1SL1 | Genus

Total Genus 26

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	26
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/electron transport/dna
molecule keywords	5'-D(CPGPAPAPAPAPCPGPAPCPGPGPCPCPAPGPTPGP*
publication title	Nucleotide insertion opposite a cis-syn thymine dimer by a replicative DNA polymerase from bacteriophage T7. pubmed doi rcsb
source organism	Enterobacteria phage t7
total genus	26
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1sl1B00

4PGTA 3HVXA 4LMVA 4O5RA 2KP1A 5F05A 5B6NA 1XW6A 2H1GA 2VCVA 1M99A 2GQKA 3UL3A 2LUSA 1GSEA 2N5AA 2LJAA 3TJBA 3P90A 2TRXA 4JR6A 2FWFA 3P7XA 5B8AA 1Q4JA 2IFQB 2C4JA 5J9CA 2L4QA 4WF5A 5GAND 1ST9A 1GTIA 1DE2A 3IDVA 4N11A 3IPZA 1V57A 2MMAA 3DMLA 2EC4A 4PQ1A 4L5LA 2YNXA 2OA7A 2VD1A 4K7OA 5KN1A 2DJKA 1K0MA 1A2JA 4NAXA 3D6IA 4HU9A 2FHEA 3FEUA 1T4YA 2RLIA 3HA9A 3HZ4A 3TKSE 1J08A 2VL9A 3W8JA 1PMTA 3NIVA 4TN8A 1MDJA 1SU9A 3IA1A 4XRDA 4ZL7A 1M2DA 2B5EA 3TKPA 2L5OA 4K2DA 1EOGA 1EOHA 1JZOA 1A8YA 1SENA 6GSWA 5ELAA 2CVKA 3FW2A 5DAKA 1G7OA 2V1MA 4O7HA 3RPNA 1X9WB 2GSRA 3TJJA 4ZB6A 2VCXA 1GSUA 2LEGA 5B8BA 1O7UA 5DQYA 4XS4B 4JBBA 3S9FA 5CO3A 2CAIA 4NPBA 2C3NA 1K0BA 2KOKA 2F9SA 4E8EA 1BG5A 4OWYA 3J7Yb 4BVXA 5G2ZA 2F8AA 1BX9A 3EU4A 3I69A 1U88A 3UBKA 3LJRA 1PD21 1TK5B 1AQXA 2C8UA 1ILOA 1AC1A 3LSZA 1GSFA 5IMAA 2WCIA 4OMVA 1OKTA 5LCZA 2CV4A 1HQOA 3TUEA 1V9WA 1XWCA 3ED3A 3D21A 1TK0B 2A2RA 4JR4A 4MPGA 2OACA 4NHWA 1QUWA 2MYGA 2BJXA 2LJRA 2YPMA 4XCSA 2K8VA 1AUCA 3KP9A 2PN8A 4D73A 3GSTA 2LRNA 5D9XA 5CREA 2PERA 1VF4A 4ECCA 1XWKA 1TJDA 1Z6MA 3GKXA 5CRDA 2HNLA 1FO5A 1LBKA 1R26A 2DIYA 1OE7A 1MTCA 2XC2A 1SKWB 5A4WA 1PSQA 1UC7A 3KD0A 4XS1A 4BWQA 2AJQB 2WULA 3DRNA 4Q5FA 4IJ3A 4KCEA 2DSAA 1U6TA 3ZITA 1GLPA 5J41A 2VL2A 4ZXGA 3FR9A 5D9TA 4MPFA 1LJRA 1JHBA 1GRXA 2J9HA 1YJ6A 1AQVA 1SL0B 5G1KA 1SYRA 3CSIA 2WFCA 3MSZA 2G0FA 4L8EA 3V1WA 2B7KA 3P8WA 1AAZA 3TRXA 3HXSA 1JZDA 4V2LA 2LV3A 4GSSA 2CVDA 3IV4A 3O6TA 4IJIA 3J7Yk 5HR3A 4HDEA 3TCOA 1QGVA 3ERWA 2VM1A 4J2FA 4JRRA 1X9SB 