3C1RA 4GXZA 3WGXA 2PN8A 2K8VA 4EO3A 4RQXA 3MSZA 2C8UA 5J3RA 4JEDA 1QXHA 2MZCA 2V1MA 3TKSA 2AB6A 4OMVA 3DMLA 3WGDA 2XBQA 1WJKA 2HZFA 1TTZA 1M9AA 4MJEA 1F9MA 2VCQA 1A8LA 3VURA 2PUKC 1GSDA 1NHOA 1XW5A 2DMLA 5ENUA 2MMNA 5EPFA 3F9UA 4TR0A 5G1LA 4Q5RA 2O85A 3UJ1A 1X9SB 1EGOA 19GSA 3VPTA 11GSA 4N0VA 1TU7A 1KBNA 4RI6A 1A0RP 3CMIA 1GTIA 4NMUA 4AGSA 1EV4A 2C3QA 3WD6A 6GSWA 4ML1A 1FHEA 1WMJA 3IHQA 5DVBA 2H0GA 1XVQA 5J9BA 2H6YA 3IE3A 2A4VA 3HJOA 5KN1A 2K6VA 3F6FA 2HI7A 3FHKA 5DALB 2H6ZA 4TVEA 1A8YA 3QAGA 4E8HA 2VL2A 4ZXGA 4ECCA 3KEBA 2GZZA 3CSHA 3DXBA 1O8XA 1SK1A 1V2AA 5ELGA 3KP8A 3BJ5A 5G5FA 1YJ6A 4EL1A 2Z9SA 5J4UA 4BWQA 1SENA 1B9YC 1A2JA 20GSA 3IA1A 3GX8A 2BTOT 1S3DA 3CBUA 4NHWA 3KGKA 2YV9A 1LBKA 2DJ0A 8GSSA 4ZL7A 1PL1A 2WS2A 5GZZB 3G7IA 3LWAA 1J0FA 1AQWA 2QKEA 2YWMA 2O89A 1U3AA 4EXJA 3C1SA 1X9MB 3TRXA 3ZL5A 1T00A 2IMDA 1GSSA 5ID2B 1GUHA 3ME7A 1G0TA 2LUSA 4PQHA 4LA1A 1TKDB 2CQ9A 3IR4A 3FEUA 4GCIA 5IMFA 4TOPA 1PKWA 2BMXA 4KDUA 4Z7XA 2EC4A 3ISOA 4GSSA 1AUCA 3IPZA 3GMFA 2H1DA 2JSZA 4XS1A 4OD7A 2XBIA 5IO2A 3IK7A 1WRYA 4QL9A 1XIYA 1XWKA 4DSQA 3BCKA 2YWOA 4K1FA 4BA7A 2H8LA 1OKDA 1GLPA 1GSYA 1SJZA 4F0BA 5IIZA 3UBKA 1PX6A 1OC8A 3VFIA 5IM9A 3IXRA 3ZMLA 4O32A 3L4NA 3M1GA 1N8JA 4K0NA 1O8WA 1YY7A 3ZRDA 2YZHA 3LYPA 10GSA 1YZXA 5ECOB 1BX9A 3A2VA 3QFAC 4TN8A 1V40A 4TXVA 4YAPA 3OR5A 1K3YA 3KH9A 2FWFA 1SL1B 1OE8A 5ECKB 3EC3A 4NXIA 2YJ7A 2VM2A 2FUG2 2E7PA 2FD3A 3VWXA 3KH7A 3EU4A 3GKXA 1T8EB 4JBBA 5CO3A 4PQIA 2DIZA 1PX7A 4MLYA 5JWOB 1HNBA 1O7UA 3M9JA 3H8QA 3IC4A 3C71A 2OACA 4ZBDA 3G7JA 1FB0A 1WIKA 1M2AA 3LXTA 4ZL9A 3RPPA 1C72A 2IPAA 4RUVA 1EWXA 1XW9A 2BJXA 5F07A 4ISDA 2VM1A 3I43A 4QQ7A 4L0WA 1ACVA 4LLRA 5DAKB 3GV1A 3F3RA 1Z7RA 5DDLA 4POLA 3A5WA 3H4KA 2YNXA 3P8WA 4EDYA 1XBSA 3W8JA 1M7TA 2YP6A 1Z7PA 4PQ1A 3ZFBA 4H86A 5D9XA 2DMMA 2H01A 5CRDA 4MP4A 3UAPA 2TIRA 2XPEA 4WR4A 3HZ8A 1HQOA 4HJ2A 1M99A 2GSSA 