1SKW | Genus

Total Genus 30

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	30
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/electron transport/dna
molecule keywords	5'-D(CPGPAPAPAPAPCPGPAPCGPGPCPCPAPGPTPGP*C
publication title	Nucleotide insertion opposite a cis-syn thymine dimer by a replicative DNA polymerase from bacteriophage T7. pubmed doi rcsb
source organism	Enterobacteria phage t7
total genus	30
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1skwB00

2AV4A 2XPDA 4K0NA 4ZBDA 3HXSA 1YZXA 4WKWA 5C00A 4AJ7A 1XWBA 5CO3A 4HJ2A 3FZAA 2VCVA 3N9JA 2OADA 3IBHA 1NW2A 3IDVA 4IELA 3GL5A 1BEDA 1KEBA 3P8WA 4PUFC 5B8AA 1GTAA 2IPAA 5DCGA 2YWOA 1TKDB 3C8EA 2EIOA 3HHVA 2LJKA 3KMOA 1QMVA 1Z6MA 2HRNA 4OFNA 3VI7A 1EZKA 4IJIA 3UBLA 3IOSA 4PQIA 5KN3A 1SL2B 4EC0A 1MDKA 4KW6A 4L0UA 2VCTA 1XVWA 1G7EA 1YJ6A 5HQPA 1Z7PA 1RW1A 1QK8A 1K0BA 1URMA 1T3BA 1SJZA 4JEDA 3CMIA 1Q4JA 1S3DA 5B6MA 3A2XA 1XW9A 3DKSA 4YAPA 1YDKA 2P5RA 3F8UA 1ML6A 1FB0A 1V58A 2GSRA 1SKRB 2VLTA 3F4TA 2CAQA 2PVOC 1PN9A 2H19A 5CAXA 1GSQA 3F3QA 5ECMB 3KJYA 3TGZA 1XWKA 4PNFA 3ZTLA 2YCDA 2WZ9A 2AUVA 2C8UA 1TDIA 4LMVA 3GKXA 4EXJA 2YNXA 2YP6A 1PL1A 3HVVA 4KGIA 3DWVA 3IRAA 1VF4A 4AJ8A 2GT6A 3IHQA 1YKAA 3TKRA 4FYUA 2CVBA 1JZWA 1O8WA 5DAKA 2MYGA 3LGCA 4TR0A 2QSIA 4Q5QA 1O7UA 3AY8A 2DIYA 1NM3A 1Z5YE 4WR4A 2IMEA 1V9WA 2DBCA 2H75A 1DBYA 1OE7A 2HI7A 1PMTA 2GDRA 2FA8A 4HS1A 1C72A 3F63A 4E8HA 2OE0A 3P90A 1BG5A 3CRUA 4V1Ag 2FUG2 3GL3A 1GSFA 2GSQA 4JRRA 3R2QA 3LG6A 5DBQA 1BAYA 2HSHA 3LFLA 3PGTA 4XHMA 5IMFA 4KNDA 1LJRA 3C71A 4PQ1A 1SU9A 4ZL8A 5KEJA 4PQHA 1TW9A 2DJ2A 5G5EA 3HKRA 1SJ6A 1A24A 3GV1A 1O81A 1GTBA 3H4KA 4G19A 6GSXA 3VK9A 4KX4A 3H1NA 3HDCA 3KMNA 3RDWA 1OAZA 2DJ3A 1ERUA 3WGEA 5GZZB 1M7TA 3O6TA 4V2MA 2YJ7A 2O8VB 3ISOA 3QAVA 1BYEA 4MPFA 1F9MA 5D9TA 3KXOA 2R5GA 5IQYA 2FD3A 1YF0A 2YV7A 2HFDA 3ZMKA 1XCCA 1GLQA 3O76A 5G1KA 1EEMA 1G6WA 2PMTA 4HJMA 3RAZA 4K1FA 1M0UA 5J5NA 2D2ZA 1FVJA 2PBJA 3M1GA 3ZFLA 5A5KA 4F2IA 3HA9A 1NHYA 4DSSA 3ZMLA 5CRGA 