2GS3A 3WT1A 1PL2A 4KDUA 2NBSA 3M3MA 4O32A 1FB0A 2VOCA 1H75A 3SBCA 3GKMA 2HSHA 4NWYA 4WETA 3HDCA 4KDXA 4K0GA 1F2EA 1IYIA 2IPAA 3PINA 4TXVA 3HHVA 1CQGA 4EKZA 1T7PB 3HVVA 2L6DA 2MMNA 5LD0A 3Q6OA 2YWIA 2I3YA 5GSSA 2LNTA 4J56E 2KLXA 3EMPA 5DAKB 11GSA 2OE0A 3E0UA 1XXUA 4IELA 2DBCA 4NV5A 5IMVA 1O73A 3TOUA 5B6MA 3WGXA 5ECKB 3A5WA 2R5GA 2K8SA 2FCHA 4LLRA 5E59A 5L71A 2LS5A 2GQLA 3C7MA 3QCPA 4KE3A 5IQYA 2M46A 4MJAA 2FY6A 4XRAA 4GQFA 1F37A 4ZB8A 2B5XA 4WBRD 2X8CA 1VRSD 2XBIA 2IFQA 3PGTA 3F9UA 5IMFA 5KEJA 4WBJA 1KTEA 1KEBA 4K9ZA 5FHIA 4XIHA 3KTBA 1U3IA 4ISDA 1GH2A 3QMXA 1NW2A 1WIKA 2M72A 2PMTA 2GVPA 4MJBA 3VPQA 3DEXA 3O76A 1M2BA 6GSUA 5ECOB 3Q18A 3L78A 4POMA 2MZCA 4TXOA 3L9VA 8GSSA 1OAZA 1GNEA 1GTAA 3F63A 5F0GA 1MDKA 2O7KA 5ECLB 3CTFA 1T4ZA 2LJKA 2ZUPA 2H0HA 4ECIA 16GSA 2H74A 5AIVA 3H8QA 2Z9SA 2VLTA 2V41A 2LNSA 4BVYA 2OE3A 1TOFA 1I5GA 3F4TA 2KUCA 4ZL8A 2B1LA 3ZIJA 2R2JA 1R5PA 2K9FA 5F8BA 1RK4A 2WJUA 3EMXA 4ACSA 4XS4A 1B4QA 3KMNA 2A2SA 3VI5A 5D96A 2YJHA 5EPFA 1EV4A 1PA3A 2WZ9A 1F3BA 3VWXA 3M9JA 5D73A 3C73A 4V1Ag 5AISA 3GX0A 4EDZA 5CRWA 1Z3EA 4K6XA 2GT6A 4OCEA 1X5CA 3GRXA 4F0CA 3QAGA 3QR6A 4QQ7A 2BTOT 2C0FA 5F06A 1MDIA 2TIRA 3WT2A 5IM9A 3D4MA 3D5JA 3JCML 3HJPA 3FZAA 4L0WA 3KTLA 4X0XA 3L0HA 3N9JA 4NMUA 3KH9A 1G7EA 2OKAA 3GMFA 2OBKA 3QDNA 3KEBA 2AHEA 1EWXA 2IWTA 3C8EA 4V2MA 5DQSA 4KGIA 4IHUA 4HEA2 2PPTA 5ID2A 2IN3A 2NPBA 2GGTA 2K18A 3HVSA 5FWGA 2H0GA 2JADA 2H70A 1GSYA 5HQPA 1ZOFA 5AIXA 4ZL9A 2WRTA 1T1VA 3EURA 1GP1A 3TKSC 3TOTA 1A0FA 2V6KA 2VCZA 4XS6A 4MH3A 6GSSA 3APSA 2YJ7A 4DSQA 3G9BA 4EUYA 4V1Ap 13GSA 3D22A 4MLYA 1FAAA 2H30A 5A5KA 1Z7RA 2OJLA 3VWUA 3UAPA 5ENUA 2H8LA 3H4KA 2VUPA 1GSSA 3BD2A 2J23A 2HZFA 3QD9A 3A3TA 3ZMLA 4GXZA 3CSJA 1WRYA 3ZFLA 3K8NA 4JE1A 4DSSA 2AAWA 2ZCTA 22GSA 1VF3A 2PVQA 4PQHA 2RM5A 4IW9A 2MMOA 4TW5A 2H76A 2L59A 3EWLA 1BAYA 5IMCA 1TI1A 1WOUA 2ON7A 3C1SA 1SK1A 3EINA 1RW1A 1W4VA 2JZRA 3UEMA 2B3SA 3EYTA 2LTKA 1SD8A 1NHYA 2H6ZA 3C71A 1QK8A 4G2EA 1XVQA 1ZGNA 3KJYA 2V2GA 5CP1A 4MCUA 5CRHA 4TXOB 5JCWA 3A2WA 