1A24A 2HSYA 2F8AA 2MYGA 2FNOA 2ZCTA 3LORA 1PQNA 1GRXA 4N0ZA 2F51A 1SKWB 4IN0A 1UC7A 2DBCA 2QC7A 2JU5A 2RLIA 1QMVA 3RAZA 4PURA 2G2QA 2E2MA 5GSSA 2FWHA 4EUYA 2WULA 1RW1A 5D96A 4NV2A 1BYEA 5E4WA 22GSA 3M8NA 3FW2A 2B7JA 1JZDA 4JR4A 3EURA 3APSA 1JZRA 2KUCA 2R2JA 2LSTA 4KAEA 5CNWA 5FWGA 4O92A 4IQ1A 2WRTA 1ZMAA 2JZRA 3A3TA 1Z3EA 1F3BA 2WDUA 4G9HA 3KZQA 2YANA 3DKSA 2LV3A 6GSTA 1GUMA 2PU9C 2FY6A 1F2EA 4POMA 4BVXA 3FY7A 5HR0A 4KNDA 2I1UA 1U87A 2P5RA 3H79A 2FA4A 2M46A 1DE1A 2PERA 1W89A 2YPMA 5B7CA 2NPBA 1S3AA 2FLSA 2E0QA 5A4VA 1XPVA 1MD3A 1GTAA 3FR6A 1MD4A 2LNTA 4OCEA 1LU4A 2AV4A 2X64A 3J7Yb 2XPDA 4EE0A 3WT1A 4FH8A 5D9VA 4IS0A 1TRUA 4Q5QA 5JWRB 2LJKA 4HI7A 2VL2C 4JR6A 3TDGA 1M9BA 4LMVA 3W8SA 3FZ5A 2IMKA 2X8CA 1U3IA 1ZCPA 5J9CA 2B5EA 4MA9A 1GNWA 2A2SA 3QD9A 2C1YA 4ULXA 2VCXA 1XWGA 4J2FA 1Z9HA 1SL2B 4FO5A 2PMTA 2B1KA 3NOFA 2I9HA 2WB9A 3IAS2 4BWSA 3VI5A 2LJAA 1H75A 2JADA 3HKRA 1NW2A 4JZQA 4JU5A 4FYUA 3D4MA 2LNSA 4RQRA 3ME8A 2H76A 4YQUA 1GSQA 5IMCA 4MF7A 1EP8A 1SJIA 3CYNA 3HHVA 4ILFA 3US3A 4WF4A 1G6YA 1MTCA 2HSHA 4TXOA 2V2GA 3HA9A 3IK9A 3QFBC 4L5LA 3EVIA 5HR3A 1URMA 2JL4A 5DQSA 3EYTA 5ELAA 3QCPA 5CRHA 1K3LA 3EE2A 3APQA 3QOUA 2GT6A 4XTSA 4ZIJA 4PUAA 1KTEA 3TGZA 2C0EA 3LYKA 5ECQB 3MNGA 3ZVJD 5D93A 5B6NA 3ZFLA 2DSAA 3GIXA 3ZREA 1SKRB 1YKAA 1FW1A 1ST9A 2D2ZA 2K9FA 1OC9B 3TOUA 2NVLA 2DIYA 4MF6A 2H73A 4TXOB 1KEBA 1SJ6A 1TJDA 2MBTA 2YV7A 1OKTA 2H19A 2R6KA 1VF4A 3VWVA 3IBHA 4K0GA 5DBQA 5A4UA 1XCCA 2H72A 5KN3A 1ZYEA 4L8EA 2HYXA 1SK2A 1E6BA 3KP9A 3CXGA 1AQXA 2I3YA 1SYRA 2CA8A 3GA4A 1PKZA 1GULA 4HU9A 2IJYA 3GTUA 3V1WA 1Z5YE 3DWVA 1Z6NA 3ERWA 1SYXA 2DJKA 3E0UA 3KMNA 4KH7A 6GSUA 3ZTLA 3TB2A 3TOTA 1GLQA 4RI7A 2CAQA 2H74A 2DJ1A 1OE7A 2N5FA 1SD8A 3IDVA 1Q98A 3F0IA 1X5DA 1XXUA 1XWCA 3DIEA 1YEPA 2C0DA 2IMIA 3TRQA 2ZUPA 2IN3A 3KM6A 5ECNB 3HDCA 3F4RA 4TW5A 5H5SA 2L57A 4BPYA 4MF5A 3QDNA 3UOMA 1GUKA 