2REMA 4PNGA 1QQ2A 3BJ5A 3FY7A 1EGRA 3IC4A 1T4YA 4K7IA 3C1SA 1Z9HA 3SBCA 5HFGA 4MH3A 1M9BA 2GSTA 3UMAA 1CQHA 2FA4A 2E7PA 4LA1A 2DSAA 3FK8A 5DAKB 1M2AA 4IS0A 5IMCA 2B7JA 4TXOB 3EINA 5C04A 1J9BA 3BBYA 3QPMA 4YQVA 1N2AA 1J08A 2I81A 4KCEA 2H30A 1GSUA 4HZ2A 4EL1A 2VCXA 2E2MA 3TRQA 4F82A 2DJKA 3UVTA 5L71A 2HZEA 3FRCA 1B9XC 5CP1A 3TJJA 4EKZA 2H1BA 3EWLA 4TXVA 1VF2A 3BOAA 3FZ9A 4N30A 4GTUA 2KLXA 1QFNA 3PINA 2CX3A 1WMJA 4JU5A 1SK2A 2YANA 2DMMA 4GXZA 5ECKB 2P31A 5JWOB 4QQ7A 1A2JA 1LBKA 3W6GA 4CHSA 3KM6A 3TJBA 1F37A 1MD3A 2KOKA 2CX4A 5D9VA 3EU3A 4HOJA 2LRTA 3ZRDA 1R5PA 1PX7A 3IXRA 4BVYA 3FKFA 4GSNA 8GSSA 2VCZA 2AHEA 4NAXA 1IYHA 3JCML 2MMAA 1XBSA 13GSA 2K8SA 1G6YA 2MBTA 4HQZA 3VWVA 2FWGA 1E2YA 1OYJA 1U88A 4I5QA 2VL3A 3PR8A 4BWQA 1ZYQB 1T8EB 2B5EA 1U3IA 3WYWA 3GA4A 4BWSA 1TI1A 11GSA 1JLWA 4EDYA 4DSSB 4I8BA 4XRDA 4N0VA 3TRPA 1ON4A 1GLPA 5IOWA 1U6TA 1UA5A 4IP6A 1XXUA 2LNSA 2XBIA 1X5DA 3GMFA 4KUNA 3VFIA 1AUCA 2AAWA 3WGDA 4X1UA 4EDZA 4POBA 2H0GA 4KDXA 2P5QA 1BJXA 1HD2A 2AYTA 2M80A 2G0FA 3LORA 2IMKA 3EVIA 1RQMA 4O92A 2ES7A 2X8HA 3F6DA 1VF3A 2WDUA 3KEBA 3GSTA 1G7OA 1YF1A 2LS5A 4OO4A 1OKDA 2YPMA 1SYRA 2CV4A 3C73A 4RUVA 1EP8A 3LQ7A 3HJPA 4DSRA 2VAFA 4PXOA 9GSSA 1EGOA 1O73A 1K0NA 5IMZA 5DALA 5J9BA 5CREA 3LSZA 2VM2A 4I2TA 3A2VA 2LQOA 1O6JA 3RBTA 2R4VA 4RQRA 5ECIB 5IMAA 5IOXA 1X5CA 1V98A 1W4VA 3H8QA 1F2EA 2MBSA 4NXIA 2OE3A 5JCWA 4I97A 5D96A 2OACA 3BCIA 3J7Yk 3LXTA 2WULA 1PX6A 1ACVA 4TR3A 1PA3A 1TP9A 3RPPA 5LD0A 3TOTA 5HR0A 1WPIA 2DIZA 4JE1A 3EMXA 3GH6A 4IP1A 2XPEA 4YQMA 5FT3A 4CW9A 3CSJA 3VWWA 3QAWA 4KDUA 1FO5A 1X9SB 4MMMA 2FGXA 5IPGA 3UARA 2R3XA 3QFAC 4ZXGA 2YN1A 4HU7A 4XCSA 4G9HA 1EV9A 5ECHB 1JLVA 2RLIA 3EMPA 3M9JA 3KP8A 5AGYA 4WXTA 5D9WA 3VWXA 5KN1A 2V41A 3UOMA 1TU7A 2B6MA 1GP1A 2GLRA 5B6NA 2HZFA 2PPTA 4WR5A 2VD0A 1FHEA 3CRTA 3G7JA 2Z9SA 3UAPA 3ZIVA 17GSA 2DJ0A 3IE3A 5DJMA 4FO5A 4ID0A 1VGLA 4XS4B 4MLYA 4IVFA 3US3A 4OFMA 2LEGA 3ZZXA 3ED3A 4MCUA 2LRCA 1OC9A 2O89A 4LL1B 4O5RA 4MDCA 2I1UA 3Q18A 2V6OA 2H70A 4ECIA 