4MF6A 1TDIA 4ZB9A 4EF0A 1J9BA 4LA1A 4MMMA 1XOAA 4KNDA 1GULA 4TR4A 2XPEA 2BMXA 3GNJA 1M0UA 1GUKA 3QPMA 4CDOA 4HQSA 5ECSA 3ME7A 3FRCA 4K0NA 5ECNB 4ZILA 5GAPD 4TVEA 3IR4A 1SJ6A 4G19A 3A2XA 4WXTA 1A2LA 2E2GA 4MF7A 3WGEA 2QC7A 3KZQA 3IC4A 5D9WA 4YQUA 2D2ZA 2MBSA 4BPYA 3OR5A 2A4VA 1OVNA 5H5QA 1XWBA 2KP2A 4P3YB 2B6MA 1Z5YE 2YWMA 5ECPB 4PUAA 9GSSA 1HNBA 4I2UA 1UN2A 1XPVA 3R2QA 3ZYWA 5IMZA 4IKHA 2OADA 2GZPA 4I8BA 3F4SA 3GYKA 1S3CA 4X43A 3FK8A 1AQWA 1PL1A 3N5OA 5J5NA 4IS0A 5DJLA 5A4VA 3CYNA 3L4NA 5C04A 5ID2B 3ZREA 3U5RE 2VLVA 3U6VA 2JSYA 4PNFA 5DALB 2H6XA 3BBYA 3M8NA 3KMOA 3RPPA 2PBJA 3I9V2 3IK7A 1JLVA 1T8EB 3UIWA 4L5OA 2DLXA 2OBIA 1ZL9A 1R4WA 1GNWA 3FZ9A 2R3XA 1XWGA 3IAS2 5F07A 2XBQA 1TI3A 2ALBA 3KP8A 4ID0A 20GSA 3GA4A 5ABRA 1NM3A 1S3DA 3VPTA 5AGYA 3DXBA 3P2AA 4BL7A 4AF2A 4EC0A 3E3EA 2XHFA 3F3RA 14GSA 19GSA 1V98A 4DSSB 1AIUA 2OE1A 2X64A 5J9BA 2PVOC 1FVJA 2IMIA 4IBPA 3EVIA 1VF1A 4Q5RA 4FYBA 4KAEA 2LQOA 2H6YA 3FY7A 3IXRA 1LU4A 3F0IA 4DSRA 2H75A 2O87A 3TJKA 4POKA 1ZCPA 5DCGA 2H66A 3TJGA 3C1RA 2DC5A 4ML6A 1IYHA 1PGTA 2HLSA 1A24A 3VURA 4KA0A 1EGOA 4OFNA 3I6AA 1GLQA 3F6DA 1BJXA 6GSXA 4IGJA 1YDKA 5G31A 1G0TA 1VGLA 3ZVJD 2VAFA 4I97A 3MWHA 2H01A 4ECJA 1YEXA 1TP9A 5AN1A 5IO0A 3GURA 4HJ2A 3A2VA 4TRXA 2L4CA 2F8FA 1ABAA 4MZWA 1PX6A 4BA7A 4RQXA 3ZMKA 1EGRA 4ZBBA 2VIMA 2FWEA 2NDOA 2H73A 4MA9A 1CQHA 2E7PA 3HCZA 1DBYA 2EIRA 5EVOA 3H93A 2I81A 1O81A 3G7YA 2RUFA 1O8WA 3D4TA 3KM6A 3UOMA 2I4AA 4GF0A 1GTUA 1ML6A 2H0IA 2P5RA 3WYWA 3HD5A 1SKSB 1TTZA 1XWAA 1WMJA 2VCQA 3MDKA 1PKWA 2AUVA 3RAZA 1N2AA 2C80A 2H1DA 2CT6A 3UVHA 1SJIA 2AV4A 5H5RA 1ERWA 1FHEA 1ZYQB 1XBSA 1HNCA 2NTOA 4KW6A 2HYXA 2IMKA 3UJ1A 3O3TA 1QXHA 4KCAA 3EE2A 1ZMAA 4HOJA 4KDYA 2CZ3A 2CZ2A 4RI6A 4HQZA 2FWHA 4AJ7A 1TKDB 2RM6A 3GKKA 1XOBA 2V32A 4CW9A 2VLUA 4H86A 3QFBC 4MP4A 3WGDA 1OE8A 5ECHB 4GCIA 5HR2A 1WE0A 3RDWA 3ISOA 2AB6A 3LFLA 2CX4A 4EE0A 2IJYA 1VF2A 4YAVA 4DEJA 3KGKA 3IHQA 1QFNA 1WJKA 1K3OA 2E0QA 2FUG2 3IRAA 3F3QA 4CHSA 3MNGA 2M80A 4FYCA 4IP6A 2H1AA 2EIOA 1XW5A 4HU7A 