2OA7A 4X1UA 2ES7A 4IP6A 1PA3A 3DVXA 1TOFA 3GSSA 4I6XA 4MZBA 1ERTA 4V1Ap 5G2ZA 3TKRA 3ZVJA 4XS6A 3D5JA 3ZIVA 4PNFA 1R7HA 3QMXA 2VCVA 1MDJA 2X99A 2KHPA 1Z6MA 2LTKA 2VL3A 3D4TA 2YN1A 4MK3A 5IMVA 5LD0A 6GSXA 1QUWA 2NBSA 2IL3A 3HZ4A 2LKUA 3Q74A 1TRVA 3Q19A 5AISA 1BJXA 5HR1A 2OBIA 1I9DA 3GHAA 2LQQA 3R2QA 2HZEA 3GUSA 3RHBA 2ON5A 3Q6OA 3HVSA 1DSBA 1DUGA 5H5QA 1EP7A 4LMWA 2FWEA 1QGVA 3P2AA 1VF1A 1V57A 3TJGA 2KP2A 2HXKA 1YQ1A 4OFNA 4OWYA 3F63A 2KP1A 2H75A 1V9WA 1ZGNA 4AJ6A 5FT3A 2WJUA 1F3AA 4NAXA 3MWHA 3VK9A 3M9KA 1R5AA 2WFCA 4GSTA 2HZEB 3VWWA 3A2XA 3GH6A 1J9BA 1VF3A 3LEFA 2GVPA 1RQMA 1EZKA 4YQMA 3TRPA 3IAM2 5B8AA 1AXDA 4V2NA 1IYIA 3FRCA 2VIMA 3H1NA 1AIUA 4K6XA 3HY2A 1PD21 6GSVA 2E2GA 3I6AA 2CZ3A 2VL9A 2DC5A 1T3BA 4MJAA 1KNGA 2ZNMA 3GRXA 2B7KA 3DVWA 4DSSA 3HVVA 3L9UA 3GURA 2GS3A 2YCDA 1K0NA 1IYHA 4F0CA 1A2LA 1ILOA 3DYRA 3EINA 2L4CA 5A5KA 1F37A 1THOA 1T1VA 4DSRA 5IMDA 4PNGA 3CTFA 2C0GA 2OKAA 4J57E 3L0HA 4K7NA 3ZITA 3GSTA 3KD0A 4WKWA 2OADA 5DJMA 2IWTA 2YJHA 3SBCA 2EIRA 5IMAA 4G10A 4HQZA 1FAAA 2RIIA 3P90A 2K18A 2J9HA 2PVQA 1XFLA 2FCHA 1U88A 3QR6A 2CAIA 1TK0B 2LQOA 1B4QA 1ZZYA 3UEMA 4AJ8A 1PL2A 4P3YB 4MH3A 5CRGA 3IOSA 1WOUA 3TKSE 3TKQA 4HUAA 1K0AA 2TRCP 3N5OA 3L9VA 1T4YA 2C0FA 4MZCA 4F82A 3UVTA 2GSQA 2O8VB 3HD5A 4KCAA 3VLNA 3FYGA 1EEMA 4DVCA 5ECIB 2M80A 3ZYWA 1S3CA 4IW9A 2B5YA 4MABA 3HVXA 1O81A 4X0XA 1XVWA 2VD0A 3TKSC 2H70A 1WE0A 2REMA 2L5OA 1R5PA 1Y6EA 3Q18A 5F0GA 4PX1A 4KDXA 3MAKA 5DJLA 2KOKA 1OC3A 3FK8A 2VD1A 2L4QA 3G9BA 18GSA 5JCUA 1M2DA 3KTLA 2GZYA 5C00A 1AW9A 2NTOA 2V41A 4ZB9A 2TRXA 3TCOA 2H1GA 2LRNA 4K7IA 5D73A 1SU9A 3F4TA 5KEJA 2C3NA 5AN1A 1O85A 3GKNA 4L0UA 4HEA2 2QGVA 2XC2A 1B48A 1K0DA 4FYBA 3GH9A 4N11A 1HYUA 3KXOA 4ZB6A 2WCIA 5LNKe 5IMZA 1JFUA 2PVOC 4MPGA 3LSZA 12GSA 4K7OA 1UN2A 1TI1A 3KCMA 3KIJA 3TJBA 2P0GA 2P31A 2LJRA 4K2DA 4WETA 4WEYA 1K0MA 2PBJA 5D9TA 4ZL8A 1PGTA 4POKA 