2YZHA 4GLTA 3DXBA 4O7HA 4F03A 4MJEA 2H0HA 2GTUA 4Z7XA 3W8SA 4IKHA 3E3EA 2DLXA 2JZRA 1ZMAA 4X0XA 1JZRA 2BMXA 4RI6A 3TCOA 2PERA 4MZBA 2AJQB 4ML6A 2LV3A 2N5AA 5DALB 3CSHA 5B8BA 3KIJA 3ERFA 3F4SA 1WOUA 1X9WB 2FWHA 5A4WA 4XS1A 3IV4A 2H66A 1TK5B 2PU9C 1B9YC 3GSSA 1DUGA 3NIVA 1XVQA 2IIYA 1F3BA 1K0MA 1K0DA 1EWXA 1SK1A 3HYPA 4FYBA 1XIYA 4Q5RA 4EF0A 5E59A 1Z7RA 4D73B 4TR4A 22GSA 6GSWA 1Y6EA 1I9DA 3FR3A 1R26A 1EOHA 3VPTA 3VI5A 1NSWA 3LXZA 1PKWA 5ELGA 4PGTA 1GL8A 2H6YA 2B7KA 3GN3A 2V32A 3PH9A 2H73A 3GKNA 1GSDA 2FWEA 1ILOA 3GKKA 3H79A 4K9ZA 2GT5A 3DEXA 1XOBA 1T00A 4HU9A 5ECOB 1U87A 1O85A 2R2JA 1UC7A 4ISDA 2L4QA 3I6AA 1AQVA 1VF1A 2H6ZA 1M2DA 5DQSA 1SJIA 3MNGA 4TOPA 1SKWB 4KSMA 3MSZA 4K8MA 4YH2A 2YZUA 2AB6A 1OC3A 1XW6A 3G7YA 1AAZA 4HZ4A 1IYIA 1R5AA 1PD21 4Q5FA 4Q5NA 1OC9B 5G5FA 2PGTA 4I6XA 2A2SA 3BD2A 2WRTA 3H93A 4TN8A 4MA9A 4ILFA 3GUSA 1WE0A 5F05A 2I4AA 2NPBA 3HY2A 1GRXA 4MF6A 3GFKA 3VPQA 5FHIA 2A2RA 2DJ1A 4HUAA 4ML1A 2L57A 1OVNA 1U3AA 1HNBA 4MH2A 4G10A 4NWYA 5G30A 2PWJA 2VL9A 2H71A 2K18A 2GQLA 1KNGA 1A0RP 3ME7A 1WP0A 1H75A 3QFBC 5LNKe 3IAS2 2YJHA 4NPBA 5IO0A 5F07A 1X9MB 1T7PB 3APSA 1UN2A 20GSA 3L9VA 3GYKA 3G9BA 3TJKA 4N11A 5AIXA 3CBUA 4FH8A 1ERWA 5ABRA 2FY6A 2ON7A 2C3TA 3I69A 5HR2A 4QL9A 4AF2A 4KSOA 3IK7A 1SL1B 1GNEA 4L5LA 1ZZYA 2LNTA 2H01A 5A4UA 4P3YB 4ZILA 2NBSA 5CNWA 2H1GA 2XBQA 2C0GA 2GQMA 4POMA 4IW9A 4JZQA 2WJUA 3VWUA 3VURA 1XWGA 2C3NA 2LSTA 1AW9A 1X5EA 3KCMA 1B8XA 4AJ6A 3BCKA 2FHEA 5IM9A 1WJKA 4HDEA 2PN8A 4MZCA 5AIVA 1PKZA 1KBNA 3UVHA 3NZNA 5FWGA 4ZBAA 4E8EA 5EL8A 4HI7A 6GSVA 3A5WA 3CXGA 4OWYA 3E9JB 1AQWA 5JWQB 4K7OA 1EP7A 1TOFA 3WT1A 1SKSB 2IMIA 3DMLA 2K6VA 3RHCA 3TUEA 1F6MC 2RUEA 2E0QA 3KH9A 2OE1A 4POLA 4BA7A 4F0CA 3LJRA 2VCQA 4OD7A 3DD3A 3RPNA 1N8JA 4F9ZA 3HCZA 3MWHA 4IQAA 2FNOA 2HYXA 1FW1A 1NHOA 1TRSA 4MJCA 4QL7A 3MDKA 3D6IA 1XWCA 3HZ4A 6GSUA 3DRNA 5INYA 3ZVJD 5G1LA 4F0BA 3ERGA 1PSQA 5ID2A 3KGKA 3U6VA 4V1Ap 4MJBA 5G2ZA 1MTCA 1GTUA 3D21A 3LYKA 2YWIA 2I9HA 2HSYA 3D0ZA 3WGXA 5J3RA 2LUSA 1K0AA 