2XPDA 3GL5A 1SL1B 1E2YA 1X9MB 5DCHA 2DIZA 5G1LA 1SL2B 2ES7A 2FA8A 3NOFA 2WDUA 1K3LA 1AW9A 1SJZA 4AJ8A 2WGRA 4NHZA 1DE1A 4YQVA 1Y6EA 3IBHA 2YZUA 2P31A 3FKFA 3DYRA 3RBTA 4MK3A 3LG6A 4I2TA 3TJFA 1A23A 1JFUA 4TKYA 3US3A 3H79A 3VFIA 1HD2A 1GUMA 2YWNA 3CMIA 2G2QA 1TRWA 3EU3A 1UA5A 3TKSA 1C72A 4K1FA 3F8UA 4GSTA 2PGTA 3G7IA 1G6YA 2H19A 2R6KA 4F2IA 4WR4A 2ON5A 3FZ5A 3TB2A 4MH2A 3FYGA 4GRFA 4QL9A 1RQMA 3GV1A 3ZLPA 3ZZXA 2YN1A 2HT9A 3VWWA 1I9DA 2I1UA 3QAVA 1ZZYA 4ZBDA 2FGXA 2C3TA 1K0DA 4IP1A 3DIEA 4GLTA 4GSNA 4IQ1A 4OO5A 1S3AA 3DGQA 4AGSA 1H4OA 4MJCA 4GQCA 5JWQB 3FHKA 1GTBA 5DALA 3KXOA 3ERGA 5J4UA 4JZQA 4F9ZA 1M7TA 2PWJA 2ZNMA 1JZRA 1BEDA 2YV9A 1Y25A 4DVCA 1SKRB 3I43A 1M2AA 4GTUA 4WF4A 3LORA 5KN2A 3HKRA 5INYA 4K8MA 3UBLA 3GKNA 4Q5QA 3ZRDA 3H1NA 4RUVA 2DMLA 2HE3A 2B7JA 12GSA 1TRSA 1PN9A 2GZYA 3GTUB 2F3MA 3HYPA 2LQQA 2GZZA 3M1GA 4NXIA 6GSTA 1A0RP 2FD3A 5CYYA 3GN3A 5ECMB 1NHOA 1OC3A 1TW9A 3KIJA 4FO5A 4ZIJA 3HZ8A 2YOIA 4L0UA 3BCKA 2GT5A 2MMZA 1OC9A 1YQ1A 2X8GA 2O89A 2IIYA 5FT3A 2E2MA 5DDLA 5DBQA 4TOPA 3IOSA 4QL7A 1SK0A 1T00A 1PQNA 1GUHA 1XFLA 2DJ3A 3QAWA 1U87A 3APOA 2CX3A 5COHA 4PUFC 4ECBA 1T3BA 1GWCA 4N0ZA 1YZXA 1XW9A 3WD6A 3PR8A 4IN0A 4K7IA 3DWVA 4WKWA 1FG4A 4OFTA 3ZL5A 2VCTA 3DD3A 4YAPA 2JSZA 2GSQA 3ZIVA 1Z7PA 2JU5A 4HZ2A 3M0FA 3PH9A 3TKRA 2LRTA 3L9SA 2GTUA 4LL1B 1ACVA 3HJOA 4KUNA 3DVWA 1K0CA 3CXGA 2F51A 4FH8A 1ZYEA 1J0FA 5CRGA 3IK9A 2N5BA 1KBNA 2DMMA 4KB3A 2HSYA 2DJ1A 3APQA 2O8VB 4TR1A 1EEJA 5ECIB 5CAXA 1ON4A 2CVBA 6GSVA 4PXOA 1R5AA 5KN3A 2FLSA 4J57E 5JCUA 4OO4A 3LWAA 3HJMA 5HR0A 5D93A 4IQAA 1U3AA 4V2NA 4PURA 1DSBA 1B9XC 4ZBAA 4PNGA 1V58A 2HRNA 3TRPA 1FVKA 1PKZA 3QOUA 2FA4A 3FR3A 2FNOA 3EC3A 5GSTA 1F9MA 2V6OA 4F03A 3SWLA 1E6BA 2X8HA 2HXKA 5IOWA 2GSTA 2L5LA 3W8SA 3GH9A 1X5EA 4O92A 1B9YC 2YP6A 1EEMA 2RUEA 4HI7A 3TRQA 2VD0A 1USBA 1FW1A 1SYXA 4BWSA 4MF5A 1ERVA 1THOA 2DJJA 4ULXA 2YV7A 4LL4B 4KH7A 2X99A 1ERTA 2FWGA 2HZEB 2IMFA 2QSIA 4E8HA 2H71A 5KN0A 4NV2A 3LEFA 3F6FA 1W89A 3W6GA 4KX4A 4Z7XA 2VM2A 5E4WA 1O85A 5IO2A 3UARA 