3UARA 4MCUA 2ON7A 2H71A 3BCIA 5LCZA 1DBYA 2IFQA 4EDZA 1VGLA 5L71A 5C04A 2J23A 1TRWA 3DGQA 2OE3A 1QFNA 2QSIA 3C7MA 2DJ2A 4MJCA 2JSYA 4CDOA 1XWBA 5HFGA 1Q4JA 5HR2A 4WXTA 5ECRB 2OE1A 2M72A 2IMFA 4XHMA 1X0RA 5B8BA 4GRFA 1B4PA 2EIOA 1I5GA 4MZWA 5AIXA 1H4OA 2H1AA 1R26A 3PGTA 2I4AA 1TK8B 4AJ7A 1K0CA 4PXOA 5DQYA 2H1BA 1TK5B 1BQ7A 3HCZA 3TJJA 4KSOA 3DD3A 2OJLA 5D8IA 2IFQB 1Y25A 1X5CA 2OBKA 1VRSD 4J56E 4OO4A 4YH2A 2N5AA 3FZAA 1MEKA 4MH2A 5ABRA 4V2MA 4QL7A 4IKHA 4I5QA 1THXA 4EC0A 2HT9A 4XRDA 3I69A 2B6MA 2V32A 2WZ9A 3FKFA 1JHBA 3EMXA 4GF0A 1GH2A 3VPQA 1MDIA 2RM5A 2F3MA 2B3SA 5GSTA 3D22A 2XHFA 4G19A 2GLRA 3O3TA 9GSSA 3K8NA 5IOWA 2GSTA 2GTUA 3BD2A 2X8HA 2HFDA 1E2YA 5ECMB 4HDEA 1TP9A 2L6DA 2YZUA 4MMMA 2HRFA 4TR4A 1GSFA 3HJMA 3GN3A 1ML6A 2B5XA 1WWJA 4IBPA 3BBYA 1GL8A 2VLTA 2YWIA 2NDOA 3D0ZA 1NSWA 3LG6A 3WT2A 2VLVA 5DALA 4FYCA 16GSA 5J5NA 2VO4A 1U6TA 5HFIA 4HS1A 5EL8A 1A2MA 2LS5A 5G30A 3CRTA 5HQPA 4OFMA 2DJ3A 3U6VA 3FZ4A 3RPNA 1K3OA 3KJYA 1ABAA 17GSA 4D73A 3EWLA 3ZLPA 2CX3A 1TRSA 1T4ZA 4MJBA 3FZ9A 3BOAA 3RDWA 4EVMA 1V58A 3RHCA 2AAWA 4JRRA 3A2WA 5FHIA 5CYYA 2LRTA 1ERUA 5ECPB 2JZSA 5ID2A 2LRCA 3TJKA 3GTUB 4DEJA 2K8SA 4XCSA 3ERGA 3C8EA 3WYWA 3ZZXA 2I81A 5CREA 1SK0A 4D73B 4F9ZA 5J41A 5CRWA 3WGEA 1O73A 1T7PB 4Q5NA 1F6MC 6GSYA 3PH9A 4HZ4A 1HNCA 4O5RA 3KTBA 3UMAA 3O76A 5IPGA 3NIVA 1VF2A 5IPHA 5E59A 1FG4A 3FR3A 5GAND 4IELA 4BL7A 4XS4A 1ZOFA 4I97A 5JCGA 5COHA 3ZIJA 4ZBBA 1HD2A 5G31A 4GQFA 2KLXA 4N30A 4GLTA 3M0FA 2YWNA 4GTUA 1GTBA 5IOXA 4HQSA 3GNJA 3QPMA 5AIVA 3APOA 2CVKA 4Q5FA 2GQMA 4ACSA 3M3MA 1TU8A 3PR8A 4WBRD 1O6JA 4GSNA 1EV9A 1CQGA 5A4WA 1B8XA 5G1KA 5ECLB 2H0HA 1V98A 5EVOA 1W4VA 4OFTA 2R3XA 4IHUA 3VWUA 4XS4B 2FGXA 4IP1A 2B1LA 2VOCA 2VCTA 6GSSA 1NHYA 1XZOA 4IVFA 2JZTA 2PWJA 2N5BA 5ECHB 2EIQA 5KN2A 1SL0B 4V1Ag 2OE0A 1MDKA 3GFKA 3ERFA 2PPTA 3EMPA 1YEXA 4TR3A 2G0FA 4KE3A 3LJRA 4KA0A 4NPBA 5H5RA 