3I43A 5ECLB 2EIRA 3ZYWA 2IFQA 3KTLA 2O85A 1HNCA 2M72A 4GRFA 2WB9A 2C3QA 3K8NA 3ZREA 3F4RA 1GULA 1JHBA 4NHWA 4NV5A 1Y25A 2YWNA 3A3TA 1UVZA 1RK4A 1GSSA 1HNAA 3L78A 4IQ1A 3CSIA 4MP4A 2FLSA 2GZYA 5GSSA 3IAM2 2IJYA 1A2LA 3ERWA 2JL4A 3IA1A 1MDJA 4LLRA 4GF0A 3F9UA 1WRYA 1B4QA 3UJ1A 3U5RE 2RUFA 4WBJA 5JWRB 3V1WA 2HNLA 3UEMA 5H5QA 5D8IA 1ABAA 2HZEB 3TKSE 1XWAA 3TDGA 1KTEA 4TW5A 5IMDA 1SD9A 1JFUA 4OMVA 3FYGA 3GKMA 2VL2C 1TI3A 3D22A 1H4OA 4N10A 2F51A 1R7HA 4ZB8A 14GSA 5D93A 5F06A 5HR1A 2LQQA 4IGJA 1QUWA 4MABA 3FW2A 2WGRA 2LRNA 4AGSA 1SK0A 2ALBA 1ERTA 2YV9A 4OO5A 4WEYA 3N5OA 4KA0A 1SENA 4J57E 1AC1A 1G0TA 1SL0B 4I2UA 5DVBA 3IK9A 3APOA 4WBRD 2HRFA 4ZIJA 3KH7A 1XOAA 2OBKA 4GQFA 4XRAA 4ECCA 2C0FA 4ECJA 2CZ2A 1PGTA 2EC4A 5ID2B 3IPZA 4EE0A 1TJDA 16GSA 4IN0A 1XFLA 5EPFA 2F8AA 3FR9A 2DC5A 2MMZA 3KD0A 5ECPB 1XW5A 3TKSA 4GSTA 2N5BA 5ELAA 4GQCA 2VM1A 2WS2A 4DSQA 3QCPA 3GH9A 1M99A 4H86A 4KH7A 3TB2A 3D4MA 2IFQB 4GSSA 3F0IA 1S3AA 1M9AA 3UIWA 1ZOFA 5ECRB 1V57A 2KP2A 4LL4B 3UL3A 2F9SA 2C80A 5ECSA 4XS6A 4L0WA 4NV2A 2RM6A 3TKPA 3TRXA 1PL2A 5CYYA 3TKSC 2OA7A 3GTUA 1TRUA 3DVWA 2KHPA 2H72A 4BL7A 1A2MA 4MF5A 2ON5A 3CTGA 1K0OA 1TK8B 1R4WA 1TTZA 2IL3A 1CQGA 4N0ZA 1GSYA 4TR1A 2XC2A 2B1LA 2LJRA 3LYPA 1BX9A 2K8VA 3HJOA 2NDOA 3FHKA 2QGVA 5A4VA 3L9SA 6GSTA 3HVSA 1THOA 2V1MA 2WCIA 1QXHA 1GWCA 2IMFA 1FAAA 1SYXA 1ZYEA 4G2EA 4O32A 3QMXA 3GURA 2LJAA 2OBIA 3D5JA 4EUYA 2JSYA 3O3TA 3SWLA 2X64A 4IHUA 5DJLA 3IR4A 4DVCA 3ZFBA 2M46A 5E4WA 2V2GA 2J9HA 2VIMA 1YY7A 3WD6A 1AIUA 3EURA 4L8EA 4NMUA 1LU4A 3FZ4A 4GWRA 5IMVA 1T4ZA 5AISA 2LTKA 4TRXA 2JZSA 2K9FA 2B5XA 1X0RA 2H1DA 1HQOA 2TRCP 3M0FA 4KDYA 1TK0B 2CAIA 5IO2A 2H76A 1Z3EA 3KTBA 2X99A 5D73A 4PURA 2F8FA 3ZL5A 2XHFA 3HZ8A 5IIZA 3NOFA 4WF4A 5G31A 1THXA 1OC8A 3ME8A 5KN2A 3HD5A 2H8LA 2BJXA 2L5OA 2OKAA 3APQA 4ZB6A 3QDNA 3WT2A 3ZLPA 4ZL9A 4KAEA 3I9V2 4TXOA 10GSA 3FEUA 1MD4A 4JR4A 4L5OA 1PRXA 5GSTA 5D9XA 5DQYA 4PUAA 2PVQA 3DIEA 3C7MA 1A8LA 1XPVA 4JR6A 3P7XA 1USBA 4RQXA 2OJLA 4TVEA 18GSA 4DEJA 2MZCA 2GVPA 