4OCFA 3VI7A 4KSOA 2JZSA 10GSA 4PX1A 2VCWA 1B8XA 1OC9B 1O6JA 1WP0A 5GZZB 2GLRA 4MABA 5HFGA 3E9JB 3TDGA 4HUAA 3TKQA 4N0VA 1XVWA 3Q19A 5G30A 4EL1A 4X1UA 1PRXA 5J3RA 4I6XA 2VL2C 1EP7A 2HI7A 5HFIA 2YWOA 3CTGA 5LNKe 4AJ6A 3GX8A 4WR5A 1QMVA 4TR3A 1BYEA 2REMA 3BCIA 3F4RA 1V2AA 5EY6A 4JEDA 5JWRB 3ZVJA 4YH2A 4IVFA 1HNAA 4EDYA 1FOVA 5ELGA 4MZBA 4Q5NA 5IOXA 1PX7A 1MD3A 2C3QA 5HR1A 1NSWA 4RI7A 2P5QA 5B7CA 1THXA 3G7JA 2DJ2A 1O8XA 3D0ZA 4XHMA 3GTUA 2GQMA 2KHPA 1EV9A 3BOAA 3GSSA 1Q98A 3DVXA 3FR6A 1A2MA 7GSSA 1M9AA 2PU9C 1TXXA 1YKCA 5A4UA 2IMDA 4TR1B 2YZHA 2EIQA 2HRFA 3NZNA 5ECRB 2LKUA 3BJ5A 1YKAA 5HFKA 2VL3A 1B4PA 1TU7A 3LGCA 1SD9A 1GSQA 1GSDA 2H1BA 4GWRA 5H5SA 3ME8A 4POBA 1EP8A 4K7NA 1M9BA 3AY8A 1K0OA 2C0GA 5ECQB 4LMWA 4ML1A 4EVMA 1OKDA 6GSYA 3VLNA 5DJMA 1GL8A 1X5DA 1URMA 1K0AA 4XTSA 2QKEA 2HFDA 2NVLA 2L6CA 1K3YA 2P0GA 5DVBA 3L9UA 4I5QA 2GDRA 2MBTA 2YANA 4MZCA 2WS2A 4N30A 1F3AA 1F6MC 4PQIA 1DUGA 1FB6A 4D73B 1N8JA 2TRCP 4TR0A 3CSHA 2VO4A 2I9HA 2CA8A 3LXZA 1X0RA 3LQ7A 3VWVA 3CRTA 2C0EA 1OC8A 5IPHA 2PUKC 1B48A 5IPGA 2JL4A 1XIYA 1G6WA 3GH6A 4HJMA 1WWJA 2QGVA 1YEPA 2GSSA 1OYJA 3KCMA 3KH7A 5JWOB 1MEKA 3VK9A 3RHBA 2CQ9A 4RQRA 4HZ4A 3IE3A 4HS1A 17GSA 5D9VA 2B1KA 2R37A 2B5YA 3QFAC 5JCGA 1BQ7A 2IMEA 2O85A 1YF0A 1TK8B 2WB9A 4EO3A 3LXTA 3UMAA 1YF1A 3ERFA 4FYUA 4ILFA 1TU8A 2LRCA 4OFMA 2DJ0A 1JZWA 3MAKA 3UVTA 1UVZA 4G10A 1TRUA 4MDCA 4EXJA 1K0NA 4WEYA 4POLA 3LYKA 2CAQA 5D8IA 1MD4A 1QQ2A 2L57A 1A8LA 5IMDA 2AYTA 1SK2A 1WPIA 3FZ4A 5CNWA 3DKSA 4G9HA 1R7HA 2RIIA 2H72A 3RHCA 2R4VA 5G5EA 5G5FA 18GSA 1KNGA 4MJEA 3GUSA 2IL3A 1EZKA 4OD7A 1YY7A 3CBUA 1V40A 4FIWA 2JZTA 1Z6NA 3ZFBA 3GIXA 1Z9HA 5C00A 3GFKA 4YQMA 4N10A 2LSTA 3M9KA 1JLWA 3Q74A 3IAM2 2K6VA 4F0BA 3TGZA 3ZTLA 4JU5A 1ERUA 4F82A 3GL3A 1TRVA 2C0DA 1AXDA 4KSMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1SL1B

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

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Chord Diagram

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