4OCFA 1R4WA 3EU3A 3CRUA 2L5LA 1GWCA 3CTGA 3F3QA 2GDRA 4ZB8A 3NZNA 4AF2A 3GYKA 2R5GA 3U5RE 2IIYA 2C80A 3FR9A 4KB3A 2AHEA 4KSMA 2YOIA 1K0OA 4MDCA 1M0UA 2HRNA 2O87A 3W6GA 5DAKA 1WPIA 2CT6A 3I9V2 3GX0A 1X9WB 5CP1A 5D9WA 5F06A 4F2IA 1JLWA 3DRNA 1OVNA 1XW6A 4EKZA 5ECSA 5DCHA 1FO5A 2VCZA 4KX4A 1XOBA 2HNLA 2CVDA 4ZBAA 2R4VA 3UL3A 4WR5A 1GTUA 2V6OA 1UA5A 2H66A 4KDYA 5IQYA 5CAXA 1M2BA 5INYA 3TUEA 1EGRA 4K8MA 3HJPA 2MBSA 1K0BA 4IJ3A 5F05A 1ZYQB 1PRXA 3TJFA 3H93A 3LQ7A 4XRAA 1QQ2A 4IGJA 3RBTA 1EOHA 2FHEA 1G6WA 3HXSA 3GKMA 1UVZA 3G7YA 4IJIA 4DSSB 2RUEA 3SWLA 2MMOA 4F03A 1J08A 2FWGA 4POBA 2MMAA 3O6TA 3IRAA 1QK8A 4V2LA 5DCGA 2MMZA 3CSJA 5GAPD 3QAVA 1X5EA 3LGCA 1ERWA 2AJQB 3C73A 5JWQB 2L6CA 2GSRA 2CVBA 1RK4A 3UBLA 1GP1A 2P5QA 2HLSA 4KGIA 5G5EA 5B6MA 1TW9A 4HJMA 1JZWA 1BEDA 1G7EA 3IV4A 4GWRA 3ZMKA 1DE2A 1BAYA 1TI3A 1PMTA 3L78A 4HOJA 4K9ZA 1FVJA 4FIWA 4I2TA 5F8BA 4ECJA 5EY6A 3PINA 1GNEA 4L5OA 1LJRA 3F6DA 4BVYA 1EOGA 4NHZA 2DLXA 4PGTA 3CSIA 3QAWA 2HE3A 1GSEA 1XOAA 2C3TA 1AQVA 4NV5A 3D6IA 3N9JA 4EF0A 2GGTA 2A2RA 4HU7A 4LL4B 1SKSB 5JCWA 4TR1A 2O7KA 1YF0A 2AYTA 2H30A 5HFKA 3UIWA 1YKCA 4MPFA 2F8FA 2CV4A 1G7OA 1SD9A 2GQLA 4I2UA 1WP0A 1YF1A 1N2AA 2RUFA 3LXZA 2JACA 4ECBA 2F9SA 2X8GA 2RM6A 4E8EA 4TKYA 1YDKA 2VUPA 4ID0A 1AC1A 1FVKA 3TKPA 4WBJA 1USBA 2ALBA 1B9XC 4TRXA 3VI7A 4WF5A 4OO5A 2VLUA 4G2EA 3GL3A 1NM3A 4GQCA 2H0IA 3HYPA 4KUNA 1BG5A 4NWYA 4YAVA 13GSA 1XWAA 1GSUA 4XIHA 2GT5A 4ML6A 2GQKA 4TR1B 2VAFA 4CHSA 1ON4A 5AGYA 4X43A 4JE1A 4ZILA 1TXXA 2DJJA 2R37A 2FA8A 3L9SA 2V6KA 5KN0A 4YQVA 1TDIA 3F4SA 2IMEA 2WGRA 4KW6A 3GL5A 1OYJA 3KMOA 1CQHA 4O7HA 3UVHA 2LEGA 4ECIA 3E3EA 1JLVA 3MDKA 14GSA 2CZ2A 3AY8A 3DEXA 3ED3A 7GSSA 1ZL9A 3E9JB 3S9FA 2PGTA 4LL1B 1A0FA 3D21A 1AAZA 3J7Yk 1PN9A 2VCWA 4KCEA 1JZOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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