3UBKA 3GIXA 2EIQA 3TKQA 5LCZA 2VLVA 1WWJA 2H1AA 3TJGA 3EE2A 2L59A 3GTUB 2JU5A 3LWAA 4MJAA 4GCIA 2VLUA 4XTSA 1TU8A 1K0CA 3Q6OA 1YQ1A 2ZUPA 1YEXA 5J41A 3P2AA 5ENUA 2PUKC 2VD1A 4TR1B 3DGQA 5JCGA 1PQNA 4MZWA 2C0EA 4MF7A 3F6FA 4BPYA 1B4PA 1FVKA 4NHZA 1J0FA 1ZGNA 2X8CA 4XIHA 5B7CA 1ZL9A 3A2WA 2GS3A 2CVDA 6GSYA 3GNJA 2B5YA 2HLSA 5IPHA 3HVXA 2L6CA 4YAVA 2RM5A 3GRXA 2R6KA 4FYCA 2H6XA 5AN1A 1B48A 3OR5A 3GHAA 1E6BA 2E2GA 1GNWA 3EYTA 3J7Yb 2FWFA 4K7NA 1I5GA 1TRVA 1V40A 5J4UA 3M3MA 4POKA 2MMNA 3E0UA 2RIIA 2YOIA 3FZ5A 1VRSD 4WF5A 5F0GA 2V6KA 2JADA 2VO4A 1YKCA 1DSBA 4K0GA 2IN3A 4MPGA 4HQSA 2CA8A 4KCAA 2HXKA 2BTOT 1K3YA 1GSEA 7GSSA 4OCEA 3S9FA 2NVLA 5CRWA 2DMLA 2R37A 5EY6A 3DVXA 2C4JA 1XZOA 2H0IA 1ZCPA 4K2DA 5HFKA 3LEFA 2O7KA 2ZCTA 5GAPD 4KB3A 1W89A 3VLNA 3L4NA 2KP1A 4CDOA 3QAGA 2B1KA 2VUPA 1SD8A 3CYNA 1F3AA 4OCFA 1A0FA 5DDLA 2JZTA 2P0GA 4IJ3A 19GSA 4MK3A 3MAKA 2GZPA 2GZZA 3RHBA 4JBBA 4BVXA 2VOCA 3DYRA 3GX8A 2F3MA 1EV4A 2C0DA 2DJJA 1JZOA 3KZQA 1K3LA 1FB6A 4ULXA 2B3SA 1FOVA 4PX1A 1AXDA 2GQKA 3FR6A 5ECQB 2C1YA 2YWMA 1GH2A 2L6DA 1HYUA 1EEJA 4K6XA 4TKYA 2GSSA 2G2QA 1ERVA 5F8BA 2FCHA 2CZ3A 5HR3A 4WETA 3L9UA 1BQ7A 2LKUA 3ZITA 4LMWA 3L0HA 2HE3A 3ZIJA 3C1RA 2I3YA 3KP9A 2L4CA 1M2BA 2JACA 4J56E 1EOGA 5EVOA 1O8XA 4ZB9A 2X8GA 4ZL7A 1MEKA 4X43A 2L5LA 2H74A 2O87A 2JSZA 1GUHA 2VCWA 1JZDA 4RI7A 5CRDA 3GX0A 4V2NA 2VL2A 1V2AA 1TRWA 4XS4A 2TRXA 4V2LA 4KE3A 1AQXA 5H5SA 5HFIA 5J9CA 2CVKA 3M8NA 4FIWA 3EC3A 1OKTA 1QGVA 1GUKA 3Q19A 1OE8A 1T1VA 1GTIA 3ZVJA 3TJFA 3CTFA 1YEPA 4EO3A 4YQUA 5ECNB 4J2FA 1TXXA 5GAND 4IBPA 1MDIA 4ACSA 2HT9A 4HEA2 1K3OA 2J23A 2ZNMA 2QKEA 4ZBBA 2QC7A 5JCUA 2NTOA 2A4VA 3M9KA 2N5FA 4ECBA 2CT6A 3HJMA 1Q98A 2CQ9A 1Z6NA 5H5RA 2IMDA 3QOUA 3W8JA 5KN0A 1DE1A 2IWTA 12GSA 2GGTA 3F3RA 2WFCA 6GSSA 3TOUA 1ST9A 3QD9A 1WIKA 2KUCA 1A8YA 1GUMA 3Q74A 1A23A 3D4TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1SKWB

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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